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1. Meunier, Christophe. Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées.

Degree: 2010, DIAL (Belgium)

Evolution pressure typically forces natural systems to become highly optimized, sophisticated and efficient. Specifically, the living systems are able to perform a series of complex and attractive catalytic reactions. Consequently, their integration into new devices has the potential to produce breakthroughs in both fundamental science and possibly leads to new technologies in diverse fields (environment, energy, health). However, cells, isolated from their native environment, are generally fragile or unsuitable in the development of technologies. In the past few years, abundant researches have proved that encapsulation of biomolecules, enzymes and microorganisms into various artificial matrices can be very attractive to create new functional bio-composites. This ever-growing field of research is very promising in the development of new eco-friendly technologies such as whole cell sensors, depolluting devices, stable bioreactors and artificial organs. The aim of this thesis consists of a fundamental study on the elaboration of functional and stable bio-hybrid materials via the immobilisation of organelles or photosynthetic plant cells within various silica matrices in order to design a photo-bioreactor. The first part of this work was devoted to the development of immobilisation methods adapted for the in situ incorporation of fragile biological species (thylakoids, chloroplasts, cells) within porous silica scaffold. Several inorganic precursors and synthesis parameters were studied in order to determine their effects on the morphological, textural and rheological properties of the silica matrices. Particularly, the bioactivity of entrapped thylakoids was investigated and correlated with the properties of the support. Since these photosynthetic structures are very sensitive, a biocompatible synthesis pathway has been designed to allow the formation of stable hybrid materials. In these conditions, the photochemical activity of thylakoids can be preserved for more than 40 days whereas no enzymatic activity can be detected after 3 days in a free suspension of thylakoids. The second part was focused on the realisation of a solid photobioreactor via the in situ or post-synthesis immobilisation of plant cells (Arabidopsis thaliana). With this in mind, the biological activity and the cell-matrix interactions were investigated by using several techniques. A control of the chemical surface properties of silica has shown to be crucial in order to avoid the mineralization of cell walls and prolong the cellular viability of plant cells. Additionally, the porosity of the matrix was also studied. This parameter is able to control the growth and the confinement of cells within the material. Encapsulated within an organo-modified silica matrix, the photoautotrophic plant cells are able to convert water into O2 and produce valuable compounds from CO2 under light irradiation. In the future, such bio-hybrid gels could play a key role in the development of new sustainable technologies.

Après plusieurs milliards d’années d’évolution,…

Advisors/Committee Members: FUNDP - SCHI_GCNM (groupe de chimie des nanomatériaux), FUNDP - Ecole doctorale en sciences, Su, Bao-Lian, Van Cutsem, Pierre, Lanners, Steve, Livage, Jacques, Vincent, Stéphane, Krief, Alain, Léonard, Alexandre.

Subjects/Keywords: Encapsulation; Silice; Cellule; Bioréacteur; Biominéralisation; interface cellulaire; Matériaux hybrides

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APA (6th Edition):

Meunier, C. (2010). Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées. (Thesis). DIAL (Belgium). Retrieved from http://hdl.handle.net/2078.2/32295

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

Meunier, Christophe. “Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées.” 2010. Thesis, DIAL (Belgium). Accessed April 19, 2019. http://hdl.handle.net/2078.2/32295.

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MLA Handbook (7th Edition):

Meunier, Christophe. “Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées.” 2010. Web. 19 Apr 2019.

Vancouver:

Meunier C. Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées. [Internet] [Thesis]. DIAL (Belgium); 2010. [cited 2019 Apr 19]. Available from: http://hdl.handle.net/2078.2/32295.

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Council of Science Editors:

Meunier C. Conception de Matériaux bio-hybrides photosynthétiques par immobilisation de biosystèmes végétaux au sein de matrices silicées. [Thesis]. DIAL (Belgium); 2010. Available from: http://hdl.handle.net/2078.2/32295

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Université de Montréal

2. Sénéchal, Hélène. Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus .

Degree: 2013, Université de Montréal

Les papillomavirus sont de petits virus à ADN double brin qui infectent les cellules de l’épithélium de la peau et des muqueuses d’une variété de vertébrés causant des lésions bénignes telles des verrues. Certains de ces virus sont également associés au développement de lésions malignes, notamment le cancer du col utérin. La protéine régulatrice E2 des papillomavirus est impliquée dans diverses fonctions contribuant à l’établissement de l’infection par ces virus. Entre autre, E2 régule la transcription des gènes viraux, participe à l’initiation de la réplication de l’ADN viral en s’associant à l’hélicase virale E1 et est responsable du maintien et de la ségrégation de l’épisome viral au cours de la division cellulaire. Toutes ces activités sont attribuables à la capacité de E2 à s’associer au génome viral et à interagir avec des protéines virales et cellulaires. De plus, ces fonctions sont elles-mêmes régulées par des modifications post-traductionnelles de la protéine E2. Plusieurs études ont été réalisées afin de découvrir les mécanismes de régulation des fonctions de E2 mais le rôle exact des différents domaines de E2 dans ces contrôles reste à être défini. En premier lieu, nous nous sommes intéressés à l’interaction entre E2 et Brd4(L) qui avait été définie comme étant essentielle à la ségrégation de l’épisome. Plusieurs caractéristiques associées à la protéine Brd4(L) telles que sa capacité à lier les lysines acétylées des histones, son interaction avec le complexe Mediator et sa participation à l’activation de la transcription en formant un complexe avec pTEFb, nous ont permis d’émettre l’hypothèse que l’interaction E2-Brd4(L) est nécessaire à l’activité transcriptionnelle de E2. Nous avons démontré que la protéine Brd4(L) interagit avec le domaine de transactivation de E2 de divers types de papillomavirus. De plus, cette interaction implique les résidus de E2 essentiels à son activité transcriptionnelle. Ainsi, ces résultats proposent que l’association E2-Brd4(L) serve à la régulation de la transcription des gènes viraux. Dans un second temps, nos recherches se sont concentrées sur l’existence d’une interface de dimérisation au sein du domaine de transactivation de E2 et de son implication dans les activités transcriptionnelles et réplicatives de la protéine. Nos études ont aussi mis en évidence que l’intégrité de la structure de ce domaine contribue au bon fonctionnement de la réplication du génome viral. Cette découverte suggère que la dimérisation de E2 peut réguler l’initiation de la réplication et propose l’existence d’un niveau de régulation additionnel impliquant l’état de la structure quaternaire de la protéine E2 et une modulation de l’interaction entre E1 et E2 à cette étape du cycle viral. Finalement, l’étude de l’instabilité de la protéine E2 nous a permis de définir une région importante dans le domaine flexible de la protéine, nécessaire à sa dégradation par le protéasome. De plus, la présence de résidus conservés localisés dans ce domaine, sont associés à la dégradation et portent la… Advisors/Committee Members: Archambault, Jacques (advisor).

Subjects/Keywords: Papillomavirus; E2; Brd4(L); réplication; transcription; interaction protéine-protéine; interface dimérique; dégradation; protéasome; localisation cellulaire; replication; protein-protein interaction; dimeric interface; degradation; cellular localization; proteasome

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APA (6th Edition):

Sénéchal, H. (2013). Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus . (Thesis). Université de Montréal. Retrieved from http://hdl.handle.net/1866/10131

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

Sénéchal, Hélène. “Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus .” 2013. Thesis, Université de Montréal. Accessed April 19, 2019. http://hdl.handle.net/1866/10131.

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MLA Handbook (7th Edition):

Sénéchal, Hélène. “Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus .” 2013. Web. 19 Apr 2019.

Vancouver:

Sénéchal H. Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus . [Internet] [Thesis]. Université de Montréal; 2013. [cited 2019 Apr 19]. Available from: http://hdl.handle.net/1866/10131.

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Council of Science Editors:

Sénéchal H. Étude de la régulation des activités transcriptionnelle, réplicative et de l’instabilité de la protéine régulatrice E2 des papillomavirus . [Thesis]. Université de Montréal; 2013. Available from: http://hdl.handle.net/1866/10131

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