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Universidade Federal de Viçosa

1. Poliane Ferreira Alfenas. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.

Degree: 2006, Universidade Federal de Viçosa

Durante a coevolução entre vírus e hospedeiro desenvolve-se uma interação complexa envolvendo diversos mecanismos de ataque do patógeno, e de defesa do hospedeiro. A alteração no padrão de expressão gênica do hospedeiro é uma conseqüência desses mecanismos. Entretanto, o conhecimento sobre os efeitos da infecção viral na expressão gênica ainda é limitado. Com o objetivo de identificar genes diferencialmente expressos em uma interação vírus - planta, uma biblioteca subtrativa foi produzida a partir de plantas suscetíveis de tomateiro infectadas pelo potyvírus Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), utilizando-se folhas inoculadas, 72 horas após a inoculação. Foram identificados 777 genes diferencialmente expressos durante a infecção viral, que possuem homologia com proteases, proteossomos, diversos fatores de transcrição, proteínas envolvidas na via de ubiquitinação, proteínas de resposta a choque térmico, catalases, proteínas envolvidas em silenciamento gênico, dentre outras. Também foram identificados 104 genes reprimidos, que da mesma forma apresentaram homologia com genes envolvidos em diversas vias celulares. A expressão diferencial dos genes foi validada por RTPCR quantitativo e análise de macroarranjos. O estudo dos genes identificados, em conjunto com as informações sobre o ciclo de infecção viral, proporciona uma visão global de como o vírus utiliza fatores do hospedeiro para a biossíntese de proteínas virais e infecção de novos tecidos, e também das respostas de defesa do hospedeiro na tentativa de conter, ou ao menos minimizar, os danos causados pela infecção viral. A análise funcional dos genes identificados será necessária para determinar seu papel específico na interação.

During co-evolution between virus and host, a complex interaction has been developed involving several mechanisms of pathogen attack and host defense. Host defense responses cause up- and downward shifts in gene expression. However, the effects of viral infection in the hosts gene expression profile are still poorly understood. With the objective of identifying differentially expressed genes in a virushost interaction, susceptible tomato plants were inoculated with the potyvirus Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), and a subtractive library was constructed based on mRNA extracted from inoculated leaves at 72 h after inoculation. A total of 777 genes differentially expressed were identified, including genes involved in a number of plant defense responses as well as transcriptional regulators and signaling proteins, including catalase, aldolase, cystein proteases, heat shock proteins, polyubiquitin, proteassome subunits, proteins involved in gene silencing, among others. A total of 104 down-regulated genes were also identified, which likewise display homology with genes involved in several metabolic pathways. Differential expression of selected genes was validated by quantitative RT-PCR and macroarray analysis. The study of these genes, together with information on the viral infection cycle, provides a global view of the host factors used…

Advisors/Committee Members: Elizabeth Pacheco Batista Fontes, Elza Fernandes de Araujo, Francisco Murilo Zerbini Júnior, Sérgio Hermínio Brommonschenkel, Júlio Cezar Mattos Cascardo, Ivan de Godoy Maia.

Subjects/Keywords: MELHORAMENTO VEGETAL; Interação PepYMV; Tomateiro; Transcriptoma; VIGS; Interaction PepYMV; Tomato; Transcriptome; VIGS

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APA (6th Edition):

Alfenas, P. F. (2006). Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. (Thesis). Universidade Federal de Viçosa. Retrieved from http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=5490

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Alfenas, Poliane Ferreira. “Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.” 2006. Thesis, Universidade Federal de Viçosa. Accessed October 18, 2019. http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=5490.

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MLA Handbook (7th Edition):

Alfenas, Poliane Ferreira. “Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.” 2006. Web. 18 Oct 2019.

Vancouver:

Alfenas PF. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2006. [cited 2019 Oct 18]. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=5490.

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Council of Science Editors:

Alfenas PF. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2006. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=5490

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Universidade Federal de Viçosa

2. Poliane Alfenas Zerbini. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.

Degree: 2006, Universidade Federal de Viçosa

During co-evolution between virus and host, a complex interaction has been developed involving several mechanisms of pathogen attack and host defense. Host defense responses cause up- and downward shifts in gene expression. However, the effects of viral infection in the hosts gene expression profile are still poorly understood. With the objective of identifying differentially expressed genes in a virushost interaction, susceptible tomato plants were inoculated with the potyvirus Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), and a subtractive library was constructed based on mRNA extracted from inoculated leaves at 72 h after inoculation. A total of 777 genes differentially expressed were identified, including genes involved in a number of plant defense responses as well as transcriptional regulators and signaling proteins, including catalase, aldolase, cystein proteases, heat shock proteins, polyubiquitin, proteassome subunits, proteins involved in gene silencing, among others. A total of 104 down-regulated genes were also identified, which likewise display homology with genes involved in several metabolic pathways. Differential expression of selected genes was validated by quantitative RT-PCR and macroarray analysis. The study of these genes, together with information on the viral infection cycle, provides a global view of the host factors used by the virus to synthesize its proteins and to infect new cells and tissues, as well as the responses from the host, in its attempt to contain or at least minimize the damage caused by the infection. Functional analysis of these genes will be necessary in order to determine their specific role in the interaction.

Durante a coevolução entre vírus e hospedeiro desenvolve-se uma interação complexa envolvendo diversos mecanismos de ataque do patógeno, e de defesa do hospedeiro. A alteração no padrão de expressão gênica do hospedeiro é uma conseqüência desses mecanismos. Entretanto, o conhecimento sobre os efeitos da infecção viral na expressão gênica ainda é limitado. Com o objetivo de identificar genes diferencialmente expressos em uma interação vírus - planta, uma biblioteca subtrativa foi produzida a partir de plantas suscetíveis de tomateiro infectadas pelo potyvírus Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), utilizando-se folhas inoculadas, 72 horas após a inoculação. Foram identificados 777 genes diferencialmente expressos durante a infecção viral, que possuem homologia com proteases, proteossomos, diversos fatores de transcrição, proteínas envolvidas na via de ubiquitinação, proteínas de resposta a choque térmico, catalases, proteínas envolvidas em silenciamento gênico, dentre outras. Também foram identificados 104 genes reprimidos, que da mesma forma apresentaram homologia com genes envolvidos em diversas vias celulares. A expressão diferencial dos genes foi validada por RTPCR quantitativo e análise de macroarranjos. O estudo dos genes identificados, em conjunto com as informações sobre o ciclo de infecção viral, proporciona uma visão global de como o vírus utiliza fatores do…

Advisors/Committee Members: Elizabeth Pacheco Batista Fontes, Elza Fernandes de Araujo, Sérgio Hermínio Brommonschenkel, Júlio Cezar Mattos Cascardo, Ivan de Godoy Maia.

Subjects/Keywords: Interação PepYMV-tomateiro; Transcriptoma; Virus induced gene silincing (VIGS); MELHORAMENTO VEGETAL; Tomato-PepYMV interaction; Transcriptional regulations; Virus induced gene silincing (VIGS)

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APA (6th Edition):

Zerbini, P. A. (2006). Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. (Thesis). Universidade Federal de Viçosa. Retrieved from http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=555

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

Zerbini, Poliane Alfenas. “Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.” 2006. Thesis, Universidade Federal de Viçosa. Accessed October 18, 2019. http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=555.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

MLA Handbook (7th Edition):

Zerbini, Poliane Alfenas. “Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus.” 2006. Web. 18 Oct 2019.

Vancouver:

Zerbini PA. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2006. [cited 2019 Oct 18]. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=555.

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Council of Science Editors:

Zerbini PA. Identificação de genes potencialmente envolvidos na interação tomateiro - Potyvirus. [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2006. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=555

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