subject:(Real time PT PCR)

University of Minnesota

1. Yang, Anna. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.

Degree: MS, Plant Pathology, 2015, University of Minnesota

► Early and accurate diagnosis of oak wilt, caused by Ceratocystis fagacearum, is important when disease control action is planned. When laboratory diagnosis is needed, standard… (more)

▼ Early and accurate diagnosis of oak wilt, caused by Ceratocystis fagacearum, is important when disease control action is planned. When laboratory diagnosis is needed, standard isolation protocols that are used rely on high quality samples and require up to 14 days for incubation. New methods, involving the use of polymerase chain reaction (PCR) have the potential to offer faster and more reliable plant disease diagnostics. The purpose of this thesis was to 1) compare the use of a nested PCR and real-time PCR protocol to detect C. fagacearum in sapwood drill shavings using published isolation methods and 2) develop standard sampling and processing guidelines for oak wilt diagnostics using the protocols, and 3) test and evaluate the use of the protocols in operational plant disease diagnostic clinics. All assays were performed on samples obtained from Quercus rubra/Q. ellipsoidalis (red oak), Q. macrocarpa (bur oak), and Q. alba (white oak) trees in Minnesota. Drill shavings were collected from actively wilting oak trees as well as from tissues taken the year following branch or whole tree death. Between the assays tested (nested PCR, real-time PCR, and isolation), the nested PCR assay resulted in the highest estimated probability of C. fagacearum detection for branch segments sampled from actively wilting oak trees. For bur and white oak branches that had been dead for >= 1 year, the pathogen was detected using nested PCR (55 and 87% of branch segments, respectively) and real-time PCR (19%, white oak only), while isolation was not able to detect the pathogen in any branch segments. All three detection methods were able to detect the fungus in main stem samples of red oaks with a streaking cambium, however, the molecular protocols resulted in more frequent pathogen detection. Only the molecular assays detected the pathogen in sapwood samples underlying the remnants of C. fagacearum sporulation mats on main stem samples of red oak trees. The fungus was not detected by either technique in branch segments obtained from healthy oaks (controls). Inter-laboratory testing of the nested PCR and real-time PCR protocols supported the previously described differences in assay reliability. Overall, the comparison of traditional isolation and nested PCR by the University of Minnesota Plant Disease Clinic resulted in the same number of trees testing positive for the pathogen by both detection methods. A comparison of isolation methods and real-time PCR was completed by the University of Wisconsin-Madison Plant Disease Diagnostic Clinic, which resulted in a higher rate of detection using isolation methods.

Subjects/Keywords: Nested PCR; Real-Time PCR

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APA (6^th Edition):

Yang, A. (2015). Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. (Masters Thesis). University of Minnesota. Retrieved from http://hdl.handle.net/11299/174737

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Yang, Anna. “Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.” 2015. Masters Thesis, University of Minnesota. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/11299/174737.

MLA Handbook (7^th Edition):

Yang, Anna. “Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.” 2015. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Yang A. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. [Internet] [Masters thesis]. University of Minnesota; 2015. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/11299/174737.

Council of Science Editors:

Yang A. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. [Masters Thesis]. University of Minnesota; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/11299/174737

Université de Neuchâtel

2. Humbert, Sylvia. Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems.

Degree: 2011, Université de Neuchâtel

URL: http://doc.rero.ch/record/22458

► Avant cette étude, le processus anammox (oxydation anaérobie de l’ammonium) était uniquement étudié dans les usines de traitement des eaux usées et dans les milieux… (more)

▼ Avant cette étude, le processus anammox (oxydation anaérobie de l’ammonium) était uniquement étudié dans les usines de traitement des eaux usées et dans les milieux aquatiques, sédiments inclus. Cependant, rien n'était connu encore sur la distribution, la diversité, l'abondance et l'activité des bactéries anammox dans les écosystèmes terrestres. Dans cette étude, nous apportons l’évidence, par approche moléculaire, de la présence de bactéries anammox dans les sols de zones humides, les sédiments des marais, le profil de sol d’un Reductisol, des sols de rives de lacs, un sol sur Permafrost et un aquifère poreux. L'analyse phylogénétique des séquences du gène ARNr 16S a démontrée que les bactéries anammox présentes dans les écosystèmes terrestres sont affiliées à <i>Candidatus</i> ‘Brocadia’, ‘Kuenenia’, ‘Scalindua’, ‘Jettenia’ and ‘Anammoxoglobus’ ainsi qu’à deux groupes non identifiés. Ces candidats anammox étaient largement distribués dans les différents environnements terrestres indiquant une plus grande diversité que dans les colonnes d’eau des milieux marins. Les bactéries anammox n'étaient pas présentes dans tous les milieux et fractions de sol échantillonnés, l’analyse démontrant leur distribution hétérogène et leurs besoins écologiques spécifiques comme la présence d’interfaces oxique / anoxique à long terme et de composés azotés inorganiques. Nous avons quantifié les bactéries anammox dans ces différents environnements en développant une nouvelle approche qPCR spécifique anammox, et leur abondance variait de 10⁴ à 10⁶ copies / g de sol. Finalement, le Réductisol a été sélectionné pour réaliser une analyse détaillée de l’activité anammox le long du profil de sol par des expériences d'incubation à l’isotope ¹⁵N. Pour chaque date d'échantillonnage, une production de ²⁹N₂ était observée à toutes les profondeurs du Réductisol, démontrant la présence de bactéries anammox actives. La contribution d‘anammox à la production totale de N₂ était inférieure à 14%. Cette étude fournit la première preuve que les bactéries anammox sont présentes, diverses et actives dans les écosystèmes terrestres. Advisors/Committee Members: Michel (Dir.), Jakob (Codir.).

Subjects/Keywords: real-time PCR

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Humbert, S. (2011). Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems. (Thesis). Université de Neuchâtel. Retrieved from http://doc.rero.ch/record/22458

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Humbert, Sylvia. “Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems.” 2011. Thesis, Université de Neuchâtel. Accessed January 17, 2021. http://doc.rero.ch/record/22458.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Humbert, Sylvia. “Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Humbert S. Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems. [Internet] [Thesis]. Université de Neuchâtel; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://doc.rero.ch/record/22458.

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Council of Science Editors:

Humbert S. Discovery of anammox bacteria in terrestrial ecosystems. [Thesis]. Université de Neuchâtel; 2011. Available from: http://doc.rero.ch/record/22458

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3. Andrade, Julio Cesar Farias de. Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR.

Degree: 2010, Universidade Federal de Alagoas

URL: http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/247

►

In Brazil there is still no variety of commercial transgenic sugarcane used in large scale, although biotechnological research in the area of gene expression has… (more)

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In Brazil there is still no variety of commercial transgenic sugarcane used in large scale, although biotechnological research in the area of gene expression has been performed in order to obtain varieties that can be cultivated in low rainfall, high temperatures and in low fertil soils. In the present work it was analised the diferencial gene expression in leaves of the variety of sugarcane RB72910 in field capacity and under severe water stress in a greenhouse. The evaluation was done using the technique real-time RT-PCR a powerful tool used to identify and quantify significant changes in the levels of transcripts, facilitating the selection of candidate genes for use in transgenic plants. For this we analized the expression of 11 genes in leaf samples in two conditions of water regime. The genes analyzed were: DNAJ, PGR5, H1, PSI, LTP, WIP, ZmPIP2-1, ZmTIP4-2, SAMDC and two genes with unknown functions. It was observed that the variety studied showed diferential gene expression under water stress mainly for genes encoding proteins of the protective fotosynthetic system and for maintenance of the homeostasis. Thus, it was concluded that the genotype RB72910 has important agronomical traits of fotoprotection and adaptation to drought.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas

No Brasil ainda não há uma variedade de cana-de-açúcar transgênica comercial usada em larga escala, porém pesquisas biotecnológicas na área de expressão gênica estão sendo feitas visando a obtenção de variedades que possam ser cultivadas em condições de baixa pluviosidade, altas temperaturas e solos com pouca fertilidade. No presente trabalho foi analisada a expressão gênica diferencial em folhas na variedade de cana-deaçúcar RB72910 nas condições de capacidade de campo e sob estresse hídrico severo em casa de vegetação. A avaliação foi feita por meio da técnica real-time RT-PCR, uma potente ferramenta usada para identificar e quantificar mudanças significativas nos níveis de transcritos, facilitando a seleção de genes candidatos à utilização em transgenia. Para isso foi analisada a expressão de 11 genes em amostras foliares em duas condições de regime hídrico. Os genes analisados foram: DNAJ, PGR5, H1, PSI, LTP, WIP, ZmPIP2-1, ZmTIP4-2, SAMDC e dois genes com funções indeterminadas. Observou-se que a variedade estudada demonstrou expressão diferencial sob estresse hídrico principalmente para genes que codificam proteínas de proteção do sistema fotossintético e de manutenção da homeostase. Com isso, concluímos que o genótipo RB72910 apresenta importantes características agronômicas de fotoproteção e de adaptação à seca.

Advisors/Committee Members: Almeida, Cicero Carlos de Souza, CPF:02719760471, ALMEIDA, C. C. S., Andrade, Tiago Gomes de, CPF:02697210458, De ANDRADE, T. G., Silva, José Vieira, CPF:33059837368, SILVA, J. V., Caetano, Luiz Carlos, CPF:28358996615, CAETANO, L. C..

Subjects/Keywords: Cana-de-açúcar; Estresse hídrico; Expressão gênica; Real time RT-PCR; Sugar cane; Water stress; Gene expression; Real-time PT-PCR; CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA

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APA (6^th Edition):

Andrade, J. C. F. d. (2010). Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR. (Masters Thesis). Universidade Federal de Alagoas. Retrieved from http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/247

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Andrade, Julio Cesar Farias de. “Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR.” 2010. Masters Thesis, Universidade Federal de Alagoas. Accessed January 17, 2021. http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/247.

MLA Handbook (7^th Edition):

Andrade, Julio Cesar Farias de. “Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR.” 2010. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Andrade JCFd. Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal de Alagoas; 2010. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/247.

Council of Science Editors:

Andrade JCFd. Análise de expressão gênica diferencial em genótipo de cana-de-açúcar tolerante ao estresse hídrico, usando real-time RT-PCR. [Masters Thesis]. Universidade Federal de Alagoas; 2010. Available from: http://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/247

University of Guelph

4. Duggal, Megha. Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples.

Degree: MS, School of Environmental Sciences, 2013, University of Guelph

URL: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/7443

► A PCR Differentiation Method, a hybrid of the US EPA and MOE methods, for quantifying human infectious C. parvum/C. hominis as a group and non-human… (more)

Subjects/Keywords: Cryptosporidium; detection; PCR; real time; environment

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APA (6^th Edition):

Duggal, M. (2013). Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples. (Masters Thesis). University of Guelph. Retrieved from https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/7443

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Duggal, Megha. “Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples.” 2013. Masters Thesis, University of Guelph. Accessed January 17, 2021. https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/7443.

MLA Handbook (7^th Edition):

Duggal, Megha. “Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Duggal M. Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples. [Internet] [Masters thesis]. University of Guelph; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/7443.

Council of Science Editors:

Duggal M. Detection and quantification of Cryptosporidium oocysts in environmental samples. [Masters Thesis]. University of Guelph; 2013. Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/7443

Univerzitet u Beogradu

5. Dmitrić, Marko, 1987-, 33530983. Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane.

Degree: Fakultet veterinarske medicine, 2020, Univerzitet u Beogradu

URL: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:22425/bdef:Content/get

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Veterinarska medicina - Higijena i tehnologija mesa / Veterinary Medicine - Meat Hygiene and Technology

Izolacija i identifikacija Salmonella spp. ostaje nezamenjiva kao potvrdna metoda… (more)

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Veterinarska medicina - Higijena i tehnologija mesa / Veterinary Medicine - Meat Hygiene and Technology

Izolacija i identifikacija Salmonella spp. ostaje nezamenjiva kao potvrdna metoda u mikrobiologiji hrane i hrane za životinje. Međutim, savremena industrija hrane, ali i javno zdravstvo zahtevaju razvoj novih, brzih metoda za detekciju Salmonella spp., jednog od najvažnijih patogenih mikroorganizama prenosivih hranom. Pored toga, tokom epidemioloških studija, uglavnom nije dovoljno da se izolati Salmonella tipiziraju do nivoa vrste i serotipa, već je neophodna i primena metoda tipizacije koje mogu napraviti razliku između epidemiološki različitih, ali genetski srodnih izolata. Veliki broj alternativnih metoda, uključujući i real-time PCR protokole, razvijen je i validovan u cilju detekcije Salmonella spp. Pored toga, napredak u razvoju molekularnih metoda pružio je alate visoke diskriminatorne moći koji su posebno mesto primene zauzeli pri određivanju izvora kontaminacije hrane, omogućavajući brzu i izuzetno pouzdanu tipizaciju Salmonella spp. Ova doktorska disertacija obuhvata četiri osnovne celine: (1)“In house” validacija real-time PCR protokola za detekciju invA i ttr gena Salmonella spp. u hrani i hrani za životinje; (2) „In house“ validacija real-time PCR protokola za detekciju Salmonella Enteritidis i S. Typhimurium u hrani; (3) Razvoj i „in house“ validacija novog real-time PCR protokola za detekciju invA gena Salmonella spp. u hrani; (4) Molekularna karakterizacija i ispitivanje antimikrobne osetljivosti Salmonella Enteritidis and S. Typhimurium izolovanih iz hrane, hrane za životinje i fecesa. Tokom izrade ove doktorske disertacije formirana je kolekcija od 60 izolata Salmonella Enteritidis i 60 izolata S. Typhimurium (po 12 poreklom ljudi, 24 poreklom iz hrane i 24 poreklom iz fecesa živine), a zatim je izvršena njihova molekularna karakterizacija i ispitivanje antimikrobne osetljivosti. Ispitivanje antimikrobne osetljivosti Salmonella izvršeno je disk difuzionom metodom prema EUCAST protokolu, dok je za određivanje minimalne inhibitorne koncentracije primenjen E test. Molekularna karakterizacija izvršena je primenom PFGE metode (Pulsed Field Gel Electrophoresis) prema „CDC PulseNet“ protokolu...

Advisors/Committee Members: Karabasil, Neđeljko, 1971-, 12819559.

Subjects/Keywords: Salmonella; real-time PCR; PFGE; antimicrobial resistance

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APA (6^th Edition):

Dmitrić, Marko, 1987-, 3. (2020). Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane. (Thesis). Univerzitet u Beogradu. Retrieved from https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:22425/bdef:Content/get

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Dmitrić, Marko, 1987-, 33530983. “Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane.” 2020. Thesis, Univerzitet u Beogradu. Accessed January 17, 2021. https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:22425/bdef:Content/get.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Dmitrić, Marko, 1987-, 33530983. “Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane.” 2020. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Dmitrić, Marko, 1987- 3. Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane. [Internet] [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2020. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:22425/bdef:Content/get.

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Council of Science Editors:

Dmitrić, Marko, 1987- 3. Detekcija salmonela vrsta i karakterizacija Salmonella Enteritidis i Salmonella Typhimurium poreklom iz lanca hrane. [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2020. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:22425/bdef:Content/get

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6. Dib, Cristina Corsi. Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose.

Degree: PhD, Epidemiologia Experimental Aplicada às Zoonoses, 2011, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27092012-164459/ ;

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A estirpe Fromm de Leptospira interrogans sorovar Kennewicki foi utilizada para produção de uma bacterina experimental anti-leptospirose. A extração do RNA total utilizado para transcrição… (more)

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A estirpe Fromm de Leptospira interrogans sorovar Kennewicki foi utilizada para produção de uma bacterina experimental anti-leptospirose. A extração do RNA total utilizado para transcrição reversa e quantificação dos antígenos LigA e LipL32 por PCR em Tempo Real, foi efetuada a partir de alíquotas colhidas das diluições da bacterina antes da sua inativação, as quais foram armazenadas à temperatura de -80ºC. O volume restante da bacterina foi inativado em banho-maria à 56ºC e mantido à temperatura de -20ºC para avaliação da sua potência em hamsters bem como da detecção e quantificação dos antígenos LigA e LipL32 em ensaios de ELISA Indireto e ELISA Sanduíche Indireto. Os resultados do ensaio de potência em hamsters demonstraram que a bacterina foi aprovada de acordo com as exigências dos padrões internacionais de qualidade até a diluição 1/6400, protegendo os hamters contra a infecção letal frente ao desafio com a diluição 10-6 (100 doses infectantes 50%/ 0,2mL). Os resultados das reações de Real Time PCR detectaram 3,2 x 103 e 2,3 x 101 cópias do mRNA que codifica a proteína LigA, na bacterina pura e diluída a 1:200, respectivamente. Apenas oito cópias do mRNA que codifica a proteína LipL32 foram detectadas na amostra de bacterina pura. Os ensaios com ELISA Indireto não detectaram a proteína LigA na amostra de bacterina inativada, mas demonstraram a detecção da proteína LipL32 até a diluição 1/1600 da bacterina. Os ensaios de ELISA Sanduíche Indireto apresentaram reações cruzadas nas placas controle, e, portanto seus resultados não puderam ser considerados nas análises. Os resultados da real time PCR não puderam ser correlacionados com o teste de potência em hamsters, mas os ensaios de ELISA Indireto para a proteína LipL32 demonstraram resultados condizentes com os apresentados pelo teste de potência em hamsters oferecendo uma possível alternativa in vitro para avaliação de potência de bacterinas anti-leptospirose.

Leptospira interrogans serovar Kennewicki strain Fromm was used for the production of a experimental leptospirosis bacterin. The extraction of total RNA used for reverse transcription and quantification of the antigens LigA and LipL32 for Real Time PCR was performed from the aliquots harvested of bacterin dilutions before inactivation that were separated and maintained at -80ºC. The remaining volume of bacterin was inativated at 56ºC and maintained at -20ºC for the evaluation bacterin potency in hamsters and detection and quantification of LigA and LipL32 antigens by Indirect ELISA assay and Indirect Sandwich ELISA. The results of potency assay in hamsters demonstrated that the bacterin was approved by the international patterns of quality until dilution 1/6400, protecting the hamters against lethal infection challenge by the dilution 10-6 (100 infectious doses 50%/0,2 mL). The results of Real Time PCR detected 3,2 x 103 e 2,3 x 101 copies of mRNA that encodes the LigA protein, in samples of pure bacterin and diluted 1:200, respectively. Few eight copies of mRNA that encodes LipL32 protein were detected…

Advisors/Committee Members: Vasconcellos, Silvio Arruda.

Subjects/Keywords: Bacterinas; Bacterins; ELISA; ELISA; Hamsters; Hamsters; Leptospirose; Leptospirosis; Real Time PCR; Real Time PCR

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APA (6^th Edition):

Dib, C. C. (2011). Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27092012-164459/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Dib, Cristina Corsi. “Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose.” 2011. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27092012-164459/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Dib, Cristina Corsi. “Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Dib CC. Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27092012-164459/ ;.

Council of Science Editors:

Dib CC. Emprego da reação em cadeia pela polimerase em tempo real para o controle de eficiência de bacterinas anti-leptospirose. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2011. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-27092012-164459/ ;

Univerzitet u Beogradu

7. Simeunović, Predrag R., 1984-. Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije.

Degree: Fakultet veterinarske medicine, 2016, Univerzitet u Beogradu

URL: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:10885/bdef:Content/get

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Veterinarska medicina - Veterinarska genetika / Veterinary Medicine - Veterinary Genetics

Primena molekularno – genetičkih metoda zauzima značajno mesto u dijagnostici oboljenja kod životinja izazvanih… (more)

Subjects/Keywords: real-time RT-PCR; PCR; viruses; microsporidia; Apis mellifera

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APA (6^th Edition):

Simeunović, Predrag R., 1. (2016). Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije. (Thesis). Univerzitet u Beogradu. Retrieved from https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:10885/bdef:Content/get

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Simeunović, Predrag R., 1984-. “Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije.” 2016. Thesis, Univerzitet u Beogradu. Accessed January 17, 2021. https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:10885/bdef:Content/get.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

MLA Handbook (7^th Edition):

Simeunović, Predrag R., 1984-. “Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije.” 2016. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Simeunović, Predrag R. 1. Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije. [Internet] [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2016. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:10885/bdef:Content/get.

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Council of Science Editors:

Simeunović, Predrag R. 1. Molekularno-genetička detekcija i identifikacija uzročnika mikrosporidijalnih i virusnih infekcija zastupljenih kod pčelinjih društava na teritoriji Srbije. [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2016. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:10885/bdef:Content/get

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Iowa State University

8. Streauslin, Nicholas. Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices.

Degree: 2020, Iowa State University

URL: https://lib.dr.iastate.edu/etd/18234

► ABSTRACT Porcine Reproductive and Respiratory Virus (PRRSV) and Porcine Circovirus Type 2 (PCV2) are both viruses which cause significant economic and production losses to the… (more)

▼ ABSTRACT Porcine Reproductive and Respiratory Virus (PRRSV) and Porcine Circovirus Type 2 (PCV2) are both viruses which cause significant economic and production losses to the swine industry around the world. The gold standard for monitoring these viruses is real-time PCR. Sequencing assays are also used to keep track of the epidemiology of these viruses. The work presented in this thesis aims to examine the repeatability of these types of assays with various concentrations of virus and within common diagnostic sample types. The repeatability of real-time PCR assays for PRRSV and PCV2 was examined using clinical specimens of various sample types which were submitted to the Iowa State University (ISU) Veterinary Diagnostic Laboratory (VDL). This was accomplished by creating a dilution series for each virus and for each of the specimen types: viral isolate, lung homogenate, serum, and oral fluids. These samples were diluted to targeted Cq ranges of 31-32, 32-33, 33-34, 34-35, 35-36, 36-37, 37-38, 38-39, 39-40. The dilutions were performed into negative material of the same sample matrix as the clinical specimen. The nucleic acids were then extracted in triplicate. Ten PRRSV RT-qPCR assays were performed from each extract for each sample matrix, and 15 qPCR reactions from each for PCV2. The repeatability was then determined as a percentage of the positive results from each group. Repeatability was also evaluated based on the cutoff of 40 or 37 cycles for PRRSV, and 40 or 35 cycles for PCV2. The repeatability of a sequencing assay for PRRSV open reading frame (ORF) 5 was also evaluated in this work. A similar methodology used to examine the real-time assays was used to evaluate the sequencing assay. The samples were diluted to different targeted Cq range of 29-30, 30-31, 31-32, 32-33, 33-34, 34-35, 35-36, 36-37. Five amplification PCRs were performed from each extract. Amplification product was then sequenced via Sanger sequencing. The sequencing data was determined to be successful or unsuccessful. The repeatability was determined as the number of acceptable sequences out of the total sequencing attempts that were performed. Acceptable sequences were also compared to each other within their expected Cq group using a phylogenetic analysis to evaluate the repeatability of the nucleic acids determined by the sequencing software. The work in this thesis aims to examine the repeatability of these important diagnostic assays as they approach the limit of detection. The research presented here shows the repeatability of these real time PCR assays decrease as the Cq¬ values increase. A decrease in repeatability of acceptable sequences with increasing Cq values was also observed for the ORF5 sequencing assay for PRRSV. These findings were true for each of the sample matrices evaluated.

Subjects/Keywords: PCR; PCV2; PRRSV; Real-time PCR; Repeatability; Sequencing

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APA (6^th Edition):

Streauslin, N. (2020). Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices. (Thesis). Iowa State University. Retrieved from https://lib.dr.iastate.edu/etd/18234

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Streauslin, Nicholas. “Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices.” 2020. Thesis, Iowa State University. Accessed January 17, 2021. https://lib.dr.iastate.edu/etd/18234.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Streauslin, Nicholas. “Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices.” 2020. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Streauslin N. Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices. [Internet] [Thesis]. Iowa State University; 2020. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://lib.dr.iastate.edu/etd/18234.

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Council of Science Editors:

Streauslin N. Repeatability of diagnostic real-time PCR and sequencing at various concentrations within different sample matrices. [Thesis]. Iowa State University; 2020. Available from: https://lib.dr.iastate.edu/etd/18234

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9. Ferreira, Karin Correa Scheffer. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.

Degree: PhD, Epidemiologia Experimental Aplicada às Zoonoses, 2011, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

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Este estudo teve como objetivo detectar a presença do vírus da raiva em diferentes órgãos de morcegos do gênero Artibeus empregando as técnicas moleculares como… (more)

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Este estudo teve como objetivo detectar a presença do vírus da raiva em diferentes órgãos de morcegos do gênero Artibeus empregando as técnicas moleculares como RT-PCR, hnRT-PCR e Real Time RT-PCR. De aproximadamente 4000 espécimes de morcegos recebidas no Instituto Pasteur para o diagnóstico da raiva, foram selecionados 30 morcegos do gênero Artibeus, com resultados positivos para raiva pelas técnicas tradicionais de IFD e inoculação em células N2A utilizando suspensões feitas a partir do SNC. Para as técnicas moleculares, foram retirados glândulas salivares, bexigas urinárias, rins, pulmões e conteúdos fecais e ainda foram lavadas as calotas cranianas dos espécimes. Os órgãos e conteúdos fecais foram diluídos a 1:10 (P/V) e as bexigas urinárias a 1:20 (P/V). As suspensões foram inoculadas em células N2A para o isolamento viral. Foi realizada a extração do RNA total usando o TRIzol®, foram realizadas a transcrição reversa seguida da PCR e hnRT-PCR com utilização de primers específicos para o gene codificante da proteína N. A partir do produto da transcrição reversa foi realizada a técnica de Real Time RT-PCR, utilizando primers e sonda específicos para variante antigênica 3. Das 30 suspensões de lavado cerebral, 28 (93,33%) resultaram positivos, na inoculação em cultura de células, seguido de glândulas salivares (36,67%), bexigas (16,67%) e conteúdos fecais (3,33%). Os resultados encontrados da sensibilidade nas técnicas de RT-PCR, hnRT-PCR e Real Time RT-PCR foram 56,25%, 82,57% e 82,19% quando avaliadas as 180 amostras analisadas. A comparação das técnicas de hnRT-PCR e Real Time RT-PCR feita pelo teste exato de Fisher quanto a proporção de positivos detectados mostrou que para o lavado cerebral, órgãos e conteúdos fecais a proporção foi igual (P>0,05). Em relação à positividade os resultados encontrados nas técnicas de hnRT-PCR e Real Time RT-PCR foram 100% em lavado cerebral; 90% e 93,33% em glândulas salivares; 83,33% e 90% em bexigas; 80% e 93,33% em rins; 76,67% e 50% em pulmões e 43,33% em ambas as técnicas em conteúdos fecais. Esses resultados sugerem que tanto as técnicas de hnRT-PCR como Real Time RT-PCR podem ser utilizadas como métodos complementares para o diagnóstico da raiva e são sensíveis o bastante para o uso em estudos de patogênese. A técnica de Real Time RT-PCR realizada neste estudo se mostrou eficiente em detectar o RABV em diferentes órgãos e tecidos extraneurais com a vantagem de ser uma técnica mais rápida e sensível.

This study was aimed to detect the presence of rabies virus in different organs of the genus Artibeus bats using molecular techniques such as RT-PCR, hnRT-PCR, and the Real Time RT-PCR. From about 4,000 specimens of bats received for rabies diagnosis at the Pasteur Institute, 30 bats of the genus Artibeus were then selected. The selected bats presented positive results by the traditional DFA and N2A-cells inoculation test using brain tissue suspensions. Samples of salivary glands, urinary bladders, kidneys, lungs, and fecal contents and washings of the skulls were…

Advisors/Committee Members: Ito, Fumio Honma.

Subjects/Keywords: Hemi-Nested RT-PCR; Real Time RT-PCR; Bats; Diagnosis; Diagnóstico; Hemi-Nested RT-PCR; Morcegos; Rabies; Raiva; Real Time RT-PCR; RT-PCR; RT-PCR

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APA (6^th Edition):

Ferreira, K. C. S. (2011). Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Ferreira, Karin Correa Scheffer. “Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.” 2011. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Ferreira, Karin Correa Scheffer. “Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Ferreira KCS. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;.

Council of Science Editors:

Ferreira KCS. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2011. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

10. Orico, Lilian Dias. Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo.

Degree: Mestrado, Epidemiologia, 2013, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6132/tde-11112013-142955/ ;

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INTRODUÇÃO: Em grandes cidades, como São Paulo, a pequena porcentagem de matas existentes é representada pelos parques municipais. Estas áreas, além de representarem ambientes de… (more)

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INTRODUÇÃO: Em grandes cidades, como São Paulo, a pequena porcentagem de matas existentes é representada pelos parques municipais. Estas áreas, além de representarem ambientes de lazer para as pessoas, albergam uma enorme diversidade biológica, desde mosquitos até aves e mamíferos. A interação destas espécies favorece a circulação de Flavivirus, causadores de importantes doenças humanas, que têm nas aves um importante reservatório. Atribui-se às aves migratórias o papel de carreadoras dos vírus, já que as mesmas percorrem longas distâncias para completar seu ciclo biológico. A chegada de aves do Hemisfério Norte ocorre em alguns Parques, o que favoreceria a dispersão de alguns vírus, como o Vírus do Nilo Ocidental, já que nestas áreas estão presentes mosquitos potencialmente vetores. OBJETIVOS: identificar infecção por Flavivírus nas aves dos parques municipais de São Paulo. MÉTODOS: De Março de 2012 a Janeiro de 2013, foram coletadas amostras de swab de cloaca, orofaringe e sangue de aves capturadas em redes de neblina de duas áreas do município de São Paulo: Parque Anhanguera e Fazenda Castanheiras/APA Bororé Colônia. As aves foram anilhadas e liberadas após a coleta do material. Foi realizada técnica de RT-PCR em tempo real, utilizando iniciadores genéricos que amplificam fragmento do gene NS5 de Flavivirus. Amostras positivas foram encaminhadas para sequenciamento. RESULTADOS: Foi capturado um total de 231 aves, em sua maioria da Ordem Passeriformes. De um total de 463 amostras, nenhuma amostra apresentou presença de RNA viral. DISCUSSÃO: Em se tratando de alguns Flavivírus, os passeriformes são considerados os reservatórios mais competentes no ciclo de transmissão, pois atingem altos níveis de viremia. Cabe ressaltar que algumas espécies desta ordem, de ocorrência na cidade de São Paulo, já foram identificadas como portadoras dos vírus Rocio e Ilhéus. A ausência de positividade é esperada, pois embora altamente sensível, a técnica de PCR depende do estado de viremia das aves, que é curta. CONCLUSÃO: Os parques municipais são áreas que aproximam aves, mosquitos e humanos, pelo papel ambiental e de lazer que os mesmos representam. Este fato classifica estas áreas como locais com potencial de transmissão de Flavivirus, o que torna importante a continuação este estudo, aumentando as áreas de abrangência, para conhecer os Flavivírus circulantes e realizar vigilância para vírus que podem ocasionar problemas de Saúde Pública

INTRODUCTION: In big cities, as São Paulo, the little percentage of existing forests is represented by the municipal parks. These áreas, besides acting as entertainment environments to the users, promote a huge biodiversity, including mosquitoes, birds and mammals. These species interaction promotes Flavivirus circulation, viruses responsible for important human diseases. The avian species are important reservoirs for these viruses, specially the migrating birds that can fly for long distances, carrying these viruses to several areas. In some parks, the arrival of migrating birds from the North…

Advisors/Committee Members: Marrelli, Mauro Toledo.

Subjects/Keywords: Aves; Birds; Flavivirus; Flavivirus; Parks; Parques; Real time RT-PCR; RT-PCR em tempo real

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APA (6^th Edition):

Orico, L. D. (2013). Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo. (Masters Thesis). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6132/tde-11112013-142955/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Orico, Lilian Dias. “Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo.” 2013. Masters Thesis, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6132/tde-11112013-142955/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Orico, Lilian Dias. “Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Orico LD. Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo. [Internet] [Masters thesis]. University of São Paulo; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6132/tde-11112013-142955/ ;.

Council of Science Editors:

Orico LD. Pesquisa de infecções por Flavivirus sp. em aves silvestres provenientes das áreas verdes do município de São Paulo. [Masters Thesis]. University of São Paulo; 2013. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/6/6132/tde-11112013-142955/ ;

11. Mozol, Ivan Miletovic. Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii.

Degree: Mestrado, Genética e Melhoramento de Plantas, 2013, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/ ;

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A floresta plantada de eucalipto representa a maior porcentagem entre as florestas plantadas no Brasil, principalmente para a producao de papel e celulose. Porem, durante… (more)

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A floresta plantada de eucalipto representa a maior porcentagem entre as florestas plantadas no Brasil, principalmente para a producao de papel e celulose. Porem, durante todo o seu desenvolvimento, o eucalipto sofre o ataque de diferentes patogenos, e entre eles esta o fungo Puccinia psidii causador da ferrugem, principal doenca do eucalipto em regioes tropicais. Assim, com o intuito de estudar alguns mecanismos de defesa da planta contra a infeccao do fungo, este trabalho visou analisar a expressao genica de enzimas relacionadas ao estresse oxidativo e a atividade das mesmas; e o proteoma de clones de eucalipto resistentes e suscetiveis, ao longo do processo de infeccao, colonizacao e multiplicacao do fungo nas plantas. Foi possivel observar diferencas na expressao dos genes em todos os horarios estudados, principalmente as 24 horas apos inoculacao com o fungo. Alem disso, com a analise do proteoma pode-se observar algumas proteinas de grande relevancia para este trabalho, como algumas relacionadas a estresse oxidativo e a resposta de defesa da planta.

The eucalyptus planted forest represents the major percentage among all planted forests in Brazil, mainly for the production of paper and cellulose. However, during its development, the eucalyptus can be attacked by a large number of different pathogens, like the fungus Puccinia psidii, the causer of the eucalyptus rust, main disease that affects the eucalyptus in tropical regions. Thus, in order to study some plant defense mechanisms against the infection of the fungus, this study aimed to analyse the gene expression of some enzymes related to oxidative stress and their activities, and the proteome of resistant and susceptible eucalyptus clones, during the process of infection, colonization and multiplication of the fungus in the plant. We could observe differences in the gene expression at all times studied, mostly at 24 hours after inoculation with the fungus. Besides, with the proteome analysis we could find the very relevant proteins for this study, for instance some proteins related to the oxidative stress and to the plant defense response.

Advisors/Committee Members: Labate, Carlos Alberto.

Subjects/Keywords: Eucalipto; Eucalyptus; Ferrugem; PCR em tempo real; Proteoma; Proteome; Real Time PCR; Rust

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APA (6^th Edition):

Mozol, I. M. (2013). Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii. (Masters Thesis). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Mozol, Ivan Miletovic. “Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii.” 2013. Masters Thesis, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Mozol, Ivan Miletovic. “Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Mozol IM. Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii. [Internet] [Masters thesis]. University of São Paulo; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/ ;.

Council of Science Editors:

Mozol IM. Análise temporal da expressão gênica e atividade enzimática, relacionadas ao estresse oxidativo e proteômica de Eucalyptus grandis inoculados com Puccinia psidii. [Masters Thesis]. University of São Paulo; 2013. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-13112013-151232/ ;

12. Silva, Thaís Galhardo Egreja Ribeiro da. Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes.

Degree: Mestrado, Fitopatologia, 2013, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17122013-112133/ ;

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Devido à sua múltipla utilidade, a cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é amplamente cultivada em mais de 127 países tropicais e subtropicais. No Brasil, a cultura apresentou… (more)

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Devido à sua múltipla utilidade, a cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é amplamente cultivada em mais de 127 países tropicais e subtropicais. No Brasil, a cultura apresentou expansão em área plantada nos últimos anos em virtude da crescente demanda por biocombustíveis. Porém, a produção de mudas sadias tende a ser um fator limitante a este aumento de demanda, já que diversas doenças são transmitidas por toletes contaminados. Dentre estas, destaca-se o raquitismo da soqueira (RSD), causado pela bactéria fastidiosa Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx) (KAO e DAMANN, 1980). De acordo com a literatura, a transmissão de Lxx se dá através de toletes contaminados e/ou instrumentos de corte, não havendo relatos sobre sua transmissão por sementes. Desta forma, seu controle se baseia no princípio da exclusão, através do uso de toletes tratados termicamente como fonte de material propagativo. Porém, não se conhece o efeito do tratamento no título de Lxx, uma vez que os relatos de eficiência da termoterapia baseiam-se em avaliações qualitativas. Em face destas informações, este estudo objetivou avaliar a transmissão de Leifsonia xyli subsp. xyli por sementes e também quantificar o efeito da termoterapia no título de Lxx em duas variedades de cana-de-açúcar através da PCR quantitativa em tempo real. No ensaio de transmissão via sementes, a bactéria foi detectada em altas incidências (>87%) em plantas de 90 dias oriundas de sementes coletadas de plantas infectadas e em quantidades estimadas superiores a 51 células por 100ng de DNA total de sementes. Além disso, aos 270 dias após o plantio, a bactéria foi isolada de 6 plantas. A identidade das colônias foi comprovada através de PCR convencional utilizando primers específicos para Lxx. Dois ensaios foram conduzidos para quantificar o efeito da termoterapia na população bacteriana. O título de Lxx foi determinado em folhas de plantas de duas variedades de cana-deaçúcar oriundas de toletes tratados termicamente ou não aos 90 dias após o plantio. O título inicial presente nos colmos utilizados como fonte de toletes interferiu na eficiência do tratamento, que reduziu a população bacteriana somente no ensaio onde os colmos apresentaram elevado título bacteriano inicial. Além disso, 70 e 55% das plantas oriundas de toletes tratados termicamente no primeiro e no segundo ensaio, respectivamente, apresentavam células de Lxx, porém em menores quantidades quando comparadas a plantas oriundas de toletes não tratados. Com isso, conclui-se que Lxx é transmitida em elevada frequência via sementes e a termoterapia, embora não tenha efeito erradicante pronunciado, é capaz de reduzir o título bacteriano no tecido vegetal.

Due to its multiple uses, sugarcane (Saccharum spp.) is widely cultivated in more than 127 tropical and subtropical countries. In Brazil, sugarcane cropping has increased in recent years because of the growing demand for biofuels. However, the production of healthy seedlings tends to be a limiting factor to this increase, since contaminated setts transmit many diseases. Among these, the…

Advisors/Committee Members: Camargo, Luis Eduardo Aranha.

Subjects/Keywords: Cana-de-açúcar; PCR em tempo real; Real time PCR; Seeds; Sementes; Sugarcane; Termoterapia; Thermotherapy

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APA (6^th Edition):

Silva, T. G. E. R. d. (2013). Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes. (Masters Thesis). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17122013-112133/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Silva, Thaís Galhardo Egreja Ribeiro da. “Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes.” 2013. Masters Thesis, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17122013-112133/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Silva, Thaís Galhardo Egreja Ribeiro da. “Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Silva TGERd. Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes. [Internet] [Masters thesis]. University of São Paulo; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17122013-112133/ ;.

Council of Science Editors:

Silva TGERd. Raquitismo da soqueira de cana-de-açúcar: transmissão do patógeno via sementes e avaliação quantitativa de seu controle através da termoterapia de toletes. [Masters Thesis]. University of São Paulo; 2013. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-17122013-112133/ ;

13. Biazuzo, Milena Moura de Araujo. Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum.

Degree: PhD, Biologia na Agricultura e no Ambiente, 2013, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/ ;

► O Brasil é o maior produtor mundial de feijão com produção média anual de 3,5 milhões de toneladas, entretanto, um dos maiores problemas enfrentados por… (more)

▼ O Brasil é o maior produtor mundial de feijão com produção média anual de 3,5 milhões de toneladas, entretanto, um dos maiores problemas enfrentados por essa cultura é o déficit hídrico, que leva a uma redução considerável em seu rendimento. Dessa forma, a identificação de genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água durante o seu desenvolvimento é de grande utilidade. E, como a tolerância à seca é um caráter multigênico, genótipos com diferentes graus de tolerância apresentam expressão gênica diferencial, com ativação e/ou repressão de determinados genes. Diante disso, esse trabalho teve como objetivos: (i) identificar genes diferencialmente expressos em dois genótipos de feijoeiro comum, sendo um tolerante (BAT 477) e o outro suscetível (IACCarioca 80SH) à seca; (ii) verificar a expressão gênica espacial (em raízes, caules e folhas) e temporal (cinco níveis crescentes de déficit hídrico - 24 h, 48 h, 72 h, 96 h e 120 h de exposição ao estresse) por meio de RT-qPCR; (iii) predizer a função dos genes identificados, com base nos genes ortólogos de Arabidopsis thaliana, usando dados públicos de microarranjo disponíveis na plataforma Genevestigator. Para atingir esses objetivos, foi conduzido um experimento em casa-de-vegetação, sendo induzido o déficit hídrico, por meio da suspensão da irrigação, quando as plantas atingiram o estádio fenológico R5, mantendo sob suprimento hídrico adequado as plantas-controle. Foi então utilizada a técnica de cDNA-AFLP para isolar os transcritos diferencialmente expressos entre os dois genótipos, sob seca, a qual aliada ao sequenciamento possibilitou a identificação e anotação de 45 transcritos, sendo 21 exclusivamente expressos no genótipo tolerante e 24 no genótipo suscetível. Dentre os transcritos identificados no genótipo tolerante, podem ser listados pelo menos 11, com potencial de serem usados para transformação genética (chlorophyll A-B binding protein, HSP40, HSP70, glycosyl hydrolase, serine/threonine protein kinase, trehalose-6-phosphate synthase, E3 ubiquitin ligase, fructose biphosphate aldolase, mediator complex subunit 13, aquaporin nodulin MTN-3-related e TCP transcription factor), e no genótipo suscetível, podem ser listados nove (coatomer protein complex, monoamine-oxidase A repressor R1, synaptobrevin, haloacid dehalogenase-like hydrolase, ADP-ribosylation factor, mTERF, serine protease S1C HtrA-related, legume lectin e SWI/SNF-related chromatin binding). Na análise de expressão gênica espacial e temporal, os transcritos mais promissores para uso em trabalhos futuros de transformação genética foram: aquaporin nodulin MTN3, E3 ubiquitin ligase, serine/threonine protein kinase, glycosyl hydrolase e HSP 70 protein, uma vez que tiveram uma expressão bastante pronunciada no genótipo tolerante. Através das análises in silico, baseadas nos genes ortólogos de A. thaliana, foram descobertos processos e vias metabólicas que podem estar envolvidos na resposta do feijoeiro comum ao déficit hídrico. Além disso, foram identificados genes… Advisors/Committee Members: Mui, Tsai Siu.

Subjects/Keywords: Electrophoresis; Eletroforese; PCR em tempo real; Phaseolus vulgaris; Phaseolus vulgaris; Real-time PCR; Transcriptome; Transcritoma

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APA (6^th Edition):

Biazuzo, M. M. d. A. (2013). Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Biazuzo, Milena Moura de Araujo. “Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum.” 2013. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 17, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Biazuzo, Milena Moura de Araujo. “Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Biazuzo MMdA. Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/ ;.

Council of Science Editors:

Biazuzo MMdA. Análise da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância ao déficit hídrico em feijoeiro comum. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2013. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/64/64133/tde-03092013-141700/ ;

Brno University of Technology

14. Šurková, Alice. Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR.

Degree: 2019, Brno University of Technology

URL: http://hdl.handle.net/11012/80679

► The thesis has optimized DNA isolation from pure yoghurt cultures and yoghurt products. The isolated DNA was than subjected to RT-PCR analysis. In the first… (more)

Subjects/Keywords: PCR; PCR v reálném čase; amplifikace DNA; izolace DNA; jogurtové kultury; PCR; real-time PCR; DNA amplification; DNA isolation; yoghurt cultures

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APA (6^th Edition):

Šurková, A. (2019). Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR. (Thesis). Brno University of Technology. Retrieved from http://hdl.handle.net/11012/80679

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Šurková, Alice. “Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR.” 2019. Thesis, Brno University of Technology. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/11012/80679.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Šurková, Alice. “Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR.” 2019. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Šurková A. Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR. [Internet] [Thesis]. Brno University of Technology; 2019. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/11012/80679.

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Council of Science Editors:

Šurková A. Optimalizace izolace DNA jogurtových kultur a její detekce pomocí RT-PCR: Optimization of DNA isolation form yogurt cultures and their detection by RT-PCR. [Thesis]. Brno University of Technology; 2019. Available from: http://hdl.handle.net/11012/80679

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Universidade Federal de Viçosa

15. Salvador Lima Brito Júnior. Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean.

Degree: 2007, Universidade Federal de Viçosa

URL: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1024

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Ferrugem asiática da soja, uma doença causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, tem provocado sérios danos econômicos à sojicultura brasileira e mundial. A obtenção de linhagens… (more)

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Ferrugem asiática da soja, uma doença causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, tem provocado sérios danos econômicos à sojicultura brasileira e mundial. A obtenção de linhagens de soja resistentes ao fungo tem sido um desafio, e atualmente as medidas de controle da doença são baseadas no manejo da cultura e aplicação de fungicidas. Com o objetivo de avançar o conhecimento sobre o mecanismo molecular de defesa da planta frente a ferrugem asiática da soja, avaliou-se, através da técnica de PCR em tempo real, a expressão de genes que supostamente estão envolvidos no mecanismo de defesa. Dois genótipos foram selecionados para a condução do experimento, PI 230970, que possui o alelo Rpp2 e desenvolve lesões do tipo RB, quando em presença de P. pachyrhizi, e Embrapa-48, suscetível, desenvolvendo lesões tipo TAN. O experimento foi conduzido em sala climatizada (Fitotron) e para a análise de expressão gênica foram extraídos RNAs de folhas da soja inoculadas com o patógeno e falso-inoculadas (água). Dentre os genes avaliados, quitinase apresentou uma expressão 117 vezes maior no genótipo resistente (PI 230970), quando comparado com o calibrador (PI 230970 falso-inoculado), atuando possivelmente como uma barreira de defesa da planta. No genótipo suscetível a expressão deste gene foi 1,75 vezes maior que o seu calibrador (Embrapa-48 falsoinoculado). Foi observada uma expressão diferencial de genes relacionados a espécies reativas de oxigênio, produção de fitoalexinas bem como genes envolvidos na liberação de elicitores. Esses genes podem estar atuando no mecanismo de defesa contra P. pachyrhizi no genótipo resistente, porem sua expressão também no genótipo suscetível pode estar relacionado a uma maior colonização do patógeno no tecido hospedeiro ou uma resposta tardia à infecção. A identificação de uma rota de defesa pode possibilitar o estudo mais aprofundado da mesma, com o objetivo de identificar genes mais específicos no processo de defesa celular e apontar novas alternativas para obtenção de cultivares resistente.

Soybean Asian Rust, a disease caused by the fungi Phakopsora pachyrhizi, has caused serious economic damages to the Brazilian and world-wide soybean crop. The development of soybean lines resistant to this fungi has been a challenge, and currently the measures of control this disease are based on the handling of the crop and application of fungicides. With the objective to advance the knowledge on the molecular mechanism of defense of the plant to the Soybean Asian Rust, it was evaluated, by PCR in real time, the expression of genes that supposedly are involved in the defense mechanism. Two genotypes had been selected for the conduction of the experiment, PI 230970, that it possess allele Rpp2 and develops type RB type injuries, when in presence of P. pachyrhizi, and Embrapa-48, susceptible, which develops injuries of Tan type. The experiment was carried out in Fitotron and for the analysis of the gene expression was done using RNAs from leaves of the soybean inoculated either with pathogen or mock-inoculated…

Advisors/Committee Members: Eveline Teixeira Caixeta, Ney Sussumu Sakiyama, Múcio Silva Reis, Aluízio Borém de Oliveira, Francismar Corrêa Marcelino.

Subjects/Keywords: GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS; Glycine max; Gene expression; Glycine max; Real time PCR; Real time PCR; Expressão gênica

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APA (6^th Edition):

Júnior, S. L. B. (2007). Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean. (Thesis). Universidade Federal de Viçosa. Retrieved from http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1024

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Júnior, Salvador Lima Brito. “Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean.” 2007. Thesis, Universidade Federal de Viçosa. Accessed January 17, 2021. http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1024.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Júnior, Salvador Lima Brito. “Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean.” 2007. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Júnior SLB. Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2007. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1024.

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Council of Science Editors:

Júnior SLB. Analysis of gene expression induced for Phakopsora pachyrhizi in soybean. [Thesis]. Universidade Federal de Viçosa; 2007. Available from: http://www.tede.ufv.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1024

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Brno University of Technology

16. Papala, František. Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques.

Degree: 2020, Brno University of Technology

URL: http://hdl.handle.net/11012/195298

► The aim of this bachelor thesis is the identification of plant DNA in a complex matrix using molecular techniques. The work first focuses on a… (more)

Subjects/Keywords: Izolace rostlinné DNA; borůvka; real-time PCR; HRM analýza; Isolation of Plant DNA; Blueberry; Real-time PCR; HRM Analysis

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APA (6^th Edition):

Papala, F. (2020). Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques. (Thesis). Brno University of Technology. Retrieved from http://hdl.handle.net/11012/195298

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Papala, František. “Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques.” 2020. Thesis, Brno University of Technology. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/11012/195298.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Papala, František. “Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques.” 2020. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Papala F. Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques. [Internet] [Thesis]. Brno University of Technology; 2020. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/11012/195298.

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Council of Science Editors:

Papala F. Identifikace rostlinné DNA v komplexní matrici pomocí molekulárních technik: Identification of DNA from plant foods using molecular techniques. [Thesis]. Brno University of Technology; 2020. Available from: http://hdl.handle.net/11012/195298

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Brno University of Technology

17. Bečička, Martin. Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR.

Degree: 2018, Brno University of Technology

URL: http://hdl.handle.net/11012/81823

► Bachelor thesis is concerned with the visualization of real-time PCR data in MATLAB. Theoretical part of the thesis provides introduction to PCR and real-time PCR,… (more)

Subjects/Keywords: Real-time PCR; GUI; end-point analýza; Matlab; RDML; Real-time PCR; GUI; end-point analysis; Matlab; RDML

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APA (6^th Edition):

Bečička, M. (2018). Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR. (Thesis). Brno University of Technology. Retrieved from http://hdl.handle.net/11012/81823

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Bečička, Martin. “Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR.” 2018. Thesis, Brno University of Technology. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/11012/81823.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Bečička, Martin. “Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR.” 2018. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Bečička M. Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR. [Internet] [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/11012/81823.

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Council of Science Editors:

Bečička M. Analýza dat získaných z genotypizačních esejí z real-time PCR: Analysis of data obtained from genotyping essays from the real-time PCR. [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/11012/81823

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Brno University of Technology

18. Šmíd, Jiří. Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction.

Degree: 2018, Brno University of Technology

URL: http://hdl.handle.net/11012/41901

► We were developing detection methods for three food allergens of plant origin. We used real-time PCR for soy detection in food oriented on gene lec,… (more)

Subjects/Keywords: real-time PCR; soja; pistácie; mandle; potravinové alergeny; real-time PCR; soy; pistachio; almond; food allergens

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APA (6^th Edition):

Šmíd, J. (2018). Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction. (Thesis). Brno University of Technology. Retrieved from http://hdl.handle.net/11012/41901

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Šmíd, Jiří. “Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction.” 2018. Thesis, Brno University of Technology. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/11012/41901.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

MLA Handbook (7^th Edition):

Šmíd, Jiří. “Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction.” 2018. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Šmíd J. Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction. [Internet] [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/11012/41901.

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Council of Science Editors:

Šmíd J. Identifikace DNA rostlinných a živočišných druhů v potravinách použitím polymerázové řetězové reakce: Identification DNA of Plant and Animal Species in Food by Polymerase Chain Reaction. [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/11012/41901

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University of Helsinki

19. Biström, Mia. Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa.

Degree: Department of Basic Veterinary Sciences; Helsingin yliopisto, Eläinlääketieteellinen tiedekunta, Peruseläinlääketieteen laitos; Helsingfors universitet, Veterinärmedicinska fakulteten, Institutionen för basveterinärmedicin, 2009, University of Helsinki

URL: http://hdl.handle.net/10138/14509

► Reovirukset kuuluvat Reoviridae -heimoon ja Orhtoreovirus –sukuun. Ensimmäiset reovirukset löydettiin ihmisen hengitysteistä ja suolistosta, mutta niiden merkitystä taudinaiheuttajana ei tunnettu. Tästä syystä ne nimettiin sanoilla… (more)

▼ Reovirukset kuuluvat Reoviridae -heimoon ja Orhtoreovirus –sukuun. Ensimmäiset reovirukset löydettiin ihmisen hengitysteistä ja suolistosta, mutta niiden merkitystä taudinaiheuttajana ei tunnettu. Tästä syystä ne nimettiin sanoilla "respiratory enteric orphan". Sanojen alkukirjaimista muodostuu nimi "reo". Lintujen reoviruksia on löydetty useista lintulajeista. Ne voivat olla mukana aiheuttamassa sairauksia, mutta niitä löytyy yleisesti myös kliinisesti täysin terveistä yksilöstä. Reovirukset aiheuttavat siipikarjalle kinnerjänteen tulehdusta (artriitti) sekä jännetupin tulehdusta (tenosynoviitti). Reovirukset ovat taloudellisesti merkittävä virusryhmä niiden aihettamien tuotantotappioiden vuoksi. Tutkielman tarkoituksena oli perustaa elintarviketurvallisuusvirasto Eviran eläintautivirologian tutkimusyksikköön diagnostinen menetelmä lintujen reovirusten osoittamiseksi. Aihe tuli ajankohtaiseksi, kun teuraslinjoilla havaittiin broilereita, joiden kinnernivelet olivat tulehtuneet ja vihertävät. Monilla todettiin myös akillesjänteen repeämä. Tulehdusoireet muistuttivat paljolti kirjallisuudessa kuvattua artriittia ja tenosynoviittia. Tautia ei ole aiemmin varmuudella todettu siipikarjalla Suomessa. Menetelmäksi valittiin RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) sen herkkyyden ja nopeuden vuoksi. Lisäksi menetelmän etuna on se, ettei se edellytä elävän viruksen löytymistä, vaan viruksen genomin läsnäolo riittää positiiviseen diagnoosiin. Työssä kokeiltiin myös real time RT-PCR:n toimivuutta. Kolmea eri reoviruskantaa käytettiin menetelmän kehityksessä kontrollikantoina. Tutkielman tuloksena luotiin RT-PCR –menetelmä reovirusten toteamiseksi. Näytemateriaalina oli 37 broilerin ja kahden kalkkunan tulehtuneet jänteet ja jännetupet. Niistä eristettiin totaaliRNA ja tehtiin RT-PCR yhdellä tai useammalla kolmesta eri reoviruksille spesifistä alukeparista. Lisäksi jännenäytteitä käytettiin solulinjojen infektioon mahdollisten virusten kasvattamiseksi. Jännenäytteistä reoviruksia ei todettu PCR:llä eikä soluviljelyssä. Se ei kuitenkaan välttämättä tarkoita, että tulehdus ei olisi reovirksen aiheuttama. Jos reovirus on tulehduksen aiheuttaja, sitä ei löytynyt näytteistä todennäköisesti tulehduksen kroonistumisen vuoksi. Tulehduksen alkuvaiheessa otetuista näytteistä virusta saattaisi löytyä paremmin.

Subjects/Keywords: reovirus; tenosynoviitti; artriitti; RT-PCR; real time RT-PCR; Mikrobiologia ja epidemiologia; Mikrobiologi och epidemiologi; Microbiology and Epidemiology; reovirus; tenosynoviitti; artriitti; RT-PCR; real time RT-PCR

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APA (6^th Edition):

Biström, M. (2009). Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa. (Thesis). University of Helsinki. Retrieved from http://hdl.handle.net/10138/14509

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Biström, Mia. “Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa.” 2009. Thesis, University of Helsinki. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/10138/14509.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Biström, Mia. “Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa.” 2009. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Biström M. Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa. [Internet] [Thesis]. University of Helsinki; 2009. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/10138/14509.

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Council of Science Editors:

Biström M. Reovirusten osuus broilereiden artriitissa ja tenosynoviitissa. [Thesis]. University of Helsinki; 2009. Available from: http://hdl.handle.net/10138/14509

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University of Vienna

20. Kern, Carola Christina. Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR.

Degree: 2010, University of Vienna

URL: http://othes.univie.ac.at/10078/

► Die Authentizitätsbestimmung von Lebensmitteln ist in den letzten Jahren zu einer treibenden Kraft für die Entwicklung DNA-basierter Methoden zur Aufdeckung von Verfälschungen und fehlerhaften Deklarationen… (more)

▼ Die Authentizitätsbestimmung von Lebensmitteln ist in den letzten Jahren zu einer treibenden Kraft für die Entwicklung DNA-basierter Methoden zur Aufdeckung von Verfälschungen und fehlerhaften Deklarationen auf Lebensmitteln ebenso wie zum Schutz des Konsumenten vor potentiellen Gesundheitsrisiken wie Allergenen gewachsen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden zwei verschiedene spezies-spezifische PCR Systeme eingesetzt um Kuhmilchanteile in Schafkäsen und Sojamilchprodukten nachweisen zu können. Die verwendeten Primer zielten dabei auf das mitochondriale 12S rRNA Gen bzw. das mitochondriale Cytochromoxidase II Gen der Rinder ab. Beide Systeme erlaubten den qualitativen Nachweis einer minimalen Konzentration von 0,1% Kuhmilchanteil in Standardmischungskäsen aus Schaf- und Kuhmilch ebenso wie in einer Standardmischungsreihe aus Kuh- und Sojamilch. Dieselben PCR Systeme konnten auch zum qualitativen Nachweis von Kuhmilchanteilen in zwölf verschiedenen im Handel erhältlichen Sojamilchprodukten angewendet werden. Um auch quantitative Aussagen über den enthaltenen Kuhmilchanteil in Schafkäsen und Sojamilchprodukten zu ermöglichen, wurde außerdem Real-time PCR eingesetzt. Dabei wurde SYBR Green als Fluoreszenzfarbstoff verwendet und mit Hilfe einer Schmelzkurvenanalyse die Spezifität der amplifizierten Produkte überprüft. Für den quantitativen Nachweis von Kuhmilchanteilen in Schafkäse wurde ein rinderspezifisches Primerpaar verwendet, das auf das mitochondriale 12S rRNA Gen des Rindes abzielt und ein 256 bp Amplikon liefert. In Kombination mit dem speziesspezifischen Primerpaar wurde auch ein Universalprimerpaar eingesetzt. Das daraus resultierende Amplikon war eine 464 bp lange Sequenz des mitochondrialen Cytochrom b Gens. Die unter Verwendung des Universalprimerpaares erzielten Ergebnisse wurden eingesetzt um die Resultate des speziesspezifischen Primerpaares zu normalisieren. Das Universalprimerpaar fungierte also als endogene Kontrolle, die den gesamten Gehalt an amplifizierbarer DNA in der Probe anzeigen sollte. Zur Quantifizierung wurden aus Schaf- und Kuhmilch hergestellte Käse einer Mischungsreihe als Standards herangezogen, deren Kuhmilchanteil bekannt war. Für die Quantifizierung des Kuhmilchanteils in Sojamilchprodukten wurde dieselbe rinderspezifische 256 bp lange Gensequenz als Zielregion verwendet. Der Universalprimer war auf das nukleäre 18S rRNA Gen eukaryontischer DNA gerichtet und ergab ein 137 bp Amplikon. Eine Mischungsreihe aus Kuh- und Sojamilch mit bekannten Konzentrationen der jeweiligen Komponente wurde als Standard eingesetzt. Das System lieferte verlässliche Ergebnisse und konnte so auch zur Quantifizierung des Kuhmilchanteils in den im Handel erhältlichen Sojamilchprodukten verwendet werden. Dabei wurden jene vier Proben untersucht, die bereits mittels speziesspezifischer PCR positive oder fragwürdige Resultate erzielten. Die eben beschriebene Real-time PCR Methode erlaubte die Quantifizierung des Kuhmilchanteils in allen vier Proben. Es hat sich gezeigt, dass die Real-time PCR eine schnelle,…

Subjects/Keywords: 42.99 Biologie: Sonstiges; 44.21 Ernährung; 42.13 Molekularbiologie; PCR / Real-time PCR / Milchprodukte / Käse / Sojamilchprodukte / Spezies / Nachweis; PCR / Real-time PCR / dairy products / cheese / soy milk products / species / detection

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APA (6^th Edition):

Kern, C. C. (2010). Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR. (Thesis). University of Vienna. Retrieved from http://othes.univie.ac.at/10078/

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Kern, Carola Christina. “Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR.” 2010. Thesis, University of Vienna. Accessed January 17, 2021. http://othes.univie.ac.at/10078/.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Kern, Carola Christina. “Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR.” 2010. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Kern CC. Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR. [Internet] [Thesis]. University of Vienna; 2010. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://othes.univie.ac.at/10078/.

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Council of Science Editors:

Kern CC. Speziesdifferenzierung in Milch- und Sojamilchprodukten mittels Real-time PCR und PCR. [Thesis]. University of Vienna; 2010. Available from: http://othes.univie.ac.at/10078/

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Technical University of Lisbon

21. Marques, Ana Isabel Ambrósio. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

►

Mestrado em Engenharia Agronómica - Protecção das Plantas - Instituto Superior de Agronomia

Phytoplasmas are unicellular organisms, prokaryotes, cell wall-less that cause diseases in hundreds… (more)

Subjects/Keywords: phytoplasmas; 16SrX group; psyllids; nested-PCR; real-time PCR; Candidatus; phytoplasma pyri

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APA (6^th Edition):

Marques, A. I. A. (2011). Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Marques, Ana Isabel Ambrósio. “Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 17, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Marques, Ana Isabel Ambrósio. “Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Marques AIA. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117.

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Council of Science Editors:

Marques AIA. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

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Universidade do Rio Grande do Sul

22. Rozales, Franciéli Pedrotti. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.

Degree: 2013, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/72990

►

A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do… (more)

▼

A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do Mycobacterium tuberculosis, prevenindo a transmissão da TB. O objetivo deste estudo foi avaliar dois testes moleculares para detecção de bactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC) diretamente de amostras clínicas. Foi realizado um estudo transversal, no qual foram selecionadas 124 amostras respiratórias. As amostras foram avaliadas por dois testes moleculares “in house” para detecção do MTBC: NESTED-PCR (NPCR) e Real Time PCR (RT-PCR) ambos com primers para o IS6110. As amostras também foram avaliadas por um teste direto (pesquisa de BAAR). Os resultados foram comparados com a cultura para M.tuberculosis e também com os resultados da cultura juntamente com dados clínicos. Uma amostra comercial com quantificação de DNA conhecida foi utilizada para determinação do Limite de Detecção (LOD) dos testes moleculares. O LOD foi de 1 cópia/μL para o RT-PCR e de 25 cópias/μL para o NPCR. O BAAR apresentou baixa sensibilidade - SE - (40%) e alta especificidade - SP - (94%). Ambos os ensaios moleculares, apresentaram elevada SE e SP (RT-PCR 98% e 91%, NPCR 86% e 93%, respectivamente) em relação à cultura. Quando comparamos os resultados frente a cultura juntamente com os dados clínicos, a SE e a SP foram de 90% e 97% para a RT-PCR e de 80% e 99% para a NPCR, respectivamente. Houve um pequeno decréscimo da SE dos métodos moleculares, quando comparados com a cultura mais os dados clínicos em relação à cultura isoladamente, no entanto, a SP foi consideravelmente elevada para os três métodos avaliados. Avaliamos o custo dos insumos para os ensaios moleculares: o custo do NPCR foi de 17.77/teste enquanto que o custo do RT-PCR foi de 15.76/teste. Em relação ao tempo de execução dos testes o RT-PCR foi mais rápido (2 horas) do que o NPCR (4 horas). Este estudo confirma que técnicas de PCRs podem ser muito úteis para o diagnóstico rápido da TB respiratória, com altas taxas de SP. Ele também pode ser muito importante para a exclusão de diagnóstico, considerando o alto VPN encontrados no nosso estudo. Os resultados demonstraram que os ensaios moleculares visando IS6110 do M. tuberculosis podem ajudar a melhorar o diagnóstico da TB pulmonar, com muitos potenciais efeitos positivos para a gestão clínica e de controle da doença.

Tuberculosis (TB) remains as an important public health problem worldwide. Therefore, the rapid detection of M. tuberculosis is of primary importance to effectively reduce transmission among patients. The aims of this study were to evaluate two molecular tests to detect M. tuberculosis complex (MTBC) directly from clinical samples. The study included 124 respiratory samples which were evaluated by two in house molecular assays for MTBC detection: Nested PCR (NPCR) and Real Time PCR (RT-PCR). The respiratory samples were also evaluated by the direct test (AFB assay). The results were compared with the results of culture and also compared…

Advisors/Committee Members: Barth, Afonso Luis.

Subjects/Keywords: Real time PCR; Mycobacterium tuberculosis; Nested PCR; Tuberculose; Tuberculosis; Diagnostico molecular; IS 6110; Clinical criteria

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APA (6^th Edition):

Rozales, F. P. (2013). Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/72990

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Rozales, Franciéli Pedrotti. “Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.” 2013. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/10183/72990.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Rozales, Franciéli Pedrotti. “Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Rozales FP. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/72990.

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Council of Science Editors:

Rozales FP. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2013. Available from: http://hdl.handle.net/10183/72990

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University of Alberta

23. Bartusiak, Robert. Gene expression and BSE progression in beef cattle.

Degree: MS, Department of Agricultural, Food, and Nutritional Science, 2009, University of Alberta

URL: https://era.library.ualberta.ca/files/2514nk66z

► Bovine Spongiform Encephalopathy (BSE) belongs to a group of neurodegenerative diseases known as transmissible spongiform encephalopathies (TSEs) which affect many species. From 1986 more than… (more)

Subjects/Keywords: beef cattle; RT-PCR; gene expression; innate immunity; real time PCR; BSE

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APA (6^th Edition):

Bartusiak, R. (2009). Gene expression and BSE progression in beef cattle. (Masters Thesis). University of Alberta. Retrieved from https://era.library.ualberta.ca/files/2514nk66z

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Bartusiak, Robert. “Gene expression and BSE progression in beef cattle.” 2009. Masters Thesis, University of Alberta. Accessed January 17, 2021. https://era.library.ualberta.ca/files/2514nk66z.

MLA Handbook (7^th Edition):

Bartusiak, Robert. “Gene expression and BSE progression in beef cattle.” 2009. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Bartusiak R. Gene expression and BSE progression in beef cattle. [Internet] [Masters thesis]. University of Alberta; 2009. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://era.library.ualberta.ca/files/2514nk66z.

Council of Science Editors:

Bartusiak R. Gene expression and BSE progression in beef cattle. [Masters Thesis]. University of Alberta; 2009. Available from: https://era.library.ualberta.ca/files/2514nk66z

Univerzitet u Beogradu

24. Vejnović, Branislav, 1989- 21616487. Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu.

Degree: Fakultet veterinarske medicine, 2019, Univerzitet u Beogradu

URL: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20112/bdef:Content/get

►

Veterinarska medicina - Veterinarska ekonomika, Veterinarska genetika / Veterinary Medicine - Veterinary Economics, Veterinary Genetics

Zbog nepostojanja molekularne metode za determinaciju vrsta pčelinjih tripanozoma Crithidia… (more)

▼

Veterinarska medicina - Veterinarska ekonomika, Veterinarska genetika / Veterinary Medicine - Veterinary Economics, Veterinary Genetics

Zbog nepostojanja molekularne metode za determinaciju vrsta pčelinjih tripanozoma Crithidia mellificae i Lotmaria passim bez naknadnog sekvencioniranja, definisan je cilј ovog rada, a to je molekularna identifikacija tripanozome L. passim i ispitivanje njenog uticaja na zdravlјe pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelastvu. Razvijeni su specijes-specifični prajmeri za PCR detekciju C. mellificae i L. passim kao i real-time PCR metoda za detekciju i kvantifikaciju L. passim. Uzorci pčela koji su sakupljani u Srbiji u devetogodišnjem periodu (2007-2015) retrospektivno su analizirani kako bi se utvrdila prevalencija ovog eukariotskog parazita molekulanrnom analizom DNA. Kako bi se utvrdila godišnja dinamika L. passim, njen uticaj na oksidativni stres, kao i na ekonomsku dobit formirane su dve grupe košnica. Istraživanje je sprovedeno na ukupno dvadeset Langstroth košnica, 10 košnica koje su bile L. passim-pozitivne i 10 košnica koje su bile L. passim-negativne, a koje su se nalazile na dva različita pčelinjaka. Tokom trajanja eksperimenta (od marta 2016. do marta 2017. godine) svakog meseca izuzev zimskih meseci (oktobar-februar) iz svake košnice je uzorkovano najmanje 120 živih odraslih pčela sa leta košnice (za detekciju i kvantifikaciju L. passim i Nosema spp), a u junu i septembru 20 živih odraslih pčela za potrebe analize parametara oksidativnog stresa. Razvijeni su specijes-specifični prajmeri za PCR detekciju tripanozoma vrste C. mellificae i L. passim, koji su validirani i u uslovima mešovite infekcije, kao i infekcije tripanozomom bumbara Crithidia bombi. Infekcija sa N. apis i N. ceranaesu analizirane korišćenjem PCR. Tehnikom real-time PCR je utvrđen nivo infekcije vrstom L. passim kod L. passim-pozitivnih društva, dok je brojanjem spora određen nivo infekcije sa N. ceranae u svim društvima. Analizirani su uzorci pčela iz 162 društva (18 iz svake godine), koji su prikupljeni sa 57 različitih lokacija. L. passim je detektovana u uzorcima koji su poticali iz svake godine i kod prosečno 62,3% (godišnja prevalencija od 38,9% do 83,3%)...

Advisors/Committee Members: Stevanović, Jevrosima, 1970- 12809575.

Subjects/Keywords: Apis mellifera; trypanosomatidae; microsporidia; PCR; real-time PCR; molecular detection; cost-benefit analysis

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APA (6^th Edition):

Vejnović, Branislav, 1. 2. (2019). Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu. (Thesis). Univerzitet u Beogradu. Retrieved from https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20112/bdef:Content/get

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Vejnović, Branislav, 1989- 21616487. “Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu.” 2019. Thesis, Univerzitet u Beogradu. Accessed January 17, 2021. https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20112/bdef:Content/get.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vejnović, Branislav, 1989- 21616487. “Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu.” 2019. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Vejnović, Branislav 12. Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu. [Internet] [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2019. [cited 2021 Jan 17]. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20112/bdef:Content/get.

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Council of Science Editors:

Vejnović, Branislav 12. Molekularno-genetička identifikacija tripanozome Lotmaria passim Schwarz, 2014 i analiza njenih efekata na zdravlje pčelinjih zajednica i ekonomske efekte u pčelarstvu. [Thesis]. Univerzitet u Beogradu; 2019. Available from: https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:20112/bdef:Content/get

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University of Manitoba

25. Van Walleghem, Elissa. Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens).

Degree: Biological Sciences, 2013, University of Manitoba

URL: http://hdl.handle.net/1993/30754

► Namao virus (NV) was associated with mortality in lake sturgeon Acipenser fulvescens reared as part of a conservation stocking program for this endangered species in… (more)

Subjects/Keywords: Namao virus; NCLDV; Lake Sturgeon; Endangered species; qPCR; Diagnostic PCR; Real-time PCR; Mimiviridae

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APA (6^th Edition):

Van Walleghem, E. (2013). Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens). (Masters Thesis). University of Manitoba. Retrieved from http://hdl.handle.net/1993/30754

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Van Walleghem, Elissa. “Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens).” 2013. Masters Thesis, University of Manitoba. Accessed January 17, 2021. http://hdl.handle.net/1993/30754.

MLA Handbook (7^th Edition):

Van Walleghem, Elissa. “Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens).” 2013. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Van Walleghem E. Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens). [Internet] [Masters thesis]. University of Manitoba; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://hdl.handle.net/1993/30754.

Council of Science Editors:

Van Walleghem E. Analytical performance characteristics and application of diagnostic tests for Namao virus in experimentally infected and wild Manitoba lake sturgeon (Acipenser fulvescens). [Masters Thesis]. University of Manitoba; 2013. Available from: http://hdl.handle.net/1993/30754

Technical University of Lisbon

26. Brito, Renata Alves Paiva de. Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4086

►

Mestrado em Engenharia Zootécnica - Produção Animal - Instituto Superior de Agronomia

The effect of food restriction on expression of genes encoding the regulatory enzymes… (more)

Subjects/Keywords: lambs; food restriction; intermediary metabolism; gene expression; real-time PCR

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APA (6^th Edition):

Brito, R. A. P. d. (2011). Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4086

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Brito, Renata Alves Paiva de. “Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 17, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4086.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Brito, Renata Alves Paiva de. “Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Brito RAPd. Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4086.

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Council of Science Editors:

Brito RAPd. Estudo da expressão génica de enzimas reguladoras do metabolismo intermediário em ovinos sujeitos a restrição alimentar. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4086

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Technical University of Lisbon

27. Ramos, Miguel de Jesus Nunes. A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4099

►

Mestrado em Biologia Funcional - Instituto Superior de Agronomia

The cork oak (Quercus suber) is an important species in Portugal, mainly due to the economic… (more)

Subjects/Keywords: Quercus suber; cork; DNA methyltransferases; phellogen; image analysis; real-time PCR

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Ramos, M. d. J. N. (2011). A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4099

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Ramos, Miguel de Jesus Nunes. “A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 17, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4099.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Ramos, Miguel de Jesus Nunes. “A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Ramos MdJN. A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4099.

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Council of Science Editors:

Ramos MdJN. A qualidade da cortiça e a sua relação com a expressão génica no felogénio de Quercus suber. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4099

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Technical University of Lisbon

28. Araújo, Sofia Gomes Melvill. Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4106

►

Mestrado em Engenharia Agronómica - Instituto Superior de Agronomia

Title: Analysis at molecular level of the apple-scab interaction in a resistant and susceptible host This… (more)

Subjects/Keywords: Malus x domestica; apple scab; host-parasite interaction; real-time PCR

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APA (6^th Edition):

Araújo, S. G. M. (2011). Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4106

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Araújo, Sofia Gomes Melvill. “Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 17, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4106.

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Araújo, Sofia Gomes Melvill. “Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível.” 2011. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Araújo SGM. Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4106.

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Araújo SGM. Análise a nivel molecular da interacção pedrado-macieira num hospedeiro resistente e num hospedeiro susceptível. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4106

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NSYSU

29. Li, Jia-Yuan. Isolation and Characteristic Analysis of Mercury Resistant Bacteria.

Degree: Master, Biological Sciences, 2013, NSYSU

URL: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0701113-153125

► A combination of PCP, mercury and dioxin polluted site in Southern Taiwan causes great damage to the natural environment and endangers the health of nearby… (more)

Subjects/Keywords: merA gene; real time PCR; mercuric reductase; DGGE; mercury

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Li, J. (2013). Isolation and Characteristic Analysis of Mercury Resistant Bacteria. (Thesis). NSYSU. Retrieved from http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0701113-153125

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Li, Jia-Yuan. “Isolation and Characteristic Analysis of Mercury Resistant Bacteria.” 2013. Thesis, NSYSU. Accessed January 17, 2021. http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0701113-153125.

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Li J. Isolation and Characteristic Analysis of Mercury Resistant Bacteria. [Internet] [Thesis]. NSYSU; 2013. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0701113-153125.

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Li J. Isolation and Characteristic Analysis of Mercury Resistant Bacteria. [Thesis]. NSYSU; 2013. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0701113-153125

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NSYSU

30. Kuo, Chia-chou. Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS.

Degree: Master, Institute of Biomedical Sciences, 2005, NSYSU

URL: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0802105-002913

► Abstract Legionella species and Chlamydia pneumoniae are a common cause of community-acquired pneumonia and occasional cause of hospital-acquired pneumonia. Significant mortality rates among the elderly… (more)

Subjects/Keywords: legionella; real-time PCR; chlamydia

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Kuo, C. (2005). Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS. (Thesis). NSYSU. Retrieved from http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0802105-002913

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Kuo, Chia-chou. “Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS.” 2005. Thesis, NSYSU. Accessed January 17, 2021. http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0802105-002913.

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Kuo, Chia-chou. “Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS.” 2005. Web. 17 Jan 2021.

Vancouver:

Kuo C. Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS. [Internet] [Thesis]. NSYSU; 2005. [cited 2021 Jan 17]. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0802105-002913.

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Kuo C. Development of a Real-Time PCR Assay to Detect Legionella Species and Chlamydia pneumoniae from Clinical Specimens of Patients with Community-acquired Pneumonia in VGHKS. [Thesis]. NSYSU; 2005. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0802105-002913

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