subject:(RNA mensageiro)

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Universidade do Rio Grande do Sul

1. Silva, Weber Cláudio Francisco Nunes da. Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial.

Degree: 2009, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/19087

► As memórias não são armazenadas em sua forma definitiva logo após sua aquisição. Para que isso ocorra, há a necessidade de um longo processo de… (more)

▼ As memórias não são armazenadas em sua forma definitiva logo após sua aquisição. Para que isso ocorra, há a necessidade de um longo processo de estabilização conhecido como consolidação, que requer a indução de expressão gênica e de síntese proteica em várias regiões do cérebro, dentre elas o hipocampo, estrutura de importância capital para a formação de memórias declarativas. Após a consolidação, as memórias tornam-se novamente instáveis logo após a evocação, e para persistirem necessitam ser reestabilizadas através de um processo denominado reconsolidação, que também envolve a ativação de síntese proteica no hipocampo. Dentro deste cenário, até o momento da realização deste trabalho, não havia nenhum estudo disponível sobre o efeito da inibição da transcrição gênica sobre a consolidação e reconsolidação de memórias espacias, um tipo de memória declarativa dependente do hipocampo para ser formada e armazenada. Portanto, visando contribuir para o esclarecimento desta questão, no presente trabalho foi investigado o efeito da inibição pós-treino e pós-evocação da síntese de mRNA hipocampal sobre a retenção de uma memória espacial, utilizando dois distintos inibidores da síntese de mRNA. Nós mostramos que a inibição da expressão gênica no hipocampo dorsal de ratos, durante uma restrita janela temporal pós-treino ou pós-teste, prejudica a retenção da memória espacial de longa duração para a tarefa do labirinto aquático de Morris, sem afetar a memória de curto prazo, o aprendizado não-espacial, ou a funcionalidade do hipocampo. Nossos resultados indicam que a consolidação de uma memória espacial induz a ativação da maquinaria transcricional hipocampal, e sugere a existência de um processo de reconsolidação dependente de expressão gênica que funciona no hipocampo dorsal no momento da evocação para estabilizar o traço mnemônico reativado. Advisors/Committee Members: Izquierdo, Ivan Antonio.

Subjects/Keywords: Memória; Aprendizagem; RNA mensageiro; Transcrição genética; Hipocampo

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APA (6^th Edition):

Silva, W. C. F. N. d. (2009). Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/19087

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Silva, Weber Cláudio Francisco Nunes da. “Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial.” 2009. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/19087.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Silva, Weber Cláudio Francisco Nunes da. “Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial.” 2009. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Silva WCFNd. Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/19087.

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Council of Science Editors:

Silva WCFNd. Inibição da síntese de mRNA no hipocampo prejudica a consolidação e a reconsolidação de memória espacial. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. Available from: http://hdl.handle.net/10183/19087

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Universidade do Rio Grande do Sul

2. Sperb, Fernanda. Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas.

Degree: 2008, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/13625

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A eritropoietina (EPO) é um hormônio que pertence a um grupo de fatores de crescimento hematopoiético, controlando a proliferação e a diferenciação de células da… (more)

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A eritropoietina (EPO) é um hormônio que pertence a um grupo de fatores de crescimento hematopoiético, controlando a proliferação e a diferenciação de células da medula óssea. Ela age induzindo a elevação da produção de células vermelhas, aumentando a quantidade de hemoglobina e o oxigênio circulante. Este hormônio é principalmente secretado pelo rim, e é amplamente usado na medicina no tratamento de anemias, desordens renais e cardíacas, tumores e diversas outras doenças. A EPO recombinante tem sido produzida em células de mamíferos (COS-1 e CHO) em culturas in vitro e tem sido expressa experimentalmente em células de insetos, leveduras e bactérias. Até o momento, há somente uma descrição da expressão transgênica desta proteína em plantas sem, no entanto, sucesso na regeneração de plantas saudáveis e férteis. No presente trabalho, plantas transgênicas de arroz (Oryza sativa) e tabaco (Nicotiana tabaccum) contendo o gene da EPO foram geradas, nas quais foi avaliada a expressão gênica e detectada a presença da proteína recombinante. O gene recombinante da EPO utilizado foi sintetizado baseado na técnica de “overlapping” de nucleotídeos. Um fragmento de 582 pb correspondente ao cDNA da EPO foi clonado e submetido a seqüenciamento automático. Uma mutação no nucleotídeo 252 (G A) foi identificada, o que não modificou o aminoácido codificado pelo códon, uma glicina. O fragmento foi transferido para o vetor de expressão pWUbi.tm1, o qual contém o promotor do gene da ubiquitina e o terminador tm1'. Este cassete de expressão foi transferido para o vetor binário pWBVec4a, que foi transformado nas cepas AGL1 e LBA4404 de Agrobacterium tumefaciens. Estas cepas foram utilizadas na transformação de arroz e de tabaco, respectivamente. A integração do transgene no genoma da planta foi comprovada por PCR. A expressão da EPO nas plantas de tabaco foi detectada por RT-PCR convencional e quantitiativa, e a presença da proteína foi avaliada por SDS-PAGE e Western blot, provando o sucesso da obtenção de plantas transgênicas de tabaco expressando EPO. Foi obtida por auto-fecundação a geração T1, a qual apresentou segregação mendeliana. Nenhuma das plantas avaliadas apresentou qualquer tipo de deformidade ou mal-formação. Não foi possível a obtenção de plantas de arroz transgênicas devido à deficiência das mesmas no processo de regeneração, possivelmente em conseqüência da super-expressão do transgene em função do promotor escolhido.

Erythropoietin (EPO) is a hormone that belongs to a group of growth hematopoeitic factors, which control the proliferation and differentiation of marrow bone´s cells. It acts inducing the production of blood red cells, increasing the amount of circulating hemoglobin and oxygen. This hormone, mostly secreted by kidneys, is widely used in medicine as a treatment for anaemia, kidney and heart disorders, tumors and numerous diseases. Recombinant EPO has been produced in mammalian cells (COS-1 and CHO) cultured in vitro and has been also experimentally inserted into insect, yeast and bacterial cells. Up to now,…

Advisors/Committee Members: Pasquali, Giancarlo.

Subjects/Keywords: Eritropoetina; Plantas transgênicas; RNA mensageiro; Nicotiana tabacum; Oryza sativa; Biotecnologia

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APA (6^th Edition):

Sperb, F. (2008). Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/13625

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Sperb, Fernanda. “Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas.” 2008. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/13625.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Sperb, Fernanda. “Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas.” 2008. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Sperb F. Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2008. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/13625.

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Sperb F. Expressão transgênica da eritropoietina humana em plantas. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2008. Available from: http://hdl.handle.net/10183/13625

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Universidade do Rio Grande do Sul

3. Rohden, Francieli. Quantificação e análise da expressão do mRNA de proglucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV e modulação in vitro destes genes por ácidos graxos monoinsaturados (cis ou trans) e glicose em jejuno proximal de obesos grau III submetidos à cirurgia bariátrica (RYGB).

Degree: 2009, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/17587

► A obesidade caracterizada pelo excesso de tecido adiposo está associada a comorbidades como diabetes mellitus tipo 2 (DMT2), hipertensão arterial, doenças cardiovasculares e alguns tipos… (more)

▼ A obesidade caracterizada pelo excesso de tecido adiposo está associada a comorbidades como diabetes mellitus tipo 2 (DMT2), hipertensão arterial, doenças cardiovasculares e alguns tipos de câncer. Para pacientes considerados obesos mórbidos (OBM) (IMC>40Kg/m²) a melhor opção terapêutica é a cirurgia de bypass gástrico em Y de Roux (RYGB). Estudos clínicos mostram que após esse procedimento os indivíduos OBM com DMT2 melhoram seu estado. Uma explicação para esse fenômeno é a mudança anatômica que ocorre no trato gastrintestinal, alterando assim a produção das incretinas, GIP e GLP-1, que promovem a liberação de insulina. Essas incretinas são liberadas pela mucosa do intestino delgado na forma de próhormônios e necessitam da ativação feita pela enzima PC 1/3. Carboidratos e ácidos graxos estimulam sua liberação. Após exercerem sua ação são inativadas pela enzima DPP-IV. Logo o objetivo desse trabalho foi a quantificação de mRNA de pró-glucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV em jejuno proximal de OBM DMT2 e não diabetes mellitus tipo 2 (NDM2) , bem como avaliar o efeito, in vitro, de ácidos graxos monoinsaturados cis, trans e glicose sobre esse tecido. O jejuno foi obtido de indivíduos OBM submetidos RYGB. Para a quantificação basal do mRNA dos genes de interesse, o tecido (n=25) retirado na cirurgia foi diretamente imerso em TRIzol para a extração do RNA total. O mRNA foi quantificado pela reação em cadeia da polimerase (qRTPCR). Para avaliar o efeito dos ácidos graxos in vitro, o jejuno (n=5) foi fatiado (400 µm) e incubado em meio DMEM suplementado com 50 µM de acido oléico, elaidico, vaccênico ou 11 mM de glicose por 4 horas a 37°C em atmosfera de 5% de CO2 Entre OBM DMT2 e NDM2 não houve diferença estatística na expressão do mRNA de GIP, GLP-1 e DPP-IV, apenas observamos que indivíduos NDM2 tem tendência a uma maior expressão do mRNA de PC1/3 (p=0,065). No entanto, alguns pacientes não expressaram mRNA de PC1/3. A expressão dos genes estudados foi heterogênea, permitindo a divisão dos pacientes em alta e baixa expressão de GIP, sendo este utilizado como gene calibrador. Constatamos que a expressão de mRNA dos demais genes acompanham o perfil de expressão de GIP. Os testes in vitro revelaram que o ácido oléico diminuiu a expressão do mRNA de DPP-IV; o ácido vaccênico, aumentou significante a expressão do mRNA de próglucagon; e o ácido elaídico, não modulou a expressão dos genes estudados nesse trabalho. O tratamento com alta concentração de glicose aumentou o mRNA da enzimas PC1/3 e DPP-IV. Em conclusão, OBM NDM2 e DMT2 apresentaram expressão heterogênea desses genes não permitindo verificar diferença significativa entre os grupos. Alguns pacientes não expressaram o mRNA da PC1/3, e NDM2 transcreveram maior quantidade de mRNA desta enzima. Sugerimos que no jejuno proximal, os ácidos oleico e vaccênico da dieta, agem diretamente sobre as células e modulam os níveis das incretinas, diminuindo a expressão do mRNA da DPP-IV e aumentando o pró-glucagon, respectivamente. A glicose em altas concentrações estimula a transcrição das… Advisors/Committee Members: Guaragna, Regina Maria Vieira da Costa.

Subjects/Keywords: RNA mensageiro; Incretinas; Obesidade; Cirurgia bariátrica; Ácidos graxos

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APA (6^th Edition):

Rohden, F. (2009). Quantificação e análise da expressão do mRNA de proglucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV e modulação in vitro destes genes por ácidos graxos monoinsaturados (cis ou trans) e glicose em jejuno proximal de obesos grau III submetidos à cirurgia bariátrica (RYGB). (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/17587

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Rohden, Francieli. “Quantificação e análise da expressão do mRNA de proglucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV e modulação in vitro destes genes por ácidos graxos monoinsaturados (cis ou trans) e glicose em jejuno proximal de obesos grau III submetidos à cirurgia bariátrica (RYGB).” 2009. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/17587.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Rohden F. Quantificação e análise da expressão do mRNA de proglucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV e modulação in vitro destes genes por ácidos graxos monoinsaturados (cis ou trans) e glicose em jejuno proximal de obesos grau III submetidos à cirurgia bariátrica (RYGB). [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/17587.

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Council of Science Editors:

Rohden F. Quantificação e análise da expressão do mRNA de proglucagon, GIP, PC1/3 e DPP-IV e modulação in vitro destes genes por ácidos graxos monoinsaturados (cis ou trans) e glicose em jejuno proximal de obesos grau III submetidos à cirurgia bariátrica (RYGB). [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. Available from: http://hdl.handle.net/10183/17587

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4. Cruz, David. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.

Degree: 2011, RCAAP

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.insa.pt:10400.18/2275

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Dissertação de mestrado em Biologia (Biologia Humana e Ambiente) apresentada à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2011

[PT] A expressão génica nos eucariotas… (more)

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Dissertação de mestrado em Biologia (Biologia Humana e Ambiente) apresentada à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2011

[PT] A expressão génica nos eucariotas envolve um número de etapas interligadas desde a transcrição do material genético até à tradução em proteína, sendo os RNAs mensageiros (mRNAs) os intermediários chave ao longo deste processo. Embora a complexidade da expressão génica dos eucariotas permita um controlo da produção proteica a vários níveis, também torna este processo vulnerável a erros. As células eucariotas desenvolveram mecanismos elaborados de controlo de qualidade do mRNA que asseguram a fidelidade da expressão génica através da detecção e degradação de transcritos anómalos. Como exemplo destes mecanismos de controlo de qualidade temos: o NMD (Nonsense-mediated mRNA Decay), que reconhece e elimina mRNAs que contenham codões prematuros de terminação da tradução, e o NSD (Nonstop mRNA Decay) que elimina mRNAs que não possuem codões de terminação em fase na grelha de leitura. O exossoma é um complexo proteico evolutivamente conservado que possui actividade ribonucleolítica e que se encontra presente tanto no núcleo como no citoplasma das células eucariotas. Uma das várias funções do exossoma é participar na degradação de mRNAs anómalos portadores de mutações nonsense ou de mutações nonstop. Como consequência da recente identificação de uma nova ribonuclease, a hDis3L1, como parte integrante do exossoma, este trabalho teve como objectivo avaliar o envolvimento desta subunidade do exossoma humano na degradação inerente ao NMD e ao NSD. Para tal, usaram-se variantes do gene da β-globina humana: um gene portador de mutação nonsense e sensível ao mecanismo de NMD (β39, com uma mutação nonsense no codão 39), um gene sem qualquer codão de terminação em fase (βnonstop) e o correspondente gene normal (βn), como genes modelo. Estes genes clonados em vectores de expressão foram usados para transfectar transitoriamente células HeLa em cultura. Simultaneamente, foram realizados testes de RNA interference (RNAi) através da transfecção de small interference RNAs (siRNAs) específicos para o transcrito que codifica hDis3L1 e, como controlo, siRNAs para um transcrito não específico (luciferase). Nestas condições de inibição da expressão da hDis3L1 ou em condições normais, as células em cultura foram colhidas para extracção do RNA total. O nível de mRNA das globinas foi quantificado por RT-qPCR (quantitative reverse transcription polymerase chain reaction), enquanto que o nível de inibição da expressão de cada transcrito sujeito a RNAi foi avaliado por RT-PCR (semi-quantitative reverse transcription polymerase chain reaction). Em condições de baixa expressão de hDis3L1 na célula, pretendeu-se verificar se os transcritos β39 e βnonstop aumentam de expressão, o que indicaria que o mecanismo de NMD e/ou o mecanismo de NSD ficariam inibidos, sugerindo que a ribonuclease hDis3L1 estaria envolvida no processo de degradação de transcritos com mutações nonsense ou non-stop, respectivamente. De facto, os…

Advisors/Committee Members: Loison, Luísa Romão, Dias, Deodália Maria Antunes.

Subjects/Keywords: Genética Funcional e Estrutural; Biolopia Celular; Expressão Génica; RNA Mensageiro

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APA (6^th Edition):

Cruz, D. (2011). Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. (Thesis). RCAAP. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.insa.pt:10400.18/2275

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Cruz, David. “Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.” 2011. Thesis, RCAAP. Accessed January 23, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.insa.pt:10400.18/2275.

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Cruz, David. “Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.” 2011. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Cruz D. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. [Internet] [Thesis]. RCAAP; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.insa.pt:10400.18/2275.

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Council of Science Editors:

Cruz D. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. [Thesis]. RCAAP; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.insa.pt:10400.18/2275

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Universidade do Rio Grande do Sul

5. Branchini, Gisele. Estabelecimento de cultura primária de células de carcinoma prostático e avaliação da resposta ao silenciamento por RNAi do receptor de androgênio e seu correpressor NCoR.

Degree: 2011, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/134361

► Introdução: O câncer de próstata atinge cerca de três quartos da população masculina acima de 65 anos, sendo esta neoplasia o sexto tipo de câncer… (more)

▼ Introdução: O câncer de próstata atinge cerca de três quartos da população masculina acima de 65 anos, sendo esta neoplasia o sexto tipo de câncer mais comum no mundo, e o mais prevalente em homens. O receptor de androgênios (AR) desempenha um papel crítico no desenvolvimento normal da próstata, bem como no câncer prostático. Sua atividade transcricional é regulada através da interação com diversas proteínas. O NCoR1 (correpressor de receptores nucleares) está envolvido na diminuição da atividade do AR sobre a transcrição de genes alvo. Objetivos: Desenvolver um modelo de cultura celular de câncer prostático a partir de fragmentos tumorais; identificar o melhor gene normalizador para estudos de expressão gênica em amostras das células em cultivo; avaliar os efeitos do silenciamento do AR e seu corregulador, NCoR1, sobre a proliferação celular e expressão gênica de PSA, um gene alvo do AR, em células de cultura primária e em células de uma linhagem de câncer prostático (LNCaP – Lymph Node Carcinoma of the Prostate). Métodos: Fragmentos de tumores prostáticos coletados após prostatectomia radical ou prostatovesiculectomia foram plaqueados e mantidos em cultivo. As células que proliferaram a partir dos explants foram testadas para marcadores de epitélio (citoqueratinas) e de malignidade (racemase). Após 10 dias, as células foram silenciadas para o AR e, posteriormente, lisadas para a extração de RNA total ou de proteínas. Células LNCaP foram mantidas em cultura e silenciadas para o AR e o NCoR1, sendo avaliada também a proliferação celular nesta última condição. O cDNA obtido a partir das culturas primárias de CaP foi usado para a amplificação do mRNA de oito genes candidatos a normalizadores, além dos mRNAs do AR e PSA. O cDNA das células LNCaP foi usado para amplificação do mRNA do PSA, e o sobrenadante das células coletado para a dosagem do PSA secretado. Resultados: Apenas 47,7% do total de culturas primárias apresentaram adesão dos fragmentos e proliferação de células. Não foi observada associação entre a adesão dos fragmentos e o escore de Gleason dos tumores. As células cultivadas apresentaram positividade para os marcadores de células epiteliais e de malignidade de células prostáticas, indicando que as células em cultivo se tratavam de células tumorais prostáticas. Para análise da expressão gênica nestas células, o gene que mostrou os melhores parâmetros de estabilidade de expressão foi o gene SDHA, e a melhor combinação de dois genes sugerida neste estudo foi SDHA e ALAS1. O silenciamento do receptor de androgênios foi observado 48 horas após a transfecção com siRNAs, sendo observada uma diminuição nos níveis do mRNA já em 24 horas após a transfecção. Observou-se uma diminuição da expressão gênica do PSA em 24 horas, em resposta à diminuição dos níveis do AR, tanto em cultura primária de CaP quanto na linhagem LNCaP. Em células LNCaP, a transfecção com siRNAs específicos para o NCoR1 não depletou completamente os níveis proteicos, porém estes diminuíram em 24, 48 e 72 horas após a transfecção. Foi verificado… Advisors/Committee Members: Brum, Ilma Simoni.

Subjects/Keywords: Neoplasias da próstata; Receptores androgênicos; Expressão gênica; RNA mensageiro

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APA (6^th Edition):

Branchini, G. (2011). Estabelecimento de cultura primária de células de carcinoma prostático e avaliação da resposta ao silenciamento por RNAi do receptor de androgênio e seu correpressor NCoR. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/134361

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Branchini, Gisele. “Estabelecimento de cultura primária de células de carcinoma prostático e avaliação da resposta ao silenciamento por RNAi do receptor de androgênio e seu correpressor NCoR.” 2011. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/134361.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Branchini G. Estabelecimento de cultura primária de células de carcinoma prostático e avaliação da resposta ao silenciamento por RNAi do receptor de androgênio e seu correpressor NCoR. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/134361.

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Council of Science Editors:

Branchini G. Estabelecimento de cultura primária de células de carcinoma prostático e avaliação da resposta ao silenciamento por RNAi do receptor de androgênio e seu correpressor NCoR. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2011. Available from: http://hdl.handle.net/10183/134361

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Universidade do Rio Grande do Sul

6. Costa, Cíntia dos Santos. Análise da quantificação da expressão basal do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1 e PPARs em tecidos adiposos de obesos grau III com diferentes níveis de esteatose e a modulação destes genes por resveratrol em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III.

Degree: 2009, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/20930

► A obesidade é uma doença multifatorial fortemente associada com a síndrome metabólica e com as doenças hepáticas. A distribuição da gordura corporal é um fator… (more)

▼ A obesidade é uma doença multifatorial fortemente associada com a síndrome metabólica e com as doenças hepáticas. A distribuição da gordura corporal é um fator relevante, e especificamente o tecido adiposo visceral parece ser o elo entre o aumento de peso, a síndrome metabólica e o acúmulo de gordura hepática. Os adipócitos estão envolvidos na regulação do balanço energético e podem ser modulados por hormônios, citocinas e nutrientes, entre eles o resveratrol. São dois os objetivos principais deste trabalho: (1) identificar os níveis basais de expressão do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1, PPARg e PPARb/d em diferentes tecidos adiposos (retroperitoneal, subcutâneo e visceral) de indivíduos obesos grau III com diferentes níveis de esteatose hepática; e (2) identificar a ação do resveratrol sobre a expressão do mRNA dos genes citados em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de indivíduos obesos grau III. Os tecidos adiposos foram obtidos durante cirurgia bariátrica. O RNA total foi extraído usando o reagente TRIzol e o mRNA foi quantificado por PCR em tempo real. Para a análise da expressão basal dos genes, dividimos os pacientes em dois grupos: aqueles com esteatose simples ou moderada e aqueles com esteatose severa associada ou não à fibrose e inflamação. Comparando os dois grupos estudados, os pacientes com esteatose severa apresentaram uma menor expressão do mRNA de SIRT1 (p=0,006), apenas no tecido adiposo visceral. Os níveis de adiponectina, FOXO1, PPARg1-3 e PPARb/d não diferiram estatisticamente entre os dois grupos de pacientes nos três depósitos de gordura corporal. O valor de HOMA-IR foi diferente estatisticamente entre os grupos estudados, sendo maior no grupo de pacientes com diagnóstico de esteatose severa associada ou não a fibrose e necroinflamação (p=0,006). Neste mesmo grupo de pacientes, a expressão de SIRT1 e o valor de HOMA-IR correlacionaram-se positivamente no tecido adiposo visceral (r=0,607; p=0,048). Quanto à modulação por resveratrol, houve aumento significativo nos níveis do mRNA de SIRT1 (p=0,021), adiponectina (p=0,025) e FOXO1 (p=0,001) nos adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III. A expressão do mRNA de PPARg1-3 foi modulada negativamente (p=0,003) nas células estudadas. Considerando a expressão do PPARb/d, não houve modulação por resveratrol na concentração, tempo e modelo celular estudados. Analisando a literatura, verificamos que valores diminuídos de SIRT1 já foram associados à progressão da esteatose, em modelos experimentais. Neste trabalho, observamos menor transcrição de SIRT1 no tecido adiposo visceral de obesos com esteatose severa, o que poderia prejudicar a biogênese mitocondrial e a oxidação de ácidos graxos, contribuindo com o aumento de ácidos graxos livres na circulação portal, favorecendo o acúmulo hepático de lipídeos nestes pacientes. Desta forma, sugerimos que o aumento da expressão de SIRT1 no tecido adiposo visceral pode ter efeito protetor contra a evolução da esteatose em obesos grau III. Também constatamos que resveratrol… Advisors/Committee Members: Margis, Rogerio.

Subjects/Keywords: Obesidade; Tecido adiposo; Figado gorduroso; Adiponectina; Sirtuina 1; Resveratrol; RNA mensageiro

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APA (6^th Edition):

Costa, C. d. S. (2009). Análise da quantificação da expressão basal do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1 e PPARs em tecidos adiposos de obesos grau III com diferentes níveis de esteatose e a modulação destes genes por resveratrol em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/20930

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Costa, Cíntia dos Santos. “Análise da quantificação da expressão basal do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1 e PPARs em tecidos adiposos de obesos grau III com diferentes níveis de esteatose e a modulação destes genes por resveratrol em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III.” 2009. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/20930.

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Costa CdS. Análise da quantificação da expressão basal do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1 e PPARs em tecidos adiposos de obesos grau III com diferentes níveis de esteatose e a modulação destes genes por resveratrol em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/20930.

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Costa CdS. Análise da quantificação da expressão basal do mRNA de SIRT1, adiponectina, FOXO1 e PPARs em tecidos adiposos de obesos grau III com diferentes níveis de esteatose e a modulação destes genes por resveratrol em adipócitos isolados do tecido adiposo visceral de obesos grau III. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2009. Available from: http://hdl.handle.net/10183/20930

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Universidade do Rio Grande do Sul

7. Goveia, Susie de Andrade. Efeitos da progesterona sobre o comportamento tipo depressivo e sobre a expressão das subunidades do receptor GABA A de ratos Wistar machos e fêmeas.

Degree: 2010, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/24165

► A depressão é um transtorno que possui maior prevalência nas mulheres do que nos homens. A progesterona pode estar envolvida nos mecanismos que geram estas… (more)

▼ A depressão é um transtorno que possui maior prevalência nas mulheres do que nos homens. A progesterona pode estar envolvida nos mecanismos que geram estas diferenças. Este hormônio é utilizado clinicamente para mulheres em diversos eventos reprodutivos, e seu efeito na depressão não está bem estabelecido. Estudos em modelos animais mostraram que existe uma influência da progesterona no comportamento tipo-depressivo em roedores, mas estes estudos são inconclusivos. Autores têm demonstrado que as mudanças comportamentais em roedores ocasionadas pela progesterona estão associadas à alterações nas subunidades do receptor GABAA. O ácido Y-aminobutírico (GABA) é o principal neurotransmissor inibitório do sistema nervoso central. O receptor GABAérgico é composto de uma combinação de 5 subunidades que formam um poro iônico. A composição de subunidades mais comum é a composta de 2a1, 2b2 e 1g2. A modulação da atividade GABAérgica pela progesterona é específica à estrutura encefálica utilizada. O estriado é a estação de entrada para os núcleos da base, uma estrutura envolvida em respostas comportamentais. O córtex préfrontal é uma estrutura de grande importância no circuito límbico envolvida no controle de situações estressantes. Estudos têm mostrado uma assimetria funcional nesta estrutura relacionada ao gênero em respostas adaptativas ao estresse e no processamento emocional em humanos. Há também evidências relacionadas à depressão, de assimetria no sistema GABAérgico no estriado. Desta forma, no primeiro artigo, foi investigado o efeito antidepressivo de baixas doses de progesterona com dois protocolos de tratamento: agudo e crônico. No segundo e terceiro artigos foram avaliadas a expressão das subunidades a1 e g2 do receptor GABAA nos hemisférios direito e esquerdo do estriado e do córtex préfrontal de ratos Wistar machos e fêmeas que receberam o tratamento crônico com progesterona e de ratos que, adicionalmente, foram submetidos ao teste do nado forçado. No estriado, foi avaliada a expressão do mRNA, por RT-PCR, e no córtex pré-frontal foi avaliado em machos, adicionalmente, a expressão protéica por Western Blot destas subunidades. O tratamento agudo com progesterona não alterou o comportamento tipodepressivo dos ratos, mas o tratamento crônico diminuiu o comportamento tipodepressivo em fêmeas e aumentou em machos. A dose utilizada não alterou o ciclo hormonal das fêmeas. A análise da imobilidade dos animais que receberam veículo demonstrou que as fêmeas em diestro II foram mais depressivas do que os machos, refletida por sua maior imobilidade no teste do nado forçado. Este resultado comportamental das fêmeas pode estar associado aos mais baixos níveis séricos de progesterona característicos desta fase do seu ciclo reprodutivo. A expressão da subunidade g2 no estriado dos ratos controle foi assimétrica, onde machos mostraram maior expressão no hemisfério esquerdo do que no direito, que pode representar uma característica de risco mais baixo para depressão. Não houve assimetria no estriado das fêmeas ou no córtex… Advisors/Committee Members: Ribeiro, Maria Flavia Marques.

Subjects/Keywords: Depressão; Progesterona; Receptores de GABA-A; RNA mensageiro

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APA (6^th Edition):

Goveia, S. d. A. (2010). Efeitos da progesterona sobre o comportamento tipo depressivo e sobre a expressão das subunidades do receptor GABA A de ratos Wistar machos e fêmeas. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/24165

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Goveia, Susie de Andrade. “Efeitos da progesterona sobre o comportamento tipo depressivo e sobre a expressão das subunidades do receptor GABA A de ratos Wistar machos e fêmeas.” 2010. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/24165.

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Goveia SdA. Efeitos da progesterona sobre o comportamento tipo depressivo e sobre a expressão das subunidades do receptor GABA A de ratos Wistar machos e fêmeas. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24165.

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Goveia SdA. Efeitos da progesterona sobre o comportamento tipo depressivo e sobre a expressão das subunidades do receptor GABA A de ratos Wistar machos e fêmeas. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24165

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Universidade do Rio Grande do Sul

8. Joelsons, Gabriel. Estudo longitudinal de curto prazo da reprodutibilidade e da resposta quantitativa do RNA mensageiro às manobras imunossupressoras para o tratamento da rejeição aguda de transplantes renais : avaliação por reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sangüíneas.

Degree: 2010, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/24266

► O objetivo do presente estudo foi avaliar longitudinalmente a acurácia diagnóstica da análise transcripcional de enxertos renais. Trinta e seis receptores de transplante renal foram… (more)

▼ O objetivo do presente estudo foi avaliar longitudinalmente a acurácia diagnóstica da análise transcripcional de enxertos renais. Trinta e seis receptores de transplante renal foram avaliados pelo período de três meses pós-transplante. Amostras de sangue periférico para a análise dos genes da Perforina e TIM3 pela reação em cadeia da polimerase em tempo real foram coletadas nos dias 3, 4-6, 9-11, 14-16, 19-21, 24-26, 29-31, 44-46, 59-61 e 89-91 do pós-operatório. Biópsias por indicação e de vigilância foram realizadas para avaliar disfunção aguda do enxerto ou durante períodos de disfunção inicial do enxerto (DGF) respectivamente e foram interpretadas usando a classificação Banff de 2007. Treze pacientes apresentaram 16 episódios de rejeição aguda. Receptores com rejeição demonstraram níveis mais elevados de transcritos de mRNA do gene TIM3 em comparação com pacientes que não foram acometidos por episódios de rejeição (mediana da expressão gênica foi de 153,7% e 40,1% respectivamente, p<0,01). Da mesma maneira, a expressão gênica da Perforina foi elevada em pacientes com rejeição (mediana da expressão gênica foi de 136,6% e 46,5% respectivamente, p<0,01). Curvas ROC (receiver operating characteristic) mostraram uma área sob a curva para o gene do TIM3 de 0,752 (intervalo de confiança de 95%: 0,653 – 0,852). A expressão de mRNA de Perforina forneceu uma área sob a curva de 0,733 (com um intervalo de confiança de 95%: 0,580 – 0,809). A acurácia global da expressão gênica foi de 77% para o gene do TIM3 e de 66% para o gene da Perforina. A acurácia combinada dos dois genes alcançou 82%. Valores preditivos negativos foram de 96% nas três análises. A expressão gênica foi significativamente modulada por tratamento de rejeição, onde observou-se um decréscimo de 60% (para o gene do TIM3) e 48% (para o gene da Perforina) em comparação com amostras pré-rejeição. Concluindo, a abordagem longitudinal mostrou-se muito útil para exclusão do diagnóstico de rejeição e também ao determinar a eficácia de seu tratamento. Advisors/Committee Members: Manfro, Roberto Ceratti.

Subjects/Keywords: Transplante de rim; Rejeição de enxerto; RNA mensageiro; Estudos longitudinais

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APA (6^th Edition):

Joelsons, G. (2010). Estudo longitudinal de curto prazo da reprodutibilidade e da resposta quantitativa do RNA mensageiro às manobras imunossupressoras para o tratamento da rejeição aguda de transplantes renais : avaliação por reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sangüíneas. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/24266

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Joelsons, Gabriel. “Estudo longitudinal de curto prazo da reprodutibilidade e da resposta quantitativa do RNA mensageiro às manobras imunossupressoras para o tratamento da rejeição aguda de transplantes renais : avaliação por reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sangüíneas.” 2010. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/24266.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Joelsons G. Estudo longitudinal de curto prazo da reprodutibilidade e da resposta quantitativa do RNA mensageiro às manobras imunossupressoras para o tratamento da rejeição aguda de transplantes renais : avaliação por reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sangüíneas. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24266.

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Council of Science Editors:

Joelsons G. Estudo longitudinal de curto prazo da reprodutibilidade e da resposta quantitativa do RNA mensageiro às manobras imunossupressoras para o tratamento da rejeição aguda de transplantes renais : avaliação por reação em cadeia da polimerase em tempo real em células sangüíneas. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24266

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UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO

9. Jamille Locatelli. EFEITO DO TREINAMENTO EM NATAÇÃO SOBRE A EXPRESSÃO DE RNAs MENSAGEIROS DE PROTEÍNAS REGULADORAS DE CÁLCIO NO MÚSCULO CARDÍACO DE RATOS COM HIPERTENSÃO RENOVASCULAR.

Degree: 2011, UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO

URL: http://www.tede.ufop.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=670

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A hipertensão arterial leva a alterações na expressão de proteínas envolvidas na mobilização de cálcio (Ca2+ ), durante o acoplamento excitação-contração. O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos do exercício físico sobre a expressão de RNA mensageiro das proteínas reguladoras do cálcio no tecido cardíaco. Para isso, ratos Fischer (p=150-200g) foram submetidos à cirurgia para a indução da hipertensão renovascular 2R1C, e posteriormente, divididos nos grupos 2R1C SED (sedentário) e 2R1C EX (exercitado), sendo que os grupos SHAM (cirurgia fictícia), foram seus respectivos controles (SED e EX). Após, os animais iniciaram um protocolo de natação (1h/dia, 5x/semana, durante 6 semanas) e foram avaliadas a pressão arterial média basal, a freqüência cardíaca, a hipertrofia de cardiomiócitos e a expressão de algumas proteínas envolvidas na mobilização de Ca2+ . O exercício atenuou da pressão arterial média (PAM) e a freqüência cardíaca (bpm) basais no grupo 2R1C EX em comparação aos animais 2R1C SED. A massa do coração (g) foi avaliada e os grupos SHAM EX, 2R1C SED e 2R1C EX mostraram um aumento em comparação com o grupo SHAM SED. Ao analisarmos os resultados do PCR em tempo real, observamos que os níveis da Ca2+ -ATPase do retículo (SERCA2a) aumentaram após o treinamento com natação, enquanto o trocador de Na+/Ca2+ (NCX1) teve seus níveis reduzidos no tecido cardíaco, em relação aos animais hipertensos sedentários. Com relação à fosfolamban (FLB), também observamos aumento na expressão em coração de animais 2R1C EX. Diante desses resultados, concluímos que o exercício físico pode reduzir a pressão arterial média basal e a freqüência cardíaca, além de promover a hipertrofia cardíaca e influenciar o padrão de expressão de RNAs mensageiros das proteínas reguladoras do Ca 2+ em cardiomiócitos de ratos com hipertensão renovascular.

The hypertension leads to changes in the expression of proteins involved in the calcium handling (Ca 2+ ) during the excitation-contraction coupling. The aim of this study was to evaluate the effects of physical exercise on the expression of messenger RNA of calcium regulatory proteins in heart tissue. For this, Fischer rats (p=150-200g) underwent surgery for the induction of renovascular hypertension 2R1C, and then divided into groups 2R1C SED (sedentary) and EX 2R1C (exercised), and SHAM groups (sham surgery), were their respective controls (SED and EX). After the animals started swimming (1 h, 5 time per week for 6 weeks) and were evaluated at baseline mean arterial pressure, heart rate, hypertrophy of cardiomyocytes and the expression of some proteins involved in Ca 2+ handling. Exercise attenuated the mean arterial pressure (MAP) and heart rate (bpm) baseline in the group 2K1C EX animals compared to SED. The heart mass (g) was evaluated and SHAM EX, 2K1C EX and 2K1C SED groups showed an increase compared with the SHAM SED. Analyzing the results of real-time PCR, we found that levels of Ca 2+ -ATPase of the reticulum (SERCA2a) mRNAs increased after training with swimming, while the…

Advisors/Committee Members: Antonio José Natali, Mauro César Isoldi, Karen Cristiane Martinez de Moraes.

Subjects/Keywords: natação; tecido cardíaco; cálcio; hipertensão; RNA mensageiro; hipertrofia cardíaca; BIOQUIMICA

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APA (6^th Edition):

Locatelli, J. (2011). EFEITO DO TREINAMENTO EM NATAÇÃO SOBRE A EXPRESSÃO DE RNAs MENSAGEIROS DE PROTEÍNAS REGULADORAS DE CÁLCIO NO MÚSCULO CARDÍACO DE RATOS COM HIPERTENSÃO RENOVASCULAR. (Thesis). UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO. Retrieved from http://www.tede.ufop.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=670

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Locatelli, Jamille. “EFEITO DO TREINAMENTO EM NATAÇÃO SOBRE A EXPRESSÃO DE RNAs MENSAGEIROS DE PROTEÍNAS REGULADORAS DE CÁLCIO NO MÚSCULO CARDÍACO DE RATOS COM HIPERTENSÃO RENOVASCULAR.” 2011. Thesis, UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO. Accessed January 23, 2021. http://www.tede.ufop.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=670.

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Vancouver:

Locatelli J. EFEITO DO TREINAMENTO EM NATAÇÃO SOBRE A EXPRESSÃO DE RNAs MENSAGEIROS DE PROTEÍNAS REGULADORAS DE CÁLCIO NO MÚSCULO CARDÍACO DE RATOS COM HIPERTENSÃO RENOVASCULAR. [Internet] [Thesis]. UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.tede.ufop.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=670.

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Locatelli J. EFEITO DO TREINAMENTO EM NATAÇÃO SOBRE A EXPRESSÃO DE RNAs MENSAGEIROS DE PROTEÍNAS REGULADORAS DE CÁLCIO NO MÚSCULO CARDÍACO DE RATOS COM HIPERTENSÃO RENOVASCULAR. [Thesis]. UNIVERSIDADE FEDERAL DE OURO PRETO; 2011. Available from: http://www.tede.ufop.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=670

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10. Mariana Ferreira Leal. Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis.

Degree: 2011, Universidade Federal de São Paulo

► O câncer gástrico é o quarto tipo de tumor mais comum e a segunda maior causa de morte por câncer no mundo. No Estado do… (more)

▼ O câncer gástrico é o quarto tipo de tumor mais comum e a segunda maior causa de morte por câncer no mundo. No Estado do Pará, essa neoplasia é um grave problema de saúde pública, pois é diagnosticada em estágios avançados, com taxas de sobrevida extremamente baixas. Esses fatos reforçam a gravidade dessa patologia e a necessidade de novos estudos que possam modificar esse panorama. Objetivos: 1) Comparar o perfil de expressão proteica de amostras de adenocarcinoma gástrico e dos correspondentes não neoplásicos. 2) Identificar proteínas com expressão desregulada e das principais vias metabólicas e de interação envolvidas na carcinogênese gástrica. 3) Avaliar a expressão proteica e do RNAm de ENOA/ENO1, HSPB1, NPM1 e 14-3-3ɛ/YWHAE em amostras de tecido gástrico neoplásico e não neoplásico e associá-la às características clínico-patológicas de adenocarcinomas gástricos. Métodos: o perfil de expressão proteica foi avaliado por gel em eletroforese bidimensional seguido por espectrometria de massa utilizando-se 15 pares de tecido gástrico neoplásico e não neoplásico de indivíduos do Estado do Pará. Para selecionar as proteínas diferencialmente expressas, foram realizados testes paramétricos com reamostragem. Após a identificação das proteínas, foi realizada análise de cluster e as proteínas foram classificadas quanto à localização celular, aos processos biológicos, à função molecular e à localização do gene relacionado. Foram realizadas análises de bioinformática para avaliar as principais vias canônicas e de interação física e/ou funcional envolvidas na carcinogênese gástrica. A expressão de ENOA/ENO1, HSPB1, NPM1 e 14-3-3ɛ/YWHAE foi avaliada por PCR quantitativa em tempo real e por western Blot. Resultados: foram identificadas 111 proteínas associadas à carcinogênese gástrica. A análise de cluster demonstrou a presença de dois grupos principais: um composto por amostra de tecido gástrico não neoplásico e outro com amostras neoplásicas e duas amostras de não neoplásico. As principais vias canônicas envolvidas na carcinogênese gástrica estavam relacionadas ao metabolismo energético. Pela análise de proteômica, foram identificados dois spots de ENOA com expressão elevada em tecido gástrico tumoral em relação ao tecido não neoplásico. A média da expressão de ENOA por western blot foi significantemente reduzida em neoplasias gástricas. A redução da expressão de ENOA foi relacionada à menor invasão tecidual (T1/T2). Pela análise de proteômica, foi identificado um spot de HSPB1 com expressão elevada em câncer gástrico. Por western blot, a expressão de HSPB1 não diferiu entre tecido gástrico neoplásico e não neoplásico. A expressão de NPM1 e de 14-3-3e foi significantemente reduzida em tumores gástricos em relação aos correspondentes não neoplásicos. A expressão reduzida de NPM1 foi associada a um pior prognóstico. A expressão reduzida de 14-3-3e foi associada ao tipo difuso e a tumores de acometimento precoce. Conclusões: O presente estudo relata a expressão diferencial de diversas proteínas que poderão contribuir… Advisors/Committee Members: Janete Maria Cerutti, Eloiza Helena Tajara da Silva, Silvia Regina Caminada de Toledo, Rommel Mario Rodríguez Burbano, Marilia de Arruda Cardoso Smith.

Subjects/Keywords: Câncer gástrico; Proteômica; Expressão gênica; Proteínas; RNA mensageiro; MORFOLOGIA

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Leal, M. F. (2011). Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis. (Thesis). Universidade Federal de São Paulo. Retrieved from http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2306 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2307 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2303 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2304 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2305 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2308 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2309 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2310 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2311 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2312 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2313 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2314 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2315 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2316 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2317 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2318 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2319

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Leal, Mariana Ferreira. “Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis.” 2011. Thesis, Universidade Federal de São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2306 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2307 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2303 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2304 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2305 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2308 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2309 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2310 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2311 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2312 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2313 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2314 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2315 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2316 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2317 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2318 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2319.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Leal, Mariana Ferreira. “Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis.” 2011. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Leal MF. Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de São Paulo; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2306 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2307 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2303 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2304 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2305 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2308 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2309 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2310 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2311 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2312 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2313 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2314 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2315 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2316 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2317 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2318 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2319.

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Council of Science Editors:

Leal MF. Differential proteomic analysis in gastric carcinogenesis. [Thesis]. Universidade Federal de São Paulo; 2011. Available from: http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2306 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2307 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2303 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2304 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2305 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2308 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2309 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2310 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2311 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2312 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2313 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2314 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2315 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2316 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2317 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2318 ; http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2319

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Universidade de Lisboa

11. Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão, 1963-. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.

Degree: 2011, Universidade de Lisboa

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/5903

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Tese de mestrado. Biologia (Biologia Humana e Ambiente). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2011

A expressão génica nos eucariotas envolve um número de etapas… (more)

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Tese de mestrado. Biologia (Biologia Humana e Ambiente). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2011

A expressão génica nos eucariotas envolve um número de etapas interligadas desde a transcrição do material genético até à tradução em proteína, sendo os RNAs mensageiros (mRNAs) os intermediários chave ao longo deste processo. Embora a complexidade da expressão génica dos eucariotas permita um controlo da produção proteica a vários níveis, também torna este processo vulnerável a erros. As células eucariotas desenvolveram mecanismos elaborados de controlo de qualidade do mRNA que asseguram a fidelidade da expressão génica através da detecção e degradação de transcritos anómalos. Como exemplo destes mecanismos de controlo de qualidade temos: o NMD (Nonsense-mediated mRNA Decay), que reconhece e elimina mRNAs que contenham codões prematuros de terminação da tradução, e o NSD (Nonstop mRNA Decay) que elimina mRNAs que não possuem codões de terminação em fase na grelha de leitura. O exossoma é um complexo proteico evolutivamente conservado que possui actividade ribonucleolítica e que se encontra presente tanto no núcleo como no citoplasma das células eucariotas. Uma das várias funções do exossoma é participar na degradação de mRNAs anómalos portadores de mutações nonsense ou de mutações nonstop. Como consequência da recente identificação de uma nova ribonuclease, a hDis3L1, como parte integrante do exossoma, este trabalho teve como objectivo avaliar o envolvimento desta subunidade do exossoma humano na degradação inerente ao NMD e ao NSD. Para tal, usaram-se variantes do gene da β-globina humana: um gene portador de mutação nonsense e sensível ao mecanismo de NMD (β39, com uma mutação nonsense no codão 39), um gene sem qualquer codão de terminação em fase (βnonstop) e o correspondente gene normal (βn), como genes modelo. Estes genes clonados em vectores de expressão foram usados para transfectar transitoriamente células HeLa em cultura. Simultaneamente, foram realizados testes de RNA interference (RNAi) através da transfecção de small interference RNAs (siRNAs) específicos para o transcrito que codifica hDis3L1 e, como controlo, siRNAs para um transcrito não específico (luciferase). Nestas condições de inibição da expressão da hDis3L1 ou em condições normais, as células em cultura foram colhidas para extracção do RNA total. O nível de mRNA das globinas foi quantificado por RT-qPCR (quantitative reverse transcription polymerase chain reaction), enquanto que o nível de inibição da expressão de cada transcrito sujeito a RNAi foi avaliado por RT-PCR (semi-quantitative reverse transcription polymerase chain reaction). Em condições de baixa expressão de hDis3L1 na célula, pretendeu-se verificar se os transcritos β39 e βnonstop aumentam de expressão, o que indicaria que o mecanismo de NMD e/ou o mecanismo de NSD ficariam inibidos, sugerindo que a ribonuclease hDis3L1 estaria envolvida no processo de degradação de transcritos com mutações nonsense ou non-stop, respectivamente. De facto, os resultados obtidos neste…

Advisors/Committee Members: Loison, Luísa Romão, 1963-, Dias, Deodália Maria Antunes, 1952-.

Subjects/Keywords: Biolopia celular; Expressão génica; RNA mensageiro; Teses de mestrado - 2011

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APA (6^th Edition):

Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão, 1. (2011). Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. (Thesis). Universidade de Lisboa. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/5903

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão, 1963-. “Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.” 2011. Thesis, Universidade de Lisboa. Accessed January 23, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/5903.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão, 1963-. “Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica.” 2011. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão 1. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. [Internet] [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/5903.

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Council of Science Editors:

Cruz, David João Clara da, 1986; Loison, Luísa Romão 1. Envolvimento da ribonuclease humana Dis3L1 em processos de controlo de qualidade da expressão génica. [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/5903

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Universidade de Lisboa

12. Peixeiro, Isabel Cristina Ramos, 1982-. The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame.

Degree: 2011, Universidade de Lisboa

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/6198

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Tese de doutoramento, Bioquímica (Genética Molecular), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2012

Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a surveillance pathway that recognizes and rapidly… (more)

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Tese de doutoramento, Bioquímica (Genética Molecular), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2012

Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a surveillance pathway that recognizes and rapidly degrades mRNAs containing premature termination codons (PTC). The unified model for NMD, proposes that the decision of NMD triggering is the outcome of the competition between the cytoplasmatic poly(A)-binding protein 1 (PABPC1) and the NMD effector UPF1 for the termination complex. Consequently, PTCs located far, in a linear sense, from the poly(A) tail and associated PABPC1 in mRNAs containing residual downstream exon junction complexes (EJCs) are expected to elicit NMD. Nevertheless, it has been reported that mRNAs containing PTCs in close proximity to the translation initiation codon (AUG-proximal PTCs) can substantially evade NMD. The work described in this thesis was focused on the mechanistic basis for this NMD resistance, exemplified by human β-globin transcripts carrying an AUG-proximal PTC. We demonstrated that translation termination at an AUG-proximal PTC lacks the ribosome stalling that is evident in an NMD-sensitive PTC. In fact, we have shown that the establishment of an efficient translation termination reaction at the AUG-proximal PTC is dependent on PABPC1 interaction with the initiation factor eIF4G and with the release factor eRF3 at the terminating ribosome. These interactions underlie critical 3’-5’ linkage of translation initiation with efficient termination at the AUG-proximal PTC and contribute to an NMD-resistant PTC definition at an early phase of translation elongation. Furthermore, we provide strong evidence that the eukaryotic initiation factor 3 is involved in delivering eIF4G-associated PABPC1 into the vicinity of the AUG-proximal PTC through eIF3h and eIF3f subunits. These data support the “AUG-proximity effect” as a major inhibitor of the NMD pathway. The work presented here corroborates a role for PABPC1 on NMD evasion of AUG-proximal transcripts and provides further insights into the mechanistic details of PTC definition and translation initiation.

O mecanismo de decaimento do mRNA mediado por mutações nonsense, ou nonsense-mediated mRNA decay (NMD), é um processo de controlo de qualidade da expressão génica que permite a eliminação de transcritos portadores de codões de terminação da tradução prematura (CTPs). A eliminação dos transcritos anómalos permite reduzir a produção de proteínas truncadas, protegendo a célula dos efeitos dominantes negativos resultantes da acumulação de péptidos potencialmente tóxicos (Behm-Ansmant & Izaurralde, 2006; Chang et al, 2007). Este mecanismo desempenha não só uma função como modulador de doenças genéticas, mas também uma importante função na regulação de transcritos fisiológicos envolvidos em vários processos celulares (McGlincy et al, 2010; Mendell et al, 2004; Rehwinkel et al, 2006). Nos mamíferos, durante o processo de splicing, é depositado um complexo proteico, cerca de 20-24 nucleótidos (nt) a montante de cada junção exão-exão, designado…

Advisors/Committee Members: Loison, Luísa Romão, 1963-, Amaral, Margarida, 1958-.

Subjects/Keywords: RNA mensageiro; β-globina humana; Genética molecular; Teses de doutoramento - 2012

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APA (6^th Edition):

Peixeiro, Isabel Cristina Ramos, 1. (2011). The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame. (Thesis). Universidade de Lisboa. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/6198

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Peixeiro, Isabel Cristina Ramos, 1982-. “The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame.” 2011. Thesis, Universidade de Lisboa. Accessed January 23, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/6198.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Peixeiro, Isabel Cristina Ramos, 1982-. “The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame.” 2011. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Peixeiro, Isabel Cristina Ramos 1. The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame. [Internet] [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/6198.

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Council of Science Editors:

Peixeiro, Isabel Cristina Ramos 1. The role of mRNA translation on nonsense-mediated decay inhibition of transcripts carrying a short open reading frame. [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/6198

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Universidade do Rio Grande do Sul

13. Seibel, Fernanda Eugênia Rodrigues. Expressão gênica e proteica das isoformas dos receptores de estrogênio e da enzima aomatase em hiperplasia prostática benigna e câncer de próstata.

Degree: 2010, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/24691

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Tanto os androgênios quanto os estrogênios possuem um papel significativo na próstata e são indispensáveis para o crescimento normal prostático. A enzima aromatase catalisa a… (more)

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Tanto os androgênios quanto os estrogênios possuem um papel significativo na próstata e são indispensáveis para o crescimento normal prostático. A enzima aromatase catalisa a reação de conversão de androgênios para estrogênios. O papel dos estrogênios e seus receptores na etiologia e progressão do câncer de próstata (CaP) e da hiperplasia prostática benigna (HPB) é muito pouco compreendido. Objetivo: Analisar a expressão do mRNA dos receptores de estrogênio ER , ER 2, ER 5 e da enzima aromatase. Analisar a expressão protéica do ER e ER nos grupos CaP e HPB. Métodos: Tecidos prostáticos oriundos de câncer de próstata e de hiperplasia prostática benigna foram submetidos à extração de RNA total com o reagente Trizol, o RNA foi reversamente transcrito para cDNA e avaliado usando RT-PCR para a expressão dos receptores de estrogênio , 2, 5 e aromatase. A expressão protéica de ER e ER foi analisada por Western blot. Resultados: Comparações entre os tecidos hiperplásico e de carcinoma indicaram uma maior expressão do mRNA ER (P<0,001) e da proteína (P<0,038) em amostras de câncer comparada a HPB. A expressão do mRNA do ER 5 foi significativamente aumentada nos tecidos hiperplásicos comparada ao grupo câncer. A expressão do mRNA do ER 2 e da aromatase não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Nossos resultados também mostraram que a expressão protéica do ER não foi diferente entre os grupos HPB e CaP. Conclusões: O presente estudo indicou que a expressão protéica e gênica do ER e a expressão gênica do ER 5 são diferentes entre os grupos sugerindo que o aumento dos níveis do ER no CaP e do mRNA ER 5 na HPB pode ser importante na progressão das doenças prostáticas.

Both androgens and estrogens play a significant role in the prostate and are critical for normal prostate growth. The aromatase enzyme catalyzes the reaction to conversion of androgens to estrogens. The role of estrogen and its receptors in the etiology and progression of prostate cancer (PCa) and benign prostatic hyperplasia (BPH) is poorly understood. Objective: The purpose of this study was to evaluate the estrogen receptors ER , 2, 5 and aromatase enzyme mRNA expression and to investigate also the ER and ER protein expression in groups PCa and BPH. Method: Total RNA of prostate cancer and benign prostatic hyperplasia tissues was extracted from each sample by the Trizol method and cDNA was performed. ER , ER 2, ER 5 estrogen receptors and aromatase gene expression were quantified by RT-PCR. ER and ER protein expression was evaluated by Western blot. Results: Comparisons of the hyperplastic and tumor prostate tissues indicated an overexpression of ER mRNA (P<0,001) and protein (P<0,038) in tumor specimens. The mRNA expression of ER 5 was significantly increased in hyperplastic tissues compared to tumor group. The mRNA expression of ER 2 and aromatase was not different between BPH and PCa groups. Our results also showed that the protein expression of ER was not different between BPH and PCa groups. Conclusions: The present study indicated that gene and…

Advisors/Committee Members: Brum, Ilma Simoni.

Subjects/Keywords: RNA mensageiro; Receptores estrogenicos; Expressão gênica; Expressão protéica; Hiperplasia prostática; Neoplasias da próstata

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APA (6^th Edition):

Seibel, F. E. R. (2010). Expressão gênica e proteica das isoformas dos receptores de estrogênio e da enzima aomatase em hiperplasia prostática benigna e câncer de próstata. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/24691

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Seibel, Fernanda Eugênia Rodrigues. “Expressão gênica e proteica das isoformas dos receptores de estrogênio e da enzima aomatase em hiperplasia prostática benigna e câncer de próstata.” 2010. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/24691.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Seibel FER. Expressão gênica e proteica das isoformas dos receptores de estrogênio e da enzima aomatase em hiperplasia prostática benigna e câncer de próstata. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24691.

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Council of Science Editors:

Seibel FER. Expressão gênica e proteica das isoformas dos receptores de estrogênio e da enzima aomatase em hiperplasia prostática benigna e câncer de próstata. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2010. Available from: http://hdl.handle.net/10183/24691

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Universidade do Rio Grande do Norte

14. Silva, Iasmim Santos Mangabeira e. Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus .

Degree: 2017, Universidade do Rio Grande do Norte

URL: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/24075

► The aim of this study was to understand molecular mechanisms underlying host resistance. We compared the abomasal mucosal transcriptome of 17 crossbred ½ Santa Inês… (more)

▼ The aim of this study was to understand molecular mechanisms underlying host resistance. We compared the abomasal mucosal transcriptome of 17 crossbred ½ Santa Inês and ½ Dorper lambs, previously classified as infected (resistant and susceptible) and uninfected distributed in two feeding system (ad libitum and restrict feed) in response to Haemonchus sp. infection using RNA-Seq technology. The libraries preparation, genome sequencing and sequence analyses were performed at the Laboratory of Animal Biotechnology - ESALQ, Piracicaba, Brazil. The average of reads per sample before and after filtering was 12.522.573 and 9.626.457, respectively, and the average of mapping rate of filtered reads against to Ovis aries Oar_v4.0 reference genome assembly was 79.66%. 421 and 1123 differentially expressed (DE) genes were identified when compared to infected and uninfected animals, within the restricted and ad libitum feed groups, respectively. When evaluated the infected animals inserted in the ad libitum feed versus restricted feeding, 13 genes were DE. When evaluated the resistant and susceptible animals with fixed feeding effect, only 36 genes were DE. Finally, by comparing infected versus control animals with feed as a fixed effect, 881 DE genes were identified. Functional enrichment analysis showed that some Gene Ontology terms were significantly enriched (adjusted p-value <0.05). Our findings suggest that in addition to genes that participate directly in the immune system, genes that participate in other biological pathways such as arachidonic acid metabolism, signaling pathway and complement system, for example, are essential in the host's response to Haemonchus contortus, generating a greater sheep resistance. In addition, feeding did not have a significant effect on the gene expression profile, showing that the difference between gene expressions was due to H. contortus infection. Advisors/Committee Members: Medeiros, Lilian Giotto Zaros de (advisor), 24554066878 (advisor), Medeiros, Henrique Rocha de (advisor), 59689960482 (advisor).

Subjects/Keywords: Alimentação de animais; Endoparasitas; Ovinocultura; Resposta imune; Resistência; Sequenciamento do RNA mensageiro

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APA (6^th Edition):

Silva, I. S. M. e. (2017). Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus . (Masters Thesis). Universidade do Rio Grande do Norte. Retrieved from http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/24075

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Silva, Iasmim Santos Mangabeira e. “Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus .” 2017. Masters Thesis, Universidade do Rio Grande do Norte. Accessed January 23, 2021. http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/24075.

MLA Handbook (7^th Edition):

Silva, Iasmim Santos Mangabeira e. “Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus .” 2017. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Silva ISMe. Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus . [Internet] [Masters thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2017. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/24075.

Council of Science Editors:

Silva ISMe. Transcriptoma do abomaso de ovinos e possíveis mecanismos de resposta a Haemonchus contortus . [Masters Thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2017. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/24075

15. Maria Luisa Bezerra de Macedo. DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais.

Degree: Master, 2013, Universidade Federal do Ceará

URL: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12527 ;

► A hansenÃase Ã uma doenÃa infecciosa crÃnica causada pelo bacilo Mycobacterium leprae. No CearÃ Ã observado o aumento do nÃmero de casos novos de hansenÃase.… (more)

▼ A hansenÃase Ã uma doenÃa infecciosa crÃnica causada pelo bacilo Mycobacterium leprae. No CearÃ Ã observado o aumento do nÃmero de casos novos de hansenÃase. A infecÃÃo de indivÃduos suscetÃveis acontece principalmente pela inalaÃÃo de bacilos eliminados pelas vias aÃreas superiores de pacientes multibacilares. A transmissÃo Ã influenciada por fatores genÃticos do hospedeiro, estado nutricional e taxa de exposiÃÃo ao M. leprae ou outras micobactÃrias. Acredita-se que o contato com fatores ambientais sejam possÃveis fontes de infecÃÃo, como a Ãgua, o solo e alguns animais. O papel exato do ambiente na dinÃmica de transmissÃo ainda Ã especulativo. Assim, este estudo teve como objetivo avaliar por tÃcnicas de biologia molecular a presenÃa de Ãcidos nucleicos de M. leprae em amostras de Ãguas ambientais coletadas em Ãreas endÃmicas de municÃpios de Estado do CearÃ, assim como cultivar micobactÃrias ambientais nestas mesmas amostras. Foram coletadas amostras de Ãgua de 24 reservatÃrios, sendo coletadas rÃplicas de cada sÃtio selecionado, totalizando 119 amostras. As amostras coletadas foram provenientes de aÃudes, riachos, rios e balneÃrios recreativos. O DNA e RNA total foram extraÃdos atravÃs de kits especÃficos para amostras ambientais de acordo com as recomendaÃÃes do fabricante, seguido de amplificaÃÃo dos Ãcidos nucleicos por PCR e RT-PCR respectivamente, gerando produto de 187pb relativo ao gene gyrA de M. leprae. Em relaÃÃo ao cultivo, as amostras de Ãgua foram descontaminadas e cultivadas em meio Lowestein-Jensen, seguido de identificaÃÃo da espÃcie de micobactÃria por mÃtodo de PRA. O DNA e o RNAm do M. leprae foram detectados em todos os municÃpios estudados. Do total de 119 amostras de Ãgua analisadas, 76 apresentaram positividade para Ãcidos nucleicos de M. leprae (64%). Dentre estas, 23 foram positivas apenas para DNA (30,3%), 24 apenas para RNAm (31,5%) e 29 positivas para ambos os Ãcidos nucleicos (38,2%). O produto de PCR de duas amostras da regiÃo gyrA foi confirmado por sequenciamento e BLAST. Houve uma significÃncia estatÃstica de maior frequÃncia de positividade de DNA e RNAm nos reservatÃrios de Ãgua com temperatua mÃdia de 28,4 °C. O cultivo mostrou que alÃm do bacilo M. leprae, as amostras de Ãgua continham espÃcies de micobactÃrias nÃo tuberculosas Este estudo indica presenÃa de DNA e RNAm de M. leprae nas amostras de Ãguas ambientais. Demonstrando, portanto, nÃo somente a existÃncia do bacilo da hansenÃase, mas indica fundamentalmente a presenÃa de bacilos viÃveis, os quais sÃo geneticamente iguais Ã referÃncia de M. leprae em relaÃÃo ao fragmento analisado. Desta forma, os resultados obtidos contribuem para ampliar o conhecimento da dinÃmica de transmissÃo da hansenÃase. Advisors/Committee Members: Cibele Barreto Mano de Carvalho, Cristiane Cunha Frota, VÃnia Maria Maciel Melo, JeovÃ Keny Baima Colares.

Subjects/Keywords: ANATOMIA PATOLOGICA E PATOLOGIA CLINICA; Ãguas de SuperfÃcie; Mycobacterium leprae; DNA; RNA Mensageiro; Surface Waters ; Mycobacterium leprae; DNA; RNA, Messenger

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APA (6^th Edition):

Macedo, M. L. B. d. (2013). DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais. (Masters Thesis). Universidade Federal do Ceará. Retrieved from http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12527 ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Macedo, Maria Luisa Bezerra de. “DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais.” 2013. Masters Thesis, Universidade Federal do Ceará. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12527 ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Macedo, Maria Luisa Bezerra de. “DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais.” 2013. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Macedo MLBd. DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Ceará 2013. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12527 ;.

Council of Science Editors:

Macedo MLBd. DetecÃÃo do Mycobacterium leprae em coleÃÃes de Ãgua ambientais. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Ceará 2013. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=12527 ;

16. Dantas, Ive Maíra de Carvalho. Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico.

Degree: Mestrado, Doenças Tropicais e Saúde Internacional, 2014, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/99/99131/tde-03082015-103941/ ;

► Na fase ativa da leishmaniose visceral (LV) ocorrem alterações no metabolismo de lipoproteínas com redução dos níveis de HDL e aumento de triglicérides. A partir… (more)

▼ Na fase ativa da leishmaniose visceral (LV) ocorrem alterações no metabolismo de lipoproteínas com redução dos níveis de HDL e aumento de triglicérides. A partir desses dados, focamos neste projeto essas alterações na progressão da infecção e apontamos alguns elementos como seus possíveis desencadeantes. Como essas alterações poderiam resultar de redução de atividade e expressão da lipoproteína lipase (LPL), do receptor alfa do proliferador ativado de peroxissoma (PPAR?) e da proteína transferidora de ésteres de colesteril (CETP), a sua expressão foi avaliada durante a progressão da LV em hamster. Em hamsteres infectados com 2 x 107 amastigotas de L. (L.) infantum observamos aumento de triglicérides nos hamsteres com 55 dias (mediana = 294,0 mg/dL) e 90 dias (303,0 mg/dL ) de infecção comparados aos controles de 55 dias (119,0 mg/dL) e de 90 dias (117,0 mg/dL) (p <= 0,05). Os níveis de colesterol total e de HDL não apresentaram diferença significante entre controles e infectados com 30, 55 e 90 dias de infecção. A expressão de mRNA de PPAR? no fígado com 55 e 90 dias de infecção apresentou tendência de redução nos infectados. Já de CETP no fígado dos hamsteres com 55 dias de infecção, a expressão relativa (CT) estava reduzida nos infectados (0,08) comparados aos controles (1,69) (p <= 0,05) e de LPL no coração dos hamsteres com 90 dias de infecção também estava reduzida (1,43) com relação aos controles (2,61) (p <= 0,05). Há dados na literatura sugerindo a importância de lipídios para o desenvolvimento de amastigotas no hospedeiro vertebrado e é possível que as alterações dos níveis de lipoproteínas contribuam na progressão da infecção. Assim, avaliamos neste estudo o efeito da droga hipolipemiante ciprofibrato no controle do parasitismo na LV em hamster, sabendo-se que ciprofibratos atuam aumentando a expressão de PPAR? e a produção e atividade de LPL. O tratamento com ciprofibrato nos hamsteres com 55 dias de infecção gerou redução de triglicérides (123,0 mg/dL) em relação aos infectados não tratados (294,0 g/dL) (p <= 0,05), além dos níveis de triglicérides nos animais infectados não tratados terem aumentado quando comparados aos controles não tratados (119,0 mg/dL) (p <= 0,05). Houve também, redução de triglicérides nos animais não infectados tratados com ciprofibrato (89,0 mg/dL) comparando-se aos infectados não tratados (p <= 0,05). Os níveis de colesterol nos hamsteres não infectados tratados com ciprofibrato reduziram (53,5 mg/dL) em comparação aos infectados não tratados (93,0 mg/dL) (p <= 0,05). Já naqueles que foram infectados e tratados com ciprofibrato, constatamos redução de colesterol (53,5 mg/dL) quando comparados aos infectados não tratados (p <= 0,05). Os níveis de HDL não aumentaram com ciprofibrato e foram similares entre os hamsteres infectados não tratados e os controles não tratados. A carga parasitária no baço e no fígado não foi reduzida com ciprofibrato. Na leishmaniose visceral em hamster ocorrem alterações do metabolismo lipídico com aumento de triglicérides e redução da expressão da mRNA… Advisors/Committee Members: Goto, Hiro.

Subjects/Keywords: Hamsters; Hamsters; Leishmaniose visceral; Lipídeos - metabolismo; Lipids - metabolism; Lipoproteínas; Lipoproteins; Messenger RNA; Peroxisomes; Peroxissomos; RNA mensageiro; Visceral leishmaniasis

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APA (6^th Edition):

Dantas, I. M. d. C. (2014). Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico. (Masters Thesis). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/99/99131/tde-03082015-103941/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Dantas, Ive Maíra de Carvalho. “Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico.” 2014. Masters Thesis, University of São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/99/99131/tde-03082015-103941/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Dantas, Ive Maíra de Carvalho. “Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico.” 2014. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Dantas IMdC. Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico. [Internet] [Masters thesis]. University of São Paulo; 2014. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/99/99131/tde-03082015-103941/ ;.

Council of Science Editors:

Dantas IMdC. Perfil lipídico na leishmaniose visceral em hamster e expressão de mRNA de genes relacionados ao metabolismo liprotéico. [Masters Thesis]. University of São Paulo; 2014. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/99/99131/tde-03082015-103941/ ;

Universidade Estadual de Campinas

17. Duarte, Gustavo Turqueto, 1982-. Avaliação da importância do controle da estabilidade de RNAm na sinalização por glicose e ABA e na interação desses sinais em Arabidopsis thaliana: Evaluation of the importance of mRNA stability control in glucose and ABA-signaling and in the interaction of these signals in Arabidopsis thaliana.

Degree: 2012, Universidade Estadual de Campinas

URL: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317159

► Abstract: Plants, as sessile organisms, have developed a set of mechanisms that allow efficient adaptation to adverse environmental conditions. These processes rely on the integration… (more)

▼ Abstract: Plants, as sessile organisms, have developed a set of mechanisms that allow efficient adaptation to adverse environmental conditions. These processes rely on the integration of hormone biosynthesis, activation of stress-responsive pathways and on a balanced use of the available energy. Sugars, besides their role as carbon and energy sources, may also function as signaling molecules that may act together with hormonal signals to trigger adaptive responses to biotic and abiotic stresses. In this context, several studies have indicated an important relation between abscisic acid (ABA), one of the major hormones related to abiotic stresses responses, and glucose. ABA signaling, besides its function over transcription control, is known to involve factors regulating the stability of mRNAs. However, the importance of glucose-mediated mRNA decay control is essentially unknown. Our work intended to evaluate the potential of the participation of post-transcriptional regulations in response to ABA and glucose in Arabidopsis thaliana, by determining mRNA profile alteration in response to these signals after transcription inhibition. An experimental model which optimizes the conditions for transcription inhibition was established and used for transcriptome profiling with CATMA microarrays. A total of 962 genes were found to be differentially expressed after the treatments, suggesting a possible post-transcriptional control acting upon 204, 245 and 513 transcripts in response to glucose, ABA and the combination glucose + ABA, respectively. The genes were classified by their functions according to Gene Ontology, suggesting a close relation with adaptive response to stress conditions. Apparently, ABA- and glucose-mediated control of mRNA stability follows two opposite strategies, while ABA post-transcriptional responses may also act as a fast negative feedback mechanism over its own core signaling pathway, as a way to desensitize and reset the pathway responses. The second part of this work focused on the participation of microRNAs (miRNAs) pathway in responses mediated by glucose during plant early developmental stages. The mutants ago1-25 and hyl1-2, which are deficient in miRNA activity and biogenesis, respectively, showed hyposensitivity to glucose during a narrow time window of early plant development, between germination and seedling establishment. Such result raises the possibility that miRNA pathway may be involved in the glucose-mediated delay of early seedling development. To obtain further evidences about which miRNAs could be involved, the expression profile of 200 pri-miRs was evaluated by large-scale quantitative real-timepolymerase chain reaction (qRT-PCR) profiling, indicating that 38 pri-miRNA are potentially regulated by glucose, several of which are known to participate directly or indirectly in plant development. The data indicate that deficiency in miRNA machinery leads to an imbalance on glucose control over gene expression during early seedling development Advisors/Committee Members: UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS (CRUESP), Vincentz, Michel Georges Albert, 1958- (advisor), Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia (institution), Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (nameofprogram), Souza, Anete Pereira de (committee member), Caldana, Camila (committee member), Kobarg, Jörg (committee member), Nogueira, Fabio Tebaldi Silveira (committee member).

Subjects/Keywords: Regulação pós-transcricional; Glicose; Acido abscisico; Arabidopsis; RNA mensageiro - Estabilidade; Post-transcriptional control; Glucose; Abscisic acid; Arabidopsis thaliana; Messenger RNA - Stability

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APA (6^th Edition):

Duarte, Gustavo Turqueto, 1. (2012). Avaliação da importância do controle da estabilidade de RNAm na sinalização por glicose e ABA e na interação desses sinais em Arabidopsis thaliana: Evaluation of the importance of mRNA stability control in glucose and ABA-signaling and in the interaction of these signals in Arabidopsis thaliana. (Thesis). Universidade Estadual de Campinas. Retrieved from http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317159

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Duarte, Gustavo Turqueto, 1982-. “Avaliação da importância do controle da estabilidade de RNAm na sinalização por glicose e ABA e na interação desses sinais em Arabidopsis thaliana: Evaluation of the importance of mRNA stability control in glucose and ABA-signaling and in the interaction of these signals in Arabidopsis thaliana.” 2012. Thesis, Universidade Estadual de Campinas. Accessed January 23, 2021. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317159.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Duarte, Gustavo Turqueto 1. Avaliação da importância do controle da estabilidade de RNAm na sinalização por glicose e ABA e na interação desses sinais em Arabidopsis thaliana: Evaluation of the importance of mRNA stability control in glucose and ABA-signaling and in the interaction of these signals in Arabidopsis thaliana. [Internet] [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2012. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317159.

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Council of Science Editors:

Duarte, Gustavo Turqueto 1. Avaliação da importância do controle da estabilidade de RNAm na sinalização por glicose e ABA e na interação desses sinais em Arabidopsis thaliana: Evaluation of the importance of mRNA stability control in glucose and ABA-signaling and in the interaction of these signals in Arabidopsis thaliana. [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2012. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/317159

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Universidade Estadual de Campinas

18. Meloto, Carolina Beraldo, 1983-. Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD.

Degree: 2013, Universidade Estadual de Campinas

URL: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/290517

► Abstract: Catecolamine-O-methyltransferase (COMT) is an enzyme with broad biological functions, including pain modulation, exerted through metabolization of substrates such as dopamine, epinephrine, and norepinephrine. It… (more)

▼ Abstract: Catecolamine-O-methyltransferase (COMT) is an enzyme with broad biological functions, including pain modulation, exerted through metabolization of substrates such as dopamine, epinephrine, and norepinephrine. It is well known that COMT activity is genetically polymorphic in humans, and correlates to individual pain perception and efficiency in its remission among temporomandibular disorder (TMD) patients treated with propranolol. Thus, our first aim was to investigate new single nucleotide polymorphism (SNP) that might mark for this benefit. Indeed, we have found a new SNP, rs165774 (G>A), that was associated with TMD or intermediate phenotypes in two different cohorts. This polymorphism, in turn, is in close proximity to a second SNP, rs165895 (T>C), both in the 3' untranslated region (3'UTR) of an alternative COMT mRNA that has not yet been characterized. Therefore, we also aimed to (i) verify the expression of this transcript in different human tissues and cell systems, tracking it through RT-PCR (Reverse Transcriptase - Polymerase Chain Reaction); (ii) predict the crystalline structure of the enzyme encoded by it, modeling it with discrete molecular dynamics; (iii) express it in a cell system and compare its relative expression and enzymatic activity to the conventional isoform, using RT-PCR and HPLC (High Performance Liquid Chromatography), respectively; and (iv) verify the effects of SNPs rs165774 and rs165895 on the transcript, creating different mutants by site-directed mutagenesis and observing their effects on the relative expression and enzymatic activity. Our findings show that (i) the alternative COMT transcript is expressed in different human tissues and cell systems; (ii) the crystalline structure of its enzyme exhibits a unique C-terminus that is distinct from the conventional isoform; and that this transcript is (iii) less relatively expressed and its enzyme is less active than the conventional transcript and enzyme, respectively, and (iv) is regulated, at transcriptional level, by the SNPs rs165774 e rs165895. With this study, we conclude that SNP SNPs rs165774 is a strong genetic marker for TMD; that along with SNPs rs165895, they are located in the 3'UTR of an alternative COMT mRNA which proved, for the first time, to be able of encoding an alternative isoform of the enzyme that exhibits enzymatic activity; and that this alternative COMT mRNA is regulated, at transcriptional level, by both SNPs Advisors/Committee Members: UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS (CRUESP), Rizzatti-Barbosa, Celia Marisa, 1957- (advisor), Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Odontologia de Piracicaba (institution), Programa de Pós-Graduação em Clínica Odontológica (nameofprogram), Camparis, Cinara Maria (committee member), Serrano, Priscila de Oliveira (committee member), Del Bel Cury, Altair Antoninha (committee member), Line, Sergio Roberto Peres (committee member).

Subjects/Keywords: Transtornos da articulação temporomandibular; Polimorfismo de nucleotídeo único; RNA mensageiro; Temporomandibular joint disorders; Polymorphism single nucleotide; RNA messenger

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APA (6^th Edition):

Meloto, Carolina Beraldo, 1. (2013). Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD. (Thesis). Universidade Estadual de Campinas. Retrieved from http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/290517

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Meloto, Carolina Beraldo, 1983-. “Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD.” 2013. Thesis, Universidade Estadual de Campinas. Accessed January 23, 2021. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/290517.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Meloto, Carolina Beraldo, 1983-. “Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD.” 2013. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Meloto, Carolina Beraldo 1. Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD. [Internet] [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2013. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/290517.

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Council of Science Editors:

Meloto, Carolina Beraldo 1. Caracterização de uma nova isoforma da enzima COMT associada à DTM: Characterization of a new COMT isoform associated with TMD. [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2013. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/290517

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Universidade de Lisboa

19. Estima, Cláudia Filipa de Noronha. The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia.

Degree: 2016, Universidade de Lisboa

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/26387

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Tese de mestrado, Biologia Molecular e Genética, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016

A beta talassémia é uma doença genética que se caracteriza pela… (more)

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Tese de mestrado, Biologia Molecular e Genética, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016

A beta talassémia é uma doença genética que se caracteriza pela redução ou ausência de síntese de beta globina, um dos constituintes da hemoglobina, resultando no aumento de glóbulos vermelhos e, consequentemente, em anemia. Uma das causas desta doença tem origem na alteração de um nucleótido, levando à introdução de um codão de terminação prematura (na sigla inglesa PTC ou codão nonsense) nos transcritos de beta globina. A presença de um PTC não permite que a tradução progrida normalmente, ocorrendo, na maior parte dos casos, a formação de péptidos truncados que são, possivelmente, não funcionais ou, até, tóxicos para a célula. No sentido de recuperar a homeostase, a célula desenvolveu mecanismos de controlo de qualidade para assegurar a fidelidade da expressão genética. Entre estes mecanismos está o decaimento do RNA mensageiro (mRNA) mediado por mutações nonsense (na sigla inglesa NMD – nonsense mediated mRNA decay) que permite identificar e degradar transcritos que contenham um PTC, reduzindo a sua abundância. Deste modo, a eliminação destes transcritos anómalos evita a formação e acumulação de proteínas truncadas que, caso contrário, danificariam a célula. Assim, o NMD tem, na maioria dos casos, um papel protetor contra erros genéticos. A degradação do transcrito que contém o PTC inicia-se logo após a exportação da ribonucleoproteína mensageira (na sigla inglesa mRNP) para o citoplasma. Durante a ronda pioneira de tradução, se o transcrito não possuir um PTC, o ribossoma remove da mRNP todos os complexos de junção exão-exão (na sigla inglesa EJC) até chegar ao codão de terminação. Os EJC são complexos multiproteicos, depositados 20 a 24 nucleótidos (nt) de distância a montante das junções exão-exão (local de excisão dos intrões) durante o splicing. Se, por ventura, o transcrito possuir um PTC e este se localizar a, pelo menos, 50 a 55 nt de distância a montante da última junção exão-exão, a tradução é terminada prematuramente e pelo menos um EJC fica associado ao mRNA. Nestas condições, o EJC facilita o recrutamento e a interacção dos factores do NMD com o complexo de terminação da tradução, activando o NMD. Este é o caso mais comum, no qual o transcrito é degradado, reduzindo os seus níveis drasticamente (entre 0 a 20% dos níveis normais). Como exemplo para esta situação temos o caso do transcrito de beta globina com uma mutação nonsense no codão 39. Contudo, esta regra posicional dos EJC não é tão linear como aparenta, dado que existem transcritos que, mesmo estando nas condições previstas pelo modelo, conseguem resistir à acção do NMD, como é o caso de mRNAs que contenham PTCs próximos do codão de iniciação. Como exemplo de um mRNA que escapa à degradação pelo NMD, temos o transcrito de beta globina que possui uma mutação nonsense no codão 15, sendo que os seus níveis de expressão são semelhantes aos do gene da beta globina normal. De facto, verificou-se que existem outras características do mRNA, para além…

Advisors/Committee Members: Romão, Luísa Maria Ferreira, Menezes, Juliane.

Subjects/Keywords: Tradução do RNA mensageiro; Mutação nonsense; Terapia de supressão; G418; PTC124; Teses de mestrado - 2016; Departamento de Biologia Vegetal

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APA (6^th Edition):

Estima, C. F. d. N. (2016). The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia. (Thesis). Universidade de Lisboa. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/26387

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Estima, Cláudia Filipa de Noronha. “The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia.” 2016. Thesis, Universidade de Lisboa. Accessed January 23, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/26387.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Estima, Cláudia Filipa de Noronha. “The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia.” 2016. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Estima CFdN. The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia. [Internet] [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2016. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/26387.

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Council of Science Editors:

Estima CFdN. The effect of G418 and PTC124 as suppression therapy for Beta Thalassemia. [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2016. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/26387

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Universidade do Rio Grande do Sul

20. Joelsons, Gabriel. Avaliação molecular das disfunções subclínicas do enxerto renal : quantificação gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-β, CTGF e CD138 no sangue periférico de pacientes com função estável que realizaram biópsia protocolar no terceiro mês após o transplante renal.

Degree: 2014, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/106762

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Introdução: A sobrevivência em curto prazo dos transplantes renais tem melhorado notavelmente nas últimas duas décadas. No entanto, a sobrevivência em longo prazo de enxertos… (more)

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Introdução: A sobrevivência em curto prazo dos transplantes renais tem melhorado notavelmente nas últimas duas décadas. No entanto, a sobrevivência em longo prazo de enxertos e pacientes ainda são muito inferiores ao desejado e a maioria dos enxertos são perdidos por falecimento dos receptores e deterioração crônica da função do enxerto. Acredita-se que a maior parte das lesões que resultam em encurtamento da sobrevida do enxerto se iniciam logo após o transplante e muitas vezes são subclínicas. O desenvolvimento de biomarcadores não invasivos para identificar com precisão as lesões sub-clínicas, sem a necessidade de biópsias de protocolo, seria um grande passo para a prática clínica de transplantes de órgãos, uma vez que permitiria o reconhecimento precoce de eventos de agressões ao enxerto e poderia levar a adequadas ações terapêuticas potencialmente propiciando sobrevida mais prolongada dos aloenxertos. Objetivos: O objetivo do presente estudo foi avaliar o potencial diagnóstico de agressões sub-clínicas da análise molecular não-invasiva da expressão gênica de leucócitos do sangue periférico em receptores de transplante renal com função estável em curto prazo. Métodos: Cento e trinta e seis pacientes renais com função estável do enxerto foram arrolados no estudo e realizaram biópsia protocolar no 3º mês póstransplante. Foram coletadas amostras de sangue periférico concomitantemente para realizarmos a quantificação da expressão gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-B, CTGF e CD138 através da metodologia de PCR em tempo real. Resultados: Trinta e nove pacientes foram diagnosticados com rejeição aguda (28,7%), sendo 33 destes com alterações borderline, 5 com rejeição aguda Banff IA e um paciente com rejeição Banff IB, vinte pacientes apresentaram fibrose intersticial e atrofia tubular (14,7%), sete apresentaram necrose tubular aguda (5,1%), três infecções pelo vírus do polioma (2,2%) e um caso de nefrotoxicidade aguda por inibidores da calcineurina (0,8%). A mensuração da expressão gênica foi realizada através de qPCR e os pacientes com disfunção do enxerto apresentaram expressões diminuídas de perforina, TIM3, FOXP3 e TGF-β em relação aos pacientes com rejeição aguda e histologia normal do enxerto. Outras análises demonstraram que a perforina, TIM3 e FOXP3 também são capazes de excluir o diagnóstico de rejeição aguda, com valores preditivos negativos (VPN) de 83%, 83% e 79,6%, respectivamente. Em uma análise combinada dos 3 genes associados o VPN para rejeição aguda foi de 86.4%. A avaliação do RNA mensageiro dos genes TGF-B e CTGF mostrou que eles estão hiperexpressos nos enxertos com fibrose intersticial e atrofia tubular. Conclusões: Existe uma elevada incidência de agressões sub-clínicas dos enxertos renais que podem ser detectadas por biópsias protocolares. A mensuração do RNA mensageiro, em amostras do sangue periférico, mostrou ser uma ferramenta de potencial utilidade em identificar essas agressões de forma não-invasiva.

Background: Short term survival of kidney transplants has improved remarkably over…

Advisors/Committee Members: Manfro, Roberto Ceratti.

Subjects/Keywords: Kidney transplantation; Transplante de rim; Acute rejection; Rejeição de enxerto; Expressão gênica; Gene expression; RNA mensageiro; Diagnosis; mRNA

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APA (6^th Edition):

Joelsons, G. (2014). Avaliação molecular das disfunções subclínicas do enxerto renal : quantificação gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-β, CTGF e CD138 no sangue periférico de pacientes com função estável que realizaram biópsia protocolar no terceiro mês após o transplante renal. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/106762

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Joelsons, Gabriel. “Avaliação molecular das disfunções subclínicas do enxerto renal : quantificação gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-β, CTGF e CD138 no sangue periférico de pacientes com função estável que realizaram biópsia protocolar no terceiro mês após o transplante renal.” 2014. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/106762.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Joelsons G. Avaliação molecular das disfunções subclínicas do enxerto renal : quantificação gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-β, CTGF e CD138 no sangue periférico de pacientes com função estável que realizaram biópsia protocolar no terceiro mês após o transplante renal. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2014. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/106762.

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Council of Science Editors:

Joelsons G. Avaliação molecular das disfunções subclínicas do enxerto renal : quantificação gênica de perforina, TIM3, FOXP3, TGF-β, CTGF e CD138 no sangue periférico de pacientes com função estável que realizaram biópsia protocolar no terceiro mês após o transplante renal. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2014. Available from: http://hdl.handle.net/10183/106762

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Universidade de Lisboa

21. Soares, Rui Manuel da Silva, 1975-. Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2.

Degree: 2011, Universidade de Lisboa

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/3581

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Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas (Imunologia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2011

The acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), first described in 1981, has caused more… (more)

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Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas (Imunologia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2011

The acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), first described in 1981, has caused more than 25 million deaths worldwide with an estimated 2 million deaths related to disease in 2008, representing one of the most important public health problems worldwide. AIDS is caused by infection with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and type 2 (HIV-2). HIV-1 infection is pandemic, with more than 33 million people estimated to be infected, whilst HIV-2 infection remains relatively contained to a few West African countries, with Portugal representing the only non-African country with a significant HIV-2 prevalence (3.2% of infection cases reported in 2009). HIV-2 infection is characterized by a slower progression to AIDS as compared to HIV-1 infection, with a limited impact on the survival of the majority of infected adults. The rate of CD4 T cell decline is much slower than in HIV-1 and the levels of circulating virus (viremia) are significantly lower irrespective of disease stage. The low levels of viremia in patients infected with HIV-2 suggest a lower replicative activity. However, despite the lower viremia in HIV-2, our results, as well as studies from other groups, showed that levels of proviral DNA in peripheral blood mononuclear cells are similar in both infections, suggesting that a similar number of cells are infected. The cell tropism of HIV-2 and HIV-1 is determined by the expression of chemokine receptors on target cells in addition to the expression of the CD4 molecule. CCR5 and CXCR4 are the major co-receptors that are used for HIV-1 entry, and their levels of expression were shown to be directly related to the susceptibility to infection and to the rate of disease progression in HIV-1 infected individuals. Several studies suggest that, although HIV-2 can use a larger number of co-receptors as compared to HIV-1 in vitro, the major co-receptors used in vivo are also CCR5 and CXCR4. It is possible that different expression levels of these co-receptors lead to different patterns of infection in T cells populations determining the reduced production of virus and disease progression that is observed in individuals infected with HIV-2. We compared the expression of CCR5 and CXCR4 in patients infected with HIV-2 and HIV-1 that had similar levels of CD4 T cell depletion and found that patients infected with HIV-2 had an increased frequency of cells expressing CCR5 in the CD4 memory-effector population as compared to seronegative subjects. We also found a significant correlation between the frequency of cells expressing CCR5 in total CD4 T cells and the level of CD4 T cell depletion in individuals infected with HIV-2, but not in the ones infected with HIV-1. The expression of CCR5 is induced by cell activation and is usually restricted to the memory-effector population. We found the existence of a direct correlation between the frequency of cells expressing CCR5 and the levels of immune activation in…

Advisors/Committee Members: Sousa, Ana Espada de, 1962-.

Subjects/Keywords: Alergia e imunologia; HIV; HIV-2; Carga viral; Replicação viral; Infecções por HIV; RNA mensageiro; Teses de doutoramento - 2011

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APA (6^th Edition):

Soares, Rui Manuel da Silva, 1. (2011). Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2. (Thesis). Universidade de Lisboa. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/3581

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Soares, Rui Manuel da Silva, 1975-. “Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2.” 2011. Thesis, Universidade de Lisboa. Accessed January 23, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/3581.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Soares, Rui Manuel da Silva, 1975-. “Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2.” 2011. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Soares, Rui Manuel da Silva 1. Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2. [Internet] [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/3581.

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Council of Science Editors:

Soares, Rui Manuel da Silva 1. Papel da carga viral celular na imunodeficiência HIV/SIDA : contributo do estudo da infecção pelo HIV-2. [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/3581

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22. Daniela da Silva Bezerra. âAnÃlise da viabilidade e expressÃo de genes de virulÃncia de Streptococcus mutans em lesÃes dentinÃrias de crianÃas com cÃrie precoce da infÃnciaâ.

Degree: PhD, 2014, Universidade Federal do Ceará

URL: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=14273 ;

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A cÃrie precoce da infÃncia (CPI) Ã caracterizada pela presenÃa de uma ou mais lesÃes em superfÃcie dentÃria de crianÃas menores de 6 anos de… (more)

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A cÃrie precoce da infÃncia (CPI) Ã caracterizada pela presenÃa de uma ou mais lesÃes em superfÃcie dentÃria de crianÃas menores de 6 anos de idade, sendo considerada um problema de saÃde pÃblica. Streptococcus mutans (SM) Ã considerado o principal agente etiolÃgico da doenÃa e possui vÃrios atributos de virulÃncia que permitem sua sobrevivÃncia na cavidade oral e, portanto, sua seleÃÃo em situaÃÃes de estresse nesse ambiente. Neste contexto, este trabalho teve por objetivos: (a) padronizar um mÃtodo de extraÃÃo e purificaÃÃo de RNA total para viabilizar estudos de expressÃo gÃnica bacteriana de lesÃes de cÃrie dentinÃria in vivo (capÃtulo 1); (b) identificar e quantificar SM metabolicamente ativo e analisar a expressÃo dos genes de virulÃncia atpD, fabM, nox, pdhA e aguD em lesÃes dentinÃrias ativas e inativas (capÃtulo 2). Foi realizada a coleta de 29 amostras de dentina cariada ativa e de 16 amostras de lesÃes dentinÃrias inativas de crianÃas com CPI. As amostras foram submetidas Ã extraÃÃo e purificaÃÃo do RNA total por um mÃtodo padronizado, com base no uso de lise mecÃnica e kit de extraÃÃo comercial e, em seguida, submetidas Ãs reaÃÃes de transcriÃÃo reversa (RT) para obtenÃÃo do DNA complementar (cDNA). Com o intuito de comprovaÃÃo da especificidade dos primers para os genes de virulÃncia de SM em amostras in vivo, 06 amostras de cDNA foram amplificadas e submetidas ao sequenciamento de Sanger para cada primer. ApÃs verificaÃÃo da especificidade, reaÃÃes em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real da transcriÃÃo reversa (RT-qPCR) foram executadas para todas as amostras. Os resultados obtidos mostraram que o RNA bacteriano pÃde ser extraÃdo em adequada quantidade e qualidade pelo protocolo padronizado, viabilizando seu uso em estudos de expressÃo de genes bacterianos em dentina cariada (CapÃtulo 01). Os resultados da RT-qPCR mostraram que, apesar da baixa quantificaÃÃo em relaÃÃo aos estreptococos e bactÃrias totais, SM viÃveis foram detectados com quantificaÃÃo semelhante em lesÃes ativas e inativas (p>0.05). Apesar disso, maior expressÃo dos genes de virulÃncia pdhA e aguD foi detectada nas lesÃes inativas (p≤0,05) (CapÃtulo 02). Concluiu-se que, apÃs padronizaÃÃo de uma tÃcnica eficaz de extraÃÃo de RNA, reaÃÃes de RT-qPCR foram executadas com eficiÃncia para identificaÃÃo, quantificaÃÃo e expressÃo gÃnica de SM em amostras de dentina humana cariada. SM estavam viÃveis nos dois grupos de lesÃes, porÃm sÃ nas lesÃes dentinÃrias inativas mostraram maior expressÃo dos genes pdhA e aguD, provavelmente para viabilizar sua atividade metabÃlica nas condiÃÃes menos favorÃveis Ã sua sobrevivÃncia, inerentes a este substrato.

Early childhood caries (ECC) is characterized by the presence of one or more lesions on dental surface of children under 6 years old, being considered a public health issue. Streptococcus mutans (SM) is considered the main etiologic agent of the disease and has several virulence features that allow its survival in the oral cavity and, therefore, its selection under environmental…

Advisors/Committee Members: Nadia Accioly Pinto Nogueira, Marlise InÃs Klein, Maria Izabel Florindo Guedes, Rodrigo Maranguape Silva da Cunha, Lidiany Karla Azevedo Rodrigues.

Subjects/Keywords: ODONTOLOGIA; CÃrie DentÃria; Dentina; RNA Mensageiro; ReaÃÃo em Cadeia da Polimerase em Tempo Real; ExpressÃo GÃnica; Dental Caries; Dentin; RNA, Messenger; Real-Time Polymerase Chain Reaction; Gene Expression

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Bezerra, D. d. S. (2014). âAnÃlise da viabilidade e expressÃo de genes de virulÃncia de Streptococcus mutans em lesÃes dentinÃrias de crianÃas com cÃrie precoce da infÃnciaâ. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Ceará. Retrieved from http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=14273 ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Bezerra, Daniela da Silva. “âAnÃlise da viabilidade e expressÃo de genes de virulÃncia de Streptococcus mutans em lesÃes dentinÃrias de crianÃas com cÃrie precoce da infÃnciaâ.” 2014. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Ceará. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=14273 ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Bezerra DdS. âAnÃlise da viabilidade e expressÃo de genes de virulÃncia de Streptococcus mutans em lesÃes dentinÃrias de crianÃas com cÃrie precoce da infÃnciaâ. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Ceará 2014. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=14273 ;.

Council of Science Editors:

Bezerra DdS. âAnÃlise da viabilidade e expressÃo de genes de virulÃncia de Streptococcus mutans em lesÃes dentinÃrias de crianÃas com cÃrie precoce da infÃnciaâ. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Ceará 2014. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=14273 ;

23. Borim, Leila Neves Bastos. Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico.

Degree: PhD, Pediatria, 2006, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-30092010-122509/ ;

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INTRODUÇÃO: A relevância da expressão MYCN em neuroblastomas sem amplificação, diferentemente do seu aumento quando amplificado, permanece controverso. Neste trabalho, avaliou-se a relação do nível de expressão do transcrito MYCN em neuroblastoma não amplificado com os fatores clínicos e biológicos de prognóstico. MÉTODOS: Neste estudo observacional realizado entre janeiro de 2000 e dezembro de 2004, foram aferidos os valores do nível de expressão MYCN em 29 amostras tumorais, pela técnica RQ-PCR, no Laboratório de Biologia Tumoral da Fundação Pró-Sangue de São Paulo. Seus resultados foram analisados em relação à idade ao diagnóstico, ao estadiamento tumoral, ao grupo de risco, à ocorrência de recaída tumoral e de óbito. RESULTADOS: Foram nove crianças com idade 1 ano, os valores da expressão do transcrito MYCN variaram de 0,041 e 27,569, mediana 3,193. O estadiamento foi: quatro estádio 1; três estádio 2; oito estádio 3 e 14 crianças estádio 4. Entre 20 crianças com classificação patológica, 11 foram favoráveis e nove desfavoráveis. Considerando a mediana dos valores expressos a estratificação em grupos de risco com aumento da expressão foram: cinco crianças baixo risco; quatro risco intermediário e cinco alto risco. Grupos de risco sem aumento da expressão foram: duas crianças baixo risco; quatro risco intermediário e nove alto risco. Vinte e oito crianças obtiveram remissão completa e entre elas 14 apresentaram doença progressiva, sendo que sete morreram. As variáveis clínicas e biológicas não apresentaram freqüências diferentes entre os grupos de risco sem e com aumento de expressão. Entre os grupo alto risco e não alto-risco as variáveis idade, recaída tumoral e óbito apresentaram resultado com significado estatístico quando não se considerou o valor da expressão e quando não houve o seu aumento. Entre os grupos alto risco e nãoalto risco com aumento da expressão apenas a idade apresentou resultado com significado estatístico. CONCLUSÃO: Em crianças com estádio clínico não avançado o nível de expressão parece exercer uma relevância clínica, sugerindo um efeito protetor quanto menor for o aumento da expressão MYCN.

INTRODUTION: MYCN expression value in non-amplified neuroblastosmas remains a controversial issue. In order to add contributions to this field, children with nonamplified neuroblastomas were studied regarding their expression and correlation with clinical and other biological factors. METHODS: Twenty nine tumor samples obtained from non-consecutive patients admitted from January, 2000 through December, 2004, had their MYCN transcript expression levels evaluated according to the RQ-PCR assay, at the Tumoral Biology of Laboratory of the \"Fundação Pró -Sangue Hemocentro de São Paulo\", and compared to the following other factor: age at onset; tumor stage; risk - group; tumoral relapse rate and death. RESULTS: nine under one-year-old children and 20 over one-year-old children, with MYCN transcription expression level between 0.041 and 27.569, mean 3.193. Four children were stage 1, three were stage 2,…

Advisors/Committee Members: Odone Filho, Vicente, Scrideli, Carlos Alberto.

Subjects/Keywords: Neuroblastoma/fisiopalogia; Neuroblastosma/physiopathology; Prognosis; Prognóstico; RNA mensageiro; RNA messenger

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APA (6^th Edition):

Borim, L. N. B. (2006). Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-30092010-122509/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Borim, Leila Neves Bastos. “Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico.” 2006. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-30092010-122509/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Borim, Leila Neves Bastos. “Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico.” 2006. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Borim LNB. Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2006. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-30092010-122509/ ;.

Council of Science Editors:

Borim LNB. Estudo da expressão de MYCN em neuroblastomas que não o amplifiquem: correlação com estádios e relevância como fator de prognóstico. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2006. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5141/tde-30092010-122509/ ;

24. Clarissa Pedrosa da Costa Gomes. Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos.

Degree: 2013, Universidade Católica de Brasilia

URL: http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1971

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A prática regular de atividade física tem sido reconhecida como um dos fatores mais importantes na manutenção da saúde, particularmente no que se refere à… (more)

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A prática regular de atividade física tem sido reconhecida como um dos fatores mais importantes na manutenção da saúde, particularmente no que se refere à sua ação preventiva. No entanto, o moderno estilo de vida sedentário tem aumentado a incidência de diversas moléstias na população, especialmente cardiovasculares. Portanto, determinar os mecanismos moleculares responsáveis pelos benefícios do exercício físico torna-se um grande aliado na prevenção de várias doenças. Este trabalho tem dois objetivos principais: (1) investigar o perfil de microRNAs músculo-específicos no plasma de humanos em resposta a uma meiamaratona e (2) investigar o papel do treinamento aeróbio crônico no perfil de microRNAs no plasma e músculo esquelético, bem como de RNA mensageiros (mRNAs) no músculo esquelético em modelos de hipertensão animal (SHR). O plasma de corredores recreacionais obtido antes e após uma meia-maratona foi estudado por PCR quantitativa (qPCR) para três microRNAs específicos de músculo (1, 133a e 206). Nesses houve um aumento significativo imediatamente após a corrida, sugerindo tanto dano muscular quanto predominância de tipo de fibra muscular lenta nesses indivíduos. Os modelos animais foram divididos em três grupos: controle, exercício de baixa intensidade (EBI) e exercício de alta intensidade (EAI). Enquanto o grupo controle permaneceu sedentário, os de exercício foram submetidos a corrida em esteira por oito semanas. Os animais exercitados aumentaram sua capacidade aeróbia e foi verificada uma diminuição significativa da pressão arterial após o período de treinamento, confirmando o efeito hipotensor pós-exercício. O plasma e o gastrocnêmio foram avaliados por sequenciamento de RNA. Foram observadas diferenças significativas em 28 microRNAs circulantes, com 12 em comum entre as intensidades de exercício. Entre esses, estavam microRNAs possivelmente ligados à hipertensão, saúde renal, adipogênese e miogênese. Não foram observadas diferenças significativas nos microRNAs em músculo, contudo, mRNAs envolvidos na via de biogênese mitocondrial, contração do músculo liso vascular, fosforilação oxidativa e proliferação celular aumentaram nos grupos de exercício em relação ao controle. Foi possível concluir que um exercício agudo altera microRNAs específicos de músculo em plasma de humanos e que o efeito crônico do exercício inclui alterações no perfil de microRNAs em plasma e mRNAs em tecido. Este é o primeiro trabalho onde um perfil amplo de microRNAs circulantes e de microRNAs e mRNAs em tecido é obtido em resposta a exercício físico. Assim, ele contribui para uma visão mais ampla dos microRNAs em plasma envolvidos na adaptação ao exercício em modelos animais hipertensos, abrindo novas perspectivas para estudos futuros.

The regular practice of physical activity has been recognized as one of the most effective factors to maintain good health and quality of life, as well as to prevent diseases. However, the modern lifestyle that encourages sedentarism and ingestion of high calorie foods has increased the incidence of…

Advisors/Committee Members: Octavio Luiz Franco, Rinaldo Wellerson Pereira.

Subjects/Keywords: ácido ribonucléico; rna mensageiro; exercícios físicos; hipertensão; sistema musculosquelético; genética; genomas; biotecnologia; GENETICA; physical exercise; hypertension; skeletal muscle; plasma; quantitative pcr; rna-seq; GENETICA

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APA (6^th Edition):

Gomes, C. P. d. C. (2013). Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos. (Doctoral Dissertation). Universidade Católica de Brasilia. Retrieved from http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1971

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Gomes, Clarissa Pedrosa da Costa. “Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos.” 2013. Doctoral Dissertation, Universidade Católica de Brasilia. Accessed January 23, 2021. http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1971.

MLA Handbook (7^th Edition):

Gomes, Clarissa Pedrosa da Costa. “Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos.” 2013. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Gomes CPdC. Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Católica de Brasilia; 2013. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1971.

Council of Science Editors:

Gomes CPdC. Investigações de microRNAs e RNAs mensageiros na adaptação ao exercício aeróbio em ratos e humanos. [Doctoral Dissertation]. Universidade Católica de Brasilia; 2013. Available from: http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1971

Universidade do Rio Grande do Sul

25. Rohden, Francieli. Estudo da expressão de mRNA, síntese e liberação de GIP e GLP-1 no jejuno de indivíduos obesos grau III, diabéticos e não diabéticos, sua modulação por ácidos graxos monoinsaturados e envolvimento de marcadores inflamatórios.

Degree: 2015, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/117998

► A obesidade juntamente com suas comorbidades vem aumentando em números assustadores. A cirurgia bariátrica associada com a qualidade dos alimentos consumidos é a mais eficaz… (more)

▼ A obesidade juntamente com suas comorbidades vem aumentando em números assustadores. A cirurgia bariátrica associada com a qualidade dos alimentos consumidos é a mais eficaz opção para o tratamento da obesidade e as suas complicações, especialmente o diabetes tipo 2. O excesso de tecido adiposo pode desencadear uma inflamação crônica e sistêmica, ocasionando disfunção dos tecidos, entre eles o mesentérico, responsável por alojar diversas células secretoras de fatores que influenciam no metabolismo da glicose. Objetivos: O objetivo deste estudo foi investigar a expressão do RNA mensageiro (mRNA) de proglucagon, peptídeo insulinotrófico dependente de glicose (GIP), prohormônio convertase 1/3 (PC1/3), e dipeptidil peptidase-IV (DPP-IV) em células jejuno de obesos mórbidos (OB) não diabéticos do tipo 2 diabetes (NDM2) e diabéticos tipo 2 (DM2), para determinar a base molecular da secreção das incretinas após a cirurgia bariátrica. Além disso, objetivamos avaliar os efeitos in vitro de MUFAs sobre a expressão do mRNA, imunoconteúdo e secreção de incretinas, bem como a relação entre a expressão de PPAR-γ e NF-kB em células intestinais de pacientes obesos submetidos a cirurgia bariátrica. E com objetivo de identificar um biomarcador para DM2, dosamos níveis de S100B sanguíneo em indivíduos não obesos (NOB) NDM2 ou DM2, OB NDM2 ou DM2. Métodos: As amostras de mucosa do jejuno foram obtidas dos pacientes OB submetidos à cirurgia bariátrica. Pacientes NDM2: retirada de uma secção do jejuno a 60 centímetros distais ao ligamento de Treitz; e DM2: remoção de uma secção do jejuno a cerca de 100 cm distais ao ligamento de Treitz. A mucosa do jejuno foi analisada com ou sem tratamento com ácidos graxos oléico, elaidico ou vaccenico (50 μM). O RNA total foi extraído usando Trizol. Foi realizada a quantificação por PCR em tempo real (RT-qPCR). As amostras foram sequenciadas para PC1/3 pela ACTGene Análises Moleculares Ltda. O imunoconteúdo de GIP e de peptídeo semelhante a glucagon-1 (GLP-1) foi quantificado em microscópio de fluorescência. A secreção de GIP, GLP-1 e S100B foi quantificada pela técnica de ELISA, utilizando KIT específico. Resultados: DM2 apresentaram diminuição na expressão PC1 / 3 mRNA (primer a, p = 0,014; primer b, p = 0,048). 36,5% não transcreveram o mRNA de PC1/3. NDM2 e indivíduos DM2 não mostraram significativa diferença na expressão do mRNA de proglucagon, GIP e DPP-IV. O imunoconteúdo de GLP-1 e GIP se encontraram diminuído em DM2, mas incubação com alta concentração de glicose estimulou esses depósitos. Nas incubações, ácido vaccênico estimulou a expressão de mRNA de GIP e proglucagon no jejuno de obesos NDM2 (p = 0,041; p= 0,041 respectivamente) e proglucagon em DM2 (p = 0,02). O ácido oléico regulou negativamente a expressão de mRNA de DPP-IV em obesos NDM2 (p = 0,045). Vaccênico aumentou significativamente o imuno conteúdo de GLP-1, mas não aumentou a sua secreção. Expressão basal de mRNA do PPAR-γ foi baixa no jejuno dos OB DM2 e não foi modulada após tratamento com os ácidos graxos. DM2 apresentou… Advisors/Committee Members: Guaragna, Regina Maria Vieira da Costa.

Subjects/Keywords: Obesidade mórbida; Cirurgia bariátrica; Diabetes mellitus tipo 2; RNA mensageiro; Polipeptídeo inibidor gástrico; Peptídeo 1 semelhante ao glucagón; Proteínas S100; Ácidos graxos; Jejuno

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APA (6^th Edition):

Rohden, F. (2015). Estudo da expressão de mRNA, síntese e liberação de GIP e GLP-1 no jejuno de indivíduos obesos grau III, diabéticos e não diabéticos, sua modulação por ácidos graxos monoinsaturados e envolvimento de marcadores inflamatórios. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/117998

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Rohden, Francieli. “Estudo da expressão de mRNA, síntese e liberação de GIP e GLP-1 no jejuno de indivíduos obesos grau III, diabéticos e não diabéticos, sua modulação por ácidos graxos monoinsaturados e envolvimento de marcadores inflamatórios.” 2015. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 23, 2021. http://hdl.handle.net/10183/117998.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Rohden F. Estudo da expressão de mRNA, síntese e liberação de GIP e GLP-1 no jejuno de indivíduos obesos grau III, diabéticos e não diabéticos, sua modulação por ácidos graxos monoinsaturados e envolvimento de marcadores inflamatórios. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2015. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/117998.

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Rohden F. Estudo da expressão de mRNA, síntese e liberação de GIP e GLP-1 no jejuno de indivíduos obesos grau III, diabéticos e não diabéticos, sua modulação por ácidos graxos monoinsaturados e envolvimento de marcadores inflamatórios. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/10183/117998

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26. Aguena, Meire. Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli.

Degree: PhD, Microbiologia, 2007, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-30012008-094907/ ;

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O operon pst de Escherichia coli é formado pelos genes pstS, pstC, pstA, pstB e phoU. Os quatro primeiros genes codificam proteínas que compõem um… (more)

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O operon pst de Escherichia coli é formado pelos genes pstS, pstC, pstA, pstB e phoU. Os quatro primeiros genes codificam proteínas que compõem um sistema de transporte do tipo ABC denominado Pst. O sistema Pst, junto com a proteína PhoU participa da repressão dos genes do regulon PHO. A transcrição dos genes do operon pst é induzida pela carência de fosfato inorgânico (Pi). Neste trabalho, o padrão de transcrição do operon pst foi analisado. A existência de um transcrito primário instável foi comprovada através de uma nova técnica de RT-PCR. O papel da RNase E na degradação do mRNA de pst foi demonstrado. A análise das seqüências intergênicas do operon revelou a importância da seqüência REP (Repetitive Extragenic Palindrome) localizada na região intergênica entre pstS e pstC na estabilização da mensagem de pstS. As seqüências localizadas a 5d́os genes pstC, pstB e phoU também foram analisadas e demonstraram uma atividade promotora fraca, que resulta na síntese de transcritos dos genes distais de pst.

The pst operon of Escherichia coli consists of the genes pstS, pstC, pstA, pstB and phoU. The four proximal genes of the operon encode the proteins of the ABC-type Pi phosphate (Pi) transporter Pst.The Pst system, together with the PhoU protein, also acts as a negative regulator of the PHO regulon. Transcription of the pst genes is induced by Pi starvation. The present study describes the transcription pattern of the pst operon. The existence of an unstable primary transcript was confirmed by using an improved RT-PCR protocol. The role of RNase E in pst transcript decay was demonstrated.Analysis of the operon intergenic regions revealed the role of a REP sequence (Repetitive Extragenic Palindrome) located between pstS and pstC in pst mRNA stability. The regions upstream of pstC, pstB and phoU displayed promoter activity. Transcription from these internal promoters resulted in a small amount of mRNAs corresponding to the pst distal genes.

Advisors/Committee Members: Spira, Beny.

Subjects/Keywords: Escherichia coli; Escherichia coli; Biologia Molecular; Molecular biology; mRNA; Operon pst; pst operon; REP sequences; RNA mensageiro; RNase E; RNase E.; Sequências REP

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APA (6^th Edition):

Aguena, M. (2007). Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-30012008-094907/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Aguena, Meire. “Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli.” 2007. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-30012008-094907/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Aguena, Meire. “Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli.” 2007. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Aguena M. Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2007. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-30012008-094907/ ;.

Council of Science Editors:

Aguena M. Análise transcricional do operon pst de Escherichia coli. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2007. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-30012008-094907/ ;

27. Wang, Hui-Tzu Lin. Estudo sequencial do perfil de expressão gênica em biópsias endomiocárdicas parafinadas: associação com rejeição humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco.

Degree: PhD, Medicina/Tecnologia e Intervenção em Cardiologia, 2014, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/98/98131/tde-16032015-085220/ ;

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O transplante cardíaco é a última opção terapêutica para pacientes portadores de insuficiência cardíaca grave. Apesar dos avanços na terapia imunossupressora, a rejeição continua sendo o principal obstáculo para o sucesso do transplante. No presente estudo, propõe-se avaliar o perfil de expressão gênica no tecido cardíaco. Com isso, espera-se contribuir para o melhor entendimento do processo de rejeição a nível molecular. Foram analisadas as amostras sequenciais (1, 3 e 6 meses, 1 e 2 anos pós-transplante) de biópsias endomiocárdicas em parafina de 63 indivíduos transplantados cardíacos. O diagnóstico de rejeição humoral foi realizado pela detecção de C3d e C4d do complemento na reação de imuno-histoquímica, e as expressões dos genes protetores (ADIPOR1, ADIPOR2, HMOXO-1, BCL2L1 e VEGF) e genes associados à inflamação (IL-6, TNF?, IFN?, TGF-?, AIF-1, NOS2, ICAM, VCAM e MCP-1); foram avaliadas pela reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real (qPCR). As frequências de indivíduos positivos para C4d (28,6%) e vasculite (20,0%) foram significantemente maiores em relação ao teste de reatividade de anticorpos realizado nos receptores antes do transplante (6,3%). Houve mudança no perfil de expressão gênica no tecido cardíaco após o transplante, com aumento da expressão dos genes inflamatórios (AIF-1, TNF?, IL-6, NOS2 e VCAM) e diminuição da expressão dos genes protetores (ADIPOR1, ADIPOR2, BCL2L1 e VEGF). Além disso, as expressões dos genes ADIPOR1 e ADIPOR2 foram significantemente menores nos indivíduos positivos para C4d (p<0,001) e gene VEGF (p<0,001) no grupo com vasculite. Houve também uma correlação positiva entre a expressão do gene VEGF e ADIPOR1 (r=0,5688) e ADIPOR2 (r=0,5191). Por outro lado, a expressão aumentada do gene VCAM (p<0,001) foi detectada em todos os tipos de rejeição. Conclui-se que, depois do transplante, o sistema imune do receptor passou a reconhecer os antígenos do órgão transplantado. Com isso, ocorreu uma mudança no perfil de expressão gênica no enxerto cardíaco, caracterizada pela expressão aumentada dos genes inflamatórios e diminuição dos genes protetores. A expressão aumentada do gene VCAM associada à baixa expressão dos genes protetores: ADIPOR1, ADIPOR2, BCL2L1 e VEGF resultaram em maior gravidade da rejeição celular, humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco.

Heart transplantation is the ultimate treatment for patients with severe heart failure. Despite advances in immunosuppressive therapy, rejection still remains the main obstacle to successful transplant. The purpose of this study is to evaluate the gene expression profile in cardiac tissue. With this we hope to contribute to a better understanding of the rejection process at the molecular level. Sequential samples (1, 3, and 6 months, 1 to 2 years post-transplant) endomyocardial biopsies paraffin of 63 heart transplant subjects were analyzed. The diagnosis of humoral rejection was performed by detection of C3d and C4d complement in immunohistochemistry and the expression of protective genes (ADIPOR1, ADIPOR2,…

Advisors/Committee Members: Hirata, Mario Hiroyuki.

Subjects/Keywords: Heart transplantation; Graft rejection; Gene expression; RNA messenger; Biopsy; Paraffin embedding; Polymerase chain reaction; Adiponectin receptors;

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APA (6^th Edition):

Wang, H. L. (2014). Estudo sequencial do perfil de expressão gênica em biópsias endomiocárdicas parafinadas: associação com rejeição humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/98/98131/tde-16032015-085220/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Wang, Hui-Tzu Lin. “Estudo sequencial do perfil de expressão gênica em biópsias endomiocárdicas parafinadas: associação com rejeição humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco.” 2014. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/98/98131/tde-16032015-085220/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Wang HL. Estudo sequencial do perfil de expressão gênica em biópsias endomiocárdicas parafinadas: associação com rejeição humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2014. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/98/98131/tde-16032015-085220/ ;.

Council of Science Editors:

Wang HL. Estudo sequencial do perfil de expressão gênica em biópsias endomiocárdicas parafinadas: associação com rejeição humoral e vasculopatia do aloenxerto cardíaco. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2014. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/98/98131/tde-16032015-085220/ ;

28. Fernandes, Roberta Possato. Quantificação do RNAm de tireoglobulina em sangue periférico de pacientes com câncer diferenciado de tireóide: acompanhamento a longo prazo.

Degree: PhD, Endocrinologia, 2009, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-15042009-154717/ ;

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O carcinoma diferenciado de tireóide (CDT) abrange 95% de todas as doenças malignas da tireóide. Nos EUA, aumentou em 2,4 vezes nos últimos anos (1973-2002).… (more)

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O carcinoma diferenciado de tireóide (CDT) abrange 95% de todas as doenças malignas da tireóide. Nos EUA, aumentou em 2,4 vezes nos últimos anos (1973-2002). O seu tratamento inclui tireoidectomia total, seguido por terapia com radioiodo e supressão do TSH com L-tiroxina. A doença pode recidivar em ~20% dos casos, sendo necessária avaliação periódica através de exames de imagens e dosagem de tireoglobulina sérica (TGs). Os Anticorpos (Acs) anti-TG podem ser detectados em 15 a 25% dos pacientes, comprometendo, parcialmente, o uso da TGs como marcador de recidiva do câncer. Um método alternativo proposto para monitorar os pacientes é a detecção de células tireoidianas em sangue periférico, através da mensuração do RNA mensageiro de TG (RNAm-TG) pela técnica de RTPCR em tempo real. Esta nova metodologia aumenta a sensibilidade da detecção desta molécula. O objetivo deste estudo é verificar a significância da quantificação do RNAm-TG, como método diagnóstico complementar no acompanhamento a longo prazo de pacientes com CDT. Amostras de sangue de 45 pacientes (25 sem metástase, 14 com metástase ganglionar e 6 com metástase à distância) foram coletadas nos tempos: antes e 24, 48, 72 horas, 7 dias, 1, 3, 6, 9 meses, 1, 2, 4, 5, 6 e 7 anos após a dose ablativa de radioiodo. Foi realizada extensiva padronização da técnica com a finalidade de excluir interferências metodológicas, empregando dois genes controles interno (GAPDH e HPRT1) para o cálculo da concentração do RNAm-TG. Concomitantemente foi realizada a mensuração de TGs, perfil hormonal e de anticorpos anti-TG. A pesquisa de corpo inteiro, realizada 7 dias após a dose terapêutica, estabeleceu o estadio clínico inicial dos pacientes. Não foi possível estabelecer um valor de corte para o RNAm-TG. O RNAm-TG não diferenciou os estadios clínicos da doença ao longo do tempo, independente do gene controle interno utilizado, e tampouco quando analisaram-se os dados na presença de Acs anti-TG e TSH30ng/mL. A TGs diferenciou os estadios clínicos ao longo do tempo. Concluiu-se que, o RNAm-TG não é um bom marcador de recidiva do CDT, mesmo quando considerou-se critérios de padronização da técnica, avaliação em longo prazo e presença de Acs anti-TG, sendo assim não poderia ser utilizado como método diagnóstico complementar no acompanhamento de pacientes com CDT. Este estudo demonstra que a técnica de RT-PCR em tempo real é muito sensível perdendo especificidade, inviabilizando sua utilização no acompanhamento dos pacientes com CDT

The differentiated thyroid carcinoma (DTC) encloses 95% of all thyroid malignant disease. In USA, it increased 2,4 times in recent years (1973- 2002). The treatment includes total thyroidectomy, ablation with radioiodine (RAI) followed by TSH suppression with L-Thyroxine. The cancer recurrence occurs in 20% of the cases. Periodic evaluation through imaging examinations and serum thyroglobulin (TG) measurements by imunoassays method is recommended for careful follow-up of these patients. The anti-TG antibodies prevalence is 15-25% and would impair,…

Advisors/Committee Members: Medeiros Neto, Geraldo Antonio de, Rubio, Ileana Gabriela Sanchez de.

Subjects/Keywords: Iodine radioisotopes/therapeutic use; Neoplasias da glândula tireóide; Radioisótopos do iodo/uso terapêutico; Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa; Reverse transcriptase polymerase chain reaction; RNA mensageiro; RNA messenger; Thyroglobulin; Thyroid neoplasms; Tireoglobulina

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APA (6^th Edition):

Fernandes, R. P. (2009). Quantificação do RNAm de tireoglobulina em sangue periférico de pacientes com câncer diferenciado de tireóide: acompanhamento a longo prazo. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-15042009-154717/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Fernandes, Roberta Possato. “Quantificação do RNAm de tireoglobulina em sangue periférico de pacientes com câncer diferenciado de tireóide: acompanhamento a longo prazo.” 2009. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-15042009-154717/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Vancouver:

Fernandes RP. Quantificação do RNAm de tireoglobulina em sangue periférico de pacientes com câncer diferenciado de tireóide: acompanhamento a longo prazo. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2009. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-15042009-154717/ ;.

Council of Science Editors:

Fernandes RP. Quantificação do RNAm de tireoglobulina em sangue periférico de pacientes com câncer diferenciado de tireóide: acompanhamento a longo prazo. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2009. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-15042009-154717/ ;

Universidade Estadual de Campinas

29. Quaresma, Alexandre Jose Christino. Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ.

Degree: 2008, Universidade Estadual de Campinas

URL: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314763

► Abstract: The members of the hnRNPs family (heterogenous nuclear ribonuclein proteins) play important roles in gene expression control and mRNAs metabolism. The proteins hnRNPD (AUF1)… (more)

▼ Abstract: The members of the hnRNPs family (heterogenous nuclear ribonuclein proteins) play important roles in gene expression control and mRNAs metabolism. The proteins hnRNPD (AUF1) and hnRNPQ (NSAP1) were the main targets of this study. AUF1 has two RNA recognition motifs (RRM) and participates in the process of destabilization of a class of mRNAs that contain AU-rich sequences in their 3' untranslated regions (3'-UTR). We found, using the ¿yeast two-hybrid system¿ (Y2HS), that the isoform p37 of AUF1 (AUF1p37) interacts with the proteins: hnRNPQ, IMP-2, NSEP1 (YB-1) and UBC9. Moreover, the protein hnRNPQ was also identified as a prey protein in another Y2HS screen, which used as bait the human protein Arginine methyltransferase (PRMT1). HnRNPQ presents, in its C-terminal region, an "Arginine/Glicine-rich sequence" (RGG box). We are able to show that this RGG box is a target for methylation by PRMT1 in vitro and is methylated in vivo. Functionally, this methylation is important for its nuclear localization. hnRNPQ has a modular organization with an acid domain (AcD) in its N-terminal, followed by three RNA-binding domains (RRM) and the previously mentioned RGG box in its C-terminal. Functionally, hnRNPQ is involved in diverse aspects of RNA metabolism, including editing of the mRNA encoding the human protein ApoB. It has been shown previously to interact with the mRNA of ApoB, and also with the editing enzyme Apobec1 and the Apobec1 activation protein (ACF1). Here we show that the acid domain of hnRNPQ mediates the interaction with Apobec1 and that its in vitro phosphorylation (by PKC) inhibits this interaction. Furthermore, we found that hnRNPQ interacts with members the heat shock family of proteins (including HSP70 and BiP), and demonstrated that hnRNPQ can be in vitro phosphorylated by PKCd. Finally, we discovered that the sub-cellular localization of hnRNPQ undergoes modification after activation of PKC pathways. This also occurs after application of endoplasmic reticulum stress (using tarpsigargin), oxidative or heat stress. Under all of these conditions hnRNPQ translocated from the nucleus to the cytoplasm, where it is found at defined vesicles or granules. In summary, our data suggest that the diverse functions of hnRNPQ in the context of mRNA metabolism, may suffer specific regulations, by post-translational modifications, including phosphorylation and methylation, which modify both the proteins sub-cellular localizations as well as its affinity to interacting protein partners Advisors/Committee Members: UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS (CRUESP), Kobarg, Jörg, 1965- (advisor), Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia (institution), Programa de Pós-Graduação em Biologia Funcional e Molecular (nameofprogram), Slovic, Avram Michael (committee member), Valentini, Sandro Roberto (committee member), Goldaman, Gustavo Henrique (committee member), Cerutti, Janete Maria (committee member).

Subjects/Keywords: Proteínas - Análise; Ribonucleoproteinas nucleares heterogeneas; RNA mensageiro; Proteins - Analysis; Heterogeneous-nuclear ribonucleoproteins; RNA, Messenger

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APA (6^th Edition):

Quaresma, A. J. C. (2008). Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ. (Thesis). Universidade Estadual de Campinas. Retrieved from http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314763

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Quaresma, Alexandre Jose Christino. “Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ.” 2008. Thesis, Universidade Estadual de Campinas. Accessed January 23, 2021. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314763.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Quaresma, Alexandre Jose Christino. “Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ.” 2008. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Quaresma AJC. Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ. [Internet] [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2008. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314763.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Council of Science Editors:

Quaresma AJC. Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1: Funcional and structural studies of human protein hnRNPQ. [Thesis]. Universidade Estadual de Campinas; 2008. Available from: http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314763

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30. Isana Mara AragÃo Frota. Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos.

Degree: Master, 2010, Universidade Federal do Ceará

URL: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=4680 ;

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Este trabalho tem como objetivo avaliar a estabilidade de genes de referÃncia e a expressÃo de fatores de crescimento e de receptores de hormÃnios em… (more)

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Este trabalho tem como objetivo avaliar a estabilidade de genes de referÃncia e a expressÃo de fatores de crescimento e de receptores de hormÃnios em folÃculos secundÃrios de caprinos. AlÃm disso, visa quantificar a expressÃo dos RNA mensageiros para BMP-6 e BMP-7 em folÃculos prÃ-antrais e antrais caprinos e avaliar os efeitos de FSH, BMP-6 e BMP-7 sobre o crescimento e expressÃo gÃnica em folÃculos secundÃrios caprinos durante 6 dias de cultivo. Para avaliar a estabilidade dos genes de referÃncia, folÃculos secundÃrios (150-200 Âm) foram isolados mecanicamente de ovÃrios caprinos. ApÃs a extraÃÃo do RNA total e sÃntese de DNA complementar, realizou a quantificaÃÃo dos mRNA, por PCR em tempo real, utilizando-se primers especÃficos para genes de referÃncia (GAPDH, β-tubulina, β-actina, PGK, UBQ, RPL-19, rRNA18S), fatores de crescimento (GDF-9, BMP-15, BMP-6, FGF-2, VEGF, KL e IGF-1) e receptores de hormÃnio (FSH-R, LH-R e GH-R). Para avaliar a expressÃo de BMP-6 e BMP-7, folÃculos primordiais, primÃrios e secundÃrios, bem como pequenos e grandes folÃculos antrais foram obtidos e os nÃveis de mRNA de BMP-6 e 7 foram quantificados. Nos estudos in vitro, os efeitos da BMP-6 (50 ng/mL) e BMP-7 (50 ng/mL) na presenÃa ou ausÃncia de FSH (50 ng/mL) sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos secundÃrios e sobre a expressÃo de mRNA para BMP-6 e 7 e FSH-R foi avaliada apÃs 6 dias de cultivo. Os resultados mostraram que UBQ e β-actina sÃo os genes de referÃncia mais estÃveis em folÃculos prÃ-antrais caprinos fresco cultivados por 12 dias. Os RNAs mensageiros para os fatores de crescimento (EGF, GDF-9, BMP-15, VEGF, FGF-2, BMP-6, IGF-1 e KL) e os receptores de FSH, LH e GH sÃo expressos em diferentes nÃveis em folÃculos prÃ-antrais de caprinos, sendo que o IGF-1 e o EGF apresentaram, respectivamente, o maior e o menor nÃvel de mRNA. O nÃvel de mRNA para BMP-6 em folÃculos primÃrios e secundÃrios foi significativamente maior do que aqueles em primordial, enquanto que os nÃveis de mRNA para BMP-7 foi maior nas cÃlulas da granulosa/teca de grandes do que nos pequenos folÃculos antrais. ApÃs o cultivo de folÃculos secundÃrios durante 6 dias, FSH aumentou o diÃmetro folicular e FSH e BMP-7 aumentou significativamente os nÃveis de mRNA para BMP-7 e FSH-R. JÃ a BMP-6 na presenÃa ou ausÃncia de FSH aumentou o diÃmetro dos folÃculos secundÃrios. AlÃm disso, FSH aumentou os nÃveis de mRNA para BMP-6, enquanto ambos BMP-6 e FSH e aumentaram os nÃveis de mRNA para FSH-R, apÃs o perÃodo de cultivo. Em conclusÃo, UBQ e β-actina sÃo os dois genes mais estÃveis para folÃculos secundÃrios caprinos e o FSH e as BMPs dos tipos 6 e 7 estimulam o crescimento de folÃculos prÃ-antrais in vitro durante 6 dias de cultivo.

This study aims to evaluate the stability of reference genes and the expression of growth factors and hormone receptors in goat secondary follicles. It also seeks to quantify the expression of messenger RNA for BMP-6 and BMP-7 in goat preantral follicles and to evaluate the effects of FSH, BMP-6 and BMP-7 on…

Advisors/Committee Members: FabrÃcio de Sousa Martins, Alice Andrioli Pinheiro, JosÃ Roberto Viana Silva.

Subjects/Keywords: CiÃncias BiolÃgicas; BMP-6; BMP-7; Receptores; Genes de ReferÃncia; FolÃculos PrÃ-antrais; BMP-6; BMP-7; Hormone Receptors; Genes of Reference; Preantral Follicle; Engenharia GenÃtica; Caprinos - ReproduÃÃo; Caprinos - GenÃtica; FolÃculo Ovariano - fisiologia; OvÃrio - fisiologia; RNA Mensageiro; ReproduÃÃo; Fertilidade; Biotecnologia

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APA (6^th Edition):

Frota, I. M. A. (2010). Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos. (Masters Thesis). Universidade Federal do Ceará. Retrieved from http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=4680 ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Frota, Isana Mara AragÃo. “Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos.” 2010. Masters Thesis, Universidade Federal do Ceará. Accessed January 23, 2021. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=4680 ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Frota, Isana Mara AragÃo. “Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos.” 2010. Web. 23 Jan 2021.

Vancouver:

Frota IMA. Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Ceará 2010. [cited 2021 Jan 23]. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=4680 ;.

Council of Science Editors:

Frota IMA. Estabilidade de genes de referÃncia e influÃncia das BMPs-6 e 7 sobre o desenvolvimento in vitro de folÃculos prÃ-antrais caprinos. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Ceará 2010. Available from: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=4680 ;

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