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O ditelureto de difenila (DTDF) é um composto organotelurado simples e estável e é um potencial candidato de protótipos para o desenvolvimento de novas moléculas biologicamente ativas. Então, é importante avaliar os efeitos tóxicos desse composto. No presente estudo, foram avaliadas as propriedades citotóxicas, genotóxicas e mutagênicas do DTDF em vários modelos biológicos: em células de fibroblastos de pulmão de hamster chinês, em linhagens da levedura S. cerevisiae proficientes e deficientes em algumas vias de reparação de DNA e na bactéria Salmonela typhimurium. O DTDF pode induzir alteração no quadro de leitura em S. typhimurium e em linhagen selvagem haplóide de S. cereviviae. Assim, o DTDF apresenta um comportamento similar a um agente intercalante. Os mutantes de S. cerevisiae defectivos na reparação por excisão de bases e na reparação recombinacional mostraram elevada sensibilidade ao DTDF. Em células V79 tratadas com concentrações crescentes de DTDF, a atividade citotóxica, foi determinada usando ensaio de lactato desidrogenase no meio extracelular, ocorre na concentração de 1 µM após 2 h de exposição. Consistentemente, o tratamento das células por 2 h com concentrações de DTDF citotóxicas aumentaram os níveis de TBARS e diminuíram os níveis de GSH/GSSH em levedura e em células V79, indicando que DTDF pode levar ao aumento da peroxidação lipídica e da oxidação da glutationa intracelular, caracterizando um estado de estresse oxidatívo. Nas concentrações mais elevadas, o DTDF induziu a formação de quebras simples e duplas de DNA em células V79, como evidenciado pelo ensaio cometa, nas versões alcalina e neutra, na presença e ausência de ativação metabólica. O DTDF induziu a danos oxidativos ao DNA, determinados pelo ensaio cometa modificado empregando as endonucleases formamidopirimidina DNA-glicosilase (Fpg) e endonuclease III (endoIII) com e sem ativação metabólica. O tratamento também induziu aumento no número de células binucleadas no teste micronúcleo em células V79, demonstrando potencial mutagênico dessa molécula em altas concentrações. Finalmente, o pré-tratamento com N-acetilcisteina, que restaura o GSH ao nível normal, reduziu os efeitos oxidativos, genotóxicos e mutagênicos do DTDF em levedura e em células V79. Em resumo, os efeitos celulares do DTDF parecem ser muito complexos e ligados a sua habilidade induzir distúrbios na homeostase redox celular e na capacidade de intercalar no DNA, que conduzem a dano e a quebras do DNA, danos e morte celular.

Diphenyl ditelluride (DPDT) is a simple and stable organotellurium compound and it is a potential candidate to prototype for a development of novel biological active molecules. Thus, it is important to evaluate the toxic effects of this compound. In the present study, we evaluated the putative cytotoxic, genotoxic, and mutagenic properties of DPDT in various biological models: in V79 Chinese lung fibroblast cells, in strains of the yeast S.cerevisiae proficient and deficient in several DNA repair pathways and in Salmonella typhimurium. DPDT is able…

Advisors/Committee Members: Henriques, Joao Antonio Pegas.

▼ A mineração é uma atividade antrópica de importância econômica que gera grandes impactos aos diferentes ecossistemas. Dentre estes, o ecossistema aquático é um dos mais afetados. Este estudo detectou e comparou a diversidade e a distribuição de procariotos de dois córregos por meio de uma abordagem independente de cultivo, compreendendo construção de bibliotecas de clones do gene 16S rRNA e seu sequenciamento. Os sítios de amostragem foram os sedimentos do Córrego da Mina (MS), historicamente contaminado por metais, com ênfase no arsênio, e do Córrego Mutuca (MTS), que é relativamente pristino, ambos pertencentes à bacia do Rio das Velhas. As curvas de rarefação e os índices de diversidade das bibliotecas de clones indicaram uma alta diversidade filogenética de bactérias, enquanto as arqueias foram menos diversas. Embora as comunidades bacterianas de ambos sedimentos tenham sido diversas, foram estatisticamente distintas, de acordo com a análise pelo LIBSHUFF. Identificaram-se 224 OTUs (operational taxonomic unity), pertencentes ao domínio Bacteria, sendo que os clones da biblioteca MS e MTS afiliaram-se a 14 e 17 filos, respectivamente. A maioria dos filos afiliaram-se a Proteobacteria (, , , ) e Bacteroidetes. Os taxa Gemmatimonadetes, Actinobacteria e Alphaproteobacteria foram encontrados somente na biblioteca MS, enquanto Fusobacteria, Spirochaetes, Armatimonadetes e os candidatos às divisões OP11 e KSB1, ocorreram apenas na biblioteca MTS. Sequências de 16S rDNA de arqueias afiliaram-se apenas a dois filos em ambas bibliotecas: Crenarchaeota e Euryarchaeota. No entanto, 75% destas sequências se afiliaram ao Crenarchaeota, na biblioteca MS, enquanto Euryarchaeota foi predominante na biblioteca MTS. A análise por PCR quantitativa revelou que as bactérias do sedimento de MS foram 100 vezes mais abundantes do que em MTS. Em contrapartida, a abundância de arqueias foi equivalente em ambos os sedimentos. Os dados obtidos neste estudo mostraram que, apesar dos sedimentos dos córregos apresentarem características distintas, as comunidades bacterianas compartilharam alta diversidade, revelando que ambientes historicamente impactados por metais podem ser tão diversos quanto ambientes relativamente pristinos. Advisors/Committee Members: Andrea Maria Amaral Nascimento, Edmar Chartone de Souza, Andrea Maria Amaral Nascimento, Edmar Chartone de Souza, Vera Lucia dos Santos, Alvaro Cantini Nunes.

▼ The human activities responsible for the ambient degradation in the modern world are diverse. The industrial activities are preponderant in the question of the impact consequences for brazilian ecosystems. Amongst the human activities, the petroliferous industry in operation in Potiguar Petroliferous Basin (PPB) displays the constant risk of ambient impacts in the integrant cities, not only for the human populations and the environment, but also it reaches the native microorganisms of Caatinga ground and in the mangrove sediment. Not hindering, the elaboration of strategies of bioremediation for impacted areas pass through the knowledge of microbiota and its relations with the environment. Moreover, in the microorganism groups associated to oil, are emphasized the sulfate-reducing prokaryotes (SRP) that, in its anaerobic metabolism, these organisms participate of the sulfate reduction, discharging H2S, causing ambient risks and causing the corrosion of surfaces, as pipelines and tanks, resulting in damages for the industry. Some ancestries of PRS integrate the Archaea domain, group of microorganisms whose sequenced genomes present predominance of extremophilic adaptations, including surrounding with oil presence. This work has two correlated objectives: i) the detection and monitoring of the gene dsrB, gift in sulfate-reducing prokaryotes, through DGGE analysis in samples of mDNA of a mangrove sediment and semiarid soil, both in the BPP; ii) to relate genomic characteristics to the ecological aspects of Archaea through in silico studies, standing out the importance to the oil and gas industry. The results of the first work suggest that the petrodegraders communities of SRP persist after the contamination with oil in mangrove sediment and in semiarid soil. Comparing the populations of both sites, it reveals that there are variations in the size and composition during one year of experiments. In the second work, functional and structural factors are the probable cause to the pressure in maintenance of the conservation of the sequences in the multiple copies of the 16S rDNA gene. Is verified also the discrepancy established between total content GC and content GC of the same gene. Such results relating ribosomal genes and the ambient factors are important for metagenomic evaluations using PCR-DGGE. The knowledge of microbiota associated to the oil can contribute for a better destination of resources by the petroliferous industry and the development of bioremediation strategies. Likewise, search to lead to the best agreement of the performance of native microbiota in biogeochemical cycles in Potiguar Petroliferous Basin ecosystem Advisors/Committee Members: Corso, Gilberto (advisor), CPF:36990485000 (advisor), http://lattes.cnpq.br/0274040885278760 (advisor), Blaha, Carlos Alfredo Galindo (advisor), CPF:80573380082 (advisor), http://lattes.cnpq.br/2307806644081146 (advisor).

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Symbiosis between insects and prokaryotes are recognized as essential to the survival of these invertebrates. The bacterial community in the gastrointestinal tract of termites, social insects, is diverse and the function of this microbiota has been characterized. This study investigated the molecular diversity of prokaryotes in soil of the mound and its agent Cornitermes cumulans using a cultivation-independent approach. Thus, samples of the termite nest soil (SC), reference soil (SR) and termite (CP) - Cornitermes cumulans - were collected. The amplicon of the 16S rRNA gene of bacteria was used for the ARDRA fingerprint analysis of the SC, SR and CP samples and the construction of libraries from SC and CP. Moreover, the construction of 16S rDNA library from archaea was obtained using SC sample. Analysis of restriction profiles of 16S rRNA gene revealed that bacterial communities in SC, SR and CP were different, although SR and CP communities were more similar. Phylogenetic analysis using 16S rRNA gene sequences revealed a high diversity of bacterial communities in SC, detecting 67 OTUs which were affiliated to ten phyla: Actinobacteria, Proteobacteria, Acidobacteria, Firmicutes, Planctomycetes, Bacteroidetes, Verrucomicrobia, Chloroflexi, Gemmatimonadetes and Bacteria_incertae_sedis. On the other hand, the community of archaea of the sample SC showed that only two OTUs affiliated to the phylum Chrenoarcheota. The bacterial community of Cornitermes cumulans presented eight OTUs which were affiliated with four phyla Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Synergistetes. Identified bacterial phyla, Proteobacteria, Firmicutes and Actinobacteria were common to both communities in SC and CP. The Shannon-Weaver and Simpson indices and the ACE and Chao1 values showed that SC and CP had high bacterial diversity while SC had a low diversity of archaea. Thus, the results reveal bacterial diversity, yet unexplored, in the soil of termite mound and Cornitermes cumulans.

A simbiose entre insetos e procariotos é reconhecida como sendo essencial para a sobrevivência desses invertebrados. A microbiota existente no trato gastrointestinal de cupins, insetos sociais, é diversa e a sua função vem sendo caracterizada. Este estudo pesquisou a diversidade molecular de procariotos em solo do cupinzeiro e de seu agente Cornitermes cumulans, utilizando uma abordagem independente de cultivo. Assim amostras de solo do cupinzeiro (SC), do solo de referência (SR) e do cupim (CP) - Cornitermes cumulans - foram coletadas. O amplicon do gene de rRNA 16S de bactérias foi usado para a análise do fingerprint ARDRA das amostras SC, SR e CP e para a construção de bibliotecas de clones de SC e CP. Além disso, a construção da biblioteca de clones do gene de rRNA 16S de arqueias foi obtida para a amostra SC. A análise do perfil de restrição do gene de rRNA 16S revelou que as comunidades bacterianas de SC, SR e de CP foram distintas, sendo as comunidades SR e CP mais similares. A análise filogenética utilizando o gene de rRNA 16S revelou uma alta…

Advisors/Committee Members: Andrea Maria Amaral Nascimento, Edmar Chartone de Souza, Andrea Maria Amaral Nascimento, Edmar Chartone de Souza, Vera Lucia dos Santos, Alvaro Cantini Nunes.

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The human activities responsible for the ambient degradation in the modern world are diverse. The industrial activities are preponderant in the question of the impact consequences for brazilian ecosystems. Amongst the human activities, the petroliferous industry in operation in Potiguar Petroliferous Basin (PPB) displays the constant risk of ambient impacts in the integrant cities, not only for the human populations and the environment, but also it reaches the native microorganisms of Caatinga ground and in the mangrove sediment. Not hindering, the elaboration of strategies of bioremediation for impacted areas pass through the knowledge of microbiota and its relations with the environment. Moreover, in the microorganism groups associated to oil, are emphasized the sulfate-reducing prokaryotes (SRP) that, in its anaerobic metabolism, these organisms participate of the sulfate reduction, discharging H2S, causing ambient risks and causing the corrosion of surfaces, as pipelines and tanks, resulting in damages for the industry. Some ancestries of PRS integrate the Archaea domain, group of microorganisms whose sequenced genomes present predominance of extremophilic adaptations, including surrounding with oil presence. This work has two correlated objectives: i) the detection and monitoring of the gene dsrB, gift in sulfate-reducing prokaryotes, through DGGE analysis in samples of mDNA of a mangrove sediment and semiarid soil, both in the BPP; ii) to relate genomic characteristics to the ecological aspects of Archaea through in silico studies, standing out the importance to the oil and gas industry. The results of the first work suggest that the petrodegraders communities of SRP persist after the contamination with oil in mangrove sediment and in semiarid soil. Comparing the populations of both sites, it reveals that there are variations in the size and composition during one year of experiments. In the second work, functional and structural factors are the probable cause to the pressure in maintenance of the conservation of the sequences in the multiple copies of the 16S rDNA gene. Is verified also the discrepancy established between total content GC and content GC of the same gene. Such results relating ribosomal genes and the ambient factors are important for metagenomic evaluations using PCR-DGGE. The knowledge of microbiota associated to the oil can contribute for a better destination of resources by the petroliferous industry and the development of bioremediation strategies. Likewise, search to lead to the best agreement of the performance of native microbiota in biogeochemical cycles in Potiguar Petroliferous Basin ecosystem

São diversas as atividades humanas responsáveis pela degradação ambiental observada no mundo moderno. As atividades industriais são preponderantes na questão das conseqüências impactantes para os ecossistemas brasileiros. Entre as atividades antrópicas, a indústria petrolífera atuante na Bacia Petrolífera Potiguar (BPP), expõe a risco constante de impactos ambientais nos municípios…

Advisors/Committee Members: Hugo Alexandre de Oliveira Rocha, Carlos Alfredo Galindo Blaha, Gilberto Corso, Paulo Fernando de Almeida.

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Gene expression on prokaryotes initiates when the RNA-polymerase enzyme interacts with DNA regions called promoters. In these regions are located the main regulatory elements of the transcription process. Despite the improvement of in vitro techniques for molecular biology analysis, characterizing and identifying a great number of promoters on a genome is a complex task. In silico approaches are usually employed to recognize theses regions on prokaryotes. Nevertheless, the main drawback is the absence of a large set of promoters to identify conserved patterns among the species. Hence, a in silico method to predict them on any species is a challenge. This work proposes a protocol to use hidden Markov models (HMMs) methodology with Decision Threshold Estimation and Discrimination Analysis on this problem. Four prokaryotic species are investigated (Escherichia coli, Bacillus subtilis, Helicobacter pylori e Helicobacter hepaticus). The influence of different aspects in the recognition and prediction are examined: the size of promoter datasets, structural and functional available information, and A+T content of each genome. The results show that the proposed protocol increases the recognition ability of the HMM, obtaining a reduction in 44.96% of error rate compared with previous works on Escherichia coli promoters. For Bacillus subtilis, the accuracy is 95% on recognition and 78% on prediction. However, the protocol presents a high error rate on promoter prediction of Helicobacter species, since it generates a large number of false positives.

A expressão dos genes em procariotos é desencadeada quando a enzima RNApolimerase interage com uma região adjacente ao gene, chamada de promotor, onde se encontram os principais elementos regulatórios do processo de transcrição. Apesar do crescente avanço das técnicas experimentais em biologia molecular, caracterizar e identificar um número significante de promotores, presentes em um dado genoma, continua sendo uma tarefa demorada e cara. Abordagens in silico são bastante utilizadas para reconhecer essas regiões em procariotos. Entretanto, além do alto número de falsos positivos obtidos, elas enfrentam a inexistência de um número adequado de promotores conhecidos para identificar padrões conservados entre as espécies. Logo, um método criterioso e confiável para predizêlos em qualquer organismo procariótico ainda é um desafio. Esta dissertação propõe um protocolo de uso de hidden Markov models (HMMs) que emprega Estimação de Limiar de Decisão (ELD) e Análise de Discriminação (AD) neste problema. Quatro espécies procarióticas são analisadas (Escherichia coli, Bacillus subtilis, Helicobacter pylori e Helicobacter hepaticus), verificando-se a influência do tamanho das bases de dados de promotores, do conjunto de informações estruturais e funcionais, e do conteúdo A+T de cada genoma no desempenho do reconhecimento e da predição de promotores. Os resultados mostram que o protocolo proposto aumenta a capacidade do modelo HMM reconhecer essas regiões, alcançando uma redução de 44,96% na…

Advisors/Committee Members: Ney Lemke.

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A comunidade de microrganismos do sistema aquático dos rios Solimões e Negro, bem como a diversidade destes ecossistemas não foram exaustivamente estudadas até o momento. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a microbiota bacteriana do rio Negro em relação a sazonalidade, tanto em seu aspecto quantitativo (contagem de Unidades Formadoras de Colônias - UFCs) e no qualitativo (identificação taxonômica via sequenciamento do DNA codificador do RNA de pequena subunidade ribossomal SSU-rRNA). Amostras de água do rio Negro foram coletadas em cinco diferentes pontos, em 4 profundidades e em 5 datas de diferentes épocas do ano, sendo que de todas amostras as UFCs foram contadas. O DNA total foi extraído da biomassa contida na água do rio Negro em períodos de cheia (RN2) e vazante (RN3) e analisado espectrofotometricamente e por eletroforese em gel de agarose 0,8%. Foram amplificadas as regiões variáveis V3 e V4 do SSU-rRNA por PCR (Reação em Cadeia da DNA Polimerase) e os amplicons foram sequenciados por pirosequenciamento utilizando o equipamento 454 (Roche®). Os arquivos brutos das bibliotecas RN2 e RN3 do Rio Negro foram submetidas à suíte do programa Mothur para o controle de qualidade, alinhamento das sequências, cálculo das distâncias genéticas e definição das Unidades Taxonômicas Operacionais – OTUs, além de, estimativa da riqueza e diversidade das espécies. Pela contagem de UFCs foi possível comparar o número de bactérias cultiváveis nos diferentes pontos de coleta e em função da sazonalidade. Pela análise molecular verificou-se que o filo Proteobacteria mostrou-se dominante nestas duas coletas do rio (cheia e vazante), os gêneros dominantes deste filo na cheia foram Limnohabitans, Methylomonas, e outro filo expressivo foi Acidobacteria do gênero Gp3. No período de vazante os gêneros abundantes foram Polynucleobacter, Acinetobacter e Curvibacter, dentro do filo Proteobacteria. As curvas de rarefação demonstraram que a biblioteca RN3 é mais diversa em número de espécies do que a biblioteca RN2 e confirmado pelo índice de Shannon e InvSimpson. Pode-se observar a partir dos índices de ACE e Cha 1 que a biblioteca RN3 é mais rica em espécies comparada com a RN2.

The microorganisms of the community aquatic system of the Solimões and Negro rivers, as well as the diversity of these ecosystems have not been thoroughly investigated so far. The aim of this study was to characterize the bacterial microbiota of the Negro River in relation to seasonality, both in its quantitative aspect (forming units count colonies - CFUs) and qualitative (taxonomic identification via DNA sequencing RNA encoding small ribosomal subunit SSU -rRNA). Negro River water samples were collected at five different points on 4 and 5 depths dates from different times of the year, and all samples CFUs were counted. Total DNA was extracted from the biomass contained in the water of the Negro in full periods (N2) and receding (RN3) and analyzed spectrophotometrically and by agarose gel electrophoresis 0.8%. They…

Advisors/Committee Members: Astolfi Filho, Spartaco, http://lattes.cnpq.br/2699190136695057.

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A comunidade de microrganismos do sistema aquático dos rios Solimões e Negro, bem como a diversidade destes ecossistemas não foram exaustivamente estudadas até o momento. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a microbiota bacteriana do rio Negro em relação a sazonalidade, tanto em seu aspecto quantitativo (contagem de Unidades Formadoras de Colônias - UFCs) e no qualitativo (identificação taxonômica via sequenciamento do DNA codificador do RNA de pequena subunidade ribossomal SSU-rRNA). Amostras de água do rio Negro foram coletadas em cinco diferentes pontos, em 4 profundidades e em 5 datas de diferentes épocas do ano, sendo que de todas amostras as UFCs foram contadas. O DNA total foi extraído da biomassa contida na água do rio Negro em períodos de cheia (RN2) e vazante (RN3) e analisado espectrofotometricamente e por eletroforese em gel de agarose 0,8%. Foram amplificadas as regiões variáveis V3 e V4 do SSU-rRNA por PCR (Reação em Cadeia da DNA Polimerase) e os amplicons foram sequenciados por pirosequenciamento utilizando o equipamento 454 (Roche®). Os arquivos brutos das bibliotecas RN2 e RN3 do Rio Negro foram submetidas à suíte do programa Mothur para o controle de qualidade, alinhamento das sequências, cálculo das distâncias genéticas e definição das Unidades Taxonômicas Operacionais – OTUs, além de, estimativa da riqueza e diversidade das espécies. Pela contagem de UFCs foi possível comparar o número de bactérias cultiváveis nos diferentes pontos de coleta e em função da sazonalidade. Pela análise molecular verificou-se que o filo Proteobacteria mostrou-se dominante nestas duas coletas do rio (cheia e vazante), os gêneros dominantes deste filo na cheia foram Limnohabitans, Methylomonas, e outro filo expressivo foi Acidobacteria do gênero Gp3. No período de vazante os gêneros abundantes foram Polynucleobacter, Acinetobacter e Curvibacter, dentro do filo Proteobacteria. As curvas de rarefação demonstraram que a biblioteca RN3 é mais diversa em número de espécies do que a biblioteca RN2 e confirmado pelo índice de Shannon e InvSimpson. Pode-se observar a partir dos índices de ACE e Cha 1 que a biblioteca RN3 é mais rica em espécies comparada com a RN2.

The microorganisms of the community aquatic system of the Solimões and Negro rivers, as well as the diversity of these ecosystems have not been thoroughly investigated so far. The aim of this study was to characterize the bacterial microbiota of the Negro River in relation to seasonality, both in its quantitative aspect (forming units count colonies - CFUs) and qualitative (taxonomic identification via DNA sequencing RNA encoding small ribosomal subunit SSU -rRNA). Negro River water samples were collected at five different points on 4 and 5 depths dates from different times of the year, and all samples CFUs were counted. Total DNA was extracted from the biomass contained in the water of the Negro in full periods (N2) and receding (RN3) and analyzed spectrophotometrically and by agarose gel electrophoresis 0.8%. They…

Advisors/Committee Members: Astolfi Filho, Spartaco, 10245197168, http://lattes.cnpq.br/2699190136695057.

▼ The human activities responsible for the ambient degradation in the modern world are diverse. The industrial activities are preponderant in the question of the impact consequences for brazilian ecosystems. Amongst the human activities, the petroliferous industry in operation in Potiguar Petroliferous Basin (PPB) displays the constant risk of ambient impacts in the integrant cities, not only for the human populations and the environment, but also it reaches the native microorganisms of Caatinga ground and in the mangrove sediment. Not hindering, the elaboration of strategies of bioremediation for impacted areas pass through the knowledge of microbiota and its relations with the environment. Moreover, in the microorganism groups associated to oil, are emphasized the sulfate-reducing prokaryotes (SRP) that, in its anaerobic metabolism, these organisms participate of the sulfate reduction, discharging H2S, causing ambient risks and causing the corrosion of surfaces, as pipelines and tanks, resulting in damages for the industry. Some ancestries of PRS integrate the Archaea domain, group of microorganisms whose sequenced genomes present predominance of extremophilic adaptations, including surrounding with oil presence. This work has two correlated objectives: i) the detection and monitoring of the gene dsrB, gift in sulfate-reducing prokaryotes, through DGGE analysis in samples of mDNA of a mangrove sediment and semiarid soil, both in the BPP; ii) to relate genomic characteristics to the ecological aspects of Archaea through in silico studies, standing out the importance to the oil and gas industry. The results of the first work suggest that the petrodegraders communities of SRP persist after the contamination with oil in mangrove sediment and in semiarid soil. Comparing the populations of both sites, it reveals that there are variations in the size and composition during one year of experiments. In the second work, functional and structural factors are the probable cause to the pressure in maintenance of the conservation of the sequences in the multiple copies of the 16S rDNA gene. Is verified also the discrepancy established between total content GC and content GC of the same gene. Such results relating ribosomal genes and the ambient factors are important for metagenomic evaluations using PCR-DGGE. The knowledge of microbiota associated to the oil can contribute for a better destination of resources by the petroliferous industry and the development of bioremediation strategies. Likewise, search to lead to the best agreement of the performance of native microbiota in biogeochemical cycles in Potiguar Petroliferous Basin ecosystem Advisors/Committee Members: Corso, Gilberto (advisor), CPF:36990485000 (advisor), http://lattes.cnpq.br/0274040885278760 (advisor), Blaha, Carlos Alfredo Galindo (advisor), CPF:80573380082 (advisor), http://lattes.cnpq.br/2307806644081146 (advisor).

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O presente trabalho teve como objetivo isolar procariotos residentes de filoplano de tomateiro como agentes de biocontrole contra o patógeno Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. 300 isolados foram obtidos a partir de folhas sadias de tomateiros coletadas na micro-região de Viçosa-MG, as quais foram submetidas à extração das populações procarióticas epifíticas em solução de tampão fosfato (PBS) com emprego de ultra-som (60Hz, 20 min.) e semeadura de diluições em série em placas de Petri contendo meio 523. Em casa-de-vegetação, numa primeira etapa 79 isolados apresentaram capacidade de reduzir, em média, 82 % da severidade de doença. Desses, numa segunda etapa, 33 isolados apresentaram redução média da severidade de doença em 50 %. Os 33 isolados foram submetidos a testes de antibiose in vitro, em que foi avaliada a potencialidade em inibir o crescimento bacteriano e fúngico dos seguintes patógenos do tomateiro: Pseudomonas syringae pv. tomato, Pseudomonas corrugata, Xanthomonas campestris pv. vesicatoria, Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Alternaria solani e Corynespora cassiicola. Dos 33 isolados pré- selecionados verificou-se que o isolado RFK-24 foi capaz de inibir o crescimento dos patógenos, Xanthomonas campestris pv. vesicatoria, Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis e Alternaria solani e o RFS-183 em inibir o crescimento dos patógenos Alternaria solani, Xanthomons campestris pv. vesicatoria, Pseudomonas syringae pv. tomato e Pseudomonas corrugata, mas ambos não inibiram o crescimento da Corynespora cassiicola. Os dois isolados foram selecionados para ensaios in vivo e em folíolos destacados, contra os patógenos desafiantes Alternaria solani e Xanthomons campestris pv. vesicatoria. Para ambos foi observada a correlação entre a severidade de doença apresentada em casa-de-vegetação e os resultados em folíolos destacados, como a inibição da germinação de conídios do patógeno fúngico e a supressividade em meio semi-seletivo dos antagonistas sob o patógeno bacteriano. Os resultados obtidos com o método com folíolos destacados e sua correlação com os dados de biocontrole experimental em casa-de-vegetação permitem deduzir que o uso de folíolos destacados pode ser utilizado como método para seleção massal.

This work aimed to select tomato prokaryotic phylloplane residents for biocontrol purposes, by using Xanthomonas campestris pv. vesicatoria and Alternaria solani as challenging pathogens. Additionally, to perform a screening test using detached leaves. Consequently, leaves from healthy tomato plants were collected at Viçosa, MG and epiphytic prokaryote populations were extracted by shacking them in PBS (0,85% NaCl in 0,1M phosphate buffer saline, pH 7.0) following sonication (60Hz, 20 minutes) and serial dilution and plating in culture medium. Three hundred bacterial isolates were obtained and preserved in refrigerator, with periodical tubetube transfer, in a refrigerator. The screening was performed in two selection cycles. In the first selection in greenhouse, with three replicates per…

Advisors/Committee Members: José Rogério de Oliveira, Olinto Liparini Pereira, Maria Catarina Megumi Kasuya, Leandro Grassi de Freitas, Reginaldo da Silva Romeiro.