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You searched for subject:(Precleaning). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

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University of Texas – Austin

1. Burden, Cassidy Aaron. Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs.

Degree: MSin Engineering, Electrical and Computer Engineering, 2018, University of Texas – Austin

This report evaluates two distinct methods of improving the performance of GPU memory systems. Over the past semester, our research has focused on applying a state-of-the-art CPU cache replacement policy on GPUs and exploring headroom of preemptively writing back dirty cache lines. Our first goal is to reduce L1 and L2 cache miss rates on GPU by implementing the Hawkeye cache replacement policy. Hawkeye calculates the optimal cache replacement policy on previous cache accesses in order to train its predictor for future caching decisions. While some benchmarks show performance improvements with Hawkeye, a significant amount of our benchmarks are not sensitive to the performance of the cache. From our experiments, we show that Hawkeye, on average, gives an IPC improvement of 3.57% and 0.56% over Least Recently Used (LRU) when applied to the L1 and L2 caches respectively. We also introduce the idea of precleaning, an alternative to write-back or write-through caching that aims to spread out write bandwidth. Committing L2 writes to main memory when memory congestion is low can hide or lower the performance impact of said write. The idea of precleaning shows promise, but evaluating precleaning fully requires more research in GPU access patterns and prediction techniques. Advisors/Committee Members: Lin, Yun Calvin (advisor).

Subjects/Keywords: GPU; Hawkeye; Precleaning; Caching; Headroom; Cache replacement policy; GPU memory systems; Cache miss rates

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APA (6th Edition):

Burden, C. A. (2018). Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs. (Masters Thesis). University of Texas – Austin. Retrieved from http://hdl.handle.net/2152/65984

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Burden, Cassidy Aaron. “Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs.” 2018. Masters Thesis, University of Texas – Austin. Accessed March 08, 2021. http://hdl.handle.net/2152/65984.

MLA Handbook (7th Edition):

Burden, Cassidy Aaron. “Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs.” 2018. Web. 08 Mar 2021.

Vancouver:

Burden CA. Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs. [Internet] [Masters thesis]. University of Texas – Austin; 2018. [cited 2021 Mar 08]. Available from: http://hdl.handle.net/2152/65984.

Council of Science Editors:

Burden CA. Evaluating headroom for smart caching policies on GPUs. [Masters Thesis]. University of Texas – Austin; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/2152/65984

2. Holste, Angela Sarah. Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry.

Degree: Docteur es, Chimie analytique, 2014, Pau; Christian Albrechts-Universität (Kiel, Allemagne)

Cette thèse est le résultat d’une cotutelle entre l'Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA) à Pau, en France et l'Université Christian Albrecht (CAU) à Kiel, en Allemagne. Dans le cadre de cette collaboration internationale, des méthodes bio-analytiques sont développées pour analyser quantitativement et qualitativement des peptides et protéines marquées par le couplage de la chromatographie avec la spectrométrie de masse. Les peptides et les digestats des protéines sont marquées selon un protocole optimisé par des lanthanides en utilisant des composés à base de DOTA. La séparation des peptides est réalisée par IP-RP-nanoHPLC. Des données complémentaires sont acquises par MALDI-MS pour l'identification et par ICP-MS pour la quantification. Dans ce contexte, une étape de pré-nettoyage en ligne est développée et mise en œuvre dans le protocole de séparation par nanoHPLC. Cette étape permet l'élimination efficace des réactifs appliqués en excès et ainsi la diminution du bruit de fond lié à la présence de métaux lors des analyses par ICP-MS. Les données obtenues sont alors plus facile à interpréter, la sensibilité des signaux des peptides n’étant par ailleurs pas modifié. L'extraction en phase solide (SPE) appliquée comme alternative entraîne des pertes importantes de peptides et peut être considérée comme inadaptée pour l'analyse quantitative. Des additifs pour éluants de nanoHPLC, tels que l'EDTA et le HFBA sont testés et jugés non bénéfiques pour l'analyse des échantillons peptidiques normaux. HFBA peut être reconsidéré pour une application spéciale sur des peptides très hydrophiles. Des peptides marqués sont développés. Leur utilisation en quantité connue pourrait permettre la quantification rapide et simple d'un échantillon de digestat à faible complexité. De plus, cet ensemble de peptides permet la superposition fiable des chromatogrammes, et ainsi de comparer des données complémentaires obtenues par l’analyse d’échantillon par ICP-MS et MALDI-MS. Expériences d'application avec le couplage laser femtoseconde avec ICP-MS sont effectuées sur des plaques métalliques de MALDI MS et montrent des résultats très prometteurs. Pour cela, les échantillons préalablement identifiés par MALDI-MS sont analysés par fsLA-ICP-MS. Les premières tentatives de quantification sur la plaque en acier modifiée sont satisfaisantes et donnent des résultats répondant aux attentes. L’optimisation des paramètres de MALDI-MS facilite l’identification des peptides.

This PhD thesis was a Cotutelle between the Université de Pau et des Pays de l’Adour (UPPA) in Pau, France and the Christian-Albrechts University (CAU) in Kiel, Germany. In the course of this international collaboration, bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins were developed, which were based on the hyphenation of chromatography with mass spectrometry. Peptides and protein digests were lanthanide labelled using DOTA-based compounds according to an optimised protocol. Separation on the peptide level was performed…

Advisors/Committee Members: Schaumloffel, Dirk (thesis director).

Subjects/Keywords: Spectrométrie de masse moléculaire et élémentaire; MALDI-MS; ICP-MS; FsLA-ICP-MS Marquage avec des lanthanides; NHS-DOTA; Maleimido-monoamide-DOTA; Peptides; Digestats de protéines nanoHPLC; Purification en ligne; Extraction en phase solide,; HFBA; EDTA Superposition des chromatogrammes; Identification; Quantification; Molecular and elemental mass spectrometry; MALDI-MS; ICP-MS; FsLA-ICP-MS Lanthanide labelling; NHS-DOTA; Maleimido-monoamide-DOTA; Model peptides; Protein digests nanoHPLC; Online precleaning; Solid Phase Extraction; HFBA; , EDTA Data alignment; Identification; Quantification

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APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Holste, A. S. (2014). Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry. (Doctoral Dissertation). Pau; Christian Albrechts-Universität (Kiel, Allemagne). Retrieved from http://www.theses.fr/2014PAUU3004

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Holste, Angela Sarah. “Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry.” 2014. Doctoral Dissertation, Pau; Christian Albrechts-Universität (Kiel, Allemagne). Accessed March 08, 2021. http://www.theses.fr/2014PAUU3004.

MLA Handbook (7th Edition):

Holste, Angela Sarah. “Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry.” 2014. Web. 08 Mar 2021.

Vancouver:

Holste AS. Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry. [Internet] [Doctoral dissertation]. Pau; Christian Albrechts-Universität (Kiel, Allemagne); 2014. [cited 2021 Mar 08]. Available from: http://www.theses.fr/2014PAUU3004.

Council of Science Editors:

Holste AS. Développement des méthodes bio analytique pour l’analyse quantitative et qualitative des peptides et protéines marqués par le couplage de la chromatographie et la spectrométrie de masse : Development of bio-analytical methods for the quantitative and qualitative analysis of labelled peptides and proteins via hyphenation of chromatography and mass spectrometry. [Doctoral Dissertation]. Pau; Christian Albrechts-Universität (Kiel, Allemagne); 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014PAUU3004

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