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You searched for subject:(Polifarmacologia). Showing records 1 – 3 of 3 total matches.

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Universidade de Lisboa

1. Ferreira, Vânia Alexandra Conceição. Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules.

Degree: 2015, Universidade de Lisboa

Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional (Biologia Computacional), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências 2015

A identificação de novos compostos ativos, passíveis de serem aplicados no tratamento de doenças, é a principal preocupação da indústria farmacêutica, que se foca em encontrar compostos de atuação altamente específica, evitando assim a existência de efeitos secundários. Contudo, este processo nem sempre é fácil, pois tem sido comprovado que muitas moléculas têm como alvo mais do que um recetor. Estas são moléculas promiscuas que ao se ligarem a diferentes recetores podem levar ao surgimento de efeitos inesperados. Este problema recebe o nome de polifarmacologia e muitos estudos têm sido desenvolvidos no seu âmbito. Na primeira parte deste trabalho, tentou-se estabelecer uma relação entre os perfis de ligação de moléculas a diferentes recetores e a sua relação com a semelhança entre as sequências proteicas dos mesmos. Verificou-se que não existe um padrão constante e que, na maioria dos casos, as moléculas apresentam perfis de ligação diferentes, mesmo para recetores muito semelhantes. Este resultado mostrou que a polifarmacologia é, de facto, um problema complexo e que é necessário investir em diferentes tipos de informação para prever perfis de ligação e evitar o surgimento de efeitos secundários indesejados. Para prever todos os efeitos resultantes da atuação de uma molécula, é necessário ter um conhecimento prévio acerca das interações entre esta e os recetores, conhecer os tipos de ligações e também as suas forças. Uma forma de obter este conhecimento passa por experiências laboratoriais, no entanto, estes são processos muito dispendiosos e que consomem muito tempo. Uma forma mais acessível de abordar esta questão foi criando modelos computacionais capazes de prever possíveis interações entre moléculas e recetores com o objetivo de identificar moléculas alvo para a realização dos ensaios experimentais, aumentando assim a probabilidade de sucesso. Muitos destes modelos computacionais são baseados em métodos de aprendizagem automática, abordagens muito comuns em informática. Estes métodos baseiam-se num processo de aprendizagem de entidades, tendo como fundamento as suas caraterísticas já conhecidas, para criar um modelo capaz de classificar novas entidades. O sucesso destas técnicas tem sido comprovado em vários contextos da bioinformática e são uma aposta promissora na predição de interações entre moléculas e recetores. Com este trabalho, pretendeu-se utilizar uma abordagem de aprendizagem automática para desenvolver um modelo de predição de interações entre moléculas e recetores, tendo por base as semelhanças estruturais entre as moléculas e os seus respetivos níveis de atividade, já conhecidos, para recetores de serotonina e dopamina. O interesse nestas duas famílias de recetores recai no facto de fazerem parte da superfamília de recetores acoplados à proteína G, uma das mais importantes presentes no Sistema Nervoso Central. Para além disso, é conhecido o envolvimento de…

Advisors/Committee Members: Falcão, André Osório e Cruz de Azerêdo, 1969-.

Subjects/Keywords: Polifarmacologia; Aprendizagem automática; Classificador de Naive Bayes; Recetores acoplados à proteína G; NAMS; Teses de mestrado - 2015; Departamento de Informática

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APA (6th Edition):

Ferreira, V. A. C. (2015). Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules. (Thesis). Universidade de Lisboa. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/22423

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Ferreira, Vânia Alexandra Conceição. “Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules.” 2015. Thesis, Universidade de Lisboa. Accessed September 27, 2020. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/22423.

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MLA Handbook (7th Edition):

Ferreira, Vânia Alexandra Conceição. “Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules.” 2015. Web. 27 Sep 2020.

Vancouver:

Ferreira VAC. Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules. [Internet] [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2015. [cited 2020 Sep 27]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/22423.

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Council of Science Editors:

Ferreira VAC. Modeling CNS receptor binding profiles of small molecules. [Thesis]. Universidade de Lisboa; 2015. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.ul.pt:10451/22423

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Universitat Pompeu Fabra

2. Olivés Farrés, Joaquim, 1987-. Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans.

Degree: Departament de Ciències Experimentals i de la Salut, 2017, Universitat Pompeu Fabra

The ability of small molecules to bind to multiple proteins is not exclusive of drugs but general to most chemicals, including endogenous metabolites of living organisms, from plants to humans. In this respect, herbal medicines have been used since the dawn of time for treating discomforts and maladies, but their exact mode of action remains, still nowadays, unknown for most of them. Remedial herbs are composed of hundreds of active compounds interacting between them and with many proteins, forming what we can refer to as a therapeutic cocktail. Some of these interactions are essential for the therapeutic effect of the plant, but some others may be detrimental to their pharmacological action or even cause undesired side effects. Gaining a deeper understanding of the mechanism of action of remedial herbs is one of the main objectives of this Thesis. In addition, recent findings indicate a key role of the endogenous metabolome in drug discovery, a dimension seldom being considered so far. In particular, we are interested in comparing the set of metabolomes currently available as a means to assess the degree of variability among species. Based on this, a second main objective of this Thesis is to develop a computational approach to generate the metabolome from its genome. From plants to humans, accounting for the endogenous metabolome of biological systems emerges as a new paradigm in drug discovery. Advisors/Committee Members: [email protected] (authoremail), true (authoremailshow), Mestres i López, Jordi (director), true (authorsendemail).

Subjects/Keywords: Polifarmacologia; Predicció del metabolome; Etnofarmacologia; Biologia de sistemes; Perfilatge virtual; Polypharmacology; Metabolome prediction; Ethnopharmacology; Systems biology; Target profiling; 615

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APA (6th Edition):

Olivés Farrés, Joaquim, 1. (2017). Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans. (Thesis). Universitat Pompeu Fabra. Retrieved from http://hdl.handle.net/10803/572044

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

Olivés Farrés, Joaquim, 1987-. “Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans.” 2017. Thesis, Universitat Pompeu Fabra. Accessed September 27, 2020. http://hdl.handle.net/10803/572044.

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MLA Handbook (7th Edition):

Olivés Farrés, Joaquim, 1987-. “Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans.” 2017. Web. 27 Sep 2020.

Vancouver:

Olivés Farrés, Joaquim 1. Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans. [Internet] [Thesis]. Universitat Pompeu Fabra; 2017. [cited 2020 Sep 27]. Available from: http://hdl.handle.net/10803/572044.

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Council of Science Editors:

Olivés Farrés, Joaquim 1. Endogenous metabolites in drug discovery : from plants to humans. [Thesis]. Universitat Pompeu Fabra; 2017. Available from: http://hdl.handle.net/10803/572044

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Universitat Pompeu Fabra

3. Antolín Hernández, Albert, 1984-. The Impact of polypharmacology on chemical biology.

Degree: Departament de Ciències Experimentals i de la Salut, 2014, Universitat Pompeu Fabra

Avui dia un gran nombre de proves demostren que els fàrmacs exerceixen interaccions biològicament rellevants amb més d’una proteïna, un comportament generalment anomenat polifarmacologia. Aquest descobriment està començant a influir en el procés de descobriment de fàrmacs, transformant-lo en una empresa més holística. Per contra, la biologia química continua essent una disciplina reduccionista que encara considera les sondes químiques com molècules molt selectives que permeten la modulació i l’estudi d’una diana específica. En un esforç per portar una visió més àmplia a la pràctica de la biologia química, aquesta Tesi té l’objectiu de demostrar que les sondes químiques, com els fàrmacs, tendeixen a unir-se amb més d’una diana, un comportament que podria haver confós moltes de les conclusions biològiques derivades del seu ús. En conseqüència, en aquesta Tesi utilitzem la superfamília de les proteïnes Poly(ADP-ribose) polymerasa (PARPs) per il•lustrar les conseqüències de la polifarmacologia de les sondes químiques en la pràctica de la biologia química i el conseqüent descobriment de fàrmacs. Seguidament, ampliem aquest anàlisi a una col•lecció de sondes químiques per demostrar la prevalença de la polifarmacologia i aportem recomanacions per a convertir l’ús de sondes químiques potencialment promiscues en biologia química en una pràctica menys arriscada. La biologia química no pot seguir obviant l’existència de la polifarmacologia i els resultats presentats en aquesta Tesi demostren que la biologia química ha d’esdevenir una disciplina més holística que consideri l’ús de sondes químiques des d’una perspectiva de sistemes. Advisors/Committee Members: [email protected] (authoremail), true (authoremailshow), Mestres i López, Jordi (director), true (authorsendemail).

Subjects/Keywords: Polypharmacology; Chemical biology; Protein target; Synthetic lethality; Molecular descriptor; Kinases; Biomarkers; Molecular docking; Polifarmacologia; Biologia química; Sonda química; Proteïna diana; Farmacologia de sistemes; Letalitat sintètica; Similatitat química; Descriptor molecular; Quinases; Biomarcador; Acoblament molecular; 615

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APA (6th Edition):

Antolín Hernández, Albert, 1. (2014). The Impact of polypharmacology on chemical biology. (Thesis). Universitat Pompeu Fabra. Retrieved from http://hdl.handle.net/10803/329012

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

Antolín Hernández, Albert, 1984-. “The Impact of polypharmacology on chemical biology.” 2014. Thesis, Universitat Pompeu Fabra. Accessed September 27, 2020. http://hdl.handle.net/10803/329012.

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MLA Handbook (7th Edition):

Antolín Hernández, Albert, 1984-. “The Impact of polypharmacology on chemical biology.” 2014. Web. 27 Sep 2020.

Vancouver:

Antolín Hernández, Albert 1. The Impact of polypharmacology on chemical biology. [Internet] [Thesis]. Universitat Pompeu Fabra; 2014. [cited 2020 Sep 27]. Available from: http://hdl.handle.net/10803/329012.

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Council of Science Editors:

Antolín Hernández, Albert 1. The Impact of polypharmacology on chemical biology. [Thesis]. Universitat Pompeu Fabra; 2014. Available from: http://hdl.handle.net/10803/329012

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