You searched for subject:(Penalization).
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Texas A&M University
1.
Ngere, Lauretta.
Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants.
Degree: 2015, Texas A&M University
URL: http://hdl.handle.net/1969.1/155097 
► Internal parasites are a major concern to the livestock industry leading to huge losses. Genetic enhancement of ruminants for resistance/tolerance to internal parasites may provide…
(more)
▼ Internal parasites are a major concern to the livestock industry leading to huge losses. Genetic enhancement of ruminants for resistance/tolerance to internal parasites may provide for a lasting solution to the problem of internal parasite infection in livestock. The objective of this study was to estimate heritability and permanent environmental variance for internal parasite resistance traits in sheep and to apply penalties on the records of treated animals, analyzing the effect of such penalties on the genetic parameters. Records from 1008 Dorper sheep in a private South African flock comprised 17,711 FAMACHA scores, 3,758 fecal egg counts (mostly Haemonchus contortus), and 4,209 hematocrit values that were collected from 1997 ? 2000. Animal models were used to conduct single trait analyses. Data were analyzed in three sets: 1) untreated records only; 2) all records; no penalties; and 3) all records with treated records penalized. Heritability estimates of Fc (FAMACHA) ranged from 0.33 ? 0.03 to 0.37 ? 0.03; FEC (Fecal egg count) from 0.04 ? 0.02 to 0.05 ? 0.03 and hematocrit from 0.19 ? 0.04 to 0.20 ? 0.05. Permanent environmental variance as a proportion of phenotypic variance was 0.02 ? 0.02 to 0.03 ? 0.02 for Fc, 0.14 ? 0.04 to 0.18 ? 0.05 for Ht and 0.07 ? 0.02 to 0.08 ? 0.03 for FEC. The Inclusion of treated animal records in the analyses, with or without
penalization did not change the estimates of heritability and permanent environmental variance as a proportion of phenotypic variance.
The objective of the second study was to assess genetic variation in fecal egg count and the associations of fecal egg count with other traits in growing crossbred Nelore-Angus cattle. Records of 201 F2 and F3 ? Nelore ? Angus steers in feedlot conditions in a genomics resource population in Central Texas were collected in 2012 and 2013. Helminth egg counts were determined from fecal samples before treatment with an anthelmintic product. The association of fecal egg count with other traits was assessed by modeling each in distinct analyses as a linear covariate. Year explained substantial variation in fecal egg count (P = 0.001). No other investigated covariate (birth weight, weaning weight, weaning temperament score, live weight, temperature, and exit velocity) was important in the different models (P > 0.2). Subsequently, sire (n= 13) was evaluated as a fixed effect (sires with less than 3 steers with records were excluded). Two sire families had significantly lower (P < 0.05) fecal egg counts (1.31 ? 0.28 and 1.57 ? 0.10) than the three sire families with the highest fecal egg counts (1.87 ? 0.10 - 2.06 ? 0.20). These results suggest the presence of additive genetic variation for fecal egg count, implying that selection can be carried out for the ability to suppress parasite worms in cattle.
The objective of the second study was to assess genetic variation in fecal egg count and the associations of fecal egg count with other traits in growing crossbred Nelore-Angus cattle. Records of 201 F2 and F3 ? Nelore ? Angus…
Advisors/Committee Members: Riley, David (advisor), Sanders, James (committee member), Herring, Andy (committee member), Craig, Thomas (committee member).
Subjects/Keywords: Internal Parasite; FAMACHA; Heritability; Penalization
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Ngere, L. (2015). Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants. (Thesis). Texas A&M University. Retrieved from http://hdl.handle.net/1969.1/155097
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Ngere, Lauretta. “Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants.” 2015. Thesis, Texas A&M University. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1969.1/155097.
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MLA Handbook (7th Edition):
Ngere, Lauretta. “Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants.” 2015. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Ngere L. Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants. [Internet] [Thesis]. Texas A&M University; 2015. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1969.1/155097.
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Council of Science Editors:
Ngere L. Estimation of Genetic Parameters and Assessment of Genetic Variation for Internal Parasite Resistance Traits in Ruminants. [Thesis]. Texas A&M University; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/1969.1/155097
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University of Minnesota
2.
Zhu, Yanni.
Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data.
Degree: PhD, Biostatistics, 2009, University of Minnesota
URL: http://purl.umn.edu/57042
► The importance of network-based approach to identifying biological markers for diag- nostic classification and prognostic assessment in the context of microarray has been increasingly recognized.…
(more)
▼ The importance of network-based approach to identifying biological markers for diag-
nostic classification and prognostic assessment in the context of microarray has been
increasingly recognized. Standard methods treat all genes independently and identically
a priori and ignore the biological observation that genes function together in biological
processes. For binary classification, we are motivated to improve predictive accuracy
and gene selection by developing novel network-based classification tools that explicitly
incorporate interrelationships of genes as described by gene networks.
We propose three network-based support vector machines (SVM) by suitably forming
the penalty term. The neighboring-gene (NG) penalty groups pairwise gene neighbors
and sums up the L1-norm of each group over the entire network, leading to NG-SVM.
NG-SVM tends to select pairs of neighboring genes. The disease-gene-centric (DGC)
penalty is constructed on groups defined on an upper-lower hierarchy imposed on the
undirected network. DGC-SVM aims to detect collectives of genes clustering together
and around some key disease genes. The truncated L1-norm (TL1) penalty intends
to correct bias induced by penalization through a threshold parameter C > 0 built
into the L1-norm as used in NG-SVM and DGC-SVM. Simulation studies and real
data applications demonstrate that the proposed methods are able to capture more
disease genes and less noise genes than the existing popular methods, standard SVM
and L1-SVM. We conclude that the proposed methods have the potential to be effective
classification tools for microarrays and other high-dimensional data.
Subjects/Keywords: Gene expression; Gene network; Penalization; Support vector machine
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Zhu, Y. (2009). Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data. (Doctoral Dissertation). University of Minnesota. Retrieved from http://purl.umn.edu/57042
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Zhu, Yanni. “Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data.” 2009. Doctoral Dissertation, University of Minnesota. Accessed January 22, 2020.
http://purl.umn.edu/57042.
MLA Handbook (7th Edition):
Zhu, Yanni. “Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data.” 2009. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Zhu Y. Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of Minnesota; 2009. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://purl.umn.edu/57042.
Council of Science Editors:
Zhu Y. Network-based support vector machines for classification of microarray gene expression data. [Doctoral Dissertation]. University of Minnesota; 2009. Available from: http://purl.umn.edu/57042
Leiden University
3.
Rood, Sheila.
Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques.
Degree: 2018, Leiden University
URL: http://hdl.handle.net/1887/69201
Subjects/Keywords: penalization;
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Rood, S. (2018). Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques. (Masters Thesis). Leiden University. Retrieved from http://hdl.handle.net/1887/69201
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Rood, Sheila. “Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques.” 2018. Masters Thesis, Leiden University. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1887/69201.
MLA Handbook (7th Edition):
Rood, Sheila. “Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Rood S. Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques. [Internet] [Masters thesis]. Leiden University; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1887/69201.
Council of Science Editors:
Rood S. Classifying Parkinson's Disease patients based on resting state fMRI data, using penalised regression techniques. [Masters Thesis]. Leiden University; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/1887/69201
University of Washington
4.
Paynter, Alexander Caldwell.
Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness.
Degree: 2019, University of Washington
URL: http://hdl.handle.net/1773/44064
► Our goal is estimating the true number of classes in a population. We focus on the scenario where multiple frequency count tables have been collected…
(more)
▼ Our goal is estimating the true number of classes in a population. We focus on the scenario where multiple frequency count tables have been collected from the same population. In this setting we demonstrate the efficacy of a previously published penalized maximum likelihood method. Four novel methods to tune the requisite
penalization parameter are proposed. The performance of all proposed tuning methods is compared in simulations.
Advisors/Committee Members: Willis, Amy D (advisor).
Subjects/Keywords: abundance; microbial ecology; penalization; species richness; Biostatistics; Biostatistics
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Paynter, A. C. (2019). Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness. (Thesis). University of Washington. Retrieved from http://hdl.handle.net/1773/44064
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Paynter, Alexander Caldwell. “Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness.” 2019. Thesis, University of Washington. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1773/44064.
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MLA Handbook (7th Edition):
Paynter, Alexander Caldwell. “Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness.” 2019. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Paynter AC. Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness. [Internet] [Thesis]. University of Washington; 2019. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1773/44064.
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Council of Science Editors:
Paynter AC. Tuning parameter selection for a penalized maximum likelihood estimator of species richness. [Thesis]. University of Washington; 2019. Available from: http://hdl.handle.net/1773/44064
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Universidade do Minho
5.
Reis, Alexandra Cláudia Garcês.
Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
.
Degree: 2017, Universidade do Minho
URL: http://hdl.handle.net/1822/46595
► A dissertação Criminalização dos sem-abrigo: Abordagens e políticas expõe um cenário europeu de um problema controverso de escala mundial. Esta investigação apresenta as perspetivas teóricas…
(more)
▼ A dissertação Criminalização dos sem-abrigo: Abordagens e políticas expõe um cenário
europeu de um problema controverso de escala mundial. Esta investigação apresenta as
perspetivas teóricas de vários autores e confronta o mesmo problema em locais geográficos
diferentes: primeiro analisa-se a realidade das políticas de exclusão dos sem-abrigo nos Estados
Unidos da América e depois na Europa, mais concretamente nos 16 Estados-Membros da União
Europeia. O estudo das abordagens e das políticas em torno da criminalização dos sem-abrigo é
feito através de um método de pesquisa bibliográfico e documental abrangendo diferentes áreas
científicas como a sociologia e o direito. O mapeamento das políticas penais europeias e uma
demonstração e confrontação de diferentes correntes punitivas que se fazem sentir nos dias de
hoje são o foco central deste estudo.
A presente investigação relaciona a evolução social e política das sociedades (urbanas)
modernas e os “novos problemas” resultantes destas. O declínio dos laços sociais, o controlo
social, a vigilância dos espaços públicos, e perda de valores solidários são efeitos que têm estado
em permanente evolução e se fazem sentir nas comunidades urbanas ocidentais. São estes feitos
que se enumeram e analisam ao longo da dissertação.
Advisors/Committee Members: Cunha, Manuela Ivone P. da (advisor).
Subjects/Keywords: Criminalização dos sem-abrigo;
Penalização;
Pobreza;
Exclusão;
Criminalization of the homeless;
Penalization;
Neoliberalism;
Poverty;
Exclusion
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Reis, A. C. G. (2017). Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
. (Masters Thesis). Universidade do Minho. Retrieved from http://hdl.handle.net/1822/46595
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Reis, Alexandra Cláudia Garcês. “Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
.” 2017. Masters Thesis, Universidade do Minho. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1822/46595.
MLA Handbook (7th Edition):
Reis, Alexandra Cláudia Garcês. “Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
.” 2017. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Reis ACG. Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
. [Internet] [Masters thesis]. Universidade do Minho; 2017. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1822/46595.
Council of Science Editors:
Reis ACG. Criminalização dos sem-abrigo na Europa: abordagens e políticas
. [Masters Thesis]. Universidade do Minho; 2017. Available from: http://hdl.handle.net/1822/46595
University of Pennsylvania
6.
Yang, Dan.
Singular Value Decomposition for High Dimensional Data.
Degree: 2012, University of Pennsylvania
URL: https://repository.upenn.edu/edissertations/595
► Singular value decomposition is a widely used tool for dimension reduction in multivariate analysis. However, when used for statistical estimation in high-dimensional low rank matrix…
(more)
▼ Singular value decomposition is a widely used tool for dimension reduction in multivariate analysis. However, when used for statistical estimation in high-dimensional low rank matrix models, singular vectors of the noise-corrupted matrix are inconsistent for their counterparts of the true mean matrix. We suppose the true singular vectors have sparse representations in a certain basis. We propose an iterative thresholding algorithm that can estimate the subspaces spanned by leading left and right singular vectors and also the true mean matrix optimally under Gaussian assumption. We further turn the algorithm into a practical methodology that is fast, data-driven and robust to heavy-tailed noises. Simulations and a real data example further show its competitive performance. The dissertation contains two chapters. For the ease of the delivery, Chapter 1 is dedicated to the description and the study of the practical methodology and Chapter 2 states and proves the theoretical property of the algorithm under Gaussian noise.
Subjects/Keywords: Cross validation; Denoise; Low rank matrix approximation; PCA; Penalization; Thresholding; Statistics and Probability
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Yang, D. (2012). Singular Value Decomposition for High Dimensional Data. (Thesis). University of Pennsylvania. Retrieved from https://repository.upenn.edu/edissertations/595
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Yang, Dan. “Singular Value Decomposition for High Dimensional Data.” 2012. Thesis, University of Pennsylvania. Accessed January 22, 2020.
https://repository.upenn.edu/edissertations/595.
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Yang, Dan. “Singular Value Decomposition for High Dimensional Data.” 2012. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Yang D. Singular Value Decomposition for High Dimensional Data. [Internet] [Thesis]. University of Pennsylvania; 2012. [cited 2020 Jan 22].
Available from: https://repository.upenn.edu/edissertations/595.
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Council of Science Editors:
Yang D. Singular Value Decomposition for High Dimensional Data. [Thesis]. University of Pennsylvania; 2012. Available from: https://repository.upenn.edu/edissertations/595
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7.
Leroy, Matthieu.
Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume.
Degree: Docteur es, Mécanique et Physique des Fluides, 2013, Aix Marseille Université
URL: http://www.theses.fr/2013AIXM4786
► Dans ce travail de thèse, une méthode de pénalisation en volume pour la simulation d'écoulements magnétohydrodynamiques (MHD) en domaines confinés est présentée. Les équations incompressibles…
(more)
▼ Dans ce travail de thèse, une méthode de pénalisation en volume pour la simulation d'écoulements magnétohydrodynamiques (MHD) en domaines confinés est présentée. Les équations incompressibles de la MHD résistives sont résolues par le truchement d'un solveur pseudo-spectral parallèlisé. La pénalisation en volume est une méthode de frontières immergées, caractérisée par une grande flexibilité dans le choix de la géométrie de l'écoulement. Dans le cas présent, elle permet d'utiliser des conditions aux limites non-périodiques dans un schéma pseudo-spectral Fourier. La méthode numérique est validée et sa convergence est quantifiée pour des écoulements hydrodynamiques et MHD, en deux et trois dimensions, en comparant les résultats numériques à ceux de la littérature et à des solutions analytiques. Dans un second temps, la génération spontanée de moment cinétique et magnétique est étudiée pour des écoulements MHD confinés 2D et 3D. L'influence du nombre de Reynolds et du rapport des énergies cinétique/magnétique est explorée, ainsi que les différences induites par les conditions aux limites. Le fait que l'axisymétrie des frontières résulte en un terme de pression non-nul est primordial pour engendrer de grandes valeurs du moment cinétique. L'exclusivité de cette auto-organisation aux écoulements 2D est étudiée en considérant la MHD 3D en présence d'un fort champ magnétique axial. La suite est consacrée à la simulation d'un fluide conducteur dans un cylindre avec un forçage magnétique axial et poloidal. En faisant varier l'amplitude du forçage poloidal, différents états dynamiques sont atteints. Enfin, l'effet du nombre de Prandtl sur le seuil des instabilitées est étudié.
A volume penalization method for the simulation of magnetohydrodynamic (MHD) flows in confined domains is presented. Incompressible resistive MHD equations are solved in 3D by means of a parallelized pseudo-spectral solver. The volume penalization technique is an immersed boundary method, characterized by a high flexibility in the choice of the geometry of the considered flow. In the present case, it allows the use of conditions different from periodic boundaries in a Fourier pseudo-spectral scheme. The numerical method is validated and its convergence is assessed for two- and three-dimensional hydrodynamical and MHD flows by comparing the numerical results with those of the literature or analytical solutions. Then, the spontaneous generation of kinetic and magnetic angular momentum is studied for confined 2D and 3D MHD flows. The influence of the Reynolds number and of the ratio of kinetic/magnetic energies is explored, as well as the differences induced by the boundary conditions. The fact that axisymmetric borders introduce a non-zero pressure term in the evolution equation of the angular momentum is essential to generate large values of the angular momentum. It is investigated whether this self-organization is exclusively observed in 2D flows by considering 3D MHD in the presence of a strong axial magnetic field. The last part is devoted to the…
Advisors/Committee Members: Schneider, Kai, Bernd (thesis director), Bos, Wouter (thesis director).
Subjects/Keywords: MHD; Pseudo-spectral; Pénalisation; Domaines confinés; Instabilités; MHD; Pseudo-spectral; Penalization; Confined domains; Instabilities
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Leroy, M. (2013). Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2013AIXM4786
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Leroy, Matthieu. “Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume.” 2013. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2013AIXM4786.
MLA Handbook (7th Edition):
Leroy, Matthieu. “Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume.” 2013. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Leroy M. Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2013. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2013AIXM4786.
Council of Science Editors:
Leroy M. Simulation of three-dimensional magnetohydrodynamic flows using a pseudo-spectral method with volume penalization : Simulation d’écoulements magnétohydrodynamiques en trois dimensions utilisant un code pseudo-spectral avec la méthode de pénalisation en volume. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013AIXM4786
University of Iowa
8.
Jang, Mi Jin.
Working correlation selection in generalized estimating equations.
Degree: PhD, Biostatistics, 2011, University of Iowa
URL: https://ir.uiowa.edu/etd/2719
► Longitudinal data analysis is common in biomedical research area. Generalized estimating equations (GEE) approach is widely used for longitudinal marginal models. The GEE method…
(more)
▼ Longitudinal data analysis is common in biomedical research area. Generalized estimating equations (GEE) approach is widely used for longitudinal marginal models. The GEE method is known to provide consistent regression parameter estimates regardless of the choice of working correlation structure, provided the square root of n consistent nuisance parameters are used. However, it is important to use the appropriate working correlation structure in small samples, since it improves the statistical efficiency of β estimate. Several working correlation selection criteria have been proposed (Rotnitzky and Jewell, 1990; Pan, 2001; Hin and Wang, 2009; Shults et. al, 2009). However, these selection criteria have the same limitation in that they perform poorly when over-parameterized structures are considered as candidates. In this dissertation, new working correlation selection criteria are developed based on generalized eigenvalues. A set of generalized eigenvalues is used to measure the disparity between the bias-corrected sandwich variance estimator under the hypothesized working correlation matrix and the model-based variance estimator under a working independence assumption. A summary measure based on the set of the generalized eigenvalues provides an indication of the disparity between the true correlation structure and the misspecified working correlation structure. Motivated by the test statistics in MANOVA, three working correlation selection criteria are proposed: PT (Pillai's trace type criterion),WR (Wilks' ratio type criterion) and RMR (Roy's Maximum Root type criterion). The relationship between these generalized eigenvalues and the CIC measure is revealed. In addition, this dissertation proposes a method to penalize for the over-parameterized working correlation structures. The over-parameterized structure converges to the true correlation structure, using extra parameters. Thus, the true correlation structure and the over-parameterized structure tend to provide similar variance estimate of the estimated β and similar working correlation selection criterion values. However, the over-parameterized structure is more likely to be chosen as the best working correlation structure by "the smaller the better" rule for criterion values. This is because the over-parameterization leads to the negatively biased sandwich variance estimator, hence smaller selection criterion value. In this dissertation, the over-parameterized structure is penalized through cluster detection and an optimization function. In order to find the group ("cluster") of the working correlation structures that are similar to each other, a cluster detection method is developed, based on spacings of the order statistics of the selection criterion measures. Once a cluster is found, the optimization function considering the trade-off between bias and variability provides the choice of the "best" approximating working correlation structure. The performance of our proposed criterion measures relative to other relevant criteria (QIC, RJ…
Advisors/Committee Members: Pendergast, Jane F. (supervisor).
Subjects/Keywords: Generalized Eigenvalue; Generalized Estimating Equation; Longitudinal data; Model Selection; Penalization; Working Correlation Structure; Biostatistics
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Jang, M. J. (2011). Working correlation selection in generalized estimating equations. (Doctoral Dissertation). University of Iowa. Retrieved from https://ir.uiowa.edu/etd/2719
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Jang, Mi Jin. “Working correlation selection in generalized estimating equations.” 2011. Doctoral Dissertation, University of Iowa. Accessed January 22, 2020.
https://ir.uiowa.edu/etd/2719.
MLA Handbook (7th Edition):
Jang, Mi Jin. “Working correlation selection in generalized estimating equations.” 2011. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Jang MJ. Working correlation selection in generalized estimating equations. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of Iowa; 2011. [cited 2020 Jan 22].
Available from: https://ir.uiowa.edu/etd/2719.
Council of Science Editors:
Jang MJ. Working correlation selection in generalized estimating equations. [Doctoral Dissertation]. University of Iowa; 2011. Available from: https://ir.uiowa.edu/etd/2719
9.
Benamour, Malek.
Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies.
Degree: Docteur es, Mécanique des fluides, 2015, La Rochelle
URL: http://www.theses.fr/2015LAROS017
► Les écoulements autour de structures en mouvement font l'objet de plusieurs travaux numériques et expérimentaux. L'objectif de ce travail de thèse consiste à montrer la…
(more)
▼ Les écoulements autour de structures en mouvement font l'objet de plusieurs travaux numériques et expérimentaux. L'objectif de ce travail de thèse consiste à montrer la pertinence de la combinaison de la pénalisation volumique avec la méthode de lattice Boltzmann (LBM), dans l'étude du mouvement d'obstacles mobiles dans un écoulement, et de leur interaction avec celui-ci. La LBM,qui est simple et précise à mettre en œuvre, a prouvé ces dernières années son efficacité dans le domaine de la mécanique des fluides. Par ailleurs, la méthode de pénalisation volumique consiste à introduire un terme de pénalisation dans l'équation que l'on souhaite résoudre, afin de prendre en compte l'influence de l'obstacle sur le domaine fluide. Comme cette équation est résolue sur l'ensemble du domaine composé du fluide et du solide, les conditions aux limites à l'interface fluide-solide sont appliquées de façon naturelle. Il semble donc aisé de combiner cette technique avec la méthode de lattice Boltzmann. Nous avons dans un premier temps rappelé les notions de base et les principales caractéristiques de la méthode de lattice Boltzmann. On a présenté quelques exemples d'applications sur des cas tests, que nous avons programmés. Ensuite, une étude bibliographique faisant état des différentes approches qui utilisent la LBM dans l'étude des problèmes d'interaction fluide structure (IFS) a été réalisée. Puis, la combinaison de la pénalisation volumique avec la LBM a été testée avec succès sur l'équation de Burgers monodimensionnelle. La validation s'est portée en premier lieu, sur un écoulement autour d'un solide fixe, puis sur un écoulement autour d'une structure dont le mouvement est imposé, et finalement sur un problème d'IFS de type masse-ressort. La méthode développée a été ensuite testée sur les équations de Navier-Stokes, en considérant un fluide incompressible et une structure rigide. La validation s'est portée tout d'abord sur un écoulement autour d'obstacles immobiles (carré et cylindre), puis autour d'un cylindre mobile en oscillations forcées et libres. Enfin, une dernière application a été portée sur un écoulement entre deux plaques mobiles dans un canal. Nous avons montré que pour tous les cas étudiés, l'approche développée donne de bons résultats, elle reproduit avec précision les résultats de référence.
Flows around moving bodies are the subject of several numerical and experimental studies. The work presented in this document deals with the implementation of a volume penalization technique in a lattice Boltzmann model (LBM), in order to compute flows around moving obstacles. The LBM, which is accurate and easy to implement, has been successfully applied in fluid mechanics during the last decades. It was thus chosen in the present work, for flow computation. Furthermore, the volume penalization technique consists in introducing a volume penalization term into the equation that needs to be solved, in order to take into account the influence of the obstacle on the fluid domain. Since this equation is solved on both fluid…
Advisors/Committee Members: Wehrli, Claudine (thesis director).
Subjects/Keywords: Lattice Boltzmann; Pénalisation volumique; Interaction fluide structure; CFD; Lattice Boltzmann; Volume penalization; Fluid structure interaction; CFD
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Benamour, M. (2015). Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies. (Doctoral Dissertation). La Rochelle. Retrieved from http://www.theses.fr/2015LAROS017
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Benamour, Malek. “Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies.” 2015. Doctoral Dissertation, La Rochelle. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2015LAROS017.
MLA Handbook (7th Edition):
Benamour, Malek. “Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies.” 2015. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Benamour M. Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies. [Internet] [Doctoral dissertation]. La Rochelle; 2015. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2015LAROS017.
Council of Science Editors:
Benamour M. Développement d'une méthode de pénalisation volumique en lattice Boltzmann : application aux domaines mobiles : A combined volume penalization-lattice Boltzmann method : for simulating flows around moving bodies. [Doctoral Dissertation]. La Rochelle; 2015. Available from: http://www.theses.fr/2015LAROS017
10.
Francilene Barbosa dos Santos Silva.
Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado.
Degree: 2011, Universidade Federal de Juiz de Fora
URL: http://www.bdtd.ufjf.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1161
► Estrategias de penalização são muito utilizadas no trato de problemas com restrições. Problemas inerentes a escolha de valores adequados para os termos de penalização dificultam…
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▼ Estrategias de penalização são muito utilizadas no trato de problemas com restrições. Problemas inerentes a escolha de valores adequados para os termos de penalização dificultam a obtenção de resultados contáveis e robustos na sua aplicação em problemas da otimização estrutural. Tecnicas baseadas em modelos de penalização adaptativa tem apresentado relativo sucesso quando aplicadas em conjunto com algoritmos evolucionistas. Apresenta-se aqui uma nova alternativa utilizando uma estrategia de lagrangeano aumentado para o trato das restrições do problema de otimização estrutural. Encontra-se na literatura modelos para penalização adaptativa bem como o uso do lagrangeano aumentado em conjunto com algoritmos geneticos geracionais. O objetivo desse trabalho e adaptar um modelo de penalização para um algoritmo genetico não geracional, bem como criar um algoritmo baseado em lagrangeano aumentado tambem para o algoritmo não-geracional. Esses algoritmos foram aplicados em estruturas reticuladas, muito utilizadas na construção civil como coberturas de ginasios, hangares, galpões, etc. O desempenho desses tipos de estruturas e funções matemáticas foi analisado com as tecnicas de tratamento de restrição apresentadas nesse trabalho. Isso foi feito durante a busca de soluções otimas na tentativa de minimizar os custos e satisfazer as restrições adequadas para diversas estruturas e funções matematicas.
Penalty strategies are widely used in dealing with problems with constraints. Problems inherent in the choice of appropriate values for the terms of penalties dicult to obtain reliable and strong results in its application in problems of structural optimization. Techniques based on models of adaptive penalty has shown some success when applied in conjunction with evolutionary algorithms. Here is presented a new alternative using augmented Lagrangian strategy for dealing with the problem of constrained structural optimizations. It is found in the literature models for adaptive penalties as well as the use of the augmented Lagrangian together with generational genetic algorithms. The aim of this work is to adapt a model of penalization for non-generational genetic algorithm, as well as create an algorithm based on augmented Lagrangian as also for a non-generational algorithm. These algorithms were applied to structures, widely used in construction as coverage of gymnasiums, hangars, etc. The performance of these types of structures and functions was analyzed using mathematical techniques for handling constraints presented in this work. This was done during the search for optimal solutions in an attempt to minimize costs and satisfy the constraints appropriate for various structures and mathematical functions.
Advisors/Committee Members: Afonso Celso de Castro Lemonge, Helio José Correa Barbosa, Leonardo Goliatt Fonseca, Carlos Cristiano Hasenclever Borges.
Subjects/Keywords: Otimização com restrição; Penalização; Lagrangeano aumentado; Algoritmos geneticos; Constrained optimization; Penalization; Augmented lagrangian; Genetic algorithm; SISTEMAS DE COMPUTACAO
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Silva, F. B. d. S. (2011). Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado. (Thesis). Universidade Federal de Juiz de Fora. Retrieved from http://www.bdtd.ufjf.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1161
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Silva, Francilene Barbosa dos Santos. “Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado.” 2011. Thesis, Universidade Federal de Juiz de Fora. Accessed January 22, 2020.
http://www.bdtd.ufjf.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1161.
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MLA Handbook (7th Edition):
Silva, Francilene Barbosa dos Santos. “Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado.” 2011. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Silva FBdS. Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de Juiz de Fora; 2011. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.bdtd.ufjf.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1161.
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Silva FBdS. Algoritmos geneticos para otimização de estruturas reticuladas baseadas em modelos adaptativos e lagrangeano aumentado. [Thesis]. Universidade Federal de Juiz de Fora; 2011. Available from: http://www.bdtd.ufjf.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1161
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11.
Flamia-Biondetti, Marika.
Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability.
Degree: Docteur es, Droit privé, 2010, La Rochelle
URL: http://www.theses.fr/2010LAROD022
► Nul ne conteste la nature compensatrice de la responsabilité civile. Pourtant, si cette fonction réparatrice n’est guère discutée, les auteurs se séparent aujourd’hui sur le…
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▼ Nul ne conteste la nature compensatrice de la responsabilité civile. Pourtant, si cette fonction réparatrice n’est guère discutée, les auteurs se séparent aujourd’hui sur le point de savoir si cette fonction doit être la seule assumée par la responsabilité civile. Non qu’il soit contesté qu’elle assume bien d’autres fonctions ; la grande majorité de la doctrine indique en effet, sans toutefois en souligner les ressorts, que les buts poursuivis par la responsabilité sont multiples et relèvent tant de la compensation des préjudices que de la punition et de la dissuasion des comportements dommageables. A l’heure d’une crise de la responsabilité dénoncée par tous, la question touche donc aux rôles que la responsabilité civile doit assumer. Alors que certains auteurs plaident pour un recentrage dur sa mission première d’indemnisation des victimes, de plus en plus de voix plaident au contraire pour l’élargissement de ses fonctions dans un sens à la fois plus répressif mais aussi préventif. Il s’agit donc désormais d’envisager la responsabilité civile comme un véritable outil de gestion des risques. Totalement axée sur l’indemnisation des victimes depuis plusieurs décennies, la responsabilité civile semble paradoxalement mal armée pour répondre à cette nouvelle attente. De plus, un élargissement des fonctions de la responsabilité civile conduit à s’interroger sur la prééminence d’une fonction sur l’autre ou à leur possible conciliation. En réalité, il existe sans conteste un terreau favorable au développement d’une véritable fonction punitive de la responsabilité civile et l’on constate un double mouvement qui nous semble révélateur du rôle régulateur qu’elle peut assumer. En premier lieu, si l’effet punitif diffus que l’on attachait traditionnellement à la condamnation civile est en net recul, sous l’effet du repli de la faute mais aussi des règles gouvernant la réparation, cet effet subsiste néanmoins, comme le démontre notamment l’analyse économique de la responsabilité. Nous avons donc mis en évidence une résistance latente mais bien réelle d’une conception morale de la responsabilité civile servant son objectif normatif. Surtout, nous avons constaté qu’à cet effet secondaire de la responsabilité tend aujourd’hui à se substituer une véritable fonction punitive et dissuasive de la condamnation civile, construite et cohérente. Nous avons donc proposé une lecture renouvelée du fonctionnement de la responsabilité civile après avoir relevé les germes quelque peu épars de cette conception normative de la responsabilité civile : évolution de la notion de préjudice réparable avec notamment l’assouplissement des critères du préjudice réparable en droit des affaires ou l’émergence de nouveaux préjudices comme en matière environnementale ; modification de l’évaluation et des modalités de la réparation ; émergence de la notion de peine privée. Deux méthodes semblent envisageables afin de soutenir la résurgence de la fonction dissuasive et punitive de la responsabilité civile : la première tient à un alourdissement de la…
Advisors/Committee Members: Grynbaum, Luc (thesis director).
Subjects/Keywords: Responsabilité civile extracontractuelle; Faute; Peine privée; Dommage réparable; Extra contractual civil liability; Fault; Private penalization; Reparable damage
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Flamia-Biondetti, M. (2010). Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability. (Doctoral Dissertation). La Rochelle. Retrieved from http://www.theses.fr/2010LAROD022
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Flamia-Biondetti, Marika. “Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability.” 2010. Doctoral Dissertation, La Rochelle. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2010LAROD022.
MLA Handbook (7th Edition):
Flamia-Biondetti, Marika. “Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability.” 2010. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Flamia-Biondetti M. Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability. [Internet] [Doctoral dissertation]. La Rochelle; 2010. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2010LAROD022.
Council of Science Editors:
Flamia-Biondetti M. Réparation et dissuasion : analyse de la dimension punitive de la condamnation civile : Repair and dissuasion : analysis of the punitive dimension of civil liability. [Doctoral Dissertation]. La Rochelle; 2010. Available from: http://www.theses.fr/2010LAROD022
Université de Montréal
12.
Gaulin, Dominique.
Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
.
Degree: 2018, Université de Montréal
URL: http://hdl.handle.net/1866/20355
Subjects/Keywords: Identité;
Santé mentale;
Judiciarisation;
Trajectoire;
Stigmatisation;
Identity;
Mental health;
Penalization;
Trajectory;
Stigmatisation
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Gaulin, D. (2018). Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
. (Thesis). Université de Montréal. Retrieved from http://hdl.handle.net/1866/20355
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Gaulin, Dominique. “Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
.” 2018. Thesis, Université de Montréal. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1866/20355.
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MLA Handbook (7th Edition):
Gaulin, Dominique. “Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Gaulin D. Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
. [Internet] [Thesis]. Université de Montréal; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1866/20355.
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Council of Science Editors:
Gaulin D. Doubles stigmates : au croisement de la judiciarisation et de la folie
. [Thesis]. Université de Montréal; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/1866/20355
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13.
Mimeau, Chloé.
Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements.
Degree: Docteur es, Mathématiques appliquées, 2015, Grenoble Alpes
URL: http://www.theses.fr/2015GREAM018
► Dans cette thèse nous mettons en oeuvre une méthode vortex hybride pénalisée (HVP) afin desimuler des écoulements incompressibles autour de corps non profilés dans des…
(more)
▼ Dans cette thèse nous mettons en oeuvre une méthode vortex hybride pénalisée (HVP) afin desimuler des écoulements incompressibles autour de corps non profilés dans des milieux complexessolides-fluides-poreux. Avec cette approche particulaire hybride, le phénomène de convection estmodélisé à l’aide d’une méthode vortex afin de bénéficier du caractère peu diffusif et naturel desméthodes particulaires. Un remaillage des particules est alors réalisé systématiquement sur unegrille cartésienne sous-jacente afin d’éviter les phénomènes de distorsion. D’autre part, les effetsdiffusifs et d’étirement ainsi que le calcul de la vitesse sont traités sur la grille cartésienne, àl’aide de schémas eulériens. Le traitement des conditions de bords aux parois de l’obstacle esteffectué à l’aide d’une technique de pénalisation, particulièrement bien adaptée au traitementde milieux solides-fluides-poreux.Cette méthode HVP est appliquée au contrôle passif d’écoulement. Cette étude de contrôleest effectuée respectivement en 2D et en 3D autour d’un demi-cylindre et d’un hémisphère parl’ajout d’un revêtement poreux à la surface de l’obstacle. La présence de cette couche poreusemodifiant la nature des conditions aux interfaces, permet de régulariser l’écoulement global etde diminuer la traînée aérodynamique de l’obstacle contrôlé. A travers des études paramétriquessur la perméabilité, l’épaisseur et la position du revêtement poreux, ce travail vise à identifier desdispositifs de contrôles efficaces pour des écoulements autour d’obstacles comme des rétroviseursautomobiles.
In this work we use a hybrid vortex penalization method (HVP) to simulate incompressibleflows past bluff bodies in complex solid-fluid-porous media. In this hybrid particle approach,the advection phenomenon is modeled through a vortex method in order to benefit from thenatural description of the flow supplied by particle methods and their low numerical diffusionfeatures. A particle remeshing is performed systematically on an underlying Cartesian grid inorder to prevent distortion phenomena. On the other hand, the viscous and stretching effects aswell as the velocity calculation are discretized on the mesh through Eulerian schemes. Finally,the treatment of boundary conditions is handled with a penalization method that is well suitedfor the treatment of solid-fluid-porous media.The HVP method is applied to passive flow control. This flow control study is realized pasta 2D semi-circular cylinder and a 3D hemisphere by adding a porous layer on the surface of thebody. The presence of such porous layer modifies the characteristics of the conditions at theinterfaces and leads to a regularization of the wake and to a decrease of the aerodynamic dragof the controlled obstacle. Through parametric studies on the permeability, the thickness andthe position of the porous coating, this works aims to identify efficient control devices for flowsaround obstacles like the rear-view mirrors of a ground vehicle.
Advisors/Committee Members: Cottet, Georges-Henri (thesis director), Mortazavi, Iraj (thesis director).
Subjects/Keywords: Méthode vortex hybride; Méthode de pénalisation; Contrôle passif d’écoulements; Milieux poreux; Hybrid vortex method; Penalization method; Passive flow control; Porous media; 510
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Mimeau, C. (2015). Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements. (Doctoral Dissertation). Grenoble Alpes. Retrieved from http://www.theses.fr/2015GREAM018
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Mimeau, Chloé. “Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements.” 2015. Doctoral Dissertation, Grenoble Alpes. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2015GREAM018.
MLA Handbook (7th Edition):
Mimeau, Chloé. “Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements.” 2015. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Mimeau C. Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements. [Internet] [Doctoral dissertation]. Grenoble Alpes; 2015. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2015GREAM018.
Council of Science Editors:
Mimeau C. Conception and implementation of a hybrid vortex penalization method for solid-fluid-porous media : application to the passive control of incompressible flows : Conception et mise en oeuvre de méthodes vortex hybrides-frontières immergées pour des milieux solides-fluides-poreux. Application au contrôle passif d'écoulements. [Doctoral Dissertation]. Grenoble Alpes; 2015. Available from: http://www.theses.fr/2015GREAM018
14.
Levinson, Matthew David.
Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms.
Degree: Statistics, 2013, UCLA
URL: http://www.escholarship.org/uc/item/3z80r612
► Penalization and sparse model selection have become topics of intense research interest in the era of big data, newly available through ubiquitous computing power, advancing…
(more)
▼ Penalization and sparse model selection have become topics of intense research interest in the era of big data, newly available through ubiquitous computing power, advancing data collection technologies, and internet connectivity. In genomics, chromatin immunoprecipitation, microarrays, and next generation sequencing have made available a wealth of information which continues to accumulate and which we have only begun to understand and fully utilize. We propose two penalized Bayesian tech- niques, one to select a sparse set of DNA binding factors (DBFs) from a large library with enriched binding to the genome in a set of regions of interest and to predict joint binding landscapes for the selected DBFs, and another to predict gene expression from joint binding landscapes.Cellular processes are controlled, directly or indirectly, by the binding of hundreds of different DBFs to the genome. One key to deeper understanding of the cell is discovering where, when, and how strongly these DBFs bind to the DNA sequence. Direct measurement of DBF binding sites (e.g. through ChIP-Chip or ChIP-Seq experiments) is expensive, noisy, and not available for every DBF in every cell type. Naive and most existing computational approaches to detecting which DBFs bind in a set of genomic regions of interest often perform poorly, due to the high false discovery rates and restrictive requirements for prior knowledge.We develop a penalized iterative sampling Bayesian method for identifying DBFs active in the considered regions and predicting a joint probabilistic binding land- scape. Utilizing a sparsity penalization, SparScape is able to select a small subset of DBFs with enriched binding sites in a set of DNA sequences from a much larger candidate set. This substantially reduces the false positives in prediction of binding sites. Analysis of ChIP-Seq data in mouse embryonic stem cells (ESCs) and simu- lated data show that SparScape dramatically outperforms the naive motif scanning method and the comparable computational approaches in terms of DBF identification and binding site prediction.We also propose an extension of Bayesian treed regression to predict gene expres- sion from joint binding landscapes. Rather than sampling from the space of possible partitioning trees, we follow a broad optimization approach, forking the growing partitioning tree at each possible split if multiple possible splits yield similar results in the given objective function. After growing the tree, we select variables at each leaf node of each forked partitioning tree, then take the union of these selected variables and the splitting variables at each internal node and re-grow the partitioning tree considering only the selected variables.
Subjects/Keywords: Statistics; Bioinformatics; Genetics; Bayesian; Computational Biology; Gene Regulation; Penalization; Sparsity
…Sparsity Through Penalization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
19
2.2.4 The Tuning… …three of
these cases, 20% penalization (λ = 0.2) pushed the concentration estimates… …positive DBFs are generally quite
stable under non-excessive penalization.
viii… …counteracting this by employing penalization as we do, they simply set each concentration to the K d… …sampled sites. The level of penalization is
controlled by a tuning parameter, chosen in the…
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Levinson, M. D. (2013). Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms. (Thesis). UCLA. Retrieved from http://www.escholarship.org/uc/item/3z80r612
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Levinson, Matthew David. “Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms.” 2013. Thesis, UCLA. Accessed January 22, 2020.
http://www.escholarship.org/uc/item/3z80r612.
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Levinson, Matthew David. “Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms.” 2013. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Levinson MD. Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms. [Internet] [Thesis]. UCLA; 2013. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.escholarship.org/uc/item/3z80r612.
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Levinson MD. Penalized Bayesian Model Selection and Prediction for Gene Regulation in Higher Organisms. [Thesis]. UCLA; 2013. Available from: http://www.escholarship.org/uc/item/3z80r612
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15.
Nouveau, Léo.
Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage.
Degree: Docteur es, Mathématiques appliquées et calcul scientifique, 2016, Bordeaux
URL: http://www.theses.fr/2016BORD0410
► La prédiction de mouvement de solide évoluant dans un fluide présente un réel intérêt pour des applications industrielles telle que l’accrétion de glace sur des…
(more)
▼ La prédiction de mouvement de solide évoluant dans un fluide présente un réel intérêt pour des applications industrielles telle que l’accrétion de glace sur des surfaces aérodynamiques. Dans ce contexte, en considérant des systèmes de dégivrage, la prévision des trajectoire de glace est nécessaire pour éviter des risques de collision/ingestion de glace sur/dans des zones sensibles de l’avion. Ce type d’application soulève de nombreux challenges d’un point de vue numérique, en particulier concernant la génération/l’adaptation de maillage au cours du mouvement du solide dans le domaine. Pour gérer ces difficultés, dans cette étude, les solides sont définis de manière implicite via une fonction level set. Une méthode de type frontière immergée, appelée Pénalization, est utilisée pour imposer les conditions de bords. Pour améliorer la précision de l’interface, les équations sont résolues sur des maillages non structurés adaptatifs. Cela permet d’obtenir un raffinement proche des bords du solide et ainsi d’améliorer sa définition, permettant un meilleure impositions des conditions de bord. Pour économiser du temps de calcul, et éviter de coûteuses étapes de remaillage/interpolation, la stratégie adoptée pour les simulations instationnaires est d’utiliser une adaptation de maillage à connectivité constante, aussi appelée r-adaptation.
The prediction of solid motion evolving in a fluid presents a real interest for engineering application such as ice accretion on aerodynamics bodies.In this context, considering de-icing systems, the ice shedding trajectory is needed to prevent the risk of collision/ingestion of the ice in/with some sensitive part of the aircraft. This application raises many challenges from a numerical point of view, especially concerning mesh generation/adaptation as the solid moves in the computational domain. To handle this issue, in this work the solids are known implicitly on the mesh via a level set function. An immersed boundary method, called penalization, is employed to impose the wall boundary conditions. To improve the resolution of these boundaries, the equations are solved on adaptive unstructured grids. This allows to have are finement close to the solid boundary and thus increases the solid definition,leading to a more accurate imposition of the wall conditions. To save computational time, and avoid costly remeshing/interpolation steps, the strategy chosen for unsteady simulations is to use a constant connectivity mesh adaptation,also known as r-adaptation
Advisors/Committee Members: Ricchiuto, Mario (thesis director), Beaugendre, Héloïse (thesis director), Dobrzynski, Cécile (thesis director).
Subjects/Keywords: Pénalization; Objets mobiles; Interaction fluide structure; Schémas aux résidus distribués; Adaptation de maillage; Penalization; Moving bodies; Fluid structure interaction; Residual distribution schemes; Mesh adaptation
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Nouveau, L. (2016). Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage. (Doctoral Dissertation). Bordeaux. Retrieved from http://www.theses.fr/2016BORD0410
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Nouveau, Léo. “Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage.” 2016. Doctoral Dissertation, Bordeaux. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2016BORD0410.
MLA Handbook (7th Edition):
Nouveau, Léo. “Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage.” 2016. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Nouveau L. Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage. [Internet] [Doctoral dissertation]. Bordeaux; 2016. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2016BORD0410.
Council of Science Editors:
Nouveau L. Adaptive residual based schemes for solving the penalized Navier Stokes equations with moving bodies : application to ice shedding trajectories : Schémas aux résidus distribués adaptatifs pour résoudre les équations de Navier Stokes pénalisées avec objets mobiles : applications aux trajectoires de glace dans le cadre du givrage. [Doctoral Dissertation]. Bordeaux; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016BORD0410
16.
Bufferand, Hugo.
Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord.
Degree: Docteur es, Mécanique des fluides, 2012, Aix Marseille Université
URL: http://www.theses.fr/2012AIXM4325
► Pour concevoir les futurs réacteurs à fusion nucléaire, une bonne compréhension des mécanismes régissant l'intéraction plasma-paroi est requise. En particulier, il est nécessaire d'estimer quantitativement…
(more)
▼ Pour concevoir les futurs réacteurs à fusion nucléaire, une bonne compréhension des mécanismes régissant l'intéraction plasma-paroi est requise. En particulier, il est nécessaire d'estimer quantitativement les flux de chaleurs impactant les matériaux et la contamination du coeur par les impuretés provenant du mur. Dans ce contexte, le code fluide SolEdge2D a été développé pour simuler le transport dans le plasma de bord. L'interaction plasma-paroi est prise en compte grâce à une méthode de pénalisation innovante et originale. Cette méthode permet en particulier de modéliser la géométrie complexe des éléments face au plasma avec une grande flexibilité. En parallèle, une étude plus théorique sur les propriétés du transport dans les milieux faiblement collisionels a été conduite avec les physiciens du groupe CSDC de l'université de Florence. Une généralisation de la loi de Fourier prenant en compte les corrélation spatio-temporelle à longue distance à été obtenue par l'analyse de modèles stochastiques 1D. Cette loi retrouve en particulier la transition entre un régime diffusif à forte collisionalté et un régime balistique à faible collisionalité.
In the scope of designing future nuclear fusion reactors, a clear understanding of the plasma-wall interaction is mandatory. Indeed, a predictive estimation of heat flux impacting the surface and the subsequent emission of impurities from the wall is necessary to ensure material integrity and energy confinement performances. In that perspective, the fluid code SolEdge2D has been developed to simulate plasma transport in the tokamak edge plasma. The plasma-wall interaction is modeled using an innovative penalization technique. This method enables in particular to take complex plasma facing components geometry into account. In parallel to this numerical effort, a theoretical work has been achieved to find appropriate corrections to fluid closures when collisionality drops. The study of stochastic 1D models has been realized in collaboration with physicists from the CSDC group in Florence. A generalized Fourier law taking long range spatio-temporal correlations has been found to properly account for ballistic transport in the low collisional regime. This formulation is expected to be used to model parallel heat flux or turbulent cross-field transport in tokamak plasmas.
Advisors/Committee Members: Serre, Eric (thesis director), Ciraolo, Guido (thesis director).
Subjects/Keywords: Physique des plasmas; Méthode de pénalisation; Transport non local; Modèles stochastiques; Modélisation fluide; Plasma physics; Penalization technique; Non-local transport; Stochastic models; Fluid models
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Bufferand, H. (2012). Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2012AIXM4325
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Bufferand, Hugo. “Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord.” 2012. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2012AIXM4325.
MLA Handbook (7th Edition):
Bufferand, Hugo. “Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord.” 2012. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Bufferand H. Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2012. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM4325.
Council of Science Editors:
Bufferand H. Development of a fluid code for tokamak edge plasma simulation. Investigation on non-local transport : Non-localités dans le transport et implémentation dans les codes fluides de simulation du plasma de bord. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM4325
Université Paris-Sud – Paris XI
17.
Montuelle, Lucie.
Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures.
Degree: Docteur es, Mathématiques, 2014, Université Paris-Sud – Paris XI
URL: http://www.theses.fr/2014PA112364
► Ce manuscrit se concentre sur deux problèmes d'estimation de fonction. Pour chacun, une garantie non asymptotique des performances de l'estimateur proposé est fournie par une…
(more)
▼ Ce manuscrit se concentre sur deux problèmes d'estimation de fonction. Pour chacun, une garantie non asymptotique des performances de l'estimateur proposé est fournie par une inégalité d'oracle. Pour l'estimation de densité conditionnelle, des mélanges de régressions gaussiennes à poids exponentiels dépendant de la covariable sont utilisés. Le principe de sélection de modèle par maximum de vraisemblance pénalisé est appliqué et une condition sur la pénalité est établie. Celle-ci est satisfaite pour une pénalité proportionnelle à la dimension du modèle. Cette procédure s'accompagne d'un algorithme mêlant EM et algorithme de Newton, éprouvé sur données synthétiques et réelles. Dans le cadre de la régression à bruit sous-gaussien, l'agrégation à poids exponentiels d'estimateurs linéaires permet d'obtenir une inégalité d'oracle en déviation, au moyen de techniques PAC-bayésiennes. Le principal avantage de l'estimateur proposé est d'être aisément calculable. De plus, la prise en compte de la norme infinie de la fonction de régression permet d'établir un continuum entre inégalité exacte et inexacte.
This manuscript focuses on two functional estimation problems. A non asymptotic guarantee of the proposed estimator’s performances is provided for each problem through an oracle inequality.In the conditional density estimation setting, mixtures of Gaussian regressions with exponential weights depending on the covariate are used. Model selection principle through penalized maximum likelihood estimation is applied and a condition on the penalty is derived. If the chosen penalty is proportional to the model dimension, then the condition is satisfied. This procedure is accompanied by an algorithm mixing EM and Newton algorithm, tested on synthetic and real data sets. In the regression with sub-Gaussian noise framework, aggregating linear estimators using exponential weights allows to obtain an oracle inequality in deviation,thanks to pac-bayesian technics. The main advantage of the proposed estimator is to be easily calculable. Furthermore, taking the infinity norm of the regression function into account allows to establish a continuum between sharp and weak oracle inequalities.
Advisors/Committee Members: Le Pennec, Erwan (thesis director).
Subjects/Keywords: Inégalité d'oracle; Sélection de modèle; Pénalisation; Poids exponentiels; Apprentissage; Agrégation; Modèles de mélange; Maximum de vraisemblance; Oracle inequality; Model selection; Penalization; Exponential weight; Learning; Aggregation; Mixture model; Maximum likelihood
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Montuelle, L. (2014). Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures. (Doctoral Dissertation). Université Paris-Sud – Paris XI. Retrieved from http://www.theses.fr/2014PA112364
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Montuelle, Lucie. “Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures.” 2014. Doctoral Dissertation, Université Paris-Sud – Paris XI. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2014PA112364.
MLA Handbook (7th Edition):
Montuelle, Lucie. “Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures.” 2014. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Montuelle L. Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Paris-Sud – Paris XI; 2014. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2014PA112364.
Council of Science Editors:
Montuelle L. Inégalités d'oracle et mélanges : Oracle inequalities and mixtures. [Doctoral Dissertation]. Université Paris-Sud – Paris XI; 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014PA112364
18.
Cappanera, Loïc.
Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows.
Degree: Docteur es, Mécanique des fluides, 2015, Paris Saclay
URL: http://www.theses.fr/2015SACLS149
► Les travaux présentés dans ce manuscrit se concentrent sur l'approximation numérique des équations de la magnétohydrodynamique (MHD) et sur leur stabilisation pour des problèmes caractérisés…
(more)
▼ Les travaux présentés dans ce manuscrit se concentrent sur l'approximation numérique des équations de la magnétohydrodynamique (MHD) et sur leur stabilisation pour des problèmes caractérisés par des nombres de Reynolds cinétique élevés ou par des écoulements multiphasiques. Nous validons numériquement un nouveau modèle de Simulation des Grandes Echelles (ou Large Eddy Simulations, LES), dit de viscosité entropique, sur des écoulements de cylindre en précession ou créés par des turbines contra-rotatives (écoulement de Von Kármán). Ces études sont réalisées avec le code MHD SFEMaNS développé par J.-L. Guermond et C. Nore depuis 2002 pour des géométries axisymétriques. Ce code est basé sur une décomposition spectrale dans la direction azimutale et des éléments finis de Lagrange dans un plan méridien. Nous adaptons une méthode de pseudo-pénalisation pour prendre en compte des turbines en mouvement, ce qui étend le code SFEMaNS à des géométries quelconques. Nous présentons aussi une méthode originale d'approximation des équations de Navier-Stokes à densité variable qui utilise la quantité de mouvement comme variable et la viscosité entropique pour stabiliser les équations de la masse et du mouvement.
The investigations presented in this manuscript focus on the numerical approximation of the magnetohydrodynamics (MHD) equations and on their stabilization for problems involving either large kinetic Reynolds numbers or multiphase flows. We validate numerically a new Large Eddy Simulation (LES) model, called entropy viscosity, on flows driven by precessing cylindrical containers or counter-rotating impellers (Von Kármán flow). These studies are performed with SFEMaNS MHD-code developed by J.-L. Guermond and C. Nore since 2002 for axisymmetric geometries. This code is based on a spectral decomposition in the azimuthal direction and a Lagrange finite element approximation in a meridian plane. We adapt a pseudo-penalization method to report the action of rotating impellers that extends the range of SFEMaNS's applications to any geometry. We also present an original approximation method of the Navier-Stokes equations with variable density. This method uses the momentum as variable and stabilizes both mass and momentum equations with the same entropy viscosity.
Advisors/Committee Members: Nore, Caroline (thesis director).
Subjects/Keywords: Écoulements multiphasiques; Viscosité entropique; Méthode de pseudo-Penalisation; Méthode level set; Magnétohydrodynamique; Mutliphase flow; Entropy viscosity; Pseudo-Penalization method; Level set method; Magnetohydrodynamics
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Cappanera, L. (2015). Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows. (Doctoral Dissertation). Paris Saclay. Retrieved from http://www.theses.fr/2015SACLS149
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Cappanera, Loïc. “Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows.” 2015. Doctoral Dissertation, Paris Saclay. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2015SACLS149.
MLA Handbook (7th Edition):
Cappanera, Loïc. “Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows.” 2015. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Cappanera L. Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows. [Internet] [Doctoral dissertation]. Paris Saclay; 2015. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2015SACLS149.
Council of Science Editors:
Cappanera L. Stabilisation non linéaire des équations de la magnétohydrodynamique et applications aux écoulements multiphasiques : Nonlinear stabilization of magnetohydrodynamic equations and applications to multiphase flows. [Doctoral Dissertation]. Paris Saclay; 2015. Available from: http://www.theses.fr/2015SACLS149
University of Guelph
19.
Valiyaparampil, Merin.
Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
.
Degree: 2017, University of Guelph
URL: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/11441
► The year 2015 was characterized by large-scale movements of im/migrants, asylum seekers, and refugees who attempted to escape civil and political unrest and violence. Described…
(more)
▼ The year 2015 was characterized by large-scale movements of im/migrants, asylum seekers, and refugees who attempted to escape civil and political unrest and violence. Described as the “immigration crises” this movement of people generated international attention and caused concerns regarding border control, terrorism, national security, and humanitarianism. Whereas some countries constructed barricades and erected fences to keep out migrants, other countries altered their policies in order to resettle them. At the same time, nation-states are grappling with their own immigration law and its administration as more and more im/migrants cross borders “legally” or “illegally”. Situated within this context, my thesis research observes the process by which nation-states create and enforce immigration laws that restrict, exclude, and remove im/migrants who are considered to be “undesirable” or “harmful” to a country’s social and cultural mosaic. Through my analysis of immigration hearings, in-depth interviews, and archival research, I argue that im/migrant illegalization is a sociopolitical and juridical process that implicates various institutions and actors who are tasked with administering immigration law. By exploring the ways in which ideas like “deservingness”, “(im) morality”, “credibility”, and “rationality” operate in immigration hearings, I emphasize that illegalization is not simply about removal. It is about the legal and administrative interactions and processes that dehumanize and demean im/migrants who are constructed to be “illegal” in Canada.
Advisors/Committee Members: Leach, Belinda (advisor), Sylvain, Renee (advisor).
Subjects/Keywords: Immigration;
Immigration Hearings;
Illegalization;
Detention Reviews;
Deportation;
Admissibility Hearings;
Immigration and Refugee Board;
Adjudication;
Legal Anthropology;
Immigration and Refugee Protection Act;
Penalization;
Deservingness
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Valiyaparampil, M. (2017). Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
. (Thesis). University of Guelph. Retrieved from https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/11441
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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Valiyaparampil, Merin. “Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
.” 2017. Thesis, University of Guelph. Accessed January 22, 2020.
https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/11441.
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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
MLA Handbook (7th Edition):
Valiyaparampil, Merin. “Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
.” 2017. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Valiyaparampil M. Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
. [Internet] [Thesis]. University of Guelph; 2017. [cited 2020 Jan 22].
Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/11441.
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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Council of Science Editors:
Valiyaparampil M. Immigration is about Deportation: An Exploration of Immigration Hearings and the Penalization of Im/migrants in Canada
. [Thesis]. University of Guelph; 2017. Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/11441
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Brno University of Technology
20.
Středulová, Monika.
Optimalizace trasy předpínacích kabelů
.
Degree: 2018, Brno University of Technology
URL: http://hdl.handle.net/11012/84829
► Bakalářská práce se zabývá možnostmi využití genetických algoritmů pro optimalizaci trasy předpínacích kabelů. Cílem práce je vyvinout genetický algoritmus na základě metody automatické dynamické penalizace…
(more)
▼ Bakalářská práce se zabývá možnostmi využití genetických algoritmů pro optimalizaci trasy předpínacích kabelů. Cílem práce je vyvinout genetický algoritmus na základě metody automatické dynamické penalizace a ověřit jeho robustnost na vybraných analytických funkcích. Následně je tento algoritmus napojen na TDA modul pro výpočet předpětí a použit pro řešení optimalizační úlohy s omezením. Veškeré úlohy jsou řešeny v programovacím jazyce Python s využitím knihovny Distributed Evolutionary Algorithms.; The thesis explores possibilities of applying genetic algorithms on the problem of finding the optimal prestressed concrete tendon path. The objective of the thesis is to develop a genetic algorithm based on the Automatic Dynamic
Penalization method and to test its robustness on selected analytical functions. Subsequently, the algorithm is connected to a Time Dependent Analysis module for the computation of prestressed concrete structure to solve selected examples of prestressed beams in the form of a constrained optimization problem. The algorithm is developed in the Python programming language with the help of the Distributed Evolutionary Algorithm library.
Advisors/Committee Members: Eliáš, Jan (advisor).
Subjects/Keywords: optimalizace;
omezení;
genetické algoritmy;
automatická dynamické penalizace;
předpjatý beton;
trasa předpínacích kabelů;
optimization;
constraints;
genetic algorithms;
automatic dynamic penalization;
prestressed concrete;
tendon path
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Středulová, M. (2018). Optimalizace trasy předpínacích kabelů
. (Thesis). Brno University of Technology. Retrieved from http://hdl.handle.net/11012/84829
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Chicago Manual of Style (16th Edition):
Středulová, Monika. “Optimalizace trasy předpínacích kabelů
.” 2018. Thesis, Brno University of Technology. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/11012/84829.
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MLA Handbook (7th Edition):
Středulová, Monika. “Optimalizace trasy předpínacích kabelů
.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Středulová M. Optimalizace trasy předpínacích kabelů
. [Internet] [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/11012/84829.
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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Council of Science Editors:
Středulová M. Optimalizace trasy předpínacích kabelů
. [Thesis]. Brno University of Technology; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/11012/84829
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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Université de Bordeaux I
21.
Pinilla Velandia, Johana Lizeth.
Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection.
Degree: Docteur es, Mathématiques appliquées et calcul scientifique, 2012, Université de Bordeaux I
URL: http://www.theses.fr/2012BOR14667
► Ce travail est motivé par la nécessité de mieux comprendre la technique de récupération du pétrole par injection de polymères à l'échelle du pore. On…
(more)
▼ Ce travail est motivé par la nécessité de mieux comprendre la technique de récupération du pétrole par injection de polymères à l'échelle du pore. On considère deux fluides immiscibles dans un réseau de microcanaux. A cette échelle, le diamètre des canaux est de l'ordre de quelques dizaines de micromètres tandis que la vitesse est de l'ordre du centimètre par seconde. Cela nous permet d'utiliser les équations de Stokes incompressible pour décrire l'écoulement des fluides. Le modèle Olroyd-B est utilisé pour décrire l'écoulement du fluide viscoélastique. Afin d'effectuer des simulations numériques dans une géométrie complexe comme un réseau de microcanaux, une méthode de pénalisation est utilisée. Pour suivre l'interface entre les deux fluides, la méthode Level-Set est employée. Le modèle pour la dynamique de la ligne triple est basé sur les la loi de Cox. Enfin, on présente des résultats de simulations numériques avec des paramètres physiques réalistes.
This work is motivated by the need for better understanding the polymer Enhanced Oil Recovery (EOR) technique at the pore-scale. We consider two phase immiscible fluids in a microchannel network. In microfluidics, the diameter of the channels is of the order of a few tens of micrometers and the flow velocity is of the order of one centimeter per second. The incompressible Stokes equations are used to describe the fluid flow. The Oldroyd-B rheological model is used to capture the viscoelastic behavior. In order to perform numerical simulations in a complex geometry like a microchannel network, a penalization method is implemented. To follow the interface between the two fluids, the Level-Set method is employed. The dynamic contact line model used in this work is based on the Cox law. Finally, we perform simulations with realistic parameters.
Advisors/Committee Members: Bruneau, Charles-Henri (thesis director).
Subjects/Keywords: Microfluidique; Écoulement diphasique; Ligne triple,; Modèle de Cox; Pénalisation; Level-set; Échelle du pore; Polymères; Oldroyd-B; Microfluidics; Two-phase flow; Triple contact line; Cox model; Penalization; Level-set; Pore scale; Polymer; Oldroyd-B
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Pinilla Velandia, J. L. (2012). Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection. (Doctoral Dissertation). Université de Bordeaux I. Retrieved from http://www.theses.fr/2012BOR14667
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Pinilla Velandia, Johana Lizeth. “Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection.” 2012. Doctoral Dissertation, Université de Bordeaux I. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2012BOR14667.
MLA Handbook (7th Edition):
Pinilla Velandia, Johana Lizeth. “Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection.” 2012. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Pinilla Velandia JL. Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Bordeaux I; 2012. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2012BOR14667.
Council of Science Editors:
Pinilla Velandia JL. Modélisation et simulation à l' échelle du pore de la récupération assistée des hydrocarbures par injection de polyméres : Pore-scale numerical simulation of Oil Recovery by polymer injection. [Doctoral Dissertation]. Université de Bordeaux I; 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012BOR14667
22.
Bensiali, Bouchra.
Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas.
Degree: Docteur es, Mécanique et physique des fluides, 2014, Aix Marseille Université
URL: http://www.theses.fr/2014AIXM4332
► Motivée par deux problématiques liées aux plasmas de tokamak, cette thèse propose deux méthodes d'approximation numérique pour deux problèmes mathématiques s'y rattachant. D'une part, pour…
(more)
▼ Motivée par deux problématiques liées aux plasmas de tokamak, cette thèse propose deux méthodes d'approximation numérique pour deux problèmes mathématiques s'y rattachant. D'une part, pour l'étude du transport turbulent de particules, une méthode numérique basée sur les schémas de subdivision est présentée pour la simulation de trajectoires de particules dans un champ de vitesse fortement variable. D'autre part, dans le cadre de la modélisation de l'interaction plasma-paroi, une méthode de pénalisation est proposée pour la prise en compte de conditions aux limites de type Neumann ou Robin. Analysées sur des problèmes modèles de complexité croissante, ces méthodes sont enfin appliquées dans des situations plus réalistes d'intérêt pratique dans l'étude du plasma de bord.
Motivated by two issues related to tokamak plasmas, this thesis proposes two numerical approximation methods for two mathematical problems associated with them. On the one hand, in order to study the turbulent transport of particles, a numerical method based on subdivision schemes is presented for the simulation of particle trajectories in a strongly varying velocity field. On the other hand, in the context of modeling the plasma-wall interaction, a penalization method is proposed to take into account Neumann or Robin boundary conditions. Analyzed on model problems of increasing complexity, these methods are finally applied in more realistic situations of practical interest in the study of the edge plasma.
Advisors/Committee Members: Chiavassa, Guillaume (thesis director), Liandrat, Jacques (thesis director).
Subjects/Keywords: Plasmas de fusion; Schémas de subdivision; Simulation de trajectoires; Méthodes de pénalisation; Conditions aux limites de Neumann/Robin; Fusion plasmas; Subdivision schemes; Simulation of trajectories; Penalization methods; Neumann/Robin boundary conditions
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Bensiali, B. (2014). Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2014AIXM4332
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Bensiali, Bouchra. “Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas.” 2014. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2014AIXM4332.
MLA Handbook (7th Edition):
Bensiali, Bouchra. “Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas.” 2014. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Bensiali B. Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2014. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2014AIXM4332.
Council of Science Editors:
Bensiali B. Approximations numériques en situations complexes : applications aux plasmas de tokamak : Numerical approximations in complex situations : applications to tokamak plasmas. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014AIXM4332
Université Montpellier II
23.
Noun, Nahla.
Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization.
Degree: Docteur es, Mathématiques et modélisation, 2013, Université Montpellier II
URL: http://www.theses.fr/2013MON20011
► Nous étudions la convergence de systèmes dynamiques vers des équilibres. En particulier, nous nous intéressons à deux types d'équilibres. D'une part, les solutions d'inéquations variationnelles…
(more)
▼ Nous étudions la convergence de systèmes dynamiques vers des équilibres. En particulier, nous nous intéressons à deux types d'équilibres. D'une part, les solutions d'inéquations variationnelles sous contraintes qui interviennent aussi dans la résolution de problèmes d'optimisation hiérarchique. D'autre part l'état stable d'un système dynamique, c'est à dire l'état où l'énergie du système est nulle. Cette thèse est divisée en deux parties principales, chacune focalisée sur la recherche d'un de ces équilibres. Dans la première partie nous étudions une classe d'algorithmes explicite-implicites pour résoudre certaines inéquations variationnelles sous contraintes. Nous introduisons un algorithme proximal-gradient pénalisé, "splitting forward-backward penalty scheme". Ensuite, nous prouvons sa convergence ergodique faible vers un équilibre dans le cas général d'un opérateur maximal monotone, et sa convergence forte vers l'unique équilibre si l'opérateur est de plus fortement monotone. Nous appliquons aussi notre algorithme pour résoudre des problèmes d'optimisation sous contrainte ou hiérarchique dont les fonctions objectif et de pénalisation sont formées d'une partie lisse et d'une autre non lisse. En effet, nous démontrons la convergence faible de l'algorithme vers un optimum hiérarchique lorsque l'opérateur est le sous-différentiel d'une fonction convexe semi-continue inférieurement et propre. Nous généralisons ainsi plusieurs algorithmes connus et nous retrouvons leurs résultats de convergence en affaiblissant les hypothèses utilisées dans nombre d'entre eux.Dans la deuxième partie, nous étudions l'action d'un contrôle interne local sur la stabilisation indirecte d'un système dynamique couplé formé de trois équations d'ondes, le système de Bresse. Sous la condition d'égalité des vitesses de propagation des ondes, nous montrons la stabilité exponentielle du système. En revanche, quand les vitesses sont différentes, nous prouvons sa stabilité polynomiale et nous établissons un nouveau taux de décroissance polynomial de l'énergie. Ceci étend des résultats présents dans la littérature au sens où le contrôle est localement distribué (et non pas appliqué à tout le domaine) et nous améliorons le taux de décroissance polynomial de l'énergie pour des conditions au bord de type Dirichlet et Dirichlet-Neumann.
We study the convergence of dynamical systems towards equilibria. In particular, we are interested in two types of equilibria. On one hand solutions of constrained variational inequations that are also involved in the resolution of hierarchical optimization problems. On the other hand the stable state of a dynamical system, i.e. the state when the energy of the system is zero. The thesis is divided into two parts, each focused on one of these equilibria. In the first part, we study a class of forward-backward algorithms for solving constrained variational inequalities. We consider a splitting forward-backward penalty scheme. We prove the weak ergodic convergence of the algorithm to an equilibrium for a general maximal…
Advisors/Committee Members: Czarnecki, Marc-Olivier (thesis director), Rifford, Ludovic (thesis director), Wehbe, Ali (thesis director).
Subjects/Keywords: Stabilité exponentielle et polynomiale; Pénalisation extérieure; Algorithme proximal-gradient; Optimisation hiérarchique; Feedbacks localement distibués; Inéquations variationnelles sous contraintes; Exponential and polynomial stability; Exterior penalization; Forward-backward algorithms; Hierarchical optimization; Locally distributed feedbacks; Constarined variational inequalities
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Noun, N. (2013). Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization. (Doctoral Dissertation). Université Montpellier II. Retrieved from http://www.theses.fr/2013MON20011
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Noun, Nahla. “Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization.” 2013. Doctoral Dissertation, Université Montpellier II. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2013MON20011.
MLA Handbook (7th Edition):
Noun, Nahla. “Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization.” 2013. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Noun N. Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Montpellier II; 2013. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2013MON20011.
Council of Science Editors:
Noun N. Convergence et stabilisation de systèmes dynamiques couplés et multi-échelles vers des équilibres sous contraintes : application à l’optimisation hiérarchique : Convergence and stabilization of coupled and multiscale dynamical systems towards constrained equilibria : application to hierarchical optimization. [Doctoral Dissertation]. Université Montpellier II; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013MON20011
24.
Butr-Indr, Bhumindr.
La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law.
Degree: Docteur es, Droit, 2012, Paris 2
URL: http://www.theses.fr/2012PA020031
► La contrefaçon est un phénomène de dimension internationale qui constitue aujourd’hui plus qu’hier un véritable fléau. Il apparaît que les principaux pays de provenance des…
(more)
▼ La contrefaçon est un phénomène de dimension internationale qui constitue aujourd’hui plus qu’hier un véritable fléau. Il apparaît que les principaux pays de provenance des contrefaçons saisies dans l’Union Européenne sont les pays d’Asie,notamment la Thaïlande. Cette recherche a pour but d'étudier les problèmes juridiques relatifs à la contrefaçon des droits de propriété intellectuelle. Ceci nous amène à poursuivre la recherche suivant deux axes. La première partie a pour but de mettre en évidence la comparaison de la définition de la contrefaçon en France et en Thaïlande. Elle se décompose en deux sous-parties, la première s'attachant à décrire la qualification de l’atteinte constitutive de contrefaçon selon les droits concernés (le terme « contrefaçon » en lui-même, tant en France qu’en Thaïlande, désignant différentes formes d’atteintes à un droit patrimonial de propriété intellectuelle). Pour identifier les atteintes constitutives de contrefaçon, notamment l’élément matériel, nous mettons l’accent sur 4 points: l’existence de la création, la diffusion de la création, l’usage de la création et la participation à l’action contrefaisante. S’agissant de l’élément intentionnel de contrefaçon, il semble présenter de multiples facettes. La seconde définit la preuve de la contrefaçon. On observe alors les moyens de preuve de la contrefaçon : la loi prévoit deux séries de mesures principales que nous pouvons regrouper en moyens de preuve en matière civile et pénale. Par ailleurs, il y a des moyens de preuve alternatifs entre les deux régimes. Ce sont des procédures douanières.La seconde partie a pour objet la prise en considération de la répression par les juridictions civiles et pénales. Elle se décompose donc en deux sous-parties : la première concerne les sanctions prononcées par les juridictions pénales. Nous avons déjà étudié la procédure pénale et les sanctions applicables à la contrefaçon. Il se trouve que la situation en Thaïlande est totalement différente de la situation française, notamment concernant la jurisprudence en matière pénale. Il semblerait que la majorité des décisions soient des sanctions prononcées par les juridictions pénales. La seconde sous-partie concerne quant à elle la réparation des atteintes à la propriété intellectuelle. Nous constatons que le préjudice subi, en France tout comme en Thaïlande constitue en un gain manqué . En outre l’évaluation du préjudice en France et en Thaïlande est difficile (préjudice subi en matière de marque, préjudice moral et fixation de l’indemnisation de peine privée).
Counterfeiting is an international problem. It appears that the main countries of origin of counterfeit goods seized in the European Union are the Asian countries, including Thailand. The research explains concisely the entire key factors to this whole problem. The research is divided into two parts; in the first place, I will outline pointly the definition of Intellectual Property Rights law (IPRs law) infringement between French and Thailand. Firstly, we focus on the structure of IPRs…
Advisors/Committee Members: Galloux, Jean-Christophe (thesis director).
Subjects/Keywords: Contrefaçon; Action en contrefaçon; Preuve de la contrefaçon; Sanctions applicables à la contrefaçon; Réparation des atteintes à la contrefaçon; France; Thaïlande; Intellectual property rights law infringement; Intellectual property rights liability; Proof of infringement; Penalization of IPRs law; Categories of damages; Criteria for proof of damages; France; Thailand
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Butr-Indr, B. (2012). La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law. (Doctoral Dissertation). Paris 2. Retrieved from http://www.theses.fr/2012PA020031
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Butr-Indr, Bhumindr. “La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law.” 2012. Doctoral Dissertation, Paris 2. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2012PA020031.
MLA Handbook (7th Edition):
Butr-Indr, Bhumindr. “La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law.” 2012. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Butr-Indr B. La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law. [Internet] [Doctoral dissertation]. Paris 2; 2012. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2012PA020031.
Council of Science Editors:
Butr-Indr B. La contrefaçon des droits de propriété intellectuelle : étude comparative en droits français et thaïlandais : Infringement of intellectual property rights : a comparative study in french law and thai law. [Doctoral Dissertation]. Paris 2; 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012PA020031
25.
Auphan, Thomas.
Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak.
Degree: Docteur es, Mathématiques, 2014, Aix Marseille Université
URL: http://www.theses.fr/2014AIXM4706
► Cette thèse concerne l'étude des interactions entre le plasma et la paroi d'un réacteur à fusion nucléaire de type tokamak. L'objectif est de proposer des…
(more)
▼ Cette thèse concerne l'étude des interactions entre le plasma et la paroi d'un réacteur à fusion nucléaire de type tokamak. L'objectif est de proposer des méthodes de résolution des systèmes d'équations issus de modèles de plasma de bord. Nous nous sommes intéressés au traitement de deux difficultés qui apparaissent lors de la résolution numérique de ces modèles. La première difficulté est liée à la forme complexe de la paroi du tokamak. Pour cela, il a été choisi d'utiliser des méthodes de pénalisation volumique. Des tests numériques de plusieurs méthodes de pénalisation ont été réalisés sur un problème hyperbolique non linéaire avec un domaine 1D. Une de ces méthodes a été étendue à un système hyperbolique quasilinéaire avec bord non caractéristique et conditions aux limites maximales strictement dissipatives sur un domaine multidimensionnel : il est alors démontré que cette méthode de pénalisation ne génère pas de couche limite. La deuxième difficulté provient de la forte anisotropie du plasma, entre la direction parallèle aux lignes de champ magnétique et la direction radiale. Pour le potentiel électrique, cela se traduit par une résistivité parallèle très faible. Afin d'éviter les difficultés liées au fait que le problème devient mal posé quand la résistivité parallèle tend vers 0, nous avons utilisé des méthodes de type asymptotic-preserving (AP). Pour les problèmes non linéaires modélisant le potentiel électrique avec un domaine 1D et 2D, nous avons fait l'analyse théorique ainsi que des tests numériques pour deux méthodes AP. Des tests numériques sur le cas 1D ont permis une étude préliminaire du couplage entre les méthodes de pénalisation volumique et AP.
This thesis deals with the study of wall plasma interactions in a nuclear fusion reactor such as a tokamak. The goal is to propose methods to solve partial differential equations issued from edge plasma models. We focus on two difficulties for the numerical resolution of these models. The first issue concerns the complex shape of the tokamak wall: we choose volume penalty methods. Numerical tests on several penalization methods have been performed on a nonlinear hyperbolic problem. One of these methods has been extended to a quasilinear hyperbolic system with a non characteristic boundary and maximally strictly dissipative boundary conditions on a multidimensional domain: it is proven that this penalty method does not generate any boundary layer. The second question comes from the strong plasma anisotropy between the direction parallel to the magnetic field lines and the radial one. Concerning the electrical potential, this results in a very low parallel resistivity. In order to avoid the troubles due to the ill-posedness of the equations when the parallel resistivity tends to 0, we study asymptotic preserving (AP) methods. For 1D and 2D nonlinear models of the electrical potential, we performed the theoretical analysis and numerical simulations for two AP methods. A preliminary study of the coupling between volume penalty and AP methods is also…
Advisors/Committee Members: Gues, Olivier (thesis director), Angot, Philippe (thesis director).
Subjects/Keywords: Equation aux dérivées partielles; Problème hyperbolique; Méthode de domaines fictifs; Pénalisation volumique; Méthode préservant l'asymptotique; Plasma; Tokamak; Tests numériques; Partial differential equatiion; Hyperbolic problem; Fictitious domain method; Volume penalization; Asymptotic preserving method; Plasma; Tokamak; Numerical tests
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Auphan, T. (2014). Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2014AIXM4706
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Auphan, Thomas. “Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak.” 2014. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2014AIXM4706.
MLA Handbook (7th Edition):
Auphan, Thomas. “Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak.” 2014. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Auphan T. Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2014. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2014AIXM4706.
Council of Science Editors:
Auphan T. Analyse de modèles pour ITER : traitement des conditions aux limites de systèmes modélisant le plasma de bord dans un tokamak : Analysis of models for ITER : treatment of boundary conditions for the edge plasma in a tokamak. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014AIXM4706
26.
Yan, Xiaohan.
Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
.
Degree: 2018, Cornell University
URL: http://hdl.handle.net/1813/59513
► In achieving structural patterns in parameters, we focus on two challenging cases in which (1) hierarchical sparsity pattern is desired such that one group of…
(more)
▼ In achieving structural patterns in parameters, we focus on two challenging cases in which (1) hierarchical sparsity pattern is desired such that one group of parameters is set to zero whenever another is set to zero; and (2) many features that are counts of rarely occurring events are present, and appropriate aggregation of the rare features may lead to better estimation. In either case, the methods under consideration use a tree or a directed acyclic graph (DAG) that encodes relations among parameters as side information. For achieving hierarchical sparsity patterns in parameters, we investigate the differences between group lasso (GL) and latent overlapping group lasso (LOG) in terms of their statistical properties and computational efficiency. We highlight a phenomenon of GL in which parameters embedded deep within the DAG are more aggressively regularized than those that are less deeply embedded. By contrast, we show that using LOG fulfills our goal without any additional complication and performs, both in practice and in theory, very similarly to the GL penalty that is modified to curb its over-aggressiveness. In terms of computation, we derive a finite-step algorithm for the proximal operator of LOG in the case of the DAG being a directed path graph; we later exploit this efficiency to propose a novel path-based block coordinate descent scheme. Finally, we compare the two frameworks in estimating banded covariance matrix, where we introduce a new sparsely-banded estimator using LOG, which we show achieves the statistical advantages of an existing GL-based method but is simpler to express and more efficient to compute. Another kind of sparsity we care about is sparsity in the data itself. It is prevalent to have many highly sparse features for counting frequency of rare events in diverse areas, ranging from natural language processing (e.g., rare words) to biology (e.g., rare species). We show, both theoretically and empirically, that not explicitly accounting for the rareness of features can greatly reduce the effectiveness of an analysis. We propose a tree-guided framework for aggregating rare features into denser ones through solving a convex optimization problem. The tree, which encodes feature similarity information on the leaves, comes from prior knowledge or data sources external to the current problem and is used as side information in aggregation. In our proposal, aggregating rare features is equivalent as enforcing equal coefficients within each group learned from solving the convex problem, resulting in another case of structural pattern in parameters. We apply our method on two data sets: a TripAdvisor hotel review data set, in which we predict the numerical rating of a hotel based on the text of an associated review; and a microbiome data set from the American Gut project that measures microbial species abundance from fecal samples, in which we predict the one's BMI based on both microbiome and non-microbiome features. In both applications, our method achieves high accuracy by making effective use…
Advisors/Committee Members: Wells, Martin Timothy (committeeMember), Joachims, Thorsten (committeeMember).
Subjects/Keywords: Convex optimization;
Statistics;
hierarchical sparse modeling;
l1 penalization;
rare feature;
statistical learning
…This “over-penalization” phenomenon has been observed previously (Jenatton et al., 2011a… …terms of the “over-penalization” phenomenon.
Proposition 1. Let β∗d = 1{d≤K ∗ } for…
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Yan, X. (2018). Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
. (Thesis). Cornell University. Retrieved from http://hdl.handle.net/1813/59513
Note: this citation may be lacking information needed for this citation format:
Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Yan, Xiaohan. “Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
.” 2018. Thesis, Cornell University. Accessed January 22, 2020.
http://hdl.handle.net/1813/59513.
Note: this citation may be lacking information needed for this citation format:
Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
MLA Handbook (7th Edition):
Yan, Xiaohan. “Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Yan X. Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
. [Internet] [Thesis]. Cornell University; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://hdl.handle.net/1813/59513.
Note: this citation may be lacking information needed for this citation format:
Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
Council of Science Editors:
Yan X. Statistical Learning for Structural Patterns with Trees
. [Thesis]. Cornell University; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/1813/59513
Note: this citation may be lacking information needed for this citation format:
Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation
27.
Yu, Liqun.
Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method.
Degree: PhD, Mathematics, 2018, Washington University in St. Louis
URL: https://openscholarship.wustl.edu/art_sci_etds/1604
► This dissertation develops novel methodologies for distributed quantile regression analysis for big data by utilizing a distributed optimization algorithm called the alternating direction method…
(more)
▼ This dissertation develops novel methodologies for distributed quantile regression analysis for big data by utilizing a distributed optimization algorithm called the alternating direction method of multipliers (ADMM). Specifically, we first write the penalized quantile regression into a specific form that can be solved by the ADMM and propose numerical algorithms for solving the ADMM subproblems. This results in the distributed QR-ADMM algorithm. Then, to further reduce the computational time, we formulate the penalized quantile regression into another equivalent ADMM form in which all the subproblems have exact closed-form solutions and hence avoid iterative numerical methods. This results in the single-loop QPADM algorithm that further improve on the computational efficiency of the QR-ADMM. Both QR-ADMM and QPADM enjoy flexible parallelization by enabling data splitting across both sample space and feature space, which make them especially appealing for the case when both sample size n and feature dimension p are large. Besides the QR-ADMM and QPADM algorithms for penalized quantile regression, we also develop a group variable selection method by approximating the Bayesian information criterion. Unlike existing
penalization methods for feature selection, our proposed gMIC algorithm is free of parameter tuning and hence enjoys greater computational efficiency. Although the current version of gMIC focuses on the generalized linear model, it can be naturally extended to the quantile regression for feature selection. We provide theoretical analysis for our proposed methods. Specifically, we conduct numerical convergence analysis for the QR-ADMM and QPADM algorithms, and provide asymptotical theories and oracle property of feature selection for the gMIC method. All our methods are evaluated with simulation studies and real data analysis.
Advisors/Committee Members: Nan Lin, Yixin Chen, Jimin Ding, Jose Figueroa-Lopez, Todd Kuffner.
Subjects/Keywords: admm, big data, divide-and-combine, group variable selection, penalization, quantile regression; Statistics and Probability
…approximating the Bayesian information
criterion. Unlike existing penalization methods for feature… …data, i.e., when p is large, penalization is often
required for shrinkage and feature… …case penalization becomes necessary to obtain reliable estimation.
Specifically, the… …the scalar
(1.3)
> 0 is a tunable penalization parameter.
Common choices of P… …criterion. Compared to
existing penalization methods for feature selection, the gMIC is free of…
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Yu, L. (2018). Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method. (Doctoral Dissertation). Washington University in St. Louis. Retrieved from https://openscholarship.wustl.edu/art_sci_etds/1604
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Yu, Liqun. “Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method.” 2018. Doctoral Dissertation, Washington University in St. Louis. Accessed January 22, 2020.
https://openscholarship.wustl.edu/art_sci_etds/1604.
MLA Handbook (7th Edition):
Yu, Liqun. “Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Yu L. Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method. [Internet] [Doctoral dissertation]. Washington University in St. Louis; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: https://openscholarship.wustl.edu/art_sci_etds/1604.
Council of Science Editors:
Yu L. Distributed Quantile Regression Analysis and a Group Variable Selection Method. [Doctoral Dissertation]. Washington University in St. Louis; 2018. Available from: https://openscholarship.wustl.edu/art_sci_etds/1604
INP Toulouse
28.
Morente, Antoine.
Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows.
Degree: Docteur es, Dynamique des fluides, 2017, INP Toulouse
URL: http://www.theses.fr/2017INPT0096
► Ce travail est dédié au développement d'une méthode numérique pour la simulation des écoulements liquide-bulles. La présence des bulles dans l'écoulement visqueux et incompressible est…
(more)
▼ Ce travail est dédié au développement d'une méthode numérique pour la simulation des écoulements liquide-bulles. La présence des bulles dans l'écoulement visqueux et incompressible est prise en compte via une méthode de pénalisation. Dans cette représentation Euler-Lagrange, les bulles supposées indéformables et parfaitement sphériques sont assimilées à des objets pénalisés interagissant avec le fluide. Une méthode VOF (Volume Of Fluid) est employée pour le suivi de la fonction de phase. Une adaptation de la discrétisation des équations de Navier-Stokes est proposée afin d'imposer la condition de glissement à l'interface entre le liquide et les bulles. Une méthode de couplage entre le mouvement des bulles et l'action du liquide est proposée. La stratégie de validation est la suivante. Dans un premier temps, une série de cas-tests est proposée; les objets pénalisés sont supposés en non-interaction avec le fluide. L'étude permet d'exhiber la convergence et la précision de la méthode numérique. Dans un second temps le couplage est testé via deux types de configurations de validation. Le couplage est d'abord testé en configuration de bulle isolée, pour une bulle en ascension dans un liquide au repos pour les Reynolds Re=17 and Re=71. Les résultats sont comparés avec la théorie établie par la corrélation de Mei pour les bulles sphériques propres décrivant intégralement la dynamique de la bulle. Enfin, des simulations en configurations de nuage de bulles sont présentées, pour des populations mono- et bidisperses dans un domaine entièrement périodique pour des taux de vide s'établissant entre 1% et 15%. Les statistiques fournies par les simulations caractérisant l'agitation induite par les bulles sont comparées à des résultats expérimentaux. Pour les simulations de nuages de bulles bidisperses, de nouveaux résultats sont présentés.
This work is devoted to the development of a numerical method for the simulation of two-phase liquid-bubble flows. We use a volume penalization method to take into account bubbles in viscous incompressible flows. The chosen Euler-Lagrange framework involves spherical and nondeformable bubbles represented as moving penalized obstacles interacting with the fluid. A VOF (Volume Of Fluid) method is used to track the phase function while a discretization of the penalized conservation equations is realized to impose slip conditions at the liquid-bubble interface. A coupling method devised from the penalized momentum equations is proposed. The validation process is set as following. First, the fluid is supposed non-acting on the bubbles; several test-cases are presented; we consider configurations with different penalized obstacles shapes (curved channel, inclined channel), the obstacles are either static or dynamic; in each configuration an analytical solution is known. The results show the compliance and the quality of our numerical closures by exposing the convergence order of the method. In order to verify the accuracy of the coupling method, numerical simulations of a 1mm diameter single bubble…
Advisors/Committee Members: Legendre, Dominique (thesis director), Lavieville, Jérôme (thesis director).
Subjects/Keywords: Mécanique des Fluides; Écoulements liquide-bulles; Méthode de pénalisation; Méthode de Frontières Immergées; Bulle isolée; Nuage de bulles; Fluid Mechanics; Bubbly flows; Penalization method; IBM Method; Single bubble; Swarm of bubbles
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Morente, A. (2017). Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows. (Doctoral Dissertation). INP Toulouse. Retrieved from http://www.theses.fr/2017INPT0096
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Morente, Antoine. “Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows.” 2017. Doctoral Dissertation, INP Toulouse. Accessed January 22, 2020.
http://www.theses.fr/2017INPT0096.
MLA Handbook (7th Edition):
Morente, Antoine. “Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows.” 2017. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Morente A. Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows. [Internet] [Doctoral dissertation]. INP Toulouse; 2017. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2017INPT0096.
Council of Science Editors:
Morente A. Développement d'une méthode de pénalisation pour la simulation d'écoulements liquide-bulles : A penalization method for the simulation of bubbly flows. [Doctoral Dissertation]. INP Toulouse; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017INPT0096
Virginia Commonwealth University
29.
Gentry, Amanda E.
Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families.
Degree: PhD, Biostatistics, 2018, Virginia Commonwealth University
URL: https://scholarscompass.vcu.edu/etd/5575
► The Brisbane Longitudinal Twin Study (BLTS) was being conducted in Australia and was funded by the US National Institute on Drug Abuse (NIDA). Adolescent…
(more)
▼ The Brisbane Longitudinal Twin Study (BLTS) was being conducted in Australia and was funded by the US National Institute on Drug Abuse (NIDA). Adolescent twins were sampled as a part of this study and surveyed about their substance use as part of the Pathways to Cannabis Use, Abuse and Dependence project. The methods developed in this dissertation were designed for the purpose of analyzing a subset of the Pathways data that includes demographics, cannabis use metrics, personality measures, and imputed genotypes (SNPs) for 493 complete twin pairs (986 subjects.) The primary goal was to determine what combination of SNPs and additional covariates may predict cannabis use, measured on an ordinal scale as: “never tried,” “used moderately,” or “used frequently”. To conduct this analysis, we extended the ordinal Generalized Monotone Incremental Forward Stagewise (GMIFS) method for mixed models. This extension includes allowance for a unpenalized set of covariates to be coerced into the model as well as flexibility for user-specified correlation patterns between twins in a family. The proposed methods are applicable to high-dimensional (genomic or otherwise) data with ordinal response and specific, known covariance structure within clusters.
Advisors/Committee Members: Kellie J. Archer, Ph.D., Nitai Mukhopadhyay, Ph.D., Nathan Gillespie, Ph.D., Michael Neale, Ph.D., Guimin Gao, Ph.D..
Subjects/Keywords: ordinal regression; penalization; mixed models; twin modeling; cannabis use; GWAS; Applied Statistics; Biostatistics; Categorical Data Analysis; Longitudinal Data Analysis and Time Series; Medical Genetics; Other Applied Mathematics; Other Public Health; Personality and Social Contexts; Psychiatric and Mental Health; Statistical Models; Substance Abuse and Addiction
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Gentry, A. E. (2018). Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families. (Doctoral Dissertation). Virginia Commonwealth University. Retrieved from https://scholarscompass.vcu.edu/etd/5575
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Gentry, Amanda E. “Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families.” 2018. Doctoral Dissertation, Virginia Commonwealth University. Accessed January 22, 2020.
https://scholarscompass.vcu.edu/etd/5575.
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Gentry, Amanda E. “Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families.” 2018. Web. 22 Jan 2020.
Vancouver:
Gentry AE. Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families. [Internet] [Doctoral dissertation]. Virginia Commonwealth University; 2018. [cited 2020 Jan 22].
Available from: https://scholarscompass.vcu.edu/etd/5575.
Council of Science Editors:
Gentry AE. Penalized mixed-effects ordinal response models for high-dimensional genomic data in twins and families. [Doctoral Dissertation]. Virginia Commonwealth University; 2018. Available from: https://scholarscompass.vcu.edu/etd/5575
30.
Morales Mena, Jorge.
Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques.
Degree: Docteur es, Mécanique des fluides, 2013, Ecully, Ecole centrale de Lyon
URL: http://www.theses.fr/2013ECDL0025
► La description magnétohydrodynamique est utilisée pour étudier les plasmas de fusion par confinement magnétique dans deux configurations: tokamak et reversed field pinch. Une méthode de…
(more)
▼ La description magnétohydrodynamique est utilisée pour étudier les plasmas de fusion par confinement magnétique dans deux configurations: tokamak et reversed field pinch. Une méthode de Fourier pseudo-spectrale et une technique de pénalisation en volume sont employées pour résoudre les équations. La méthode de pénalisation permet d’introduire des conditions aux limites de Dirichlet et donc de faire varier facilement la géométrie considérée. Les simulations dans des géométries toroïdales de type tokamak montrent l’apparition spontanée de vitesses. Une importante composante toroïdale se développe si le système est peu dissipatif. Il est aussi montré que la brisure de symétrie dans la forme de la section du tore fait apparaitre un moment angulaire toroïdal. Pour le Reversed Field Pinch on montre l’émergence de structures hélicoïdales. La forme de ces structures varie en fonction des coefficients de transport ainsi que du paramètre de pincement du champ magnétique imposé. Pour compléter l’étude on compare les résultats du tore aux calculs dans un cylindre périodique. Les différences dans la dynamique des deux cas sont mises en avant. Finalement les simulations sont confrontées à des expériences et un meilleur accord est observé entre simulation et expérience pour la géométrie toroïdale que pour la géométrie cylindrique.
A magnetohydrodynamic description is used to study magnetic fusion plasmas in two different configurations: tokamak and reversed field pinch. A Fourier pseudo-spectral method with a volume penalization technique are used to solve the system of equations. The penalization method is used to introduce Dirichlet boundary conditions and it al- lows to easily modify the consider geometry. The simulations of a tokamak configuration in a toroidal geometry show the spontaneous appearance of velocities. These velocities are dominated by their toroidal component if the system is little dissipative. It is also shown that the symmetry breaking of the cross section of the torus causes a toroidal angular momentum to develop. For the Reversed Field Pinch configuration we show the appearance of helical structures. The shape of these structures varies with the value of the transport coefficients and with the pinch ratio parameter of the imposed magnetic field. To complete the study, we compare the results of simulations obtained in toroidal and in periodic cylindrical geometries. The differences in the dynamics of these two cases are highlighted. Finally, simulations are compared to experimental data and a significant better agreement is observed between the simulation and the experiment for the toroidal geometry than for the cylindrical case.
Advisors/Committee Members: Bos, Wouter (thesis director).
Subjects/Keywords: Magnétohydrodynamique; Tokamak; Reversed field pinch; Méthode de pénalisation en volume; Méthode Fourier pseudo-spectrale; Moment angulaire; Influence de la toroïdicité; Magnetohydrodynamics; Tokamak; Reversed field pinch; Volume penalization method; Spectral method; Toroidal momentum; Quasi single helicity; Toroidicity effects
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Morales Mena, J. (2013). Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2013ECDL0025
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Morales Mena, Jorge. “Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques.” 2013. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed January 22, 2020.
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Morales Mena, Jorge. “Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques.” 2013. Web. 22 Jan 2020.
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Morales Mena J. Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2013. [cited 2020 Jan 22].
Available from: http://www.theses.fr/2013ECDL0025.
Council of Science Editors:
Morales Mena J. Confined magnetohydrodynamics applied to magnetic fusion plasmas : Magnétohydrodynamique confinée appliquée aux plasmas de fusion magnétiques. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013ECDL0025
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