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1. Carlón-Andrés, Irene. Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery.

Degree: Docteur es, Microbiologie Immunologie, 2017, Bordeaux

Les adénovirus (AdV), comme d'autres virus à réplication nucléaire, ont besoin d’arriver jusqu’aunoyau cellulaire afin de libérer leur génome. Pour ce faire, les particules des AdV contenant l’ADNviral sont transportées jusqu’au complexe du pore nucléaire (NPC), via le centre d’organisation desmicrotubules, par un mécanisme encore mal compris qui implique l’exportine cellulaire CRM1. Lacapside des AdV dépasse la taille limite d’entrée dans le noyau, et par conséquent, elle doit êtredésassemblée au niveau du NPC. Le mécanisme d’import de molécules d’ADN n’est pas un processusphysiologique. Pour cela, les AdV doivent détourner la machinerie cellulaire afin d’importer leurgénome dans le noyau. Le NPC est un complexe de protéines appelées nucléoporines. LaNup358/RanBP2, principal composant des filaments cytoplasmiques, sert de plateforme de liaison àdes karyopherines (e.g Importin-β, CRM1) et à la protéine GTPase Ran. Les karyopherinesreconnaissent des signaux spécifiques présents dans les cargos et facilitent leur transport d’unemanière très régulée dépendante de RanGTP. Nous avons constaté que l’import du génome AdV estmoins efficace en l’absence de Nup358. Dans ces conditions, nous avons observé que certaineskaryopherines deviennent limitantes pour l’import du génome viral, et identifié la région minimale deNup358 requise pour compenser ce défaut. D’autre part, nous avons confirmé l’implication de CRM1dans l’arrivé des particules virales au noyau et identifié un nouveau rôle de CRM1 dans ledésassemblage de la capside des AdV. Ces travaux contribuent à mieux connaître le mécanismed’entrée du génome AdV dans le noyau et donnent une idée de la façon dont les virus peuventcontourner la machinerie de transport cellulaire pour leur propre bénéfice.

Nuclear delivery of viral genomes is an essential step for nuclear replicating DNA viruses such asAdenovirus (AdV). AdV particles reach the nuclear pore complex (NPC) in the form of genomecontaining, partially disassembled capsids, through a poorly understood CRM1-dependent mechanism.These capsids exceed the NPC size limit and therefore, they must disassemble at the NPC to releasethe viral genome. Nuclear import of DNA cargos is not a physiological process. Consequently, AdVneed to divert the cellular transport machinery for nuclear genome delivery. The NPC is a multiproteincomplex consisting of nucleoporins (Nups). The Nup358/RanBP2 is the major component ofthe cytoplasmic filaments of the NPC and serves as binding platform for factors includingkaryopherins (i.e Importin-β, CRM1) and the small GTPase Ran. Selective transport of cargo throughthe NPC is mediated by karyopherins, which recognize specific signals within the cargos and facilitatetheir transport in a RanGTP-dependent regulated manner. We identified that Nup358-depleted cellsreduce nuclear import efficiency of the AdV genome. Indeed, we observed that karyopherins are ratelimitingfor AdV genome import under these conditions and we mapped the minimal region ofNup358 necessary to compensate the import defect. On the…

Advisors/Committee Members: Lafon, Marie-Edith (thesis director).

Subjects/Keywords: Adénovirus; Nup358; CRM1; Transport nucléo-cytoplasmique; Adenovirus; Nup358; CRM1; Nucleo-cytoplasmic transport

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APA (6th Edition):

Carlón-Andrés, I. (2017). Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery. (Doctoral Dissertation). Bordeaux. Retrieved from http://www.theses.fr/2017BORD0807

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Carlón-Andrés, Irene. “Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery.” 2017. Doctoral Dissertation, Bordeaux. Accessed August 06, 2020. http://www.theses.fr/2017BORD0807.

MLA Handbook (7th Edition):

Carlón-Andrés, Irene. “Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery.” 2017. Web. 06 Aug 2020.

Vancouver:

Carlón-Andrés I. Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery. [Internet] [Doctoral dissertation]. Bordeaux; 2017. [cited 2020 Aug 06]. Available from: http://www.theses.fr/2017BORD0807.

Council of Science Editors:

Carlón-Andrés I. Implication fonctionnelle de la nucléoporine Nup358/RanBP2 et des récepteurs de transport dans l’entrée du génome adénoviral : Functional implications of the nucleoporin Nup358/RanBP2 and transport receptors in adenoviral genome delivery. [Doctoral Dissertation]. Bordeaux; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017BORD0807

2. Rouland, Lila. Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers.

Degree: Docteur es, Pharmacologie moléculaire et cellulaire, 2019, Université Côte d'Azur (ComUE)

La parkine, est une protéine responsable de certaines formes autosomiques familiales récessives de la maladie de Parkinson. Elle est principalement considérée comme une ubiquitine ligase E3 mais la parkine se comporte également comme facteur de transcription (FT). En effet, elle réprime trancriptionnellement p53 et module différemment l’expression des presenilines puisqu’elle active PS1 et réprime PS2. A ce jour, trois cibles transcriptionnelles de la parkine p53, PS1 et PS2 ont été identifiées. Il est intéressant de noter que la parkine joue également un rôle dans le cancer en tant que suppresseur de tumeur. Elle est également fréquemment délétée ou inactivée dans un certain nombre de tumeurs malignes. De précédentes études ont montré que l’expression de la parkine était fortement réduite dans les gliomes. Il s’avère que cette baisse des niveaux de parkine était associée à la perte de fonction d’un autre facteur de transcription clef fréquemment muté dans les gliomes, p53. Ces études suggèrent que la parkine aurait un rôle majeur dans l’origine et/ou le développement des gliomes, mais l’implication de sa fonction transcriptionnelle dans ces processus n’est pas encore établie.Nous nous sommes intéressés aux mécanismes d’imports et exports de la parkine dans le transport nucléo-cytoplasmique. Cela nous a permis de déterminer l’existence de séquences NLS (signal d’import) et NES (signal d’export) sur la structure de la parkine. Ces séquences NLS et NES sont reconnues par les complexes importines et exportines, respectivement. De plus, nous avons muté au sein de ces séquences endogènes un ou plusieurs acides aminés rendant les séquences inactives et non reconnaissables pour le transport. Ainsi, nous avons généré des outils génétiques permettant de « forcer » la localisation de la parkine dans le cytosol ou dans le noyau. Ces travaux identifient les processus moléculaires régissant la navette de la parkine entre le noyau et le cytosol et confortent le rôle de facteur de transcription de la parkine. De plus, ces nouvelles constructions mutées permettent de déterminer avec précision la part des fonctions ubiquitine-ligase et FT de la parkine dans la régulation de ses cibles.Nous nous sommes également intéressés à l’implication de l’activité FT de la parkine dans l’étiologie des gliomes et notamment, sur un processus clés majoritairement dérégulé dans les cancers, la prolifération. Dans ce cadre, nous avons identifié deux nouvelles cibles transcriptionnelles de la parkine: les cyclines A et B contrôlant respectivement le déclenchement/progression en phase S et la transition G2/M du cycle cellulaire.Grâce aux mutants précédemment décrits, nous avons pu déterminer que la parkine régulait la cycline A uniquement via son activité FT et la cycline B via ses deux activités. Nous avons également utilisé un modèle in vivo (souris sauvages (PK+/+) ou invalidées (PK-/-) pour la parkine), dans lequel nous avons injecté des cellules de glioblastomes murins. En absence de parkine, la taille des tumeurs est significativement supérieure à… Advisors/Committee Members: Costa, Cristine Alves da (thesis director).

Subjects/Keywords: Glioblastome; Parkine; Facteur de transcription; Prolifération; Transport nucléo-cytoplasmique; Séquences NLS e NES; Glioblastoma; Parkin; Transcription; Proliferation; Nucleo-cytoplasmic transport; NLS and NES sequence

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APA (6th Edition):

Rouland, L. (2019). Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers. (Doctoral Dissertation). Université Côte d'Azur (ComUE). Retrieved from http://www.theses.fr/2019AZUR6002

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Rouland, Lila. “Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers.” 2019. Doctoral Dissertation, Université Côte d'Azur (ComUE). Accessed August 06, 2020. http://www.theses.fr/2019AZUR6002.

MLA Handbook (7th Edition):

Rouland, Lila. “Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers.” 2019. Web. 06 Aug 2020.

Vancouver:

Rouland L. Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Côte d'Azur (ComUE); 2019. [cited 2020 Aug 06]. Available from: http://www.theses.fr/2019AZUR6002.

Council of Science Editors:

Rouland L. Étude de la fonction transcriptionnelle de la parkine dans les cancers cérébraux : Study of the transcriptional function of parkin in brain cancers. [Doctoral Dissertation]. Université Côte d'Azur (ComUE); 2019. Available from: http://www.theses.fr/2019AZUR6002

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