subject:(Nested PCR)

University of Minnesota

1. Yang, Anna. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.

Degree: MS, Plant Pathology, 2015, University of Minnesota

► Early and accurate diagnosis of oak wilt, caused by Ceratocystis fagacearum, is important when disease control action is planned. When laboratory diagnosis is needed, standard… (more)

▼ Early and accurate diagnosis of oak wilt, caused by Ceratocystis fagacearum, is important when disease control action is planned. When laboratory diagnosis is needed, standard isolation protocols that are used rely on high quality samples and require up to 14 days for incubation. New methods, involving the use of polymerase chain reaction (PCR) have the potential to offer faster and more reliable plant disease diagnostics. The purpose of this thesis was to 1) compare the use of a nested PCR and real-time PCR protocol to detect C. fagacearum in sapwood drill shavings using published isolation methods and 2) develop standard sampling and processing guidelines for oak wilt diagnostics using the protocols, and 3) test and evaluate the use of the protocols in operational plant disease diagnostic clinics. All assays were performed on samples obtained from Quercus rubra/Q. ellipsoidalis (red oak), Q. macrocarpa (bur oak), and Q. alba (white oak) trees in Minnesota. Drill shavings were collected from actively wilting oak trees as well as from tissues taken the year following branch or whole tree death. Between the assays tested (nested PCR, real-time PCR, and isolation), the nested PCR assay resulted in the highest estimated probability of C. fagacearum detection for branch segments sampled from actively wilting oak trees. For bur and white oak branches that had been dead for >= 1 year, the pathogen was detected using nested PCR (55 and 87% of branch segments, respectively) and real-time PCR (19%, white oak only), while isolation was not able to detect the pathogen in any branch segments. All three detection methods were able to detect the fungus in main stem samples of red oaks with a streaking cambium, however, the molecular protocols resulted in more frequent pathogen detection. Only the molecular assays detected the pathogen in sapwood samples underlying the remnants of C. fagacearum sporulation mats on main stem samples of red oak trees. The fungus was not detected by either technique in branch segments obtained from healthy oaks (controls). Inter-laboratory testing of the nested PCR and real-time PCR protocols supported the previously described differences in assay reliability. Overall, the comparison of traditional isolation and nested PCR by the University of Minnesota Plant Disease Clinic resulted in the same number of trees testing positive for the pathogen by both detection methods. A comparison of isolation methods and real-time PCR was completed by the University of Wisconsin-Madison Plant Disease Diagnostic Clinic, which resulted in a higher rate of detection using isolation methods.

Subjects/Keywords: Nested PCR; Real-Time PCR

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APA (6^th Edition):

Yang, A. (2015). Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. (Masters Thesis). University of Minnesota. Retrieved from http://hdl.handle.net/11299/174737

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Yang, Anna. “Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.” 2015. Masters Thesis, University of Minnesota. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/11299/174737.

MLA Handbook (7^th Edition):

Yang, Anna. “Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology.” 2015. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Yang A. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. [Internet] [Masters thesis]. University of Minnesota; 2015. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/11299/174737.

Council of Science Editors:

Yang A. Detection of the Oak Wilt Pathogen in Sapwood of Northern Oak Species Using PCR Technology. [Masters Thesis]. University of Minnesota; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/11299/174737

2. Luciana de Lima Bezerra. Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião.

Degree: 2011, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro

URL: http://bdtd.ufrrj.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1535

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Este estudo teve por objetivo avaliar a influência da babesiose nas taxas de recuperação embrionária, gestação e perda embrionária precoce. O projeto foi realizado em… (more)

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Este estudo teve por objetivo avaliar a influência da babesiose nas taxas de recuperação embrionária, gestação e perda embrionária precoce. O projeto foi realizado em uma Central Comercial de Transferência de Embrião, situado no Município de Itaguaí, e em dois haras no município de Seropédica- RJ. Foram utilizadas 13 doadoras e 40 receptoras de embrião da raça Mangalarga Marchador, positivas para Theileria equi através do método de nested-PCR. Nas éguas doadoras foram realizados duas coletas de embriões em dois ciclo estrais consecutivos (GId), em sequência, esses mesmos animais foram tratados com dipropionato de imidocarb (1,2 mg/kg IM.) para realização de mais duas coletas de embriões em dois ciclos estrais (GIId). As receptoras de embrião foram divididas em dois grupos de 20 animais cada, onde um grupo foi o controle (GIr) e, o outro grupo, foi tratado (GIIr) com 1,2 mg/ Kg IM de dipropionato de imidocarb, com intuito de avaliar a taxa de gestação aos 15, 30, 45 e 60 dias. As éguas doadoras apresentaram eritrograma normal antes e após o tratamento com dipropionato de imidocarb, e em relação ao leucograma, apresentaram diminuição na contagem de leucócitos e neutrófilos totais e discreto aumento de linfócitos e monócitos somente após o tratamento. As receptoras apresentaram eritrograma e leucograma normal antes e após o tratamento com dipropionato de imidocarb. Após a realização de 52 coletas de embrião, a taxa de recuperação embrionária foi 53,84% (14/26) e 65,38% (17/26) (p>0,05) para GId e GIId respectivamente. A taxa de gestação foi de 70% (14/20) (p>0,05) aos 15, 30, 45 e 60 dias no grupo GIr e para o GIIr foi 85% (17/20) (p>0,05) aos 15 dias, 80% (16/20) (p>0,05) aos 30, 45 e 60 dias. O tratamento com dipropionato de imidocarb na forma como foi realizado não promoveu melhora significativa na eficiência reprodutiva em um programa de TE.

This study aimed to evaluate the influence of babesiosis in embryo recovery rates, early pregnancy and embryonic loss. The project was carried out in a Central Commercial Embryo Transfer, located in the city of Itaguai, and two farms in the county of Seropédica-RJ, using animals from the same breed (Mangalarga Marchador). The 13 donors and 40 recipients used in this experiment were positive for Theileria equi confirmed by nested-PCR method . Two embryo collections were performed in donor mares in two consecutive estrous cycles (GID), in sequence these same animals were treated with imidocarb dipropionate (1.2 mg / kg IM.) in order to conduct two more embryo collections in two estrous cycles (GIId). The embryo recipients were divided into two groups of 20 animals each, where one was the control group (IRG), and the other group was treated (GIIr) with 1.2 mg / kg IM imidocarb dipropionate, with the aim of evaluating pregnancy rate at 15, 30, 45 and 60 days. The embryo donors mares had normal erythrocyte before and after treatment with imidocarb dipropionate. ConcerningWBC, the embryo donors showed a decrease in the count of total leukocytes and neutrophils after treatment and a…

Advisors/Committee Members: Julio Cesar Ferraz Jacob.

Subjects/Keywords: babesiose; Nested-PCR; éguas; ZOOTECNIA; biotechnology; Babesiosis; nested PCR; mares; biotecnologia

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APA (6^th Edition):

Bezerra, L. d. L. (2011). Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião. (Thesis). Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Retrieved from http://bdtd.ufrrj.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1535

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Bezerra, Luciana de Lima. “Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião.” 2011. Thesis, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Accessed January 19, 2021. http://bdtd.ufrrj.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1535.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Bezerra, Luciana de Lima. “Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Bezerra LdL. Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://bdtd.ufrrj.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1535.

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Council of Science Editors:

Bezerra LdL. Eficiência reprodutiva em éguas assintomáticas portadoras de Theileria equi submetidas a um programa de transferência de embrião. [Thesis]. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro; 2011. Available from: http://bdtd.ufrrj.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1535

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3. Felippelli, Gustavo [UNESP]. Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas.

Degree: 2017, Universidade Estadual Paulista

URL: http://hdl.handle.net/11449/149738

► A toxoplasmose é uma zoonose cosmopolita, importante em medicina veterinária e humana por ocasionar abortos e doenças congênitas em diversas espécies. A viabilidade da transmissão… (more)

▼ A toxoplasmose é uma zoonose cosmopolita, importante em medicina veterinária e humana por ocasionar abortos e doenças congênitas em diversas espécies. A viabilidade da transmissão sexual do Toxoplasma gondii em vacas, sorologicamente negativas para a infecção por T. gondii, submetidas à inseminação artificial em tempo fixo (IATF) com sêmen criopreservado e contaminado com taquizoítos de T. gondii, por meio das técnicas (RIFI, bioprova e nested PCR). Inicialmente, utilizou-se a bioprova (em inoculação camundongos) objetivando avaliar a sobrevivência de taquizoítos de T. gondii em sêmen, criopreservado em DMSO (2,5%, 5,0%, 7,5%, 8,0% e 10,0%) e congelado em nitrogênio líquido (-196°C). Foram selecionadas 10 vacas em idade reprodutiva, soronegativas: Brucella abortus, Neospora caninum, Toxoplasma gondii. Os animais foram submetidos ao protocolo de inseminação artificial em tempo fixo (IATF) e tratados com dose única de estreptomicina (25mg/Kg) contra leptospirose. Das 10 vacas, cinco foram inseminadas com sêmen convencional (Glicerol 3%) e mantidas como grupo controle. As outras cinco foram inseminadas com sêmen criopreservado com DMSO (8%), contendo 1x106 taquizoítos de T. gondii. Nas datas experimentais 1, 3, 5, 7, 12, 14, 21, 28, 35, 42, 50, 56, 63, 70, 77 e 100 dias pós-inoculação (IATF), exames clínicos, hematológicos e sorológicos e moleculares (nested PCR) foram realizados. A soroconversão ocorreu em quatro fêmeas bovinas, pertencentes ao grupo que receberam sêmen infectado com taquizoítos de T. gondii (Amostra RH). Decorridos 21 dias pós-inseminação artificial foi possível diagnosticar em uma vaca (nº 1008), deste mesmo grupo, recíproca crescente de títulos sorológicos variando de 64 até 256 (28º, 35º, 42º DPIA). A partir do 49º até o 100º DPIA, os títulos foram decrescendo de 128 a 64, caracterizando um processo de cronificação (títulos IgG anti-T. gondii ≥64). Outras três fêmeas bovinas (nº 1108, nº 2018 e nº 3462) apresentaram títulos sorológicos (64) a partir do 56º até 100º DPIA, Apenas uma fêmea do grupo infectado não apresentou soroconversão durante todo estudo. Nenhum animal pertencente ao grupo controle apresentou anticorpos (IgG) contra T. gondii ao longo de todo experimento. No 100º DPIA, sete vacas que não estavam gestantes pelo exame ultrassonográfico, de ambos os grupos foram eutanasiadas e necropsiadas. Foram colhidos tecidos (cérebro, retina, pulmão, fígado, baço, linfonodos mesentéricos, musculatura – Longissimus dorsi, ovário e útero). Foi possível diagnosticar a presença do parasito por meio do bioensaio e nested PCR. O parasitismo tissular por T. gondii (bioensaio e nested PCR) foi diagnosticado em retina, musculatura, cérebro e fígado pertencentes às vacas nº 1008, nº 2018, nº 0813, nº 1108 e nº 3462. Em síntese, estes resultados sugerem a viabilidade da transmissão, via IATF Toxoplasma gondii em bovinos. Advisors/Committee Members: Costa, Alvimar José da [UNESP], Universidade Estadual Paulista (UNESP).

Subjects/Keywords: Criopreservação; Amostra RH; Toxoplasmose; Nested PCR

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APA (6^th Edition):

Felippelli, G. [. (2017). Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas. (Thesis). Universidade Estadual Paulista. Retrieved from http://hdl.handle.net/11449/149738

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Felippelli, Gustavo [UNESP]. “Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas.” 2017. Thesis, Universidade Estadual Paulista. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/11449/149738.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Felippelli, Gustavo [UNESP]. “Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas.” 2017. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Felippelli G[. Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas. [Internet] [Thesis]. Universidade Estadual Paulista; 2017. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/11449/149738.

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Council of Science Editors:

Felippelli G[. Viabilidade da transmissão sexual de Toxoplasma gondii (Nicolle & Manceaux, 1909) pela biotécnica da inseminação artificial em fêmeas bovinas (Bos taurus taurus x Bos taurus indicus) soronegativas. [Thesis]. Universidade Estadual Paulista; 2017. Available from: http://hdl.handle.net/11449/149738

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Technical University of Lisbon

4. Cardoso, Margarida do Nascimento. Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4114

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Mestrado em Engenharia Agronómica - Instituto Superior de Agronomia

Black foot of grapevine is an important disease caused primarily by fungi of the genus Ilyonectria.… (more)

Subjects/Keywords: black foot; Ilyonectria spp; Cylindrocarpon spp; nested-PCR; multiplex nested-PCR; microbiological isolation

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APA (6^th Edition):

Cardoso, M. d. N. (2011). Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4114

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Cardoso, Margarida do Nascimento. “Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 19, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4114.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Cardoso, Margarida do Nascimento. “Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Cardoso MdN. Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4114.

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Council of Science Editors:

Cardoso MdN. Detecção de fungos do género Ilyonectria em viveiro vitícola. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4114

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5. Hasegawa, Marjorie Yumi. Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta.

Degree: PhD, Clínica Veterinária, 2014, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-07012015-081945/ ;

► Artrite Encefalite Caprina é uma enfermidade infecciosa, multissistêmica, causada pelo vírus da Artrite Encefalite Caprina, que pertence dentre os Lentivírus de Pequenos Ruminantes. Sobre o… (more)

▼ Artrite Encefalite Caprina é uma enfermidade infecciosa, multissistêmica, causada pelo vírus da Artrite Encefalite Caprina, que pertence dentre os Lentivírus de Pequenos Ruminantes. Sobre o aspecto reprodutivo na transmissão, o objetivo do presente estudo consiste em avaliar experimentalmente a transmissibilidade do lentivírus caprino em cabras e suas crias pela placenta e sêmen. Para avaliar a influência da transmissão via placentária, foram utilizadas cinco fêmeas com CAEV inseminadas artificialmente com sêmen de bode livre de CAEV. Para avaliar a influência da transmissão pelo sêmen, foram utilizadas seis fêmeas livres de CAEV inseminadas artificialmente com sêmen de bode livre de CAEV. O CAEV-Cork foi adicionado ao sêmen fresco com a finalidade de se obter título infectante com carga viral em 105 TCID50/mL. Como grupo controle, duas cabras livres de CAEV foram inseminadas artificialmente com sêmen de mesmo bode sem o inóculo viral; e outras duas cabras com CAEV inseminadas com a carga viral. As fêmeas foram monitoradas durante a gestação até 15 dias pós-parto e as crias separadas das mães foram monitoradas até 12 meses de idade, empregando-se as técnicas de IDGA, cELISA e nested-PCR. As fêmeas com CAEV apresentaram resultados positivos em IDGA (87,10%), cELISA (88,71%) e nested-PCR (25,81%). As crias apresentaram resultados negativos em ambos os testes de IDGA e cELISA, embora na técnica de nested-PCR, 7,14% das amostras apresentaram banda positiva. Das seis fêmeas livres de CAEV, quatro (66,67%) apresentaram soroconversão com 18,46% das amostras positivas ao IDGA, 49,23% das amostras positivas ao cELISA e nenhuma para nested-PCR. Anticorpos anti-CAEV foram detectados 30 dias pós IA. Quanto às crias, 5,26% e 11,28% das amostras apresentaram resultado positivo para IDGA e nested-PCR, respectivamente. Nenhuma amostra apresentou positividade para cELISA. O grupo controle livre de CAEV tiveram resultados negativos para as três técnicas, incluindo suas crias; enquanto que as fêmeas com CAEV inseminadas com o inóculo viral apresentaram 61,90% das amostras positivas para IDGA, 100% para cELISA e nenhuma amostra para nested-PCR. Suas crias obtiveram no total somente um resultado positivo para IDGA e outro para nested- PCR. A positividade encontrada em nested-PCR nas crias pode ter um significado particular de identificar animais infectados porém soronegativos, como em situações de soroconversão tardia. Entretanto, não é possível assumir a transmissão do CAEV para crias de forma insofismável, embora não é descartada a possibilidade de infecção das crias pelo sêmen e placenta com soroconversão tardia. Contudo é possível a transmissão do CAEV por IA com sêmen infectado em fêmeas livres de CAEV. A carga viral utilizada no estudo foi capaz de infectar as fêmeas. Com relação aos testes utilizados, o cELISA detectou a soroconversão mais cedo que o IDGA. A técnica de nested-PCR falhou em detectar a infecção antes da soroconversão nas fêmeas. Este estudo proporcionou maiores informações sobre a transmissão do lentivírus caprino… Advisors/Committee Members: Gregory, Lilian.

Subjects/Keywords: AGID; Caprine lentivirus; cELISA; cELISA; IDGA; Lentivirus caprino; Nested-PCR; Nested-PCR; Transmissão; Transmission

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APA (6^th Edition):

Hasegawa, M. Y. (2014). Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-07012015-081945/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Hasegawa, Marjorie Yumi. “Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta.” 2014. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 19, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-07012015-081945/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Hasegawa, Marjorie Yumi. “Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta.” 2014. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Hasegawa MY. Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2014. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-07012015-081945/ ;.

Council of Science Editors:

Hasegawa MY. Estudo sobre a transmissibilidade do vírus da artrite encefalite caprina através do sêmen e da placenta. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2014. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-07012015-081945/ ;

Universidade Federal do Maranhão

6. LISANDRA ROCHA VIDOTTI. DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL.

Degree: 2012, Universidade Federal do Maranhão

URL: http://www.tedebc.ufma.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=721

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Introdução: A infecção pelo Vírus do Papiloma Humano (HPV) é uma das doenças sexualmente transmissíveis mais prevalentes no mundo, e pode ser encontrada em vários… (more)

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Introdução: A infecção pelo Vírus do Papiloma Humano (HPV) é uma das doenças sexualmente transmissíveis mais prevalentes no mundo, e pode ser encontrada em vários sítios anatômicos, como trato anogenital, pele, laringe, conjuntiva, mucosa traqueobrônquica, esôfago e cavidade oral. A via de transmissão do HPV para a cavidade oral ainda não está completamente compreendida, e por isso, diversas pesquisas, estão sendo realizadas objetivando esclarecer se a infecção genital por este vírus pode ser um fator predisponente. Metodologia: Trata-se de um estudo de coorte transversal: A amostra foi constituída por mulheres atendidas no Ambulatório de Ginecologia do Centro de Pesquisa Clínica do Hospital Universitário da UFMA (CEPEC/HUUFMA). Após assinarem o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE), todas as pacientes responderam um questionário sobre informações sociais, história médica, hábitos de tabagismo, consumo alcóolico e comportamento sexual e também foram submetidas a coleta de material celular da cavidade oral e da região genital para pesquisa do ácido desoxirribonucleico (DNA) do HPV pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Resultados e Conclusões: A prevalência do HPV na cavidade oral foi maior nas portadoras de HPV nos genitais, com associação significativa entre a presença do DNA-HPV oral com o DNA-HPV genital: A prática de sexo oral, o tabagismo e o etilismo não estiveram relacionados à presença do DNA-HPV na cavidade oral.

Background: Human Pappilomavirus infection is one of the most common sexually transmitted disease, and can be found at various anatomical sites, such as the anogenital tract, skin, larynx, conjunctiva, tracheobronchial mucosa, esophagus and oral cavity. The path of HPV transmission to the oral cavity is not completely understood, and so many studies are being undertaken aiming to clarify if the genital infection by the virus may be a predisposing factor. Methodology: This is a cross-sectional cohort study. The sample consisted of women attending in ambulatory of the Centro de Pesquisas Clínicas-CEPEC / HUUFMA. After signing the TCLE, all patients answered a questionnaire about social information, medical history, smoking habits, alcohol consumption and sexual behavior and were also subjected to collection of cellular material from the oral cavity and genital area for research of Desoxirribonucleic Acid by polymerase chain reaction technique (PCR). Results And Conclusions: The prevalence of human papillomavirus in the oral cavity was higher in women with genital HPV. With a significant association between the presence of oral HPV DNA and genital HPV DNA: The practice of oral sex, smoking and drinking were not related to the presence of HPV DNA in the oral cavity.

Advisors/Committee Members: FERNANDA FERREIRA LOPES.

Subjects/Keywords: HPV; Cavidade oral; Genital; PCR-nested; ODONTOLOGIA; HPV; Oral cavity; Genital; Nested PCR

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APA (6^th Edition):

VIDOTTI, L. R. (2012). DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL. (Thesis). Universidade Federal do Maranhão. Retrieved from http://www.tedebc.ufma.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=721

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

VIDOTTI, LISANDRA ROCHA. “DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL.” 2012. Thesis, Universidade Federal do Maranhão. Accessed January 19, 2021. http://www.tedebc.ufma.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=721.

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MLA Handbook (7^th Edition):

VIDOTTI, LISANDRA ROCHA. “DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL.” 2012. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

VIDOTTI LR. DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal do Maranhão; 2012. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.tedebc.ufma.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=721.

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Council of Science Editors:

VIDOTTI LR. DETECÇÃO DE DNA-HPV NA MUCOSA ORAL E SUA ASSOCIAÇÃO COM DNA-HPV GENITAL. [Thesis]. Universidade Federal do Maranhão; 2012. Available from: http://www.tedebc.ufma.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=721

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

7. Ferreira, Karin Correa Scheffer. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.

Degree: PhD, Epidemiologia Experimental Aplicada às Zoonoses, 2011, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

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Este estudo teve como objetivo detectar a presença do vírus da raiva em diferentes órgãos de morcegos do gênero Artibeus empregando as técnicas moleculares como… (more)

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Este estudo teve como objetivo detectar a presença do vírus da raiva em diferentes órgãos de morcegos do gênero Artibeus empregando as técnicas moleculares como RT-PCR, hnRT-PCR e Real Time RT-PCR. De aproximadamente 4000 espécimes de morcegos recebidas no Instituto Pasteur para o diagnóstico da raiva, foram selecionados 30 morcegos do gênero Artibeus, com resultados positivos para raiva pelas técnicas tradicionais de IFD e inoculação em células N2A utilizando suspensões feitas a partir do SNC. Para as técnicas moleculares, foram retirados glândulas salivares, bexigas urinárias, rins, pulmões e conteúdos fecais e ainda foram lavadas as calotas cranianas dos espécimes. Os órgãos e conteúdos fecais foram diluídos a 1:10 (P/V) e as bexigas urinárias a 1:20 (P/V). As suspensões foram inoculadas em células N2A para o isolamento viral. Foi realizada a extração do RNA total usando o TRIzol®, foram realizadas a transcrição reversa seguida da PCR e hnRT-PCR com utilização de primers específicos para o gene codificante da proteína N. A partir do produto da transcrição reversa foi realizada a técnica de Real Time RT-PCR, utilizando primers e sonda específicos para variante antigênica 3. Das 30 suspensões de lavado cerebral, 28 (93,33%) resultaram positivos, na inoculação em cultura de células, seguido de glândulas salivares (36,67%), bexigas (16,67%) e conteúdos fecais (3,33%). Os resultados encontrados da sensibilidade nas técnicas de RT-PCR, hnRT-PCR e Real Time RT-PCR foram 56,25%, 82,57% e 82,19% quando avaliadas as 180 amostras analisadas. A comparação das técnicas de hnRT-PCR e Real Time RT-PCR feita pelo teste exato de Fisher quanto a proporção de positivos detectados mostrou que para o lavado cerebral, órgãos e conteúdos fecais a proporção foi igual (P>0,05). Em relação à positividade os resultados encontrados nas técnicas de hnRT-PCR e Real Time RT-PCR foram 100% em lavado cerebral; 90% e 93,33% em glândulas salivares; 83,33% e 90% em bexigas; 80% e 93,33% em rins; 76,67% e 50% em pulmões e 43,33% em ambas as técnicas em conteúdos fecais. Esses resultados sugerem que tanto as técnicas de hnRT-PCR como Real Time RT-PCR podem ser utilizadas como métodos complementares para o diagnóstico da raiva e são sensíveis o bastante para o uso em estudos de patogênese. A técnica de Real Time RT-PCR realizada neste estudo se mostrou eficiente em detectar o RABV em diferentes órgãos e tecidos extraneurais com a vantagem de ser uma técnica mais rápida e sensível.

This study was aimed to detect the presence of rabies virus in different organs of the genus Artibeus bats using molecular techniques such as RT-PCR, hnRT-PCR, and the Real Time RT-PCR. From about 4,000 specimens of bats received for rabies diagnosis at the Pasteur Institute, 30 bats of the genus Artibeus were then selected. The selected bats presented positive results by the traditional DFA and N2A-cells inoculation test using brain tissue suspensions. Samples of salivary glands, urinary bladders, kidneys, lungs, and fecal contents and washings of the skulls were…

Advisors/Committee Members: Ito, Fumio Honma.

Subjects/Keywords: Hemi-Nested RT-PCR; Real Time RT-PCR; Bats; Diagnosis; Diagnóstico; Hemi-Nested RT-PCR; Morcegos; Rabies; Raiva; Real Time RT-PCR; RT-PCR; RT-PCR

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APA (6^th Edition):

Ferreira, K. C. S. (2011). Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Ferreira, Karin Correa Scheffer. “Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.” 2011. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 19, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Ferreira, Karin Correa Scheffer. “Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Ferreira KCS. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;.

Council of Science Editors:

Ferreira KCS. Detecção do vírus da raiva em órgãos de morcegos do gênero Artibeus (Leach, 1821) por meio de RT-PCR, Hemi-Nested RT-PCR e Real Time RT-PCR. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2011. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-19102012-132944/ ;

Universitat Autònoma de Barcelona

8. Moreno Degollado, Gustavo. Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México.

Degree: Departament de Ciència Animal i dels Aliments, 2018, Universitat Autònoma de Barcelona

URL: http://hdl.handle.net/10803/666859

► Toxoplasma gondii (T. gondii) is a parasitic agent that causes toxoplasmosis, a disease that affects a large number of vertebrate hosts including humans and has… (more)

▼ Toxoplasma gondii (T. gondii) is a parasitic agent that causes toxoplasmosis, a disease that affects a large number of vertebrate hosts including humans and has a wide global distribution. The objective of the present work was to detect genomic material of T. gondii in meat and milk of goats of the North of Mexico. We collected 326 samples of meat from kids from 4 states of the north of the republic, on a Federal Inspection Type Trail (TIF) located in the state of Nuevo León; and 120 samples of goat's milk collected in the farms of the producers of the same states. For the detection of deoxyribonucleic acid (DNA) of this parasite the technique of Polymerase Chain Reaction (PCR) and nested PCR (nPCR) was developed to amplify a region of the multicopy gene specific for T. gondii B1 using for the first PCR primers N1 C1, amplifying a fragment of 193 bp, and for nPCR primers N2 C2, amplifying a fragment of 97 bp. From the total of the samples of meat collected positive 10 (3.06%) were obtained at the first PCR, which were amplified in the nPCR, all of them from the state of Chihuahua. The consensus sequences of the positive samples of meat were obtained, these sequences were analyzed and aligned by Clustal Method W of the program MegAlign / DNAStar version 13 in search of homology with previously reported sequences in the GenBank (Nucleotide), establishing a 100% of homology between all sequences and with the sequence reported in GenBank with accession number AF179871.1 (Sequence partial of Gene B1 of T. gondii). The results in the milk samples were all negative. This research work is evidence of the presence of T. gondii in kids slaughtered in the State of Nuevo Leon from different states of northern Mexico, suggesting that the consumption of badly processed and poorly cooked goat meat could represent an important public health risk. Advisors/Committee Members: [email protected] (authoremail), true (authoremailshow), Roig Sagués, Artur Xavier (director), Zarate Ramos, Juan José (director), Hernández Herrero, María Manuela (tutor).

Subjects/Keywords: Toxoplasmosi; Toxoplasmosis; PCR niat; PCR anidado; Nested PCR; Gen B1; Ciències de la Salut; 64

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APA (6^th Edition):

Moreno Degollado, G. (2018). Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México. (Thesis). Universitat Autònoma de Barcelona. Retrieved from http://hdl.handle.net/10803/666859

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Moreno Degollado, Gustavo. “Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México.” 2018. Thesis, Universitat Autònoma de Barcelona. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/10803/666859.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Moreno Degollado, Gustavo. “Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México.” 2018. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Moreno Degollado G. Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México. [Internet] [Thesis]. Universitat Autònoma de Barcelona; 2018. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10803/666859.

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Council of Science Editors:

Moreno Degollado G. Detección molecular de toxoplasma gondii en carne y leche de caprinos del norte de México. [Thesis]. Universitat Autònoma de Barcelona; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/10803/666859

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9. Parra, Andréa Cristina. Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto.

Degree: PhD, Clínica Veterinária, 2009, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-10022011-152248/ ;

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Em função da proximidade cada vez maior entre o cavalo e o homem, é de extrema importância ter conhecimentos das doenças que acometem os equinos,… (more)

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Em função da proximidade cada vez maior entre o cavalo e o homem, é de extrema importância ter conhecimentos das doenças que acometem os equinos, que por ventura, podem acometer seres humanos. Dentre muitas doenças, pode-se citar duas, que promovem grandes perdas econômicas aos rebanhos eqüinos, tanto no tratamento desses rebanhos, como com a morte dos mesmos, dificultando a importação e exportação de animais: a babesiose e a erliquiose (anaplasmose), que podem estar ou não associadas, acometendo um animal, concomitantemente. A presente pesquisa teve como objetivo investigar e diagnosticar doença concomitante babesiose (por Babesia equi ou Theileria equi) e Erliquiose (por Erliquia equi ou Anaplasma phagocytophilum), no estado de São Paulo, em rebanhos eqüinos, utilizando as técnicas de Nested PCR (Nested polymerase chain reaction reação em cadeia pela polimerase para diagnóstico de T. equi e A. phagocytophilum) e c-ELISA (competitive enzyme-linked immunosorbent assay para diagnóstico de T. equi) ou ELISA indireto (para diagnóstico de A. phagocytophilum) e comparar os resultados obtidos nas diferentes técnicas em 250 amostras de eqüino (sangue total e soro). Como resultado, obteve-se 38,4%, 46% e 36% de positividade, respectivamente, nos testes de pesquisa de hematozoário, c-ELISA e Nested PCR para Theileria equi e 0%, 3% e 0% de positividade, respectivamente, nos testes de pesquisa de hemoparasita, ELISA indireto e Nested PCR para Anaplasma phagocytophilum, não sendo observada a co-infecção de Babesiose e Anaplasmose no rebanho estudo

Due to the increasing proximity between horse and man, it is of extreme importance to understand the diseases that affect horses which by chance may affect humans. Among many diseases, babesiosis and ehrlichiosis (anaplasmosis) promote high economic losses to horses herds in consequence of costs of treatment and also death, making it difficult to import and export animals: They can or not be linked affecting an animal at the same time. This study aimed to investigate and diagnose concomitant babesiosis (Babesia equi and Theileria equi) and ehrlichiosis (for ehrlichia equipment or Anaplasma phagocytophilum) in equine herds of the state of Sao Paulo, using the techniques of Nested PCR (Nested polymerase chain reaction for the diagnosis of T. equi and A. phagocytophilum) and c-ELISA (competitive enzyme-linked immunosorbent assay for diagnosis of T. equi) or ELISA (for diagnosis of A. phagocytophilum). Also to compare results obtained in these different techniques in 250 samples of horse (whole blood and serum). Results showed 38.4%, 46% and 36% positivity, respectively, in tests for the detection of Theileria equi through hematozoan, c-ELISA and Nested PCR and 0%, 3% and 0% positivity, respectively, in tests for the detection of Anaplasma phagocytophilum through blood parasites, indirect ELISA and Nested PCR. It was not observed co-infection Babesiosis and anaplasmosis in the herd study

Advisors/Committee Members: Fernandes, Wilson Roberto.

Subjects/Keywords: Anaplasma phagocytophilum; Anaplasma phagocytophilum; Nested PCR; Nested PCR; Theileria equi; Theileria equi; ELISA; ELISA; Equine; Equino

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APA (6^th Edition):

Parra, A. C. (2009). Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-10022011-152248/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Parra, Andréa Cristina. “Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto.” 2009. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 19, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-10022011-152248/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Parra, Andréa Cristina. “Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto.” 2009. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Parra AC. Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2009. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-10022011-152248/ ;.

Council of Science Editors:

Parra AC. Investigação diagnóstica de doença concomitante babesiose e anaplasmose em rebanho eqüino, por técnicas de Nested PCR e c - ELISA ou ELISA indireto. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2009. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10136/tde-10022011-152248/ ;

10. Lira, Evelyn Costa. Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada.

Degree: 2010, Universidade Federal do Amazonas

URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3664

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O câncer de colo do útero é o segundo tipo de câncer mais comum entre as mulheres no mundo inteiro. Para o Brasil, o número… (more)

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O câncer de colo do útero é o segundo tipo de câncer mais comum entre as mulheres no mundo inteiro. Para o Brasil, o número de novos casos esperados, em 2010, é de 18.430. Na região Norte é o mais incidente. Um dos fatores mais importantes para o surgimento deste tipo de câncer é a presença da infecção pelo Papilomavírus Humano (HPV). Sozinho, este vírus não pode levar à carcinogênese. Alguns estudos sugerem a presença da Chlamydia trachomatis como co-fator em seu desenvolvimento. Este estudo teve como objetivo investigar a co-infecção de HPV e C. trachomatis em amostras cervicais com citologia normal e alterada. Trata-se de um estudo transversal, onde foram utilizados dois grupos: o GRUPO I, constituído de 152 mulheres que apresentaram lesões pré-malignas e malignas do colo do útero e o GRUPO II, constituído de 164 mulheres que apresentaram citologia inflamatória. A co-infecção HPV/C. trachomatis foi detectada através da PCR e os tipos de HPV foram identificados via seqüenciamento. Foi encontrada co-infecção em 27,1% (41/152) das mulheres do GRUPO I e em 3,75% das mulheres do GRUPO II. A associação entre a co-infecção e os fatores sócio-econômicos-ambientais e clínicos foi observada apenas para a variável Tipo de HPV (p=0,0424) que associa o HPV 16 a 64,1% das mulheres co-infectadas.

The cervical cancer is the second most common type of cancer between women worldwide. In Brazil, 18.430 new cases of the disease are expected through 2010. Its incidence is greater in the North region. One of the most crucial factors to the spawning of this kind of cancer is the presence of an infection caused by the HPV (Human Papillomavirus). By itself, this virus can t lead to carcinogenesis. Some studies suggest the presence of Chlamydia trachomatis as a co-factor in its development. This study s goal was to investigate the co-infection of HPV and C. trachomatis in cervical samples with normal and altered cell biologies. Its consisted of a transversal study, where two groups were applied: GROUP I, made of 152 women who showed pre-malignant and malignant cervical injuries, and GROUP II, of 164 women who showed inflammatory cell biology. The HPV/C. trachomatis co-infection was detected through PCR and the two HPV types were detected by sequencing. Co-infection was found in 27,1% (41/152) of women in GROUP I and 3,75% in GROUP II s. The connection between the co-infection and the environmental, socio-economic and clinical factors was observed only to the variable HPV type (p=0,0424) which associates HPV 16 to 64,1% of co-infected women.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas

Advisors/Committee Members: Santos, Cristina Maria Borborema dos, CPF:13692399200, http://lattes.cnpq.br/7512612117477966.

Subjects/Keywords: DST; Co-infecção; HPV; C. trachomatis; Nested-PCR; STI; Co-infection; HPV; C. trachomatis; Nested-PCR; CIÊNCIAS DA SAÚDE

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APA (6^th Edition):

Lira, E. C. (2010). Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3664

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Lira, Evelyn Costa. “Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada.” 2010. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed January 19, 2021. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3664.

MLA Handbook (7^th Edition):

Lira, Evelyn Costa. “Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada.” 2010. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Lira EC. Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3664.

Council of Science Editors:

Lira EC. Co-infecção do papilomavírus humano e chlamydia trachomatis em mulheres com citologia normal e alterada. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3664

Technical University of Lisbon

11. Marques, Ana Isabel Ambrósio. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.

Degree: 2011, Technical University of Lisbon

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

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Mestrado em Engenharia Agronómica - Protecção das Plantas - Instituto Superior de Agronomia

Phytoplasmas are unicellular organisms, prokaryotes, cell wall-less that cause diseases in hundreds… (more)

Subjects/Keywords: phytoplasmas; 16SrX group; psyllids; nested-PCR; real-time PCR; Candidatus; phytoplasma pyri

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APA (6^th Edition):

Marques, A. I. A. (2011). Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. (Thesis). Technical University of Lisbon. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Marques, Ana Isabel Ambrósio. “Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.” 2011. Thesis, Technical University of Lisbon. Accessed January 19, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Marques, Ana Isabel Ambrósio. “Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Marques AIA. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. [Internet] [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117.

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Council of Science Editors:

Marques AIA. Pesquisa de fitoplasmas das pomóideas e prunóideas em Portugal. [Thesis]. Technical University of Lisbon; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4117

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Universidade do Rio Grande do Sul

12. Rozales, Franciéli Pedrotti. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.

Degree: 2013, Universidade do Rio Grande do Sul

URL: http://hdl.handle.net/10183/72990

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A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do… (more)

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A tuberculose (TB) é um importante problema de saúde pública, portanto, é necessário o desenvolvimento de novas ferramentas para a detecção rápida e confiável do Mycobacterium tuberculosis, prevenindo a transmissão da TB. O objetivo deste estudo foi avaliar dois testes moleculares para detecção de bactérias do Complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC) diretamente de amostras clínicas. Foi realizado um estudo transversal, no qual foram selecionadas 124 amostras respiratórias. As amostras foram avaliadas por dois testes moleculares “in house” para detecção do MTBC: NESTED-PCR (NPCR) e Real Time PCR (RT-PCR) ambos com primers para o IS6110. As amostras também foram avaliadas por um teste direto (pesquisa de BAAR). Os resultados foram comparados com a cultura para M.tuberculosis e também com os resultados da cultura juntamente com dados clínicos. Uma amostra comercial com quantificação de DNA conhecida foi utilizada para determinação do Limite de Detecção (LOD) dos testes moleculares. O LOD foi de 1 cópia/μL para o RT-PCR e de 25 cópias/μL para o NPCR. O BAAR apresentou baixa sensibilidade - SE - (40%) e alta especificidade - SP - (94%). Ambos os ensaios moleculares, apresentaram elevada SE e SP (RT-PCR 98% e 91%, NPCR 86% e 93%, respectivamente) em relação à cultura. Quando comparamos os resultados frente a cultura juntamente com os dados clínicos, a SE e a SP foram de 90% e 97% para a RT-PCR e de 80% e 99% para a NPCR, respectivamente. Houve um pequeno decréscimo da SE dos métodos moleculares, quando comparados com a cultura mais os dados clínicos em relação à cultura isoladamente, no entanto, a SP foi consideravelmente elevada para os três métodos avaliados. Avaliamos o custo dos insumos para os ensaios moleculares: o custo do NPCR foi de 17.77/teste enquanto que o custo do RT-PCR foi de 15.76/teste. Em relação ao tempo de execução dos testes o RT-PCR foi mais rápido (2 horas) do que o NPCR (4 horas). Este estudo confirma que técnicas de PCRs podem ser muito úteis para o diagnóstico rápido da TB respiratória, com altas taxas de SP. Ele também pode ser muito importante para a exclusão de diagnóstico, considerando o alto VPN encontrados no nosso estudo. Os resultados demonstraram que os ensaios moleculares visando IS6110 do M. tuberculosis podem ajudar a melhorar o diagnóstico da TB pulmonar, com muitos potenciais efeitos positivos para a gestão clínica e de controle da doença.

Tuberculosis (TB) remains as an important public health problem worldwide. Therefore, the rapid detection of M. tuberculosis is of primary importance to effectively reduce transmission among patients. The aims of this study were to evaluate two molecular tests to detect M. tuberculosis complex (MTBC) directly from clinical samples. The study included 124 respiratory samples which were evaluated by two in house molecular assays for MTBC detection: Nested PCR (NPCR) and Real Time PCR (RT-PCR). The respiratory samples were also evaluated by the direct test (AFB assay). The results were compared with the results of culture and also compared…

Advisors/Committee Members: Barth, Afonso Luis.

Subjects/Keywords: Real time PCR; Mycobacterium tuberculosis; Nested PCR; Tuberculose; Tuberculosis; Diagnostico molecular; IS 6110; Clinical criteria

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APA (6^th Edition):

Rozales, F. P. (2013). Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. (Thesis). Universidade do Rio Grande do Sul. Retrieved from http://hdl.handle.net/10183/72990

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Rozales, Franciéli Pedrotti. “Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.” 2013. Thesis, Universidade do Rio Grande do Sul. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/10183/72990.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Rozales, Franciéli Pedrotti. “Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar.” 2013. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Rozales FP. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. [Internet] [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2013. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10183/72990.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Council of Science Editors:

Rozales FP. Real time-pcr e nested-pcr no diagnóstico da tuberculose pulmonar. [Thesis]. Universidade do Rio Grande do Sul; 2013. Available from: http://hdl.handle.net/10183/72990

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Universidade do Rio Grande do Norte

13. Joventino, Kércia Monaline de Souza. Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal .

Degree: 2017, Universidade do Rio Grande do Norte

URL: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/25572

► Cytomegalovirus infection is an important complication after renal transplantation. The use of immunosuppressants in the prevention of rejection may trigger changes in the behavior of… (more)

Subjects/Keywords: Carga viral; Citomegalovírus; Monitoramento; Nested-PCR; PCR em tempo real; Transplante renal

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APA (6^th Edition):

Joventino, K. M. d. S. (2017). Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal . (Masters Thesis). Universidade do Rio Grande do Norte. Retrieved from http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/25572

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Joventino, Kércia Monaline de Souza. “Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal .” 2017. Masters Thesis, Universidade do Rio Grande do Norte. Accessed January 19, 2021. http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/25572.

MLA Handbook (7^th Edition):

Joventino, Kércia Monaline de Souza. “Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal .” 2017. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Joventino KMdS. Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal . [Internet] [Masters thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2017. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/25572.

Council of Science Editors:

Joventino KMdS. Monitoramento da infecção por citomegalovírus em pacientes submetidos a transplante renal . [Masters Thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2017. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/25572

University of Georgia

14. Page-Karjian, Cynthia Anne. Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas).

Degree: 2015, University of Georgia

URL: http://hdl.handle.net/10724/33631

► Fibropapillomatosis (FP) is an infectious, neoplastic disease of sea turtles in circumtropical coastal ocean waters worldwide. FP tumors can cause debilitation by hampering turtles’ feeding,… (more)

▼ Fibropapillomatosis (FP) is an infectious, neoplastic disease of sea turtles in circumtropical coastal ocean waters worldwide. FP tumors can cause debilitation by hampering turtles’ feeding, movement, and vision, and visceral tumors can cause organ failure. Fibropapillomatosis is panzootic in free-ranging green sea turtles (Chelonia mydas), and is also a concern in rehabilitating turtles because it requires extensive quarantine measures and complicates prognoses. An alphaherpesvirus, designated chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus (CFPHV), is consistently identified in FP tumors, and cell-free tumor extracts successfully transmitted the disease. CFPHV was also identified in some normal turtles via serology and polymerase chain reaction (PCR). Despite numerous studies, the actual pathogenesis of CFPHV, its nature of persistence or latency, and its transmission dynamics are not yet fully understood. The objective of this study was to investigate aspects of CFPHV natural history dynamics in free-ranging and rehabilitating green turtles with and without FP. First, nested PCR was used to identify CFPHV DNA in skin from tumored and non-tumored, free-ranging green turtles, and combined with laser capture microdissection to identify CFPHV DNA in microscopically separated epidermis and dermis sections of non-tumored skin. A retrospective case series analysis was performed to describe the biology and survival rates of rehabilitating turtles with FP, and evaluate clinical parameters as survivorship predictors. To investigate the relationship between CFPHV loads and clinical disease, and identify potential routes of viral shedding, a quantitative PCR (qPCR) assay was developed, validated, and applied to various biological samples taken from tumored and non-tumored, free-ranging and rehabilitating green turtles. The qPCR data provide relevant, novel evidence for CFPHV DNA localization and mobilization in symptomatic and asymptomatic turtles. CFPHV DNA presence in blood cells may represent a critical viral life cycle phase and transport mechanism, and CFPHV DNA in urine suggests a previously unknown route of transmission. Quantitative CFPHV DNA data also show that, in addition to cutaneous tissues, kidney and nerve cells play a role in CFPHV pathogenesis. Practical application of the presented information will aid in the evaluation of symptomatic and asymptomatic turtles, helping to prevent transmission opportunities among captive turtles and informing management decisions for free-ranging populations.

Subjects/Keywords: Chelonia mydas; Fibropapillomatosis; Green turtle; CFPHV; Chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus; Nested PCR; Quantitative PCR; Rehabilitation

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APA (6^th Edition):

Page-Karjian, C. A. (2015). Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas). (Thesis). University of Georgia. Retrieved from http://hdl.handle.net/10724/33631

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Page-Karjian, Cynthia Anne. “Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas).” 2015. Thesis, University of Georgia. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/10724/33631.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Page-Karjian, Cynthia Anne. “Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas).” 2015. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Page-Karjian CA. Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas). [Internet] [Thesis]. University of Georgia; 2015. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10724/33631.

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Council of Science Editors:

Page-Karjian CA. Investigation of the natural history of chelonid fibropapilloma-associated herpesvirus infection in green sea turtles (Chelonia mydas). [Thesis]. University of Georgia; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/10724/33631

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15. PONTES, Nayara Evaristo de. Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco .

Degree: 2014, Universidade Federal de Pernambuco

URL: http://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12508

► O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus sem envelope e contém um DNA fita simples circular com 1,7 kb de tamanho. O vírus… (more)

Subjects/Keywords: Circovírus suíno tipo 2; Nested-PCR em tubo único; Suíno

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APA (6^th Edition):

PONTES, N. E. d. (2014). Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco . (Thesis). Universidade Federal de Pernambuco. Retrieved from http://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12508

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

PONTES, Nayara Evaristo de. “Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco .” 2014. Thesis, Universidade Federal de Pernambuco. Accessed January 19, 2021. http://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12508.

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MLA Handbook (7^th Edition):

PONTES, Nayara Evaristo de. “Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco .” 2014. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

PONTES NEd. Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco . [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de Pernambuco; 2014. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12508.

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Council of Science Editors:

PONTES NEd. Estudos moleculares aplicados ao circovírus suíno tipo 2: desenvolvimento da técnica de Nested-PCR em tubo único (STNPCR) e descrição das variantes virais em Pernambuco . [Thesis]. Universidade Federal de Pernambuco; 2014. Available from: http://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12508

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16. Iamamoto, Keila. Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR.

Degree: PhD, Epidemiologia Experimental Aplicada às Zoonoses, 2011, University of São Paulo

URL: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-09102012-173007/ ;

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Várias zoonoses virais acometem equídeos causando quadros neurológicos, entre as quais a raiva e as encefalites equinas do Leste (EEE) e Oeste (WEE). O diagnóstico… (more)

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Várias zoonoses virais acometem equídeos causando quadros neurológicos, entre as quais a raiva e as encefalites equinas do Leste (EEE) e Oeste (WEE). O diagnóstico clínico geralmente não é conclusivo, o que torna imprescindível o diagnóstico laboratorial. Dados do Laboratório de Diagnóstico de Raiva do Instituto Pasteur de São Paulo, entre os anos 2000 e 2010, mostram que aproximadamente 75% das amostras enviadas foram negativas para raiva, ressaltando a relevância da realização de um diagnóstico diferencial para as encefalites equinas causadas por alfavírus. Os objetivos do estudo foram testar a adequação do uso de multiplex hemi-nested RT-PCR para o diagnóstico de raiva, EEE e WEE em amostras de sistema nervoso central de equídeos e realizar uma análise de custo das reações de cada técnica. Foram utilizados os primers 21G, 304 e 504 dirigidos ao gene N do vírus da raiva, e os primers cM3W, M2W, nEEE e nWEE dirigidos ao gene NSP1 dos vírus da EEE e WEE. Procedeu-se a um estudo preliminar dos primers e de seu uso em uma hemi-nested RT-PCR, avaliando a temperatura ótima de anelamento, a sensibilidade e especificidade analíticas e a reprodutibilidade da técnica em amostras de campo positivas para raiva e para EEE. A partir do protocolo estabelecido na reação de hemi-nested RT-PCR, realizaram-se variações de concentração de reagentes no protocolo para a reação de multiplex hemi-nested RT-PCR. Após o estabelecimento do protocolo para esta reação, os mesmos testes para verificação da sensibilidade e especificidade analíticas e da reprodutibilidade foram realizados, comparando-se os resultados com os obtidos pela hemi-nested RT-PCR. No teste de limiar de detecção, a sensibilidade analítica foi semelhante para as duas técnicas, obtendo-se 10-1,7 para os três vírus padrão CVS, EEEV e WEEV. No teste de limiar de detecção utilizando uma amostra com os três vírus verificou-se uma alta especificidade dos primers, sendo que na reação de multiplex hemi-nested RT-PCR foi possível detectar simultaneamente os três vírus padrão. Não houve diferença nas proporções de amostras detectadas como positivas para raiva obtidas pelas duas técnicas, analisando-se pelo teste exato de Fisher (P=1,0000). No entando, para amostras de campo positivas para EEE, a proporção de amostras detectadas como positivas pela hemi-nested RT-PCR foi maior do que a proporção obtida pela multiplex hemi-nested RT-PCR (P<0,0001). Apesar de não ter sido possível o uso de amostras de campo positivas para WEE nesse estudo, os resultados sugerem que seria possível a detecção pela multiplex hemi-nested RT-PCR. Estes dados sugerem que a técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR poderia ser aplicada para detecção de raiva e WEE, mas com limitações para a detecção de EEE. Pela análise de custo dos reagentes, o valor de uma reação de multiplex hemi-nested RT-PCR é semelhante ao de uma hemi-nested RT-PCR, podendo representar uma economia de pelo menos 49,17%.

Several viral zoonoses affect the equids causing neurological diseases, including rabies and Eastern and…

Advisors/Committee Members: Ito, Fumio Honma, Kawai, Juliana Galera Castilho.

Subjects/Keywords: Hemi-nested RT-PCR (técnica); Multiplex hemi-nested RT-PCR (técnica); Eastern equine encephalitis (diagnosis); Encefalite equina do Leste (diagnóstico); Encefalite equina do Oeste (diagnóstico); Hemi-nested RT-PCR (tecnique); Multiplex hemi-nested RT-PCR (tecnique); Rabies (diagnosis); Raiva (diagnóstico); Western equine encephalitis (diagnosis)

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APA (6^th Edition):

Iamamoto, K. (2011). Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR. (Doctoral Dissertation). University of São Paulo. Retrieved from http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-09102012-173007/ ;

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Iamamoto, Keila. “Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR.” 2011. Doctoral Dissertation, University of São Paulo. Accessed January 19, 2021. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-09102012-173007/ ;.

MLA Handbook (7^th Edition):

Iamamoto, Keila. “Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Iamamoto K. Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR. [Internet] [Doctoral dissertation]. University of São Paulo; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-09102012-173007/ ;.

Council of Science Editors:

Iamamoto K. Diagnóstico da raiva e das encefalites equinas do Leste e Oeste em equídeos pelo emprego da técnica de multiplex hemi-nested RT-PCR. [Doctoral Dissertation]. University of São Paulo; 2011. Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/10/10134/tde-09102012-173007/ ;

NSYSU

17. Wang, I-ting. Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis.

Degree: Master, Biological Sciences, 2018, NSYSU

URL: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0729118-035651

► Blastocystis hominis (B. hominis) is one of the most common intestinal protozoan parasites in humans. Pathogenicity of B. hominis remains controversial and it has been… (more)

▼ Blastocystis hominis (B. hominis) is one of the most common intestinal protozoan parasites in humans. Pathogenicity of B. hominis remains controversial and it has been suggested that it may be associated with certain subtypes of organism. Based on the genetic diversity of SSU rRNA (small subunit ribosomal RNA gene, SSU rRNA), B. hominis can be classified into 17 subtypes. From the results of stool samples for parasite test from the regional hospital in southern Taiwan, it was demonstrated that B hominis had the highest prevalence rate (90.2%) of intestinal parasites. The infection rate of B. hominis in foreign population was significantly higher than that of nationals (14.7% vs 4.2%). The aims of this study were to set up nested polymerase chain reaction (nested PCR) for DNA amplification and subtyping. The results were shown 81 of 112 specimens positive for B. hominis and 18 of 200 specimens negative for microscopy were shown positive by nested PCR detection. The sensitivity and the specificity of the nested PCR molecular detection method were 72.3% and 91%; respectively. Our results revealed the positive detection rate increased 9% by nested PCR compared with by microscopy. We hoped that this technology can be applied in the clinical laboratory for B. hominis screening. The sequences of 99 PCR positive samples were analyzed. The most common subtypes were ST3 (44.4%, 44/99), ST1 (43.4%, 43/99), followed by ST2 (5.1 %, 5/99), ST6 (4.0%, 4/99) and ST7 (3.0%, 3/99). A phylogenetic tree was reconstructed using the neighbor-joining method based on the Kimura-2-Parameter model and it was found that five subtypes (ST1, ST2, ST3, ST6 and ST7) can be regarded as five independent monophyletic groups. By phylogenetic analysis, Bh97 and ST1 (AB107961, host: pig), Bh149 and ST3 (AB107965, host: cattle) were highly correlated. It can be inferred that human Blastocysts is transmitted by humans and the possibility of common infections between humans and animals. Although the current prevalence of B. hominis in Taiwanese is lower than that of foreign workers, there is still the possibility of mutual infection through fecal-oral route. In this study, we found the subtype distribution of B. hominis were very similar between Taiwan population and Indonesians. Therefore, the foreign workers should be conducted appropriate health education to reduce B. hominis transmission and dissemination. Advisors/Committee Members: Tsun-Mei Lin (committee member), Jiin-Tsuey Cheng (committee member), Shu-Wen Wan (chair), Huey-Ling You (chair).

Subjects/Keywords: SSU rRNA; Blastocystis hominis; prevalence; sensitivity; nested PCR; subtypes

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APA (6^th Edition):

Wang, I. (2018). Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis. (Thesis). NSYSU. Retrieved from http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0729118-035651

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Wang, I-ting. “Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis.” 2018. Thesis, NSYSU. Accessed January 19, 2021. http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0729118-035651.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Wang, I-ting. “Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis.” 2018. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Wang I. Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis. [Internet] [Thesis]. NSYSU; 2018. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0729118-035651.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Council of Science Editors:

Wang I. Molecular Detection Technique Establishment and Subtype Distribution of Blastocystis hominis. [Thesis]. NSYSU; 2018. Available from: http://etd.lib.nsysu.edu.tw/ETD-db/ETD-search/view_etd?URN=etd-0729118-035651

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Universidade dos Açores

18. Baptista, Cláudio Monteiro. Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR.

Degree: 2011, Universidade dos Açores

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.uac.pt:10400.3/1189

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Dissertação de Mestrado em Engenharia Zootécnica.

Este estudo teve como objectivo averiguar a presença de cavalos portadores de T. equi em duas ilhas do arquipélago… (more)

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Dissertação de Mestrado em Engenharia Zootécnica.

Este estudo teve como objectivo averiguar a presença de cavalos portadores de T. equi em duas ilhas do arquipélago dos Açores. Para tal foram utilizados o cELISA e o nested-PCR. Foram colhidas 26 amostras na ilha Graciosa e 53 na ilha Terceira. Das amostras colhidas na ilha Terceira, 21 pertencem à população do Pónei da ilha Terceira, sendo que as restantes amostras colhidas nas duas ilhas são de cavalos importados do exterior do arquipélago ou descendentes destes. Foram ainda colhidas 162 amostras no continente português. Analisando a totalidade das amostras colhidas nos Açores, 7,6% dos animais apresentaram resultado positivo unicamente para o cELISA e 15,2% foram apenas positivos para o nested-PCR, 3,8% foram positivas para ambos os testes e 73,4% foram negativas para ambos os testes. Verificou-se ainda que todos os animais da população do Pónei da Terceira apresentaram resultados negativos para ambos os testes. Das amostras colhidas no continente português, 7,4% foram positivas unicamente para cELISA e 11,7% positivas apenas para nested-PCR, 18,5% foram positivas para ambos os métodos e 62,4% foram negativas para ambos os métodos. Este é o primeiro estudo a utilizar técnicas moleculares na diagnose de infecções por T. equi em cavalos nos Açores e o primeiro a registar cavalos portadores do parasita no arquipélago.

The objective of this study was to investigate the presence of carrier horses with T. equi in two islands of the Azorean archipelago. For such, cELISA and nested-PCR were used. Twenty six samples were collected in Graciosa island and 53 in Terceira island. From the samples collected in Terceira island, 21 belong to the Pónei da ilha Terceira population. The remaining samples, of both islands, are from horses that were imported from outside of the archipelago, or are descendant from them. There were also collected 162 samples from the Portugal mainland. From the analysis of all the samples from the Azores, 7,6% of the animals were positive exclusively for cELISA and 15,2% were positive exclusively for nested-PCR. For both tests, 3,8% of the samples were positive and 73,4% were negative. It was also observed that all the animals from the Pónei da ilha Terceira population were negative for both tests. From the samples of the mainland, 7,4% were positive exclusively for cELISA and 11,7% were positive exclusively for nested-PCR. For both tests, 18,5% were positive and 62,4% were negative. In Azores, this is the first study using molecular techniques on the diagnosis of infections by T. equi in horses in Azores and the first to report carrier horses with the parasite in the archipelago.

Advisors/Committee Members: Machado, Artur da Câmara.

Subjects/Keywords: Parasitismo Animal; Protozoários; Theileria equi; cELISA; Nested-PCR; Açores

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APA (6^th Edition):

Baptista, C. M. (2011). Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR. (Thesis). Universidade dos Açores. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.uac.pt:10400.3/1189

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Baptista, Cláudio Monteiro. “Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR.” 2011. Thesis, Universidade dos Açores. Accessed January 19, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.uac.pt:10400.3/1189.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Baptista, Cláudio Monteiro. “Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Baptista CM. Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR. [Internet] [Thesis]. Universidade dos Açores; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.uac.pt:10400.3/1189.

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Council of Science Editors:

Baptista CM. Diagnose de infecções pelo protozoário Theileria equi em cavalos nos Açores por cELISA e nested-PCR. [Thesis]. Universidade dos Açores; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio.uac.pt:10400.3/1189

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Queensland University of Technology

19. Perrott, Phillipa Evelyn. Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets.

Degree: 2011, Queensland University of Technology

URL: https://eprints.qut.edu.au/46706/

► Influenza is a widespread disease occurring in seasonal epidemics, and each year is responsible for up to 500,000 deaths worldwide. Influenza can develop into strains… (more)

▼ Influenza is a widespread disease occurring in seasonal epidemics, and each year is responsible for up to 500,000 deaths worldwide. Influenza can develop into strains which cause severe symptoms and high mortality rates, and could potentially reach pandemic status if the virus’ properties allow easy transmission. Influenza is transmissible via contact with the virus, either directly (infected people) or indirectly (contaminated objects); via reception of large droplets over short distances (one metre or less); or through inhalation of aerosols containing the virus expelled by infected individuals during respiratory activities, that can remain suspended in the air and travel distances of more than one metre (the aerosol route). Aerosol transmission of viruses involves three stages: production of the droplets containing viruses; transport of the droplets and ability of a virus to remain intact and infectious; and reception of the droplets (via inhalation). Our understanding of the transmission of influenza viruses via the aerosol route is poor, and thus our ability to prevent a widespread outbreak is limited. This study explored the fate of viruses in droplets by investigating the effects of some physical factors on the recovery of both a bacteriophage model and influenza virus. Experiments simulating respiratory droplets were carried out using different types of droplets, generated from a commonly used water-like matrix, and also from an ‘artificial mucous’ matrix which was used to more closely resemble respiratory fluids. To detect viruses in droplets, we used the traditional plaque assay techniques, and also a sensitive, quantitative PCR assay specifically developed for this study. Our results showed that the artificial mucous suspension enhanced the recovery of infectious bacteriophage. We were able to report detection limits of infectious bacteriophage (no bacteriophage was detected by the plaque assay when aerosolised from a suspension of 103 PFU/mL, for three of the four droplet types tested), and that bacteriophage could remain infectious in suspended droplets for up to 20 minutes. We also showed that the nested real-time PCR assay was able to detect the presence of bacteriophage RNA where the plaque assay could not detect any intact particles. Finally, when applying knowledge from the bacteriophage experiments, we reported the quantitative recoveries of influenza viruses in droplets, which were more consistent and stable than we had anticipated. Influenza viruses can be detected up to 20 minutes (after aerosolisation) in suspended aerosols and possibly beyond. It also was detectable from nebulising suspensions with relatively low concentrations of viruses.

Subjects/Keywords: influenza; respiratory viruses; bacteriophage; aerosols; airborne transmission; nested real-time PCR

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APA (6^th Edition):

Perrott, P. E. (2011). Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets. (Thesis). Queensland University of Technology. Retrieved from https://eprints.qut.edu.au/46706/

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Perrott, Phillipa Evelyn. “Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets.” 2011. Thesis, Queensland University of Technology. Accessed January 19, 2021. https://eprints.qut.edu.au/46706/.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Perrott, Phillipa Evelyn. “Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Perrott PE. Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets. [Internet] [Thesis]. Queensland University of Technology; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: https://eprints.qut.edu.au/46706/.

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Council of Science Editors:

Perrott PE. Detection of bacteriophage and respiratory viruses in droplets. [Thesis]. Queensland University of Technology; 2011. Available from: https://eprints.qut.edu.au/46706/

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Universidade do Rio Grande do Norte

20. Pinheiro, Sthephanie Nassif. Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares .

Degree: 2018, Universidade do Rio Grande do Norte

URL: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/26491

► The Apicomplexa group comprises protozoa that cause globally distributed diseases such as malaria, toxoplasmosis, or opportunistic intestinal disorders. The major protozoa of medical importance are… (more)

Subjects/Keywords: Semi-nested-PCR; Toxoplasma gondi; Plasmodium; Diagnóstico molecular

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APA (6^th Edition):

Pinheiro, S. N. (2018). Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares . (Masters Thesis). Universidade do Rio Grande do Norte. Retrieved from http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/26491

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Pinheiro, Sthephanie Nassif. “Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares .” 2018. Masters Thesis, Universidade do Rio Grande do Norte. Accessed January 19, 2021. http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/26491.

MLA Handbook (7^th Edition):

Pinheiro, Sthephanie Nassif. “Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares .” 2018. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Pinheiro SN. Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares . [Internet] [Masters thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2018. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/26491.

Council of Science Editors:

Pinheiro SN. Caracterização do gene 18S rRNA em parasitos do grupo Apicomplexa: uma abordagem aplicada à seleção de marcadores moleculares . [Masters Thesis]. Universidade do Rio Grande do Norte; 2018. Available from: http://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/26491

University of Georgia

21. Fong, Theng Theng. Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA.

Degree: 2014, University of Georgia

URL: http://hdl.handle.net/10724/21825

► The stringent host specificity of enteric viruses makes them good library-independent markers for identification of water pollution sources. Here we developed molecular assays targeting human… (more)

Subjects/Keywords: enteric viruses; fecal contamination; water quality; nested-PCR

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APA (6^th Edition):

Fong, T. T. (2014). Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA. (Thesis). University of Georgia. Retrieved from http://hdl.handle.net/10724/21825

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Fong, Theng Theng. “Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA.” 2014. Thesis, University of Georgia. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/10724/21825.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Fong, Theng Theng. “Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA.” 2014. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Fong TT. Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA. [Internet] [Thesis]. University of Georgia; 2014. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10724/21825.

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Council of Science Editors:

Fong TT. Molecular detection of waterborne human and bovine enteric viruses in a multi-use coastal watershed in Southeast Georgia, USA. [Thesis]. University of Georgia; 2014. Available from: http://hdl.handle.net/10724/21825

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22. Paulo José Martins Bispo. Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana.

Degree: 2009, Universidade Federal de São Paulo

URL: http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=481

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Objetivo: Desenvolvimento e aplicação de protocolos de Nested Multiplex PCR e PCR em Tempo Real para a detecção bacteriana e classificação de Gram em amostras… (more)

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Objetivo: Desenvolvimento e aplicação de protocolos de Nested Multiplex PCR e PCR em Tempo Real para a detecção bacteriana e classificação de Gram em amostras de humor aquoso e vítreo coletadas de pacientes com suspeita clínica de endoftalmite. Métodos: Especificidade analítica foi estabelecida utilizando 31 microrganismos clinicamente importantes, 20 gram-positivos e 11 gram-negativos. Reação cruzada com DNA humano e DNA fúngico foi testada. Amostras controles de humor aquoso coletadas após facoemulsificação foram incluídas. Sensibilidade analítica para as metodologias de PCR foram determinadas utilizando diluição seriada 1:10 de DNA extraído de S. epidermidis e E. coli. As técnicas foram posteriormente aplicadas e testadas em amostras de humor aquoso e vítreo coletadas de pacientes com diagnóstico clínico de endoftalmite. Preparações comerciais de Taq DNA polimerase foram pré-tratadas com DNaseI. Resultados: Amplificação genérica do gene 16S rDNA foi positiva para todos os isolados bacterianos. Classificação de Gram pela técnica de Nested Multiplex PCR não foi possível apenas para isolados de Acinetobacter spp. Utilizando PCR Multiplex em Tempo Real, todos os isolados foram classificados por Gram, sendo que P. acnes exibiu um padrão misto de amplificação. Limite de detecção da metodologia de Nested Multiplex PCR foi de 1 fg/μl para S. epidermidis e E.coli. A sensibilidade de detecção para S. epidermidis e E. coli utilizando reação para detecção universal bacteriana por PCR em Tempo Real com SYBR Green foi de 100 fg/μl (E = 0,82 e 0,86; r2 = 0,99) e 1 pg/μl utilizando metodologia de PCR Multiplex em Tempo Real com Sondas TaqMan (E = 0,66 e 0,77; r2 = 0,99). A positividade da cultura para detecção bacteriana a partir de amostras de humor aquoso e vítreo foi de 47,6% e pelas metodologias de Nested Multiplex PCR e PCR em Tempo Real foi de 100% e 95,2% respectivamente. Entre as amostras negativas por cultura (n=10), a metodologia de Nested Multiplex PCR foi positiva para todas (100%) e PCR em Tempo Real em 90% dos casos (9/10). Entretanto, a proporção de falso-positivos pela metodologia de Nested Multiplex PCR (65,4%) foi superior aos valores obtidos por PCR em Tempo Real (7,7%). A classificação de gram foi obtida em 88,8% dos casos por Nested PCR e 100% por PCR em Tempo Real. A correlação entre a identificação clássica e classificação de Gram molecular foi 63,6% para ambas as técnicas. A identificação pelo sequenciamento dos produtos obtidos por Nested Multiplex PCR e PCR em Tempo Real apresentou correlação de 100% e 88,8%, respectivamente, quando comparada a identificação fenotípica. Conclusões: As metodologias de PCR apresentaram boa correlação quando comparadas com os resultados da cultura e a detecção passou de 47,6% por cultura para 100%, demonstrando serem testes viáveis e mais sensíveis para a caracterização laboratorial de endoftalmite.

Objective: Development and application of Nested Multiplex PCR and Real Time PCR assays for detection and Gram classification of bacteria using aqueous and…

Advisors/Committee Members: Marinês Dalla Valle Martino, Celso Francisco Hernandes Granato, Antonio Carlos Campos Pignatari, Ana Luisa Hofling de lima Farah.

Subjects/Keywords: 1. Endoftalmite bacteriana. 2. Infecções intra-oculares. 3. Multiplex PCR. 4. Nested PCR. 4. PCR em Tempo Real.; IMUNOLOGIA

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Bispo, P. J. M. (2009). Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana. (Thesis). Universidade Federal de São Paulo. Retrieved from http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=481

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Bispo, Paulo José Martins. “Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana.” 2009. Thesis, Universidade Federal de São Paulo. Accessed January 19, 2021. http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=481.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Bispo, Paulo José Martins. “Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana.” 2009. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Bispo PJM. Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana. [Internet] [Thesis]. Universidade Federal de São Paulo; 2009. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=481.

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Council of Science Editors:

Bispo PJM. Aplicação de Métodos Moleculares no Diagnóstico de Endoftalmite Bacteriana. [Thesis]. Universidade Federal de São Paulo; 2009. Available from: http://www.bdtd.unifesp.br/tede//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=481

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Universidade do Porto

23. Lagoa, Arlindo Marques. Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number.

Degree: 2011, Universidade do Porto

URL: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/22055

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Mestrado em Ciências Forenses

Master Degree Course in Forensic Sciences

A possibilidade de analisar amostras com quantidades exíguas de material genético (amostras Low Copy Number… (more)

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Mestrado em Ciências Forenses

Master Degree Course in Forensic Sciences

A possibilidade de analisar amostras com quantidades exíguas de material genético (amostras Low Copy Number ou LCN), em que estão presentes apenas algumas células, tem alterado a forma de encarar a cena do crime. Alguns vestígios que até agora não eram considerados como susceptíveis de proporcionarem resultados, podem actualmente ser analisados com sucesso. As impressões digitais são um bom exemplo. Estes vestígios apresentam um baixo número de células, permitindo apenas recuperar quantidades de DNA inferiores a 100 pg. Assim, para a análise do DNA nuclear, é necessário implementar sistemas muito sensíveis que consistem, habitualmente, no aumento do número de ciclos da PCR. Contudo, alguns artefactos são produzidos, tornando difícil a interpretação dos electroforectogramas. Neste trabalho pretendeu-se comparar a aplicação do estudo de STR autossómicos, Y-STR e miniSTR na análise genética de impressões digitais, partindo do conceito do aumento do número de ciclos como estratégia para se obter maior sensibilidade. Procedeu-se também à amplificação total do genoma e nested-PCR, como métodos alternativos ao aumento do número de ciclos. Adicionalemente, neste estudo tentou-se perceber a influência dos principais métodos reveladores de impressões digitais (cianoacrilato, pó magnético e pó branco) na análise do DNA. Os resultados mostram que o aumento do número de ciclos é a melhor opção como método para aumentar a sensibilidade. Constata-se também que o DNA extraído de impressões digitais encontra-se parcialmente degradado, obtendo-se diferenças significativas entre loci com fragmentos de amplificação menores e maiores do que 200 pb. Dos diferentes marcadores caracterizados verifica-se que, em termos de percentagem de alelos detectados, os miniSTR proporcionam os melhores resultados. Por outro lado, os Y-STR parecem altamente sensíveis à degradação ou presença de inibidores, pelo que são menos robustos para este tipo de análises. Verifica-se também que os perfis LCN são drasticamente afectados por artefactos, principalmente os derivados de variação estocástica, como o allele dropout e o desequilíbrio heterozigótico. A determinação de perfis de consenso permite reduzir alguns destes artefactos. Dos métodos de revelação estudados, o cianoacrilato é o que apresenta menor influência na análise e, pelo contrário, o pó branco provoca os resultados mais negativos.

The possibility to perform low copy number DNA typing, when just a few cells are available, as changed the way how crime scene investigations is faced. Nowadays it is possible to successfully type some evidence that couldn t be considered until now. Fingerprints are a good example of those. Since that just a few cells are present in this evidence (enabling recovery of low quantities of DNA, fewer than 100pg) just very sensitive systems can detect nuclear DNA. The most used method is definitely increasing the number of PCR cycles. However, increased occurrence of stutters and artifacts that…

Subjects/Keywords: Impressões Digitais; DNA; Low Copy Number; miniSTR; STR; Y-STR; Nested-PCR; WGA; Fingerprints; DNA; Low Copy Number; miniSTR; STR; Y-STR; Nested-PCR; WGA; Ciências Forenses; Porto

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APA (6^th Edition):

Lagoa, A. M. (2011). Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number. (Thesis). Universidade do Porto. Retrieved from http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/22055

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Lagoa, Arlindo Marques. “Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number.” 2011. Thesis, Universidade do Porto. Accessed January 19, 2021. http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/22055.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Lagoa, Arlindo Marques. “Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Lagoa AM. Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number. [Internet] [Thesis]. Universidade do Porto; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/22055.

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Council of Science Editors:

Lagoa AM. Análise genética de impressões digitais - Amostras Low Copy Number. [Thesis]. Universidade do Porto; 2011. Available from: http://www.rcaap.pt/detail.jsp?id=oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/22055

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24. Adriana Antônia da Cruz Furini. Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis.

Degree: 2010, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto

URL: http://bdtd.famerp.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=364

► Introdução. O diagnóstico das formas paucibacilares da tuberculose (TB), que acomete principalmente crianças, imunocomprometidos, transplantados e formas extrapulmonares é limitado pelas técnicas fenotípicas de baciloscopia… (more)

▼ Introdução. O diagnóstico das formas paucibacilares da tuberculose (TB), que acomete principalmente crianças, imunocomprometidos, transplantados e formas extrapulmonares é limitado pelas técnicas fenotípicas de baciloscopia e cultura. Ademais, o diagnóstico das micobacterioses, também apresenta-se comprometido pelos métodos fenotípicos. A reação da polymerase em cadeia (PCR) e suas variações, tais como a Nested-PCR (NPCR), tem sido descritas como técnicas promissoras para o rápido diagnóstico da tuberculose e micobacterioses. Objetivos. Avaliação de um protocolo de NPCR para detecção do complexo Mycobacterium tuberculosis em sítios anatômicos pulmonares e extrapulmonares de indivíduos com suspeita clínica de TB. Casuística e Método. Foram incluídas, prospectivamente, 24 amostras de sítios pulmonares e 85 extrapulmonares, coletadas a partir de 49 indivíduos soropositivos para o HIV e 28 soronegativos e submetidas ao método gold standard e a NPCR tendo como alvo o transposon IS6110. Resultados. A tuberculose foi diagnosticada em 11 pacientes (14,3%), com 54,5% de formas extrapulmonares e 45,5% pulmonares. A NPCR foi positiva em todos, enquanto a cultura em apenas cinco deles. A positividade da baciloscopia entre os espécimes clínicos foi de 9.2%. A cultura permitiu o isolamento de sete cepas de M. tuberculosis e duas do Complexo M. avium (8,25%). A positividade molecular foi descrita em 23,85% das amostras. O desempenho da NPCR frente a cultura, para amostras pulmonares (n=22) e extrapulmonares (n=83) foi similar (100% de sensibilidade e aproximadamente 83% de especificidade). A positividade pela NPCR foi significantemente maior que o isolamento por cultura entre as amostras extrapulmonares (p=0.0042). Conclusões. Os resultados obtidos sugerem a realização de estudos mais amplos que corroborem o potencial da NPCR-IS6110 para a detecção do genoma micobacteriano na TB extrapulmonar, em especial entre imunocomprometidos. Ademais, a detecção da micobactéria permanece como confirmação diagnóstica e a oportunidade de investigação do perfil de sensibilidade, favorecendo o tratamento efetivo para qualquer faixa etária e status imunológico. Advisors/Committee Members: Ricardo Luiz Dantas Machado, Irineu Luiz Maia, Lilian Castiglioni, Andrea Regina Baptista Rossit.

Subjects/Keywords: Nested-PCR; Mycobacterium spp.; PNEUMOLOGIA; Pneumologia; Tuberculose; HIV; Molecular diagnosis; Mycobacterium tuberculosis; Tuberculose; HIV; Nested PCR; Paucibacillary; Transposon IS6110; Neumología; Pulmonary Medicine; Tuberculosis; VIH

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Furini, A. A. d. C. (2010). Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis. (Thesis). Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Retrieved from http://bdtd.famerp.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=364

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Furini, Adriana Antônia da Cruz. “Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis.” 2010. Thesis, Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Accessed January 19, 2021. http://bdtd.famerp.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=364.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Furini, Adriana Antônia da Cruz. “Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis.” 2010. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Furini AAdC. Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis. [Internet] [Thesis]. Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto; 2010. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://bdtd.famerp.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=364.

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Council of Science Editors:

Furini AAdC. Avaliação de diagnósticos do Mycobacterium spp. em populações diferencialmente susceptíveis. [Thesis]. Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto; 2010. Available from: http://bdtd.famerp.br//tde_busca/arquivo.php?codArquivo=364

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Kyoto University

25. Ikhsan, Guswenrivo. Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection .

Degree: 2018, Kyoto University

URL: http://hdl.handle.net/2433/232357

Subjects/Keywords: Ectoparasitic fungi; Laboulbeniopsis termitarius; Antennopsis gallica; Multiplex nested PCR; Nested PCR

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APA (6^th Edition):

Ikhsan, G. (2018). Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection . (Thesis). Kyoto University. Retrieved from http://hdl.handle.net/2433/232357

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Ikhsan, Guswenrivo. “Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection .” 2018. Thesis, Kyoto University. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/2433/232357.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Ikhsan, Guswenrivo. “Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection .” 2018. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Ikhsan G. Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection . [Internet] [Thesis]. Kyoto University; 2018. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/2433/232357.

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Council of Science Editors:

Ikhsan G. Termite Ectoparasitic Fungi in Japan: Distribution, Prevalence, and Molecular Detection . [Thesis]. Kyoto University; 2018. Available from: http://hdl.handle.net/2433/232357

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

26. Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.

Degree: 2009, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia

URL: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1217

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No período de 12 meses, entre setembro/2007 a agosto/2008, foram realizadas capturas de flebotomíneos utilizando armadilhas luminosas e isca animal (Disney) em uma área da… (more)

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No período de 12 meses, entre setembro/2007 a agosto/2008, foram realizadas capturas de flebotomíneos utilizando armadilhas luminosas e isca animal (Disney) em uma área da Reserva Biológica de Campina, km 42 da BR 174, Manaus-Boa Vista. Foram capturados 1.842 insetos, sendo 1.297 fêmeas e 545 machos, distribuídos em 22 espécies pertencentes ao gênero Lutzomyia França, 1924. A espécie encontrada em maior quantidade e distribuída em todas as áreas foi Lutzomyia flaviscutellata (85,7%), seguida por L. georgii (5,1%) e L. olmeca nociva (3,2%). As fêmeas de L. flaviscutellata foram as mais abundantes em todas as capturas, principalmente com armadilhas Disney na campina, sendo que os machos apresentaram maior densidade em coletas com armadilhas CDC, nas áreas de campina (59,2%), seguida pela campinarana (27,5%) e por último nas áreas de mata (13,2%). O estudo sazonal de L. flaviscutellata nestes ambientes mostrou maior densidade populacional no período de chuvas, verificando-se número mais elevado de fêmeas na campinarana no período compreendido entre fevereiro a abril. A diversidade de espécies foi variável de acordo com o método de captura e ambiente estudado. O índice de diversidade foi de 3,6 e nos três ambientes estudados representaram valores de 4,2 para mata, 1,5 campinarana e 1,1 para campina, verificando se maior diversidade na área de mata, ao contrário do observado nas outras áreas. Realizaram-se exames para detecção de infecção natural por exame direto e pela técnica de PCR. A infecção por flagelados foi observada apenas pela nested PCR, tendo DNA amplificado de Leishmania (Leishmania) sp. em 11,7% (22/188) das fêmeas testadas pela reação. Os resultados deste trabalho corroboram para a compreensão da ecologia e epidemiologia dos vetores de leishmaniose na região do Amazonas, além de ser um dos pioneiros em estudos de fauna de flebotomíneos em áreas de mata de Campina no Brasil. O registro da predominância de L. flaviscutellata em um ambiente de poucos abrigos de animais e dificuldades quanto ao encontro da fonte alimentar sanguínea, sugere que esta espécie apresenta-se adaptada às condições adversas deste ambiente.

In the period of 12 months, between september/2007 to august/2008, in an area of the Biological Reserve of Campina, km 42 of the BR 174, Manaus Boa Vista had been carried through captures of sandflies using CDC light traps and bait animal (Disney traps). 1,842 insects had been captured, being 1,297 females and 545 males, distributed in 22 species of the genus Lutzomyia França, 1924. The species found in bigger amount and distributed in all the areas was Lutzomyia flaviscutellata, (85.7%), followed for L. georgii (5.1%) and L. olmeca nociva (3.2%). The females of L. flaviscutellata had been the most abundant in all captures, mainly with Disney traps in the campina, being that the males had presented greater density in collections with light traps CDC, in the areas of campina (59.2%), followed for the campinarana (27.5%) and finally in the bush areas (13.2%). The sazonal study of L.…

Advisors/Committee Members: Franco, Antonia Maria Ramos, Pessoa, Felipe Arley Costa, Santos, Joselita Maria Mendes dos, Luz, Sergio Luiz Bessa, Reis, Sônia Rolim, Reis, Sônia Rolim.

Subjects/Keywords: Lutzomyia flaviscutellata; Flebotomíneos; Campinarana; Nested PCR (Técnica); Entomofauna; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA

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APA (6^th Edition):

Albuquerque, M. I. C. (2009). Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. (Masters Thesis). Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Retrieved from http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1217

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. “Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.” 2009. Masters Thesis, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Accessed January 19, 2021. http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1217.

MLA Handbook (7^th Edition):

Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. “Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.” 2009. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Albuquerque MIC. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. [Internet] [Masters thesis]. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; 2009. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1217.

Council of Science Editors:

Albuquerque MIC. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. [Masters Thesis]. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; 2009. Available from: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1217

27. Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.

Degree: 2009, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia

URL: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1274

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No período de 12 meses, entre setembro/2007 a agosto/2008, foram realizadas capturas de flebotomíneos utilizando armadilhas luminosas e isca animal (Disney) em uma área da… (more)

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No período de 12 meses, entre setembro/2007 a agosto/2008, foram realizadas capturas de flebotomíneos utilizando armadilhas luminosas e isca animal (Disney) em uma área da Reserva Biológica de Campina, km 42 da BR 174, Manaus-Boa Vista. Foram capturados 1.842 insetos, sendo 1.297 fêmeas e 545 machos, distribuídos em 22 espécies pertencentes ao gênero Lutzomyia França, 1924. A espécie encontrada em maior quantidade e distribuída em todas as áreas foi Lutzomyia flaviscutellata (85,7%), seguida por L. georgii (5,1%) e L. olmeca nociva (3,2%). As fêmeas de L. flaviscutellata foram as mais abundantes em todas as capturas, principalmente com armadilhas Disney na campina, sendo que os machos apresentaram maior densidade em coletas com armadilhas CDC, nas áreas de campina (59,2%), seguida pela campinarana (27,5%) e por último nas áreas de mata (13,2%). O estudo sazonal de L. flaviscutellata nestes ambientes mostrou maior densidade populacional no período de chuvas, verificando-se número mais elevado de fêmeas na campinarana no período compreendido entre fevereiro a abril. A diversidade de espécies foi variável de acordo com o método de captura e ambiente estudado. O índice de diversidade foi de 3,6 e nos três ambientes estudados representaram valores de 4,2 para mata, 1,5 campinarana e 1,1 para campina, verificando se maior diversidade na área de mata, ao contrário do observado nas outras áreas. Realizaram-se exames para detecção de infecção natural por exame direto e pela técnica de PCR. A infecção por flagelados foi observada apenas pela nested PCR, tendo DNA amplificado de Leishmania (Leishmania) sp. em 11,7% (22/188) das fêmeas testadas pela reação. Os resultados deste trabalho corroboram para a compreensão da ecologia e epidemiologia dos vetores de leishmaniose na região do Amazonas, além de ser um dos pioneiros em estudos de fauna de flebotomíneos em áreas de mata de Campina no Brasil. O registro da predominância de L. flaviscutellata em um ambiente de poucos abrigos de animais e dificuldades quanto ao encontro da fonte alimentar sanguínea, sugere que esta espécie apresenta-se adaptada às condições adversas deste ambiente.

In the period of 12 months, between september/2007 to august/2008, in an area of the Biological Reserve of Campina, km 42 of the BR 174, Manaus Boa Vista had been carried through captures of sandflies using CDC light traps and bait animal (Disney traps). 1,842 insects had been captured, being 1,297 females and 545 males, distributed in 22 species of the genus Lutzomyia França, 1924. The species found in bigger amount and distributed in all the areas was Lutzomyia flaviscutellata, (85.7%), followed for L. georgii (5.1%) and L. olmeca nociva (3.2%). The females of L. flaviscutellata had been the most abundant in all captures, mainly with Disney traps in the campina, being that the males had presented greater density in collections with light traps CDC, in the areas of campina (59.2%), followed for the campinarana (27.5%) and finally in the bush areas (13.2%). The sazonal study of L.…

Advisors/Committee Members: Franco, Antonia Maria Ramos, Pessoa, Felipe Arley Costa, Santos, Joselita Maria Mendes dos, Luz, Sergio Luiz Bessa, Reis, Sônia Rolim, Reis, Sônia Rolim.

Subjects/Keywords: Lutzomyia flaviscutellata; Flebotomíneos; Campinarana; Nested PCR (Técnica); Entomofauna; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA

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APA (6^th Edition):

Albuquerque, M. I. C. (2009). Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. (Masters Thesis). Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Retrieved from http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1274

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. “Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.” 2009. Masters Thesis, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. Accessed January 19, 2021. http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1274.

MLA Handbook (7^th Edition):

Albuquerque, Maria Ivonei Carvalho. “Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil.” 2009. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Albuquerque MIC. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. [Internet] [Masters thesis]. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; 2009. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1274.

Council of Science Editors:

Albuquerque MIC. Fauna de flebotomíneos (Diptera: Psychodidae) e taxa de infecção natural por Leishmania sp. (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) da Reserva Biológica de Campina - INPA da BR 174, Manaus, AM - Brasil. [Masters Thesis]. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; 2009. Available from: http://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1274

University of South Florida

28. Hernandez Bojorge, Santiago E. Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae.

Degree: 2020, University of South Florida

URL: https://scholarcommons.usf.edu/etd/8217

► Lymphatic filariasis is a very painful and disfiguring helminth disease caused by the tissue nematodes Wuchereria bancrofti, Brugia malayi, and Brugia timori. This parasitosis is… (more)

▼ Lymphatic filariasis is a very painful and disfiguring helminth disease caused by the tissue nematodes Wuchereria bancrofti, Brugia malayi, and Brugia timori. This parasitosis is considered a Neglected Tropical Disease and it is a major public health burden for 72 tropical countries of Africa, Southeast Asia, the Caribbean, and South America. Despite the effectiveness of many control programs, there remains the need to develop new pharmacological agents to treat lymphatic filariasis, as most programs rely on a limited variety of drugs that are expensive, logistically difficult to obtain, and can lead to drug resistance. The Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) based technology is currently being used to develop a genetic toolkit and methods for the study of transcriptional and post-transcriptional regulation in all lifecycle stages and tissues of B. malayi. To genotype transgenic parasites, it is necessary to detect the genomic DNA of B. malayi in a non-invasive way, since the invasive sampling of the parasite damages its cuticle resulting in death. This study presents the development of specific nested primers to amplify Y chromosomal DNA from the DNA present in the media of the molting parasites. Knowing the sex of the larvae will allow us to optimize the sex ratio for the backcrossing of transgenic parasites. B. malayi third stage infective L3 were cultured with 1x105 Bovine Embryo Skeletal Muscle (BESM) cells/well and Minimal Essential Media (MEM) containing 20% fetal bovine serum (FBS). Following the collection of the molting media for day 8, DNA was extracted using the DNeasy® Blood & Tissue Kit and the DynabeadsTM M-280 Streptavidin method. A single distinct band of approximately 210-220 bp was obtained from molting media samples that contained one singe L3 larvae using the NPRx2 and NPSet1 nested primers. A single distinct band of approximately 420 bp was obtained from the same media samples using the RPS12UTRF2 and the RPS12UTRR2 nested primers. Amplification from both the shp2 and BmRPS12 genes demonstrated that the genomic DNA present in the media of molting parasites can be used to non-invasively genotype individual larvae. Furthermore, the Tag on Y (ToY) assay can then be used to determine the sex of the cultured parasites. This study provides important tools to genotype and to optimize the sex ratio for the backcrossing of transgenic parasites.

Subjects/Keywords: B. malayi; nested PCR; primer development; Y chromosome marker gene; Epidemiology; Parasitology; Public Health

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APA (6^th Edition):

Hernandez Bojorge, S. E. (2020). Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae. (Thesis). University of South Florida. Retrieved from https://scholarcommons.usf.edu/etd/8217

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Hernandez Bojorge, Santiago E. “Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae.” 2020. Thesis, University of South Florida. Accessed January 19, 2021. https://scholarcommons.usf.edu/etd/8217.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Hernandez Bojorge, Santiago E. “Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae.” 2020. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Hernandez Bojorge SE. Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae. [Internet] [Thesis]. University of South Florida; 2020. [cited 2021 Jan 19]. Available from: https://scholarcommons.usf.edu/etd/8217.

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Council of Science Editors:

Hernandez Bojorge SE. Non-invasive Sex Determination and Genotyping of Transgenic Brugia malayi Larvae. [Thesis]. University of South Florida; 2020. Available from: https://scholarcommons.usf.edu/etd/8217

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Uppsala University

29. Mariam, Nakintu. Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan.

Degree: Medical Biochemistry and Microbiology, 2011, Uppsala University

URL: http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-155295

Subjects/Keywords: Sulfadoxin-Phyrimethamine; malaria resistance; nested-PCR

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APA (6^th Edition):

Mariam, N. (2011). Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan. (Thesis). Uppsala University. Retrieved from http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-155295

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Mariam, Nakintu. “Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan.” 2011. Thesis, Uppsala University. Accessed January 19, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-155295.

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Mariam, Nakintu. “Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan.” 2011. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Mariam N. Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan. [Internet] [Thesis]. Uppsala University; 2011. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-155295.

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Mariam N. Detection of mutations in dihydropteroate synthase (dhps) and dihydrofolate reductase (dhfr) in Plasmodium falciparum in eastern Sudan. [Thesis]. Uppsala University; 2011. Available from: http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-155295

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University of Maryland

30. Allen, Carol Dianne. TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE.

Degree: Plant Science and Landscape Architecture (PLSA), 2012, University of Maryland

URL: http://hdl.handle.net/1903/13664

► ABSTRACT Title of Thesis: TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE Carol Dianne Allen, Master of Science. 2012 Thesis Directed by:… (more)

Subjects/Keywords: Virology; Entomology; Plant pathology; Australian Cockroach; Cymbidium mosaic virus; Hemi-nested PCR; Orchids; Periplaneta australasiae

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APA (6^th Edition):

Allen, C. D. (2012). TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE. (Thesis). University of Maryland. Retrieved from http://hdl.handle.net/1903/13664

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Allen, Carol Dianne. “TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE.” 2012. Thesis, University of Maryland. Accessed January 19, 2021. http://hdl.handle.net/1903/13664.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Allen, Carol Dianne. “TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE.” 2012. Web. 19 Jan 2021.

Vancouver:

Allen CD. TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE. [Internet] [Thesis]. University of Maryland; 2012. [cited 2021 Jan 19]. Available from: http://hdl.handle.net/1903/13664.

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Council of Science Editors:

Allen CD. TRANSMISSION OF CYMBIDIUM MOSAIC VIRUS IN ONCIDIUM ORCHIDS BY PERIPLANETA AUSTRALASIAE. [Thesis]. University of Maryland; 2012. Available from: http://hdl.handle.net/1903/13664

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