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1. Puybareau, Elodie. Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales.

Degree: Docteur es, Informatique, 2016, Université Paris-Est

L’analyse du mouvement, ou l’analyse d’une séquence d’images, est l’extension naturelle de l’analyse d’images à l’analyse de séries temporelles d’images. De nombreuses méthodes d’analyse de mouvement ont été développées dans le contexte de la vision par ordinateur, incluant le suivi de caractéristiques, le flot optique, l’analyse de points-clef, le recalage d’image, etc. Dans ce manuscrit, nous proposons une boite a outils de techniques d’analyse de mouvement adaptées à l’analyse de séquences biomédicales. Nous avons en particulier travaillé sur les cellules ciliées qui sont couvertes de cils qui battent. Elles sont présentes chez l’homme dans les zones nécessitant des mouvements de fluide. Dans les poumons et les voies respiratoires supérieures, les cils sont responsables de l’épuration muco-ciliaire, qui permet d’évacuer des poumons la poussière et autres impuretés inhalées. Les altérations de l’épuration mucociliaire peuvent être liées à des maladies touchant les cils, pouvant être génétiques ou acquises et peuvent être handicapantes. Ces maladies peuvent être caractérisées par l’analyse du mouvement des cils sous un microscope avec une résolution temporelle importante. Nous avons développé plusieurs outils et techniques pour réaliser ces analyses de manière automatiques et avec une haute précision, à la fois sur des biopsies et in-vivo. Nous avons aussi illustré nos techniques dans le contexte d’éco-toxicité en analysant le rythme cardiaque d’embryons de poissons

Motion analysis, or the analysis of image sequences, is a natural extension of image analysis to time series of images. Many methods for motion analysis have been developed in the context of computer vision, including feature tracking, optical flow, keypoint analysis, image registration, and so on. In this work, we propose a toolbox of motion analysis techniques suitable for biomedical image sequence analysis. We particularly study ciliated cells. These cells are covered with beating cilia. They are present in humans in areas where fluid motion is necessary. In the lungs and the upper respiratory tract, Cilia perform the clearance task, which means cleaning the lungs of dust and other airborne contaminants. Ciliated cells are subject to genetic or acquired diseases that can compromise clearance, and in turn cause problems in their hosts. These diseases can be characterized by studying the motion of cilia under a microscope and at high temporal resolution. We propose a number of novel tools and techniques to perform such analyses automatically and with high precision, both ex-vivo on biopsies, and in-vivo. We also illustrate our techniques in the context of eco-toxicity by analysing the beating pattern of the heart of fish embryo

Advisors/Committee Members: Najman, Laurent (thesis director), Talbot, Hugues (thesis director).

Subjects/Keywords: Fréquence de battement; Analyse du mouvement; Imagerie; Développement; Épuration muco-Ciliaire; Beat rate; Motion analysis; Imaging; Development; Muco-Ciliary purge

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APA (6th Edition):

Puybareau, E. (2016). Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales. (Doctoral Dissertation). Université Paris-Est. Retrieved from http://www.theses.fr/2016PESC1063

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Puybareau, Elodie. “Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales.” 2016. Doctoral Dissertation, Université Paris-Est. Accessed January 29, 2020. http://www.theses.fr/2016PESC1063.

MLA Handbook (7th Edition):

Puybareau, Elodie. “Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales.” 2016. Web. 29 Jan 2020.

Vancouver:

Puybareau E. Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Paris-Est; 2016. [cited 2020 Jan 29]. Available from: http://www.theses.fr/2016PESC1063.

Council of Science Editors:

Puybareau E. Motion analysis for Medical and Bio-medical applications : Analyse du mouvement pour applications médicales et bio-médicales. [Doctoral Dissertation]. Université Paris-Est; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016PESC1063

2. Blanchon, Sylvain. Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care.

Degree: Docteur es, Pathologie et recherche clinique, 2016, Université Paris-Est

Résumé non transmis

Summary not transmitted

Advisors/Committee Members: Louis, Bruno (thesis director), Escudier, Estelle (thesis director).

Subjects/Keywords: Cils; Mouvement ciliaire; Vidéo-Microscopie à haute vitesse; Dyskinésies ciliaires primitives; Correlation phenotype:genotype; Explorations fonctioenlles respiratoires; Cilia; Ciliary motion; High speed video-Microscopy; Primary ciliary dyskinesia; Phenotype:genotype correlation; Lung function tests; 610

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APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Blanchon, S. (2016). Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care. (Doctoral Dissertation). Université Paris-Est. Retrieved from http://www.theses.fr/2016PESC0073

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Blanchon, Sylvain. “Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care.” 2016. Doctoral Dissertation, Université Paris-Est. Accessed January 29, 2020. http://www.theses.fr/2016PESC0073.

MLA Handbook (7th Edition):

Blanchon, Sylvain. “Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care.” 2016. Web. 29 Jan 2020.

Vancouver:

Blanchon S. Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Paris-Est; 2016. [cited 2020 Jan 29]. Available from: http://www.theses.fr/2016PESC0073.

Council of Science Editors:

Blanchon S. Etude de la diversité phénotypique et génotypique des dyskinésies ciliaires primitives : vers une prise en charge personnalisée : Study of the phenotype and genotype diversity in primary ciliary dyskinesia : tomward a personalized care. [Doctoral Dissertation]. Université Paris-Est; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016PESC0073

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