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Hyphessobrycon Durbin é o segundo gênero mais rico em espécies de Characidae, atualmente com 126 espécies válidas. A diagnose original do gênero, modificada por Eigenmann há quase um século, é empregada até hoje, constituindo-se em uma combinação de caracteres não-exclusivos do gênero. A natureza merofilética do gênero vem sendo discutida desde Eigenmann. Recentemente, Weitzman & Palmer propuseram um possível grupo monofilético para Hyphessobrycon, denominado “rosy tetra clade”, com base em características presentes na espécie-tipo, Hyphessobrycon compressus, e mais 25 outras espécies de Characidae. A redescrição e a osteologia da espécie-tipo do gênero, Hyphessobrycon compressus, são apresentadas aqui. A hipótese de monofilia do grupo “rosy tetra” é testada em uma análise mais abrangente de táxons do que aquela de Weitzman & Palmer, através da adição de caracteres e táxons novos à recente filogenia proposta por Mirande em Characidae. A hipótese das relações filogenéticas foi elaborada através da análise de parcimônia com pesos iguais e pesos implícitos, utilizando 227 táxons terminais (sendo 42 espécies de Hyphessobrycon) e 391 caracteres de morfologia externa, osteologia, miologia e ultraestrutura de espermatozoide. Hyphessobrycon milleri é reconhecido como sinônimo júnior de H. compressus. Três lotes de H. compressus são reconhecidos como parátipos. Hyphessobrycon é definido como um grupo monofilético restrito a 24 espécies de Characidae [i.e. (H. compressus (H. pulchripinnis (((H. hasemani, H. haraldschultzi) (Hyphessobrycon troemneri COMB. NOV., H. aff. troemneri)) (H. copelandi (H. takasei, H. minor)) (H. micropterus (H. rosaceus, H. megalopterus, H. bentosi (H. eques (H. sweglesi (H. werneri, H. epicharis)) (H. socolofi (H. pyrrhonotus, H. erythrostigma)))))))), junto com H. khardinae, H. georgettae, H. roseus e H. simulans] com a seguinte sinapomorfia nãoambígua: posição do aparelho de Weber acima da horizontal que passa pela margem dorsal do osso opercular. Uma análise histórica e comparativa das filogenias de Characidae incertae sedis é apresentada, com sugestões de diretrizes para os estudos futuros em sistemática de Characidae, em especial os Tetragonopterinae (sensu Mirande).

Hyphessobrycon Durbin is the second most speciose genus in Characidae, currently with 126 valid species. The original diagnosis of the genus, improved by Eigenmann almost one century ago, is still in use and is given by a combination of characters non-exclusive to the genus. The merophyletic nature of the genus has been discussed since Eigenmann. Weitzman & Palmer have recently proposed a possible monophyletic group for Hyphessobrycon referred as “rosy tetra”, based on features present in the type species, Hyphessobrycon compressus, and other 25 characid species. The osteology and a redescription of the type species of the genus, Hyphessobrycon compressus, are presented. The monophyly of the “rosy tetra” is tested based on a more encompassing analysis than that of Weitzman & Palmer, adding new taxa and characters to the recent…

Advisors/Committee Members: Malabarba, Luiz Roberto.

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Tese de mestrado, Ecologia marinha, 2009, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

Os elasmobrânquios estão bem representados em Portugal continental e ilhas, com mais de 80 espécies de tubarões. Com o aparecimento de artes de pesca que vão cada vez mais fundo e que trazem um número maior de espécies acessórias, começam a aparecer espécies novas (ou raras) para a ciência. Pretende-se com este trabalho, que foi iniciado pela Dra. Mafalda Freitas, clarificar a identificação das espécies de tubarões existentes nas costas de Portugal continental e Ilha da Madeira, em especial das espécies de profundidade, uma vez que são extremamente difíceis de separar morfologicamente devido às semelhanças existentes entre algumas espécies do mesmo género, tornando-se necessário recorrer a métodos complementares, como a morfologia dos dentículos dérmicos. O uso de dentículos dérmicos para fins taxonómicos é pouco conhecido, no entanto já foi utilizado, por exemplo, na identificação das espécies através dos dentículos das barbatanas (neste caso, teve-se em conta o finning retirar as barbatanas dos tubarões deitando a carcaça ao mar). Para comparação dos diversos dentículos, utilizou-se um microscópio electrónico de varrimento para fotografar as amostras recolhidas de tubarões capturados em Portugal continental e Ilha da Madeira e de espécies existentes na colecção do Museu Nacional de História Natural de Lisboa capturados ao largo de Angola mas que existem na costa Portuguesa, pois as amostras recolhidas em lotas seriam insuficientes para se realizar um trabalho de taxonomia como este. Verificou-se que é possível fazer uma separação minuciosa das espécies através dos dentículos dérmicos, embora, de acordo com a bibliografia por mim consultada, existam algumas diferenças entre dentículos de juvenis e adultos / machos e fêmeas dentro da mesma espécie, sendo necessários mais trabalhos com um maior número de amostras e espécies para se poder concluir que os dentículos dérmicos são um bom complemento na identificação de espécies de tubarões

Elasmobranchs are a well represented class in Portugal (continental and islands) with over 80 known shark species. With the increase of fishing methods that can go deeper and have a bigger bycatch, new (or rare) species to science begin to appear. The objective of this work, which was started by Dr. Mafalda Freitas, is to clarify the identification of mainland Portugal and Madeira Island shark species, particularly of deep-water species, since these are difficult to divide morphologically due to the similarities that exist between species of a same genus, becoming necessary to use complementary methods, like dermal denticles morphology. The use of dermal denticles for taxonomic purposes is not well known, however it has been used as a method to identify shark species thru fins dermal denticles (on this case was taken into account the act of finning cut off shark fins and throw the carcass off board). In order to compare all different dermal denticles, a scanning electron microscope was used…

Advisors/Committee Members: Almeida, Armando J..

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Com mais de 5.700 espécies descritas a ictiofauna neotropical é considerada a mais diversa fauna de vertebrados. Os peixes neotropicais representam 20% de todas as espécies de peixes do mundo. Deste modo qualquer tentativa de se entender a completa evolução dos vertebrados deve incluir a diversificação dos peixes na bacia amazônica e regiões adjacentes. Dentre as drenagens que compõem a bacia amazônica, os rios Xingu e Tapajós se destacam pelo grande número de corredeiras e cachoeiras, que ocorrem na área de transição entre o escudo brasileiro e a planície amazônica. Os ambientes de corredeira apresentam um conjunto de características extremas à ictiofauna, requerendo dessa especializações morfofisiológicas e comportamentais. Com aproximadamente 250 espécies válidas, a tribo Ancistrini apresenta forte relação aos ambientes de águas correntosas e são um importante componente da ictiofauna reofílica da ecorregião aquática Xingu-Tapajós. O Xingu e Tapajós são considerados rios historicamente pouco amostrados, e o elevado número de espécies que vem sendo descritas nos últimos anos é um indicativo da necessidade de ampliação de estudos taxonômicos nessa ecorregião. Os recentes investimentos do governo federal na construção de empreendimentos hidroelétricos eleva a um estado de urgência a necessidade do aumento de estudos que visem descrever e elucidar os processos que geraram essas comunidades. Por esses motivos, o presente estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade molecular e estrutura filogenética das comunidades de Ancistrini da ecorregião aquática Xingu- Tapajós a fim de esclarecer os processos ecológicos e históricos responsáveis pelo atual padrão de co-ocorrência de espécies. As análises de DNA barcodes revelaram a existência de 46 espécies de Ancistrini na ecorregião, essas estão distribuídas por 16 gêneros, sendo um deles um provável gênero novo. A elevada concordância do banco de dados molecular e as espécies morfologicamente identificadas, indica a confiabilidade da metodologia de DNA barcoding na identificação/delimitação de espécies, sendo assim uma ferramenta útil ao necessário aceleramento da descrição de novas espécies da ictiofauna neotropical. A importância das interações bióticas sugerida pelas análises de estruturação filogenética de comunidades vai de encontro às teorias propostas para formação de comunidades de peixes em ambientes lóticos. Entretanto algumas evidências apontam que essa diferença pode ser resultado de viés relacionados às escalas taxonômicas e geográficas utilizadas nesse estudo.

With more than 5,700 species described, Neotropical ichthyofauna is considered the most diverse vertebrate fauna of the world. Neotropical fishes represent 20% of all fish species in the world. Therefore any attempt to understand evolution of vertebrates must rely on the understanding of the diversification of fishes in the Amazon basin and adjacent regions. Among the drainages that comprise the Amazon basin, the Xingu and Tapajós are particularly notable for the large number of rapids and…

Advisors/Committee Members: Hrbek, Tomas, Sousa, Leandro Melo de.

▼ As espécies do gênero Hemibrycon Günther (1864) são revisadas e redescritas com base na análise do material tipo e exemplares adicionais. Hemibrycon é considerado monofilético e relacionado ao Clado A sensu Malabarba & Weitzman (2003) com base na análise de 123 caracteres e 45 táxons. No total, 21 espécies de Hemibrycon são reconhecidas, incluindo cinco novas espécies. Hemibrycon n. sp. 1 da bacia superior do río Ucayali, Peru; Hemibrycon n. sp. 2 de pequenos rios de drenagens costeiras do Mar do Caribe, Colômbia; Hemibrycon n. sp. 3 e Hemibrycon n. sp. 4 da porção média da bacia do río Magdalena, Colômbia, e Hemibrycon n. sp. 5 da bacia superior do río Madre de Dios, Peru. Estas espécies distinguem-se, principalmente, pelo padrão de colorido e número de raios ramificados da nadadeira anal, de escamas da linha lateral e de dentes no maxilar. A área de distribuição do gênero é ampliada para a bacia do baixo rio Tocantins, Brasil, com a ocorrência de H. surinamensis nessa bacia, sendo o primeiro registro da espécie para este país. A posição taxonômica de Bryconamericus decurrens e Hemibrycon orcesi é discutida. Novos sinônimos são propostos para algumas espécies de Hemibrycon: H. coxeyi é sinônimo júnior de H. polyodon, H. carrilloi é sinônimo júnior de H. dariensis e H. guppyi é sinônimo júnior de H. taeniurus. É fornecida uma chave de identificação para as espécies examinadas de Hemibrycon. Advisors/Committee Members: Luiz Roberto Malabarba.

▼ O objetivo do presente estudo foi identificar o padrão de distribuição de peixes migradores da bacia hidrográfica do rio Jacuí (Rio Grande do Sul, Brasil), propondo um modelo matemático de distribuição presumida baseado em parâmetros ambientais geomorfológicos. Através de mapas de probabilidade de ocorrência, espera-se contribuir para a tomada de decisões relacionadas ao gerenciamento de bacias hidrográficas. As espécies analisadas foram: Salminus brasiliensis (dourado), Leporinus obtusidens (piava), Prochilodus lineatus (grumatã) e o Pimelodus maculatus (pintado). As amostras foram obtidas a partir de entrevistas com pescadores e moradores locais, percorrendo-se a calha principal dos rios Jacuí, Taquarí-Antas, Vacacaí, Vacacaí-Mirim, Pardo, Pardinh o, Sinos e Caí. A probabilidade de ocorrência de peixes migradores foi ajustado utilizando-se a rotina LOGIT do software Idrisi Andes: P = e (bo + b1.altitude + b2.área de bacia).(1+e(bo + b1.altitude + b2.área de bacia))-1; onde P é a probabilidade de ocorrência da espécie (0-1) e bo, b1 e b2 são os parâmetros da equação. O programa de amostragens resultou em 204 entrevistas, sendo 187 consideradas como válidas em 155 pontos diferenciados. P. maculatus, presente em 109 pontos (70,32%), foi a espécie que apresentou a distribuição mais ampla; enquanto que L. obtusidens, ocorrente em 49 pontos (32,61%), foi a espécie com a distribuição mais restrita. P. lineatus e S. brasiliensis apresentaram resultados intermediários: 68 (43,87%) e 56 pontos (36,13%), respectivamente. A precisão do modelo, para a presença estimada, ficou entre 82% e 93%. Os parâmetros estimados da equação são descritos a seguir: S. brasiliensis: b0= -2,8762 0.2597; b1= -1,3028 0.0332; b2= 1,1487 0,0301; L. obtusidens: b0= -0.8364 0.2213; b1= -1.5564 0.0462; b2= 0,9947 0,0206; P. lineatus: b0= -0.3176 0.2731; b1= -1.3067 0.0544; b2= 0,8128 0,0177; P. maculatus: b0= -0,9487 0.3688; b1= -0,8269 0.0496; b2= 0,9255 0,0304. Advisors/Committee Members: Nelson Ferreira Fontoura.

▼ O presente trabalho pretende analisar os vestígios ósseos de peixes encontrados em escavações nos sítios arqueológicos: Sambaqui do Recreio (LII-18), Sambaqui de Itapeva (RS-LN-201) e Sambaqui da Dorva (LII-43). Os dois primeiros estão situados no município de Torres e o último no município de Três Cachoeiras, litoral Norte do Rio Grande do Sul. O Sambaqui do Recreio possui datação radiocarbônica aproximada de 3.350 50 A.P.* e 3.540 50 A.P., o Sambaqui de Itapeva foi datado em 3.130 40 A.P., e o sítio arqueológico da Dorva têm a data de 1.110 40 A.P. As espécies foram identificadas tendo como base a bibliografia especializada na temática e a utilização de uma coleção óssea de referência. A abordagem interdisciplinar realizada aqui se faz necessária devido à complexidade de múltiplos fatores, tanto culturais quanto naturais, que contribuíram para a formação dos sambaquis. O encontro entre as Ciências Biológicas, História e Geografia possibilitará entender, através dos restos de peixes escavados nestes sambaquis, os modos culturais, sociais e os ambientais que garantiram a formação-criação desta categoria de sítio arqueológico. Através da identificação dos habitats de cada espécie, será possível relacionar estes aos diferentes artefatos de pesca, possibilitando também a compreensão das técnicas empregadas pelos antigos ocupantes dos sambaquis. Por fim, iremos comparar os resultados de cada sítio entre si, para que, desta maneira, possamos alcançar uma compreensão maior da cultura sambaquiana em suas atividades pesqueiras Advisors/Committee Members: Carlos Alberto Santos de Lucena.

▼ Belonidae é composta por 48 espécies de peixes que compartilham o corpo alongado, as nadadeiras dorsal e anal posicionadas posteriormente, nadadeiras pélvicas com seis raios e as maxilas finas e compridas, com dentes grandes e cônicos. Apesar da grande homogeneidade morfológica, técnicas moleculares sugeriram que Belonidae não é monofilética. Com o objetivo de testar a monofilia de Belonidae este estudo foi concebido para realizar uma abrangente análise filogenética de evidência total. Para isto, foi realizada uma análise de máxima parcimônia sem pesagem diferencial dos caracteres, baseada numa matriz com 257 caracteres morfológicos e 4808 pares de bases de sete fragmentos de DNA (nuclear- RAG2, CK e TMO 4C4 e mitocondrial- 12S, 16S, ATPase 6 e 8, Citb) codificados a partir de 104 táxons terminais. O grupo interno foi composto por todas as espécies recentes e fósseis válidas de Belonidae e as populações mais representativas de algumas espécies que apresentam ampla distribuição. Para grupo externo foram selecionadas espécies de quase todos os gêneros válidos de Beloniformes e três representantes da ordem Cyprinodontiformes. A análise encontrou nove árvores igualmente mais parcimoniosas com 8465 passos (IC= 0,35; IR= 0,67). Nossos resultados corroboram a monofilia da superfamília Belonoidea e das famílias Exocoetidae, Scomberesocidae e Zenarchopteridae, e refutam a monofilia da superfamília Exocoetoidea e das famílias Belonidae e Hemiramphidae. Por este motivo, é aqui proposta uma nova composição para a família Belonidae, com a anexação dos gêneros atualmente em Scomberesocidae. Esta nova classificação restaura a monofilia de Belonidae, que é fortemente suportada por 20 sinapomorfias morfológicas e 19 moleculares. Em seu novo arranjo, a família Belonidae está composta por 14 gêneros distribuídos em quatro subfamílias: Beloninae, Platybeloninae, Potamorrhaphinae e Strongylurinae. Todos os gêneros de Belonidae são monofiléticos, a exceção de Strongylura, que para tornar-se monofético deve ter suas espécies alocadas em quatro gêneros: Strongylura, Dorybelone e dois gêneros novos. São apresentadas diagnoses filogenéticas para todas as subfamílias e gêneros, além de discutidas hipóteses de evolução dos principais caracteres morfológicos. Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

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Tese de mestrado, Ecologia e Gestão Ambiental, 2010, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

Foram realizados censos visuais em mergulho com escafandro autónomo durante a Primavera e Verão de 2009 com o objectivo de caracterizar as associações de peixes do Porto de Recreio de Oeiras. Nestes mergulhos foram identificadas 46 espécies de peixes pertencentes a 20 famílias diferentes. A maioria das espécies amostradas é característica de zonas marinhas de substrato rochoso, sendo as espécies mais comuns e com distribuição mais ampla no interior do Porto de Recreio: Atherina presbyter, Diplodus sargus, Diplodus vulgaris, Ctenolabrus rupestris e espécies da família Mugilidae. Compararam-se as abundâncias e frequências de ocorrência em três zonas distintas no interior do Porto de Recreio: A (zona do molhe de abrigo na entrada do Porto); B (zona de pontões flutuantes) e C (zona de enrocamento abrigada). O índice de Shannon- Wiener revelou uma diversidade decrescente da zona A para a zona C, apresentando a zona C uma diversidade significativamente mais baixa do que as zonas A e B. Realizou-se uma análise de correspondência (CA) que revelou uma clara separação entre a zona B e as zonas A e C. Espécies especialmente abundantes, como A. presbyter e D. vulgaris, posicionaram-se entre as zonas A e C, enquanto G. gasteveni, D. cervinus, D. bellottii e G. cobitis apresentam uma fraca associação em qualquer dos grupos formados, ocupando uma posição afastada em relação às zonas consideradas.

Underwater surveys were carried out in the Oeiras Harbor along the spring and summer of 2009 in order to identify the fish assemblages present inside this artificial structure. During these months 46 species belonging to 20 different fish families were identified. Most species are typically marine rocky subtidal species. The most common and widely distributed species inside the Oeiras Harbor were: Atherina presbyter, Diplodus sargus, D. vulgaris, Ctenolabrus rupestris and several Mugilidae species. Relative abundances and frequencies were estimated in three distinct areas inside the study area: A (artificial rocky area near the entrance of the harbor); B (floating piers) and C (sheltered artificial rocky area). Analysis of the Shannon-Wiener index revealed a decreasing diversity from area A to area C, with the diversity in C being significantly lower when compared with A and B. Correspondence analysis (CA) revealed the distinctiveness of area B, when compared with areas A and C. Species A. presbyter and D. vulgaris, were particularly abundant and were mainly found in areas A and C while G. gasteveni, D. cervinus, D. bellottii e G. cobitis were not associated to any of these groups.

Advisors/Committee Members: Cabral, Henrique N., 1969-.

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Tese de mestrado, Ecologia e Gestão Ambiental, 2008, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

A susceptibilidade da enguia-europeia à degradação ambiental do estuário do Tejo foi investigada em duas vertentes: contaminação biológica pelo nemátode parasita Anguillicola crassus e contaminação química por metais pesados (Cd, Cu, Pb e Zn). Para tal, foram capturadas enguias e recolhidas amostras de sedimento em quatro locais da área de estudo. A análise de ambas as contaminações foi efectuada em função de algumas variáveis biológicas (sexo e tamanho) e da variação espacial. A sua influência na condição dos indivíduos foi também avaliada. A infecção por A. crassus atingiu mais de metade da amostra com uma intensidade de dois parasitas por enguia infectada. Não se encontraram variações do parasitismo com o sexo dos hospedeiros. Contudo, em relação ao tamanho, as enguias maiores apresentaram um maior número de nemátodes. Quanto aos locais, registou-se uma menor prevalência da infecção nas enguias capturadas em águas com maior salinidade. A concentração de metais pesados nos tecidos (fígado e músculo) não variou de acordo o sexo dos indivíduos. Contudo, em relação ao tamanho, a concentração dos metais não essenciais (Cd e Pb) diminuiu com o comprimento das enguias, contrariamente à concentração dos metais essenciais (Cu e Zn) presentes no fígado, que aumentou. Quanto aos locais, observou-se uma concentração superior de cobre e zinco nos tecidos das enguias capturadas na estação com maior contaminação do sedimento, tendo-se verificado o oposto para o cádmio e o chumbo. Apesar de considerados prejudiciais para o sucesso reprodutivo da espécie, no presente estudo, não se observaram impactos negativos na condição das enguias como consequência, quer da contaminação biológica, quer da contaminação química. Assim, torna-se necessária uma avaliação dos impactos específicos na condição das enguias que contemplem aspectos fisiológicos, histológicos e citológicos, bem como uma monitorização contínua da sua qualidade, de modo a estabelecer medidas de gestão que assegurem a recuperação desta espécie em risco e que, em simultâneo, possam contribuir para a melhoria da qualidade do ambiente aquático

European eel susceptibility to environmental degradation was investigated in the Tagus Estuary focusing on biological contamination by the parasite nematode Anguillicola crassus and chemical contamination by heavy metals (Cd, Cu, Pb and Zn). In order to achieve that goal, eels were captured and sediment samples were collected in four stations within the study area. Analyses of both contaminations were performed in relation to some biological variables (sex and size) and spatial variation. Their influence on individual fitness was also evaluated. A. crassus infection was present in more than half of the sample with intensity of two parasites per infected eel. No significant variation in parasitism was found according to eel's sexes. However, in relation to size, larger eels presented more nematodes. Spatial variations revealed a…

Advisors/Committee Members: Domingos, Isabel Maria Madaleno, Caçador, Maria Isabel Violante.

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O gênero Ageneiosus é revisado e uma hipótese das relações filogenéticas inter- e intra-genérica é proposta. A revisão taxonômica contou com o exame do material tipo disponível e consulta às descrições originais. A validade das espécies foi testada por meio de comparações estatísticas das medidas e contagens e análises qualitativas dos caracteres de anatomia interna e externa. Espécies conclusivamente válidas foram consideradas no estudo de relações filogenéticas. A análise filogenética incluiu 239 caracteres codificados para 41 táxons terminais. Ageneiosus, até então reconhecido numa composição com 12 espécies, é composto por 19 espécies válidas, algumas das quais amplamente distribuídas por grandes rios da América do Sul. Ageneiosus pardalis é a única espécie trans-Andina no gênero. Ageneiosus marmoratus é um sinônimo júnior de Ageneiosus inermis. Ageneiosus dentatus e Ageneiosus rondoni são espécies válidas e seus nomes são retirados da sinonímia de Ageneiosus ucayalensis e Ageneiosus brevis, respectivamente. Seis espécies novas foram reconhecidas. A análise de parcimônia resultou em uma única árvore mais parcimoniosa com 631 passos, índice de consistência 0,52 e índice de retenção 0,85. A monofilia de Ageneiosus é corroborada e sua diagnose inclui 10 caracteres sinapomórficos exclusivos entre os Auchenipteridae. O gênero é composto por dois grandes clados: (1) composto pela maioria das espécies com bexiga natatória grande e não ossificada e (2) composto por Ageneiosus pardalis e pelas espécies com bexiga natatória reduzida e ossificada em indivíduos grandes. É proposta a revalidação do gênero Tympanopleura para o primeiro clado. O clado Ageneiosus- Tympanopleura é grupo-irmão de Tetranematichthys e o clado composto por esses gêneros é grupo-irmão de (Entomocorus, (Auchenipterus, (Epapterus, Pseudepapterus))). É apresentada uma chave para identificação de todas as dezenove espécies válidas de Ageneiosus.

The catfish genus Ageneiosus is revised and a new hypothesis of phylogenetic relationships inter- and intra-generic is proposed. The taxonomic revision was based on the examination of available type specimens and analysis to the original descriptions. Taxonomic accuracy of the species was tested by morphometric, meristic and qualitative analyses of internal and external anatomy. Valid species were considered in the study of phylogenetic relationships. The phylogenetic analysis included 239 characters coded for 41 terminal taxa. Formerly with 12 species, the genus Ageneiosus comprises currently 19 species recognized herein as valid, some of which are widely distributed across large rivers in South America. Ageneiosus pardalis is the only trans-Andean species in the genus. Ageneiosus marmoratus is a junior synonym of Ageneiosus inermis. Ageneiosus dentatus and Ageneiosus rondoni are valid species and their names are removed from the synonymy of Ageneiosus ucayalensis and Ageneiosus brevis, respectively. Six new species are recognized. The parsimony analysis resulted in a single most parsimonious tree with 631…

Advisors/Committee Members: Py-Daniel, Lúcia H. Rapp.

▼ Com base na análise morfológica de 153 caracteres de 53 táxons de Aspredinidae são propostos os seguintes resultados: a) Acanthobunocephalus e Bunocephalus como grupos monofiléticos e com suas inter-relações resolvidas; b) oito espécies novas de aspredinídeos, sendo que cinco delas já mencionadas por Friel (Acanthobunocephalus sp. nov. 1., Acanthobunocephalus sp. nov. 2., Acanthobunocephalus l sp. nov., Amaralia sp. nov. e Ernstichthys sp. nov.) e três descobertas durante o desenvolvimento deste estudo (Acanthobunocephalus sp. nov. 3., Acanthobunocephalus sp. nov. 4 e Bunocephalus sp. nov.); c) transferência de algumas espécies de Bunocephalus (B. amazonicus, B. bifidus, B. iheringii, B. quadriradiatus e B. rugosus) para Acanthobunocephalus; d) Bunocephalus aloikae como uma espécie válida e não como sinônimo de Bunocephalus amaurus; e) chave para as espécies de Acanthobunocephalus e Bunocephalus; e) uma nova classificação para Aspredinidae; e f) corroboração da hipótese de que Aspredinidae é grupo irmão do clado asiático Sisoroidea (Amblycipitidae, Akysidae, Sisoridae e Erethistidae), como proposto por de Pinna, Britto e Diogo, Vandewalle & Chardon, e não de Doradoidea como sugerido por Friel e Sullivan, Lundberg & Hardman. Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

▼ Loricariidae é uma das mais diversas famílias de peixes, atualmente incluindo cerca de 800 espécies reconhecidas. Os loricarídeos são popularmente conhecidos como cascudos ou acaris e têm tamanho de poucos centímetros a mais que um metro. São encontrados somente em água doce, com ampla variação tanto na temperatura, como tipo de ambiente, ou seja, podem ser encontrados desde em córregos frios das montanhas até em lagos da área de inundação do rio Amazonas. A distribuição do grupo é ampla, abrangendo praticamente todas as bacias hidrográficas da América do Sul e parte da América Central, da Argentina até a Costa Rica. Apesar das primeiras espécies terem sido descritas por Linnaeus em 1758 e do trabalho realizado deste então, especialmente nos últimos 15 anos, as relações filogenéticas dos loricarídeos estão apenas parcialmente resolvidas. Os resultados das análises moleculares são conflitantes com os agrupamentos propostos pelas análises morfológicas e um consenso ainda não foi alcançado. Os grupos mais problemáticos são as subfamílias Hypostominae, Hypoptopomatinae e Neoplecostominae. Os estudos morfológicos e moleculares sugerem que Hypoptopomatinae e Neoplecostominae formam um grupo monofilético, porém a monofilia das mesmas ainda é incerta. Por esta razão, o principal objetivo da presente tese é testar a monofilia destas duas subfamílias atráves de uma análise de evidência total. Num primeiro estudo, sequências de um fragmento de 709 pares de bases da primeira subunidade do gene mitocondrial citocromo c oxidase (COI) foram usadas. As análises de Máxima Parcimônia (MP) e de Máxima Verossimilhança (ML) incluíram dados de 83 espécies, pertencentes a 29 gêneros, representando cinco subfamílias de Loricariidae. Adicionalmente, oito espécies de quatro famílias próximas foram usadas como grupo externo. Os resultados confirmaram Delturinae como a subfamília mais basal e mostraram a Hypoptopomatinae + Neoplecostominae como grupo irmão de Hypostominae. Corroborando estudos moleculares anteriores, Neoplecostominae é monofilética somente quando incluído o gênero Pseudotocinclus (Hypoptopomatinae). Neoplecostominae ficou inserida dentro de Hypoptopomatinae, que assim formou um grupo parafilético. Num segundo estudo, foram adicionados mais táxons e sequências parciais dos genes nucleares recombination activating gene 1 (RAG1) e 2 (RAG2) e F-Reticulon 4, resultando na análise de 136 espécies e 4678 pares de bases. As análises de MP, ML e Bayesianas confirmaram a maioria dos resultados moleculares anteriores, exceto pela polifilia de Pareiorhaphis, Neoplecostomus e Neoplecostominae. A análise final dos dados constituiu uma análise de evidência total, com o intuito de compreender melhor os conflitos entre as análises morfológicas e moleculares e encontrar, assim, uma solução mais robusta para o grupo. O novo conjunto de dados inclui 207 espécies e sequências concatenadas de COI, RAG 1 e RAG2, bem como 472 caracteres morfológicos de estudos anteriores, resultando na maior filogenia de bagres já elaborada. A análise de MP confirmou… Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

▼ A anatomia e osteologia de Parotocinclus maculicauda (Steindachner, 1877) são descritas e comparadas com outros loricariídeos e astroblepídeos examinados. O esqueleto de Parotocinclus maculicauda exibe fusões, reduções de tamanho e de número de óssos, entre outros. Novas estruturas ou elementos ósseos não descritos previamente na literatura tradicional, são descritos. Em adição, este hypoptopomatíneo foi utilizado como um modelo descritivo na busca de caracteres informativos para o estudo filogenético da subfamília Hypoptopomatinae. Baseado em 169 caracteres de osteologia e morfologia externa, foi realizada uma análise filogenética de 114 táxon terminais de loricariídeos, especialmente das subfamílias Hypoptopomatinae e Neoplecostominae. Os resultados permitem a re-diagnose da subfamília Hypoptopomatinae, reconhecendo 24 gêneros. Cinco agrupamentos monofiléticos são reconhecidos como gêneros novos, e 34 novas espécies são identificadas. Não foi encontrado suporte para demonstrar a monofilia de Otothyrini e as tribos previamente reconhecidas dentro de Hypoptopomatinae não são mantidas neste estudo. A inclusão de representantes de outras subfamilias de Loricariidae na análise forneceu um melhor entendimento das relações filogenéticas e da biodiversidade dos Loricariidae. Complementarmente, uma nova espécie de hypoptopomatíneo do gênero Otocinclus é descrita de duas localidades no alto rio Amazonas. O novo táxon pode ser facilmente distinguido dos outros congêneres, exceto Otocinclus cocama, pela presença de uma única marca, fortemente pigmentada, em forma de morcego, na parte posterior da nadadeira caudal. De O. cocama a nova espécie é distinguida pelo padrão de colorido, que consiste em uma larga faixa lateral escura.A nova espécie é possivelmente mais proximamente relacionada a um clado formado por O. huaorani, O. mariae, O. bororo, O. mura e O. cocama. Finalmente, Otocinclus arnoldi da bacia do rio da Prata é revalidado da sinonímia de O. flexilis, descrito da bacia do rio Jacuí. Também, Otocinclus mimulus de um tribuitário do Rio Paraná, é considerado sinônimo júnior de Otocinclus arnoldi. Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

▼ A diversidade morfológica da fauna de peixes de água doce Neotropical é considerada a maior dentre as ictiofaunas epicontinentais do planeta. Esta é notavelmente maior que as estimativas, podendo chegar a um total de 8.000 espécies. A grande maioria dessas espécies está incluída na superordem Ostariophysi a qual representa cerca de 25% das espécies de ambos água doce e salgada. Sua grande diversidade ecológica e evolutiva faz deste grupo foco de estudos morfológicos e evolutivos. Uma das ordens, os Characiformes apresenta uma ampla diversidade morfológica na forma do corpo, tamanho, assim como na sua estrutura dentaria. Desta forma este trabalho tem como objetivo principal descrever e investigar, comparativamente representantes da ordem quanto ao aspecto da dentição, seja os próprios dentes funcionais e de substituição ou as estruturas onde os mesmos estão apoiados e/ou localizados. Para isso, foram utilizadas as técnicas da microscopia eletrônica de varredura para descrever as ultra-estruturas e as histológicas para descrever morfologicamente os dentes de substituição, os processos de fixação dos dentes funcionais e a disposição dos dentes de substituição; acrescido a isto foi feito o exame de ossos que formam parte abertura oral. Todos estes processos tiveram como finalidade buscar padrões morfológicos entre os representantes da ordem, podendo ser estes padrões informativos ou não para as atuais hipóteses filogenéticas do grupo. Secundariamente, verificar através dos resultados informativos obtidos, a corroboração das atuais. Foram analisadas 25 espécies representantes das 18 famílias da ordem. Ressalta-se aqui os seguintes caracteres que corroboraram a hipótese de Calcagnotto et al. (2005: fig. 53) de relações próximas entre Anostomidae, Chilodontidae, Prochilodontidae, Hemiodontidae e Parodontidae: organização dos prismas de esmalte em rede dos dentes do pré-maxilar (9.2), independentemente adquirido em Alestidae; implantação do dente funcional no lábio (10.2), independentemente adquirido em Hemiodontidae; desenvolvimento dos dentes de substituição no tecido conjuntivo do lábio (12.2), reverso a uma condição primitiva em Anostomidae; desenvolvimento dos dentes de substituição em grupos, envolvidos por uma camada de tecido conjuntivo (15.0), reverso a uma condição primitiva em Anostomidae; células odontoblastos largas (19.2), não codificado em Prochilodontidae, e região da polpa dos dentes funcionais ampla, sem limite posterior identificável (20.0), reverso a uma condição primitiva em Prochilodontidae. O clado formado por Hemiodus e Apareiodon de Calcagnotto et al. 2005 é sustentado pelo caráter dentes de substituição em mais de duas fileiras horizontais (16.0), não codificado para Prochilodontidae. A condição do caráter desenvolvimento dos dentes de substituição em cavidade de substituição (sensu Brewster, 1986) (14.0), corrobora a relação de Charax e Roeboides proposta por Lucena (1987, 2003). A análise feita aqui mostrou caracteres únicos para alguns dos gêneros estudados. Podemos citar: superfície do dente na… Advisors/Committee Members: Carlos Alberto Santos de Lucena.

▼ Compsurini é uma tribo de Cheirodontinae conhecida por abrigar as espécies inseminadoras da subfamífia, também caracterizadas por incomuns modificações morfológicas relacionadas ao dimorfismo sexual dos machos. A tribo foi definida por Malabarba, Weitzman & Burns, e se revelou monofilética dentro da filogenia de Cheirodontinae (Malabarba, 1998); porém, a relação entre seus integrantes se mostrou instável quando Malabarba (1998) adicionou novos terminais à análise, cujo a busca de carácteres havia sido focada nos Cheirodontini. Com a descrição de novas espécies após a análise de Malabarba (1998) e a descoberta de oito possíveis novas espécies para a tribo Compsurini, uma análise filogenética dos integrantes de Compsurini foi desenvolvida com o objetivo de testar a monofilia da tribo e elucidar as relações entre seus integrantes. Uma hipótese das relações filogenéticas das espécies de Compsurini foi elaborada através da análise de parcimônia com peso implícito baseada em 278 caractéres abrangendo morfologia externa, osteologia, miologia e ultraestrutura de espermatozóides. Nesta análise. tanto Cheirodontinae quando Compsurini formaram grupos monofiléticos. As novas sinapomorfia: que sustentam Compsurini são: 1) distância entre as extremidades distais dos processos laterais do mesetmóide igual ou menor que sua base; 2) ganchos da nadadeia anal anteriormente direcionados, curvados sobre a superfície lateral dos raios; 3) raios nadadeira anal com ganchos concentrados na sua metade ou terço distal; 4) nadadeira mais pigmentada na sua margem distal nos machos maduros; 5) peça intermediária dos espermatozóides não truncada posteriormente, com canal citoplasmático mais longo que o metade do comprimento do núcleo; e 6) espermatozóides com um grande de vesículas globulares. Dentro de Compsurini, duas espécies novas da bacia amazônica sem dimorfismo sexual na nadadeira caudal formam o grupo irmão de todos os outros integrantes da tribo. Os gêneros Kolpotocheirodon, Saccoderma, e Compsura, este último com duas espécies novas, se mostraram monofiléticos nesta análise. As espécies da américa central, "Compsura" gorgonae, "Odontostilbe" dialeptura e "Odontostilbe" mitoptera, formaram um clado monofilético, grupo irmão do gênero trans-andino Saccoderma, cujas sinapomorfias são referentes ao dimorfismo sexual e ultraestrutura de espermatozóides, suportando a criação de um novo gênero para abrigar estas três espécies até então rnantidas em gêneros provisórios. Na revisão taxonômica realizada em paralelo à análise filogenética, o gênero Comnpsura é redescrito juntamente coma descrição de duas espécies novas das bacias do rio Guaporé e Araguaia. O gênero Macropsobrycon é redefinido e aqui considerado monotípico com M. uruguayanae como espécie tipo. Saccoderma também é redescrito e restringido a duas espécies válidas, S. hastata e S. melanostigma, sendo as espécies S. Falcata e S. Robusta consideradas sinônimos de S. hastata. Três gêneros e seis novas espécies da tribo são descritas para o alto curso de tributários amazônicos, juntamente… Advisors/Committee Members: Luiz Roberto Malabarba.

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O gênero monotípico Schizolecis foi proposto por Britski & Garavello (1984), com Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 a espécie-tipo. Sua distribuição ocorre do norte do estado de Santa Catarina até o norte do estado do Rio de Janeiro, Brasil, compreendendo diversas bacias hidrográficas costeiras. Devido ao fato do gênero estar amplamente distribuído em bacias hidrográficas isoladas, sugeriu-se que haveria a possibilidade de mais de uma espécie estar incluída no que hoje conhecemos como Schizolecis guntheri. Para testar essa hipótese, foram realizadas as seguintes análises morfométricas: biometria tradicional e comparação de intervalo de proporções; análises multivariadas de Componentes Principais e Variáveis Canônicas e análises multivariadas de morfometria geométrica utilizando Relative Warps. Não foram encontradas diferenças significativas entre os indivíduos das populações analisadas de Schizolecis guntheri, sendo detectado apenas um dimorfismo sexual entre os exemplares pertencentes à Baía da Ilha Grande, no estado do Rio de Janeiro. Foi realizada uma revisão taxonômica, juntamente com a redescrição de gênero e espécie. Conforme resultados, conclui-se que todas as populações nas diversas bacias hidrográficas costeiras, de Santa Catarina ao Rio de Janeiro, são uma única espécie, Schizolecis guntheri.

The genus monotypical Schizolecis was proposed by Britski & Garavello (1984), being Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 the type species. Its distribution occurs from the north of the state of Santa Catarina until the north of the state of Rio de Janeiro, Brazil, comprising several coastal river basins. Due to the act that the genus is widely distributed in such isolated river basins, it was suggested the possibility of more than one species being included in what today we know as Schizolecis guntheri. To test this hypothesis, the following morphometric analysis were performed: tradition biometry and comparision of the interval of proportions; multivariate analyses of Principal Components and Canonical Variables and multivariate analyses of geometric morphometry using Relative Warps. Perceptible differences were not found among the individuals of the populations analyzed of Schizolecis guntheri, being only detected a gender dimorphism among the samples from Baía da Ilha Grande, in the state of Rio de Janeiro. A taxonomic revision was performed, together with a redescription of the genus and species. According to the results, it is concluded that all populations in differents coastal river basins of the state of Santa Catarina until the state of Rio de Janeiro, are a single species Schizolecis guntheri.

Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

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A filogenia da família Callichthyidae (Siluriformes) foi estudada realizando uma análise de Parcimônia Cladística sob uma abordagem de Evidência Total. Caracteres explorados foram principalmente baseados em osteologia e dados moleculares de genes nucleares e mitocondriais. O grupo interno incluiu 131 terminais representando 111 espécies; o grupo externo incluiu 13 terminais representando 13 espécies e incluindo Copionodon como o terminal de enraizamento da topologia. A análise filogenética resultou em 89 árvores mais parcimoniosas que foram resumidas em um cladograma de consenso estrito; com base nessa topologia, se propõe e discute uma nova classificação filogenética para Callichthyidae. A análise filogenética de Evidência Total corroborou o monofiletismo da família Callichthyidae, subfamílias Callichthyinae e Corydoradinae, gêneros Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis e Scleromystax. No entanto, os gêneros Aspidoras, Corydoras e Hoplosternum foram recuperados nãomonofiléticos. Para conciliar esta situação, se propõe a revalidação dos gêneros Hoplisoma e Gastrodermus para acomodar a maioria das espécies atualmente reconhecidas em Corydoras. Aspidoras virgulatus e Corydoras lacerdai foram transferidas para Scleromystax e assim conceber esses gêneros como monofiléticos. Por outro lado, as espécies de Hoplosternum foram recuperadas como parafiléticas. No entanto, decidiu-se não fazer mudanças taxonômicas no momento até concluir a coleta de dados moleculares para este grupo, o qual é reconhecido temporariamente como Hoplosternum. Sinapomorfias para cada clado recuperado e proposto na classificação filogenética são aqui mostrados, enfatizando seus caracteres morfológicos diagnósticos. Inter-relações entre as espécies e clados são discutidas e comparadas com estudos taxonômicos e hipóteses filogenéticas anteriores. Adicionalmente, a taxonomia de Hoplisoma nattereri foi revisada a fim de elucidar sua sinonímia e investigar a presença de diversidade críptica sob este nome. Hoplisoma nattereri e H. triseriatus são consideradas espécies válidas. A distribuição geográfica para cada espécie é reportada. Corydoras juquiaae é removida da sinonímia de Hoplisoma nattereri e transferida para Scleromystax juquiaae, nova combinação. Scleromystax prionotos é considerada um sinônimo júnior de S. juquiaae. Todas estas espécies são ilustradas neste artigo. Também, a figura original de Corydoras juquiaae preparada, mas nunca publicada, por Rudolph von Ihering é aqui reproduzida. As relações filogenéticas de Hoplisoma nattereri e H. triseriatus foram discutidas como assim a sua morfometría e a distância genética de algumas das populações amostradas.

The phylogeny of the family Callichthyidae (Siluriformes) was investigated performing a Cladistic parsimony analysis under a Total Evidence approach. Characters explored are mainly based in osteology and molecular data of nuclear and mitochondrial genes. The ingroup included 131 terminals representing 111 species, the outgroup included 13 terminals representing 13 species…

Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

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A partir das diferentes análises filogenéticas previamente propostas e do conhecimento de cinco novos táxons pertencentes à Hypoptopomatini, surgiram questionamentos a respeito das relações de parentesco dentro da tribo. Assim, a fim de esclarecer as relações filogenéticas e testar o monofiletismo de Hypoptopoma, testar a hipótese de sinonímia de Nannoptopoma e Hypoptopoma, e testar as posições de Niobichthys e de Otocinclus, o estudo tem como objetivo apresentar uma hipótese de relações para Hypoptopomatini, incluindo a maioria das espécies de Hypoptopoma, cinco possíveis novos táxons e os demais gêneros da tribo. Foi construída uma matriz de 101 caracteres morfológicos, do quais 82 foram retirados da literatura e 19 novos propostos, analisados em 65 táxons terminais. Foram realizadas buscas heurísticas com o programa TNT através de múltiplos Random Addition Sequences seguida de rearranjos dos ramos Tree Bissection and Reconnection. Ao encontrar 64 árvores maximamente parcimoniosas com 443 passos, índice de consistência 0.34 e índice de retenção 0.81, essas árvores foram sumarizadas em um cladograma de consenso estrito. Os resultados encontrados corroboram a monofilia de Hypoptopomatinae e de Hypoptopomatini. A tribo é formada por seis gêneros já descritos: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus e Oxyropsis; e por dois gêneros novos. Adicionalmente, demonstra-se que Otocinclus é o gênero mais basal da tribo; Acestridium e Niobichthys são grupos-irmãos, mais relacionados com um clado formado por dois grupos monofiléticos: Nannoptopoma + Novo Táxon A, e Novo Táxon B + Oxyropsis + Hypoptopoma. O conhecimento acerca das relações filogenéticas, da classificação e da taxonomia de Hypoptopomatini muda, sendo feitas sugestões para futuras mudanças nomenclaturais

Previous phylogenetic analyses and the discovery of five new taxa of Hypoptotopomatini raised doubts concerning the relationships of the tribe. Therefore, in order to elucidate the phylogenetic relationships and to test the monophyly of Hypoptopoma and Nannoptopoma, and to test the position of Niobichthys and Otocinclus, the present study aims to provide an encompassing hypothesis of relationships among the Hypoptopomatini, comprising most species of Hypoptopoma, five new taxa and the other genera of the tribe. We analyzed a data matrix of 101 morphological characters, 82 of which from the literature and 19 new characters are suggested, with the inclusion of 65 terminals. The analyses were conducted using the heuristic searching algorithm of multiple Random Addition Sequence (RAS) followed by branch swapping with the algorithm Tree Bissection and Reconnection (TBR). The analysis resulted in 64 maximally parsimonious trees of 443 steps, consistency index of 0.34 and retention index of 0.81. The 64 primary cladograms were then summarized in a strict consensus tree. The result confirms the monophyly of Hypoptopomatinae and Hypoptopomatini. The tribe comprises six known genera: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus…

Advisors/Committee Members: Roberto Esser dos Reis.

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Os peixes neotropicais de água doce são os mais abundantes em termos de espécies, e os peixes da família Characidae têm a maior diversidade entre eles. O gênero Astyanax contém 130 espécies, que se encontram em condição de incertae sedis em termos sistemáticos. Porém, as espécies podem ser diferenciadas com estudos de padrões morfológicos, citogenéticos e moleculares. As populações do gênero Astyanax do ribeirão São Bartolomeu de Minas Gerais, Brasil, nunca foram identificadas. Neste estudo, peixes do gênero Astyanax de duas represas da Universidade Federal de Viçosa foram analisados usando técnicas citogenéticas, incluindo coloração convencional (Giemsa), padrões de hetecromatina (banda-C), regiões de omrganizadores nucleolares (NOR) e hibridização fluorescente in situ. Os dados cromossômicos foram comparados com os caracteres morfológicos de cada espécime (número de raios da nadadeira anal, número de escamas na linha lateral, disposição das escamas e padrões dentários). Os cariótipos de 4m+18sm+22st+6t e 10m+20sm+12st+6t para A. giton e A. fasciatus não têm sido registrados anteriormente, e para A. giton, isto é o segundo cariótipo para esta bacia. As sequências de mtDNA de COI indicam que A. giton é próxima de A. giton da mesma bacia e mais distante de A. scabripinnis e A. intermedius, e Astyanax aff. fasciatus é no mesmo clado de outros A. fasciatus e A. parahybae.

Neotropical freshwater fish are the most abundant vertebrate species, with Characidae fish representing the greatest diversity among them. The genus Astyanax contains approximately 130 species, all of which are currently considered incertae sedis in systematic terms. Because of vague original descriptions, many local populations are difficult to identify. In these cases, the combined analysis of morphological, cytogenetic and molecular data may provide useful information for determining their taxonomic status. We applied this approach on two populations of Astyanax occurring in the São Bartolomeu Creek of Minas Gerais State, Brazil, a tributary of the Doce River Basin. Morphological characters included the analysis of lateral line scales, teeth, anal fin rays. Cytogenetic techniques included conventional coloration (Giemsa), heterochromatin patterns (C-Banding), nucleolar organizer regions (NORs) and fluorescentin situ hybridization (FISH). Molecular techniques were performed using a 634 bp cytochrome oxidase subunit I fragment of mitochondrial DNA. All characters indicate that both species are Astyanax giton and Astyanax fasciatus respectively. The karyotypes of 4m+18sm+22st+6t for 10m+20sm+12st+6t and A. giton and Astyanax aff.fasciatus respectively had not been previously reported, and for A. giton, this is the second karyotype in the Doce River Basin and the first incidence of B chromosomes. The mtDNA sequence COI indicate that A. giton is closely associated to other A. giton from the same basin and more distantly related to Astyanax scabripinnis and Astyanax intermedius, whereas Astyanax aff.fasciatus forms a strongly supported clade with A.…

Advisors/Committee Members: Rubens Pazza, José Cola Zanuncio, Jorge Abdala Dergam dos Santos.

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O capítulo 1 trata da sistemática do gênero Microglanis. No capítulo 2, duas novas espécies de Microglanis são descritas para a bacia do Leste. Foram examinados 226 espécimes provenientes de rios litorâneos, desde a foz da bacia do rio São Francisco até as drenagens da Lagoa dos Patos. Microglanis sp. n. 1, do rio Potinga, da baía de Paranáguá, próximo aos municípios de Guaraqueçaba e Morretes (PR), difere das demais espécies costeiras por apresentar uma coloração do pedúnculo caudal diferenciada. Microglanis sp. n. 2, do rio São João, próximo a Cabo Frio (RJ), é diagnosticada de outras espécies litorâneas por possuir uma mancha nucal clara em forma de duas elipses unidas pelas margens (vista dorsal da cabeça), pelo comprimento da cabeça e pela largura do corpo. O padrão de coloração permitiu discriminar o gênero Microglanis em dois complexos: o grupo parahybae, que ocorre entre rio o Paraíba do Sul (RJ) até a foz do rio São Francisco (AL / SE); e o grupo cottoides, que tem distribuição do rio Ribeira de Iguape (SP) até as drenagens da Lagoa dos Patos (RS). Já o capítulo 3, uma nova espécie do gênero Microglanis é descrita da bacia do médio-alto rio São Francisco. Microglanis sp. n. 3 distingue-se de outras espécies de Microglanis por apresentar a seguinte combinação de caracteres: faixa nucal clara e fina, às vezes descontínua; comprimento da cabeça, comprimento do espinho da nadadeira dorsal, comprimento do espinho da nadadeira peitoral e altura do pedúnculo caudal.

The first chapter deals with the systematics of the genus Microglanis. In chapter 2 two new species of Microglanis were described from Leste basin of Brazil. A number of two hundred twenty six specimens were examined deriving from coastal rivers, from the mouth of rio São Francisco mouth to Lagoa dos Patos. Microglanis sp. n. 1, from rio Potinga, in the Paranaguá bay State of Paraná, differs from all other coastal species by present a peculiar caudal peduncle coloration. Microglanis sp. n. 2, from rio São João (State of Rio de Janeiro) is distinguished from all other coastal drainages by the presence of a light blotch on the nape with shape of two ellipses united by the margin (dorsal view of the head), by head length and by body width. The colour pattern allowed discriminate the genus in two assembly: “parahybae” group, whose occurrence is from rio Paraíba do Sul (Rio de Janeiro State) to rio São Francisco mouth (between Alagoas and Sergipe State); and “cottoides” group, that occur from rio Ribeira de Iguape (State of São Paulo) to Lagoa dos Patos drainages (State of Rio Grande do Sul). Already the third chapter,a new species of the genus Microglanis is described from the midle-upper rio São Francisco basin. Microglanis sp. n. 3 is distinguished from its congeners by the presence of a slim light band across the nape, sometimes interrupted, head length, dorsal spine length, pectoral spine length and caudal peduncle depth.

Advisors/Committee Members: Oscar Akio Shibatta ., Francisco Langeani Neto, Alberto S. Fenocchio.

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Tese de mestrado. Biologia (Ecologia Marinha). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015

The objective of this study was to assess the variability in condition for juvenile common two-banded sea bream Diplodus vulgaris in nursery areas of the main Portuguese estuaries using several individual condition indices. Estuaries and coastal lagoons play an important role for juveniles of marine fish because they offer areas with high availability of food, high water temperature and lower predation. These characteristics permit a fast and safe growth of fish until they reach adequate size to return to the ocean and to join adult populations. In this study, two indices estimated by analysis of otolith microstructure were used: widths of the 10 last and of the 60 first daily increments were considered as recent growth index and initial growth index, respectively. Furthermore, two common condition indices were also used: biochemical RNA:DNA ratio, that assesses nutritional status of individuals, and morphometric Fulton's K, that gives an estimate of general well-being of individuals. Since recent growth index and RNA:DNA ratio were significantly related with total length of individuals, a correction was performed and corrected condition indices recent growth’ index and RNA:DNA’ ratio were considered. Fulton's K was also significantly related with total length of juveniles and for this reason was replaced by condition factor K', which considers allometry in the growth of fish. Condition factor K' was considered in the study. A significant positive correlation between recent growth’ and initial growth indices was obtained. Results of the multiple regression analyses seem to reflect the discrepancy in the response times of the different condition indices used. In general, Sado, Ria Formosa and Guadiana provided juveniles in better individual condition. Future studies should be done to better investigate relationships between condition indices and between condition indices and environmental variables, focusing on the link between individual condition and habitat quality of nursery areas.

O objetivo deste estudo foi avaliar a condição dos juvenis de sargo-safia, Diplodus vulgaris, em áreas de viveiro dos principais estuários da costa Portuguesa, utilizando vários índices de condição individual. Os estuários e lagoas costeiras desempenham uma função importante para os juvenis de muitas espécies de peixes marinhos porque oferecem elevada disponibilidade de alimento, águas quentes e menor pressão predatória. Estas caraterísticas permitem que os juvenis cresçam rapidamente e em segurança até atingirem dimensões suficientes para regressar ao mar e recrutar para as populações adultas. Neste estudo, foram usados dois índices baseados na análise da microestrutura dos otólitos: as larguras dos 10 últimos e dos 60 primeiros incrementos diários foram considerados como um índice de crescimento recente e um índice de crescimento inicial, respetivamente. Além disso, foram considerados o rácio bioquímico ARN:ADN, que estima o estado…

Advisors/Committee Members: Cabral, Henrique N., 1969-, Vasconcelos, Rita.

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Tese de mestrado, Biologia (Biologia da Conservação), 2009, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

The hybridogenetic complex Squalius alburnoides is constituted by several forms with different ploidies and combinations of parental genomes. Very little was known about the reproductive behavior of this cyprinid fish, which might play a key role in its dynamics'comprehension. Thus, the main goal of the present work was the study of reproductive behavior within the complex and also from an interspecific perspective. For the purpose, initially, a non-intrusive individual recognition system based on scale patterns was developed. Later, the intersexual selection of the most common S. alburnoides form (triploid females) was studied in northern populations. A reproduction tendency with individuals of the sympatric species S. carolitertii was observed. This preference pattern may give some important clues for clarifying S. alburnoides population and genetic dynamics. Hereupon, the present study evidenced the high importance of reproductive behavior to the comprehension of the dynamics of non-sexual complexes.

Resumo alargado em português disponível no documento

Advisors/Committee Members: Vicente, Luís A., Pereira, Maria João Colares.

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Tese de mestrado. Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2010

A determinação/diferenciação sexual em peixes teleósteos tem suscitado grande interesse devido à grande diversidade de mecanismos que têm sido descritos, sendo estes constantemente reinventados, mesmo entre espécies irmãs. A poliploidia e a hibridação correspondem a importantes factores na evolução e especiação de vertebrados, levando frequentemente a uma alteração brusca das redes regulatórias da expressão génica. O complexo ciprinícola Squalius alburnoides surge, deste modo, como um modelo interessante para endereçar questões relacionadas com a determinação/diferenciação sexual num contexto alopoliplóide. Tratando‐se de um peixe dulçaquícola endémico da Península Ibérica, S. alburnoides teve origem num processo de hibridação resultante de cruzamentos intergenéricos entre a espécie Squalius pyrenaicus (ancestral materno, genoma P) e uma espécie presumivelmente extinta da linhagem de Anaecypris hispanica (ancestral paterno, genoma A). Este complexo compreende várias formas que variam na sua ploidia (2n, 3n e 4n) e constituição genómica (PA, PAA, PPA, PPAA, nas populações do sul). Squalius alburnoides apresenta ainda uma forma diplóide de composição nuclear não híbrida (AA) constituída apenas por machos. Actualmente, o complexo S. alburnoides encontra‐se em simpatria com outras espécies de Squalius (S. pyrenaicus, S. carolitertii e S. aradensis) que participam activamente na dinâmica reprodutiva do complexo, intercruzando‐se com as várias formas do mesmo. Estudos recentes comparativos da expressão génica entre as diferentes formas do complexo revelaram a existência de um mecanismo de compensação de dosagem em S. alburnoides que reduz os níveis dos transcritos das formas poliplóides para o nível encontrado nas formas diplóides. Os mesmos estudos sugeriram ainda que, nas formas triplóides das bacias hidrográficas do Sul, os alelos do genoma menos representado estão a ser preferencialmente silenciados. No entanto, um cenário diferente foi encontrado nas populações do Norte, tendo os indivíduos uma expressão quase sempre bialélica, independentemente da sua constituição genómica. Relativamente à determinação/diferenciação sexual neste complexo alopoliplóide, alguns estudos foram realizados para avaliar quais os genes envolvidos na regulação do processo de manutenção de identidade da gónada neste organismo e na espécie parental simpátrica S. pyrenaicus. Hibridação in situ dos genes amh, dmrt1, wt1, dax1, figlα e aromatase (estudados em outros vertebrados) não revelou uma expressão dimórfica entre sexos, nem um padrão diferente entre indivíduos do complexo hibridogenético e de S. pyrenaicus. Recentemente foi reportada a ocorrência de hermafroditismo em S. alburnoides, factor relevante na interpretação de resultados de expressão dos genes ligados ao sexo. No presente trabalho pretendeu‐se esclarecer algumas dúvidas que ainda restavam sobre o hermafroditismo no complexo S. alburnoides, nomeadamente, se…

Advisors/Committee Members: Coelho, Maria Manuela, 1954-.

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Tese de mestrado. Biologia (Ecologia Marinha). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013

Desde há várias décadas, vários autores têm usado as características morfológicas dos otólitos sagitta dos peixes para inferir relações de proximidade ou distanciamento filogenético entre taxa, confirmando ou propondo alterações, mais ou menos drásticas, às classificações vigentes. O presente trabalho tem como alvo as espécies Nordeste Atlânticas da família Triglidae, cuja sistemática tem estado envolta numa certa controvérsia. Com este estudo pretende-se verificar se a caracterização e descrição morfológica detalhada dos otólitos sagitta das espécies em causa fornecem suporte para corroborar alguma das classificações existentes ou apresentar uma alternativa. Com este objectivo em vista, efectua-se uma caracterização e descrição detalhadas dos otólitos sagitta das oito espécies portuguesas da família Triglidae (Chelidonichthys cuculus, Chelidonichthys lucernus, Chelidonichthys obscurus, Eutrigla gurnardus, Lepidotrigla cavillone, Lepitotrigla dieuzeidei, Trigla lyra e Trigloporus lastoviza) com o intuito de determinar a extensão da variabilidade intraespecífica e se a mesma permite a identificação segura das espécies com base na caracterização morfológica dos seus otólitos. O teste de Qui-quadrado permitiu a identificação imediata de algumas características diagnosticantes das espécies C. lucernus, E. gurnardus, L. cavillone e T. lyra e uma Análise de Correspondências Múltiplas (ACM) permitiu determinar as combinações de características que diagnosticam as restantes quatro espécies em estudo. Do estudo realizado conclui-se, através de um caso prático, que a morfologia dos otólitos é uma ferramenta muito útil na identificação de indivíduos até à espécie e na inferência de relações filogenéticas entre eles.

Since several decades ago, many authors have used the morphological characteristics of the otoliths sagitta of fish to infer proximity or phylogenetic relationships between taxa, confirming or proposing more or less drastic changes in the current classifications. This work targets the Northeast Atlantic species of the family Triglidae, which have been systematically involved in some controversy. This study intends to verify if the characterization and detailed morphological description of the otoliths sagitta of the species concerned provides support to corroborate some of the existing classifications or to propose an alternative arrangement for the species of the family. With this in mind, a detailed description and characterization of the sagitta otoliths of the eight Portuguese species of the Triglidae family (Chelidonichthys cuculus, Chelidonichthys lucernus, Chelidonichthys obscurus, Eutrigla gurnardus, Lepidotrigla cavillone, Lepitotrigla dieuzeidei, Trigla lyra and Trigloporus lastoviza) is made, in order to determine the extent of intraspecific variability and if it allows a reliable identification of species based on the morphological characterization of their otoliths. The Chi-square test immediately…

Advisors/Committee Members: Assis, Carlos António da Silva, 1961-.

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Apesar de serem amplamente conhecidos por sua capacidade de gerar fortes descargas elétricas, pouco se conhece sobre a história de vida das espécies do gênero Electrophorus, popularmente conhecidas por “poraquê”. Dentre os aspectos da biologia de uma espécie, o desenvolvimento é um dos mais importantes para compreender os processos ecológicos e evolutivos que moldam a história dos organismos. Neste sentido, este estudo traz a descrição do desenvolvimento ontogenético de E. varii e uma proposta de organização de suas fases através da análise integrada de características morfológicas, anatômicas e comportamentais. O estudo foi realizado com material proveniente de dois ambientes distintos da Bacia Amazônica, onde os ninhos foram monitorados por diferentes períodos. Para a caracterização da ontogenia, foram analisadas as mudanças na morfologia externa, anatomia interna, estrutura esquelética e comportamento dos espécimes coletados. Foi observado que o desenvolvimento de E. varii ocorre de maneira lenta e peculiar, demorando aproximadamente um ano entre a eclosão e o desenvolvimento do aspecto juvenil, sem variação entre as populações estudadas. É registrado também o consumo de ovos providos pela mãe como único alimento consumido pela prole, processo identificado como chave para o desenvolvimento desses organismos. O estudo evidencia a oofagia obrigatória como estratégia de provisionamento altamente especializada e ressalta a importância de análises ontogenéticas aprofundadas tanto para a proposição de um estagiamento coerente quanto para a compreensão dos processos inerentes ao desenvolvimento animal

Despite being broadly known by its capacity of generating strong electric discharges, little is known about the life history of the species from the genus Electrophorus, popularly known as electric eel. Among the aspects of the species biology, the development is one of the most important for the understanding of the ecological and evolutionary processes that shape the history of the organisms. In this sense, this work brings the description of the ontogenetic development of E. varii and a proposal of organization of the stages of development through the integrated analysis of the organisms. The study was realized with material from two distinct environments of the Amazon basin, where the nests were monitored by diferent periods. For the ontogenetic characterization, changes were analysed on external morphology, internal anatomy, skeletical structure and behavior of the specimens collected on the nests. We observed that the development of E. varii is peculiar and happens slowly, taking almost a year between the eclosion and the development of the juvenile aspect, without variation between the studied populations. It’s also recorded egg comsuption provided by the mother, process identified as a key process for organisms development. The study indicates the obligatory oophagy as a highly specialized provisioning strategy and highlight the importance of the in-depth ontogenetic analysis for…

Advisors/Committee Members: PyDaniel, Lúcia Helena Rapp, http://lattes.cnpq.br/2412972837389427, Fernandes, Cristina Cox, http://lattes.cnpq.br/6700032140233784, Mattox, George Mendes Taliaferro, http://lattes.cnpq.br/4453900943293186.

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Tese de mestrado, Biologia (Ciências e Tecnologias do Ambiente), 2008, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

Para compreender o funcionamento dos ecossistemas marinhos é essencial estudar as relações tróficas entre as diferentes espécies que formam a comunidade biótica. No presente estudo o safio, Conger conger, é utilizado como amostragem biológica para avaliar as interacções tróficas nas regiões rochosas e de maior profundidade. O safio é uma espécie bentopelágica com elevado valor comercial e um predador abundante na costa portuguesa. De modo a descrever a dieta do safio foram analisados 1006 exemplares, capturados na região do Algarve entre Dezembro de 2006 e Agosto de 2007. O safio é uma espécie oportunista que ocupa um nível trófico elevado, alimentando-se tanto no fundo, como ao longo da coluna de água. A sua dieta é essencialmente constituída por peixes (%IRI = 82,6), crustáceos (%IRI = 8,8) e cefalópodes (%IRI = 8,6), sendo os peixes o principal componente em todas as épocas. Entre as principais presas do safio encontram-se Eledone cirrhosa, Scomber colias, Bathynectes maravigna, Micromesistius poutassou e Capros aper. As relações predador-presa indicam que os safios de maiores dimensões consomem os maiores exemplares das espécies-presa. Aproximadamente metade da dieta do safio, em massa, é composta por espécies comerciais, podendo o predador competir com a pesca local, por alimento. Os desembarques de safio representaram, em 2006, 1,2% da pesca marinha em Portugal. Apesar de terem vindo a decrescer desde 1994, nos últimos 5 anos os desembarques apresentaram um ligeiro aumento. Compreender os efeitos dos parâmetros oceanográficos sobre os recursos pesqueiros é cada vez mais importante, no entanto, extremamente complexo. A análise das relações entre os desembarques de safio e de dois parâmetros oceanográficos, a NAO e a temperatura a diferentes profundidades, embora não tenha sido possível determinar uma relação estatística significante entre elas, sugere-se que se façam estudos mais aprofundados nesse sentido

In order to understand how marine ecosystems function, it is essential to study the trophic relations among the different species who constitute the biotic community. In the present study the European conger eel, Conger conger, is used as a biological sampler to assess the trophic interactions in rocky and deep areas. The European conger eel is a benthopelagic species with high commercial value, and an abundant predator in the Portuguese coast. In order to describe the European conger eels diet, 1006 specimens, captured in the Algarve region, between December 2006 and August 2007, were analyzed. European conger eels are opportunistic feeders that occupy a high trophic level, feeding not only near the bottom but also in the water column. Its diet is essentially composed of fishes (%IRI = 82.6), crustaceans (%IRI = 8.8) and cephalopods (%IRI = 8.6), the fish being the main component in all seasons. The main prey of the European conger eels are Eledone cirrhosa, Scomber colias, Bathynectes…

Advisors/Committee Members: Xavier, José C., Assis, Carlos António da Silva.

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Tese de mestrado em Ecologia e Gestão Ambiental, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2007

Resumo alargado em português disponível no documento

Due to the increase of the anthropogenic pressures on the marine environment, the assessment of ecological status has become an essential tool to recover and protect it (e.g. European Marine Strategy Directive) emphasising the need for an efficient ecological index applied to this environment. Since none of the fish-based multimetric indices was developed to the marine environment, the present study had two main goals: to evaluate the efficacy of the existing indices and the development of an efficient multimetric index to promote the assessment of the ecological quality of the marine fish communities. Five estuarine indices were adapted to marine waters through the simple replacement of the functional estuarine groups for the marine ones and tested in fifteen zones of the Portuguese coast divided according to their substrate. Analysis of individual metrics suggests lack of representativeness and consideration for the particularities of each substrate's typical fish communities. These results strengthened the need of a new multimetric index development by type of substrate and depth. Recurring to a Drivers-Pressures-Impacts-Responses approach and previous studies, a set of metrics was selected and their redundancy was tested through multiple correlation matrices. Based on these results and ecological meaning of each metric, the Marine Fish Community Index (MFCI) was developed and divided in four typologies. Although, in the future, a good monitoring plan is need in order to solve some metric problems and to validate the reference values, the results of the MFCI application and it robustness test showed that this approach by typology is efficient to assess the ecological status. Therefore, a new index to assess the ecological status was successfully developed and can be applied on the evaluation of the quality of the marine environment

Advisors/Committee Members: Cabral, Henrique N., Costa, Maria José Rosado.

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Tese de mestrado. Biologia (Ecologia Marinha). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013

O comportamento das espécies de peixes limpadores facultativos de águas temperadas, só recentemente começou a ser estudado ao contrário do que sucede em águas tropicais. Duas espécies de labrídeos, Coris julis e Thalassoma pavo, são caracterizadas como limpadoras nas águas costeiras dos Açores, mas pouco se sabe sobre as suas interacções mutualísticas. Com vista a colmatar esta lacuna, este trabalho analisa o comportamento destas duas espécies de peixes limpadores e dos seus peixes visitantes (referidos como “clientes”) aos seus territórios fixos (referidos como “estações de limpeza”), comparando a frequência das suas interacções com aquelas observadas em locais não fixos e no sentido de determinar: a) qual a dependência dos limpadores relativamente às suas actividades mutualísticas, e b) o impacto do seu comportamento nos níveis de infestação da sua “clientela”. Depois de se ter confirmado a existência de “estações de limpeza” nas costas da Ilha de São Miguel, dez estações de limpeza envolvendo C. julis e dez envolvendo T. pavo foram definidas, contabilizando-se um total de 600 min de observações. Para além disso, fora das “estações de limpeza”, 13 observações foram feitas para C. julis e cinco para T. pavo num total de 540 min de observações. Todas as observações foram feitas durante 30 min. Foram capturados aleatoriamente (fora do contexto de limpeza) trinta C. julis e trinta T. pavo, assim como três C. julis e dois T. pavo considerados como limpadores (no contexto de limpeza) presentes nas suas “estações de limpeza”, para posterior análise dos seus conteúdos estomacais. No sentido de determinar o nível de infestação parasitária foram capturados um total de 77 indivíduos pertencentes a oito espécies diferentes de “clientes” e “controlos” (Symphodus caeruleus, Sparisoma cretense, Abudefduf luridus, Sarpa salpa, Labrus bergylta, Mullus surmuletus, Serranus atricauda e Diplodus sargus) que se encontravam nas imediações das “estações de limpeza”. Dentro das estações de limpeza, foram observadas mais interacções entre T. pavo e os seus “clientes” (12, 4 ± 2,3) do que C. julis (10, 7 ± 1,3), enquanto fora das “estações de limpezas” ocorreu o inverso (C. julis: 3 ± 1,8; T. pavo: 1,75 ± 0,8). No conjunto de todas as observações comportamentais das duas espécies de limpadores, não foram encontradas diferenças significativas na diversidade específica dos seus “clientes”, contabilizando um total de sete espécies, seis destas observadas como “clientes” de C. julis (S. caeruleus, S. cretense, A. luridus, L. bergylta, M. surmuletus e C. julis) e quatro de T. pavo (S. caeruleus, S. cretense, S. salpa, L. bergylta), sendo a espécie S. caeruleus o “cliente” dominante no total das interacções de limpeza. Maior parte dos “clientes” foram observados a iniciar as interacções de limpeza adoptando uma postura específica (78,9 %), sendo estas interacções normalmente terminadas pelos limpadores (81,9 %). Uma correlação significativamente…

Advisors/Committee Members: Soares, Marta Sofia Candeias, Cabral, Henrique N., 1969-.

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Tese de mestrado. Biologia (Ecologia Marinha). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013

As poças de maré, em zonas rochosas, são um importante refúgio e áreas de viveiro para as larvas e juvenis de peixes de várias espécies com interesse comercial. Os objectivos deste trabalho foram: 1) determinar a diversidade de espécies de larvas e juvenis de peixes marinhos que usam as poças de maré, em zonas rochosas, localizadas a oeste da costa portuguesa, 2) a sazonalidade do uso destes habitats por estas espécies, 3) a condição desses indivíduos através da determinação do índice K de Fulton, 4) a estrutura de tamanhos ao longo do ano, 5) a composição da dieta das larvas e juvenis dos peixes marinhos transientes mais abundantes, Diplodus sargus e Atherina spp., e o seu papel trófico nestes habitats. Para este estudo, foram seleccionadas quatro poças de maré em zona rochosa. Estas poças localizam-se em duas praias rochosas expostas (praia A e praia B) na costa ocidental Portuguesa. Cada poça foi caracterizada em termos de profundidade e área. As amostragens foram realizadas mensalmente, durante dois anos, de Janeiro de 2011 a Dezembro de 2012, na primeira baixa-mar do mês, com uma altura de cerca de 0,7 m, sempre em período de marés-vivas. A temperatura da água de cada poça de maré foi registada, bem como se procedeu à caracterização do substrato e formas de vida dominantes. As larvas e juvenis dos peixes marinhos transientes foram capturados utilizando camaroeiros de malha fina. Os peixes capturados foram colocados em sacos de plástico devidamente identificados e transportados numa pequena arca congeladora para o laboratório onde foram armazenados à temperatura de -20 °C. Os procedimentos laboratoriais incluíram a medição das larvas e dos juvenis dos peixes capturados com precisão de 1 mm, a sua pesagem com precisão de 0,01 g, excisão dos estômagos das larvas e juvenis, preservação em álcool a 70% e identificação dos conteúdos estomacais. O estágio de desenvolvimento das larvas pós-flexão das espécies de peixes transientes foi classificado como larva a, b, c, d e e para D. sargus e larva a, b e c, para Atherina spp.. Os procedimentos analíticos incluíram o cálculo de índices alimentares (índice numérico, índice volumétrico e índice de ocorrência) e do índice de condição K de Fulton. Neste estudo foram identificadas 6 espécies de peixes transientes que utilizam as poças de maré das zonas rochosas: o sargo legítimo, Diplodus sargus, o peixe-rei, Atherina spp., a taínha, Liza ramada, o bodião de Bailloni, Symphodus bailloni, o sargo-veado, Diplodus cervinus e a sardinha Europeia, Sardina pilchardus. Uma elevada variabilidade inter-anual, tanto nas densidades, como na altura de colonização das poças, foi observada. Enquanto que em 2011 as poças foram colonizadas em Março, em 2012 apenas foram colonizadas em Maio. O número de meses de colonização também foi inferior em 2012. A colonização das poças, tanto por D. sargus, como por Atherina spp. começou na Primavera e terminou no Outono. As densidades mais elevadas…

Advisors/Committee Members: Cabral, Henrique N., 1969-, Vinagre, Catarina Maria Batista, 1978-.

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Tese de mestrado. Biologia (Ecologia Marinha). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2014

Desde o século passado que, devido essencialmente à queima de combustíveis fósseis, agricultura e desflorestação, as concentrações de CO2 têm vindo a aumentar significativamente na atmosfera terrestre, levando a sérios impactes ambientais. Os níveis de CO2 atmosférico aumentaram de cerca de 280 ppM (partes por milhão) para cerca de 390 ppM em 2010 e prevê-se que continuem a subir, podendo atingir valores acima dos 1000 ppM em 2100. Como a atmosfera e os oceanos funcionam como sistemas interligados, as alterações que ocorrem num vão ter consequências no outro. Assim, com o aumento do CO2 na atmosfera, a pressão parcial do CO2 (ρCO2) da água do mar também aumenta, o que, por sua vez, conduz a uma alteração química do carbonato, resultando na acidificação da água (redução do pH). Atualmente, o pH médio das águas dos oceanos é cerca de 8,2, uma décima abaixo dos valores pré-industriais. Tendo como base os cenários realistas para as futuras emissões de CO2, prevê-se que o pH possa diminuir ainda mais 0,3 - 0,4 unidades até 2100. Estas variações vão ter graves consequências ecológicas no planeta Terra, podendo causar uma perda global de biodiversidade, distúrbios nos processos dos ecossistemas e redução de bens e serviços ecológicos úteis ao Homem. Nos organismos marinhos, as consequências poderão ser drásticas, como por exemplo, diminuição das taxas de calcificação, alterações de processos fisiológicos e, também, variações no comportamento de alguns peixes. Uma vez que as fases iniciais de vida são mais vulneráveis às mudanças do ambiente, o mais provável é que os efeitos da acidificação sejam detetados mais facilmente nestes estágios do ciclo de vida. É portanto, fundamental compreender as consequências de um meio mais ácido em larvas e juvenis, que, por sua vez, se podem refletir nas populações adultas. A maioria dos peixes de recife são caracterizados por possuírem um ciclo de vida com duas fases: uma na qual o estágio larvar pelágico se desloca para águas abertas, longe do recife, e outra envolvendo o recrutamento para águas costeiras para assentar, vivendo aqui o resto da sua vida adulta. Outrora, pensava-se que a dispersão larvar era passiva e a localização do sítio de assentamento determinada totalmente pelas correntes oceânicas. Hoje sabe-se que as larvas exibem natação ativa e orientada, podendo, deste modo, controlar a sua dispersão e assentamento. Para se orientarem no meio pelágico, as larvas, recorrem essencialmente a pistas olfativas e auditivas. Para além da orientação, os odores, são bastante úteis na deteção e evasão a predadores. No que diz respeito aos sons dos recifes, estes podem ser tanto de origem abiótica (movimento da água, rebentamento das ondas, chuva na superfície da água e eventos geológicos) como biótica (vários organismos como peixes e invertebrados), funcionando como uma pista bastante complexa. Estes sons podem variar com a hora do dia, provocando a deslocação larvar em direção aos recifes…

Advisors/Committee Members: Cabral, Henrique N., 1969-, Faria, Ana.