Advanced search options

Advanced Search Options 🞨

Browse by author name (“Author name starts with…”).

Find ETDs with:

in
/  
in
/  
in
/  
in

Written in Published in Earliest date Latest date

Sorted by

Results per page:

Sorted by: relevance · author · university · dateNew search

You searched for subject:(I SceI meganuclease). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

Search Limiters

Last 2 Years | English Only

No search limiters apply to these results.

▼ Search Limiters

1. Feri, Adeline. Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans.

Degree: Docteur es, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie. Infectiologie, microbiologie, 2016, Sorbonne Paris Cité

La levure Candida albicans présente une tolérance élevée aux réarrangements de son génome et en particulier, aux pertes d’hétérozygotie (LOH). Ces LOH sont le plus souvent le résultat de la réparation d’une cassure double-brin de l’ADN (DNA DSB) et jouent un rôle important dans différents aspects de la biologie de C. albicans. Afin d’étudier les mécanismes moléculaires à l’origine des LOH, nous avons combiné un système d’induction d’un DNA DSB par la méganucléase I-SceI et un système rapporteur de LOH optimisé pour l’analyse par FACS. La surexpression de I-SceI entraine une forte augmentation du taux de LOH, principalement des conversions géniques. La caractérisation des cellules ayant subi une LOH a permis d’identifier des allèles récessifs délétères et létaux présents à l’état hétérozygote dans le génome de la souche de laboratoire de C. albicans. Ces allèles influent sur la nature des LOH observés suite à un DNA DSB. Nous avons également caractérisé la fidélité de la réparation d’un DNA DSB induit par I-SceIchez C. albicans. Cette étude a permis de décrire des recombinaisons complexes et inattendues se déroulant pendant les événements de break-induced replication et de conversions géniques avec crossover. En parallèle, une collection de 564 plasmides de surexpression pour des gènes impliqués dans les voies de signalisation et dans l’intégrité du génome et de la paroi a été transformée dans une souche possédant les deux systèmes mentionnés ci-dessus. L’analyse des transformants dans des conditions ou non d’expression de I-SceI a permis d’identifier des gènes dont la surexpression augmente le taux basal de LOH ou diminue le taux de LOH élevé du à l’expression d’I-SceI.

The Candida albicans genome displays a high tolerance to rearrangements, notably loss-ofheterozygosity (LOH) events. These events most often result from the repair of DNA double-strandbreaks (DSBs) and are known to play an important role in different aspects of C. albicans biology.To study the molecular mechanisms leading to LOH, we have combined an I-SceI meganuclease-dependent DSB-inducing system with a FACS-optimized reporter system of LOH. Our results show that expression of I-SceI leads to a dramatic increase in the frequency of LOH events,mainly gene conversion events. Characterization of cells having undergone a LOH led us to identify recessive lethal and deleterious alleles present in the heterozygous state in the genome of the C.albicans laboratory strain. These alleles influence the nature of the LOH events that are observed following a DSB. We also characterized the fidelity of the repair following an I-SceI-induced DNA DSB. This revealed unexpected complex recombination events occurring upon both break-induced replication and gene conversion with crossover repair events. In parallel, a collection of 564 over expression plasmids for genes involved in signaling pathways, genome integrity and cell wall integrity has been transformed in a C. albicans strainharboring the I-SceI-dependent DSB-inducing system and FACS-optimized LOH reporter.…

Advisors/Committee Members: Bougnoux, Marie-Elisabeth (thesis director), Legrand, Mélanie (thesis director).

Subjects/Keywords: Méganucléase I-Scel; I-SceI meganuclease

Record DetailsSimilar RecordsGoogle PlusoneFacebookTwitterCiteULikeMendeleyreddit

APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Feri, A. (2016). Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans. (Doctoral Dissertation). Sorbonne Paris Cité. Retrieved from http://www.theses.fr/2016USPCC246

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Feri, Adeline. “Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans.” 2016. Doctoral Dissertation, Sorbonne Paris Cité. Accessed December 08, 2019. http://www.theses.fr/2016USPCC246.

MLA Handbook (7th Edition):

Feri, Adeline. “Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans.” 2016. Web. 08 Dec 2019.

Vancouver:

Feri A. Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans. [Internet] [Doctoral dissertation]. Sorbonne Paris Cité; 2016. [cited 2019 Dec 08]. Available from: http://www.theses.fr/2016USPCC246.

Council of Science Editors:

Feri A. Molecular mechanisms and signaling pathways involved in genome stability in the human fungal pathogen, Candida albicans : Mécanismes moléculaires et voies de signalisation impliqués dans la stabilité du génome du champignon pathogène de l'homme, Candida albicans. [Doctoral Dissertation]. Sorbonne Paris Cité; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016USPCC246

2. Ayar, Ayhan. Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings.

Degree: Docteur es, Physiologie et Génétique Moléculaire, 2013, Université Blaise-Pascale, Clermont-Ferrand II

La recombinaison homologue est un mécanisme de réparation de l’ADN extrêmement contrôlé et particulièrement chez les eucaryotes supérieurs. Dans les cellules méiotiques de ces derniers, où les cassures doubles brin de l’ADN sont programmées, les voies de crossing-over de la recombinaison homologue, qui génèrent de nouvelles combinaisons de gènes, sont restreintes. Dans les cellules somatiques, la recombinaison illégitime, qui assure majoritairement la réparation des cassures double brin de l’ADN, limite l’intégration ciblée du transgène par recombinaison homologue. Les entreprises de biotechnologie convoitent de maitriser la recombinaison homologue afin de contrôler d’une part le brassage génomique qui a lieu pendant la méiose, et d’autre part l’intégration du transgène dans le génome. Cette étude a porté sur le développement d’outils afin d’atteindre ces deux objectifs. Afin d’augmenter le brassage du génome, ayant lieu pendant la méiose, une version du promoteur OsDmc1b, active dans les cellules méiotiques, a été caractérisée chez le maïs. Des plantes sur-exprimant le gène ZmSpo11.1, sous contrôle de ce promoteur, ont ainsi été développées afin d’obtenir des lignées potentiellement hyper-recombinantes. Si la surexpression de ZmSpo11.1 permet effectivement d’augmenter le taux de crossing-over, il pourra être utilisé par les sélectionneurs afin d’accélérer l’introgression d’allèles d’intérêt dans des variétés élites. Concernant la mise en place d’une technique de ciblage de gène, deux stratégies, reposant sur l’utilisation de la méganucléase I-SceI, ont été testées. La démarche a nécessité trois éléments : un locus cible contenant le site de coupure I-SceI, une matrice de réparation et la séquence codant I-SceI (ou I-SceI::GR). La première stratégie, consistant à retransformer les lignées présentant le locus cible avec la matrice de réparation et I-SceI, ne semble pas exploitable car aucun évènement de ciblage de gène n’a été mis en évidence. La seconde stratégie, reposant sur l’assemblage des trois éléments par croisement, est beaucoup plus prometteuse. Malgré la faible activité d’I-SceI::GR, des évènements de recombinaison homologue ont été observés dans les tissus foliaires de certaines plantes. Du cal embryogène, développé à partir de ces dernières, a permis de régénérer des plantes présentant des évènements de ciblage de gène. Ces travaux ouvrent de nouvelles perspectives dans l’élaboration contrôlée d’OGM.

Homologous recombination is a DNA repair mechanism highly regulated in higher eukaryotes. In their meiotic cells, where DNA double-stranded breaks are programmed, the crossing-over pathway of homologous recombination, which generates new gene combinations, is limited in activity and genomic distribution. In somatic cells, illegitimate recombination, which mainly ensures DNA double-strand repair, limits the targeted integration of transgenes by homologous recombination. Biotechnology companies aim to master homologous recombination to control on the one hand the genomic mixing that occurs during meiosis,…

Advisors/Committee Members: Gallego, Maria-Eugenia (thesis director).

Subjects/Keywords: Maïs; Recombinaison homologue; Cassure double brin; Crossing-over; Méganucléase I-Scel; Ciblage de gène; Maize; Homologous recombination; Double strand break; Crossing-over; I-SceI meganuclease; Gene targeting

Record DetailsSimilar RecordsGoogle PlusoneFacebookTwitterCiteULikeMendeleyreddit

APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Ayar, A. (2013). Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings. (Doctoral Dissertation). Université Blaise-Pascale, Clermont-Ferrand II. Retrieved from http://www.theses.fr/2013CLF22345

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Ayar, Ayhan. “Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings.” 2013. Doctoral Dissertation, Université Blaise-Pascale, Clermont-Ferrand II. Accessed December 08, 2019. http://www.theses.fr/2013CLF22345.

MLA Handbook (7th Edition):

Ayar, Ayhan. “Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings.” 2013. Web. 08 Dec 2019.

Vancouver:

Ayar A. Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Blaise-Pascale, Clermont-Ferrand II; 2013. [cited 2019 Dec 08]. Available from: http://www.theses.fr/2013CLF22345.

Council of Science Editors:

Ayar A. Stimulation et contrôle de la recombinaison homologue chez le maïs pour augmenter l'efficacité du ciblage de gène et le brassage génétique : People’s reaction to uncivil and immoral behaviors in public settings. [Doctoral Dissertation]. Université Blaise-Pascale, Clermont-Ferrand II; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013CLF22345

.