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1. Barbosa Filho, Roberto Alexandre Alves. Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia.

Degree: 2010, Universidade Federal do Amazonas

O Papillomavirus Humano é responsável por lesões na mucosa oral, anal e do trato urogenital masculino e feminino, transmitidas por contato direto ou indireto com a pele infectada ou através de relações sexuais. Na mulher essas infecções podem evoluir para um câncer de colo do útero, cuja estimativa de incidência para a região Norte no ano de 2010 foi a maior do Brasil. A natureza das infecções depende do grau de integração do DNA viral com o DNA do hospedeiro associada, principalmente, aos genes das oncoproteínas E6 e E7 do HPV. A determinação dos tipos virais pode ser realizada a partir de diferenças no gene L1 do capsídeo viral e as variantes de um determinado tipo de HPV podem ser identificadas por meio do estudo da Região Não Codificadora viral. Atualmente o desenvolvimento de vacinas profiláticas contra o HPV utiliza partículas pseudo-virais formadas pela proteína L1 de tipos virais de alto risco, enquanto cresce o número de estudos que utilizam as oncoproteínas E6 e E7 no desenvolvimento de vacinas terapêuticas. Contudo, é necessário que o desenvolvimento de tais vacinas antivirais também considere a grande diversidade das variantes dos tipos de HPV existentes, uma vez que diferenças entre as regiões genômicas dessas variantes podem influenciar o grau de suas infecções. Este trabalho descreve o sequenciamento completo do genoma de uma variante do HPV 16, detectado no Estado do Amazonas, utilizando técnicas de Engenharia Genética, bem como a análise desse genoma por ferramentas de Bioinformática. Observou-se, pela análise de distâncias genéticas, que o genoma dessa variante apresenta grande proximidade genética dos exemplares identificados na literatura como variantes africanas , e as análises filogenéticas, realizadas a partir da Região Não Codificadora, reforçam essa hipótese. Além disso, também foram detectadas várias mutações ao longo do genoma obtido, resultando em alterações nas posições e na quantidade de sítios de restrição de sua sequência. As maiores diferenças entre as regiões gênicas do genoma sequenciado e as correspondentes nas variantes africanas foram observadas ao longo de E7. Espera-se, com esse trabalho, atentar os futuros projetos de pesquisa que envolvam expressão de proteínas e análises genômicas de HPV na região amazônica para as peculiaridades existentes nas variantes regionais e fornecer uma referência concisa e completa sobre o genoma do HPV 16 na região.

The Human papillomavirus is responsible for lesions in the oral mucosa, anal and urogenital tract of male and female, transmitted by direct or indirect contact with infected skin or through sexual intercourse. In women these infections can progress to cervical cancer, which is estimated incidence for the Northern region in 2010 was the largest in Brazil. The nature of the infection depends on the degree of integration of viral DNA with host DNA linked primarily to genes of oncoproteins E6 and E7 of HPV. The determination of the viral types can be held from differences in the viral capsid L1 gene and the variants of a particular…

Advisors/Committee Members: Astolfi Filho, Spartaco, CPF:102.451.971-68.

Subjects/Keywords: Diversidade genética; Variantes de HPV 16; Amazonas; Genoma viral; Genetic diversity; HPV 16 variants; Amazonian region; Viral genome; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS

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APA (6th Edition):

Barbosa Filho, R. A. A. (2010). Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3630

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Barbosa Filho, Roberto Alexandre Alves. “Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia.” 2010. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed June 05, 2020. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3630.

MLA Handbook (7th Edition):

Barbosa Filho, Roberto Alexandre Alves. “Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia.” 2010. Web. 05 Jun 2020.

Vancouver:

Barbosa Filho RAA. Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. [cited 2020 Jun 05]. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3630.

Council of Science Editors:

Barbosa Filho RAA. Clonagem, sequenciamento e estudos moleculares do genoma de HPV 16 isolado na Amazônia. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3630

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