subject:(G nomique des populations)

1. Dorat, Rémi. Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory.

Degree: Docteur es, Informatique, 2009, Université Lille I – Sciences et Technologies

URL: http://www.theses.fr/2009LIL10040

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La thése poursuit les travaux de la théorie des Jeux évolutionnaires Cette théorie est un cadre de modehsation de la dynamique des populations dans lequel… (more)

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La thése poursuit les travaux de la théorie des Jeux évolutionnaires Cette théorie est un cadre de modehsation de la dynamique des populations dans lequel les interactions entre agents sont modélisées par des dilemmes classiques de la théorie des Jeux. Les agents interagissent avec leurs pairs et les meilleurs comportements se diffusent. les moins performants tendent à disparaître. Les modèles spécifiés mettent notamment en évidence des conditions sur les rapports inter-individuels qui permettent de faire émerger des équilibres coopératifs. En supposant que chaque agent a des relations non plus avec tous les agents de la population mais seulement avec un sous-ensemble des agents de la population et toujours avec les mêmes, on augmente considérablement le nombre des dynamiques possibles. Cette démarche fait apparaître un réseau des interactions,.soit un graphe. La contrainte spatiale s'avère une condition favorable au maintien des comportements coopératifs et de la biodiversité des comportements. L'analyse formelle de la convergence n'est généralement plus possible et les modèles sont étudiés par simulation. La these poursuit l'étude de l'impact de la répartition spatiale. Elle introduit un nouveau modèle de répartition spatiale où des communautés d'agents sont en réseau et non plus des agents. Ce modèle permet de mettre en évidence de nouvelles formes d'attracteurs coopératifs et de nouvelles conditions au maintien de la biodiversité. La thèse montre aussi la possibilité de convergence de marchés vers des équilibres non concurrentiels et de maintien de comportements coopératifs, des comportements de cartel

The thesis continues the work of Evolutionary Game Theory. This theory is a framework for modeling the dynamics of populations interactions betwcen agents are modeled by the classic dilemmas from Game Theory. The agents interaet with their peers. Best behaviors spread. less suecessful ones tend to disappear. Evolutionary Game Theory prondes conditions upon which cooperative behaviors can survive and cooperative equilibriums can appear. Assuming that each agent does not interact with all the others but only with a fixed group of neighbors greatly increases the number of possible dynamics. The relations between agents form a social network. Limitation of contacts between agents favors cooperative equilibrium and biodiversity. Nevertheless, formal approach to the models is no longer possible and they are studied through massive computer simulations. The thesis continues the study of the impact of social networks. lt introduces networks of communities, a new model where commnnities are networked rather than agents. This model exhibits new forms of eooperative convergence and new conditions to persistent biodiversity. The thesis also shows the possibility of convergence of markets towards non-competitive equilibriums and the survival of behaviors collectively able to reach cartel equilibrium, a particular form of cooperative equilibrium.

Advisors/Committee Members: Delahaye, Jean-Paul (thesis director).

Subjects/Keywords: Dynamique des populations; Équilibre concurrentiel

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APA (6^th Edition):

Dorat, R. (2009). Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory. (Doctoral Dissertation). Université Lille I – Sciences et Technologies. Retrieved from http://www.theses.fr/2009LIL10040

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Dorat, Rémi. “Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory.” 2009. Doctoral Dissertation, Université Lille I – Sciences et Technologies. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2009LIL10040.

MLA Handbook (7^th Edition):

Dorat, Rémi. “Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory.” 2009. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Dorat R. Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Lille I – Sciences et Technologies; 2009. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2009LIL10040.

Council of Science Editors:

Dorat R. Répartition spatiale en théorie des jeux évolutionnaires : Spatial organizations in evolutionary game theory. [Doctoral Dissertation]. Université Lille I – Sciences et Technologies; 2009. Available from: http://www.theses.fr/2009LIL10040

2. Abu Awad, Diala. Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation.

Degree: Docteur es, Écologie et biologie évolutive, 2014, Université Lille I – Sciences et Technologies

URL: http://www.theses.fr/2014LIL10134

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La présence des mutations délétères a favorisé l'évolution de mécanismes, au niveau cellulaire et au niveau des organismes (e.g. les régimes de reproduction), permettant de… (more)

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La présence des mutations délétères a favorisé l'évolution de mécanismes, au niveau cellulaire et au niveau des organismes (e.g. les régimes de reproduction), permettant de diminuer leurs effets négatifs. Au cours de cette thèse nous avons étudié leur impact sur la taille des populations à travers des modèles tenant compte de l'interaction entre la démographie et la sélection, cette interaction étant souvent mise de coté dans les modèles conventionnels de génétique des populations. Dans un contexte déterministe à un seul locus des mutations somatiques et gamétiques influencent la taille et le fardeau génétique des populations (ces derniers étant dépendants du moment d’expression des mutations dans le cycle de vie). Nos modèles stochastiques avec un grand nombre de locus indiquent que la viabilité des populations dépend des paramètres démographiques et génétiques (taux de mutation, effet délétère des mutations). L'autofécondation est généralement avantageuse, augmentant la taille et la viabilité des populations, mais lorsque les mutations sont de faible effet un régime d'autogamie stricte mène à l'extinction par fonte mutationelle. En permettant l'évolution de l'autofécondation à partir d'une population allogame nous observons des cas de suicide évolutif où les populations évoluent vers l'autogamie stricte et s'éteignent, ce qui pourrait expliquer les taux d’extinctions élevés des espèces auto-fécondantes comparées aux allo-fécondantes. Ces modèles prédisent que la taille des populations pourrait être une conséquence et non une cause de leurs propriétés génétiques, appuyant sur l’importance de prendre en compte leur interaction dans l'étude de l'évolution des populations.

As the ultimate source of genetic variation, mutation has the inconvenience of introducing deleterious mutations. These mutations shape the evolution of species, from genetic mechanisms on the cellular level to reproductive systems, which lessen their effects on fitness. In this thesis we explore how these mutations influence population size by allowing the interaction between population size and selection, which has been little explored in conventional population genetics models. In a deterministic context with a single locus, germ-line and somatic mutations influence population size and the mutation load, both which depend on the timing of the expression of these mutations. Multi-locus individual based models show that population viability depends on the demographic properties and on the rate of introduction and impact of mutations. Though self-fertilisation generally increases population viability, strictly self-fertilising populations go extinct due to mutational meltdown when mutations are of small effect. When selfing is allowed to evolve from an outcrossing reproductive regime, there are cases of evolutionary suicide where strict selfing evolves and leads to extinction. We predict that the genetic properties of populations may not be a consequence but a cause of population size. We have emphasized the importance of taking the demographic…

Advisors/Committee Members: Billiard, Sylvain (thesis director), Tran, Viet Chí (thesis director).

Subjects/Keywords: Autofécondation; Taille des populations; 577.8

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APA (6^th Edition):

Abu Awad, D. (2014). Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation. (Doctoral Dissertation). Université Lille I – Sciences et Technologies. Retrieved from http://www.theses.fr/2014LIL10134

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Abu Awad, Diala. “Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation.” 2014. Doctoral Dissertation, Université Lille I – Sciences et Technologies. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2014LIL10134.

MLA Handbook (7^th Edition):

Abu Awad, Diala. “Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation.” 2014. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Abu Awad D. Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Lille I – Sciences et Technologies; 2014. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2014LIL10134.

Council of Science Editors:

Abu Awad D. Death and sterility with a side of evolutionary suicide : the interplay of deleterious mutations and population size and the evolution of self-fertilisation : Mort et stérilité avec un zeste de suicide évolutif : Interaction entre mutations délétères et taille de population, et l’évolution de l’autofécondation. [Doctoral Dissertation]. Université Lille I – Sciences et Technologies; 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014LIL10134

Université du Québec à Montréal

3. Senay, Caroline. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.

Degree: 2009, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

► Cette étude a été réalisée afin d'évaluer les relations entre les conditions environnementales, la structure spatiale multi-échelles et les traits fonctionnels pouvant influencer la structure… (more)

▼ Cette étude a été réalisée afin d'évaluer les relations entre les conditions environnementales, la structure spatiale multi-échelles et les traits fonctionnels pouvant influencer la structure des communautés. Dans le premier chapitre, l'influence à différentes échelles de l'environnement et de la structure spatiale sur divers descripteurs biologiques décrivant la distribution de 17 espèces de poissons des rivières a été déterminée. Dans le second chapitre, la relation entre l'environnement et la variabilité phénotypique de la morphologie et de la capacité de nage de 10 espèces de poissons des rivières a été évaluée. Pour ce faire, nous avons étudié les communautés de poissons des rivières dans la région des Laurentides au Québec, Canada. Le plan d'échantillonnage représentait le réseau hydrographique de la région et était de nature hiérarchique. Il comprenait trois bassins versants (e.g., rivière Rouge, du Nord et Ouareau), à l'intérieur desquels 39 sites ont été répartis et divisés en 143 sections au total, chacune associée à un type de mésohabitat (e.g., rapide, droit et fosse). Pour chaque section, les poissons ont été capturés à la pêcheuse électrique, anesthésiés et photographiés afin de déterminer leur présence-absence et évaluer leurs caractéristiques morphologiques en utilisant la géomorphométrie. Également pour chaque section, des conditions environnementales ont été évaluées afin de caractériser le milieu. De plus, certains poissons ont été soumis à un protocole de nage standard au laboratoire pour déterminer leur capacité de nage soutenue. Les résultats du premier chapitre ont souligné l'importance de l'échelle choisie en ce qui concerne la variabilité des conditions environnementales et de la distribution des poissons, en plus des patrons de cooccurrence et de diversité. Sur les 17 espèces retenues pour cette partie, 60% a sélectionné un type d'habitat particulier. La distance par voie d'eau totale entre les sites est celle qui a modélisé le plus fidèlement la structure spatiale de l'environnement et la distribution des espèces. L'environnement et la structure spatiale ont expliqué significativement les patrons de distribution et de cooccurrence. De plus, notre perception des patrons de diversité est affectée par le choix d'une approche hiérarchique ou non-hiérarchique. Le second chapitre a identifié des patrons de différentiation morphologique entre les types d'habitat pour 80% des espèces. Ces variations morphologiques sont présentes entre les populations provenant de différents mésohabitats indépendamment des bassins versants, mais ne sont pas constantes entre les espèces. Il est possible que différentes espèces aient des stratégies particulières pour surmonter des défis semblables. Les espèces qui n'ont pas démontré de divergences sont benthiques, ce qui peut expliquer qu'ils ressentent et répondent moins aux caractéristiques environnementales. Le mésohabitat ne semble pas affecter le niveau d'intégration phénotypique des populations, bien qu'il semble y avoir des différences entre les espèces.…

Subjects/Keywords: Poisson; Dynamique des populations; Rivière; Aspect environnemental

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Senay, C. (2009). Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Senay, Caroline. “Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.” 2009. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Senay, Caroline. “Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.” 2009. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Senay C. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2009. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf.

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Council of Science Editors:

Senay C. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2009. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

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Université du Québec à Montréal

4. Senay, Caroline. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.

Degree: 2009, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

► Cette étude a été réalisée afin d'évaluer les relations entre les conditions environnementales, la structure spatiale multi-échelles et les traits fonctionnels pouvant influencer la structure… (more)

▼ Cette étude a été réalisée afin d'évaluer les relations entre les conditions environnementales, la structure spatiale multi-échelles et les traits fonctionnels pouvant influencer la structure des communautés. Dans le premier chapitre, l'influence à différentes échelles de l'environnement et de la structure spatiale sur divers descripteurs biologiques décrivant la distribution de 17 espèces de poissons des rivières a été déterminée. Dans le second chapitre, la relation entre l'environnement et la variabilité phénotypique de la morphologie et de la capacité de nage de 10 espèces de poissons des rivières a été évaluée. Pour ce faire, nous avons étudié les communautés de poissons des rivières dans la région des Laurentides au Québec, Canada. Le plan d'échantillonnage représentait le réseau hydrographique de la région et était de nature hiérarchique. Il comprenait trois bassins versants (e.g., rivière Rouge, du Nord et Ouareau), à l'intérieur desquels 39 sites ont été répartis et divisés en 143 sections au total, chacune associée à un type de mésohabitat (e.g., rapide, droit et fosse). Pour chaque section, les poissons ont été capturés à la pêcheuse électrique, anesthésiés et photographiés afin de déterminer leur présence-absence et évaluer leurs caractéristiques morphologiques en utilisant la géomorphométrie. Également pour chaque section, des conditions environnementales ont été évaluées afin de caractériser le milieu. De plus, certains poissons ont été soumis à un protocole de nage standard au laboratoire pour déterminer leur capacité de nage soutenue. Les résultats du premier chapitre ont souligné l'importance de l'échelle choisie en ce qui concerne la variabilité des conditions environnementales et de la distribution des poissons, en plus des patrons de cooccurrence et de diversité. Sur les 17 espèces retenues pour cette partie, 60% a sélectionné un type d'habitat particulier. La distance par voie d'eau totale entre les sites est celle qui a modélisé le plus fidèlement la structure spatiale de l'environnement et la distribution des espèces. L'environnement et la structure spatiale ont expliqué significativement les patrons de distribution et de cooccurrence. De plus, notre perception des patrons de diversité est affectée par le choix d'une approche hiérarchique ou non-hiérarchique. Le second chapitre a identifié des patrons de différentiation morphologique entre les types d'habitat pour 80% des espèces. Ces variations morphologiques sont présentes entre les populations provenant de différents mésohabitats indépendamment des bassins versants, mais ne sont pas constantes entre les espèces. Il est possible que différentes espèces aient des stratégies particulières pour surmonter des défis semblables. Les espèces qui n'ont pas démontré de divergences sont benthiques, ce qui peut expliquer qu'ils ressentent et répondent moins aux caractéristiques environnementales. Le mésohabitat ne semble pas affecter le niveau d'intégration phénotypique des populations, bien qu'il semble y avoir des différences entre les espèces.…

Subjects/Keywords: Poisson; Dynamique des populations; Rivière; Aspect environnemental

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APA (6^th Edition):

Senay, C. (2009). Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Senay, Caroline. “Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.” 2009. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Senay, Caroline. “Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière.” 2009. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Senay C. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2009. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf.

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Senay C. Quelles contraintes structurent les communautés de poissons? : influence de l'environnement, de la structure spatiale multi-échelles et des traits fonctionnels sur l'assemblage des communautés de poissons en rivière. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2009. Available from: http://archipel.uqam.ca/2224/1/M10959.pdf

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Université du Québec à Montréal

5. Pilotte, Catherine. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.

Degree: 2012, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

► Les Bernaches du Canada établies en milieu tempéré sont souvent considérées comme une source de nuisances dans plusieurs régions de l'est de l'Amérique du Nord.… (more)

▼ Les Bernaches du Canada établies en milieu tempéré sont souvent considérées comme une source de nuisances dans plusieurs régions de l'est de l'Amérique du Nord. Dans le sud du Québec, une population nicheuse s'est établie il y a une vingtaine d'années et continue de croître depuis. Les oies et les bernaches sont des oiseaux à forte longévité et la survie est donc un facteur déterminant pour la gestion de ces populations. Le premier objectif de notre étude était de décrire la distribution spatio-temporelle de la récolte des bernaches établies dans le sud du Québec. Notre second objectif consistait à estimer les taux de survie de ces oiseaux et d'évaluer l'effet du sexe et de l'âge sur cette survie ainsi que les variations interannuelles. Notre dernier objectif était d'évaluer l'effet de la date d'éclosion, de l'âge au baguage et de la condition corporelle au baguage sur la survie des juvéniles. Des modèles de capture-marquage-recapture combinant des données de recaptures d'oiseaux vivants et de retours de bagues d'oiseaux abattus ont été élaborés en utilisant les oiseaux bagués comme juvéniles entre 2003 et 2009. La majorité des retours de bagues d'oiseaux abattus par la chasse provenait du Québec. La distribution des retours était concentrée en deux secteurs : aux alentours de Varennes dans le sud du Québec, puis le long de la côte américaine entre le Rhode Island et le Maryland. La récolte comprenait majoritairement des juvéniles dans le premier cas et des jeunes d'un an dans le deuxième cas. Au Québec, la récolte durant la période de chasse hâtive totalise 9 % de la récolte totale. Bien que la différence était légère, la survie des femelles était plus faible que celle des mâles. La survie des juvéniles variait entre les années entre 0.73 (95 % IC 0.43-0.90) et 0.90 (0.74-0.96) et était plus élevée que pour les adultes (0.56 [0.44-0.67] à 0.76 [0.68-0.82]) et les oiseaux d'un an (0.54 [0.45-0.63] à 0.73 [0.64-0.81]). Une relation négative entre la date d'éclosion et la survie des juvéniles a été observée mais il n'y avait pas de relation significative avec la condition corporelle ainsi que l'âge au baguage. En plus de n'avoir qu'à parcourir de courtes distances durant leur migration, l'utilisation prédominante d'habitats non ouverts à la chasse par les groupes familiaux durant l'automne pourrait expliquer la survie élevée des juvéniles. D'autre part, l'utilisation d'habitats ruraux où la pression de chasse est possiblement plus grande, combiné au phénomène de migration de mue pourrait contribuer aux taux de survie plus faibles des adultes non accompagnés de jeunes et des oiseaux d'un an. Le taux de survie observé pour les adultes porte à croire que la croissance de la population est supportée de façon importante par une fécondité élevée. L'importance de l'immigration ainsi que des paramètres de fécondité, dans le taux de croissance de la population restent donc à déterminer. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : âge, Bernache du Canada, Branta…

Subjects/Keywords: Bernache du Canada; Biologie des populations; Dynamique des populations; Survie; Québec (Sud)

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APA (6^th Edition):

Pilotte, C. (2012). Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Pilotte, Catherine. “Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.” 2012. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf.

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Pilotte, Catherine. “Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.” 2012. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Pilotte C. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf.

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Council of Science Editors:

Pilotte C. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

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Université du Québec à Montréal

6. Pilotte, Catherine. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.

Degree: 2012, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

► Les Bernaches du Canada établies en milieu tempéré sont souvent considérées comme une source de nuisances dans plusieurs régions de l'est de l'Amérique du Nord.… (more)

▼ Les Bernaches du Canada établies en milieu tempéré sont souvent considérées comme une source de nuisances dans plusieurs régions de l'est de l'Amérique du Nord. Dans le sud du Québec, une population nicheuse s'est établie il y a une vingtaine d'années et continue de croître depuis. Les oies et les bernaches sont des oiseaux à forte longévité et la survie est donc un facteur déterminant pour la gestion de ces populations. Le premier objectif de notre étude était de décrire la distribution spatio-temporelle de la récolte des bernaches établies dans le sud du Québec. Notre second objectif consistait à estimer les taux de survie de ces oiseaux et d'évaluer l'effet du sexe et de l'âge sur cette survie ainsi que les variations interannuelles. Notre dernier objectif était d'évaluer l'effet de la date d'éclosion, de l'âge au baguage et de la condition corporelle au baguage sur la survie des juvéniles. Des modèles de capture-marquage-recapture combinant des données de recaptures d'oiseaux vivants et de retours de bagues d'oiseaux abattus ont été élaborés en utilisant les oiseaux bagués comme juvéniles entre 2003 et 2009. La majorité des retours de bagues d'oiseaux abattus par la chasse provenait du Québec. La distribution des retours était concentrée en deux secteurs : aux alentours de Varennes dans le sud du Québec, puis le long de la côte américaine entre le Rhode Island et le Maryland. La récolte comprenait majoritairement des juvéniles dans le premier cas et des jeunes d'un an dans le deuxième cas. Au Québec, la récolte durant la période de chasse hâtive totalise 9 % de la récolte totale. Bien que la différence était légère, la survie des femelles était plus faible que celle des mâles. La survie des juvéniles variait entre les années entre 0.73 (95 % IC 0.43-0.90) et 0.90 (0.74-0.96) et était plus élevée que pour les adultes (0.56 [0.44-0.67] à 0.76 [0.68-0.82]) et les oiseaux d'un an (0.54 [0.45-0.63] à 0.73 [0.64-0.81]). Une relation négative entre la date d'éclosion et la survie des juvéniles a été observée mais il n'y avait pas de relation significative avec la condition corporelle ainsi que l'âge au baguage. En plus de n'avoir qu'à parcourir de courtes distances durant leur migration, l'utilisation prédominante d'habitats non ouverts à la chasse par les groupes familiaux durant l'automne pourrait expliquer la survie élevée des juvéniles. D'autre part, l'utilisation d'habitats ruraux où la pression de chasse est possiblement plus grande, combiné au phénomène de migration de mue pourrait contribuer aux taux de survie plus faibles des adultes non accompagnés de jeunes et des oiseaux d'un an. Le taux de survie observé pour les adultes porte à croire que la croissance de la population est supportée de façon importante par une fécondité élevée. L'importance de l'immigration ainsi que des paramètres de fécondité, dans le taux de croissance de la population restent donc à déterminer. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : âge, Bernache du Canada, Branta…

Subjects/Keywords: Bernache du Canada; Biologie des populations; Dynamique des populations; Survie; Québec (Sud)

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Pilotte, C. (2012). Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Pilotte, Catherine. “Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.” 2012. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Pilotte, Catherine. “Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec.” 2012. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Pilotte C. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf.

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Council of Science Editors:

Pilotte C. Survie annuelle des bernaches du Canada (Branta canadensis maxima) établies dans le sud du Québec. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. Available from: http://archipel.uqam.ca/4970/1/M12405.pdf

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Université du Québec à Montréal

7. Marion, Alexandra. La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean.

Degree: 2018, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/12155/1/D3539.pdf

► La pêche commerciale et sportive sont importantes au Canada et ont d’importantes répercussions socio-économiques. Le lac Saint-Jean, lac naturel contrôlé par une retenue, est réputé… (more)

▼ La pêche commerciale et sportive sont importantes au Canada et ont d’importantes répercussions socio-économiques. Le lac Saint-Jean, lac naturel contrôlé par une retenue, est réputé pour sa pêche sportive à la ouananiche (saumon d’eau douce Salmo salar), également au doré jaune (Sander vitreus) et à la lotte (Lota lota). Le lac abrite la plus importante population de ouananiches en Amérique du Nord. Dès lors, il est devenu un attrait écotouristique important pour la région du Québec. Le zooplancton joue un rôle essentiel dans les écosystèmes aquatiques puisqu’il permet le transfert d’énergie de la production primaire vers les niveaux trophiques supérieurs. La productivité de la ouananiche, du doré jaune et de la lotte dépendent de celle de l’éperlan arc-en-ciel (Osmerus mordax), poisson fourrage du lac. Le lien entre ces espèces et l’éperlan est bien connu toutefois très peu d’études se sont intéressées à la relation entre l’éperlan arc-en-ciel et le zooplancton. Ces études ont montré que les larves d’éperlan pouvaient consommer de 60 à 70 % par jour de leur masse corporelle au début de l’été et que leur diète était constituée de cladocères et de copépodes. Malgré l’importance du zooplancton pour ces larves, les connaissances sur le zooplancton du lac sont très limitées. Pour mieux comprendre le fonctionnement du système aquatique, il est fondamental de prendre en considération l’étude de la dynamique des populations zooplanctoniques du lac et de connaître les forces environnementales régissant le contrôle de ces populations. L’objectif de cette thèse était d’étudier la dynamique du zooplancton de ce réservoir oligotrophe du Bouclier boréal canadien. Cette étude visait à définir la dynamique du zooplancton du lac et également identifier les différents facteurs environnementaux interagissant sur cette dynamique. Pour étudier cette dynamique, un échantillonnage synoptique de zooplancton et de différentes variables environnementales a été réalisé de mai à octobre (période d’eau libre de glace) pendant deux années consécutives (2006 et 2007) afin d’étudier la dynamique de la structure saisonnière et spatiale de la communauté de crustacés zooplanctoniques ainsi que les processus ascendants et descendants contrôlant la dynamique de population des deux principales espèces de copépodes du lac. Un échantillonnage a été réalisé en 2008 à deux stations pendant cette période (mai à octobre) pour mettre en évidence les relations trophiques à l’intérieur de l’écosystème pélagique du lac à l’aide des isotopes stables de carbone et d’azote. Les résultats ont tout d’abord montré que la communauté de crustacés zooplanctoniques du lac était dominée par deux copépodes Leptodiaptomus ashlandi (calanoïde) et Diacyclops bicuspidatus thomasi (cyclopoïde). Cette communauté a révélé un changement saisonnier qui différait entre les deux années due principalement aux différents patrons d’abondance de L. ashlandi. Cette variabilité interannuelle peut être vraisemblablement expliquée par la prédation des vertébrés (jeunes de l’année d’éperlan…

Subjects/Keywords: Zooplancton – Populations; Lac Saint-Jean; Copépodes; Variations saisonnières; Distribution verticale; Chaînes alimentaires; Dynamique des populations

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APA (6^th Edition):

Marion, A. (2018). La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/12155/1/D3539.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Marion, Alexandra. “La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean.” 2018. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/12155/1/D3539.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Marion, Alexandra. “La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean.” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Marion A. La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/12155/1/D3539.pdf.

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Council of Science Editors:

Marion A. La dynamique du zooplancton au lac Saint-Jean. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2018. Available from: http://archipel.uqam.ca/12155/1/D3539.pdf

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Université Montpellier II

8. Champagnon, Jocelyn. Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos.

Degree: Docteur es, Evolution, Ecologie, Ressources génétiques, Paléontologie, 2011, Université Montpellier II

URL: http://www.theses.fr/2011MON20147

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Le renforcement des populations naturelles exploitées par des individus captifs est rarement évalué, bien qu'il puisse induire des modifications notables sur la population naturelle à… (more)

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Le renforcement des populations naturelles exploitées par des individus captifs est rarement évalué, bien qu'il puisse induire des modifications notables sur la population naturelle à de nombreux niveaux : démographie, comportement, morphologie, génétique, pathogènes. Ce travail de thèse concerne les introductions de canards colverts Anas platyrhynchos réalisées à des fins cynégétiques. Cette pratique est très répandue en Europe, depuis plus de trente ans. Du fait de leur domestication en élevage, les canards lâchés subissent une mortalité naturelle très forte comparée aux oiseaux sauvages, à laquelle s'ajoute une plus grande vulnérabilité à la chasse. Une différenciation génétique marquée permet de discriminer les oiseaux lâchés de leurs congénères sauvages. Des croisements entre les deux groupes sont détectés, mais l'introgression reste limitée. Globalement, la contribution démographique et génétique des individus d'élevage à la population sauvage est faible, même si une modification morphologique attribuable aux lâchers a été constatée dans la population sauvage en trente ans. Les conséquences écologiques pour la population réceptrice semblent donc limitées, mais une vigilance continue doit s'exercer concernant la diffusion de pathogènes (forte prévalence occasionnelle de virus Influenza A dans les élevages) et les risques génétiques associés au renforcement sur le long terme.

The consequences of releasing captive-reared game animals into the wild have received little attention, despite their potential impact for receiving populations in terms of demography, behaviour, morphometrics, genetics and pathogens. The present study considers Mallards Anas platyrhynchos released for hunting purposes, an increasing practice in Europe over the last 30 years. Because of domestication process in game farm facilities, our study shows high natural mortality of these ducks once released compared to wild Mallards, in addition to high vulnerability to hunting. A clear genetic differentiation allows discrimination of released and wild Mallards. Hybridization with wild Mallards exists, but did not result into significant introgression. Generally, genetic as well as demographic contributions of captive-bred birds to the natural population were low, but a morphological modification associated with releases was recorded over 30 years in natural population. Ecological consequences of the releases for the wild population seem to be limited, but caution should be maintained on the possible transmission of pathogens (occasionally high prevalence of avian Influenza A in some breeding facilities) and the genetic risks associated with long-term releases.

Advisors/Committee Members: Guillemain, Matthieu (thesis director).

Subjects/Keywords: Dynamique des populations; Génétique des populations; Renforcement; Chasse; Canard; Domestication; Population dynamics; Population genetics; Restocking; Hunting; Duck; Domestication

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Champagnon, J. (2011). Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos. (Doctoral Dissertation). Université Montpellier II. Retrieved from http://www.theses.fr/2011MON20147

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Champagnon, Jocelyn. “Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos.” 2011. Doctoral Dissertation, Université Montpellier II. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2011MON20147.

MLA Handbook (7^th Edition):

Champagnon, Jocelyn. “Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos.” 2011. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Champagnon J. Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Montpellier II; 2011. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2011MON20147.

Council of Science Editors:

Champagnon J. Conséquences des introductions d’individus dans les populations exploitées : l’exemple du Canard Colvert Anas platyrhynchos : Consequences of massive bird releases for hunting purposes, the Mallard Anas platyrhynchos. [Doctoral Dissertation]. Université Montpellier II; 2011. Available from: http://www.theses.fr/2011MON20147

Université du Québec à Montréal

9. Godde, Sophie. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).

Degree: 2011, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

► La vie en groupe impose à la fois des contraintes et confère des avantages aux individus. Lorsque les bénéfices supplantent les coûts, il peut y… (more)

▼ La vie en groupe impose à la fois des contraintes et confère des avantages aux individus. Lorsque les bénéfices supplantent les coûts, il peut y avoir formation d'un mode de vie social, dont les structures diffèrent selon les populations. Or, la structure sociale peut jouer un rôle déterminant sur la structure génétique, l'aptitude phénotypique des individus, ainsi que la diffusion de l'information ou la transmission de maladies. Nous avons utilisé une approche d'analyse des réseaux sociaux pour étudier la structure sociale d'une population naturelle de chèvres de montagne, en Alberta. Plus particulièrement nous souhaitions tester si les femelles apparentées s'associaient plus entre elles que des femelles non apparentées. De plus, nous voulions vérifier si les femelles s'associaient en fonction de leur similarité de masse corporelle, d'âge et de statut reproducteur. Nous basant sur les données de composition de groupes de chèvres entre 2005 et 2008, nous avons développé un nouvel indice, le « half-weight index corrigé » (HWIC) corrigeant les effets du grégarisme sur l'estimation de la force des associations. À l'aide de simulations, nous montrons que le HWIC produit des estimations beaucoup moins biaisées que l'indice le plus fréquemment utilisé, le « half-weight index ». Nous avons ensuite utilisé des arbres de régression pour déterminer l'effet des différents facteurs testés ainsi que leurs interactions sur la force des associations entre femelles. L'apparentement et la similitude du statut reproducteur influençaient les associations entre femelles, mais leur importance différait selon leur classe d'âge : tandis que les femelles immatures s'associaient fortement avec leur mère, les femelles adultes qui s'étaient reproduites s'associaient principalement entre elles. Par contre, les dyades de femelles adultes non reproductrices et les dyades de femelles de statut reproducteur différent s'associaient en fonction de leur degré de parenté. Le HWIC nous a permis d'étudier les associations des individus sur plusieurs années indépendamment des différences individuelles et populationnelle de grégarisme selon les années. Nous avons utilisé pour la première fois, à notre connaissance, une approche multivariée pour décrire les associations entre individus. Nos résultats montrent que cette approche peut être pertinente lorsque l'on étudie la structure sociale d'une population, car elle apporte des informations sur la complexité des associations en mettant en évidence les interactions entre les facteurs qui les influencent. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : structure sociale, réseau social, chèvre de montagne, apparentement, statut reproducteur, indice d'association.

Subjects/Keywords: Chèvre de montagne; Comportement social des animaux; Dynamique des populations; Femelle; Société animale

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Godde, S. (2011). Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Godde, Sophie. “Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).” 2011. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Godde, Sophie. “Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).” 2011. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Godde S. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf.

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Godde S. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

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Université du Québec à Montréal

10. Emond, Kim. Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio).

Degree: 2018, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/11777/1/D3505.pdf

► Chez les invertébrés marins benthiques, la variabilité du recrutement des premiers stades de vie (c.-à-d., œuf, larve et juvénile) peut jouer un rôle prépondérant dans… (more)

Subjects/Keywords: Crabe des neiges; Recrutement; Dynamique des populations; Larves; Phénologie; Facteurs climatiques; Cannibalisme

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APA (6^th Edition):

Emond, K. (2018). Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio). (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/11777/1/D3505.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Emond, Kim. “Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio).” 2018. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/11777/1/D3505.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Emond, Kim. “Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio).” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Emond K. Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio). [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/11777/1/D3505.pdf.

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Emond K. Phénologie et dynamique de population des crustacés décapodes : effets de facteurs biotiques et climatiques sur le recrutement du crabe des neiges (Chionoecetes opilio). [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2018. Available from: http://archipel.uqam.ca/11777/1/D3505.pdf

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Université du Québec à Montréal

11. Godde, Sophie. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).

Degree: 2011, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

► La vie en groupe impose à la fois des contraintes et confère des avantages aux individus. Lorsque les bénéfices supplantent les coûts, il peut y… (more)

▼ La vie en groupe impose à la fois des contraintes et confère des avantages aux individus. Lorsque les bénéfices supplantent les coûts, il peut y avoir formation d'un mode de vie social, dont les structures diffèrent selon les populations. Or, la structure sociale peut jouer un rôle déterminant sur la structure génétique, l'aptitude phénotypique des individus, ainsi que la diffusion de l'information ou la transmission de maladies. Nous avons utilisé une approche d'analyse des réseaux sociaux pour étudier la structure sociale d'une population naturelle de chèvres de montagne, en Alberta. Plus particulièrement nous souhaitions tester si les femelles apparentées s'associaient plus entre elles que des femelles non apparentées. De plus, nous voulions vérifier si les femelles s'associaient en fonction de leur similarité de masse corporelle, d'âge et de statut reproducteur. Nous basant sur les données de composition de groupes de chèvres entre 2005 et 2008, nous avons développé un nouvel indice, le « half-weight index corrigé » (HWIC) corrigeant les effets du grégarisme sur l'estimation de la force des associations. À l'aide de simulations, nous montrons que le HWIC produit des estimations beaucoup moins biaisées que l'indice le plus fréquemment utilisé, le « half-weight index ». Nous avons ensuite utilisé des arbres de régression pour déterminer l'effet des différents facteurs testés ainsi que leurs interactions sur la force des associations entre femelles. L'apparentement et la similitude du statut reproducteur influençaient les associations entre femelles, mais leur importance différait selon leur classe d'âge : tandis que les femelles immatures s'associaient fortement avec leur mère, les femelles adultes qui s'étaient reproduites s'associaient principalement entre elles. Par contre, les dyades de femelles adultes non reproductrices et les dyades de femelles de statut reproducteur différent s'associaient en fonction de leur degré de parenté. Le HWIC nous a permis d'étudier les associations des individus sur plusieurs années indépendamment des différences individuelles et populationnelle de grégarisme selon les années. Nous avons utilisé pour la première fois, à notre connaissance, une approche multivariée pour décrire les associations entre individus. Nos résultats montrent que cette approche peut être pertinente lorsque l'on étudie la structure sociale d'une population, car elle apporte des informations sur la complexité des associations en mettant en évidence les interactions entre les facteurs qui les influencent. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : structure sociale, réseau social, chèvre de montagne, apparentement, statut reproducteur, indice d'association.

Subjects/Keywords: Chèvre de montagne; Comportement social des animaux; Dynamique des populations; Femelle; Société animale

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Godde, S. (2011). Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Godde, Sophie. “Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).” 2011. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Godde, Sophie. “Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus).” 2011. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Godde S. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf.

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Council of Science Editors:

Godde S. Étude des facteurs influençant la structure sociale des femelles d'une population naturelle de chèvres de montagne (Oreamnos americanus). [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. Available from: http://archipel.uqam.ca/3946/1/M11962.pdf

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Université du Québec à Montréal

12. Boisjoli, Geneviève. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).

Degree: 2010, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

► L'aster à rameaux étalés (Eurybia divaricata) est une herbacée forestière rare au Canada, mais commune dans le reste de son aire de répartition. Au Québec,… (more)

▼ L'aster à rameaux étalés (Eurybia divaricata) est une herbacée forestière rare au Canada, mais commune dans le reste de son aire de répartition. Au Québec, seulement 11 occurrences sont répertoriées et elles se trouvent en Montérégie. L'espèce a le statut d'espèce menacée au Canada depuis 1995 et au Québec depuis 2005. Cette étude a été entreprise afin de mieux comprendre la dynamique des populations au Québec et pour déterminer quels facteurs écologiques définissent le microhabitat. L'étude démographique a été effectuée sur quatre populations; deux à St-Armand et deux au Petit Pinacle près de Frelishburg. Les individus ont fait l'objet d'un suivi de trois ans (2007 à 2009). Ceci a permis de connaître la structure des populations et de construire des matrices de transition et d'élasticité. Ces matrices calculent les taux de croissance des populations d'une année à l'autre et font ressortir les comportements démographiques les plus importants pour la croissance de celles-ci. Les résultats montrent que l'espèce est une herbacée typique des sous-bois par la structure de ses populations et par les taux de croissance qui varient autour de 1,0. En reliant les facteurs écologiques et l'importance attribuée aux comportements démographiques, les résultats montrent que la lumière disponible, associée à l'ouverture de la canopée, est le facteur le plus déterminant. Les populations sous un couvert forestier ouvert ont des taux de croissance positifs, et attribuent plus de ressources à la croissance individuelle, la propagation végétative et la fertilité. Lorsque la canopée se referme, la survie des individus devient le comportement démographique le plus important. Ces populations ont des taux de croissance en général négatifs et qui fluctuent, ce qui augmente leurs probabilités d'extinction. L'étude de l'habitat a montré que la présence de cet aster est influencée par la lumière et l'épaisseur de litière. Ces facteurs contribuent à la germination, à l'établissement des semis et à la propagation des rhizomes. La rareté de l'espèce pourrait s'expliquer par la fréquence modifiée des perturbations, qui ne permet plus de retrouver assez fréquemment les conditions favorables pour la recolonisation de l'espèce dans le paysage. Puisque la grande majorité du territoire naturel constituant l'habitat de l'espèce se trouve sur des terres privées, la meilleure recommandation est d'encourager les organismes de conservation à promouvoir la conservation de son habitat par l'acquisition de terrains ou de servitudes de conservation. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Eurybia divaricata, espèce menacée, démographie, matrices de transition, microhabitat, lumière disponible

Subjects/Keywords: Aster à rameaux étalés; Dynamique des populations; Niche écologique; Québec (Province)

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Boisjoli, G. (2010). Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Boisjoli, Geneviève. “Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).” 2010. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Boisjoli, Geneviève. “Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).” 2010. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Boisjoli G. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf.

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Boisjoli G. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

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Université du Québec à Montréal

13. Gauthier, Joanna. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.

Degree: 2012, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

► La stratification thermique, caractérisée par la présence d'une thermocline, est un facteur clé structurant les communautés de plancton dans la zone pélagique des lacs. Les… (more)

▼ La stratification thermique, caractérisée par la présence d'une thermocline, est un facteur clé structurant les communautés de plancton dans la zone pélagique des lacs. Les changements climatiques (vents forts, orages fréquents, sécheresses intenses) et les activités anthropiques près des lacs (déforestation) pourraient occasionner un abaissement de la thermocline dans les lacs tempérés. Les effets d'un tel abaissement sur la phénologie, la biomasse totale et la taille des individus du zooplancton dans le temps ont été évalués. La thermocline d'un bassin du Lac Croche (constitué de trois bassins), Québec, Canada, a été abaissée par mélange à l'aide d'une éolienne aquatique. L'échantillonnage a eu lieu sur une année contrôle (sans manipulation) et deux années expérimentales (avec abaissement). Le protocole statistique BACI a permis d'évaluer les effets de trois traitements différents, soit l'abaissement, l'abaissement+mélange et le mélange. Au printemps, certains effets des traitements ont été discernés indirectement par le réchauffement des sédiments, mais le climat semblait avoir une grande influence sur la dynamique des communautés de crustacés. Pendant l'été, les changements de la communauté de crustacés étaient principalement influencés par la profondeur de la thermocline. De plus, la biomasse de chlorophylle et celle des crustacées ont augmenté face aux traitements pendant l'été. Tropocyclops prasinus et Bosmina longirostris étaient plus abondantes lors de l'abaissement de la thermocline pendant l'été, ce qui a réduit significativement la taille individuelle de la communauté des crustacés. Les assemblages de rotifères étaient dominés par des espèces ayant des caractéristiques pour les protéger de la prédation. Cette étude suggère qu'un abaissement de la thermocline dans les lacs tempérés pourrait mener à une augmentation des productions primaire et secondaire, mais également à une réduction des proies zooplanctoniques pour les poissons suite à un changement dans la composition et la taille individuelle de la communauté. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : abaissement de la thermocline, zooplancton, phénologie, taille individuelle, biomasse totale, structure des communautés

Subjects/Keywords: Changement climatique; Dynamique des populations; Écosystème aquatique; Impact; Lac; Thermocline; Zooplancton

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Gauthier, J. (2012). Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Gauthier, Joanna. “Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.” 2012. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Gauthier, Joanna. “Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.” 2012. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Gauthier J. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf.

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Council of Science Editors:

Gauthier J. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

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Université du Québec à Montréal

14. Boisjoli, Geneviève. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).

Degree: 2010, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

► L'aster à rameaux étalés (Eurybia divaricata) est une herbacée forestière rare au Canada, mais commune dans le reste de son aire de répartition. Au Québec,… (more)

▼ L'aster à rameaux étalés (Eurybia divaricata) est une herbacée forestière rare au Canada, mais commune dans le reste de son aire de répartition. Au Québec, seulement 11 occurrences sont répertoriées et elles se trouvent en Montérégie. L'espèce a le statut d'espèce menacée au Canada depuis 1995 et au Québec depuis 2005. Cette étude a été entreprise afin de mieux comprendre la dynamique des populations au Québec et pour déterminer quels facteurs écologiques définissent le microhabitat. L'étude démographique a été effectuée sur quatre populations; deux à St-Armand et deux au Petit Pinacle près de Frelishburg. Les individus ont fait l'objet d'un suivi de trois ans (2007 à 2009). Ceci a permis de connaître la structure des populations et de construire des matrices de transition et d'élasticité. Ces matrices calculent les taux de croissance des populations d'une année à l'autre et font ressortir les comportements démographiques les plus importants pour la croissance de celles-ci. Les résultats montrent que l'espèce est une herbacée typique des sous-bois par la structure de ses populations et par les taux de croissance qui varient autour de 1,0. En reliant les facteurs écologiques et l'importance attribuée aux comportements démographiques, les résultats montrent que la lumière disponible, associée à l'ouverture de la canopée, est le facteur le plus déterminant. Les populations sous un couvert forestier ouvert ont des taux de croissance positifs, et attribuent plus de ressources à la croissance individuelle, la propagation végétative et la fertilité. Lorsque la canopée se referme, la survie des individus devient le comportement démographique le plus important. Ces populations ont des taux de croissance en général négatifs et qui fluctuent, ce qui augmente leurs probabilités d'extinction. L'étude de l'habitat a montré que la présence de cet aster est influencée par la lumière et l'épaisseur de litière. Ces facteurs contribuent à la germination, à l'établissement des semis et à la propagation des rhizomes. La rareté de l'espèce pourrait s'expliquer par la fréquence modifiée des perturbations, qui ne permet plus de retrouver assez fréquemment les conditions favorables pour la recolonisation de l'espèce dans le paysage. Puisque la grande majorité du territoire naturel constituant l'habitat de l'espèce se trouve sur des terres privées, la meilleure recommandation est d'encourager les organismes de conservation à promouvoir la conservation de son habitat par l'acquisition de terrains ou de servitudes de conservation. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Eurybia divaricata, espèce menacée, démographie, matrices de transition, microhabitat, lumière disponible

Subjects/Keywords: Aster à rameaux étalés; Dynamique des populations; Niche écologique; Québec (Province)

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APA (6^th Edition):

Boisjoli, G. (2010). Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Boisjoli, Geneviève. “Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).” 2010. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Boisjoli, Geneviève. “Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata).” 2010. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Boisjoli G. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf.

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Boisjoli G. Dynamique des populations et étude du microhabitat d'un aster forestier rare et menacé (Eurybia divaricata). [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. Available from: http://archipel.uqam.ca/3718/1/M11551.pdf

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Université du Québec à Montréal

15. Gauthier, Joanna. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.

Degree: 2012, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

► La stratification thermique, caractérisée par la présence d'une thermocline, est un facteur clé structurant les communautés de plancton dans la zone pélagique des lacs. Les… (more)

▼ La stratification thermique, caractérisée par la présence d'une thermocline, est un facteur clé structurant les communautés de plancton dans la zone pélagique des lacs. Les changements climatiques (vents forts, orages fréquents, sécheresses intenses) et les activités anthropiques près des lacs (déforestation) pourraient occasionner un abaissement de la thermocline dans les lacs tempérés. Les effets d'un tel abaissement sur la phénologie, la biomasse totale et la taille des individus du zooplancton dans le temps ont été évalués. La thermocline d'un bassin du Lac Croche (constitué de trois bassins), Québec, Canada, a été abaissée par mélange à l'aide d'une éolienne aquatique. L'échantillonnage a eu lieu sur une année contrôle (sans manipulation) et deux années expérimentales (avec abaissement). Le protocole statistique BACI a permis d'évaluer les effets de trois traitements différents, soit l'abaissement, l'abaissement+mélange et le mélange. Au printemps, certains effets des traitements ont été discernés indirectement par le réchauffement des sédiments, mais le climat semblait avoir une grande influence sur la dynamique des communautés de crustacés. Pendant l'été, les changements de la communauté de crustacés étaient principalement influencés par la profondeur de la thermocline. De plus, la biomasse de chlorophylle et celle des crustacées ont augmenté face aux traitements pendant l'été. Tropocyclops prasinus et Bosmina longirostris étaient plus abondantes lors de l'abaissement de la thermocline pendant l'été, ce qui a réduit significativement la taille individuelle de la communauté des crustacés. Les assemblages de rotifères étaient dominés par des espèces ayant des caractéristiques pour les protéger de la prédation. Cette étude suggère qu'un abaissement de la thermocline dans les lacs tempérés pourrait mener à une augmentation des productions primaire et secondaire, mais également à une réduction des proies zooplanctoniques pour les poissons suite à un changement dans la composition et la taille individuelle de la communauté. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : abaissement de la thermocline, zooplancton, phénologie, taille individuelle, biomasse totale, structure des communautés

Subjects/Keywords: Changement climatique; Dynamique des populations; Écosystème aquatique; Impact; Lac; Thermocline; Zooplancton

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Gauthier, J. (2012). Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Gauthier, Joanna. “Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.” 2012. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Gauthier, Joanna. “Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton.” 2012. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Gauthier J. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf.

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Gauthier J. Effets d'un abaissement de la thermocline sur la dynamique des communautés de zooplancton. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2012. Available from: http://archipel.uqam.ca/5417/1/M12711.pdf

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16. Gounot, Jean-Sébastien. Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum.

Degree: Docteur es, Bioinformatique, 2018, Université de Strasbourg

URL: http://www.theses.fr/2018STRAJ052

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Les améliorations des technologies de séquençage offrent aujourd’hui la possibilité d’explorer la variabilité intraspécifique au sein d’une espèce à travers le séquençage complet du génome… (more)

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Les améliorations des technologies de séquençage offrent aujourd’hui la possibilité d’explorer la variabilité intraspécifique au sein d’une espèce à travers le séquençage complet du génome d’un grand nombre d’individus. Dans ce contexte, mes travaux de thèse se sont basés sur l’étude et la comparaison de la variabilité génomique à travers des études de génomique des populations au sein de plusieurs espèces de levures. Dans un premier temps, j’ai réalisé une étude systématique de la variabilité intraspécifique au sein de 6 espèces de levures, me donnant notamment la possibilité d’étudier la variabilité du contenu en gènes entre les espèces. Dans un second temps, je me suis focalisé sur l’utilisation des dernières technologies de séquençage dans l’objectif de produire une séquence de référence de Dekkera bruxellensis, dont l’absence pour un grand nombre d’espèces limite l’établissement d’étude de génomique des populations. Cette séquence a été utilisée dans un dernier temps afin d’étudier l’évolution de l’espèce. Dans l’ensemble, ces travaux apportent de solides fondations dans l’exploration de la diversité génétique au sein d’espèces non-modèles.

Advent of high throughput technologies as well as the reduction of their price open the way to the exploration of the intraspecific genetic variation at the species level by sequencing the complete genome of a wide range of individuals. Doing so, I first produced populations genomics studies of 6 yeast species based on the same framework, allowing the exploration and comparison of the genes repository of each species. I then used new sequencing technologies to produce a reference sequence for the yeast species Dekkera bruxellensis. Using this sequence, I was then able to produce for the first time a population genomic study at the genome wide scale for this species.

Advisors/Committee Members: Schacherer, Joseph (thesis director).

Subjects/Keywords: Génomique des populations; Bioinformatique; Levure; Population genomic; Bioinformatic; Yeast; 572.8

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Gounot, J. (2018). Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2018STRAJ052

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Gounot, Jean-Sébastien. “Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum.” 2018. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2018STRAJ052.

MLA Handbook (7^th Edition):

Gounot, Jean-Sébastien. “Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum.” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Gounot J. Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2018STRAJ052.

Council of Science Editors:

Gounot J. Génomique des populations : étude comparative au sein du sous-phylum des Saccharomycotina : Population genomics : comparative study within the Saccharomycotina subphylum. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2018. Available from: http://www.theses.fr/2018STRAJ052

Université de Sherbrooke

17. Porlier, Melody. Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel.

Degree: 2013, Université de Sherbrooke

URL: http://hdl.handle.net/11143/6562

► La persistence des populations en milieu naturel dépend de leur capacité à répondre aux changements spatio-temporels de leur environnement et aux pressions de sélection qui… (more)

▼ La persistence des populations en milieu naturel dépend de leur capacité à répondre aux changements spatio-temporels de leur environnement et aux pressions de sélection qui en découlent. Deux mécanismes principaux permettent aux organismes de s’ajuster à de nouvelles conditions environnementales tout en assurant leur persistence locale: la plasticité phénotypique, soit un ajustement du phénotype sans modifications génétiques sous-jacentes; et l'évolution des populations en réponse à la sélection, ou adaptation, processus par lequel les génotypes les mieux adaptés aux conditions environnementales se retrouvent progressivement en plus grande proportion au sein d’une population. Or, le potentiel de réponses plastiques et génétiques peut varier entre populations d'une même espèce, entre autres puisqu'il est lui-même dépendant de l'hétérogénéité spatio-temporelle de l'environnement. Cependant, nous avons à ce jour peu de connaissances sur la façon dont l'environnement affecte les patrons de plasticité phénotypique et le potentiel adaptatif des populations en milieu naturel, rendant difficile la prédiction de la réponse des populations face aux changements environnementaux. Mon doctorat vise donc à comprendre comment l'hétérogénéité environnementale affecte la capacité des populations naturelles à répondre, par le biais de changements plastiques et/ou génétiques, aux changements environnementaux. Pour ce faire, j’ai étudié des populations de Mésanges bleues (Cyanistes caeruleus) du sud de la France et de la Corse, qui occupent différents types d’habitats forestiers (caducifoliés et sempervirents). Ce système représente un cas intéressant d’hétérogénéité environnementale étant donné la grande variabilité dans la période de disponibilité et l’abondance de nourriture entre habitats caducifoliés et sempervirents, les premiers étant plus hâtifs et plus riches en ressources que les seconds. Cette hétérogénéité environnementale est responsable d’une divergence phénotypique marquée au niveau de traits morphologiques et reproducteurs entre populations occupant ces différents types d’habitats. En utilisant à la fois une base de données phénotypiques à long terme, des pedigrees disponibles pour chacune des populations, ainsi que de l’information obtenue à partir de marqueurs microsatellites, j'ai déterminé dans un premier temps: i) les patrons de plasticité phénotypique au sein de chaque population; ii) les niveaux de potentiel adaptatif de traits morphologiques et reproducteurs au sein de chaque population; et iii) la structuration génétique de populations au sein d'un paysage hétérogène. Ensuite, j'ai mis en relation ces patrons avec diverses variables environnementales afin de comprendre comment l'hétérogénéité spatio-temporelle de l'environnement affecte ces paramètres. J'ai d'abord montré un lien entre la variabilité interindividuelle de la plasticité de la date de ponte - un trait reproducteur important chez les oiseaux puisque son ajustement permet une synchronisation de la reproduction avec la période d’abondance maximale de… Advisors/Committee Members: Garant, Dany (advisor).

Subjects/Keywords: Plasticité phénotypique; Évolution des populations; Hétérogénéité spatio-temporelle de l'environnement

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Porlier, M. (2013). Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel. (Doctoral Dissertation). Université de Sherbrooke. Retrieved from http://hdl.handle.net/11143/6562

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Porlier, Melody. “Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel.” 2013. Doctoral Dissertation, Université de Sherbrooke. Accessed January 24, 2021. http://hdl.handle.net/11143/6562.

MLA Handbook (7^th Edition):

Porlier, Melody. “Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel.” 2013. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Porlier M. Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Sherbrooke; 2013. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://hdl.handle.net/11143/6562.

Council of Science Editors:

Porlier M. Effets de l'hétérogénéité environnementale sur les patrons de plasticité phénotypique et la variabilité génétique des populations de mésange bleue (cyanistes caeruleus) en milieu naturel. [Doctoral Dissertation]. Université de Sherbrooke; 2013. Available from: http://hdl.handle.net/11143/6562

Université de Sherbrooke

18. Jean, Pierre-Olivier. Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie.

Degree: 2015, Université de Sherbrooke

URL: http://hdl.handle.net/11143/7736

► L’écologie nutritionnelle des populations de cervidés revêt une grande importance en contexte de population surabondante. L’intense pression d’herbivorie de certaines populations de cervidés nuît à… (more)

▼ L’écologie nutritionnelle des populations de cervidés revêt une grande importance en contexte de population surabondante. L’intense pression d’herbivorie de certaines populations de cervidés nuît à la régénération de la flore endémique et entraîne une baisse de la biodiversité. On explique encore mal la sélection alimentaire chez ces herbivores, ce qui nuit d’une part à notre capacité de prédire d’éventuels changements dans les trajectoires floristiques, et d’autre part à notre capacité d’anticiper la réponse démographique de ces herbivores. Or, notre capacité à acquérir des connaissances sur l’écologie nutritionnelle des herbivores peut être limitée par les contraintes logistiques et méthodologiques nécessaires à l’évaluation de la qualité nutritionnelle dans un contexte d’étude écologique, de même que par un manque d’objectivité dans la définition de devises alimentaires appropriées pour l’animal d’étude. Les principaux objectifs de mon projet de doctorat sont donc de développer de nouvelles méthodologies dans l’étude des interactions entre un grand cervidé, le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus) et son habitat, et d’implémenter ces nouveux outils dans le cadre d’études écologiques. J’ai effectué mes recherches à l’île d’Anticosti, qui est un laboratoire naturel bien adapté à l’étude des populations abondantes de cervidés. Le cerf de Virginie y a été introduit en l’absence de prédateurs naturels il y a plus de 100 ans, et cette population de cervidés est l’une des les plus denses au monde. La forte pression d’herbivorie a profondément changé la composition floristique sur l’île. Puisque l’industrie forestière et le tourisme issu de la chasse au cerf y sont les deux activités économique les plus importantes, l’étude des interactions cerf-forêt y est cruciale, tant sur le plan scientifique que pour le développement régional. Cette thèse se décline en 4 chapîtres centraux (i.e. chapitres 1,2, 3 et 4) écrits sous formes d’articles. Les deux premiers articles sont consacrés à l’élaboration de nouvelles méthodes facilitant le monitoring de la nutrition du cerf de Virginie à l’île d’Anticosti. Dans un premier temps (chapitre 1), j’utilise des modèles prédictifs utilisant la spectroscopie dans le proche infrarouge ainsi que certaines propriétés chimiques des fèces de cerf afin de prédire son régime alimentaire. Je compare ensuite (chapitre 2) différentes méthodes afin de prédire des variables alimentaires obtenues par des digestions In vitro de différents fourrages qui utilisent la liqueur ruminale de cerf. Les deux chapitres suivants sont intégrateurs et propose des implémentations de nouvelles méthodes dans le cadre d’études écologiques à l’échelle du paysage. Je propose dans le chapitre 3 un nouvel indice de qualité alimentaire qui utilise la spectroscopie dans le proche infra-rouge, les géostatistiques ainsi que des données d’inventaires floristiques afin d’estimer les patrons de qualité alimentaire à l’échelle du paysage. Finalement, dans le chapitre 4, je cherche à expliquer les patrons… Advisors/Committee Members: Bradley, Robert L. (advisor), Tremblay, Jean-Pierre (advisor).

Subjects/Keywords: Nutrition des herbivores; Gestion des populations animales; Monitoring; Suivi de populations; Qualité des fourrages; Interactions plante-herbivore; Spectroscopie dans le proche infrarouge; Écologie du paysage; Écologie animale

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APA (6^th Edition):

Jean, P. (2015). Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie. (Doctoral Dissertation). Université de Sherbrooke. Retrieved from http://hdl.handle.net/11143/7736

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Jean, Pierre-Olivier. “Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie.” 2015. Doctoral Dissertation, Université de Sherbrooke. Accessed January 24, 2021. http://hdl.handle.net/11143/7736.

MLA Handbook (7^th Edition):

Jean, Pierre-Olivier. “Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie.” 2015. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Jean P. Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Sherbrooke; 2015. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://hdl.handle.net/11143/7736.

Council of Science Editors:

Jean P. Nouvelles applications de la spectroscopie en proche infrarouge pour l’évaluation de l’écologie nutritionnelle du cerf de Virginie. [Doctoral Dissertation]. Université de Sherbrooke; 2015. Available from: http://hdl.handle.net/11143/7736

19. Ouedraogo, Sylvain. Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests.

Degree: Docteur es, Ecophysiologie, 2011, Université Paris-Est

URL: http://www.theses.fr/2011PEST0096

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Ravageurs de quarantaine, les mouches des fruits (Diptera : Tephritidae) constituent unecontrainte importante à l’exportation de la mangue au Burkina Faso. L’objectif de cette étudeétait… (more)

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Ravageurs de quarantaine, les mouches des fruits (Diptera : Tephritidae) constituent unecontrainte importante à l’exportation de la mangue au Burkina Faso. L’objectif de cette étudeétait d’améliorer nos connaissances sur l’écologie de ces ravageurs. Entre décembre 2007 etdécembre 2009, 1156598 Tephritidae ont été capturés dans 7 vergers présentant 8 cultivarsdifférents. Pendant cette période, l’évolution de la température, de l’hygrométrie et de lapluviométrie a été notée. 19764 mangues ont été collectées et observées afin de déterminerleur niveau d’infestation par ces insectes. Dix-huit espèces des genres Bactrocera, Ceratitis,et Dacus ont été identifiées, B. invadens et C. cosyra étant les plus abondantes. Les pics despopulations de mâles et de femelles, apparaissent entre mai et juin selon les sites. Les femelles,présentent aussi un pic en période de floraison des manguiers. Sept espèces de Tephritidaeinfestent les mangues et l’incidence moyenne de leurs dégâts varie entre 0% (Sabre) et 12,5%(Keitt), Keitt et Brooks sont les cultivars les plus infestés. 64% de ces dégâts sont causés parB. invadens et 31% par C. cosyra. L’inventaire des essences ligneuses autour de ces sites ainsique la collecte et l’incubation de leurs fruits entre avril 2008 et décembre 2009 ont aussi étéeffectués. 105 ligneux ont été recensés autour des vergers. Les fruits de 13 d’entre eux sontinfestés par 7 espèces de Tephritidae dont 6 se retrouvent aussi dans les mangues. Il s’agitsurtout de C. cosyra mais aussi de C. silvestrii, C. puntata et B. invadens.Ce travail montre les corrélations significativees entre les facteurs climatiques, la fluctuationdes populations, et les dégâts observés. Les espèces ligneuses alentours sont des refugespermettant le maintien des populations même hors saison de la mangue. Ces résultatsnouveaux permettent l’adaptation de la lutte contre ces ravageurs économiquement importantsau contexte agro-écologique de notre zone d’étude

Classified as a quarantine pest, mango fruit flies (Diptera Tephritidae) are an importantconstraint for mango exportation from Burkina Faso. The main objective of this study was theenhanced understanding of the ecology of mango’s Tephritids. 1156598 Tephritid flies weretraped from December 2007 to December 2009 in 7 mango orchards. During this monitoring,temperature, relative humidity and rainfalls were registered. 19764 mango fruits from 8cultivars were collected and obsreved during mango season in order to assess fruit fliesdamages. Eighteen Tephritids species notably from Bactrocera, Ceratitis and Dacus genuswere identified and B. invadens and C. cosyra are the dominant ones. The population peaks ofmales and females appear in the months of May & June according to the sites. The femalespresent a peak during the flowering period also of the mango trees. Seven species of mangoinfesting fruit flies have been identified and the incidence of this infestation varies between0% (Sabre) and 12.5% (Keitt). Keitt and Brooks are the most infested mango cultivars. 64 %of these damages are caused…

Advisors/Committee Members: Rouland-Lefèvre, Corinne (thesis director).

Subjects/Keywords: Fluctuation des populations; Dégâts; Insectes ravageurs; Mangue; Plantes hôtes; Climate; Populations fluctuations; Damages; Insects pests; Mango; Host plants; Climat

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APA (6^th Edition):

Ouedraogo, S. (2011). Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests. (Doctoral Dissertation). Université Paris-Est. Retrieved from http://www.theses.fr/2011PEST0096

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Ouedraogo, Sylvain. “Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests.” 2011. Doctoral Dissertation, Université Paris-Est. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2011PEST0096.

MLA Handbook (7^th Edition):

Ouedraogo, Sylvain. “Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests.” 2011. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Ouedraogo S. Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Paris-Est; 2011. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2011PEST0096.

Council of Science Editors:

Ouedraogo S. Dynamique spatio-temporelle des mouches des fruits (Diptera Tephritidae) en fonction des facteurs biotiques et abiotiques dans les vergers de manguiers de l'ouest du Burkina Faso : Spatial and temporal dynamics of mango fruit flies species (Diptera Tephritidae) with biotic an abiotic factors in Burkina Faso (West Africa) and development of improved control methods against these pests. [Doctoral Dissertation]. Université Paris-Est; 2011. Available from: http://www.theses.fr/2011PEST0096

20. Hamade, Bariaa. Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors.

Degree: Docteur es, Ecologie et Biodiversité, 2018, Montpellier; Université libanaise

URL: http://www.theses.fr/2018MONTG049

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La diversité des espèces cultivées résulte d’une série d’évènements de domestication, de flux de gènes entre compartiments sauvages et cultivés, d’effets de la sélection adaptative… (more)

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La diversité des espèces cultivées résulte d’une série d’évènements de domestication, de flux de gènes entre compartiments sauvages et cultivés, d’effets de la sélection adaptative naturelle et aussi de la sélection humaine et des dynamiques de diffusion à de larges échelles, souvent sur de longues périodes. L’impact de ces processus sur la diversité dépend non seulement de la biologie de l’espèce, mais elle est aussi fortement liée au contexte social et aux pratiques humaines. Cette thèse contribue à la compréhension de l’influence de l’Homme sur la dynamique de la diversité de l’amandier in situ. La démarche suivie fait appel à la génétique des populations et à l’anthropologie pour étudier la structuration de la diversité génétique de cette espèce fruitière pérenne allogame, cultivée au Liban. Cette étude comprend trois parties:Dans la première partie, nous avons cherché à comprendre les processus de diversification continue de l’amandier cultivée en se basant sur des évidences tirées de l'archéologie, de l'histoire et de la biologie évolutive de l’amandier dans le Bassin Méditerranéen. Nous avons utilisé une approche de génétique des populations avec de nombreux individus représentant chaque cultivar collecté auLiban. L'échantillonnage intensif de cultivars libanais a été comparé à un grand nombre d’arbres cultivés in situ provenant de différentes régions méditerranéennes. Les résultats nous ont permis de distinguer l’impact des différents périodes de diffusion sur la structure de la diversité génétique.La deuxième partie, a permis d’évaluer l’importance culturelle de l’amandier cultivé au Liban, et d’identifier sa diversité intra-spécifique telle qu’elle est perçue par les informateurs. Nos résultats montrent une hétérogénéité des connaissances des informateurs qui a mené à une taxonomie locale flexible. La flexibilité de la taxonomie locale est révélée par la présence de catégories englobantes et par la complexité du système de nomenclature.Dans la troisième partie, nous avons évalué l’effet du changement de pratiques de propagation sur la structuration et dynamique de la diversité génétique entre les variétés et à l’intérieur de chacune des deux variétés étudiées. Nos résultats montrent que le cultivar traditionnel, multiplié par semis, est structuré géographiquement. L’introduction du mode de propagation clonal par greffage a été adoptée graduellement. Au début, les agriculteurs ont maintenu une certaine diversité génétique par la multiplication sexuée occasionnelle du cultivar introduit. Par contre, l’introduction après l’adoption du greffage a réduit la diversité génétique intra-variétale dans les vergers récents.Cette thèse montre comment les connaissances et les décisions de l’Homme à différents échelles spatiales et temporelles influencent la structure et la dynamique de la diversité de cette espèce.

The diversity of cultivated species results from a series of domestication events, gene flow between wild and cultivated compartments, effects of natural adaptive selection and also on human selection and…

Advisors/Committee Members: Joly, Hélène (thesis director), Chalak, Lamis (thesis director).

Subjects/Keywords: Amandier; Diversité variétale; Génétique des populations; Ethnobiologie; Pratiques culturales; Liban; Almond; Varietal Diversity; Populations Genetics; Ethnobiology; Cultural Practices; Lebanon

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APA (6^th Edition):

Hamade, B. (2018). Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors. (Doctoral Dissertation). Montpellier; Université libanaise. Retrieved from http://www.theses.fr/2018MONTG049

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Hamade, Bariaa. “Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors.” 2018. Doctoral Dissertation, Montpellier; Université libanaise. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2018MONTG049.

MLA Handbook (7^th Edition):

Hamade, Bariaa. “Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors.” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Hamade B. Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors. [Internet] [Doctoral dissertation]. Montpellier; Université libanaise; 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2018MONTG049.

Council of Science Editors:

Hamade B. Structure et dynamique de la diversité génétique de l'amandier cultivé au Liban : facteurs biologiques et anthropiques : Structure and dynamic of the diversity of Lebanese cultivated almond : Biological and anthropological factors. [Doctoral Dissertation]. Montpellier; Université libanaise; 2018. Available from: http://www.theses.fr/2018MONTG049

21. Le Bourlot, Vincent. Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida.

Degree: Docteur es, Ecologie, 2014, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI

URL: http://www.theses.fr/2014PA066071

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La compétition par interférence et ses effets sur la dynamique des populations suscitent un intérêt croissant. La température a aussi un fort effet sur la… (more)

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La compétition par interférence et ses effets sur la dynamique des populations suscitent un intérêt croissant. La température a aussi un fort effet sur la physiologie et les comportements individuels ainsi que sur les dynamiques des populations. Face au changement climatique, comprendre les interactions compétition-température-dynamique des populations est un enjeu majeur en biologie des populations. Les interactions entre individus sont liées à leur taille corporelle. La structure en taille de populations de deux clones du collembole Folsomia candida a été suivie pendant 2 à 4 ans à 4 températures. L'analyse des séries temporelles de leur structure à 21°C a révélé une dépendance de la dynamique aux conditions individuelles d¿accès à la ressource, liées aux plus grands individus. Nous avons modifié la structure de populations à 21°C et observé leur retour à l'équilibre, puis observé le comportement d'accès à la ressource. Cela a démontré le rôle des grands adultes dans la régulation des populations, en interférant avec les plus petits pour l'accès aux ressources. Grâce à un modèle de populations structurées intégrant l'interférence, nous avons montré que son intensité croissante cause : l'amortissement des cycles de générations, la survie de grands individus, des cycles induits par l'interférence. Nous avons enfin comparé les normes de réactions à la température sur des individus isolés et dans des populations afin de comprendre les interactions compétition-température dans la régulation des populations. Plusieurs niveaux de complexité permettent de comprendre l'effet des changements environnementaux sur les populations.

Interference competition and its effects on population dynamics are of growing interest. Temperature also plays an important role on the physiology and individual behavior as well as on population dynamics populations. In the context of climate change, understanding the effect of interactions between individuals on population dynamics and their interactions with temperature is an important issue for population biology. Interactions between individuals are related to their body size. The size structure of several populations of two clones of Collembola Folsomia candida was monitored for 2-4 years at four temperatures from 11 ° C to 26 ° C. The time series analysis of their structure at 21 ° C revealed a dependence of the dynamics on individual access to the resource related to the presence of large individuals. We then changed some population structures at 21 ° C and observed their return to equilibrium. We observed real-time access to the resource behavior. These studies have shown the role of large adults in population control by interfering with smaller individuals for access to resources. Through a structured model incorporating interference competition, we have shown that its intensity may have different effects on the dynamics of structured populations: damping single generation cycles, allowing the survival of large individuals, and causing interference induced cycles. Finally, we compared…

Advisors/Committee Members: Claessen, David (thesis director), Tully, Frédéric Thomas (thesis director).

Subjects/Keywords: Collembole; Dynamique des populations; Populations structurées; Compétition par exploitation; Compétition par interférence; Température; Norme de réaction; Population dynamics; Springtail; 577

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APA (6^th Edition):

Le Bourlot, V. (2014). Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida. (Doctoral Dissertation). Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Retrieved from http://www.theses.fr/2014PA066071

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Le Bourlot, Vincent. “Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida.” 2014. Doctoral Dissertation, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2014PA066071.

MLA Handbook (7^th Edition):

Le Bourlot, Vincent. “Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida.” 2014. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Le Bourlot V. Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2014. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2014PA066071.

Council of Science Editors:

Le Bourlot V. Compétition par interférence, température et dynamique des populations structurées : étude expérimentale et théorique chez le collembole folsomia candida : Interference competition, temperature and structured population dynamics : empirical and theoretical study on collembola folsomia candida. [Doctoral Dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014PA066071

22. Martins, Helena. Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations.

Degree: Docteur es, Modèles, méthodes et algorithmes en biologie, santé et environnement, 2018, Université Grenoble Alpes (ComUE)

URL: http://www.theses.fr/2018GREAS022

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La recherche des signatures génétiques de l'adaptation locale est d'un grand intérêt pour de nombreuses études de génétique des populations. Les approches pour trier les… (more)

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La recherche des signatures génétiques de l'adaptation locale est d'un grand intérêt pour de nombreuses études de génétique des populations. Les approches pour trier les loci sélectifs à partir de leur contexte génomique, se concentrent sur les valeurs extrêmes de l'indice de fixation, FST, à travers les loci. Cependant, le calcul de l'indice de fixation devient difficile lorsque la population est génétiquement continue, lorsque la prédéfinition des sous-populations est une tâche difficile et en présence d'individus mélangés dans l'échantillon. Dans cette thèse, nous présentons une nouvelle méthode pour identifier les loci sous sélection basée sur une extension de la statistique FST à des échantillons avec des individus mélangés. Considérant notre objectif d'explorer des méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans la population mélangée, nous avons inclus des données spatiales pour calculer les coefficients d'ascendance et les fréquences d'allèles. Pour enrichir notre travail, nous avons investigué les effets du déséquilibre de liaison et des méthodes d'élagage de LD dans les analyses de génomes pour la sélection.

Finding genetic signatures of local adaptation is of great interest for many population genetic studies. Common approaches to sorting selective loci from their genomic background focus on the extreme values of the fixation index, FST, across loci. However, the computation of the fixation index becomes challenging when the population is genetically continuous, when predefining subpopulations is a difficult task, and in the presence of admixed individuals in the sample. In this thesis, we present a new method to identify loci under selection based on an extension of the FST statistic to samples with admixed individuals. Considering our goal of exploring statistical methods to identify local adaptation in admixed population, we included spatial data to compute ancestry coefficients and allele frequencies. To enrich our work, we investigated the effects of linkage disequilibrium and LD-pruning methods in genome scans for selection.

Advisors/Committee Members: François, Olivier (thesis director), Blum, Michaël (thesis director).

Subjects/Keywords: Génétique des populations; Scan génomique; Populations mélangées; Tests de différenciation des populations; Déséquilibre de liaison; Biostatistiques; Genome scan for selection; Population genetics; Admixed populations; Population differentiation tests; Linkage disequilibrium; Biostatistics; 570

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APA (6^th Edition):

Martins, H. (2018). Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations. (Doctoral Dissertation). Université Grenoble Alpes (ComUE). Retrieved from http://www.theses.fr/2018GREAS022

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Martins, Helena. “Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations.” 2018. Doctoral Dissertation, Université Grenoble Alpes (ComUE). Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2018GREAS022.

MLA Handbook (7^th Edition):

Martins, Helena. “Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations.” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Martins H. Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Grenoble Alpes (ComUE); 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2018GREAS022.

Council of Science Editors:

Martins H. Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées : Statistical Methods to Identify Local Adaptation in Continuous and Admixed Populations. [Doctoral Dissertation]. Université Grenoble Alpes (ComUE); 2018. Available from: http://www.theses.fr/2018GREAS022

23. Rascle, Pauline. Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France.

Degree: Docteur es, Environnement, 2018, Brest

URL: http://www.theses.fr/2018BRES0075

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L'isolement géographique est une menace élevée pour le maintien des populations sur le long terme. Il est donc primordial de comprendre selon quel degré la… (more)

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L'isolement géographique est une menace élevée pour le maintien des populations sur le long terme. Il est donc primordial de comprendre selon quel degré la viabilité des populations est affectée par leur isolement, notamment en vue de définir des priorités en terme de conservation. Eryngium viviparum J.Gay (Apiaceae) est une des espèces végétales les plus menacées d'Europe avec une distribution ibéro-armoricaine très fragmentée. En France, son statut de conservation est devenu particulièrement critique avec la disparition de la presque totalité de ses populations au cours des années 1980, à l'exception d'une seule, suite à la destruction de son habitat par les activités humaines. Cette unique population fait depuis plusieurs années l'objet d'une conservation et d'une gestion attentives au sein d'une réserve protégée. Malgré ces actions, l'isolement de cette population soulève des interrogations quant à sa viabilité sur le long terme. Dans ce cadre, et à travers une approche multidisciplinaire, la thèse propose un renforcement des connaissances sur les caractéristiques écologiques et biologiques d'E. viviparum, et plus particulièrement concernant sa dernière population française. Elle s'articule selon trois axes principaux : (1) L'étude de l'amplitude écologique de l'espèce, puis la caractérisation de ses préférences écologiques à fine échelle au sein de la dernière population française (2) L'évaluation de la viabilité de la population isolée d'après ses paramètres démographiques, son niveau de diversité génétique et son degré de différenciation avec d'autres populations. (3) L'expérimentation des modalités de réintroduction en France. Les résultats apportés par ce travail contribueront à définir les prochaines priorités en matière de gestion et de conservation pour assurer le maintien d'E. viviparum sur le long terme en France. Le cas d' E. viviparum fournit un bon modèle d'étude pour évaluer l'effet de l'isolement sur la dynamique d'une population isolée et pour appliquer une conservation adaptée à cette problématique.

The geographical isolation is an important threat for the long term preservation of populations. It is crucial to understand how the viability of populations is affected in such context, in particular to define conservation priorities. Eryngium viviparum J.Gay (Apiaceae) is one of the most endangered plant in Europe, with a fragmented distribution between the NW of the Iberian peninsula and Brittany. ln France, the species is maintained only on a single locality, after the destruction of its habitat by human activities during 1980s. Despite a conservation program and an attentive management within a protected area, the strong isolation experimented by this population bring up questions about its long-term viability. In this context, through a multidisciplinary approach, this thesis aims to improve the biological and ecological knowledge of E. viviparum, and more particularly within its last French population. This thesis is organized according three main axes : (1) The study of large-scale E.…

Advisors/Committee Members: Bioret, Frédéric (thesis director), Gallet, Sébastien (thesis director).

Subjects/Keywords: Biologie de la conservation; Écologie; Dynamique des populations; Génétique des populations; Restauration écologique; Conservation biology; Ecology; Population dynamics; Population genetics; Ecological restoration

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APA (6^th Edition):

Rascle, P. (2018). Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France. (Doctoral Dissertation). Brest. Retrieved from http://www.theses.fr/2018BRES0075

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Rascle, Pauline. “Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France.” 2018. Doctoral Dissertation, Brest. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2018BRES0075.

MLA Handbook (7^th Edition):

Rascle, Pauline. “Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France.” 2018. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Rascle P. Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France. [Internet] [Doctoral dissertation]. Brest; 2018. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2018BRES0075.

Council of Science Editors:

Rascle P. Biologie et écologie d'une population isolée : exemple d'Eryngium viviparum et perspectives pour sa conservation en France : Biology and ecology of an isolated population : example of Eryngium viviparum and perspectives for its conservation in France. [Doctoral Dissertation]. Brest; 2018. Available from: http://www.theses.fr/2018BRES0075

24. Derrien, Franck. Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought.

Degree: Docteur es, Préhistoire, 2012, Aix Marseille Université

URL: http://www.theses.fr/2012AIXM3026

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L'analyse critique des différentes prospections archéologiques réalisées dans la péninsule du Sinaï montre clairement que la partie ouest du Sinaï central n'a jamais été explorée… (more)

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L'analyse critique des différentes prospections archéologiques réalisées dans la péninsule du Sinaï montre clairement que la partie ouest du Sinaï central n'a jamais été explorée totalement avant l'inventaire qui a commencé au milieu des années 1990. Sans étude de cette zone, tout modèle d'occupation ancienne du territoire sinaïtique se révèle insuffisant. L'objectif principal de mon doctorat était de fournir des informations de nature géographique et anthropologique aux archéologues. D'un point de vue méthodologique, l'ensemble des structures archéologiques géoréférencées a été intégré dans un système d'information géographique (SIG). Ces vestiges ont été replacés dans leur contexte environnemental (climat, géologie, géomorphologie, végétation…). Parallèlement, j'ai engagé un travail de documentation anthropologique relatif aux populations bédouines actuellement installées dans la péninsule en général, dans le Sinaï central en particulier. Je me suis particulièrement concentré sur l'étude des structures et des limites tribales, de la gestion des territoires, des pratiques liées au culte des saints et de l'économie. Dans le cadre de cette réflexion ethnoarchéologique, les nouveaux acquis permettent d'établir une analyse comparative de l'occupation ancienne et actuelle du Sinaï central. Mes conclusions sont susceptibles d'être utiles à l'interprétation des vestiges archéologiques du Sinaï central et à l'élaboration d'un modèle de l'occupation ancienne de cette région durant l'Holocène.

Critical analysis of the archaeological surveys conducted in the Sinai Peninsula shows that the western central Sinai had never been explored before the beginning of this survey in the mid-1990's. Without a study of this area, models of the ancient occupation of the sinaitic territory were insufficient. The main objective of my PhD was to provide geographical and anthropological information to the archeologists. From a methodological point of view, all georeferenced archaeological structures were integrated into a Geographic Information System (GIS). These remains were placed in their environmental context (climate, geology, geomorphology, vegetation…). In parallel, I initiated an anthropological documentary work on Bedouin currently living in the Peninsula in general, in the central Sinai in particular. I particularly concentrated on the tribal structures and boundaries, the management of territories, the cult of the saints and the economy. As part of this ethnoarchaeological reflection, new learning can establish a comparative analysis of past and current occupation of central Sinai. The conclusions of my studies may help to understand the archeological remains in the central Sinai and to develop a model of the region's occupation during the Holocene.

Advisors/Committee Members: Paris, François (thesis director).

Subjects/Keywords: Sinaï (Egypte); Holocène; Sig; Populations bédouines; Culte des saints; Territoires tribaux; Gestion des territoires; Économie; Archéologie; Sinai (Egypt); Holocene; Gis; Bedouin populations; Saint’s cult; Tribal territories; Territories management; Econom; Archaeology

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APA (6^th Edition):

Derrien, F. (2012). Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2012AIXM3026

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Derrien, Franck. “Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought.” 2012. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2012AIXM3026.

MLA Handbook (7^th Edition):

Derrien, Franck. “Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought.” 2012. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Derrien F. Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2012. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM3026.

Council of Science Editors:

Derrien F. Analyse de l'occupation du Sinaï central durant l'holocène : The doctrine of Prophecy in Maimonides' Philosophy between Judaic and Islamic Thought. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM3026

25. Peter, Jackson. Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast.

Degree: Docteur es, Bioinformatique, 2017, Université de Strasbourg

URL: http://www.theses.fr/2017STRAJ064

►

Un objectif central en biologie est de comprendre la relation entre le génotype et le phénotype. Afin de disséquer les bases génétiques de la diversité… (more)

Subjects/Keywords: Génomique des populations; Études d’association; Levure; Population genomics; Genome-wide association studies; Yeast; 572.8; 576.5

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APA (6^th Edition):

Peter, J. (2017). Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2017STRAJ064

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Peter, Jackson. “Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast.” 2017. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed January 24, 2021. http://www.theses.fr/2017STRAJ064.

MLA Handbook (7^th Edition):

Peter, Jackson. “Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast.” 2017. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Peter J. Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2017. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.theses.fr/2017STRAJ064.

Council of Science Editors:

Peter J. Dissection de la relation génotype-phénotype par des études d'association chez Saccharomyces cerevisiae : Genotype-phenotype relationship exploration by genome-wide association studies in yeast. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017STRAJ064

Université du Québec à Montréal

26. Guindon, Alexandre. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.

Degree: 2010, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

► La production de toxines telles que la microcystine (MC) est le principal problème de santé publique relié à la croissance excessive des cyanobactéries dans les… (more)

▼ La production de toxines telles que la microcystine (MC) est le principal problème de santé publique relié à la croissance excessive des cyanobactéries dans les lacs eutrophes. La toxicité résultante sera reliée à la dominance de genres potentiellement toxiques au sein de la communauté. Dans le cadre de cette étude, cinq lacs du bassin versant de la rivière Yamaska (Québec) ont été échantillonnés durant l'été 2007. Les cyanobactéries ont été caractérisées sur un gel contenant un gradient de dénaturant (DGGE) à la suite de l'amplification du gène 16S du ribosome. De plus, un dénombrement microscopique classique a été entrepris. Les toxines ont aussi été dosées de deux façons, soit une méthode immuno-enzymatique et une autre basée sur la chromatographie liquide. Les résultats confirment l'association des genres potentiellement toxiques à la concentration de MC, en particulier Anabaena. Ces corrélations sont meilleures lorsqu'entreprises à partir des données taxonomiques, avec un r2 aj. atteignant 0,64 (p<0,0001). Les données DGGE, moins adaptées à la détermination d'un modèle prédictif de MC, expliquent néanmoins une partie de la variation lorsque celle-ci est partitionnée dans une analyse de redondance. De plus, les analyses moléculaires étaient plus sensibles aux changements dans la communauté. La vitesse de changement telle que déterminée par DGGE était corrélée à celle déterminée par la taxonomie sur l'échantillon pris deux semaines plus tard (n=22, r2 adj. = 0.32, p=0.004). Ceci pourrait conférer au DGGE une valeur prédictive intéressante puisque la dynamique des communautés a montré une association entre stabilité et toxicité dans deux des cinq lacs. Cette stabilité, exprimée sous forme de taux de changement, est associée aux températures les plus élevées de la saison (r2 aj. = 0,21 pour le DGGE et 0,28 pour la taxonomie, p<0,005). ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : cyanobactéries toxiques, succession saisonnière, Haute-Yamaska, Microcystis, DGGE

Subjects/Keywords: Dynamique des populations; Cyanobactérie; Toxicité; Pollution de l'eau; Bassin hydrographique; Rivière Yamaska (Québec); Microcystine

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Guindon, A. (2010). Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Guindon, Alexandre. “Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.” 2010. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Guindon, Alexandre. “Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.” 2010. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Guindon A. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf.

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Guindon A. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

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Université du Québec à Montréal

27. Lagarde, Florent. Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers.

Degree: 2013, Université du Québec à Montréal

URL: http://www.archipel.uqam.ca/5681/1/M12925.pdf

► La problématique des espèces du genre Larus en milieu urbain et périurbain est un fait d'actualité présent autant sur le continent américain qu'européen. Le Goéland… (more)

▼ La problématique des espèces du genre Larus en milieu urbain et périurbain est un fait d'actualité présent autant sur le continent américain qu'européen. Le Goéland à bec cerclé (Larus delawarensis) a connu une explosion démographique dans les années 80 qui le classe comme l'espèce de laridés la plus abondante en Amérique du nord. Le manque d'information sur sa dynamique de population dans le sud du Québec rend impossible la modélisation de la population ce qui nuit à la prise de décisions de la part des gestionnaires. Une étude de la reproduction de l'espèce sur la colonie de l'île Deslauriers, la plus grosse au Québec, a permis de combler une partie du manque d'informations. Notre premier objectif était de déterminer la chronologie de nidification, le succès de reproduction ainsi que la croissance des juvéniles avant leur envol à l'aide de la méthode des visites multiples à l'intérieur de 6 enclos déployés sur la colonie. Nous avons comparé nos résultats de manière à évaluer les différences interannuelles, les différences entre les sections de l'île ou selon le type de couvert de végétation. Notre deuxième objectif visait à comparer certains de nos résultats avec ceux trouvés au début des années 1980 sur la même colonie afin de regarder s'il existait des différences en fonction de l'évolution de la taille de la population dans le sud du Québec. La chronologie de reproduction diffère entre les années et est expliquée par les aléas du climat ainsi qu'à la disponibilité de la nourriture. La différence que nous avons observée entre les sections est simplement due au fait que les jeunes oiseaux s'installent généralement à la périphérie de la colonie et sont prêts plus tard à la reproduction. Nos résultats de succès de reproduction montrent que la production de jeunes (1,3 et 0,9 jeunes par couple pour 2010 et 2011 respectivement) est plus faible que dans les années 1980 (1,7 jeunes par couple). Cela est probablement dû à la disponibilité de nourriture qui a diminué durant l'élevage des jeunes en raison des nombreuses mesures d'effarouchement et de limitation d'accès à la nourriture dans les lieux d'enfouissement techniques (LET). Nos résultats permettent de combler le manque d'information sur la reproduction de cette espèce dans le sud du Québec et pourront être utilisés à des fins de modélisation de la population lorsque les paramètres de survie, d'émigration et d'immigration auront été déterminés. Enfin, même si la légère baisse des effectifs peut paraître alarmante, il est fort probable que la population s'ajustera à la capacité de support du milieu naturel et des milieux agricoles. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Modélisation de population, Goélands à bec cerclé, succès reproducteur.

Subjects/Keywords: Dynamique des populations; Goéland à bec cerclé; Milieu urbain; Nidification; Succès de reproduction; Québec (Sud)

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Lagarde, F. (2013). Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://www.archipel.uqam.ca/5681/1/M12925.pdf

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Lagarde, Florent. “Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers.” 2013. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://www.archipel.uqam.ca/5681/1/M12925.pdf.

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Lagarde, Florent. “Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers.” 2013. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Lagarde F. Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2013. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/5681/1/M12925.pdf.

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Lagarde F. Évaluation du succès de reproduction chez le goéland à bec cerclé de la colonie de l'île Deslauriers. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2013. Available from: http://www.archipel.uqam.ca/5681/1/M12925.pdf

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Université du Québec à Montréal

28. Zouaoui, Saliha. Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses.

Degree: 2011, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/3968/1/D2118.pdf

► Les lichens terricoles constituent une composante importante de l'écosystème forestier boréal. Cependant, cet écosystème est dynamisé par différentes perturbations qui créent des changements environnementaux qui… (more)

Subjects/Keywords: Aménagement forestier; Coupe partielle; Dynamique des populations; Épinette noire; Feu de forêt; Lichen terricole; Pessière

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Zouaoui, S. (2011). Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/3968/1/D2118.pdf

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Zouaoui, Saliha. “Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses.” 2011. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/3968/1/D2118.pdf.

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MLA Handbook (7^th Edition):

Zouaoui, Saliha. “Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses.” 2011. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Zouaoui S. Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/3968/1/D2118.pdf.

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Zouaoui S. Dynamique des lichens terricoles du genre Cladina après les feux et les coupes dans le domaine de la pessière à mousses. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2011. Available from: http://archipel.uqam.ca/3968/1/D2118.pdf

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Université du Québec à Montréal

29. Navarro, Lionel. Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale.

Degree: 2019, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/12938/1/D3639.pdf

► La tordeuse des bourgeons de l'épinette (Choristoneurafumiferana (Clemens)) (TBE) est le plus important défoliateur des forêts de l'est de l'Amérique du Nord. Dans un contexte… (more)

▼ La tordeuse des bourgeons de l'épinette (Choristoneurafumiferana (Clemens)) (TBE) est le plus important défoliateur des forêts de l'est de l'Amérique du Nord. Dans un contexte de changements climatiques, la dynamique des perturbations naturelles, et notamment celle des insectes est modifiée, influençant la synchronicité phénologique entre l'insecte et son hôte, mais aussi, tout un ensemble d'interactions tri-trophiques entre l'arbre hôte, l'insecte et ses ennemis naturels. En conséquence, la distribution spatiale de la TBE ainsi que la susceptibilité des espèces hôtes, telles que nous les connaissons, pourraient être amenées à changer dans le futur, en fonction de l'augmentation des températures. Afin de mesurer au mieux ce type de changements, il est important de développer de nouvelles méthodes pour étudier la dynamique de la TBE sur de plus vastes échelles temporelles et spatiales. Dans la première partie de cette thèse, nous nous sommes concentrés sur la vaste échelle temporelle en combinant les macrocharbons et les macrofossiles végétaux avec un nouveau proxy - les écailles de lépidoptères - pour décrire l'écologie Holocène autours d'un lac boréal. Les écailles de lépidoptère se sont avérées être un indicateur plus robuste des épidémies d'insecte que les indicateurs traditionnels tels que les capsules céphaliques et les fèces. Nous avons identifié 87 pics d'abondance significatifs au cours des 10 000 dernières années. Ces résultats indiquent que les épidémies de TBE étaient plus fréquentes que ce que suggèrent les études précédentes. Les taux d'accumulation des charbons de bois correspondent à l'historique établie pour les feux de forêt dans l'est du Canada : une fréquence de feux plus élevée au début et à la fin de !'Holocène qu'au milieu. Même si, à certaines occasions, les deux perturbations ont pu aller de pair, nos résultats démontrent plutôt une relation inverse entre la fréquence des feux et les épidémies d'insectes au cours de l’Holocène. Dans la dernière partie de la thèse, nous avons reconstruit les patrons des épidémies du 20ième siècle à l'échelle du paysage en utilisant des données dendrochronologiques. Pour cela, nous avons compilé une base de données de près de 4 000 arbres au travers d'une aire d'étude de 800 000 km2. Une interpolation ainsi que des analyses de hotspots ont été effectuées pour déterminer les zones ayant subi des réductions de croissance liées aux épidémies mais aussi pour identifier les patrons spatiotemporels liés à l'activité de la TBE au cours du dernier siècle. Un modèle climatique a été utilisé afin d'estimer les anomalies de températures et de précipitations pour cette période. Nos résultats ont permis d'identifier trois épidémies de TBE avec des patrons spatiotemporels différents au niveau de la durée et de la sévérité des événements. La première (1905-1930) a affecté près de 40% des arbres étudiés. Elle est le résultat de la synchronisation de plusieurs infestations locales et a atteint les peuplements nordiques en fin de période. La seconde était la plus longue (de 1935…

Subjects/Keywords: Tordeuse des bourgeons de l'épinette; Distribution géographique; Populations; Invasions d'insectes; Perturbations écologiques; Paléoécologie; Holocène; Ailes

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Navarro, L. (2019). Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/12938/1/D3639.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Navarro, Lionel. “Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale.” 2019. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/12938/1/D3639.pdf.

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Navarro, Lionel. “Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale.” 2019. Web. 24 Jan 2021.

Vancouver:

Navarro L. Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2019. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/12938/1/D3639.pdf.

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Navarro L. Dynamique récente et holocène de la tordeuse des bourgeons de l'épinette en forêt boréale. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2019. Available from: http://archipel.uqam.ca/12938/1/D3639.pdf

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Université du Québec à Montréal

30. Guindon, Alexandre. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.

Degree: 2010, Université du Québec à Montréal

URL: http://archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

► La production de toxines telles que la microcystine (MC) est le principal problème de santé publique relié à la croissance excessive des cyanobactéries dans les… (more)

▼ La production de toxines telles que la microcystine (MC) est le principal problème de santé publique relié à la croissance excessive des cyanobactéries dans les lacs eutrophes. La toxicité résultante sera reliée à la dominance de genres potentiellement toxiques au sein de la communauté. Dans le cadre de cette étude, cinq lacs du bassin versant de la rivière Yamaska (Québec) ont été échantillonnés durant l'été 2007. Les cyanobactéries ont été caractérisées sur un gel contenant un gradient de dénaturant (DGGE) à la suite de l'amplification du gène 16S du ribosome. De plus, un dénombrement microscopique classique a été entrepris. Les toxines ont aussi été dosées de deux façons, soit une méthode immuno-enzymatique et une autre basée sur la chromatographie liquide. Les résultats confirment l'association des genres potentiellement toxiques à la concentration de MC, en particulier Anabaena. Ces corrélations sont meilleures lorsqu'entreprises à partir des données taxonomiques, avec un r2 aj. atteignant 0,64 (p<0,0001). Les données DGGE, moins adaptées à la détermination d'un modèle prédictif de MC, expliquent néanmoins une partie de la variation lorsque celle-ci est partitionnée dans une analyse de redondance. De plus, les analyses moléculaires étaient plus sensibles aux changements dans la communauté. La vitesse de changement telle que déterminée par DGGE était corrélée à celle déterminée par la taxonomie sur l'échantillon pris deux semaines plus tard (n=22, r2 adj. = 0.32, p=0.004). Ceci pourrait conférer au DGGE une valeur prédictive intéressante puisque la dynamique des communautés a montré une association entre stabilité et toxicité dans deux des cinq lacs. Cette stabilité, exprimée sous forme de taux de changement, est associée aux températures les plus élevées de la saison (r2 aj. = 0,21 pour le DGGE et 0,28 pour la taxonomie, p<0,005). ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : cyanobactéries toxiques, succession saisonnière, Haute-Yamaska, Microcystis, DGGE

Subjects/Keywords: Dynamique des populations; Cyanobactérie; Toxicité; Pollution de l'eau; Bassin hydrographique; Rivière Yamaska (Québec); Microcystine

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Guindon, A. (2010). Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. (Thesis). Université du Québec à Montréal. Retrieved from http://archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

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Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Guindon, Alexandre. “Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.” 2010. Thesis, Université du Québec à Montréal. Accessed January 24, 2021. http://archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf.

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Guindon, Alexandre. “Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska.” 2010. Web. 24 Jan 2021.

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Guindon A. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. [Internet] [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. [cited 2021 Jan 24]. Available from: http://archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf.

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Guindon A. Relations entre la dynamique des communautés de cyanobactéries et la toxicité de l'eau dans le bassin versant de la rivière Yamaska. [Thesis]. Université du Québec à Montréal; 2010. Available from: http://archipel.uqam.ca/3393/1/M11494.pdf

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