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1. Forien, Raphael. The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne.

Degree: Docteur es, Math?matiques aux interfaces, 2017, Paris Saclay

Cette th?se porte sur la structure spatiale de la diversit? g?n?tique. Dans un premier temps, nous ?tudions un processus ? valeurs mesure d?crivant l'?volution de la composition g?n?tique d'une population soumise ? la s?lection naturelle. Nous montrons que ce processus satisfait un th?or?me de la limite centrale, et que ses fluctuations sont donn?es par la solution d'une ?quation aux d?riv?es partielles stochastique. Nous utilisons ce r?sultat pour donner une estimation du fardeau de d?rive au sein d'une population structur?e en espace.Dans un deuxi?me temps, nous nous int?ressons ? la composition g?n?tique d'une population lorsque les individus se d?placent plus facilement dans une r?gion de l'espace que dans l'autre (on parle alors de dispersion h?t?rog?ne). Nous d?montrons dans ce cas la convergence des fr?quences all?liques via la convergence des lign?es ancestrales vers un syst?me de mouvements browniens de Walsh.Nous d?taillons ?galement l'impact d'une barri?re g?ographique traversant l'habitat d'une population sur sa diversit? g?n?tique. Nous montrons que les lign?es ancestrales d?crivent dans ce cas des mouvements browniens partiellement r?fl?chis, dont nous donnons plusieurs constructions.Dans le but d'appliquer ces travaux, nous adaptons une m?thode d'inf?rence d?mographique au cas de la dispersion h?t?rog?ne. Cette m?thode utilise les blocs continus de g?nome h?rit?s d'un m?me anc?tre entre les paires d'individus dans l'?chantillon et permet d'estimer les caract?ristiques d?mographiques d'une population lorsque celles-ci varient dans l'espace. Pour terminer nous d?montrons l'efficacit? de notre m?thode sur des donn?es simul?es.

This thesis deals with the spatial structure of genetic diversity. We first study a measure-valued process describing the evolution of the genetic composition of a population subject to natural selection. We show that this process satisfies a central limit theorem and that its fluctuations are given by the solution to a stochastic partial differential equation. We then use this result to obtain an estimate of the drift load in spatially structured populations.Next we investigate the genetic composition of a populations whose individuals move more freely in one part of space than in the other (a situation called dispersal heterogeneity). We show in this case the convergence of allele frequencies via the convergence of ancestral lineages to a system of skew Brownian motions.We then detail the effect of a barrier to gene flow dividing the habitat of a population. We show that ancestral lineages follow partially reflected Brownian motions, of whom we give several constructions.To apply these results, we adapt a method for demographic inference to the setting of dispersal heterogeneity. This method makes use of long blocks of genome along which pairs of individuals share a common ancestry, and allows to estimate several demographic parameters when they vary accross space. To conclude, we demonstrate the accuracy of our method on simulated datasets.

Advisors/Committee Members: VĂ©ber, Amandine (thesis director).

Subjects/Keywords: G?n?tique des populations; Processus ? valeurs mesure; Coalescent spatial; Population genetics; Measure-Valued processes; Spatial coalescents

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APA (6th Edition):

Forien, R. (2017). The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne. (Doctoral Dissertation). Paris Saclay. Retrieved from http://www.theses.fr/2017SACLX082

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Forien, Raphael. “The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne.” 2017. Doctoral Dissertation, Paris Saclay. Accessed April 19, 2019. http://www.theses.fr/2017SACLX082.

MLA Handbook (7th Edition):

Forien, Raphael. “The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne.” 2017. Web. 19 Apr 2019.

Vancouver:

Forien R. The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne. [Internet] [Doctoral dissertation]. Paris Saclay; 2017. [cited 2019 Apr 19]. Available from: http://www.theses.fr/2017SACLX082.

Council of Science Editors:

Forien R. The spatial structure of genetic diversity under natural selection and in heterogeneous environments : Structure spatiale de la diversit? g?n?tique : influence de la s?lection naturelle et d'un environnement h?t?rog?ne. [Doctoral Dissertation]. Paris Saclay; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017SACLX082


Université de Bordeaux I

2. Vezard, Laurent. R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties.

Degree: Docteur es, Math?matiques appliqu?es, 2013, Université de Bordeaux I

L'objectif de ce travail est de d?velopper une m?thode capable de d?terminer automatiquement l'?tat de vigilance chez l'humain. Les applications envisageables sont multiples. Une telle m?thode permettrait par exemple de d?tecter automatiquement toute modification de l'?tat de vigilance chez des personnes qui doivent rester dans un ?tat de vigilance ?lev?e (par exemple, les pilotes ou les personnels m?dicaux).Dans ce travail, les signaux ?lectroenc?phalographiques (EEG) de 58 sujets dans deux ?tats de vigilance distincts (?tat de vigilance haut et bas) ont ?t? recueillis ? l'aide d'un casque ? 58 ?lectrodes posant ainsi un probl?me de classification binaire. Afin d'envisager une utilisation de ces travaux sur une application du monde r?el, il est n?cessaire de construire une m?thode de pr?diction qui ne n?cessite qu'un faible nombre de capteurs (?lectrodes) afin de limiter le temps de pose du casque ? ?lectrodes ainsi que son co?t. Au cours de ces travaux de th?se, plusieurs approches ont ?t? d?velopp?es. Une premi?re approche propose d'utiliser un pr?-traitement des signaux EEG bas? sur l'utilisation d'une d?composition en ondelettes discr?te des signaux EEG afin d'extraire les contributions de chaque fr?quence dans le signal. Une r?gression lin?aire est alors effectu?e sur les contributions de certaines de ces fr?quences et la pente de cette r?gression est conserv?e. Un algorithme g?n?tique est utilis? afin d'optimiser le choix des fr?quences sur lesquelles la r?gression est r?alis?e. De plus, cet algorithme g?n?tique permet la s?lection d'une unique ?lectrode.Une seconde approche est bas?e sur l'utilisation du Common Spatial Pattern (CSP). Cette m?thode permet de d?finir des combinaisons lin?aires des variables initiales afin d'obtenir des signaux synth?tiques utiles pour la t?che de classification. Dans ce travail, un algorithme g?n?tique ainsi que des m?thodes de recherche s?quentielle ont ?t? propos?s afin de s?lectionner un sous groupes d'?lectrodes ? conserver lors du calcul du CSP.Enfin, un algorithme de CSP parcimonieux bas? sur l'utilisation des travaux existant sur l'analyse en composantes principales parcimonieuse a ?t? d?velopp?.Les r?sultats de chacune des approches sont d?taill?s et compar?s. Ces travaux ont aboutit sur l'obtention d'un mod?le permettant de pr?dire de mani?re rapide et fiable l'?tat de vigilance d'un nouvel individu.

The aim of this work is to develop a method able to automatically determine the alertness state of humans. Such a task is relevant to diverse domains, where a person is expected or required to be in a particular state. For instance, pilots, security personnel or medical personnel are expected to be in a highly alert state, and this method could help to confirm this or detect possible problems. In this work, electroencephalographic data (EEG) of 58 subjects in two distinct vigilance states (state of high and low alertness) were collected via a cap with 58 electrodes. Thus, a binary classification problem is considered. In order to use of this work on a real-world…

Advisors/Committee Members: Chavent, Marie (thesis director), Fa?ta-A?nseba, Fr?d?rique (thesis director), Legrand, Pierrick (thesis director).

Subjects/Keywords: ?lectroenc?phalogramme; Vigilance; Algorithme g?n?tique; Common spatial pattern; Common spatial pattern parcimonieux; D?composition en ondelettes; Variation contingente n?gative; Electroencephalogram; Alertness; Genetic algorithm; Common spatial pattern; Sparse common spatial pattern; Wavelet decomposition.; Contingent negative variation

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APA (6th Edition):

Vezard, L. (2013). R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties. (Doctoral Dissertation). Université de Bordeaux I. Retrieved from http://www.theses.fr/2013BOR15005

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Vezard, Laurent. “R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties.” 2013. Doctoral Dissertation, Université de Bordeaux I. Accessed April 19, 2019. http://www.theses.fr/2013BOR15005.

MLA Handbook (7th Edition):

Vezard, Laurent. “R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties.” 2013. Web. 19 Apr 2019.

Vancouver:

Vezard L. R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Bordeaux I; 2013. [cited 2019 Apr 19]. Available from: http://www.theses.fr/2013BOR15005.

Council of Science Editors:

Vezard L. R?duction de dimension en apprentissage supervis? : applications ? l??tude de l?activit? c?r?brale : Study of the behaviour of zinc stearate under temperature and irradiation - Effect on lubricant properties. [Doctoral Dissertation]. Université de Bordeaux I; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013BOR15005

3. Wang, You. Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits.

Degree: Docteur es, Electronique et communications, 2017, Paris, ENST

La jonction tunnel magn?tique (JTM) commut?e par la couple de transfert de spin (STT) a ?t? consid?r?e comme un candidat prometteur pour la prochaine g?n?ration de m?moires non-volatiles et de circuits logiques, car elle fournit une solution pour surmonter le goulet d'?tranglement de l'augmentation de puissance statique caus?e par la mise ? l'?chelle de la technologie CMOS. Cependant, sa commercialisation est limit?e par la fiabilit? faible, qui se d?t?riore gravement avec la r?duction de la taille du dispositif. Cette th?se porte sur l'?tude de la fiabilit? des circuits bas?s sur JTM. Tout d'abord, un mod?le compact de JTM incluant les probl?mes principaux de fiabilit? est propos? et valid? par la comparaison avec des donn?es exp?rimentales. Sur la base de ce mod?le pr?cis, la fiabilit? des circuits typiques est analys?e et une m?thodologie d'optimisation de la fiabilit? est propos?e. Enfin, le comportement de commutation stochastique est utilis? dans certaines nouvelles conceptions d'applications classiques.

Spin transfer torque magnetic tunnel junction (STT-MTJ) has been considered as a promising candidate for next generation of non-volatile memories and logic circuits, because it provides a perfect solution to overcome the bottleneck of increasing static power caused by CMOS technology scaling. However, its commercialization is limited by the poor reliability, which deteriorates severely with device scaling down. This thesis focuses on the reliability investigation of MTJ based non-volatile circuits. Firstly, a compact model of MTJ including main reliability issues is proposed and validated by the comparison with experimental data. Based on this accurate model, the reliability of typical circuits is analyzed and reliability optimization methodology is proposed. Finally, the stochastic switching behavior is utilized in some new designs of conventional applications.

Advisors/Committee Members: Alves de Barros, Lirida (thesis director), Zhao, Weisheng (thesis director).

Subjects/Keywords: Jonction tunnel magn?tique; Analyse de fiabilit?; Mod?le compact; Polarization du corps asym?trique dynamique; G?n?rateur de nombre al?atoire vrai; Calcul approximatif; Calcul stochastique; Magnetic tunnel junction; Reliability analysis; Compact model; Dynamic asymmetrical body bias; True random number generator; Approximate computing; Stochastic computing

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APA (6th Edition):

Wang, Y. (2017). Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits. (Doctoral Dissertation). Paris, ENST. Retrieved from http://www.theses.fr/2017ENST0005

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Wang, You. “Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits.” 2017. Doctoral Dissertation, Paris, ENST. Accessed April 19, 2019. http://www.theses.fr/2017ENST0005.

MLA Handbook (7th Edition):

Wang, You. “Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits.” 2017. Web. 19 Apr 2019.

Vancouver:

Wang Y. Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits. [Internet] [Doctoral dissertation]. Paris, ENST; 2017. [cited 2019 Apr 19]. Available from: http://www.theses.fr/2017ENST0005.

Council of Science Editors:

Wang Y. Analyse de fiabilit? de circuits logiques et de m?moire bas?s sur dispositif spintronique : Reliability analysis of spintronic device based logic and memory circuits. [Doctoral Dissertation]. Paris, ENST; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017ENST0005

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