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You searched for subject:(Fungal exudate). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

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University of Guelph

1. Patchett, Aurora. Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere .

Degree: 2018, University of Guelph

Identifying key metabolites that are changing in the Lolium perenne - Epichloë festucae var. lolii metabolome will contribute to our understanding of their role in the belowground microfood-web and subsequently in ecosystem level processes. I designed two glasshouse studies to investigate the role of a plant-fungal endophyte symbiosis in shaping the grass-fungal metabolome and the microbial community in the rhizosphere. I tested the influence of several strains of E. festucae var. lolii on L. perenne growth and the composition of root exudate metabolites in hydroponic and soil mediums, and on the composition of microorganisms in a soil medium using metabolomic and next-generation sequencing techniques. I found that plant and endophyte growth, and the metabolomic profiles of root exudate and rhizosphere soils saw significant endophyte strain specific effects. While, compositions of the microbial communities in the rhizosphere had only subtle, and mostly non-significant changes as a result of endophyte soil conditioning treatments. The significant results of the metabolomics analyses provide a strong rational for more targeted investigations of the root exudate grass-fungal endophyte metabolome. Advisors/Committee Members: Newman, Jonathan (advisor).

Subjects/Keywords: Lolium perenne; Epichloë festucae var. lolii; plant-fungal endophyte associations; fungal endophyte strains; fungal endophyte concentration; root exudate metabolites; qPCR; LC-MS; Next-generation sequencing; microbial community structure

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APA (6th Edition):

Patchett, A. (2018). Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere . (Thesis). University of Guelph. Retrieved from https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/12320

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Not specified: Masters Thesis or Doctoral Dissertation

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Patchett, Aurora. “Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere .” 2018. Thesis, University of Guelph. Accessed November 13, 2019. https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/12320.

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MLA Handbook (7th Edition):

Patchett, Aurora. “Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere .” 2018. Web. 13 Nov 2019.

Vancouver:

Patchett A. Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere . [Internet] [Thesis]. University of Guelph; 2018. [cited 2019 Nov 13]. Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/12320.

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Council of Science Editors:

Patchett A. Effects of Epichloë festucae var. lolii fungal endophyte strains associated with Lolium perenne on root exudate chemistry and microbial communities in the rhizosphere . [Thesis]. University of Guelph; 2018. Available from: https://atrium.lib.uoguelph.ca/xmlui/handle/10214/12320

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2. Tran, Dinh Minh. Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola.

Degree: Docteur es, Génétique et amélioration des plantes, 2016, Montpellier

Hevea brasiliensis est la seule source commerciale du caoutchouc naturel. La maladie CLF (Corynespora Leaf Fall) provoquée par le champignon Corynespora cassiicola est une pathologie foliaire de l’hévéa importante en Asie et en Afrique. Les épidémies sont liées au développement de nouvelles variétés clonales très sensibles. Une méthode conductimétrique de phénotypage de la réponse de l’hévéa aux exsudats de C. cassiicola (filtrats de culture ou toxine purifiée) a été développée et caractérisée. Ce test toxinique, sans contact direct avec le champignon lui-même, peut être mis en œuvre sans risque sur les plantations. Après application de gouttes d’exsudats sur des folioles détachées d’un génotype d’hévéa, deux mesures de conductivité C1 et C2 sont réalisées avant et après autoclavage, et le pourcentage de fuite d’électrolyte dû au traitement, %FE = 100*C1/C2, est calculé. L’influence de différents facteurs tels que le stade foliaire et la durée d’incubation, a été précisée. Une corrélation positive a été trouvée entre les réponses au test toxinique et à l’inoculation par des conidies du champignon. La pertinence de la correction de C1 par C2 a été analysée.Deux études du test toxinique ont été réalisées pour une série de clones d’hévéa, d’une part en France avec des plantes en pots cultivées en serre, et d’autre part en Côte d’Ivoire, dans les conditions normalement envisagées pour ce test, avec des folioles provenant de jardins à bois de greffe. La répétabilité entre ces deux études est imparfaite mais néanmoins satisfaisante. Le critère %FE est apparu plus sensible et plus précis que la mesure de la surface de nécrose induite (SN). Une variabilité importante de la sensibilité des clones et de l’agressivité des exsudats a été observée, avec l’existence d’interactions. L’analyse du déterminisme génétique de la réponse au test toxinique a été menée par détection de QTL sur deux populations de la famille biparentale d’hévéa PB260 x RRIM600, analysées sur deux sites en Côte d’Ivoire. Une carte génétique a été construite au préalable avec 308 marqueurs SSR. Le phénotypage des deux populations a révélé un déterminisme polygénique, sans effet monolocus majeur, avec, pour l’ensemble des exsudats fongiques étudiés, 13 QTL répartis sur 10 groupes de liaison et présentant des pourcentages d’explication R2 variant de 10 à 20 %. Sur les deux sites, deux QTL ont été identifiés conjointement pour le filtrat CCP et pour la toxine Cas1 purifiée à partir du filtrat CCP, démontrant l’importance de Cas1 pour la toxicité de ce filtrat. Des corrélations positives entre certains filtrats ont été observées, avec des profils de réponse similaires et des QTL communsLe test toxinique pourrait remplacer avantageusement la méthode d’inoculation conidienne. Cependant, la valeur prédictive du test pour la sensibilité des clones d’hévéa à la maladie CLF en plantation reste à caractériser. Une meilleure connaissance de l’épidémiologie du pathosystème H. brasiliensis x C. cassiicola contribuerait à l’objectif de sélection, et plus largement à la… Advisors/Committee Members: Pujade-Renaud, Valérie (thesis director).

Subjects/Keywords: Hevea brasiliensis; Corynespora cassiicola; Clf; Test toxinique; Exsudat fongique; Qtl; Hevea brasiliensis; Corynespora casiicola; Clf; Toxinic test; Fungal exudate; Qtl

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APA (6th Edition):

Tran, D. M. (2016). Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola. (Doctoral Dissertation). Montpellier. Retrieved from http://www.theses.fr/2016MONTT178

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Tran, Dinh Minh. “Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola.” 2016. Doctoral Dissertation, Montpellier. Accessed November 13, 2019. http://www.theses.fr/2016MONTT178.

MLA Handbook (7th Edition):

Tran, Dinh Minh. “Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola.” 2016. Web. 13 Nov 2019.

Vancouver:

Tran DM. Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola. [Internet] [Doctoral dissertation]. Montpellier; 2016. [cited 2019 Nov 13]. Available from: http://www.theses.fr/2016MONTT178.

Council of Science Editors:

Tran DM. Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l’étude de l’interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola et l'identification des facteurs génétiques de sensibilité : The toxinic test : a phenotyping method for studying interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola. [Doctoral Dissertation]. Montpellier; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016MONTT178

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