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1. Aussignargues, Clement. Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling.

Degree: Docteur es, Microbiologie, 2012, Aix Marseille Université

Le soufre est utilisé à des fins bioénergétiques par des micro-organismes tels que la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus qui nécessite pour sa croissance de l'oxygène, de l'hydrogène et un composé soufré indispensable. Une soufre réductase réduisant des chaînes de soufre, une Sulfure Quinone Oxydoréductase (SQR) oxydant l'H2S et une Soufre Oxygénase Réductase (SOR) oxydant et réduisant simultanément des chaînes de soufre ont été caractérisées chez cette bactérie. L'organisation de certaines de ces enzymes dans des supercomplexes membranaires a également été démontrée.Nous avons montré qu'Aq_477, précédemment caractérisée comme une soufre transférase de la famille des rhodanèses, est capable (i) de « charger » des chaînes de soufre ; (ii) d'interagir avec deux partenaires (la soufre réductase et la SOR) ; (iii) de leur présenter ce substrat. Ceci conduit à une optimisation du métabolisme. Nous avons ainsi démontré l'implication directe d'Aq_477, rebaptisée SbdP pour Sulfur -binding -donating Protein, dans le métabolisme énergétique du soufre de la bactérie. Une analyse poussée du génome nous a permis de construire un nouveau modèle suggérant notamment un recyclage des composés soufrés entre différents systèmes enzymatiques. La recherche de l'existence d'un niveau d'organisation des complexes respiratoires supérieur aux supercomplexes chez Aquifex aeolicus nous a conduits à développer de nouvelles méthodes d'étude permettant de proposer plusieurs pistes de recherche. Enfin, nous avons montré l'existence d'un nanocompartiment protéique constitué de l'encapsuline Aq_1760, dans lequel vient s'ancrer la ferritine atypique à domaines en tandem Aq_331.

Sulfur can be used in energy metabolism by microorganisms as electron donor and acceptor. The hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus, which need oxygen, hydrogen and an essential sulfur compound for its growth presents sulfur reduction and oxidation pathways linked to the energy synthesis. A sulfur reductase (reduction of sulfur chains), a Sulfide Quinone Oxidoreductase (SQR, oxidation of H2S) and a Sulfur Oxygenase Reductase (SOR, simultaneous oxidation and reduction of sulfur chains) have been characterized in this bacterium. It has also been shown that some of these enzymes are organized in membrane-bound supercomplexes.We have demonstrated that Aq_477, previously characterized as a sulfurtransferase belonging to the rhodanese superfamily, can load long sulfur chains and acts as a sulfur donor for its partners (sulfur reductase and SOR) which use these sulfur chains as substrate, thus optimizing the metabolism. These results show that Aq_477, renamed SbdP for Sulfur -binding -donating Protein, is involved in the sulfur energy metabolism of Aquifex aeolicus. The identification in the genome of some new proteins potentially involved in this metabolism permitted us to propose a new model which suggests a recycling of sulfur compounds between different enzymatic systems. We also looked for an organization level of respiratory complexes higher than…

Advisors/Committee Members: Giudici-Orticoni, Marie-Thérèse (thesis director).

Subjects/Keywords: Métabolisme énergétique du soufre; Transfert de soufre; Enzymes membranaires respiratoires; Aquifex aeolicus; Rhodanèse; Sulfur energy metabolism; Sulfur transfer; Respiratory enzymes; Aquifex aeolicus; Rhodanese

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APA (6th Edition):

Aussignargues, C. (2012). Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2012AIXM4709

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Aussignargues, Clement. “Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling.” 2012. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed January 25, 2021. http://www.theses.fr/2012AIXM4709.

MLA Handbook (7th Edition):

Aussignargues, Clement. “Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling.” 2012. Web. 25 Jan 2021.

Vancouver:

Aussignargues C. Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2012. [cited 2021 Jan 25]. Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM4709.

Council of Science Editors:

Aussignargues C. Optimisation du métabolisme énergétique du soufre chez la bactérie hyperthermophile Aquifex aeolicus. : Prediction of the compliance of packaging materials using deformulation methods and partition coefficients modelling. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012AIXM4709

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