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You searched for subject:(Cerveau de macaque). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

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1. You, Zhenzhen. Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy.

Degree: Docteur es, Informatique, Télécommunications et Électronique, 2017, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI

La compréhension des mécanismes impliqués dans les cas sains, les maladies neurodégénératives ainsi que le développement de nouvelles approches thérapeutiques repose sur l’utilisation de modèles expérimentaux pertinents et de techniques d’imagerie adaptées. Dans ce contexte, la microscopie virtuelle offre la possibilité unique d’analyser ces modèles à l’échelle cellulaire avec une très grande variété de marquages histologiques. Mon projet de thèse consiste à mettre en place et à appliquer une méthode d’analyse d’images histologiques en couleur permettant de segmenter et de synthétiser l’information relative aux neurones à l’aide de l’anticorps NeuN sur des coupes de cerveau de macaque. Dans ce travail, nous appliquons d’abord la méthode de Random Forest (RF) pour segmenter les neurones ainsi que le tissu et le fond. Ensuite, nous proposons une méthode originale pour séparer les neurones qui sont accolés afin de les individualiser. Cette méthode s’adapte à l’ensemble des neurones présentant une taille variable (diamètre variant entre 5 et 30 μm). Elle est également efficace non seulement pour des régions dites « simples » caractérisées par une faible densité de neurones mais aussi pour des régions dites « complexes » caractérisées par une très forte densité de plusieurs milliers de neurones. Le travail suivant se concentre sur la création de cartes paramétriques synthétisant la morphologie et la distribution des neurones individualisés. Pour cela, un changement d’échelle est mis en œuvre afin de produire des cartographies présentant des résolutions spatiales plus faibles (résolution originale de 0,22 μm et cartographies créées proposant une résolution spatiale adaptative de quelques dizaines à quelques centaines de micromètres). Plusieurs dizaines de paramètres morphologiques (rayon moyen, surface, orientation, etc.) sont d’abord calculés pour chaque neurone ainsi que des paramètres colorimétriques. Ensuite, il est possible de synthétiser ces informations sous la forme de cartes paramétriques à plus basse résolution à l’échelle de régions anatomiques, de coupes voire, à terme, de cerveaux entiers. Cette étape transforme des images microscopiques qualitatives couleur en images mésoscopiques quantitatives, plus informatives et plus simples à analyser. Ce travail permet d’analyser statistiquement de très grands volumes de données, de synthétiser l’information sous la forme de cartographies quantitatives, d’analyser des problèmes extrêmement complexes tels que la mort neuronale et à terme de tester de nouveaux médicaments voire de confronter ces informations acquises post mortem avec des données acquises in vivo.

Understanding the mechanisms involved in healthy cases, neurodegenerative diseases and the development of new therapeutic approaches is based on the use of relevant experimental models and appropriate imaging techniques. In this context, virtual microscopy offers the unique possibility of analyzing these models at a cellular scale with a very wide variety of histological markers. My thesis project consists in…

Advisors/Committee Members: Delzescaux, Thierry (thesis director).

Subjects/Keywords: Individualisation des neurones; Comptage de neurones; Segmentation; Images histologiques; Microscopie optique; Cerveau de macaque; Neuron individualization; Neuron counting; Macaque brain; 004; 610.28

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APA (6th Edition):

You, Z. (2017). Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy. (Doctoral Dissertation). Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Retrieved from http://www.theses.fr/2017PA066278

Chicago Manual of Style (16th Edition):

You, Zhenzhen. “Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy.” 2017. Doctoral Dissertation, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Accessed October 24, 2020. http://www.theses.fr/2017PA066278.

MLA Handbook (7th Edition):

You, Zhenzhen. “Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy.” 2017. Web. 24 Oct 2020.

Vancouver:

You Z. Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2017. [cited 2020 Oct 24]. Available from: http://www.theses.fr/2017PA066278.

Council of Science Editors:

You Z. Etude de la morphologie et de la distribution des neurones dans le cerveau de macaque par microscopie optique : Study of the morphology and distribution of neurons in the macaque brain using optical microscopy. [Doctoral Dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017PA066278

2. Bihan-Poudec, Yann. IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods.

Degree: Docteur es, Imagerie médicale, 2019, Lyon

L'imagerie de diffusion (IRMd) est une méthode unique permettant d'étudier la microstructure cérébrale et la connectivité du cerveau de manière non-invasive. Cependant, la faible résolution et la qualité de cette imagerie restreint son utilisation dans certaines applications. L'objectif de cette thèse est de développer l'IRMd cérébrale à très haute résolution sur un modèle de macaque anesthésié au moyen d'une séquence d'imagerie 3D écho-planaire segmentée (3D-msEPI) à 3T. Après une étape de développement de la reconstruction et du post-traitement des données, nous avons réalisé des images de diffusion sur le cerveau de macaque à une résolution spatiale isotrope de 0.5mm. Cette résolution nous a permis de délimiter et caractériser les structures fines comme les sous-couches de l'hippocampe ou la matière blanche superficielle, qui sont indétectables avec des séquences classiques. Cependant, cette méthode se révèle vulnérable aux mouvements élastiques des tissus cérébraux induits par les pulsations cardio-vasculaires. Une stratégie de synchronisation de l'acquisition sur celle-ci nous a permis de caractériser leurs effets sur l'IRMd à très haute résolution chez le singe anesthésié. Ces effets se caractérisent par des artefacts de ghosting et des pertes de signal qui corrompent les images, le tenseur et la tractographie dans des zones spécifiques du cerveau. La synchronisation nous a ainsi permis de réaliser une imagerie de diffusion cérébrale de macaque à des résolutions spatiales et des pondérations en diffusion très élevées jamais atteintes auparavant. Ces résultats préliminaires démontrent le potentiel de notre méthode pour les applications neuroscientifiques et médicales chez l'homme

Diffusion imaging (dMRI) is a unique method for studying brain microstructure and brain connectivity in a non-invasive way. However, the low resolution and quality of this imaging restricts its use in some applications. The aim of this thesis is to develop very high resolution cerebral MRI on an anesthetized macaque model on a 3T scanner using a segmented 3D echo-planar 3D imaging sequence (3D-msEPI). After a stage of development of the reconstruction and post-processing of the data, we made diffusion images on the macaque brain at an isotropic spatial resolution of 0.5mm. This resolution allowed us to delineate and characterize fine structures such as hippocampal sublayers or superficial white matter, which are undetectable with classical sequences. However, this method is vulnerable to the elastic movements of the brain tissue induced by the cardiovascular pulsations. A strategy of synchronization of the acquisition on this one allowed us to characterize their effects on the very high resolution MRI in the anesthetized monkey. These effects are characterized by ghosting artifacts and signal losses that corrupt images, tensor, and tractography in specific areas of the brain. The synchronization allowed us to realize macaque brain diffusion imaging at spatial resolutions and very high diffusion weights never reached before. These…

Advisors/Committee Members: Hiba, Bassem (thesis director), Ben Hamed, Suliann (thesis director).

Subjects/Keywords: IRM de diffusion; Imagerie à Haute Résolution; Correction des Mouvements; Cerveau du Macaque; Imagerie du Cerveau; Reconstruction d'images; Méthodologie IRM; Microstructure; Diffusion MRI; High Resolution Imaging; Motion Correction; Macaque Brain; Brain Imaging; Image Reconstruction; MRI Methodology; Microstructure; 610

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APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Bihan-Poudec, Y. (2019). IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods. (Doctoral Dissertation). Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2019LYSE1299

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Bihan-Poudec, Yann. “IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods.” 2019. Doctoral Dissertation, Lyon. Accessed October 24, 2020. http://www.theses.fr/2019LYSE1299.

MLA Handbook (7th Edition):

Bihan-Poudec, Yann. “IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods.” 2019. Web. 24 Oct 2020.

Vancouver:

Bihan-Poudec Y. IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods. [Internet] [Doctoral dissertation]. Lyon; 2019. [cited 2020 Oct 24]. Available from: http://www.theses.fr/2019LYSE1299.

Council of Science Editors:

Bihan-Poudec Y. IRM de diffusion cérébrale à haute résolution : développements des méthodes de reconstruction et de post-traitement : High-Resolution Diffusion MRI of the brain : developments in reconstruction and post-processing methods. [Doctoral Dissertation]. Lyon; 2019. Available from: http://www.theses.fr/2019LYSE1299

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