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1. Bourgin, Dominique. Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes.

Degree: Docteur es, Physique, 2016, Université de Strasbourg

Les réactions de fusion-évaporation et de transfert de nucléons entre ions lourds à des énergies proches de la barrière de Coulomb jouent un rôle essentiel dans l’étude de la structure nucléaire et des mécanismes de réaction. Dans le cadre de cette thèse, deux expériences de fusion-évaporation et de transfert de nucléons ont été réalisées au Laboratoire National de Legnaro en Italie : 40Ca+58Ni et 40Ca+64Ni. Dans une première expérience, les sections efficaces de fusion de 40Ca+58,64Ni ont été mesurées à des énergies au-dessus et en dessous de la barrière de Coulomb et ont été interprétées à l’aide de calculs en voies couplées et Hartree-Fock dépendants du temps (TDHF). Les résultats montrent l’importance de l’excitation à un phonon octupolaire dans le noyau 40Ca et les excitations à un phonon quadripolaire dans les noyaux 58Ni et 64Ni, ainsi que l’importance des voies de transfert de nucléons dans le système riche en neutrons 40Ca+64Ni. Dans une expérience complémentaire, les probabilités de transfert de nucléons de 40Ca+58,64Ni ont été mesurées dans le même domaine d’énergie que l’expérience précédente et ont été interprétées en effectuant des calculs TDHF+BCS. Les résultats confirment l’importance des voies de transfert de nucléons dans 40Ca+64Ni. Une description conjointe des probabilités de transfert de nucléons et des sections efficaces de fusion a été réalisée pour les deux réactions étudiées en utilisant une approche en voies couplées.

Heavy-ion fusion-evaporation and nucleon transfer reactions at energies close to the Coulomb barrier play an essential role in the study of nuclear structure and reaction dynamics. In the framework of this PhD thesis, two fusion-evaporation and nucleon transfer experiments have been performed at the Laboratori Nazionali di Legnaro in Italy : 40Ca+58Ni and 40Ca+64Ni. In a first experiment, fusion cross sections for 40Ca+58,64Ni have been measured from above to below the Coulomb barrier and have been interpreted by means of coupled-channels and Time-Dependent Hartree-Fock (TDHF) calculations. The results show the importance of the one-phonon octupole excitation in the 40Ca nucleus and the one-phonon quadrupole excitations in the 58Ni and 64Ni nuclei, as well as the importance of the nucleon transfer channels in the neutron-rich system 40Ca+64Ni. In a complementary experiment, nucleon transfer probabilities for 40Ca+58,64Ni have been measured in the same energy region as the previous experiment and have been interpreted by performing TDHF+BCS calculations. The results confirm the importance of nucleon transfer channels in 40Ca+64Ni. A simultaneous description of the nucleon transfer probabilities and the fusion cross sections has been performed for both reactions, using a coupled-channels approach.

Advisors/Committee Members: Courtin, Sandrine (thesis director).

Subjects/Keywords: Réactions de fusion-évaporation; Sections efficaces de fusion; Distributions de barrières; Calculs en voies couplées; Calculs Hartree-Fock dépendants du temps; Réactions de transfert de nucléons; Distributions de la chaleur de réaction; Probabilités de transfert de nucléons; Fusion-evaporation reactions; Fusion cross sections; Barrier distributions; Coupled- channels calculations; Time-dependent Hartree-Fock calculations; Nucleon transfer reactions; Q-value distributions; Nucleon transfer probabilities; 539.7

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APA (6th Edition):

Bourgin, D. (2016). Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2016STRAE023

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Bourgin, Dominique. “Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes.” 2016. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed August 18, 2019. http://www.theses.fr/2016STRAE023.

MLA Handbook (7th Edition):

Bourgin, Dominique. “Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes.” 2016. Web. 18 Aug 2019.

Vancouver:

Bourgin D. Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2016. [cited 2019 Aug 18]. Available from: http://www.theses.fr/2016STRAE023.

Council of Science Editors:

Bourgin D. Réactions de fusion entre ions lourds par effet tunnel quantique : le cas des collisions entre calcium et nickel : Heavy-ion fusion reactions through quantum tunneling : collisions between calcium and nickel isotopes. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2016. Available from: http://www.theses.fr/2016STRAE023

2. Lejeune, Julien. Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states.

Degree: Docteur es, Chimie, 2013, Université Paris-Sud – Paris XI

Les composés à commutation électronique constituent une large famille de systèmes particulièrement prometteuse, notamment pour le stockage de l’information à l’échelle moléculaire. Parmi ces composés, les analogues du bleu de Prusse cobalt-fer (ABP AxCoFe) sont des polymères inorganiques formés d’enchaînements Co-N≡C-Fe pouvant présenter deux états électroniques CoII(HS)-N≡C-FeIII(BS) et CoIII(BS)-N≡C-FeII(BS) (HS : haut spin ; BS : bas spin) aux propriétés structurales et électroniques bien distinctes. La transition électronique entre ces deux états peut être contrôlée de manière réversible par une grande variété de paramètres chimique (insertion de cations alcalins) et physiques (température, pression, irradiation). Ces propriétés de photo-commutation sont particulièrement intéressantes pour le développement de mémoires optiques à l’échelle moléculaire.Afin de comprendre les propriétés électroniques des ABP AxCoFe, nous nous sommes intéressés à l’interaction entre les centres métalliques via le pont cyanure dans l’enchaînement Co-N≡C-Fe, aussi bien sur un plan expérimental (mise en œuvre de techniques d’analyse reposant sur l’utilisation du rayonnement synchrotron) que théorique (modélisation ab initio de type post-Hartree-Fock). Nous avons également étudié la nature de l’interaction, démontrée expérimentalement, entre les cations alcalins et le réseau bimétallique formé par les enchaînements Co-N≡C-Fe. Finalement, la pertinence du modèle à deux états, habituellement utilisé pour rendre compte des propriétés électroniques des systèmes commutables, est discutée, avec la mise en évidence de multistabilités au sein des ABP AxCoFe. Ce travail propose ainsi une étude la plus complète possible des phénomènes électroniques rencontrés dans ces systèmes.

Electronically switchable compounds constitute a wide family of very promising systems, especially in the field of data storage at a molecular scale. Amongst these compounds, cobalt-iron Prussian blue analogues (AxCoFe PBAs) are inorganic polymers based on Co-N≡C-Fe linkages that may exhibit two CoII(HS)-N≡C-FeIII(LS) and CoIII(LS)-N≡C-FeII(LS) (HS: high spin; LS: low spin) electronic states with very different structural and electronic properties. Electronic transition in between these two states can be reversibly controlled by a large variety of both chemical (insertion of alkali cations) and physical (temperature, pressure, irradiation) parameters. These photo switching properties are extremely appealing for the development of optical memory devices at the molecular scale.In order to understand the electronic properties of AxCoFe PBAs, the interaction occurring between the metallic centres through the cyanide bridge in the Co-N≡C-Fe linkages was investigated both at an experimental (use of synchrotron-radiation-based analytic techniques) and a theoretical (post-Hartree-Fock ab initio modelling) levels. The nature of the experimentally-demonstrated interaction between the alkali cations and the bimetallic network, made of the Co-N≡C-Fe linkages, was also studied.…

Advisors/Committee Members: Bleuzen, Anne (thesis director).

Subjects/Keywords: Analogues du bleu de Prusse; Commutation électronique; Transition de spin; Transfert de charge; Spectroscopie infra-rouge; Rayonnement synchrotron; Calculs post-Hartree-Fock; Prussian blue analogues; Electronic switching; Spin crossover; Charge transfer; Infra-red spectroscopy; Synchrotron radiation; Post-Hartree-Fock calculations

…xlvii II. Méthode Hartree-Fock : approche « self-consistent field… …Diffractométrie de rayons X Extended X-ray absorption fine structure (Post-)Hartree-Fock Haut… …x5D;4(k+(x/4))/j·nH2O Unrestricted Hartree-Fock X-ray absorption near… 

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APA (6th Edition):

Lejeune, J. (2013). Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states. (Doctoral Dissertation). Université Paris-Sud – Paris XI. Retrieved from http://www.theses.fr/2013PA112090

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Lejeune, Julien. “Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states.” 2013. Doctoral Dissertation, Université Paris-Sud – Paris XI. Accessed August 18, 2019. http://www.theses.fr/2013PA112090.

MLA Handbook (7th Edition):

Lejeune, Julien. “Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states.” 2013. Web. 18 Aug 2019.

Vancouver:

Lejeune J. Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Paris-Sud – Paris XI; 2013. [cited 2019 Aug 18]. Available from: http://www.theses.fr/2013PA112090.

Council of Science Editors:

Lejeune J. Propriétés de commutation des analogues CoFe du bleu de Prusse : vers un contrôle de la position en énergie des états stable et métastable : Switching properties of CoFe Prussian blue analogues : towards a control of the position in terms of energy of the stable and metastable states. [Doctoral Dissertation]. Université Paris-Sud – Paris XI; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013PA112090

3. Olivieri, Lilian. Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations.

Degree: Docteur es, Biologie informatique, 2012, La Réunion

FKBP12 est une protéine ubiquitaire, principalement cytosolique, qui est au carrefour de plusieurs voies signalétiques. Son abondance naturelle dans les tissus nerveux peut être reliée à son implication dans les maladies neurodégénératives telles que les maladies d'Alzheimer et de Parkinson ainsi que dans les neuropathies périphériques et diabétiques ou dans des blessures des cordons spinaux. De nombreuses études ont montré que des molécules exogènes (ligands) venant se fixer sur cette protéine permettent la régénération d'un grand nombre de connexions neuronales endommagées. Une difficulté provient cependant du fait que, pour un ligand donné, il n'existe aucune relation claire entre sa structure et sa capacité de liaison à FKBP12. Notre étude vise ainsi à rationaliser la relation entre la structure d'un ligand et son affinité pour cette protéine. Deux complexes modèles, formés entre FKBP12 et chacun des deux ligands 8 et 308, ont été utilisés. Ces deux ligands de haute affinité ont des structures différentes. Notre travail s'est appuyé sur des simulations de dynamique moléculaire pour caractériser l'état intermédiaire qui est formé transitoirement lors du processus de complexation entre la protéine et son ligand. Dans cet état particulier, l'identification des interactions naissantes entre les partenaires a permis (i) de comprendre l'implication des différentes parties du ligand dans le mécanisme de reconnaissance avec FKBP12 et (ii) de rationaliser les affinités de certains ligands apparentés.

FKBP12 is an ubiquitous, mostly cytosolic, protein found at the crossroads of several signaling pathways. Its natural abundance in the nervous tissues can be related to its implication in neurodegenerative diseases like Alzheimer's and Parkinson's as well as in peripheral neuropathies and diabetes or in injuries of the spinal cords. Several studies have demonstrated that exogenous molecules (ligands) that can bind to FKBP12 allow the regeneration of many damaged neuron connections. However, there is no clear relationship between the structure of a ligand and its ability to bind to FKBP12. Our study aims at rationalizing the relationship between the structure of a ligand and its affinity to FKBP12. Two model complexes, formed between FKBP12 and each of the two high-affinity ligands 8 and 308, were studied. These two ligands are structurally different. We used molecular dynamics simulations to characterize the intermediate state that is transiently formed during the binding process between the protein and its ligand. In this state, the analysis of the nascent interactions allowed (i) to unravel the role played by the various ligand moieties in the recognition process with FKBP12 and (ii) to rationalize the affinities of related ligands.

Advisors/Committee Members: Offmann, Bernard (thesis director), Gardebien, Fabrice (thesis director).

Subjects/Keywords: Fkbp12; État intermédiaire de complexation; Reconnaissance moléculaire; Interactions protéine-Ligand; Simulations de dynamique moléculaire; Ligand de haute affinité; Paramétrisation d’un champ de force; Calculs Hartree-Fock; Fkbp12; BÉtat intermédiaire de complexationinding intermediate state; Molecular recognition; Protein-Ligand interactions; Molecular dynamics simulations; High-Affinity ligand; Force field parameterization; Hartree-Fock calculations

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APA (6th Edition):

Olivieri, L. (2012). Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations. (Doctoral Dissertation). La Réunion. Retrieved from http://www.theses.fr/2012LARE0011

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Olivieri, Lilian. “Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations.” 2012. Doctoral Dissertation, La Réunion. Accessed August 18, 2019. http://www.theses.fr/2012LARE0011.

MLA Handbook (7th Edition):

Olivieri, Lilian. “Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations.” 2012. Web. 18 Aug 2019.

Vancouver:

Olivieri L. Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations. [Internet] [Doctoral dissertation]. La Réunion; 2012. [cited 2019 Aug 18]. Available from: http://www.theses.fr/2012LARE0011.

Council of Science Editors:

Olivieri L. Recherche et caractérisation par dynamique moléculaire d'états intermédiaires pour la complexation entre la protéine FKBP12 et des ligands de haute affinité : Study of building intermediate states between FKBP12 and high-affinity ligands by molecular dynamics simulations. [Doctoral Dissertation]. La Réunion; 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012LARE0011

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