Advanced search options

Advanced Search Options 🞨

Browse by author name (“Author name starts with…”).

Find ETDs with:

in
/  
in
/  
in
/  
in

Written in Published in Earliest date Latest date

Sorted by

Results per page:

Sorted by: relevance · author · university · dateNew search

You searched for subject:(Antibiogramme). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

Search Limiters

Last 2 Years | English Only

No search limiters apply to these results.

▼ Search Limiters

1. Bardet, Lucie. Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods.

Degree: Docteur es, Pathologie humaine. Maladies infectieuses, 2017, Aix Marseille Université

La découverte récente du premier gène de résistance plasmidique à la colistine mcr-1 a mis en évidence le besoin urgent d'améliorer la détection des isolats résistant à la colistine dans les laboratoires de microbiologie clinique afin de pouvoir rapidement isoler les patients porteurs. L’objectif de ma thèse a ainsi été de répondre à cette problématique par le développement et l’évaluation d’outils spécifiques. Une revue a été rédigée visant à résumer les nouveaux outils développés pour détecter la résistance aux polymyxines, y compris la présentation des méthodes actuelles phénotypiques, antibiogrammes et génotypiques. Le milieu de culture LBJMR a été développé pour détecter toutes les bactéries à Gram négatif résistantes à la colistine et également les souches d’entérocoques résistants à la vancomycine qui représentent un autre problème majeur de santé publique. LBJMR est polyvalent et a permis de dépister 3 bactéries d'intérêt clinique à partir d’un même échantillon: E. coli et K. pneumoniae résistantes à la colistine, et E. faecium résistant à la vancomycine. Un brevet a été déposé. Le kit UMIC Colistine est un dispositif commercial de détermination de la CMI basé sur la méthode de référence. Évalué conformément à la norme ISO 20776, sa sensibilité était excellente pour la détection des souches porteuses du gène mcr-1. Le kit UMIC Colistine constitue ainsi une méthode rapide et fiable pour évaluer la CMI des isolats cliniques dans les laboratoires de microbiologie clinique. Enfin, mes travaux de thèse ont compris l’analyse d’une souche de K. pneumoniae hétérorésistante à la colistine et la description d’une nouvelle espèce bactérienne : Pseudomonas massiliensis.

The recent discovery of mcr-1, the first plasmid-mediated colistin resistance gene, highlighted the urgent need to implement the detection of colistin-resistant isolates in clinical microbiology laboratories, in order to isolate carrier patients. My thesis aimed to address this issue by developing and evaluating specific tools. A review was redacted to summarize the new tools developed to detect polymyxin resistance including the current phenotyping, susceptibility testing and genotyping methods. The LBJMR culture medium has been developed to detect all colistin-resistant Gram-negative bacteria and also the vancomycin-resistant enterococci which represent another major problem of public health. The LBJMR medium allowed the detection of different bacteria of interest from the same clinical sample: colistin-resistant E. coli and K. pneumoniae and also a vancomycin-resistant E. faecium. This project led to a patent filing. The UMIC Colistine kit is a ready-to-use device based on the reference method to determine the polymyxin MIC. Evaluated in accordance with ISO 20776 standard, its sensitivity was excellent for the detection of colistin-resistant strains harboring the mcr-1 gene. The UMIC Colistin system is a rapid and reliable method to determine colistin MIC of clinical isolates in clinical microbiology laboratories. My thesis project also included the…

Advisors/Committee Members: Rolain, Jean-Marc (thesis director).

Subjects/Keywords: Colistine; Polymyxines; Résistance; Mcr-1; Détection; Antibiogramme; Milieu de culture; Entérobactéries; Colistin; Polymyxins; Resistance; Mcr-1; Detection; Culture medium; Susceptibility testing; Enterobacteriaceae

Record DetailsSimilar RecordsGoogle PlusoneFacebookTwitterCiteULikeMendeleyreddit

APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Bardet, L. (2017). Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2017AIXM0596

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Bardet, Lucie. “Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods.” 2017. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed April 01, 2020. http://www.theses.fr/2017AIXM0596.

MLA Handbook (7th Edition):

Bardet, Lucie. “Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods.” 2017. Web. 01 Apr 2020.

Vancouver:

Bardet L. Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2017. [cited 2020 Apr 01]. Available from: http://www.theses.fr/2017AIXM0596.

Council of Science Editors:

Bardet L. Développement de nouveaux outils de détection des bacilles à Gram négatif résistants à la colistine : Development of new tools for detection of colistin-resistant Gram-negative rods. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017AIXM0596

2. Ghodbane, Ramzi. Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis.

Degree: Docteur es, Pathologie humaine. Maladies infectieuses, 2013, Aix Marseille Université

Mycobacterium tuberculosis est la cause d’une des maladies infectieuses les plus fréquentes dans le monde causant la mort de plus de 1,2 millions de personnes chaque année selon l’organisation mondiale de la santé (OMS). Actuellement, la tuberculose à M. tuberculosis émerge chez d’autres espèces comme l’a montré notre revue bibliographique des cas de tuberculose à M. tuberculosis chez les primates non-humains, les éléphants d’Asie, les animaux de ferme, les animaux de compagnie et certains animaux sauvages. Nous avons montré que ces trois espèces survivent dans le sol pendant au moins 12 mois et restent pathogènes dans un modèle souris. Egalement nous avons montré que le sol infecté par M. tuberculosis est une source potentielle de contamination pour les animaux. Nous avons ensuite développé un protocole de culture rapide de M. tuberculosis, incluant un nouveau milieu de culture solide, des conditions optimisées d’incubation, et la détection des microcolonies par autofluorescence. Notre travail de thèse a permis de mettre en place des techniques et protocoles qui révolutionnent la culture et l’isolement de M. tuberculosis en réduisant les délais de culture et des antibiogrammes, un point déterminant pour la lutte contre la tuberculose notamment dans les pays à ressources limitées et les pays à forte émergence de souches de M. tuberculosis de plus en plus résistantes. Ces protocoles sont en cours de transfert pour la routine de laboratoire.

Mycobacterium tuberculosis is the cause of one of the most common infectious diseases in the world killing more than 1.2 million people each year according to the World Health Organization (WHO). Currently, M. tuberculosis tuberculosis emerges in other species like non-human primates, Asian elephants, farm animals and some wild animals. We have shown that three species of M. tuberculosis complex survive in the soil for at least 12 months and are pathogenic in a mouse model and M. tuberculosis-infected soil is a potential source of infection for animals. We then developed a protocol for rapid culture of M. tuberculosis, including a new solid culture medium, optimized conditions of incubation, and detection of microcolonies by autofluorescence. Our thesis has helped develop techniques and protocols that are revolutionizing the culture and isolation of M. tuberculosis by reducing delays culture and susceptibility testing, a crucial point for the fight against tuberculosis, especially in countries limited resources and countries with strong emergence of M. tuberculosis strains more resistant. These protocols are being transferred to the routine laboratory.

Advisors/Committee Members: Drancourt, Michel (thesis director).

Subjects/Keywords: Mycobacterium tuberculosis; Complexe Mycobacterium tuberculosis; Sources non-humaines; Prétraitement; Décontamination; Milieu de culture solide; Antibiogramme; Résistance; Culture rapide; Microcolonies; Mycobacterium tuberculosis; Mycobacterium tuberculosis complex; Non-human sources; Pretreatment; Decontamination; Solid culture medium; Resistance; Fast growing; Microcolonies

Record DetailsSimilar RecordsGoogle PlusoneFacebookTwitterCiteULikeMendeleyreddit

APA · Chicago · MLA · Vancouver · CSE | Export to Zotero / EndNote / Reference Manager

APA (6th Edition):

Ghodbane, R. (2013). Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis. (Doctoral Dissertation). Aix Marseille Université. Retrieved from http://www.theses.fr/2013AIXM5057

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Ghodbane, Ramzi. “Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis.” 2013. Doctoral Dissertation, Aix Marseille Université. Accessed April 01, 2020. http://www.theses.fr/2013AIXM5057.

MLA Handbook (7th Edition):

Ghodbane, Ramzi. “Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis.” 2013. Web. 01 Apr 2020.

Vancouver:

Ghodbane R. Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis. [Internet] [Doctoral dissertation]. Aix Marseille Université 2013. [cited 2020 Apr 01]. Available from: http://www.theses.fr/2013AIXM5057.

Council of Science Editors:

Ghodbane R. Diagnostic rapide de la tuberculose pulmonaire par isolement et culture de Mycobacterium tuberculosis : Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis by isolation and culture of Mycobacterium tuberculosis. [Doctoral Dissertation]. Aix Marseille Université 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013AIXM5057

.