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1. Redmond, Seth. Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii.

Degree: Docteur es, Biologie, 2015, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI

Malgré le succès des insecticides pour le contrôle du paludisme, la transmission continue dans la plupart des pays d’Afrique sub-saharienne. La recherche pour de nouveaux moyens de contrôle (plus spécialement la modification génétique des populations vecteurs), ou l'utilisation plus efficace des contrôles actuels, vont nécessiter une recherche sur les structures de populations de moustiques et les processus d’immunisation qui importent pour la transmission du Plasmodium chez les moustiques sauvages. Par ailleurs, l’utilisation des techniques d’association génomique ‘GWAS’ est basée sur un réelle compréhension des structures des populations.Ma thèse inclura une description detaillée du système immunitaire du moustique, basée sur la recherche actuelle et des comparaisons génomiques; ainsi que des descriptions des principales voies immunitaires, et des gênes potentiels mal-caracterisés qui peuvent être trouvés dans une étude GWAS. Ainsi qu’une description des connaissances actuelles des structures des populations, dont la speciation du gambiae / coluzzii, et les effets des grandes variations structurelles.Je présenterai le développement d’un nouveau moyen d'identification des variations structurelles ; utilisant les techniques d’ “apprentissage automatique” permettant d'identifier les karyotypes directement à partir des séquences haut-débit, menant à des résultats d’une précision sans précédent.Je présenterai également la première vraie cartographie génomique du ‘tout-génome’ du moustique. Les colonies sont fondées par des moustiques sauvages; les fondateurs sont controlées par strates, incluant également des sous-espèces et variations structurelles majeures. Avec ces colonies une méthode innovant de cartographie est utilisée: dans un premier temps, une identification des grandes régions au sein des groupes phenotypées par la perte de hétérogénéité; puis dans un second temps, le génotypage individuel ‘Sequenom’ sera utilisé pour une cartographie exacte. Cette méthode est utilisée pour l’identification d’une région avec un effet phenotypique sur la prévalence des infections dans la nature.Enfin, je suggèrerai comment ces techniques peuvent être importantes à l’avenir pour l’application du contrôle génomique dans la nature.

Despite successes in the use of insecticides in the control of malaria, malaria transmission continues in much of sub-saharan Africa. The search for novel methods of control (in particular genetic modification of vector populations), or of superior implementation of the currently available methods will require both greater knowledge of the population structure of the mosquito, and of the immune processes that are important in the wild. It is important to note that the mapping of novel immune genes, via genome wide association studies (GWAS) is predicated on a firm understanding of the population structure.My thesis will include a detailed description of the mosquito innate immune system based on current research and comparative genomics; this will illustrate the major pathways that might be employed…

Advisors/Committee Members: Vernick, Kenneth (thesis director).

Subjects/Keywords: Compétence des vecteurs; Immunité antipaludique; Cartographie génomique; GWAS; Génomique des populations; Anti-malarial response; GWAS; 571.157

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APA (6th Edition):

Redmond, S. (2015). Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii. (Doctoral Dissertation). Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Retrieved from http://www.theses.fr/2015PA066085

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Redmond, Seth. “Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii.” 2015. Doctoral Dissertation, Université Pierre et Marie Curie – Paris VI. Accessed January 28, 2021. http://www.theses.fr/2015PA066085.

MLA Handbook (7th Edition):

Redmond, Seth. “Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii.” 2015. Web. 28 Jan 2021.

Vancouver:

Redmond S. Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2015. [cited 2021 Jan 28]. Available from: http://www.theses.fr/2015PA066085.

Council of Science Editors:

Redmond S. Population structure and genome-wide association in the malaria vectors Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii : Structure de population et large génome association dans les vecteurs de malaria Anopheles gambiae et Anopheles coluzzii. [Doctoral Dissertation]. Université Pierre et Marie Curie – Paris VI; 2015. Available from: http://www.theses.fr/2015PA066085

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