▼ Microglia, the brain's resident immune cells and phagocytes, are emerging as critical regulators of developing synaptic circuits in the healthy brain after having long been thought to function primarily during central nervous system (CNS) injury or disease. Recent work indicates that microglia engulf synapses in the developing brain; however, how microglia know which synapses to target for removal remains a major open question. For my dissertation research, I studied microglia-mediated pruning in the retinogeniculate system and sought to identify the molecules regulating microglial engulfment of synaptic inputs. I discovered that "eat me" and "don't eat me" signals, immune molecules known for either promoting or inhibiting macrophage phagocytosis of cells or debris, localize to the dorsal lateral geniculate nucleus of the thalamus (dLGN) and direct retinogeniculate refinement. We found that "eat me" signal C3 and its microglial receptor, CR3, are required for normal engulfment, and that loss of either of these molecules leads to a reduction in phagocytosis and sustained deficits in refinement. These data suggest that microglia-mediated pruning may be analogous to the removal of non-self material by phagocytes in the immune system. To test this hypothesis, I examined whether protective signals are required to prevent excess microglial engulfment, as they prevent phagocytosis of self cells in the immune system. I found that protective "don't eat me" signal CD47 is required to prevent excess microglial engulfment and retinogeniculate pruning during development. Moreover, another "don't eat me signal", CD200, also prevents overpruning. Together, these findings indicate that immune molecules instruct microglia as to which synapses to engulf and present a model in which a balance of stimulatory and inhibitory cues is necessary to guide remodeling of immature synaptic circuits. These data shed new light on mechanisms regulating synaptic refinement and microglial function in the healthy, developing CNS, and may have implications for disorders characterized by immune dysregulation and circuit disconnectivity, such as autism spectrum disorder (ASD) and schizophrenia. Advisors/Committee Members: Stevens, Beth (advisor), Greenberg, Michael (committee member), Gu, Chenghua (committee member), Stiles, Charles (committee member), Freeman, Marc (committee member), Schwarz, Thomas (committee member), Benowitz, Larry (committee member).

▼ La coqueluche est une maladie respiratoire aiguë, causée par la bactérie à Gram négatif Bordetella pertussis. L’hémagglutinine filamenteuse (FHA) est une adhésine responsable de la colonisation du tractus respiratoire de l’hôte, ainsi qu’un antigène vaccinal important. La FHA est transportée à la surface de la bactérie par une protéine de membrane externe, FhaC, selon la voie de sécrétion à deux partenaires (voie TPS). Le couple FHA/FhaC sert de modèle aux systèmes TPS. FhaC fait également partie de la superfamille de transporteurs TpsB/Omp85 qui regroupe des protéines de la membrane externe des bactéries et de certains organites eucaryotes (dont les chloroplastes et mitochondries). La structure cristallographique de FhaC est la première à avoir été obtenue parmi les protéines de cette superfamille. Le tonneau β de FhaC est composé de 16 brins anti-parallèles, reliés par des boucles extracellulaires ou périplasmiques. Le canal formé par FhaC est obstrué par une hélice amino-terminale (H1) et une boucle de surface conservée dans la superfamille repliée à l’intérieur du tonneau (L6). Le domaine périplasmique de FhaC contient deux domaines « POTRA » (pour Polypeptide Transport Associated) en tandem. Ces domaines sont conservés dans la superfamille et seraient responsables d’interactions protéine-protéine. Mon travail de thèse a consisté à appréhender, à partir de la structure de FhaC, les mécanismes moléculaires de la sécrétion de la FHA. J’ai étudié le rôle d’une tétrade de résidus conservés dans la boucle L6, puis j’ai caractérisé les déterminants d’interaction présents dans les domaines POTRA de FhaC. Nos travaux ont montré que la tétrade conservée VRGY localisée à l’extrémité de L6 est impliquée dans la fonction de FhaC. Les substitutions de l’arginine et de la tyrosine en alanine (FhaC-R450A et FhaC-Y452A) ont montré que l’arginine était essentielle à la sécrétion de la FHA. De plus, la structure cristallographique de FhaC-R450A indique que la substitution ne perturbe pas la position de L6. L’analyse des propriétés du canal de ces deux variants reconstitués en bicouche lipidique montre en revanche une perturbation des canaux de FhaC-Y452A. Les substitutions n’altèrent pas l’étape de reconnaissance de FHA par FhaC. L’arginine serait donc impliquée dans une étape tardive de la sécrétion, alors que la tyrosine semble participer au positionnement de L6 ou à la régulation de sa mobilité au cours de la sécrétion et pourrait stabiliser FhaC « au repos ». J’ai également caractérisé les déterminants d’interaction des deux domaines POTRA de FhaC et montré que des résidus de l’extrémité de POTRA1 sont impliqués dans le recrutement de la FHA, probablement par interaction électrostatique. Deux sites majeurs d’interaction ont été identifiés dans des sillons hydrophobes des POTRA1 et 2, qui seraient compatibles avec l’hypothèse que les deux protéines interagissent par « beta augmentation ». L’étude du couple FHA/FhaC est un modèle pour la voie de sécrétion TPS. Nos résultats indiquent que les motifs structuraux conservés… Advisors/Committee Members: Jacob-Dubuisson, Françoise (thesis director).

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L'objet se place en opposition. Il est une ponctuation déroutante, un point de diffraction dans notre monde. Il induit un éclatement du réel entre plusieurs alternatives.L'apparition de l'objet constituerait un "entre-deux" : un point singulier dédoublant notre monde entre plusieurs lignes de fuites possibles. Cet entre-deux est un embranchement où émergent des lignes tangentes et insoupçonnées au quotidien. L'objet s'inscrit dans un processus interférant extrayant l'ordinaire de son ordinarité, le propulsant vers sa singularité.Au cours de notre thèse, nous cherchons à répondre à cette question: Comment l'objet et le design font-ils du quotidien un événement ? Nous interrogeons les modalités de ce passage de la banalité à l'événementialité du réel.Entre-deux, le design n'impose pas une réalité totalement autre, il propose des chemins un peu décalés, des itinéraires "bis" à notre monde. Des procédures rhizomiques sont initiatrices de percées entre ce réel-ci et des versions inédites. Le design constitue une zone schizophrène : une localité de bascule vers une variante inattendue du réel, mais envisageable de lui-même. Les entre-deux, creusés par le designer sont des accès à des mondes possibles, la révélation d'un envers utopique de ce monde-ci. Le design et l'objet ont pour dessein de dévoiler ce qu'on ne saurait voir autrement. Ils discutent les frontières du réel. Ils projettent d'explorer des prolongations éventuelles, d'ouvrir des perspectives nouvelles à notre monde commun. Ils font apparaître un mi-lieu prospectif au sein duquel des alternatives permettraient d'engager un débat, et d'opérer des choix sur le monde dans lequel nous souhaitons vivre.

The object places itself in opposition. It is a diverting punctuation, a point of diffraction within our world. It introduces a bursting of the reality between several alternatives.The object's appearance constitutes a "between-two" : a singular point where our world duplicate between several possible lines of flight. This between-two is a junction where emerge tangent and unsuspected lines to everyday life. The object is inscribed in an interfering process extracting the ordinary from its ordinarity, propelling it towards its singularity.We seek to answer to this essential question : "How the design and the object do they make of the everyday an event ?". From the analysis of our practice of the design and contemporary designer's ones, we question the modalities of this passage from reel's commonness to its evenementiality.Between-two, the design doesn't impose a completely different reality but, it proposes little-shifted ways, alternative ways in our world. The rhizomic procedures we set-up are initiating passages or breakthroughs between this reality and unheard versions. The design constitutes a schizophrenic zone : a tip-over locality to a reality's unexpected variant, but conceivable of itself. The between-two, dug by the designer whom we are, are accesses to possible worlds, perhaps even, the revelation of this world's utopian other-side.The design and the…

Advisors/Committee Members: Vandecasteele, Éric (thesis director).

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La virulence de Bordetella pertussis, agent de la coqueluche, est liée à un arsenal de facteurs de virulence dont l’expression est régulée par le système à deux composants BvgAS. BvgA est le régulateur de réponse et BvgS le capteur du système, qui possède 3 domaines putatifs de perception de signaux. Il s’agit de 2 domaines périplasmiques « Venus FlyTrap » (VFT), reliés par un segment transmembranaire à un domaine PAS (Per-ARNT-Sim) cytoplasmique qui fait la jonction avec l’histidine-kinase. Les signaux perçus par ces domaines capteurs sont inconnus, mais une température de 37°C est suffisante pour maintenir le système actif en laboratoire. Cette activité peut être modulée négativement par des composés chimiques, comme le MgSO4 ou le nicotinate, qui à concentrations suffisantes entraînent le passage de la bactérie en phase avirulente.Nous nous sommes intéressés aux domaines VFT de BvgS. Ces domaines, ubiquitaires, sont composés de 2 lobes reliés par une charnière délimitant une cavité qui permet la fixation d’un ligand spécifique stabilisant le VFT sous une forme fermée.Les domaines VFT de BvgS ont pu être cristallisés et s’organisent en un dimère entrelacé définissant de larges interfaces entre les 4 VFTs. Les VFT2 sont fermés sans ligand et les VFT1 ouverts, et la fermeture artificielle de ces domaines par des ponts disulfure a montré qu’il s’agit de la conformation active de BvgS. L’importance des interfaces entre les domaines VFT pour la fonction de BvgS a été démontrée par mutagenèse dirigée. Un signal positif proviendrait du périplasme pour être transmis à travers la membrane par les interfaces entre les VFT et intégré via un couplage fonctionnel en trans entre ces domaines et les hélices pré-membranaires, dites H19.Ces hélices se prolongeraient à travers la membrane et dans le cytoplasme jusqu’au domaine PAS. Les domaines PAS sont ubiquitaires, avec une structure fortement conservée en feuillet  à 5 brins recouvert d’hélices  délimitant une cavité. Ils sont impliqués dans diverses fonctions biologiques, selon leur capacité de liaison d’un ligand. Certains domaines PAS fonctionneraient sans ligand et pourraient servir d’adaptateurs ou d’amplificateurs de signal.Nous avons pu mettre en évidence la capacité de dimérisation de PASBvg, confirmant la nature dimérique du capteur BvgS. Des substitutions de résidus de la cavité de PASBvg indiqueraient que l’intégrité de la cavité de PASBvg est nécessaire au passage de signaux positifs et négatifs provenant du périplasme. La fixation de ligand dans la cavité n’a pu être démontrée mais n’est pas exclue. D’autre part, certains résidus sont nécessaires au couplage du domaine PAS avec ses hélices flanquantes pour la transmission de signal. La perte de ces interactions déstabilise significativement PASBvg et rend BvgS inactif.Un message positif proviendrait du périplasme et serait maintenu par le domaine PAS, dans une conformation rigide, permettant aussi la transmission des signaux modulateurs.

Virulence of Bordetella pertussis, the whooping cough agent, is due to a…

Advisors/Committee Members: Jacob-Dubuisson, Françoise (thesis director).

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Le diagnostic de Rem Koolhaas sur les métropoles actuelles montre une ville générique, sans fin, sans identité, sans passé, sans rues, la seule activité qui reste est le shopping et la condition « in-transit » devient universelle. À cette analyse manque une partie très importante, la condition biopolitique de la métropole, qui expliquerait plusieurs des caractéristiques de ce Junkspace, comme le fait qu’il contient la possibilité de résistance face au générique. À la lumière de ce constat et suivant les directions de pensée que Gilles Deleuze et Félix Guattari ouvrent dans Mille Plateaux, cette thèse propose d’identifier les intervalles témoignant de la dimension biopolitique du Junkspace au travers d’une mobilisation de la théorie des agencements comme hypothèse pour la théorie architecturale et urbaine. Le postulat général est que ces intervalles seraient des territoires entre-deux qui fonctionneraient comme des laboratoires d’agencements témoignant d’une pratique architecturale politique redéfinissant le rôle même de l’architecte. Trois axes de recherche sont déployés. Le premier interroge la pertinence d’une pensée architecturale en termes d’agencements dans le contexte des transformations actuelles des territoires. À la suite d’un croisement avec la pensée de Deleuze et Guattari l’architecture se comprend dans son processus d’agencement et réagencement. Le second axe interroge la dimension biopolitique du Junkspace identifiant les points critiques de ses agencements et évaluant le paradoxe de l’entre-deux. Le troisième axe met à l’épreuve le potentiel des territoires entre-deux de créer des opportunités pour de nouvelles configurations spatiales.

Rem Koolhaas’s diagnostic of the modern metropolis shows a generic city with no end, no identity, no past, no streets where the only activity remaining is shopping and the « in-transit » condition is becoming universal. An important part is missing from this analysis: the biopolitical condition of the metropolis, that could explain a number of Junkspace’s characteristics, like the fact that it contains the possibility to resist the generic condition. In the light of this review and in accordance with the philosophical directions that Gilles Deleuze and Félix Guattari draw in A Thousand Plateaus, this research intends to identify the intervals witnessing the biopolitical dimension of Junkspace by rallying the assemblage theory as hypothesis for the architectural and urban theory. The general postulate is that these intervals are in-between territories functioning as laboratories of assemblages that show a political and resistant architectural practice redefining the very part of the architect. Three lines of research are deployed. The first one questions the relevance of an architectural assemblage thinking in the context of the current territorial transformations. Operating a crossing with Deleuze and Guattari’s thought, architecture is understood as a process of assembling and re-assembling. The second line of research is questioning the biopolitical dimension of…

Advisors/Committee Members: Younès, Chris (thesis director), Jacques, Carine (thesis director).

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Le XIXe siècle est, en général, qualifié comme le siècle des revues pour l’Europe et pour la Grèce en particulier, où on assiste à la naissance d’un bon nombre de revues, réalisées, pour la plupart à l’image des revues étrangères. A l’origine de la presse périodique, on employa le terme journal pour désigner un écrit qui s’imprimait tous les mois et contenait le compte rendu des nouveaux livres et de ce qui se passait de plus mémorable dans le milieu des lettres. Par la suite, le terme journal fut étendu à des publications périodiques qui étaient en même temps politiques et littéraires et qui s’imprimaient une fois par mois: c’étaient les Mercures. Les revues actuelles furent les descendantes des Mercures et leur nombre se multiplia fortement tout au long du XIXe siècle. C’est par la littérature et non pas par la politique que grandit la presse et, avant d’être une puissance politique, elle fut une puissance littéraire. [etc.]

Non communiqué

Advisors/Committee Members: Masson-Vincourt, Marie-Paule (thesis director).

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L’avènement de la microscopie STED (Stimulated Emission Depletion) a bouleversé le domaine desneurosciences du au fait que beaucoup de structures neuronale, tels que les épines dendritiques, lesaxones ou les processus astrocytaires, ne peuvent pas être correctement résolu en microscopiephotonique classique. La microscopie 2-photon est une technique d’imagerie photonique très largement utilisée dans le domaine des neurosciences car elle permet d’imager les événements dynamique en profondeur dans le tissu cérébral, offrant un excellent sectionnement optique et une meilleure profondeur de pénétration. Cependant, la résolution spatiale de cette approche est limitée autour de 0.5 μm, la rendant inappropriée pour étudier les détails morphologiques des neurones et synapses. Le but de mon travail de thèse était à A) développer un microscope qui permet d'améliorer l'imagerie 2-photon en la combinant avec la microscopie STED et B) démontrer son potentiel pour l'imagerie à l'échelle nanométrique de processus neuronaux dynamiques dans des tranches de cerveau aigus et in vivo. Le nouveau microscope permet d'obtenir une résolution spatiale latérale de ~ 50 nm à des profondeurs d'imagerie de ~ 50 μm dans du tissu cérébral vivant. Il fonctionne avec des fluorophores verts, y compris les protéines fluorescentes communes telles que la GFP et YFP, offrant le contraste de deux couleurs basé sur la détection spectrale et linéaire ‘unmixing’. S’agissant d’un microscope droit, utilisant un objectif à immersion ayant une grande distance de travail, nous avons pu incorporer des techniques électrophysiologiques comme patch-clamp et ajouter une plateforme pour l'imagerie in vivo. J’ai utilise ce nouveau microscope pour imager des processus neuronaux fins et leur dynamique à l’échelle nanométrique dans différent types de préparations et des régions différentes du cerveau. J’ai pu révéler des nouvelles caractéristiques morphologique des dendrites et épines. En outre, j'ai exploré différentes stratégies de marquage pour pouvoir utiliser la microscopie STED pour imager le trafic des protéines et de leur dynamique à l'échelle nanométrique dans des tranches de cerveau.

The advent of STED microscopy has created a lot of excitement in the field of neuroscience becausemany important neuronal structures, such as dendritic spines, axonal shafts or astroglial processes,cannot be properly resolved by regular light microscopy techniques. Two-photon fluorescence microscopy is a widely used imaging technique in neuroscience because it permits imaging dynamic events deep inside light-scattering brain tissue, providing high optical sectioning and depth penetration. However, the spatial resolution of this approach is limited to around half a micron, and hence is inadequate for revealing many morphological details of neurons and synapses. The aim of my PhD work was to A) develop a microscope that improves on two-photon imaging by combining it with STED microscopy and to B) demonstrate its potential for nanoscale imaging of dynamic neural processes in acute…

Advisors/Committee Members: Nägerl, Valentin (thesis director).

▼ This thesis explored significant other responses to CFS/ME in association with patient illness outcomes and symptom maintenance utilising a multi-method approach; a systematic review, cross-sectional, longitudinal and momentary methods were included. The review identified empirical evidence for two potential interpersonal mechanisms. The evidence suggested that significant other beliefs and responses, dyadic relationship quality, and patient outcomes associated with each mechanism were different. Dyadic belief incongruence was also highlighted as important with respect to relationship quality. Thus, potential research questions and current methodological limitations were identified; the subsequent empirical papers presented attempted to address these. The first empirical study (Chapter 3) utilised the Expressed Emotion (EE) framework to investigate the impact of critical comments and EOI; no cross-sectional associations between EE and patient outcomes were observed. A longitudinal design was also employed to examine the predictive validity of EE. Longitudinally, high critical comments predicted higher fatigue severity; further analyses indicated that depression mediated this relationship. High EOI was also predictive of higher fatigue severity at follow-up. This was the first study to examine EE within a CFS/ME sample; the longitudinal impact of high-EE upon patient outcomes suggests that it is a potentially beneficial target for future interventions. Paper 2 (Chapter 4) sought to examine the factors that might contribute to significant other EE by examining significant other illness beliefs and dyadic belief incongruence. The results indicated that significant others rated as high-EE had stronger illness models, more negative beliefs about the consequences associated with the condition, and negative emotional representations. These findings identify those beliefs that may be particularly important for high-EE within the current patient group. Overall dyadic belief incongruence was not important for EE-rating; high-EE dyads reported similar illness beliefs, whilst low-EE significant others reported more optimistic beliefs about the condition. These findings suggest that optimistic beliefs about the condition may be better for both significant other and patient outcomes. The final empirical study (Chapter 5) examined the associations between significant other negative and solicitous responses and fluctuations in patient illness outcomes on a momentary basis. The impact of significant other responses was largely transitory; changes in patient outcomes did not extend past the current momentary assessment. Negative significant other responses were associated with momentary increases in symptom severity; patient distress partially mediated this relationship. Patient-perceived solicitous responses were associated with increased activity limitation, but reduced disability reported at the same momentary assessment. These results suggest that momentary reports capture more dynamic processes than observed in traditional…

▼ This thesis explored significant other responses to CFS/ME in association with patient illness outcomes and symptom maintenance utilising a multi-method approach; a systematic review, cross-sectional, longitudinal and momentary methods were included. The review identified empirical evidence for two potential interpersonal mechanisms. The evidence suggested that significant other beliefs and responses, dyadic relationship quality, and patient outcomes associated with each mechanism were different. Dyadic belief incongruence was also highlighted as important with respect to relationship quality. Thus, potential research questions and current methodological limitations were identified; the subsequent empirical papers presented attempted to address these. The first empirical study (Chapter 3) utilised the Expressed Emotion (EE) framework to investigate the impact of critical comments and EOI; no cross-sectional associations between EE and patient outcomes were observed. A longitudinal design was also employed to examine the predictive validity of EE. Longitudinally, high critical comments predicted higher fatigue severity; further analyses indicated that depression mediated this relationship. High EOI was also predictive of higher fatigue severity at follow-up. This was the first study to examine EE within a CFS/ME sample; the longitudinal impact of high-EE upon patient outcomes suggests that it is a potentially beneficial target for future interventions. Paper 2 (Chapter 4) sought to examine the factors that might contribute to significant other EE by examining significant other illness beliefs and dyadic belief incongruence. The results indicated that significant others rated as high-EE had stronger illness models, more negative beliefs about the consequences associated with the condition, and negative emotional representations. These findings identify those beliefs that may be particularly important for high-EE within the current patient group. Overall dyadic belief incongruence was not important for EE-rating; high-EE dyads reported similar illness beliefs, whilst low-EE significant others reported more optimistic beliefs about the condition. These findings suggest that optimistic beliefs about the condition may be better for both significant other and patient outcomes. The final empirical study (Chapter 5) examined the associations between significant other negative and solicitous responses and fluctuations in patient illness outcomes on a momentary basis. The impact of significant other responses was largely transitory; changes in patient outcomes did not extend past the current momentary assessment. Negative significant other responses were associated with momentary increases in symptom severity; patient distress partially mediated this relationship. Patient-perceived solicitous responses were associated with increased activity limitation, but reduced disability reported at the same momentary assessment. These results suggest that momentary reports capture more dynamic processes than observed in traditional… Advisors/Committee Members: BARROWCLOUGH, CHRISTINE C, Barrowclough, Christine, Wearden, Alison.

▼ Researchers who utilize data from longitudinal surveys nearly always assume that respondents' attributes are not changed as a result of being measured. Yet research in cognitive psychology, political science, and elsewhere suggests that the experience of being interviewed can spark important changes in the way respondents behave, in the attitudes that they possess, and in their willingness or ability to answer questions accurately when they are re-interviewed in subsequent waves. In this dissertation, I evaluate the severity of this problem in longitudinal social science surveys. Using a combination of observational and experimental data, I show that "panel conditioning" has the potential to affect a wide range of attitudinal and behavioral measures, including many items that are commonly used in sociological and demographic research. The causal mechanisms that give rise to these effects are discussed and a large-scale follow-up project is proposed.

▼ As educational professionals strive to help students become efficient and effective learners, they must assist in the development of student learning strategies and a greater understanding of the learning process. The purpose of this study was to analyze and compare the learning pattern preferences of middle and high school students in general education and special education settings. The results of this study were intended to help guide teachers and other education professionals to make informed decisions about differentiating instruction in a way to reach more, if not all, students in their classroom. The results could furthermore assist educators in fostering greater self-knowledge and self-advocacy in students, which then can assist them to become active participants of their own learning experiences. Archival data was examined using scores of middle and high school students on the Learning Connections Inventory (LCI), the survey associated with the Let Me Learn Process®. 251 students LCI scores were studied on the basis of grade level and special education classification. Research questions utilized one-way MANOVA's in order to determine preference for particular individual patterns on the LCI. The first set of research questions compared students in special education and students in general education. The second set of questions compared students in special education broken down by classification, specifically, Other Health Impairment and Specific Learning Disability. Analyses revealed preference for certain LCI patterns between the groups examined. This study was intended to be a starting point for the analysis of the learning patterns of special education students. Once pattern preferences and the interactions between preferences are identified, and the utility of the Let Me Learn Process® is examined, a greater understanding of learning will occur in combination with the development of self-advocacy skills in the classroom. Overall, the Let Me Learn Process® has been shown to have promise in utilizing cognition, conation and affectation approaches in order to assist in developing effective learning strategies. As each of these elements is taken into consideration, this process can allow learners to become active participants in their own learning process. Advisors/Committee Members: Jeffrey Miller, Tammy Hughes, Elizabeth McCallum.

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Le thème principal de cette thèse est l'analyse de données du fond diffus cosmologique (CMB). En particulier, je présente une méthode, Bayesian Independent Analysis (BICA), qui effectue à la fois la séparation des composants et l'inférence du spectre de puissance du CMB. Je commence par présenter les principes de base du CMB et souligne la nécessité d'une modélisation robuste des erreurs au niveau de la carte. Puis je présente la principale source d'erreurs dans les produits du CMB, à savoir les avant-plans. La séparation des composants est une étape cruciale dans l'analyse de données de CMB. Je passe en revue plusieurs méthodes visant à nettoyer le CMB des avant-plans. Puis je présente BICA. La méthode est formulée dans le cadre bayésien aveugle. Il en résulte une inférence jointe de la carte de CMB et de son spectre de puissance. Ainsi, les erreurs sur la reconstruction comprennent les incertitudes dues à la présence d'avant-plans dans les données. En considérant des choix particuliers de prior et d'échantillonnage, je montre comment la formulation bayésienne de séparation des composantes fournit un cadre unificateur dont les méthodes précédentes sont des cas particuliers. Je présente les résultats de BICA lorsqu'elle est appliquée sur des données simulées et les données Planck. Cette méthode est capable de reconstruire la carte du CMB et son spectre sur une large fraction du ciel. Les principales contributions de cette thèse sont : 1) un spectre de puissance du CMB dont les erreurs prennent en compte la présence d'avant-plans mais sans modèle physique, 2) une carte CMB avec un modèle d'erreur incluant à la fois le bruit et avant-plans.

The main topic of this thesis is the analysis of Cosmic Microwave Background (CMB) data. In particular, I present a method, Bayesian Independent component analysis (BICA), that performs both CMB component separation and CMB power spectrum inference.I begin by presenting the basics of our understanding of the CMB emission and highlight the need for a robust error modelling at the map level. Then I present the main source of errors in the CMB products, namely the foregrounds.Component separation is a crucial and delicate step in CMB data analysis. I review several methods aiming at cleaning the CMB from foregroundsThen I present BICA. The method is formulated in a blind Bayesian framework. The posterior distribution provides an inference of the CMB map and power spectrum from the observation maps. Thus, the errors on the reconstruction include the uncertainties due the presence of foregrounds in the data. By considering particular choices of prior and sampling scheme, I show how the Bayesian formulation of component separation provide a unifying framework of which previous methods are special cases.I present the results of BICA when applied on both simulated data and 2013 Planck data. This method is able to reconstruct the CMB map and power spectrum on a large fraction of the sky. The main contributions of this thesis is to provide: 1) a CMB power spectrum on a large multipole…

Advisors/Committee Members: Wandelt, Benjamin (thesis director).

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Les pétroglyphes de l’Âge du Bronze (1500-500 BC) en Suède se situent essentiellement au Bohuslän. Les résultats précédents portaient généralement sur l’identification et l’interprétation des items et des scènes. D’autres éléments comme le regroupement des cupules, la position des bateaux, la pente et l’orientation des dalles ne sont généralement pas traités. Nous avons utilisé un corpus déjà existant, constitué de 300 relevés de sites d’une petite région du Bohuslän englobant trois petites villes Kville, Bottna et Svenneby. Les données sont traitées par des analyses statistiques exploratoires multidimensionnelles. Les résultats apportent tout d’abord des signatures particulières pour chaque site e.g. Bottna présente un caractère marin, Kville est riche en anthropomorphes mais pauvre en bateaux et Svenneby est particulièrement riche en bateaux avec des hommes à leur bord. Ils montrent ensuite la nécessité de distinguer différentes représentations d’un même item. Par exemple la subdivision de l’item « bateaux » en 5 types permet d’établir que Bottna est riche en deux types de bateaux caractéristiques de deux périodes de l’Âge du Bronze, Svenneby particulièrement peu dense est lui riche en bateaux d’une autre époque. De plus, le regroupement des cupules (en matrice, groupe, ligne ou cupules isolées) montre des particularités liées aux sites dont il accentue la différenciation. La notion de « certitude raisonnable » avec la probabilité d’erreur renforce la validité des conclusions. Par ailleurs, une étude numérique sur l’inclinaison des bateaux montre qu’ils sont très généralement en position horizontale et suggère qu’ils ont probablement été gravés tout près du rivage.

Swedish Bronze Age rock carvings (1500-500 BC) are primarily located in Bohuslän. Previous research generally consisted in identifying and interpreting both items and scenes. Other aspects such as cup marks clusters, boats position, slope and panels orientation have been largely ignored. This thesis relies on a pre-existing corpus of 300 panels from a small region of Bohuslän including three small towns Kville, Bottna and Svenneby. Individual items were analyzed using Principal Component Analysis. We first identify specificities for each site, e.g. marine focus in Bottna, numerous anthropomorphic figures in Kville but with few boats, low density of artifacts in Svenneby but many figures onboard boats. We then demonstrate the importance of distinguishing between different forms of given items. For example, when boats are classified into five different types, Bottna appears to be featuring two of these five types, namely the two types attributed to two periods of Bronze Age. Relying on the same classification, Svenneby that generally has a low density of artifacts, is characterized by boats attributed to another period. In addition, the analysis of different cup marks clustering (matrix, group, line or isolated) enables us to identify more precise specificities for site differentiation. We also introduce the concept of “reasonable certainty” to indicate…

Advisors/Committee Members: Maillefer, Jean-Marie (thesis director).

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A la quantité limitée de l’eau disponible au Liban, vient s’ajouter un nouveau problème, la dégradation de la qualité des eaux superficielles menacées continuellement par la pollution et la salinisation. Les utilisations agricoles et industrielles et l’augmentation de la population génèrent des pollutions des cours d'eau qui posent des problèmes environnementaux et sanitaires. Afin de limiter et d'anticiper ces pollutions, il est nécessaire de disposer de méthodes d'évaluation des effets des systèmes de culture sur la pollution des eaux de rivière. Pour cela, nous avons sélectionné la rivière Litani qui est la plus longue rivière et la plus importante au Liban, sur laquelle deux dispositifs de suivis ont été mis en œuvre entre 2010 et 2013. En raison de l'absence de données sur la qualité de l'eau, nous proposons dans cette étude de vérifier les paramètres de pollution du bassin supérieur qui constitue la majorité de surface du bassin. L’objectif de ce projet est de réaliser une étude prospective sur la qualité de la ressource en eau du bassin supérieur du Litani en incluant le lac de Qarraoun, de comprendre la relation entre la recharge et la consommation d’eau et, si pertinent, de proposer des solutions pour une meilleure gestion des eaux polluées. L'étude porte sur l'interprétation des sources de pollution en mesurant de nombreux paramètres physicochimiques (pH, T °, TDS, Ec), chimiques (Na, Ca2, Mg2, Cl-, SO2-4, NH3, NO-3, PO2-4, K, DBO5 et DCO), les métaux lourds (Fe, Ni, Zn, Cu, Cr, Al, Ba, Pb, Mn) et des paramètres microbiologiques de l'eau et les sédiments de la partie supérieure du bassin Litani et dans le lac. Des échantillons ont été prélevés au cours des trois saisons d’hiver (Février), du printemps (mai) et d’été (Septembre) en 2010-2013. Les analyses microbiologiques et physico-chimiques sont effectuées en conformité avec les méthodes standards européennes et méthode standard (OMS). Des méthodes statistiques multi-variées (analyse hiérarchique de la concentration : HAC, et de l'analyse en composantes principales : PCA) et la corrélation de Pearson ont ensuite été appliquées pour déterminer l'influence des polluants dans le lac et la rivière

Lebanon has abundant water, but its river is polluted. The Litani River is the largest one, draining from north to south in the central core of the country (Bekaa Valley) before turning west to the sea. It crosses down a rather deep valley and passes by several urban agglomerations and industrial zones, which use its water as a discharge system of their waste. This study shows the impact of the anthropic activities on the water quality of this river. Physical (pH, T°, TDS, Ec), chemical (Na+, Ca2+, Mg2+, Cl?, SO2?4, NH3+, NO?3, PO2?4, K+, BOD5 and COD), heavy metals (Fe, Ni, Zn, Cu, Cr, Al, Ba, Pb, Mn) and microbiological parameters of water quality assessment and sediment for the Upper Litani River Basin was performed. They were investigated during three seasons of rainy, mid-rainy spring and wet season, during the years 2010-2013 to determine correlation between…

Advisors/Committee Members: Villiéras, Frédéric (thesis director), Toufaily, Joumana (thesis director).

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Cette thèse porte sur la conception de méthodes de surveillance de système à partir de données collectées sur des composants de conceptions identiques exploités par plusieurs processus. Nous nous sommes intéressés aux approches de diagnostic sans modèle a priori et plus particulièrement à l'élaboration des modèles de bon fonctionnement des composants à partir des données collectées sur le parc. Nous avons ainsi abordé ce problème comme un problème d'apprentissage multi-tâches qui consiste à élaborer conjointement les modèles de chaque composant, l'hypothèse sous-jacente étant que ces modèles partagent des parties communes. Dans le deuxième chapitre, on considère, dans un premier temps, des modèles linéaires de type multi-entrées/mono-sortie, ayant des structures a priori connues. Dans une première approche, après une phase d'analyse des modèles obtenus par régression linéaire pour les machines prises indépendamment les unes des autres, on identifie leurs parties communes, puis on procède à une nouvelle estimation des coefficients des modèles pour tenir compte des parties communes. Dans une seconde approche, on identifie simultanément les coefficients des modèles ainsi que leurs parties communes. Dans un deuxième temps, on cherche à obtenir directement les relations de redondance existant entre les variables mesurées par l'ACP. On s'affranchit alors des hypothèses sur la connaissance des structures des modèles et on prend en compte la présence d'erreurs sur l'ensemble des variables. Dans un troisième chapitre, une étude de la discernabilité des modèles est réalisée. Il s'agit de déterminer les domaines de variation des variables d'entrée garantissant la discernabilité des sorties des modèles. Ce problème d'inversion ensembliste est résolu soit en utilisant des pavés circonscrits aux différents domaines soit une approximation par pavage de ces domaines. Finalement, une application des approches proposées est réalisée sur des simulateurs d'échangeurs thermiques

This thesis deals with the conception of diagnosis systems using the data collected on identical machines working under different conditions. We are interested in the fault diagnosis method without a priori model and in modelling a fleet of machines using the data collected on all the machines. Hence, the problem can be formulated as a multi-task learning problem where models of the different machines are constructed simultaneously. These models are supposed to share some common parts. In the second chapter, we first consider linear models of type multiple-input/single-output. A first approach consists in analyzing the linear regression models generated using the data of each machine independently from the others in order to identify their common parts. Using this knowledge, new models for the machines are generated. The second approach consists in identifying simultaneously the coefficients of the models and their common parts. Secondly, the redundancy models are searched for using PCA. This way, no hypothesis on the knowledge of the structures of models…

Advisors/Committee Members: Ragot, José (thesis director), Mourot, Gilles (thesis director).

▼ L'analyse de données d'expression montre qu'il est avantageux d'analyser les processus biologiques en termes de modules plutôt que simplement considérer les gènes un par un. Dans ce projet nous avons conduit une analyse non supervisée des données d'expression de gènes de plusieurs cohortes de tumeurs urothéliales en appliquant la méthode d'Analyse en Composantes Indépendantes. Plusieurs études ont démontré les meilleures performances de l'ACI par rapport à l'ACP et les méthodes de clustering, pour obtenir une décomposition plus réaliste des données d'expression en patterns d'expression pertinents et associés avec le phénotype d'intérêt.Les tumeurs urothéliales apparaissent et évoluent selon deux voies distinctes dont la probabilité de progression en cancer musculo-invasif diffère radicalement. Excepté la mutation de FGFR3 dans le groupe le moins agressif, les processus moléculaires sous-jacents n'ont pas été complètement identifiés. Le principal objectif de cette thèse était dédié aux interprétations biologiques des différentes composantes indépendantes pour aider à confirmer et étendre la liste des processus biologiques connus pour être impliqués dans le cancer de vessie.Chaque composante indépendante est caractérisée par une liste de projections de gènes et de contributions pondérées d'échantillons tumoraux . En combinant expertise biologique et comparaison des listes de gènes à des voies existantes et en étudiant conjointement l'association des composantes aux annotations cliniques et moléculaires, nous avons pu différencier les CIscausées par des facteurs techniques, tels que le prélèvement chirurgical de celles ayant des interprétations biologiques pertinentes. De plus, parmi les signaux pertinents biologiquement, cette analyse nous a permis de différencier les signaux provenant du stroma, comme la réponse immunitaire médiée par les lymphocytesB&T, de ceux produits par les tumeurs elles-mêmes, comme les signaux reliés à la prolifération ou à la différenciation. La classification des tumeurs selon leurs contributions à certaines CIs a pu être étroitement associée à des annotations anatomo-cliniques, et a mis en évidence de nouveaux sous-types de tumeur spotentiels, qui suggèrent l'existence de voies de progression supplémentaires dans le cancer de vessie. De façon similaire, l'étude des contributions de groupes de tumeurs basés sur des annotations cliniques ou moléculaires a montré différents niveaux de contamination par le stroma entre les tumeurs mutées et nonmutées pour FGFR3. La reproductibilité des composantes a été étudiée en utilisant des graphes de corrélation. La majeure partie des CIs interprétées a été validée sur trois jeux de données indépendants, et plusieurs d'entre elles ont aussi détectées dans un jeu de données de lignées cellulaires.Une deuxième étude sur le rétinoblastome a montré que nous pouvions tirer partie de l'ACI dans des contextes variés. Le rétinoblastome est initié par la perte des deux alléles du gène suppresseur de tumeur RB1. D'autres évènements génomiques non identifiés sont… Advisors/Committee Members: Radvanyi, François (thesis director).

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La recherche porte sur les collectifs sectaires contemporains et la participation psychique singulière de l’adepte au sein du collectif. Après avoir déconstruit l’idée de manipulation mentale et d’une emprise transitive du gourou à l’égard de l’adepte, nous interrogeons, par la rencontre clinique (d’adeptes et d’ex-adeptes) et le paradigme du transfert qui s’en déduit, les enjeux psychiques du lien sectaire de l’adepte. Nous soutenons que la notion d’adepte, empruntée à la sociologie des religions, est impropre à indexer avec justesse une spécificité psychique du vécu d’emprise. En réponse aux approches psycho-victimologiques, les conditions de possibilité d’un discours non traumatique sont également explorées dans les rapports du sujet de l’individu avec le sujet du collectif. La thèse vise in fine l’écriture logique de la (ou des) discursivité(s) sectaire(s).

This research is about contemporary cults and the singular psychological involvement of the cult follower. After having deconstructed the notion of mind manipulation and the idea of a transitive control of the guru toward his/her follower, the author examines the psychological issue of the cult social link, by means of clinical encounters (with current or former followers) and within the paradigm of transference. The author shows that the notion of “cult follower”, which is borrowed from the sociology of religions, is inappropriate to indicate accurately the psychological specificity of the cult experience. In response to the victimological approaches, the conditions of possibility of a non-traumatic discourse are investigated within the relations between the individual subject and the collective subject. In fine, the thesis aims at the writing of the inherent logic of the cult discursivity(ies).

Advisors/Committee Members: Cabassut, Jacques (thesis director).

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Plusieurs études ont rapporté l’influence de la pression d’hydrogène, plus précisément la concentration réelle en hydrogène dissous dans le milieu réactionnel, sur l’énantiosélectivité des réactions d’hydrogénations catalytiques intervenant des catalyseurs à base de rhodium. Cependant, l’identification de l’étape ou les étapes enantiodéterminantes ou limitantes ainsi que l’explication de l’effet de la pression d’hydrogène sur cet étape, exigent la détermination des constantes cinétiques de chaque étape élémentaire. Ce projet de recherche vise une telle détermination en combinant deux études expérimentale et théorique. Dans un premier temps, un système catalytique présentant deux effets opposés de la pression de l’hydrogène en fonction de la nature du substrat, a été identifié : un effet néfaste avec le M-acrylate (MAA) et un effet bénéfique avec l’E-emap. Ensuite, deux études ont été menées sur les réactions d’hydrogénation de ces deux substrats par le Rh(I) /(R,R)-Me-BPE. L’étude cinétique expérimentale est basée sur le modèle cinétique proposé par Halpern dans le but d’estimer les paramètres cinétiques des différentes étapes élémentaires, alors que celle théorique consiste à étudier les différents chemins réactionnels possibles par calcul DFT en utilisant le logiciel de modélisation Gaussian 03. L’exploitation des résultats obtenus a permis de revisiter les concepts clés de la catalyse d’hydrogénation asymétrique et de mener une discussion par rapport à la fiabilité des méthodes théoriques à prévoir l’expérience.

Several studies brought back the influence of the hydrogen pressure, more precisely the real hydrogen concentration dissolved in solution, on the enantioselectivity of the catalytic asymmetric hydrogenation for rhodium based catalysts. However to identify the enantiodetermining step(s), and to gain some further understanding on the hydrogen pressure-enantioselectivity relationship, the determination of the kinetic constants is required. We have thus embarked a project aiming such determination by coupling experimental work and theoretical chemistry. Two studies were undertaken on the asymmetric hydrogenation of both substrates by the Rh (I)/ (R,R)-Me-bpe catalyst. The experimental kinetic work study is based on the kinetic model suggested by Halpern in order to estimate the parameters kinetic of each elementary step, whereas that theoretical, consists in studying the various possible pathways by DFT calculation using the software of modelling Gaussian 03. The analysis of the obtained results made it possible to revisit the concepts’ key of the catalytic asymmetric hydrogenation and to hold a discussion about the reliability of the theoretical methods to envisage the experiment.

Advisors/Committee Members: Delbecq, Françoise (thesis director), Bellefon, Claude de (thesis director).

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Ce travail tente de dégager le rôle de la représentation du délire dans la transformation du genre romanesque en Europe entre les années 1920 et les années 1940. L’étude s’intéresse donc aux crises d’hallucination et de délire qui ponctuent la narration dans plusieurs grands romans de langues anglaise [le chapitre 15 d’Ulysse de James Joyce et Mrs Dalloway de Virginia Woolf], allemande [Die Blendung d’Elias Canetti, Berlin Alexanderplatz d’Alfred Döblin et Le Loup des steppes de Hermann Hesse] et française [Voyage au bout de la nuit, Mort à crédit, Guignol’s band de Louis-Ferdinand Céline et Moravagine de Blaise Cendrars]. Si le délire romanesque est un enjeu dans ces années, c’est que son identification pose problème : les limites entre le réel et le délire sont en effet souvent brouillées. Dans certains romans, la prolifération du délire est telle qu’elle peut faire vaciller l’ensemble de la narration, le récit pouvant être interprété dans sa globalité comme le fruit d’un délire. Cette transformation n’est pas sans lien avec la révolution du champ de la psychopathologie qui bouleverse l’époque : les romanciers connaissent souvent assez bien les modes d’observation psychiatrique et s’intéressent de près à la psychanalyse, déjà très reconnue. Reste que le délire romanesque se dérobe aux lectures médicales : composé d’éléments hétérogènes et parfois impossibles, obéissant à des changements imprévisibles et déroutants, il échappe à une logique strictement individuelle, et ouvre à une représentation des troubles de l’époque. Introduisant une brèche dans la frontière entre fiction et réalité, il devient un espace politique où le roman s’interroge sur ses propres pouvoirs.

This study highlights the role of the representation of delirium in the transformation of the European novel between the 1920s and the 1940s. Of central importance are the hallucinatory and delirious episodes that punctuate the narration in several major novels in English [chapter 15 of Ulysses of James Joyce and Mrs Dalloway of Virginia Woolf], German [Die Blendung of Elias Canetti, Berlin Alexanderplatz of Alfred Döblin and Steppenwolf of Hermann Hesse] and French [Journey to the end of night, Death on the installment plan, Guignol’s band of Louis-Ferdinand Céline and Moravagine of Blaise Cendrars]. Delirium is an issue in these years because it can no longer be easily defined: the line between reality and delirium has become blurred. In some novels, the proliferation of delirium is so prevalent that it destabilizes the narration itself, inviting the reader to interpret the whole story as the result of delirium. This transformation is doubtless linked to the revolution of psychopathology that deeply affects the period: the novelists know, often well, the methods of psychiatric observation and follow closely psychoanalysis, which by this time was well established. But fictional delirium eludes purely medical readings: composed of heterogeneous and sometimes impossible elements, submitted to unpredictable and puzzling changes, it resists a singular…

Advisors/Committee Members: Morel, Jean-Pierre (thesis director).

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L’objectif de ce travail a porté sur l’élaboration d’une sonde bimodale ADP–TEP (absorption à deux photons–tomographie par emission de positons) pour des applications en imagerie médicale.Dans un premier temps, le projet a consisté en le design, la synthèse et l’évaluation des propriétés photophysiques d’une nouvelle série de chromophores diaziniques A–p–D (A : groupement électro-attracteur, p : lien conjugué, D : groupement électro-donneur). Des études de relation structure-propriétés photophysiques impliquant des modulations sur chacune des sous-structures (groupements A et D, lien p-conjugué) ont été réalisées puis étudiées en UV et en fluorescence. Suite à l’obtention de ces premiers résultats, des mesures d’absorption à deux photons ont été effectuées sur ces fluorophores.Dans un second temps, les fluorophores ont été modifiés afin de greffer des parties hydrophiles. Des propriétés photophysiques encourageantes ont été obtenues et des premiers tests en imagerie bi-photonique ont été réalisés.L’insertion du fluor radiomarqué est envisagée via l’insertion d’un groupement –BF2. Pour cela des structures chélatantes, « mimes de BODIPY », incorporant une pyrimidine ou un triazole ont été élaborées. Des premiers essais ont été conduits mais n’ont pas permis l’obtention des composés borés correspondants.

The purpose of this subject has been the synthesis of a bimodal probe using TPA–PET techniques for a potential application in biological imaging.In this context, we have synthesized a new range of A–π –D fluorophores incorporating diazine (p-deficient heterocycle) as electron-withdrawing moiety, N,N-dimethylaniline as electron-donating part and fluorene as p-conjugated linker. In order to increase the conjugation along the scaffold, ethynyl and/or triazole bridges have been introduced on both sides of the fluorene. The UV/Vis and photoluminescence properties have been measured. Further to those results two-photon absorption cross-section of our fluorophores (dTPA) has been obtained. Following these promising results, hydrophilic compounds using PEG groups have been prepared and photoluminescence properties have been carried out. In order to use the boron center as a site for radiofluorination, the synthesis of "BODIPY-like" probes has been considered. A new series of pyrimidine and triazole ligand have been synthesized but the corresponding boron complexes haven’t been obtained.

Advisors/Committee Members: Ramondenc, Yvan (thesis director), Baudequin, Christine (thesis director).

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L’apparition de robots de service de plus en plus complexes ouvre de nouvelles perspectives quant aux tâches de manipulation d’objets. Malgré les progrès récents des techniques de planification de mouvement, peu d'entre elles s'intéressent directement à des systèmes multi-bras comme les torses humanoïdes. Notre contribution à travers cette thèse porte sur trois aspects. Nous proposons une technique de planification de mouvement performante basée sur la coordination des mouvements du système multi-bras. Elle exploite au mieux la structure du système en la divisant en parties élémentaires dont les mouvements sont planifiés indépendamment du reste du système. La fusion des différents réseaux élémentaires générés est ensuite réalisée dans le but d’obtenir un graphe prenant en compte le robot tout entier. Une seconde contribution porte sur l'extension des méthodes de planification pour des robots présentant des chaînes cinématiques fermées. Ces boucles cinématiques apparaissent dans le système lorsque, par exemple, le torse humanoïde saisit un objet avec plusieurs bras. Cette méthode traite explicitement les configurations singulières des manipulateurs, offrant ainsi une meilleure maniabilité de l’objet. Finalement, nous proposons deux approches pour la planification de tâches de manipulation d'objets par un torse humanoïde. La première concerne la résolution d’une tâche de prise et pose d'objets par un torse humanoïde à deux bras dans le cas où les contraintes imposées par la tâche nécessitent le passage par une double prise afin de transférer l'objet d'une main à l'autre. La seconde porte sur la résolution du même type de tâche par un manipulateur mobile. La thèse, effectuée dans le cadre du projet européen Phriends, présente les résultats d'expérimentations réalisées sur le robot Justin, démonstrateur du projet.

The emergence of new more and more complex service robots opens new research fields on objet manipulation. Despite the recent progresses in motion planning techniques, few of them deal directly with multi-arm systems like humanoid torsos. Our contribution through this thesis focuses on three aspects. We present an efficient motion planning technique based on the multi-arm system motion coordination. It takes advantage of the system's structure by dividing it into elementary parts of which movements are planned independently of the rest of the system. Generated elementary networks are then fused to obtain a roadmap that takes into account the whole robot. The second contribution consists of the extension of motion planning methods for a robot under loop closure constraints. These kinematic loops appear in the system when, for example, the humanoid torso grasps an objet with two arms. This method treats explicitly the singular configurations of the manipulators, providing better handling of the object. Finally, we present two approaches for planning object manipulation tasks by humanoid torsos. The first concerns solving pick and place task by humanoid torso where the imposed task constraints require a passage…

Advisors/Committee Members: Siméon, Thierry (thesis director).

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Alors que les travaux historiens existants portant sur la médecine de la France de l’Entre-deux-guerres sont essentiellement tournés vers le réel, les objets, les institutions, cette thèse a choisi d’étudier cette médecine en en caractérisant les représentations. Les représentations de ce qu’est une activité, un domaine en sont en effet constitutives. En rendre compte implique donc d’en saisir aussi les représentations. C’est ce à quoi s’est attelée cette thèse pour la médecine de l’Entre-deux-guerres qui, par là, se veut une contribution originale à l’historiographie existante. Pour retrouver et analyser ces représentations, le choix a été fait d’analyser des revues de vulgarisation qui ont la propriété d’avoir été très peu étudiées alors même que ce sont des média encore très présents dans la France de l’Entre-deux-guerres. Une analyse comparée de grande ampleur portant sur sept revues, qui ont été retenues en fonction des publics qu’elles visaient, a été construite et mise en œuvre. Deux revues de vulgarisation scientifique populaire, deux revues de haute vulgarisation scientifique, deux revues politiques et littéraires et une revue professionnelle médicale ont été analysées suivant une approche qualitative qui permette la prise en charge et la comparaison de ces revues très diverses par leurs formats, leurs contenus, leurs auteurs et les publics visés. Cette approche a notamment pour caractéristique l’adaptation aux particularités de chaque revue et de porter une attention particulière à leur matérialité (illustrations, mises en page, signatures). Au-delà d’une diversité de représentations – les représentations dégagées sont parfois portées par plusieurs revues, parfois spécifiques à l’une d’elles – se dessine l’image d’une médecine puissante, variée et inventive, dont la puissance est assurée grâce aux sciences physiques et au recours à une Nature maîtrisée voire artificialisée. L’image du patient est celle d’un patient infantilisé et de facto ignorant qui a besoin en tout instant de l’expertise ou du savoir du médecin qui peut par ses soins permettre aux corps de la Nation de retrouver leurs santés physique et mentale, et à la Nation de redevenir ainsi économiquement prospère. Au-delà de sa contribution à l’histoire de la médecine de l’Entre-deux-guerres, en dégageant des discours et des modalités d’administration de la preuve spécifiques à certaines revues ou groupes de revues, la thèse apporte aussi des éléments à l’histoire de chacune des revues et à l’histoire des revues de vulgarisation de la France de l’Entre-deux-guerres.

While existing historical scholarship on Interwar medicine in France has mainly questioned the reality, the objects and the institutions, this thesis chose to study it by characterizing its representations. Representations of an activity or a domain are indeed constitutive of this activity or this domain. Therefore accounting for an activity or a domain implies to also grasp its representations. This is what this thesis is seeking to do for the Interwar medicine. By so doing it aims…

Advisors/Committee Members: Gispert, Hélène (thesis director), Jas, Nathalie (thesis director).

▼ Characterization of thin films is critical to the understanding of many technological and biological processes. The focus of this dissertation is to develop methods to characterize very low concentration species present on surfaces. A reflection adsorption infrared spectroscopy: RAIRS) system was constructed and tested. The instrument comprises an Fourier transform infrared: FTIR) spectrometer, an optical pathway and a vacuum chamber. The RAIRS system is designed to investigate in situ the interaction of vapor-deposited metals and gases, such as CVD precursors, with organic thin films, and so a vacuum chamber is required. To accommodate the vacuum chamber, an external IR optical pathway was designed and assembled because there was not enough room in the internal optical pathway of the FTIR spectrometer. The synthesis and characterization of terminal alkyne monolayers: TAMs) adsorbed on gold was investigated by RAIRS, single wavelength ellipsometry, time-of-flight secondary ion mass spectrometry: TOF SIMS) and x-ray photoelectron spectroscopy: XPS). TAMs have the potential to transform surface functionalization for many technological applications because they have increased temperature stability and electrical conductance. However, the data suggest that TAMs are not well-ordered and can be oxidized, which may limit their application. For TAMs with less than 11 methylene units in the backbone, the adsorbed layer is highly disordered, oxidized and has a multilayer structure. Longer chain length TAMs form disordered monolayers on gold. As the methylene chain length increases, the conformational order of the TAMs increases with the alkynes in an upright conformation and bound to the surface via a Au-C¡ÕC- bond. The use of room temperature ionic liquids: ILs) as matrices in TOF SIMS was examined to further characterize biological thin films. The data indicate that the secondary ion intensities of lipids, steroids, peptides, proteins and proteins are significantly enhanced using IL matrices. Secondary ion enhancements of at least an order of magnitude are typically observed. Limits of detection are also greatly improved. For example, the limits of detection of 1,2-dipalmityl-sn-glycero-phosphocholine: DPPC) and 1,2-dipalmityl-sn-glycero-phosphoethanolamine: DPPE) were at least two orders of magnitude better. The data also show that ILs are suitable matrices for imaging SIMS. The IL matrices did not cause changes to the sample surface; no ¡°hot spots¡± were observed. The mechanism of the secondary ion intensity enhancements using IL matrices was then investigated to optimize use in characterization. Only protic ILs, which are formed by the transfer of a proton from a Br©ªnsted acid to base, were observed to increase analyte signals. The matrix enhancement mechanism therefore involves the transfer of protons from, or to, the analyte, to, or from the matrix. The magnitude of the analyte signal enhancements is dependent on the chemistry of the matrix cation, anion and analyte. The pKa of the matrix acid and base do not… Advisors/Committee Members: Amy Walker.

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Pourquoi proposons-nous ce titre ? Pourquoi une telle entrée « Le Moi et l’Autre » dans la poésie ? Comment peut-on s’interroger sur les représentations du Moi et de l’Autre à travers des poèmes antéislamiques ? En quoi, les Mu‘allaqât nous offrent-elles un espace de lecture du Moi et de l’Autre ? Cette étude ouvre en quelque sorte un pan entier de la poésie et de la compréhension des univers symboliques et psychosociaux qu’elle véhicule. Dans un souci d’explorer de nouvelles approches de l’analyse des textes littéraires, nous considérons que la poésie antéislamique constitue un puits inépuisable pour comprendre les phénomènes liés à la construction de l’identité et à la rencontre avec l’Autre. Cette thèse s’intéresse à ce que peut nous révéler tout texte poétique, à savoir un symbolisme fertile, un univers sociologique et un imaginaire social.

Whence this title "The Self and the Other", why such an introduction to poetry? How can the representations of the Self and of the Other be explored in ante-islamic poems? In what ways do the Mu‘allaqât offer a place for interpreting the Self and the Other? This study opens up, as it were, a whole aspect of poetry and of the understanding of the symbolical and psycho-social worlds it vehicles. In the effort to experiment new approaches in the analysis of literary texts, it considers ante-islamic poetry as an inexhaustible resource to understand events related to the construction of the Self and to the encounter with the Other. This thesis is concerned with what any poetic text may reveal to us, namely a fertile symbolism, a sociological universe and a social imaginative world.

Advisors/Committee Members: Cheikh-Moussa, Abdallah (thesis director).

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Le cinéma d’Atom Egoyan présente la particularité d’être difficilement classable, par son obstination à maintenir son caractère "fermé", sans craindre d’explorer ses possibilités dans des champs cinématographiques divers. Le sentiment de perte de sens, qui traverse l’organisation de son œuvre, semble jouer le rôle le plus important quant à la réception de ses films. La recherche essaye de commenter son univers filmique captivant, préférant l’examiner par l’autre côté, là où il se tait et se cache, tout en empêchant la lecture lucide d’une analyse filmique. Se fondant d’abord sur le rôle capital du découpage, nous essayons de comprendre comment le cinéaste canadien bâtit son univers aporétique, à l’aide de toute sorte de figure de juxtaposition. Essayer d’assimiler la construction d’un tel univers d’observer comment les personnages, finalement, y vivent. Lutter contre l’inquiétude, qui touche parfois même la terreur, équivaut, chez Egoyan à la lutte de ses personnages contre le découpage. La perte de sens, ne pourrait qu’être le résultat d’une vérité filmique désarmée.

Atom Egoyan’s cinema is special in that it is not easily classifiable, since it manages to retain its ‘closed’ character while, at the same time, not afraid to explore its potential in various cinematic fields. The organization of his work is permeated by the sense of losing ‘sense’, which is a characteristic of modernism, and seems to be playing an important role in the way his films are shot. This research attempts to comment on his fascinating cinematic universe, daring to examine its other side, the one which, as it remains hidden and silent, resists straightforward filmic analysis. Based on the predominant role of decoupage in his films, we attempt to understand how the Canadian director constructs his paradoxical universe, employing all kinds of juxtapositional forms. Attempting to assimilate the construction of such a universe can have but one objective, and that is to observe how its characters inhabit it. Toiling against anxiety which sometimes borders on terror is equivalent in Egoyan’s work with the struggle of his characters against decoupage. The loss of ‘sense’ is nothing if not the result of a disarmed cinematic truth.

Advisors/Committee Members: Gagnebin, Murielle (thesis director).

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A travers l’analyse de huit pièces de théâtre se déroulant dans des no man’s lands urbains et que nous réunissons sous ce que Jean-Pierre Sarrazac appelle « la dramaturgie du no man’s land », nous tentons de montrer comment le drame moderne et contemporain continue à se réinventer par l’adoption d’autres modèles dramaturgiques. Notre recherche s’applique surtout à l’un de ses modèles, celui de la performance. Comme le dit Jacques Derrida à propos de la déconstruction, pour les auteurs de ces pièces, il s’agit aussi par la représentation du no man’s land urbain de «penser à partir de ce passage, à la limite, à un ailleurs-ici »1. Ce non-lieu hétérotopique leur permet à la fois de penser la violence du monde tout en continuant à expérimenter de nouvelles formes du drame.En se situant sur cette ligne, sur cette frontière, « dans un ailleurs de certitudes »2, ces auteurs donnent cours à un drame qui, succédant à la catastrophe de la deuxième guerre mondiale, à la chute des utopies de gauche et à l’accroissement affolé du capital, ne cherche pas à donner de réponses à la manière du théâtre brechtien, mais à soulever des questions. Par cette déconstruction et par l’adoption des éléments performatifs dans le traitement du temps, de l’espace et de la présence de l’auteur et du personnage, ces auteurs, Harold Pinter, Botho Strauss, Bernard-Marie Koltès, Edward Bond, Rodrigo Garcia, Tim Etchells, Victor Viviescas et Carolina Vivas, mettent le spectateur en relation directe avec la scène de cette cruauté annoncée par Artaud qui ne se limite pas à une imitation mais est aussi une expérience au présent : celle du vide.

By analyzing eight plays taking place in urban no-man’s-lands, which we have grouped under the heading of what Jean-Pierre Sarrazac calls “no-man’s-land dramaturgy,” we attempt to show how modern and contemporary drama continues to reinvent itself through the adoption of other dramaturgic models. Our research is applied especially to one of these models – performance art. As Jacques Derrida says in regards to deconstruction, the authors of these plays, too, «think about this passage onward, about a limit, about an elsewhere-here-and-now»3 by the representation of an urban no-man’s-land. This heterotopian non-place allows them to reflect on the violence of the world even as they experiment with new forms of drama.By going out on that edge, that border, out to «an elsewhere of certitudes»4 these authors set in motion a drama which, coming as it does after the catastrophe of the second world war, after the fall of leftist utopias, on the heels of madly spiraling capital, seeks to pose questions rather than provide answers in a Brechtian sense. Through this deconstruction and by the now adoption of performative elements in the treatment of time, space and presence of the author and of the character, authors Harold Pinter, Botho Strauss, Bernard-Marie Koltès, Edward Bond, Rodrigo Garcia, Tim Etchells, Victor Viviescas and Carolina Vivas put the audience directly in touch with the cruelty foretold by Artaud, which…

Advisors/Committee Members: Danan, Joseph (thesis director).

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Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste qui est caractérisée par son ubiquité et sa grande capacité adaptative. Cette faculté lui est notamment permise par de nombreux systèmes de perception et de régulation, la sécrétion d'un large arsenal d'exoprotéines, une capacité à alterner entre deux modes de vie, une haute résistance naturelle aux antibiotiques ainsi qu'un génome riche soumis à une importante plasticité génomique. Cette dernière, associée aux pressions de sélection exercées par la grande diversité d'environnements rencontrés par P. aeruginosa, a permis l'émergence de nombreuses souches aux caractéristiques génotypiques et phénotypiques qui leur sont propres. Durant ma thèse, nous avons réalisé une analyse transcriptomique globale comparative entre les souches connues PA14, PAO1 et un nouvel isolat clinique atypique multirésistant aux antibiotiques, la souche PA7. Cette étude nous a permis de suggérer que cette souche, dépourvue des armes principales de la cytotoxicité, tendait naturellement vers un mode de développement associé à la formation de biofilm. Nous avons également caractérisé l'îlot génomique RGP69, unique à la souche PA7 qui code un troisième système de sécrétion de type II, Txc, qui sécrète dans le milieu extracellulaire une protéine d'affinité à la chitine, CbpE, sous le contrôle régulationnel d'un nouveau système de régulation à deux composants, Tts. Cet îlot génomique serait directement impliqué dans la physiologie particulière de la souche PA7.

Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic bacterial pathogen, characterized by its ubiquity and its high adaptative property. This faculty is particularly due to many systems of perception and regulation, the secretion of a wide arsenal of exoproteins, an ability to switch between two life styles, a high natural resistance to antibiotics and a rich genome submitted to an important genomic plasticity. The latter, combined with the selection pressure exerted by the wide variety of environments encountered by P. aeruginosa, has allowed the emergence of many strains with their own genotypic and phenotypic characteristics.During my thesis, we performed an overall comparative transcriptomic analysis between the known strains PA14 and PAO1, and a new atypical clinical isolate multiresistant to antibiotics, the PA7 strain. This study allowed us to determine that this strain, lacking the main weapons of cytotoxicity, naturally tended to a life-style associated with biofilm formation. We also characterized the RGP69 genomic island, unique in the PA7 strain, which encodes a third type II secretion system, Txc, that secretes in the extracellular medium a chitin-binding protein, CbpE, under the regulatory control of a component system, Tts. This genomic island could be directly involved in the particular physiology of the PA7 strain.

Advisors/Committee Members: Voulhoux, Romé (thesis director).

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Les diaphragmes utilisés comme organes de perte de charge à l'intérieur des tuyauteries de centrales électriques ont été mis en cause dans la création de sifflement. Les conséquences de ces phénomènes sont des niveaux de bruit et de vibration pouvant dépasser les valeurs admissibles. L'objectif de la thèse est d'étudier le sifflement sur la base d'expérimentations et de calculs numériques afin de proposer des outils de compréhension et de prédiction. Un résultat de la thèse correspond à l’identification expérimentale et numérique des conditions d’amplification acoustique au niveau de diaphragmes, phénomène nécessaire au sifflement. Les expériences montrent que les plages de sifflement, exprimées sous la forme d’un nombre de Strouhal fonction de l’épaisseur du diaphragme et de la vitesse dans l’orifice, s’étendent de 0,2 à 0,4 et de 0,7 à 0,9 et sont indépendantes du nombre de Reynolds. Le potentiel de sifflement de diaphragmes est également caractérisé à l’aide de simulations numériques. Deux approches sont utilisées avec des calculs U-RANS incompressibles et des simulations LES compressibles. Il apparaît que la simulation numérique permet de reproduire l’effet d’amplification acoustique à l’origine du sifflement, pour des pas de discrétisation spatial au coin amont de l’orifice suffisamment petit. Un autre résultat de la thèse est la définition des paramètres contrôlant les caractéristiques du sifflement en présence de réflexions acoustiques. Une analyse de stabilité linéaire prédit l’apparition d’un sifflement et sa fréquence. L’amplitude de sifflement est maximum pour un nombre de Strouhal autour de 0,25 et augmente avec le taux de réflexion autour du diaphragme.

Orifices used as pressure drop devices in pipes of power plants can cause tonal noise. The consequences of whistling are noise and vibration levels higher than what is acceptable. The purpose of the present works is to study the whistling phenomenon with experiments and numeric in order to propose comprehension and prediction tools. One of the results of the study is the experimental and numerical identification of the acoustic amplification conditions at the orifice, which is a necessary phenomenon for whistling. The experiments show that the whistling ranges, expressed in a Strouhal number function of the orifice thickness and the flow velocity inside the orifice, lie between 0.2 and 0.4 and between 0.7 and 0.9 and that they are independent of the Reynolds number. The whistling ability of orifices has also been defined with numerical simulations. Two approaches are used, the first consisting of incompressible U-RANS calculations, the second based on compressible LES. The numerical simulations are able to capture the acoustic amplification at the orifice, for a spatial discretization small enough at the upstream edge of the orifice. Another result of the study is the definition of the parameters controlling the whistling features when acoustic reflections are present. A linear stability analysis is able to predict the whistling frequency, and it is…

Advisors/Committee Members: Aurégan, Yves (thesis director).

▼ Le traitement des gliomes de haut grade constitue aujourd'hui encore un réel enjeu médical. Les techniques actuellement disponibles sont principalement palliatives et permettent d'augmenter la survie des patients de quelques mois seulement. Une technique innovante de radiothérapie consiste à renforcer la dose déposée dans la tumeur grâce à l'injection d'atomes lourds de manière spécifique dans celle-ci au préalable d'une irradiation de photons de basse énergie (50-100 keV). Cette technique a fait l'objet d'essais précliniques et maintenant d'essais cliniques de phases I et II sur la ligne médicale du synchrotron Européen dont le rayonnement monochromatique et intense est particulièrement adapté pour l'application. L'utilisation d'un agent de contraste (AC) iodé (Z=53) injecté par voie veineuse permet d'améliorer le bénéfice de la radiothérapie mais n'est cependant pas suffisante pour l'élimination complète de la tumeur. En effet, l'accumulation passive d'atomes lourds dans la tumeur n'est pas assez importante et le caractère extracellulaire d'un AC ne maximise pas l'efficacité biologique de l'irradiation. Les nanoparticules (NPs) métalliques apparaissent comme un moyen efficace pour repousser ces limites. Dans le cadre de cette thèse, des études ont été conduites sur la lignée cellulaire de gliome F98 afin de caractériser la toxicité et l'internalisation de trois types de nanoparticules différents : nanoparticules de gadolinium (GdNPs 3 nm), d'or (AuNPs 13 nm) et de platine (PtNPs 6 nm). La survie cellulaire a également été évaluée après différentes conditions d'irradiation de photons monochromatiques en présence de ces nano-objets. La dépendance de la réponse cellulaire à l'énergie du rayonnement incident ainsi qu'à la distribution subcellulaire des NPs a permis de mettre en évidence plusieurs mécanismes mis en jeu dans ce traitement. A concentration identique, les NPs diminuent la survie cellulaire de manière plus importante qu'un AC, validant ainsi l'intérêt microdosimétrique des NPs. L'effet est préférentiel à basse énergie (keV) indiquant que la photoactivation des atomes lourds est en partie responsable la réponse cellulaire. Par ailleurs, les GdNPs et les PtNPs se sont aussi montrées efficaces pour diminuer la survie cellulaire en combinaison à une irradiation à haute énergie (1.25 MeV) indiquant qu'un mécanisme de radiosensibilisation différent de la photoactivation intervient également. Les études précliniques, ont montré que le recouvrement complet de la tumeur par les NPs constitue un point clé pour garantir le bénéfice thérapeutique du traitement. Dans cette optique, une méthode de tomographie à deux énergies développée au synchrotron, a été caractérisée dans le cadre de ce travail. L'étude a permis d'imager de manière quantitative et simultanée la tumeur (mise en évidence par un AC iodé) et son recouvrement par des GdNPs (injectées par voie directe) chez le rongeur porteur d'un gliome. La correspondance entre la distribution de l'AC et la tumeur a également été étudiée à l'aide de techniques d'imagerie à… Advisors/Committee Members: Elleaume, Hélène (thesis director), Ravanat, Jean-Luc (thesis director).

▼ Tous les organismes, les animaux, les plantes et les microbes, sont composés de cellules polarisées, en affichant un positionnement asymétrique des organites sub-cellulaires ou des structures. Le contrôle de polarité a été étudié chez les eucaryotes pendant une longue période, et a été montré pour être impliqués dans de nombreux processus physiologiques, tels que l'embryogenèse, le cancer métastatique et les maladies dégénératives des neurones. Chez les procaryotes, des études de polarité ne sont apparues récemment avec le développement de la microscopie à fluorescence sensibles. Ces études ont révélé que les cellules procaryotes sont en fait très organisé et une masse croissante de la littérature a montré que les cellules bactériennes également utiliser des radeaux lipidiques, courbure membranaire, la paroi cellulaire et un cytosquelette complexe pour diriger le positionnement spécifique de structures subcellulaires.Petites GTPases de la superfamille Ras sont des éléments réglementaires polarisation répandue chez les eucaryotes. Malgré l'existence depuis longtemps de ces petites GTPases dans les génomes procaryotes, leur fonction a jamais été étudiée. Pendant ce travail de thèse, nous avons trouvé, pour la première fois, qu'une petite GTPase, MglA et de sa protéine apparentée Activation GTPase (GAP) MglB, directe une dynamique axe antéro-postérieur à la motilité directe en forme de tige deltaproteobacterium Myxococcus xanthus. Dans ce processus, MglA s'accumule dans son état lié au GTP au niveau du pôle leader de cellules, en activant les machineries motilité. Ce schéma de localisation est maintenue par MglB, qui localise le pôle opposé, le blocage de l'accumulation MglA à ce pôle à travers son activité GAP. Remarquablement, les deux protéines passer leur localisation synchrone, ce qui correspond à un changement dramatique dans la direction du mouvement cellulaire (inversion). Ce commutateur est réglementé par un système chimiosensoriels-like, Frz. Dans une deuxième partie de ce travail, nous avons identifié un régulateur de protéine de réponse, RomR qui est essentiel pour le regroupement polaire de MglA. Interdépendances complexes entre la localisation RomR, MglA et MglB indiquent que ces protéines pourraient constituer un complexe de polarité dynamique de trois protéines qui reçoit Frz de signalisation pour passer l'axe de polarité. En conclusion, les résultats de ce travail de thèse suggère que M. xanthus intégré un module de polarité eucaryotes-like (MglAB) dans un procaryote spécifique (Frz) réseau de signalisation pour réguler sa motilité. Une telle réglementation est distincte sous forme de petites protéines G des règlements, qui sont généralement couplés à la protéine G récepteurs couplés (GPCR) chez les eucaryotes. Enfin, ce travail ouvre la voie pour comprendre comment la réglementation seule la motilité cellulaire sont intégrés pour générer des comportements commandés multicellulaires donnant naissance à des structures primitives de développement, par exemple, la morphogenèse du… Advisors/Committee Members: Mignot, Tâm (thesis director).