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You searched for subject:( Molecular Dynamics). Showing records 1 – 10 of 10 total matches.

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1. 小関, 祐司. Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase.

Degree: 博士(情報工学), 2017, Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学

The increasing prevalence of drug-resistant tuberculosis (TB), which is resistant to effective multiple antibiotic, remains a major public health menace. The Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis)… (more)

Subjects/Keywords: In silico drug screening; Molecular Dynamics; Mycobacterium; Pharmacophore Modeling; TMPK

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APA (6th Edition):

小関, . (2017). Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase. (Thesis). Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学. Retrieved from http://hdl.handle.net/10228/5456

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

小関, 祐司. “Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase.” 2017. Thesis, Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学. Accessed October 19, 2019. http://hdl.handle.net/10228/5456.

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MLA Handbook (7th Edition):

小関, 祐司. “Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase.” 2017. Web. 19 Oct 2019.

Vancouver:

小関 . Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase. [Internet] [Thesis]. Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学; 2017. [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10228/5456.

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Council of Science Editors:

小関 . Identification of Novel Compounds with Anti-Mycobacterial Activity Using in Silico Screening and Pharmacophore Modeling Targeting Mycobacterium Thymidine Monophosphate Kinase. [Thesis]. Kyushu Institute of Technology / 九州工業大学; 2017. Available from: http://hdl.handle.net/10228/5456

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2. 笹原, 克則. 分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ.

Degree: 博士(薬科学), 2016, Tokushima University / 徳島大学

Subjects/Keywords: activation energy; Cytochrome P450 2D6; density functional theory; molecular dynamics; sites of metabolism

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APA (6th Edition):

笹原, . (2016). 分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ. (Thesis). Tokushima University / 徳島大学. Retrieved from http://repo.lib.tokushima-u.ac.jp/109682

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

笹原, 克則. “分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ.” 2016. Thesis, Tokushima University / 徳島大学. Accessed October 19, 2019. http://repo.lib.tokushima-u.ac.jp/109682.

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MLA Handbook (7th Edition):

笹原, 克則. “分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ.” 2016. Web. 19 Oct 2019.

Vancouver:

笹原 . 分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ. [Internet] [Thesis]. Tokushima University / 徳島大学; 2016. [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://repo.lib.tokushima-u.ac.jp/109682.

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Council of Science Editors:

笹原 . 分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6におけるチオリダジンの代謝機構に関する研究 : ブンシ ドウリキガクホウ オヨビ ミツド ハンカンスウホウ オ モチイタ CYP2D6 ニオケル チオリダジン ノ タイシャ キコウ ニ カンスル ケンキュウ. [Thesis]. Tokushima University / 徳島大学; 2016. Available from: http://repo.lib.tokushima-u.ac.jp/109682

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3. 丸山, 志乃. 分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション.

Degree: Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学

Supervisor:片山 信一

材料科学研究科

修士

Subjects/Keywords: Pb1-xGexTe,分子動力学シミュレーション,局所緩和; Pb1-xGexTe, Molecular dynamics simulation, local l

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APA (6th Edition):

丸山, . (n.d.). 分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション. (Thesis). Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Retrieved from http://hdl.handle.net/10119/2775

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

丸山, 志乃. “分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション.” Thesis, Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Accessed October 19, 2019. http://hdl.handle.net/10119/2775.

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丸山, 志乃. “分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション.” Web. 19 Oct 2019.

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Vancouver:

丸山 . 分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション. [Internet] [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10119/2775.

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丸山 . 分子動力学法によるPb1-xGexTeの局所格子緩和シミュレーション. [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; Available from: http://hdl.handle.net/10119/2775

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4. 泉, 陽介. 分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション.

Degree: Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学

Supervisor:片山 信一

材料科学研究科

修士

Subjects/Keywords: 熱電材料, MD, 格子熱伝導度, PbTe, GeTe, Pb1-χGeχTe; thermoelectricity, Molecular Dynamics, lattice hea

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APA (6th Edition):

泉, . (n.d.). 分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション. (Thesis). Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Retrieved from http://hdl.handle.net/10119/3026

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

泉, 陽介. “分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション.” Thesis, Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Accessed October 19, 2019. http://hdl.handle.net/10119/3026.

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泉, 陽介. “分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション.” Web. 19 Oct 2019.

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泉 . 分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション. [Internet] [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10119/3026.

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泉 . 分子動力学法によるPb_<1-x>Ge_xTeの格子熱伝導シミュレーション. [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; Available from: http://hdl.handle.net/10119/3026

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5. 藤井, 康之. クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase.

Degree: Chiba University / 千葉大学

研究科: 千葉大学大学院薬学研究科

学位:千大院薬博甲第薬162号

抄録:Class A β-lactamase (CAB)は、β-lactam系抗生物質を加水分解するために、薬剤耐性の原因となる。本研究では、CABの触媒機能とβ-lactam化合物の性質を明らかにするために分子動力学(MD)シミュレーションを行った。まず、CABの基質結合効果を解明するために、penicillin G (penG)によってアシル化されたCABと、その基質フリー酵素の生体条件下における動的構造を比較した。動的構造の観察には、MDシミュレーションを用いた。結果、2次構造における差異は認められなかった。PenGアシル化体と基質フリー酵素には、共通に活性残基Glu166とAsn170の間に水分子が位置していることが分った。この水分子は、触媒活性の続行に必要な水分子であることが、以前の研究で分っている。…

Subjects/Keywords: 薬剤耐性; 分子動力学; 量子化学計算; Drug resistance; Molecular dynamics; Quantum chemistry calculation

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APA (6th Edition):

藤井, . (n.d.). クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase. (Thesis). Chiba University / 千葉大学. Retrieved from http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022601/

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

藤井, 康之. “クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase.” Thesis, Chiba University / 千葉大学. Accessed October 19, 2019. http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022601/.

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MLA Handbook (7th Edition):

藤井, 康之. “クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase.” Web. 19 Oct 2019.

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藤井 . クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase. [Internet] [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022601/.

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Council of Science Editors:

藤井 . クラスAベータラクタマーゼの分子動力学的研究 : Molecular dynamics study on class A β-lactamase. [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022601/

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6. 畑, 晶之. 生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450.

Degree: Chiba University / 千葉大学

研究科: 千葉大学大学院薬学研究院

学位:千大院薬博乙第226号

Advisors/Committee Members: 千葉大学大学院薬学研究院.

Subjects/Keywords: cytochrome P450; Quantum Chemistry; Molecular Dynamics; Reaction Mehanism; シトクロム P450; 量子化学; 分子動力学; 反応機構

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APA (6th Edition):

畑, . (n.d.). 生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450. (Thesis). Chiba University / 千葉大学. Retrieved from http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022724/

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

畑, 晶之. “生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450.” Thesis, Chiba University / 千葉大学. Accessed October 19, 2019. http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022724/.

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畑, 晶之. “生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450.” Web. 19 Oct 2019.

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畑 . 生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450. [Internet] [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022724/.

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畑 . 生命分子科学に関する研究 : 特にcytochrome P-450について : A molecular life scientific study on the reaction mechanism of cytochrome P450. [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900022724/

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7. 春田, 篤志. 分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察.

Degree: Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学

Supervisor:小長谷 明彦

知識科学研究科

修士

Subjects/Keywords: ユビキチン,タンパク質,立体構造,分子動力学,並列分子動力学; Ubiquitin, protein, protein structure, Molecular Dynamics(MD), Parallel MD

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APA (6th Edition):

春田, . (n.d.). 分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察. (Thesis). Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Retrieved from http://hdl.handle.net/10119/708

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

春田, 篤志. “分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察.” Thesis, Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Accessed October 19, 2019. http://hdl.handle.net/10119/708.

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MLA Handbook (7th Edition):

春田, 篤志. “分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察.” Web. 19 Oct 2019.

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春田 . 分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察. [Internet] [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10119/708.

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春田 . 分子動力学を用いたユビキチン分子の熱力学的挙動に関する考察. [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; Available from: http://hdl.handle.net/10119/708

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8. 森上,賢治. 計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings.

Degree: 博士(薬学), 2014, Nihon University / 日本大学

Subjects/Keywords: 計算科学; computational chemistry; 軸不斉; atropisomerism; 蛋白質結晶; protein crystal; 分子動力学法; molecular dynamics simulation; モンテカルロ法; Monte Carlo simulathion

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森上,賢治. (2014). 計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings. (Thesis). Nihon University / 日本大学. Retrieved from http://repository.nihon-u.ac.jp/xmlui/handle/11263/447 ; http://dx.doi.org/10.15006/32665B7105

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森上,賢治. “計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings.” 2014. Thesis, Nihon University / 日本大学. Accessed October 19, 2019. http://repository.nihon-u.ac.jp/xmlui/handle/11263/447 ; http://dx.doi.org/10.15006/32665B7105.

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MLA Handbook (7th Edition):

森上,賢治. “計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings.” 2014. Web. 19 Oct 2019.

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森上,賢治. 計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings. [Internet] [Thesis]. Nihon University / 日本大学; 2014. [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://repository.nihon-u.ac.jp/xmlui/handle/11263/447 ; http://dx.doi.org/10.15006/32665B7105.

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森上,賢治. 計算化学的手法を用いた分子の物生予測 :(1)蛋白質結晶中のカウンターイオンの位置特性(2)7員環構造を持つ低分子医薬の軸不斉 : Molecular property predictions by using computational chemistry methods (1) Positional properties of counter ions in protein crystals (2)Atropisomerism of small molecule medicines with 7-membered rings. [Thesis]. Nihon University / 日本大学; 2014. Available from: http://repository.nihon-u.ac.jp/xmlui/handle/11263/447 ; http://dx.doi.org/10.15006/32665B7105

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9. 幸, 瞳. 分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4.

Degree: Chiba University / 千葉大学

研究科: 千葉大学大学院医学薬学府

学位:千大院医薬博乙第薬50号

修了年:2011年

Advisors/Committee Members: 千葉大学大学院医学薬学府.

Subjects/Keywords: molecular dynamics simulation; quantum chemistry; sites of metabolism; cytochrome P450; activation energy; carbamazepine; 分子動力学計算; 量子化学計算; 代謝部位予測; シトクローム P450; 活性化エネルギー; カルバマゼピン

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幸, . (n.d.). 分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4. (Thesis). Chiba University / 千葉大学. Retrieved from http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900117124/

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

幸, 瞳. “分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4.” Thesis, Chiba University / 千葉大学. Accessed October 19, 2019. http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900117124/.

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幸, 瞳. “分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4.” Web. 19 Oct 2019.

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Vancouver:

幸 . 分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4. [Internet] [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900117124/.

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Council of Science Editors:

幸 . 分子動力学計算と量子化学計算を用いた化合物の代謝部位予測:CYP3A4 とcarbamazepine への適用 : ブンシ ドウ リキガク ケイサン ト リョウシ カガク ケイサン ヲ モチイタ カゴウ ブツ ノ タイシャ ブイ ヨソク CYP3A4 ト carbamazepine ヘ ノ テキヨウ; Computational prediction of sites of metabolism in a substrate molecule, instanced by carbamazepine oxidation by CYP3A4. [Thesis]. Chiba University / 千葉大学; Available from: http://opac.ll.chiba-u.jp/da/curator/900117124/

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10. 沖田, 弘明. 分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究.

Degree: Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学

Supervisor:小長谷 明彦

知識科学研究科

修士

Subjects/Keywords: 分子動力学法・自由エネルギー摂動法,Human Lysozyme, Cys77/95Ala 変異体, Cys77Ala 変異体, native状態と変性状態; Molecular Dynamics/Free Energy Perturbation, Human Lysozyme, Cys77/95Ala Mutant, Cys77Ala Mutant, Native State and Denature State

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APA (6th Edition):

沖田, . (n.d.). 分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究. (Thesis). Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Retrieved from http://hdl.handle.net/10119/346

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Chicago Manual of Style (16th Edition):

沖田, 弘明. “分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究.” Thesis, Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学. Accessed October 19, 2019. http://hdl.handle.net/10119/346.

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MLA Handbook (7th Edition):

沖田, 弘明. “分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究.” Web. 19 Oct 2019.

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Vancouver:

沖田 . 分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究. [Internet] [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; [cited 2019 Oct 19]. Available from: http://hdl.handle.net/10119/346.

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Council of Science Editors:

沖田 . 分子動力学/自由エネルギー摂動法を用いたタンパク質熱構造安定性の研究. [Thesis]. Japan Advanced Institute of Science and Technology / 北陸先端科学技術大学院大学; Available from: http://hdl.handle.net/10119/346

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