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You searched for +publisher:"Université de Strasbourg" +contributor:("Cavarelli, Jean"). Showing records 1 – 3 of 3 total matches.

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1. Mailliot, Justine. Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds.

Degree: Docteur es, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie, 2013, Université de Strasbourg

Les "protéine arginine méthyltransférases" (PRMT) sont impliquées dans de nombreux processus cellulaires : transcription, maturation et transport des ARN, traduction, transduction du signal, réplication et réparation de l'ADN, et apoptose. Différents travaux ont montré que des dérégulations de ces mécanismes impliquant les PRMT peuvent induire certains cancers, faisant de ces enzymes de nouvelles cibles potentielles en chimiothérapie. Il s’avère donc crucial de comprendre le mode d’action des PRMT à l’échelle atomique, à la fois au niveau fondamental et pour le développement de nouveaux médicaments. Les travaux décrits ici s’intéressent à la protéine PRMT4/CARM1 et s’appuient sur des études structurales par bio-cristallographie, pour comprendre les mécanismes de la réaction de méthylation catalysée par CARM1 et découvrir des inhibiteurs spécifiques, mais aussi sur des études en solution, pour caractériser l’interaction entre CARM1 et ses substrats.

Protein arginine methyltransferases (PRMTs) are involved in several cellular mechanisms: transcription, RNA maturation and transport, translation, signal transduction, DNA replication and repair, and apoptosis. Different studies showed that deregulation of those mechanisms involving PRMTs can induce some cancers, making these enzymes new potential targets for chemotherapy. It is therefore crucial to understand the mode of action of PRMTs at the atomic scale, both at the fundamental level and for the development of new drugs. The studies described here focus on PRMT4/CARM1 and rely on structural studies by bio-crystallography, in order to understand the methylation mechanisms catalyzed by CARM1 and to discover specific inhibitors, but also on in vitro studies, to characterize the interaction between CARM1 and its substrates.

Advisors/Committee Members: Cavarelli, Jean (thesis director).

Subjects/Keywords: CARM1; Coactivator-associated arginine methyltransferase 1; Coactivateurs des récepteurs nucléaires; PRMT; Biologie structurale; CARM1; Coactivator-associated arginine methyltransferase 1; Nuclear receptor coactivator; PRMT; Structural biology; 572.8

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APA (6th Edition):

Mailliot, J. (2013). Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2013STRAJ015

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Mailliot, Justine. “Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds.” 2013. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed June 25, 2019. http://www.theses.fr/2013STRAJ015.

MLA Handbook (7th Edition):

Mailliot, Justine. “Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds.” 2013. Web. 25 Jun 2019.

Vancouver:

Mailliot J. Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2013. [cited 2019 Jun 25]. Available from: http://www.theses.fr/2013STRAJ015.

Council of Science Editors:

Mailliot J. Étude structurale de l’histoneméthyltransférase « CARM1 » et de ses complexes biologiquement significatifs : des structures 3D vers la conception rationnelle de composés à action pharmacologique : Structural study of CARM1 a histone methyltransferase and its biologically significant complexes : from 3D structures to rational conception of pharmacologically active compounds. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013STRAJ015

2. Marechal, Nils. Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators.

Degree: Docteur es, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie, 2018, Université de Strasbourg

Les protéine arginine méthyltransférases (PRMT) sont impliquées dans de nombreux processus cellulaires, incluant la régulation de l’expression des gènes, le contrôle de l’épissage, le maintien de l’intégrité du génome et la transduction du signal. De nombreuses études montrent que la dérégulation de l’activité des PRMT est associée au développement de pathologies, et en particulier de cancers. Les PRMT constituent ainsi une des nouvelles cibles potentielles en chimiothérapie. Les travaux présentés dans ce manuscrit portent sur trois cibles : PRMT2, PRMT3 et PRMT4/CARM1. Combinant des approches biochimiques, biophysiques et structurales (cristallographie et cryo- microscopie électronique), ces travaux comportent deux aspects : (I) comprendre au niveau atomique la régulation de la réaction de méthylation des protéines (reconnaissance protéines-protéines et interactions entre modifications post-traductionnelles) ; (II) découvrir des inhibiteurs spécifiques et puissants de plusieurs PRMT cibles.

Protein arginine methyltransferases (PRMT) are involved in many cellular processes, including gene expression regulation, splicing control, maintenance of genome integrity and signal transduction.Since deregulation of those biological processes appears to be implicated in the pathogenesis of different diseases, PRMTs have emerged as potential new targets for the development of novel therapeutic modulators. Despite the large amount of biological and structural data on PRMTs, two challenges remain to be solved by structural biology ; (I) understanding how PRMTs recognize and bind their full-length substrates ; (II) revealing how PRMTs achieve specific arginine methylation on different target sites. The works presented here focused on 3 targets: PRMT2, PRMT3 and PRMT4/ CARM1. We used biochemical, biophysical and structural methods (bio-crystallography and cryo- electron microscopy) to decipher structural clues that drive PRMT-substrate recognition. We developed new chemical probes that can be used in early drug discovery for the conception of PRMT inhibitors.

Advisors/Committee Members: Cavarelli, Jean (thesis director).

Subjects/Keywords: PRMT; Epigénétique; Méthylation des arginines; Analogues SAM-peptides; Inhibiteurs; Structure biologique; PRMTs; Epigenetic; Arginine methylation; PRMTs; SAM-peptides analogs; Inhibitors; Structural biology; 572.8

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APA (6th Edition):

Marechal, N. (2018). Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2018STRAJ048

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Marechal, Nils. “Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators.” 2018. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed June 25, 2019. http://www.theses.fr/2018STRAJ048.

MLA Handbook (7th Edition):

Marechal, Nils. “Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators.” 2018. Web. 25 Jun 2019.

Vancouver:

Marechal N. Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2018. [cited 2019 Jun 25]. Available from: http://www.theses.fr/2018STRAJ048.

Council of Science Editors:

Marechal N. Étude structurale des protéine arginine méthyltransférases : reconnaissance des substrats et conception rationnelle de modulateurs : Structural study of protein arginine methyltransferases : substrate recognition and structure-based design of modulators. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2018. Available from: http://www.theses.fr/2018STRAJ048

3. D'Orchymont, Arnaud. Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA.

Degree: Docteur es, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie, 2013, Université de Strasbourg

Chez les Eucaryotes, l’étape d’initiation est de loin la plus complexe et la plus lente du processus de traduction. Elle nécessite l’intervention de 12 facteurs protéiques, d’une coiffe m7GpppN située à l’extrémité 5’ des ARNm et d’une queue poly(A) en 3’. Les ARNm des histones « réplication-dépendantes » sont particuliers car dépourvus d’extrémité 3’ polyadénylée et dotés d’une extrémité 5’ non traduite extrêmement courte, de 9 nt seulement chez l’ARNm H4 de la souris. Pour traduire ces ARNm, un processus d’initiation non conventionnel a été décrit au laboratoire. L’objectif de ma thèse a été d’établir les bases structurales de ce mécanisme en combinant différentes approches expérimentales. Deux protocoles originaux de repliement ont été mis au point afin d’isoler l’ARNm H4 dans deux conformations distinctes et stables. Une caractérisation fonctionnelle et structurale de ces deux formes de l’ARNm a ensuite été réalisée. La stabilité et la structure de ces deux formes ont été étudiées par DLS, par SAXS et par équilibre de sédimentation. Puis, nous avons étudié la capacité de ces deux formes d’ARNm H4 à fixer le facteur d’initiation eIF4E et les ribosomes assemblés sur le codon d’initiation ainsi que leur aptitude à être traduits in vitro. Un modèle de repliement de la structure secondaire de l’ARNm H4 a été construit après sondage enzymatique et chimique des deux formes de l’ARNm. Ce modèle a servi de base pour le travail d’ingénierie de l’ARNm H4 qui a conduit à son découpage en sous-domaines. Des essais de cristallisation ont porté sur 18 de ces fragments ainsi que sur les deux formes de l’ARNm H4 complet.

In eukaryotes, the initiation step is far more complex and the slowest inside the translation process. It requires the intervention of 12 protein factors, an m7GpppN cap located to the 5 'end of the mRNA and a poly (A) tail at the 3'. Histone mRNAs "replication-dependent" are specific because they lack of polyadenylated tail at the 3’ end and have a 5' end untranslated extremely short (9 nt only in the mouse). To translate these mRNAs, a process of unconventional initiation has been described in the laboratory. The aim of my thesis was to establish the structural basis of the mechanism by combining different experimental approaches. Two original refolding protocols have been developed to isolate mRNA H4 in two distinct and stable conformations. A functional and structural characterization of these two shapes of H4 mRNA was then performed. The stability and the structure of these two shapes have been studied by DLS, SAXS and sedimentation equilibrium. Then, we studied the ability of these two conformations of H4 mRNA to bind the eIF4E initiation factor and ribosomes assembled on the start codon as well as their ability to be translated in vitro. Models of the secondary structure has been constructed after enzymatic and chemical probing of the two shapes of the mRNA. This model was the basis for the engineering of the H4 mRNA that led to its division into sub-domains. Crystallization trials focused on 18 of…

Advisors/Committee Members: Cavarelli, Jean (thesis director), Eriani, Gilbert (thesis director).

Subjects/Keywords: MRNA; Refolding; Structure; Translation; Histone; MRNA; Refolding; Structure; Translation; Histone; 572.8

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APA (6th Edition):

D'Orchymont, A. (2013). Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA. (Doctoral Dissertation). Université de Strasbourg. Retrieved from http://www.theses.fr/2013STRAJ039

Chicago Manual of Style (16th Edition):

D'Orchymont, Arnaud. “Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA.” 2013. Doctoral Dissertation, Université de Strasbourg. Accessed June 25, 2019. http://www.theses.fr/2013STRAJ039.

MLA Handbook (7th Edition):

D'Orchymont, Arnaud. “Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA.” 2013. Web. 25 Jun 2019.

Vancouver:

D'Orchymont A. Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université de Strasbourg; 2013. [cited 2019 Jun 25]. Available from: http://www.theses.fr/2013STRAJ039.

Council of Science Editors:

D'Orchymont A. Etudes structurales de l'ARN messager de l'histone H4 : Structural studies of histone H4 messenger RNA. [Doctoral Dissertation]. Université de Strasbourg; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013STRAJ039

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