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1. Kusuma, Pradiptajati. In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie.

Degree: Docteur es, Anthropobiologie, 2017, Université Toulouse III – Paul Sabatier

L'Indonésie a été l'objet de la dispersion Austronésienne qui a débuté il y a environ 5000 ans depuis Taiwan, se propager à travers les Philippines et l'Indonésie, puis toucher l'Océanie à l'est, et à Madagascar à l'ouest. Malgré de nombreuses recherches en génétique sur la dispersion Austronésienne vers l'est, il y a très peu de données sur la dispersion vers l'ouest, laissant sans réponse de nombreuses questions, liées notamment au peuplement de Madagascar. Reposant sur l'analyse des données culturelles et biologiques, les populations d'Indonésie semblent avoir joué un rôle majeur dans la colonisation de Madagascar, le premier millénaire de notre ère. Cependant, le peu de populations Indonésiennes étudiées à ce jour n'a pas permis jusqu'à présent d'identifier la population indonésienne source. Dans ce présent travail, j'ai réalisé des études en génétique des populations de 12 populations Indonésiennes, qui à priori devraient éclairer l'histoire des migrations austronésiennes dans l'Océan Indien. Parmi elles sont inclus le Ma'anyan du sud-est de Bornéo qui sont les plus proches linguistiquement des Malgaches. En utilisant différents marqueurs génétiques, ma recherche a amélioré nos connaissances de la diversité génétique Indonésienne, et du lien génétique entre l'Indonésie et Madagascar. Résultats L'analyse des marqueurs uniparentaux (chr-Y et ADNmt) suggère que les Malgaches proviennent de plusieurs régions d'Indonésie, avec un lien privilégié avec le sud-est de Bornéo, le sud de Sulawesi et les îles de la Sonde. Etonnamment, les Ma'anyan partagent un nombre limité de lignées paternelles et maternelles avec les Malgaches, malgré leur proximité linguistique. Par ailleurs, en combinant l'analyse de fréquences des SNPs et l'analyse haplotypique à partir des données autosomales, il a été confirmé que la diversité génétique des Ma'anyan ne correspond pas à l'ancestralité asiatique des Malgaches. Cependant, en centrant l'analyse sur les populations du sud-est de Bornéo, l'origine de l'ancestralité asiatique des Malgaches est ancrée dans la population Banjar, un mélange de population Ma'anyan et Malaise, résultat des activités commerciales de l'empire Malais dans le sud-est de Bornéo, qui se sont poursuivies à travers l'océan Indien. Par ailleurs nos résultats ont aussi permis d'accroitre notre compréhension de la diversité génétique de l'Indonésie en identifiant (1) une nouvelle composante génétique austronésienne présente chez les Ma'anyan, et retrouvée à faible fréquence à travers l'Asie du Sud-Est, suggérant une plus grande complexité du modèle d'expansion austronésien dans la région et (2) le rôle joué par les nomades de la mer dans la structuration de la diversité génétique et les échanges entre populations dans l'Indonésie, soulignant l'histoire génétique complexe de populations suivant un mode de vie nomade.

Indonesia hosts a wide range of linguistic, ethnic and genetic diversity, comprising ~600 ethnic groups and 700 living languages. Indonesia has facilitated the last substantial wave of human migration was…

Advisors/Committee Members: Ricaut, Francois-Xavier (thesis director), Letellier, Thierry (thesis director).

Subjects/Keywords: Indonésie; Malgache; Migration; ADNmt; Chromosome Y; SNP génome; Indonesia; Malagasy; Migration; MtDNA; Y-chromosome; Genome-wide SNP

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APA (6th Edition):

Kusuma, P. (2017). In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie. (Doctoral Dissertation). Université Toulouse III – Paul Sabatier. Retrieved from http://www.theses.fr/2017TOU30109

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Kusuma, Pradiptajati. “In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie.” 2017. Doctoral Dissertation, Université Toulouse III – Paul Sabatier. Accessed October 30, 2020. http://www.theses.fr/2017TOU30109.

MLA Handbook (7th Edition):

Kusuma, Pradiptajati. “In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie.” 2017. Web. 30 Oct 2020.

Vancouver:

Kusuma P. In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Toulouse III – Paul Sabatier; 2017. [cited 2020 Oct 30]. Available from: http://www.theses.fr/2017TOU30109.

Council of Science Editors:

Kusuma P. In search of Asian Malagasy ancestors in Indonesia : A la recherche des ancestres asiatiques des malgaches en Indonésie. [Doctoral Dissertation]. Université Toulouse III – Paul Sabatier; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017TOU30109

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