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1. Tronnet, Sophie. Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli.

Degree: Docteur es, Microbiologie, 2017, Université Toulouse III – Paul Sabatier

Le microbiote intestinal joue un rôle majeur dans le développement des fonctions digestive, métabolique, immunitaire et neurologique de son hôte. Escherichia coli est un hôte commun de la microflore commensale intestinale de l'Homme et des animaux à sang chaud, et s'établit dans le tractus digestif dès les premières heures ou jours qui suivent la naissance. L'espèce E. coli, bactérie anaérobe facultative prévalente, peut être divisée en sept groupes phylogénétiques principaux. Le groupe phylogénétique B2 comprend le plus grand nombre de souches responsables d'infections extra-intestinales (méningites néonatales, infections urinaires, septicémies, ...) ou chroniques (cancers, maladie de Crohn, ...). Des études épidémiologiques récentes montrent que le portage de ces souches est en augmentation dans les pays industrialisés, au détriment du groupe ancestral A. L'objectif de mon projet de thèse était de déterminer les facteurs à l'origine de cette évolution. Une analyse génétique montre que les souches du groupe phylogénétique B2 ont développé une très grande capacité à acquérir le fer, notamment via les sidérophores. Les souches appartenant au groupe B2 sont aussi les seules capables de synthétiser une génotoxine, la colibactine. Celle-ci induit des cassures de l'ADN double brin dans les cellules eucaryotes, pouvant être à l'origine de cancers colorectaux ou d'un défaut de développement de la barrière intestinale. Les sidérophores et la colibactine appartiennent à la même famille de molécules, i.e. des hybrides polycétide-peptide non ribosomaux. Leur biosynthèse fait intervenir des enzymes multifonctionnelles qui doivent être activées par fixation covalente d'un groupement 4'-phosphopantethéïnyl (P-pant). Cette modification post-traductionnelle est catalysée par la 4'-phosphopantethéïnyl transférase (PPTase). La PPTase ClbA est impliquée dans la synthèse de colibactine. La PPTase impliquée dans celle des sidérophores est EntD. Récemment, notre équipe a montré que ClbA pouvait participer à la synthèse des sidérophores, et remplacer EntD. Ceci montrait pour la première fois une connexion entre les multiples voies nécessitant des PPTases et conduisant à la biosynthèse de métabolites secondaires fonctionnellement distincts dans un micro-organisme donné. Dans la mesure où l'expression de entD et la synthèse des sidérophores sont régulées par la disponibilité en fer, nous avons fait l'hypothèse que l'expression de clbA et synthèse de la colibactine étaient également régulées par la quantité de fer.

The intestinal microbiota, i.e. the microorganisms present in the intestinal tract, plays a major role in diverse host functions: digestive, metabolic, immune and neurologic. Escherichia coli is a normal inhabitant of the commensal intestinal microflora of the human and mammals, and colonizes the gut within few days after birth. E. coli can be classified into 7 major phylogenetic groups. The B2 group contains the highest number of strains responsible for chronic (cancers, Crohn's disease, ...) or extra-intestinal infections…

Advisors/Committee Members: Martin, Patricia (thesis director), Oswald, Eric (thesis director).

Subjects/Keywords: Escherichia coli; Fer; Colibactine; RyhB; Fur; Microbiote; Escherichia coli; Iron; Colibactin; RyhB; Fur; Microbiota

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APA (6th Edition):

Tronnet, S. (2017). Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli. (Doctoral Dissertation). Université Toulouse III – Paul Sabatier. Retrieved from http://www.theses.fr/2017TOU30062

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Tronnet, Sophie. “Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli.” 2017. Doctoral Dissertation, Université Toulouse III – Paul Sabatier. Accessed October 18, 2019. http://www.theses.fr/2017TOU30062.

MLA Handbook (7th Edition):

Tronnet, Sophie. “Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli.” 2017. Web. 18 Oct 2019.

Vancouver:

Tronnet S. Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli. [Internet] [Doctoral dissertation]. Université Toulouse III – Paul Sabatier; 2017. [cited 2019 Oct 18]. Available from: http://www.theses.fr/2017TOU30062.

Council of Science Editors:

Tronnet S. Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli : Regulation by iron and role of colibactin in the intestinal colonization of Escherichia coli. [Doctoral Dissertation]. Université Toulouse III – Paul Sabatier; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017TOU30062

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