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You searched for +publisher:"Universidade Federal do Amazonas" +contributor:("http://lattes.cnpq.br/9942676168552776"). Showing records 1 – 3 of 3 total matches.

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1. Mendon?a, Diego Valois Cortez. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.

Degree: 2020, Universidade Federal do Amazonas

Os quassin?ides s?o terpenoides altamente oxigenados produzidos apenas por esp?cies da fam?lia Simaroubaceae. Os quassin?ides isobruce?na B e neosergeolida apresentam atividades antitumorais e antimal?ricas experimentalmente comprovadas. Porem a isobruceina B e a neosergeolida apresentam valores altos de citotoxidade, eles atingem tanto as c?lulas neopl?sicas como as c?lulas sadias, agindo da mesma forma contra o plasm?dio da mal?ria e as c?lulas sadias. Mediante a essa situa??o se faz necess?rio a utiliza??o do docking molecular, que ? um procedimento computacional capaz de prever a melhor orienta??o e liga??o entre duas mol?culas. O docking indica um caminho para a elabora??o de f?rmacos e ajuda a diminui os problemas de citotoxidade atrav?s de conforma??es. Nesse contexto, um estudo que combina dados qu?nticos e experimentais em n?vel de teoria do funcional da densidade (DFT) das propriedades estruturais, vibracionais e eletr?nicas da isobruceina b e neosergeolida s?o apresentados. Para obten??o dos resultados foi utilizada a fun??o base 6-311G (2d,p) e o funcional de troca e correla??o introduzido por Axel Becke utilizando os par?metros Lee-Yang-Parr (B3LYP). Os dados de otimiza??o de geometria te?rica foram comparados com os dados de raios X para uma estrutura similar na literatura associada, mostrando valores pr?ximos. O valor do gap HOMO-LUMO calculado mostra que a isobruce?na B e a neosergeolida s?o consideradas mol?culas macias (reativas), cujo respectivos valores s?o 4,96 (e.V) e 4,63 (e.V) e est? diretamente relacionada ?s propriedades qu?nticas e fisico-qu?micas das mol?culas. Atrav?s da verifica??o dos estudos de IV (Infra-vermelho) e dos MEPS (Mapas de potencial eletrost?tico) ? poss?vel identificar uma poss?vel forma??o de d?meros intermoleculares na isobruce?na B, e esta forma dim?rica ? estabilizada atrav?s de liga??es de hidrog?nio que revelaram v?rias vibra??es caracter?sticas para a estrutura. O estudo de docking molecular com o complexo Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax mostrou energias livres de liga??o de -8,3 kcal / mol para a isobruce?na B e de -9,3 kcal/mol para a neosergeolida, e isso sugere que a neosergeolida pode ser considerada um bom composto l?der no desenvolvimento de novos inibidores de DHFR do que a pirimetamina, utilizada para o tratamento da mal?ria, a energia livre de liga??o ?G apresentou um valor de -7,5 kcal / mol.

The quassinoids are highly oxygenated terpenoids produced only by species of the family Simaroubaceae. The quassionoids isobrucein B and neosergeolide have experimentally proven antitumor and antimalarial activities. Nevertheless, isobrucein B and neosergeolide have high cytotoxicity values, they affect both neoplastic cells and healthy cells, acting in the same way against malaria plasmodium and healthy cells. Due to this situation it is necessary to use molecular docking, which is a computational procedure capable of predicting the best orientation and binding between two molecules. Docking indicates a pathway for drug development and helps through…

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Marques, Alberto dos Santos, http://lattes.cnpq.br/9942676168552776, Silva, Jonathas Nunes da, http://lattes.cnpq.br/3810713572412514.

Subjects/Keywords: Quassin?ides; Isobruce?na B; Atividades antitumorais; Neosergeolida; Docking molecular; CI?NCIAS EXATAS E DA TERRA: QU?MICA; Isobruce?na B; Neosergeolida; DFT; Docking molecular

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APA (6th Edition):

Mendon?a, D. V. C. (2020). Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Mendon?a, Diego Valois Cortez. “Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.” 2020. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed July 11, 2020. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754.

MLA Handbook (7th Edition):

Mendon?a, Diego Valois Cortez. “Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.” 2020. Web. 11 Jul 2020.

Vancouver:

Mendon?a DVC. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2020. [cited 2020 Jul 11]. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754.

Council of Science Editors:

Mendon?a DVC. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2020. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754

2. Iank, Julio Rodolfo Pessoa. Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono.

Degree: 2014, Universidade Federal do Amazonas

O estudo atual de nanoestruturas de carbono, dentre as quais se podem citar as buckyballs e os nanotubos de carbono, tem gerado um grande interesse em pesquisadores teóricos e experimentais devido à aplicação das propriedades químicas e físicas destas estruturas. Entre estas se encontra a capacidade de encapsulamento de diferentes substâncias químicas em seu interior, especialmente gases, sob condições específicas de reação, temperatura, pressão e taxa de velocidade. Neste trabalho se analisou a estabilidade das nanoestruturas de carbono do tipo buckyballs, como meio de armazenagem de gases. Foi utilizada uma abordagem teórico-computacional, em nível PM3 (Parametric Method 3). Para tanto se utilizou um conjunto de processadores Quad Core com o pacote computacional GAUSSIAN, existente no Laboratório de Química Teórica e Computacional na UFAM. As estruturas das buckyballs analisadas com moléculas de gases inseridas (H2O, CO2, O2 e N2) apresentaram diferentes estabilidades frente ao limite máximo de armazenamento de gases: [email protected], [email protected], [email protected] e [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] e [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] e [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] e [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] e [email protected] Estes resultados mostram o limite máximo de armazenamento das buckyballs analisadas em relação aos gases mencionados e os mesmos poderão ser utilizados como modelos para possíveis sistemas de armazenamento de gases.

The current study of carbon nanostructures, among which we can cite the buckyballs and carbon nanotubes, have generated a great interest in theoretical and experimental researchers due to the application of chemical and physical properties of these structures. Among these is the ability to encapsulate different chemicals inside, especially gases under specific conditions of reaction temperature, pressure and speed rating. This work analyzed the stability of carbon nanostructures like buckyballs, as the storage of gases. We used a theoretical-computational level PM3 (Parametric Method 3). For that we used a set of Quad Core processors with computational package GAUSSIAN existing at the Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry in UFAM. The structures of buckyballs analyzed with gas molecules inserted (H2O, CO2, O2 and N2) showed different stabilities against the maximum storage of gases: [email protected], [email protected], [email protected] and [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] and [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] and [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] and [email protected]; [email protected], [email protected], [email protected] and [email protected] These results show the maximum storage of buckyballs analyzed in relation to the gases mentioned and these may be used as models for possible gas storage systems.

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, 336.993.992-49, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Couceiro, Paulo Rogério da Costa, http://lattes.cnpq.br/0117665735282078, Marques, Alberto dos Santos, http://lattes.cnpq.br/9942676168552776, Borges, Denilson da Silva, http://lattes.cnpq.br/7149037835888302.

Subjects/Keywords: Dinâmica dos gases; Nanoestruturas; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA

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APA (6th Edition):

Iank, J. R. P. (2014). Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4445

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Iank, Julio Rodolfo Pessoa. “Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono.” 2014. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Amazonas. Accessed July 11, 2020. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4445.

MLA Handbook (7th Edition):

Iank, Julio Rodolfo Pessoa. “Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono.” 2014. Web. 11 Jul 2020.

Vancouver:

Iank JRP. Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. [cited 2020 Jul 11]. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4445.

Council of Science Editors:

Iank JRP. Estudo teórico sobre armazenagem e estabilidade de gases em nanoestruturas de Carbono. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4445

3. Costa, Renyer Alves. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.

Degree: 2018, Universidade Federal do Amazonas

Os alcaloides constituem uma classe de metabólitos com grande atividade biológica e de grande importância na história humana. Dentre as diversas classes merecem destaque os alcaloides indólicos e aporfínicos. Cerca de 1000 tipos de alcaloides dessas classes já foram isolados, entretanto estudos teóricos que justifiquem as suas atividades e forneçam novos dados acerca das suas propriedades estruturais, espectroscópicas e quânticas são escassos na literatura. Partindo desta premissa o presente estudo investigou os alcaloides strictosidina, stricnobrasilina, 12-hidroxi-10,11-dimetoxiestricnobrasilina, liriodenina, cantinona e 7-metoxi-cantinona através de uma abordagem teórica por cálculos DFT usando o funcional híbrido de correlação eletrônica B3LYP e as bases 6-31 G(d), 6-311G(2d,p) e 6-311G++(2d,p). Dados teóricos de otimização geométrica foram comparados com dados de espectroscopia de raio-X de estruturas similares existentes na literatura apresentando valores similares. Em adição cálculos de Orbitais Naturais de ligação (Natural Bond Orbitals-NBOs), orbitais HOMO e LUMO e mapas de potencial eletrostático foram realizados. Espectros teóricos de UV-Vis revelaram-se bastante similares aos espectros experimentais sendo possível o assinalamento das transições eletrônicas. Baseados nos mapas de potencial eletrostático e nos espectros teóricos de IV (por estiramentos N-H e O-H) foi possível prever a formação de ligações de hidrogênio. Cálculos de docking molecular frente os complexos enzimáticos DNA-Topoisomerase II humana e com Diidrofalato redutase de Cândida albicans foram realizados no intuito de justificar as atividades previamente descritas na literatura.

The alkaloids constitute a class of metabolites with great biological activity and o great importance in human history. Among the several classes, the idole and oxoaporphine type alkaloids are worth mentioning. About 1000 of these types alkaloids have already been isolated from plants, however theoretical studies that justify their activities providing new data about their structural, spectroscopic and quantum properties lack in the literature. Based on this premise, the present study investigated the alkaloids strictosidine, stricnobrasiline, 12-hydroxy-10,11-dimethoxystricnobrasiline, liriodenine, cantinone and 7-methoxy-cantinone through a theoretical approach by DFT calculations using the hybrid electronic correlation function B3LYP and the 6-31 G (d), 6-311G (2d, p) and 6-311G ++ (2d, p) basis set. Theoretical geometric optimization data were compared with X-ray spectroscopy data of similar structures in the literature presenting similar values. In addition calculations of Natural Bond Orbitals (NBOs), HOMO and LUMO orbitals and electrostatic potential maps were performed. Theoretical spectra of UV-Vis revealed to be quite similar to the experimental spectra being possible to signal the electronic transitions. Based on the maps of electrostatic potential and the theoretical spectra of IV (by stretches N-H and O-H) it was possible to predict the formation…

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, 33699399249, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Pinheiro, Maria Lúcia Belém, http://lattes.cnpq.br/9299061381457390, Eberlin, Marcos Nogueira, http://lattes.cnpq.br/9866858833240787, Silva, Jonathas Nunes da, http://lattes.cnpq.br/3810713572412514, Guerreiro, Haroldo de Almeida, http://lattes.cnpq.br/1014103626919593, Marques, Alberto dos Santos, http://lattes.cnpq.br/9942676168552776, [email protected].

Subjects/Keywords: Alcaloides; Docking; DFT; FT-IR; Espectroscopia; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA: FÍSICO-QUÍMICA: QUÍMICA TEÓRICA; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA: QUÍMICA ORGÂNICA: ESTRUTURA, CONFORMAÇÃO E ESTEREOQUÍMICA

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APA (6th Edition):

Costa, R. A. (2018). Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Costa, Renyer Alves. “Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.” 2018. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Amazonas. Accessed July 11, 2020. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982.

MLA Handbook (7th Edition):

Costa, Renyer Alves. “Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.” 2018. Web. 11 Jul 2020.

Vancouver:

Costa RA. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. [cited 2020 Jul 11]. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982.

Council of Science Editors:

Costa RA. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982

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