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You searched for +publisher:"Universidade Federal do Amazonas" +contributor:("Silva, Jonathas Nunes da"). Showing records 1 – 3 of 3 total matches.

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1. Branches, Adjane Dalvana Sampaio. Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae).

Degree: 2019, Universidade Federal do Amazonas

Os aporfinoides são uma classe de alcaloides isoquinolínicos com mais de 500 compostos já identificados na literatura e são conhecidos por sua ampla utilidade farmacológica tal como anticâncer, anestésica, vasodilatadora e antibacteriana. Dentro dessa classe se encaixam os alcalóides aporfínicos que, por sua vez, compreendem uma classe nova intitulada 7,7-dimetilaporfínicos (devido a presença de duas metilas no C7) que até então não possuíam nenhum dado teórico relacionando suas características estruturais, vibracionais, propriedades quânticas e estudo de docking molecular. Neste contexto, este trabalho teve como objetivo investigar os alcalóides 9-metoxiguatterfriesina (I), (R)-6,6a-dihidro-9-metoxiguatterfriesina (II) e 4,5-dehidro-9-metoxiguatterfriesina (III), pertencentes a essa nova classe, através de uma abordagem teórica utilizando cálculos DFT com o funcional B3LYP e as bases de cálculo 6-311G (2d,p). Os dados de otimização geométrica para as estruturas foram comparados com dados de raio-x para uma estrutura similar disponível na literatura e obtiveram comprimentos de ligação bem próximos. Cálculos de NBO e NLO foram realizados a fim de ampliar o conhecimento com relação às propriedades quânticas das substâncias além de explicar efeitos de deslocalização eletrônica presentes nas estruturas. Os espectros teóricos de UV-vis e IV foram comparados com dados experimentais obtidos em trabalho anterior e apresentaram semelhanças satisfatórias, além de confirmar a existência da forma dimérica para os três compostos em solução, formas estas estabilizadas por interações de ligação de hidrogênio do tipo OH – N. Foi realizado estudo de docking molecular, a substância III revelou maior potencial bioativo e, para fins comparativos, um estudo de docking também foi realizado para duas substâncias (9-metoxiguatteriscina e 6,6a-diidrodemetoxiguadiscina) com esqueleto semelhante ao das moléculas I, II e III, entretanto com substituintes diferentes nos anéis. Em adição, foi realizado ensaio citotóxico in vitro para as substâncias o qual a substância III obteve o maior poder inibitório indicando assim a confiabilidade dos métodos teóricos de docking molecular.

Apophinoids are a class of isoquinoline alkaloids with more than 500 compounds already identified in the literature and specially recognized for having a range of pharmacological activities such as anticancer, anesthetic, vasodilator and antibacterial. Belonging to this class, the aporphine alkaloids comprise a new class titled 7,7-dimethylaporphinic (due to the presence of two methyls in C7) that until then had no theoretical data relating their structural, vibrational, quantum properties and study of molecular docking.In this context, the objective of this work was to investigate the alkaloids 9-methoxyguatterfriesine (I), (R) -6,6a-dihydro-9-methoxyguatterfriesine (II) and 4,5-dehydro-9-methoxyguatterfriesine (III), part of this new class, through a theoretical approach using DFT calculations with the B3LYP functional and 6-311G (2d, p) bases set.The geometric…

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, 33699399249, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Bezerra, Jaqueline de Araújo, http://lattes.cnpq.br/4616893220707322, Silva, Jonathas Nunes da, http://lattes.cnpq.br/3810713572412514, [email protected].

Subjects/Keywords: Alcalóides; Plantas medicinais; Agentes antineoplásicos; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA; Alcaloides 7,7-dimetilaporfínicos; DFT; Análises NBO/NLO; Docking molecular; Anti-câncer

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APA (6th Edition):

Branches, A. D. S. (2019). Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae). (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7316

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Branches, Adjane Dalvana Sampaio. “Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae).” 2019. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed August 15, 2020. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7316.

MLA Handbook (7th Edition):

Branches, Adjane Dalvana Sampaio. “Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae).” 2019. Web. 15 Aug 2020.

Vancouver:

Branches ADS. Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae). [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2019. [cited 2020 Aug 15]. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7316.

Council of Science Editors:

Branches ADS. Estudo teórico e experimental em nível DFT e docking molecular para alcaloides do tipo 7,7-dimetilaporfínicos isolados de Guatteria friesiana (Annonaceae). [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2019. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7316

2. Costa, Renyer Alves. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.

Degree: 2018, Universidade Federal do Amazonas

Os alcaloides constituem uma classe de metabólitos com grande atividade biológica e de grande importância na história humana. Dentre as diversas classes merecem destaque os alcaloides indólicos e aporfínicos. Cerca de 1000 tipos de alcaloides dessas classes já foram isolados, entretanto estudos teóricos que justifiquem as suas atividades e forneçam novos dados acerca das suas propriedades estruturais, espectroscópicas e quânticas são escassos na literatura. Partindo desta premissa o presente estudo investigou os alcaloides strictosidina, stricnobrasilina, 12-hidroxi-10,11-dimetoxiestricnobrasilina, liriodenina, cantinona e 7-metoxi-cantinona através de uma abordagem teórica por cálculos DFT usando o funcional híbrido de correlação eletrônica B3LYP e as bases 6-31 G(d), 6-311G(2d,p) e 6-311G++(2d,p). Dados teóricos de otimização geométrica foram comparados com dados de espectroscopia de raio-X de estruturas similares existentes na literatura apresentando valores similares. Em adição cálculos de Orbitais Naturais de ligação (Natural Bond Orbitals-NBOs), orbitais HOMO e LUMO e mapas de potencial eletrostático foram realizados. Espectros teóricos de UV-Vis revelaram-se bastante similares aos espectros experimentais sendo possível o assinalamento das transições eletrônicas. Baseados nos mapas de potencial eletrostático e nos espectros teóricos de IV (por estiramentos N-H e O-H) foi possível prever a formação de ligações de hidrogênio. Cálculos de docking molecular frente os complexos enzimáticos DNA-Topoisomerase II humana e com Diidrofalato redutase de Cândida albicans foram realizados no intuito de justificar as atividades previamente descritas na literatura.

The alkaloids constitute a class of metabolites with great biological activity and o great importance in human history. Among the several classes, the idole and oxoaporphine type alkaloids are worth mentioning. About 1000 of these types alkaloids have already been isolated from plants, however theoretical studies that justify their activities providing new data about their structural, spectroscopic and quantum properties lack in the literature. Based on this premise, the present study investigated the alkaloids strictosidine, stricnobrasiline, 12-hydroxy-10,11-dimethoxystricnobrasiline, liriodenine, cantinone and 7-methoxy-cantinone through a theoretical approach by DFT calculations using the hybrid electronic correlation function B3LYP and the 6-31 G (d), 6-311G (2d, p) and 6-311G ++ (2d, p) basis set. Theoretical geometric optimization data were compared with X-ray spectroscopy data of similar structures in the literature presenting similar values. In addition calculations of Natural Bond Orbitals (NBOs), HOMO and LUMO orbitals and electrostatic potential maps were performed. Theoretical spectra of UV-Vis revealed to be quite similar to the experimental spectra being possible to signal the electronic transitions. Based on the maps of electrostatic potential and the theoretical spectra of IV (by stretches N-H and O-H) it was possible to predict the formation…

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, 33699399249, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Pinheiro, Maria Lúcia Belém, http://lattes.cnpq.br/9299061381457390, Eberlin, Marcos Nogueira, http://lattes.cnpq.br/9866858833240787, Silva, Jonathas Nunes da, http://lattes.cnpq.br/3810713572412514, Guerreiro, Haroldo de Almeida, http://lattes.cnpq.br/1014103626919593, Marques, Alberto dos Santos, http://lattes.cnpq.br/9942676168552776, [email protected].

Subjects/Keywords: Alcaloides; Docking; DFT; FT-IR; Espectroscopia; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA: FÍSICO-QUÍMICA: QUÍMICA TEÓRICA; CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: QUÍMICA: QUÍMICA ORGÂNICA: ESTRUTURA, CONFORMAÇÃO E ESTEREOQUÍMICA

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APA (6th Edition):

Costa, R. A. (2018). Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Costa, Renyer Alves. “Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.” 2018. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Amazonas. Accessed August 15, 2020. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982.

MLA Handbook (7th Edition):

Costa, Renyer Alves. “Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas.” 2018. Web. 15 Aug 2020.

Vancouver:

Costa RA. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. [cited 2020 Aug 15]. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982.

Council of Science Editors:

Costa RA. Investigação das propriedades vibracionais, estruturais e eletrônicas através de cálculos DFT e estudos de docking molecular de alcaloides isolados de plantas da flora amazônica: uma abordagem teórica para moléculas bioativas. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6982

3. Mendon?a, Diego Valois Cortez. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.

Degree: 2020, Universidade Federal do Amazonas

Os quassin?ides s?o terpenoides altamente oxigenados produzidos apenas por esp?cies da fam?lia Simaroubaceae. Os quassin?ides isobruce?na B e neosergeolida apresentam atividades antitumorais e antimal?ricas experimentalmente comprovadas. Porem a isobruceina B e a neosergeolida apresentam valores altos de citotoxidade, eles atingem tanto as c?lulas neopl?sicas como as c?lulas sadias, agindo da mesma forma contra o plasm?dio da mal?ria e as c?lulas sadias. Mediante a essa situa??o se faz necess?rio a utiliza??o do docking molecular, que ? um procedimento computacional capaz de prever a melhor orienta??o e liga??o entre duas mol?culas. O docking indica um caminho para a elabora??o de f?rmacos e ajuda a diminui os problemas de citotoxidade atrav?s de conforma??es. Nesse contexto, um estudo que combina dados qu?nticos e experimentais em n?vel de teoria do funcional da densidade (DFT) das propriedades estruturais, vibracionais e eletr?nicas da isobruceina b e neosergeolida s?o apresentados. Para obten??o dos resultados foi utilizada a fun??o base 6-311G (2d,p) e o funcional de troca e correla??o introduzido por Axel Becke utilizando os par?metros Lee-Yang-Parr (B3LYP). Os dados de otimiza??o de geometria te?rica foram comparados com os dados de raios X para uma estrutura similar na literatura associada, mostrando valores pr?ximos. O valor do gap HOMO-LUMO calculado mostra que a isobruce?na B e a neosergeolida s?o consideradas mol?culas macias (reativas), cujo respectivos valores s?o 4,96 (e.V) e 4,63 (e.V) e est? diretamente relacionada ?s propriedades qu?nticas e fisico-qu?micas das mol?culas. Atrav?s da verifica??o dos estudos de IV (Infra-vermelho) e dos MEPS (Mapas de potencial eletrost?tico) ? poss?vel identificar uma poss?vel forma??o de d?meros intermoleculares na isobruce?na B, e esta forma dim?rica ? estabilizada atrav?s de liga??es de hidrog?nio que revelaram v?rias vibra??es caracter?sticas para a estrutura. O estudo de docking molecular com o complexo Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax mostrou energias livres de liga??o de -8,3 kcal / mol para a isobruce?na B e de -9,3 kcal/mol para a neosergeolida, e isso sugere que a neosergeolida pode ser considerada um bom composto l?der no desenvolvimento de novos inibidores de DHFR do que a pirimetamina, utilizada para o tratamento da mal?ria, a energia livre de liga??o ?G apresentou um valor de -7,5 kcal / mol.

The quassinoids are highly oxygenated terpenoids produced only by species of the family Simaroubaceae. The quassionoids isobrucein B and neosergeolide have experimentally proven antitumor and antimalarial activities. Nevertheless, isobrucein B and neosergeolide have high cytotoxicity values, they affect both neoplastic cells and healthy cells, acting in the same way against malaria plasmodium and healthy cells. Due to this situation it is necessary to use molecular docking, which is a computational procedure capable of predicting the best orientation and binding between two molecules. Docking indicates a pathway for drug development and helps through…

Advisors/Committee Members: Oliveira, Kelson Mota Teixeira de, http://lattes.cnpq.br/8167226394049801, Marques, Alberto dos Santos, http://lattes.cnpq.br/9942676168552776, Silva, Jonathas Nunes da, http://lattes.cnpq.br/3810713572412514.

Subjects/Keywords: Quassin?ides; Isobruce?na B; Atividades antitumorais; Neosergeolida; Docking molecular; CI?NCIAS EXATAS E DA TERRA: QU?MICA; Isobruce?na B; Neosergeolida; DFT; Docking molecular

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APA (6th Edition):

Mendon?a, D. V. C. (2020). Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Mendon?a, Diego Valois Cortez. “Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.” 2020. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed August 15, 2020. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754.

MLA Handbook (7th Edition):

Mendon?a, Diego Valois Cortez. “Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax.” 2020. Web. 15 Aug 2020.

Vancouver:

Mendon?a DVC. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2020. [cited 2020 Aug 15]. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754.

Council of Science Editors:

Mendon?a DVC. Isobruce?na B e neosergeolida: modelagem em n?vel de DFT e estudos de docking molecular com Dihidrofolato Redutase de Plasmodium vivax. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2020. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7754

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