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1.
Corado, André de Lima Guerra.
Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima.
Degree: 2014, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4889
► O estudo da diversidade genética e da presença de mutações de resistências aos antirretrovirais é de fundamental importância para a vigilância epidemiológica do HIV-1, pois…
(more)
▼ O estudo da diversidade genética e da presença de mutações de resistências aos antirretrovirais é de fundamental importância para a vigilância epidemiológica do HIV-1, pois pode fornecer informações sobre a biologia do vírus e orientar as políticas de prevenção e tratamento. De 2007 a 2012, dentre todos os estados da federação, Roraima figura entre os cinco primeiros estados com as maiores taxas de incidências, sendo que de 2008 a 2010 ocupou a segunda posição. Da mesma maneira, a capital Boa Vista de 2007 até 2011 também se posiciona entre as cinco capitais com maior taxa de incidência. Dados relacionados a genotipagem do HIV-1 circulante ou dados relacionados sobre mutações de resistência no estado são de fundamental importância para compreender a epidemia local. Nesse contexto, este trabalho identificou os subtipos do HIV-1 circulante, avaliou a resistência primária e secundária nos pacientes portadores de HIV e descreveu a frequência do polimorfismo rs333 no gene CCR5, em pacientes atendidos no Laboratório Central do Estado de Roraima/Laboratório de HIV. Para isso foram coletadas 121 amostras e as regiões do DNA proviral da RT/PR, Integrase e Envelope foram amplificadas e submetidas ao sequeciamento nucleotídico. O DNA genômico humano foi apenas amplificado e comparado por eletroforese. Os dados demográficos foram analisados por estatística descritiva, enquanto que os dados genéticos foram avaliados por diversas ferramentas de bioinformática para análise de resistência, genotigem, reconstrução filogenética e tropismo viral. Foi observada uma freqüência de 9,17% para o genótipo humano CCR5/CCR5Δ32 e 90,83% em relação ao CCR5/CCR5. Com relação ao subtipo viral, a maior prevalência encontrada foi para o subtipo B (Integrase) e gene Pol, seguido do subtipo F1 e de formas recombinantes B/F (Integrase) e B/D ( Pol). Somente um caso de resistência primária foi detectado (7,69%), no entanto em pacientes em tratamento esse número atingiu 30,7% . A análise filogenética mostrou que as amostras de Roraima se agrupam em diferentes clados com amostras brasileiras, venezuelanas, uruguaias e guianenses, o que provalvelmente reflete eventos distintos de introdução viral. Foram encontradas 25% de amostras com tropismo X4, o que afeta a possibilidade de administração do inibidor de fusão Maroviroque em parte dos pacientes avaliados. Acreditamos que os dados obtidos no presente estudo contribuirão para um melhor entendimento da epidemiologia do HIV/AIDS no estado de Roraima. Além do retorno científico, acreditamos que os resultados contribuirão indiretamente para a melhoria do atendimento desta população de pacientes.
The study of genetic diversity and detection of mutations to antiretroviral therapy is crucial for epidemiological surveillance of HIV-1, because it can provide information about the viral biology, guiding policies for prevention and treatment. From 2007 to 2012, Roraima ranks among the top five states with the highest incidence rates, from 2008 to 2010 occupied the second position. Likewise, the capital of Boa…
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463.
Subjects/Keywords: Epidemiologia; Vírus do HIV; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: IMUNOLOGIA
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Corado, A. d. L. G. (2014). Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4889
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Corado, André de Lima Guerra. “Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima.” 2014. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4889.
MLA Handbook (7th Edition):
Corado, André de Lima Guerra. “Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima.” 2014. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Corado AdLG. Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4889.
Council of Science Editors:
Corado AdLG. Epidemiologia molecular do vírus da imunodeficiência humana do tipo i no estado de Roraima. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4889
2.
Nascimento, Valdinete Alves do.
Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral.
Degree: 2014, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4903
► O vírus Dengue (DENV) pertence à família Flaviviridae e ao gênero Flavivirus, sendo reconhecidos quatro sorotipos distintos denominados DENV-1 a DENV-4. Assim como os demais…
(more)
▼ O vírus Dengue (DENV) pertence à família Flaviviridae e ao gênero Flavivirus, sendo reconhecidos quatro sorotipos distintos denominados DENV-1 a DENV-4. Assim como os demais vírus RNA, o DENV exibe variação em suas sequências, com uma taxa de erro durante o ciclo de replicação estimada em 10-3 a 10-5 erros/nucleotídeo. Essas variações são observadas não só quando analisadas amostras de diferentes indivíduos, mas também dentro de um mesmo hospedeiro. Considerando a necessidade de uma maior compreensão dos mecanismos relacionados ao processo evolutivo do DENV e a emergência de subpopulações virais, o presente trabalho teve por objetivo avaliar a microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4, analisando a existência de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral (viral fitness). Para tanto, uma amostra do DENV-4 denominada BR005AM_2015 foi inoculada em células C6/36, sendo realizadas passagens seriadas do vírus nesta linhagem celular até a passagem 25. Finalizadas as passagens, foi realizada extração do RNA viral e o cDNA foi produzido utilizando iniciador específico para DENV-4. O genoma completo da amostra BR005AM_2015 e das passagens 1, 5, 10, 15, 20 e 25 foi obtido pelo método Sanger utilizando sequenciador automático ABI 3130 genetic analyzer e por meio de sequenciamento de nova geração (NGS) utilizando a tecnologia Ion Torrent no equipamento Ion PGM™ System. Os arquivos gerados após as reações de sequenciamento foram analisados utilizando o software Geneious versão 7.1.7. A análise dos dados fornecidos pelo sequenciamento de Sanger mostrou que no decorrer das passagens ocorreram duas substituições de nucleotídeos, sendo uma na região codificante para a proteína do envelope que resultou na substituição de um resíduo de aminoácido e outra na região da proteína NS1, porém esta foi uma mutação silenciosa. Os resultados do NGS corroboraram com os obtidos pelo sequenciamento de Sanger e apresentaram outras dezessete mutações não observadas pelo método anterior, sendo as mesmas nas regiões codificantes para as proteínas E, NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B e NS5. Do total de mutações observadas, seis delas resultaram em substituição de resíduo de aminoácido. Considerando as mutações observadas, realizamos o estudo de cinética viral por RT-qPCR utilizando o método de ΔΔCt que indicou um aumento do número de cópias de RNA viral, dependente do tempo pós-infecção, tanto presente no sobrenadante de células infectadas quanto no interior das células, indicando um possível aumento da competência viral. Outros estudos se tornam necessários para confirmar se as mutações aqui encontradas também ocorrem em células de mamíferos e em sistemas in vivo, de maneira a verificar se o aumento do fitness viral observado neste estudo se repete em outros sistemas.
Dengue virus (DENV) belongs to the family Flaviviridae and the genus Flavivirus, being recognized as four distinct serotypes termed DENV-1 to DENV-4. Like other RNA viruses, DENV displays variation in their sequences, with an error rate during replication…
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipes Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463.
Subjects/Keywords: Dengue; Arbovírus; Cadeia da Polimerase; Citometria de Fluxo; CIENCIAS DA SAUDE
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Nascimento, V. A. d. (2014). Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4903
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Nascimento, Valdinete Alves do. “Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral.” 2014. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4903.
MLA Handbook (7th Edition):
Nascimento, Valdinete Alves do. “Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral.” 2014. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Nascimento VAd. Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4903.
Council of Science Editors:
Nascimento VAd. Microevolução in vitro do vírus dengue, sorotipo-4: estudo de variações genéticas associadas ao aumento da competência viral. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4903
3.
Sousa, Katianne Barbosa Alves de.
Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil.
Degree: 2014, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5741
► Arbovírus são um grupo de vírus que apresenta um ciclo biológico bastante complexo, que envolve hospedeiros vertebrados suscetíveis e um ou mais vetor artrópode. Os…
(more)
▼ Arbovírus são um grupo de vírus que apresenta um ciclo biológico bastante complexo, que envolve hospedeiros vertebrados suscetíveis e um ou mais vetor artrópode. Os Phlebovirus são arbovírus da família Bunyaviridae transmitidos por insetos do gênero Lutzomyia no novo mundo e Phlebotomus no velho mundo. Estes insetos são importantes vetores de doenças tropicais, como a leishmaniose e vem causando surtos de síndromes febris pelo mundo. Mesmo com uma vasta fauna de flebotomíneos na região Amazônica poucos estudos tiveram como objetivo principal detectar vírus nestes vetores. Em função do descrito anteriormente o presente trabalho teve como objetivo a detecção de Bunyavirus em flebotomíneos coletados na Reserva Florestal Adolpho Ducke, Manaus e no Ramal Nova Esperança, Manacapuru, Amazonas. Os flebotomíneos foram coletados em armadilhas de luz do tipo CDC adaptadas, além de coletas paralelas com aspiradores manuais. Os espécimes foram agrupados em pools, por sexo e armadilha, sendo posteriormente macerados. O material macerado foi inoculado em culturas de células VERO, seguido por técnicas de imunofluorescência indireta para família Bunyaviridae. As amostras positivas pela citometria de fluxo foram submetidas a ensaios moleculares, na tentativa de amplificação dos segmentos S e L de Bunyavirus. Dos 243 pools coletados foi identificada a presença de vírus da família Bunyaviridae em 17 pools através dos resultados obtidos pela citometria de fluxo, com base no deslocamento de células positivas que variaram entre 1,19 - 71,6%. Nesse projeto foi utilizado pela primeira vez um protocolo para Citometria de fluxo para Bunyavirus. Foram aplicadas também metodologias moleculares para detecção de Bunyavirus, seguidos de sequenciamento capilar e de Nova Geração. Entretanto, não foi possível a identificação viral por técnicas moleculares. As amostras estão armazenadas para experimentos futuros, na tentativa de elucidar questões como: a circulação de arbovírus de importância médica em flebotomíneos na Amazônia Ocidental Brasileira.
The arbovirus are virus group with a complex life cycle, once vertebrate hosts as well as arthropod vectors are involved. The Phlebovirus are arboviruses of the Bunyaviridae family transmitted mainly by Lutzomyia insects in the new world and Phlebotomus in the old world. These insects are important vectors of tropical diseases, such as leishamaniasis, causing outbreaks of febrile syndromes worldwide. A large fauna of phlebotomus is observed in the Amazon region and a few studies aimed to detect virus at those vectors. The present study aimed to the detection of arboviruses in phlebotomus collected in the Reserva Florestal Adolpho Ducke, Manaus and at the Ramal Nova Esperança, Manacapuru, Amazonas. The phlebotomus were collected using adapted CDC light traps, including parallel collections with manual aspirators. Speciemens were grouped in pools by sex and trap, and subsequently macerated. The macerated samples were inoculated into VERO cells, following by indirect immunofluorescence. The positives…
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463, [email protected].
Subjects/Keywords: Bunyavírus; Arbovírus; Flebotomíneos; Citometria de fluxo; CIÊNCIAS DA SAÚDE
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Sousa, K. B. A. d. (2014). Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5741
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Sousa, Katianne Barbosa Alves de. “Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil.” 2014. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5741.
MLA Handbook (7th Edition):
Sousa, Katianne Barbosa Alves de. “Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil.” 2014. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Sousa KBAd. Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5741.
Council of Science Editors:
Sousa KBAd. Detecção de Bunyavírus em flebotomíneos coletados em duas áreas do estado do Amazonas, Brasil. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2014. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5741
4.
Silva, Marineide Souza da.
Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?.
Degree: 2017, Universidade Federal do Amazonas
URL: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6344
► A dengue é considerada atualmente a mais importante arbovirose. O seu principal vetor é o mosquito da espécie Aedes aegypti, presente em diversas regiões do…
(more)
▼ A dengue é considerada atualmente a mais importante arbovirose. O seu principal
vetor é o mosquito da espécie Aedes aegypti, presente em diversas regiões do mundo. O
diagnóstico sorológico por meio da pesquisa do antígeno NS1 é o que tem maior
aplicabilidade, pela baixa complexidade na execução e por ser detectado entre o 1º e 9º dia
de início dos sintomas, porém com frequência maior até o 5º dia. Esse estudo teve por
objetivo principal investigar a presença do vírus dengue em amostras com resultados “Não
Reagentes” para o antígeno NS1, avaliando se houve falha no diagnóstico laboratorial, ou a
existência de outros arbovírus circulando no estado do Amazonas. Utilizando a técnica de
RT-qPCR, pesquisou-se a presença do vírus dengue em 306 amostras de soros de pacientes
com suspeita clínica de infecção. As amostras que continuaram negativas foram
pesquisadas quanto a presença dos vírus Zika (ZIKV), Chikungunya (CHIKV), Mayaro
(MAYV) e Oropouche (OROV), pela mesma metodologia, bem como foi pesquisada a
presença de anticorpos das classes IgG e IgM para o vírus dengue por ELISA. Das 306
amostras analisadas 17 (5,5%) foram positivas para DENV, com três sequenciadas para o
sorotipo 4. Trinta e quatro (10,8%) foram positivas para o ZIKV, uma (0,3%) para
CHIKV, treze (4,2%) para MAYV e nove (2,9%) para OROV. Em relação ao teste NS1
todos os kits avaliados apresentaram 100% de concordância em negatividade. Para a
pesquisa de anticorpos anti-dengue da classe IgG, das 306 amostras testadas 134 (43,8%)
tiveram resultados positivos. Em relação à detecção do anticorpo IgM foram observadas
diferentes positividades para os kits comerciais: VIRION (n=250) 35,6% positivas;
FOCUS (n=105) 10,5% positivas e PANBIO (N=80) 20% positivas. Nossos resultados
confirmam casos de resultados falso-negativos, para os testes NS1 de três kits comerciais,
além da circulação de outros arbovírus entre os pacientes de diferentes municípios do
estado do Amazonas.
Dengue is currently considered the most important arbovirose. Its main vector is the
mosquito Aedes aegypti, present in several regions around the world. The serological
diagnosis by means of the NS1 antigen search is the one that has greater applicability,
because of easy of execution and the window for detection between the 1st and the 9th day
of the onset of symptoms, with a higher frequency until the 5th day. This study aimed to
investigate the presence of dengue virus in samples with non-reactive results for the NS1
antigen, assessing if there was a failure in laboratorial diagnosis, or the existence of other
arboviruses circulating in the state of Amazonas. Using the RT-qPCR technique, the
presence of dengue virus was investigated in 306 serum samples from patients with clinical
suspicion of infection. The samples that remained negative were investigated for the
presence of the Zika (ZIKV), Chikungunya (CHIKV), Mayaro (MAYV) and Oropouche
(OROV) viruses with the same methodology, as well as the presence of IgG and IgM for
dengue virus by ELISA. Of the…
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463, [email protected].
Subjects/Keywords: Arboviroses; Vírus Dengue; Proteína NS1; Vírus Mayaro; Vírus Oropouche; Vírus Chikungunya; Vírus Zika; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: IMUNOLOGIA
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Silva, M. S. d. (2017). Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6344
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Silva, Marineide Souza da. “Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?.” 2017. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6344.
MLA Handbook (7th Edition):
Silva, Marineide Souza da. “Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?.” 2017. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Silva MSd. Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2017. [cited 2021 Apr 11].
Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6344.
Council of Science Editors:
Silva MSd. Estudo de casos suspeitos de dengue negativos no teste sorológico para detecção do antígeno NS1: falha no diagnóstico ou emergência de outras arboviroses?. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2017. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6344
5.
Abdalla, Ligia Fernandes.
Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase.
Degree: 2010, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3647
► Objetivo: verificar através da Baciloscopia e da Reação em cadeia da polimerase (PCR) a presença do M. leprae no periodonto, saliva e raspados intradérmicos de…
(more)
▼ Objetivo: verificar através da Baciloscopia e da Reação em cadeia da polimerase (PCR) a presença do M. leprae no periodonto, saliva e raspados intradérmicos de pacientes com
hanseníase.
Metodologia: realizou-se um estudo transversal do tipo detecção de casos numa instituição referência de hanseníase no Amazonas.
Resultados: O trabalho foi composto por 48 pacientes sendo 15 multibacilares (MB) e 33 paucibacilares (PB). Os pacientes MB tiveram o diagnóstico confirmado pela baciloscopia e
PCR de raspados intradérmicos, enquanto que, 16 (33,3%) dos PB foram positivos na PCR e nenhum na baciloscopia. Quatro pacientes PB negativos na PCR de raspados intradérmicos foram positivos no periodonto e na saliva, 1 positivo na saliva e 2 no periodonto. Nenhuma amostra do periodonto e da saliva foi positiva na baciloscopia. Verificou-se uma prevalência de doença periodontal (DP) de 58,3%.
Conclusões: não houve relação entre a DP e a presença do M. leprae; a baciloscopia não mostrou ser uma técnica eficiente para análise da saliva e periodonto; a técnica de PCR de
raspado dérmico mostrou ser um método mais eficaz no diagnóstico dos PB do que a baciloscopia; a positividade da PCR para detecção do M. leprae nos PB pode ser aumentada
coletando raspado intradérmico, periodonto e saliva.
Objective: to verify through bacteriological examination and polymerase chain reaction (PCR) the presence of M. leprae in periodontium, saliva and skin slit smears of the leprosy
patients.
Methodology: A case detection transversal study took place in a leprosy reference center in the Amazon State.
Results: The study included 48 leprosy patients being 15 multibacilary (MB) cases and 33 paucibacilary (PB) cases. The diagnosis of MB patients was confirmed through
bacteriological examination and PCR of the skin slit smears, while, 16 (33%) of PB patients were positive in PCR and none in bacteriology examination of the skin smears. Four PB
patients with negative PCR skin smears were PCR positive in the periodontium and saliva, 1 positive in saliva and 2 in the periodontium. No sample of periodontium and saliva had
positive bacteriological results. A prevalence of 58,3% of periodontal disease (DP) was observed.
Conclusion: there was no correlation between DP and the presence of M. leprae; bacteriological examination did not proved to be an efficient technique for analysis of saliva
and periodontium; the skin smears PCR technique proved to be most efficient method for to diagnosis PB patients than bacteriological examination; PCR positivity for detection of M.
leprae in PB patients can be increase by collecting slit skin smears, periodontium and saliva.
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipe Gomes, CPF:07512955740, Cunha, Maria da Graça Souza, CPF:02380544204, http://lattes.cnpq.br/1018505538168926.
Subjects/Keywords: Mycobacterium leprae; Baciloscopia; PCR; Periodonto; Mycobacterium leprae; Skin Smears; PCR; CIÊNCIAS DA SAÚDE
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Abdalla, L. F. (2010). Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3647
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Abdalla, Ligia Fernandes. “Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase.” 2010. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3647.
MLA Handbook (7th Edition):
Abdalla, Ligia Fernandes. “Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase.” 2010. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Abdalla LF. Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3647.
Council of Science Editors:
Abdalla LF. Pesquisa de Mycobacterium leprae no periodonto, saliva e em raspados intradérmicos de pacientes com hanseníase. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2010. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/3647
6.
Silva, George Allan Villarouco da.
Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase.
Degree: 2012, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4818
► A hanseníase é uma doença infecciosa caracterizada por apresentar diferentes formas clínicas que estão associadas com o tipo de resposta imune ao Mycobacterium leprae. Polimorfismos…
(more)
▼ A hanseníase é uma doença infecciosa caracterizada por apresentar diferentes
formas clínicas que estão associadas com o tipo de resposta imune ao
Mycobacterium leprae. Polimorfismos genéticos presentes no primeiro íntron de
IFN- podem apresentar importante papel na regulação da resposta imune,
podendo resultar em consequências funcionais na transcrição do gene.
Estudos anteriores identificaram a presença de cinco polimorfismos na região
promotora de IL12RB2, sendo que estes polimorfismos poderiam suprimir
fatores de transcrição na expressão de IL12R2, afetando o desenvolvimento
da resposta imune celular. No presente estudo investigamos uma possível
associação do SNP +874, do microssatélite de IFN- e de polimorfismos
presentes na região promotora de IL12RB2 com a susceptibilidade à
hanseníase ou com desenvolvimento das formas clínicas em pacientes dos
Estados da Amazônia Legal brasileira. O sequenciamento nucleotídico foi
realizado em 118 pacientes com hanseníase e 114 indivíduos controles, assim
como a imunofenotipagem de células T CD4
+, CD8
+ e CD69
+ pela citometria de
fluxo. Entre pacientes com hanseníase e indivíduos controles, assim como
entre pacientes PB e MB não foram observadas diferenças significativas entre
os genótipos estudados nos polimorfismos de IL12RB2. Os polimorfismos -
1035, -1023 e -464 apresentam uma correlação absoluta (p<0,0001) havendo
combinação de um mesmo genótipo nas respectivas posições. O microssatélite
com 16 repetições foi significativamente associado com pacientes PB quando
comparado aos pacientes MB (p = 0,019). Indivíduos homozigóticos ao alelo
+874 A apresentaram maiores níveis de IFN- e maior média de células T CD4
+
e CD69
+. Nossos dados sugerem que polimorfismos presentes no primeiro
íntron de IFN- e da região promotora de IL12RB2 não estão associados com a
susceptibilidade à hanseníase. No entanto, o genótipo +874 A/A e 16
repetições de CA de IFN- podem estar relacionados à alta resposta imune
celular observada nestes pacientes, sendo também mais frequentemente
encontrados em pacientes PB.
Leprosy is an infectious disease characterized by different clinical forms that are
associated with the type of immune response against Mycobacterium leprae.
Polymorphisms present in the first intron of IFN- may have an important role in
the regulation of the immune response, which could have functional
consequences for gene transcription. Later studies identified the present of five
polymorphisms in the IL12RB2 promoter region, this polymorphisms will may
transcriptional factor suppress IL12R2 expression affect the development of
cellular immune response. In the present study we investigated a possible
association of the +874 T/A SNP and IFN-, microsatellite and polymorphisms
present in the IL12RB2 promoter region associated with susceptibility to leprosy
or with development of clinical forms in patients from brazilian Legal Amazon
states. Nucleotide sequencing was performed with samples from 118 leprosy
patients and 114 controls…
Advisors/Committee Members: Paula, Lúcia de, 26241709879, http://lattes.cnpq.br/5181076287139121, Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463.
Subjects/Keywords: Hanseníase; Imunidade celular; Citocina; Polimorfismo; Leprosy; Cellular immunity; Cytokine; Polymorphism; CIENCIAS BIOLOGICAS: IMUNOLOGIA: IMUNOLOGIA CELULAR
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APA (6th Edition):
Silva, G. A. V. d. (2012). Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4818
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Silva, George Allan Villarouco da. “Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase.” 2012. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4818.
MLA Handbook (7th Edition):
Silva, George Allan Villarouco da. “Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase.” 2012. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Silva GAVd. Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4818.
Council of Science Editors:
Silva GAVd. Avaliação de polimorfismos genéticos de L12RB2 e IFN-y em pacientes portadores de hanseníase. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4818
7.
Santos, Maisa Porto dos.
Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase.
Degree: 2012, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4912
► A hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae que é influenciada por aspectos genéticos do hospedeiro. Os pólos da hanseníase são ocupados…
(more)
▼ A hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae que é influenciada por aspectos genéticos do hospedeiro. Os pólos da hanseníase são ocupados por espectros imunológicos opostos, de um lado pela forma tuberculoide, com predominante resposta imunológica Th1 e do outro pela forma virchowiana, com predominante resposta Th2. Durante o desenvolvimento da resposta imune, além do sinal antígeno-específico é necessário um segundo sinal para ativação dos linfócitos T, denominado coestimulação. Este sinal pode ser fornecido pelas moléculas CD80 e CD86 presentes nas superfícies das células apresentadoras de antígenos. A ligação destas moléculas aos receptores CD28 e CTLA-4 presentes nos linfócitos T conduz à ativação ou à inibição da resposta imune, respectivamente. A baixa regulação de CD80 e CD28 em pacientes com hanseníase borderline virchowiana ou virchowiana pode ser responsável pela defeituosa sinalização de células T específicas para os antígenos de M. leprae pela via CD80/CD28. Isto pode levar à inativação clonal de células T reativas aos antígenos de M. leprae e, consequentemente, o bacilo cresceria sem restrição nos macrófagos. No presente trabalho foi investigada a possível relação entre polimorfismos presentes nos genes CD80 e CD86 com a susceptibilidade à hanseníase e/ou às formas clínicas da doença. A genotipagem dos polimorfismos foi realizada pelo método de sequenciamento direto. Foram analisados no gene CD80 seis SNP localizados na região promotora (-454 C/A, -387 T/C, -232 G/A, -79 C/G, -7T/C e +5C/A) e um polimorfismo de inserção/deleção (-557_-561 CATGA) e no gene CD86 foi analisado um SNP no éxon 8, posição +1057G/A. Quanto ao gene CD86 foi observada distribuição genotípica semelhante entre os pacientes e indivíduos controles, sendo os genótipos G/G e G/A os mais prevalentes em ambas as populações. Também não foram observadas diferenças significativas entre as frequências alélicas e genotípicas entre os pacientes com hanseníase e indivíduos controles referentes aos polimorfismos do gene CD80. Embora CD80 e CD86 tenham funções importantes na resposta imune os dados obtidos neste estudo demonstram que os polimorfismos analisados não têm influência na susceptibilidade à hanseníase e/ou diferentes formas clínicas da hanseníase.
Leprosy is a chronic infectious disease caused by Mycobacterium leprae that is influenced by host genetic. The poles of the leprosy are occupied by spectrum immunological opposite of the tuberculoid one hand, predominantly of the Th1 immune response and the other by the lepromatous, with predominant Th2 immune response. During the development of immune response, beyond antigen-specific signal is necessary a second signal for activation of T lymphocytes, termed costimulation. This signal can be delivered by costimulatory molecules CD80 and CD86 present on cell surfaces of antigen presented. The binding of these molecules to the receptors CD28 and CTLA-4 T lymphocytes present in the leads to the activation or inhibition of immune response, respectively. The…
Advisors/Committee Members: Paula, Lucia de, 26241709879, http://lattes.cnpq.br/5181076287139121, Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463.
Subjects/Keywords: Hanseníase; Polimorfismo; Moléculas Coestimulatórias; CIÊNCIAS DA SAÚDE: SAÚDE COLETIVA
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Santos, M. P. d. (2012). Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase. (Masters Thesis). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4912
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Santos, Maisa Porto dos. “Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase.” 2012. Masters Thesis, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4912.
MLA Handbook (7th Edition):
Santos, Maisa Porto dos. “Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase.” 2012. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Santos MPd. Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase. [Internet] [Masters thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4912.
Council of Science Editors:
Santos MPd. Avaliação de polimorfismos genéticos das moléculas coestimulatórias CD80 e CD86 em pacientes portadores de hanseníase. [Masters Thesis]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4912
8.
Ogusku, Maurício Morishi.
Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos.
Degree: 2012, Universidade Federal do Amazonas
URL: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5369
► Na prática clínica é amplamente admitido que um episódio de tuberculose (TB) ativa seja causado por um único clone de Mycobacterium tuberculosis. Contudo, vários estudos…
(more)
▼ Na prática clínica é amplamente admitido que um episódio de tuberculose (TB) ativa seja causado por um único clone de Mycobacterium tuberculosis. Contudo, vários estudos têm revelado que há uma heterogeneidade de clones e isso pode ser bem maior que o esperado. Neste contexto, o objetivo do presente trabalho foi investigar a TB pulmonar por infecção policlonal de M. tuberculosis em pacientes recém-diagnosticados, a partir de uma amostra de escarro e antes do início do tratamento. Foram selecionadas 62 amostras de escarros, sendo 31 paucibacilares e 31 multibacilares. A triagem de clones em meio de 7H10 proporcionou o isolamento de clones sensíveis e resistentes à Isoniazida (INH) e/ou Rifampicina (RIF) coexistentes em 19 (30,6%) isolados de M. tuberculosis. A genotipagem por DRE-PCR e o sequenciamento parcial de DNA para os genes katG, inhA e rpoB foram realizados em 74 clones sensíveis à INH e RIF, 65 clones resistentes à INH, 1 clone resistente à RIF e 3 clones resistentes à INH e RIF. A presença de clones sensíveis e resistentes a INH e/ou RIF, assim como a ocorrência de diferentes genótipos indicam a heterogeneidade de clones em um mesmo isolado de M. tuberculosis. A frequência de infecção policlonal observada foi superior aos estudos descritos na literatura, visto que os mesmos apresentaram percentuais de 0,4% a 19,0%. Estes resultados permitem afirmar que a presença de infecção policlonal não é um fenômeno raro em pacientes com TB pulmonar na população estudada. O sequenciamento parcial dos genes katG revelou que apenas 4,4% dos clones resistentes à INH apresentaram as mutações comumente descritas neste gene. Para o gene inhA não foram detectadas mutações para os clones resistentes à INH. Os clones resistentes para RIF apresentaram mutações no gene rpoB. Dos clones resistentes à INH, 83,8% não apresentaram mutações nos genes katG e inhA, enquanto 11,7% apresentaram mutações ainda não descritas no gene katG. A ausência das mutações comumente associadas à resistência medicamentosa nos genes katG e inhA e a detecção de novas mutações em clones de M. tuberculosis resistentes à INH, explicitam a necessidade de sequenciar fragmentos maiores desses genes ou ampliar a busca de mutações em outros genes, a fim de que sejam propostas estratégias mais rápidas para a detecção de resistência em M. tuberculosis. Os resultados da presente pesquisa evidenciam que a infecção policlonal está presente em aproximadamente 1/3 dos pacientes de TB recém-diagnosticados, seja pelas características fenotípica ou genotípica dos clones de M. tuberculosis, embora estas não estejam estritamente relacionadas.
In clinical practice is widely accepted that an episode of active tuberculosis (TB) is caused by a single clone of Mycobacterium tuberculosis. However, several studies have shown that there is heterogeneity of clones and this can be much larger than expected. In this context, the aim of this study was to investigate pulmonary TB by M. tuberculosis polyclonal infection in newly diagnosed patients, from a sputum sample and before…
Advisors/Committee Members: José, Julia Ignez do Nascimento Salem, 06403620282, http://lattes.cnpq.br/8677090857739002, Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463.
Subjects/Keywords: Tuberculose pulmonar; Infecção policlonal; Farmacologia; Resistência aos fármacos; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
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Ogusku, M. M. (2012). Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5369
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Ogusku, Maurício Morishi. “Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos.” 2012. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5369.
MLA Handbook (7th Edition):
Ogusku, Maurício Morishi. “Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos.” 2012. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Ogusku MM. Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. [cited 2021 Apr 11].
Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5369.
Council of Science Editors:
Ogusku MM. Investigação de tuberculose pulmonar por infecção policlonal de Mycobacterium tuberculosis e possível associação com a resistência aos fármacos antimicobacterianos. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2012. Available from: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5369
9.
Abdalla, Ligia Fernandes.
Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico.
Degree: 2018, Universidade Federal do Amazonas
URL: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6727
► O Zika virus (ZIKV) é um arbovírus emergente da família Flaviviridae e do gênero Flavivirus, que até 2007 estava restrito a alguns casos de doença…
(more)
▼ O Zika virus (ZIKV) é um arbovírus emergente da família Flaviviridae e do
gênero Flavivirus, que até 2007 estava restrito a alguns casos de doença leve na
África e na Ásia. No Brasil, suspeita-se que a entrada do vírus tenha se dado
durante a Copa das Confederações de 2013 e no primeiro semestre de 2015, já
havia casos confirmados em estados de todas as regiões do país. A epidemia
brasileira revelou que a infecção geralmente leve e autolimitada poderia estar
relacionada à distúrbios neurológicos. Os objetivos deste trabalho era esclarecer
inúmeros questionamentos existentes em relação à infecção pelo ZIKV, visando
contribuir com uma melhor compreensão dos mecanismos envolvidos na
imunopatogênese e curso da doença. Como resultados, descreveu-se o primeiro
relato de fibrilação atrial em pacientes com Zika, podendo ser considerado uma
manifestação atípica durante a infecção pelo vírus; observou-se elevação de
citocinas pró-inflamatórias durante a infecção ZIKV; identificou-se a quimiocina
CXCL10 como um biomarcador potencial de infecção; caracterizou-se a saliva como
fluído de escolha para o detecção do vírus Zika na fase aguda da doença e, montouse
um modelo de regressão logística para a classificação de casos de zika em
relação à dengue, com base na avaliação clínica.
Zika virus (ZIKV) is an emergent arbovirus of the family Flaviviridae and the
genus Flavivirus, which until 2007 was restricted to some cases of mild disease in
Africa and Asia. In Brazil, it`s suspected that the entry of the virus occurred during
the 2013 Confederations Cup and in the first half of 2015, there were already
confirmed cases in states in all regions of the country. The Brazilian epidemic
revealed that the usually mild and self-limiting infection could be related to
neurological disorders. The objectives of this study were to clarify numerous
questions regarding ZIKV infection, aiming to contribute to a better understanding of
the mechanisms involved in the immunopathogenesis and course of the disease. As
a result, the first report of atrial fibrillation in patients with Zika was described and
could be considered an atypical manifestation during the virus infection; elevation of
proinflammatory cytokines during ZIKV infection was observed; CXCL10 chemokine
was identified as a potential biomarker for infection; saliva was characterized as the
fluid of choice for the detection of Zika virus in the acute phase of the disease and a
logistic regression model for the classification of cases of zika in relation to dengue
was set up based on the clinical evaluation.
Advisors/Committee Members: Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463, Lopes, Antônio Luiz Ribeiro Boechat, 41779320272, http://lattes.cnpq.br/3558832059770794, Naveca, Felipe Gomes, 07512955740, http://lattes.cnpq.br/3396741165569463, Sadahiro, Aya, http://lattes.cnpq.br/8658798733544812, Mariúba, Luís André Morais, http://lattes.cnpq.br/4784959431673419, Sampaio, Vanderson de Souza, http://lattes.cnpq.br/0039836167659650, Pontes, Gemilson Soares, http://lattes.cnpq.br/9081671233815990, [email protected].
Subjects/Keywords: Zika virus; RT-qPCR; CXCL10; Saliva; Fibrilação; Atrial Clínica; CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
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Abdalla, L. F. (2018). Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico. (Doctoral Dissertation). Universidade Federal do Amazonas. Retrieved from https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6727
Chicago Manual of Style (16th Edition):
Abdalla, Ligia Fernandes. “Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico.” 2018. Doctoral Dissertation, Universidade Federal do Amazonas. Accessed April 11, 2021.
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6727.
MLA Handbook (7th Edition):
Abdalla, Ligia Fernandes. “Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico.” 2018. Web. 11 Apr 2021.
Vancouver:
Abdalla LF. Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico. [Internet] [Doctoral dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. [cited 2021 Apr 11].
Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6727.
Council of Science Editors:
Abdalla LF. Infecção pelo vírus Zika em uma população da Amazônia Ocidental Brasileira: estudo da resposta imune, características clínicas e de diagnóstico. [Doctoral Dissertation]. Universidade Federal do Amazonas; 2018. Available from: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6727
.