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You searched for +publisher:"Nantes" +contributor:("Fleury, Fabrice"). Showing records 1 – 2 of 2 total matches.

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1. Lafont, Florian. Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response.

Degree: Docteur es, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie, 2017, Nantes

Les cellules humaines sont soumises à des stress induisant des cassures double-brin de l’ADN principalement réparées par la voie NHEJ, où la kinase DNA-PKcs joue un rôle central. L’activité de DNA-PKcs, régulée par de nombreuses phosphorylations, est cruciale pour le maintien de l’intégrité génomique. Plus récemment, il a été montré que cette protéine était également modifiée par l’O-GlcNAcylation dans la lignée COS7. Sachant l’équilibre existant entre phosphorylation et O-GlcNAcylation, nous avons étudié le rôle de cette nouvelle MPT dans la régulation de l’activité de DNA- PKcs. Nous avons montré que DNA-PKcs est O-GlcNAcylée dans les cellules HeLa. Puis nous avons montré que la modulation de l’O-GlcNAcylation de DNA-PKcs impacte son autophosphorylation en Ser2056, suggérant l’existence d’une balance O-GlcNAcylation /phosphorylation, ainsi que la capacité des cellules à réparer les DSBs par la voie NHEJ. De plus, nos résultats nous laissent envisager que cette modification puisse jouer un rôle dans la stabilité de la protéine. DNA-PKcs est une cible potentielle dans les stratégies de lutte contre le cancer. Nous avons étudié l’impact d’un composé sur DNA-PKcs. Cette molécule provoque une réduction de la quantité et de l’activité de DNA-PKcs, impliquant son ubiquitinylation et sa dégradation par le protéasome et menant à une sensibilisation des cellules à un traitement génotoxique. Dans ce contexte, nous avons développé une puce à anticorps pour évaluer le profil phosphoprotéique des voies de réparation de l’ADN et ainsi évaluer l’effet d’inhibiteurs de DNA-PKcs. L’ensemble de ces résultats contribuent à une meilleure compréhension de la régulation de DNA-PKcs.

Human cells are subjected to stresses inducing DNA double-strand breaks mainly repaired by the NHEJ pathway, where the kinase DNA-PKcs plays a central role. The activity of DNA-PKcs, regulated by numerous phosphorylations, is crucial for the maintenance of genomic integrity. More recently, it has been shown that this protein is also modified by O-GlcNAcylation in the COS7 cell line. Knowing the balance between phosphorylation and O-GlcNAcylation, we studied the role of this new PTM in the regulation of DNA-PKcs activity. We have shown that DNA-PKcs is O-GlcNAcylated in HeLa cells. We then showed that the modulation of DNA-PKcs O-GlcNAcylation affects its autophosphorylation on Ser2056, suggesting an O-GlcNAcylation/phosphorylation balance, as well as the ability of cells to repair DSBs by NHEJ pathway. Moreover, our results allow us to consider that this modification may play a role in protein stability. DNA-PKcs is a potential target in anticancer strategies. We studied the impact of a chemical compound on DNA-PKcs activity. This molecule causes a reduction in the amount and activity of DNA-PKcs, through its ubiquitinylation and its degradation by the proteasome and leading to sensitization of the cells to genotoxic treatment. In this context, we have developed an antibody microarray to evaluate the phosphoprotein level of DNA repair pathways and thus…

Advisors/Committee Members: Fleury, Fabrice (thesis director), Benhelli Mokrani, Houda (thesis director).

Subjects/Keywords: O-GlcNAcylation

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APA (6th Edition):

Lafont, F. (2017). Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response. (Doctoral Dissertation). Nantes. Retrieved from http://www.theses.fr/2017NANT1023

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Lafont, Florian. “Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response.” 2017. Doctoral Dissertation, Nantes. Accessed September 21, 2019. http://www.theses.fr/2017NANT1023.

MLA Handbook (7th Edition):

Lafont, Florian. “Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response.” 2017. Web. 21 Sep 2019.

Vancouver:

Lafont F. Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response. [Internet] [Doctoral dissertation]. Nantes; 2017. [cited 2019 Sep 21]. Available from: http://www.theses.fr/2017NANT1023.

Council of Science Editors:

Lafont F. Implication des modifications post-traductionnelles de DNA-PKcs dans la régulation de la réponse aux dommages à l'ADN. : Involvement of DNA-PKcs post-translational modifications in the regulation of DNA damage response. [Doctoral Dissertation]. Nantes; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017NANT1023

2. Jaunet, Titouan. Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein.

Degree: Docteur es, Chimie théorique, 2017, Nantes

La protéine RAD51 est l’un des acteurs majeurs des mécanismes de la résistance et de la reconstruction des cellules cancéreuses. La modulation de son activité ouvre une nouvelle voie dans la lutte contre le cancer. De nouveaux inhibiteurs potentiels de RAD51 ont été recensés, notamment, les dérives du stilbène disulfonique (SD). Dans cette thèse, nous étudions ces inhibiteurs dans différents milieux (solvant et protéine). La première partie de cette thèse est dédiée à l’étude des propriétés physico-chimiques en solution des dérivés SD. À l’aide de spectres optiques expérimentaux et de simulations par calculs quantiques (DFT et TD-DFT), nous avons montré que les SD se présentent sous leur forme dianionique en condition physiologique et la prise en compte du couplage vibronique est cruciale pour simuler des bandes des spectres d’absorption. La seconde partie se focalise sur la modélisation du complexe SD2- en interaction avec la protéine de transport albumine sérique humaine (ASH), qui joue un rôle prépondérant dans le transport de molécule au sein du corps humain. Elle apparaît être un excellent candidat pour acheminer des inhibiteurs SD2- vers les cellules cancéreuses. Sans donnée cristallographique du complexe ASH-SD2-, la modélisation moléculaire est le seul outil prédictif utilisable pour obtenir des données structurales, et nous avons associé ici des méthodes de docking moléculaire et de dynamique moléculaire. Cette méthodologie nous a permis (i) d’identifier le(s) résidu(s) important(s), (ii) d'évaluer les énergies d'interaction par des calculs MM-GBSA et (iii) d'identifier les sites d’accueil les plus adéquats pour les composés de type SD2-.

In this PhD thesis, the SD behavior is studied in various environments (in solution and within protein). In the first part, the physico-chemical properties of SD molecules in solution are explored in a joint experimental and theoretical (DFT and TD-DFT) investigation. The latter demonstrates the dianionic nature of SD compounds in physiological conditions and indicates that accounting for vibronic coupling is crucial to reproduce the bandshape of the absorption spectra. The second part is focused on the modeling of SD2- complexes within a carrier protein, the human serum albumin (HSA), which is essential for the drug transport process through the human body. HSA appears to be an excellent candidate to carry SD2- compounds into cancer cells. Without any cristallographic structure of HSA-SD2- complex, molecular modelling is the only predictive tool to obtain structural data. We performed molecular docking and molecular dynamic methodology to (i) identify the key residues, (ii) investigate the complex energies by MM-GBSA calculations and (iii) determine the most potent binding sites to host SD2- derivatives.

Advisors/Committee Members: Jacquemin, Denis (thesis director), Fleury, Fabrice (thesis director), Laurent, Adèle (thesis director).

Subjects/Keywords: Docking; Stilbène Disulfonique

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APA (6th Edition):

Jaunet, T. (2017). Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein. (Doctoral Dissertation). Nantes. Retrieved from http://www.theses.fr/2017NANT4050

Chicago Manual of Style (16th Edition):

Jaunet, Titouan. “Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein.” 2017. Doctoral Dissertation, Nantes. Accessed September 21, 2019. http://www.theses.fr/2017NANT4050.

MLA Handbook (7th Edition):

Jaunet, Titouan. “Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein.” 2017. Web. 21 Sep 2019.

Vancouver:

Jaunet T. Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein. [Internet] [Doctoral dissertation]. Nantes; 2017. [cited 2019 Sep 21]. Available from: http://www.theses.fr/2017NANT4050.

Council of Science Editors:

Jaunet T. Modélisation et simulation de nouveaux inhibiteurs de Rad51 au sein d'une protéine de transport : Modelling and simulation of new Rad51 inhibitors within a carrier protein. [Doctoral Dissertation]. Nantes; 2017. Available from: http://www.theses.fr/2017NANT4050

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