+publisher:"Ecully, Ecole centrale de Lyon" +contributor:("Souteyrand, Eliane")

1. Goudot, Alice. Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa.

Degree: Docteur es, STIC santé et micro et nano-technologies, 2013, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2013ECDL0023

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Pseudomonas aeruginosa (PA) est l’un des principaux germes impliqués dans les maladies nosocomiales et est aussi la principale cause de mortalité et morbidité des patients… (more)

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Pseudomonas aeruginosa (PA) est l’un des principaux germes impliqués dans les maladies nosocomiales et est aussi la principale cause de mortalité et morbidité des patients atteints de la mucoviscidose malgré l’utilisation massive d’antibiotiques. Dans la lutte contre PA, une alternative aux antibiotiques est l’inhibition de ses facteurs de virulence notamment ceux impliqués dans l’adhésion et la formation du biofilm via des interactions de type sucres/protéines. Ces protéines sont appelées lectines (PA-IL, PA-IIL, FliD). L’objectif de ce travail est la recherche de molécules inhibitrices (glycoclusters) de ces lectines impliquées dans la virulence de PA. Compte tenu du grand nombre de glycoclusters à tester et des faibles quantités de matériels biologiques disponibles, un outil de criblage innovant a été développé (glycoarray) à partir d’une lame de verre microstructurée et fonctionnalisée chimiquement afin d’immobiliser de manière organisée et ordonnée les glycoclusters. La méthode d’immobilisation choisie est la méthode d’immobilisation spécifique par hybridation de l’ADN appelée DDI : DNA Directed Immobilization. Sur ces glycoarrays, 3 méthodes indépendantes (lecture de fluorescence directe, IC50 et Kd) de mesure des interactions glycoclusters/lectines ont été mises au point et validées par une étude comparative donnant un classement similaire des glycoclusters pour leur affinité vis-à-vis des lectines Il faut noter que ces mesures faites sur glycoarrays ne consomment que quelques picomoles de glycoclusters comparées aux méthodes classiques (ITC, ELLA, RMN, …) qui nécessitent des micromoles de produits. A l’aide de ces glycoarrays, un criblage d’une bibliothèque d’une centaine de glycoclusters multivalents, de différentes topologies, charges et linkers a permis d’identifier deux structures montrant une très forte affinité vis-à-vis des lectines de PA. Ces glycoclusters sont actuellement en test in vitro et in vivo. Ces études d’interactions sur DDI-glycoarray ont été étendues à d’autres agents pathogènes tels que les bactéries Burkholderia ambifaria, Viscum album ou contre le virus de la grippe. Dans le futur, pour mieux appréhender les mécanismes d’interactions sucres/protéines, il serait intéressant de pouvoir suivre en temps réel ces interactions en utilisant des systèmes de détection sans marquage tel que, par exemple, la résonance plasmonique de surface. Aussi, le dernier chapitre donne les prémices d’une adaptation de la méthode DDI sur glycoarray sur surface d’or.

Pseudomonas aeruginosa (PA) is one of the predominant bacterium encountered in nosocomial infections. PA infections often lead to chronic inflammation and eventually to death despite aggressive antibiotic therapy. A promising approach is to inhibit the virulence factors of PA such as PA-IL, PA-IIL, FliD (lectins). Therefore, there is a great interest for studying carbohydrate/lectin interactions in order to design new treatments. The goal of this work is the research for inhibitory molecules (glycoclusters ) of these lectins involved in the…

Advisors/Committee Members: Souteyrand, Eliane (thesis director).

Subjects/Keywords: Glycobiologie; Interaction glycocluster/lectine; Glycoarray; Chimie de surface; Immobilisation dirigée par l’ADN (DDI); Glycobiology; Glycocluster/lectin interaction; Glycoarray; Surface chemistry; DNA directed immobilization (DDI)

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APA (6^th Edition):

Goudot, A. (2013). Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2013ECDL0023

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Goudot, Alice. “Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa.” 2013. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2013ECDL0023.

MLA Handbook (7^th Edition):

Goudot, Alice. “Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa.” 2013. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Goudot A. Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2013. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2013ECDL0023.

Council of Science Editors:

Goudot A. Développement d'une plateforme de criblage pour la recherche de nouvelles molécules anti-infectieuses : applications à Pseudomonas aeruginosa. : Glycoarray technology development for new anti-infective molecules discovering : applications to Pseudomonas aeruginosa. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2013. Available from: http://www.theses.fr/2013ECDL0023

2. Trévisan, Marie. Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings.

Degree: Docteur es, STIC santé et micro et nano-technologies, 2011, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2011ECDL0008

► La manipulation de micro et nanoparticules magnétiques et leurs applications dans les domaines de la biologie, la biodétection et du diagnostic a continuellement gagné en… (more)

Subjects/Keywords: Particules magnétiques; Génotypage plaquettaire; Biocode barre; Filaments magnétiques; Biofonctionnalisation; Biocapteur à ondes évanescentes; Fluorescence; SPRI; Magnetic particles; Platelet genotyping; Bio-barcode assay; Magnetic filaments; Bio-functionnalization; Evanescent wave biosensor; Fluorescence; SPRI

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APA (6^th Edition):

Trévisan, M. (2011). Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2011ECDL0008

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Trévisan, Marie. “Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings.” 2011. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2011ECDL0008.

MLA Handbook (7^th Edition):

Trévisan, Marie. “Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings.” 2011. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Trévisan M. Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2011. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2011ECDL0008.

Council of Science Editors:

Trévisan M. Biofonctionnalisation, caractérisation et mise en oeuvre de particules magnétiques sur biocapteurs : application au génotypage plaquettaire : Analyse and quantification of electrical contacts endurance under fretting loadings. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2011. Available from: http://www.theses.fr/2011ECDL0008

3. Shi, Liu. Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein.

Degree: Docteur es, Micro et nano-technologies, 2015, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2015ECDL0024

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Le cancer du sein demeure un problème de santé publique majeure dans le monde. Afin d'améliorer les chances de survie et la qualité de vie… (more)

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Le cancer du sein demeure un problème de santé publique majeure dans le monde. Afin d'améliorer les chances de survie et la qualité de vie des femmes, il est nécessaire d’effectuer le diagnostic à un stade précoce et d’appliquer le traitement. Dans ce contexte, un des objectifs de cette thèse est de développer des puces à protéines pour le diagnostic et le pronostic du cancer du sein. Parmi les nombreux marqueurs biologiques potentiels, des recherches récentes ont montré que des anticorps anti-heat shock proteins (anti-HSPs) sont associés à la genèse tumorale. Ces anticorps seraient donc de bons biomarqueurs diagnostiques et pronostiques pour le cancer du sein. Par conséquent, nous avons élaboré une puce à antigènes afin de détecter les anticorps anti-HSP dans le sérum de 50 patients atteints de cancer du sein et de 26 témoins sains. Nos résultats indiquent clairement que la la détection multiplex d’une combinaison d'anticorps anti-HSP permet de discriminer les patients atteints de cancer du sein des témoins sains avec une sensibilité de 86% et une spécificité de 100%. Ensuite, nous avons élaboré une puce à anticorps pour doser la concentration de l'activateur du plasminogène de type urokinase (uPA) et de son inhibiteur principal (PAI-1) dans 16 extraits cytosoliques de tissus tumoraux. uPA et PAI-1 sont décrits comme étant de bons biomarqueurs pronostiques et prédictifs du cancer du sein. De faibles taux de uPA (≤3 ng / mg de protéine) et PAI-1 (≤14 ng / mg de protéine) sont associés à un faible risque de récidive et pas de bénéfice d’une chimiothérapie pour les patients atteints de cancer du sein. Les résultats obtenus à partir de puces à anticorps étaient surface dépendante par rapport aux résultats obtenus sous forme ELISA. En outre, l'utilisation de nos puces à anticorps nécessite 25 fois moins de volume d'échantillon par rapport à un dosage ELISA, résolvant ainsi les principales limites de la méthode ELISA. Enfin, nous avons déterminé et optimisé les paramètres influençant les performances des puces à protéines, comme par exemple la chimie de surface, la durée expérimentale, la concentration des solutions, etc. Nous avons également étudié les conditions de stockage à la fois pour des surfaces chimiquement fonctionnalisées et pour les puces à protéines. Les résultats ont montré que les puces à protéines conservent leur activité biologique jusqu’à trois mois de stockage.

Breast cancer becomes the most common cancer among women. In order to improve women's chances of survival and life quality, to be diagnosed at an early stage and to receive correct treatment are the most promising ways. In this context, we aim at developing an antigen microarray for screening serological biomarkers to diagnose breast cancer patients as early as possible. Among numerous potential biomarkers, recent researches showed that antibodies against heat shock proteins (HSPs) are associated with tumor genesis and would be good diagnostic and prognostic biomarkers for breast cancer. Therefore, we used customized antigen microarray to…

Advisors/Committee Members: Souteyrand, Eliane (thesis director), Laurenceau, Emmanuelle (thesis director).

Subjects/Keywords: Puces à protéines; Anticorps; Diagnostic de cancer du sein; Biomarqueurs prédictifs; Stockage; Protein microarray; Autoantibodies; Breast cancer diagnosis; Predictive biomarkers; Storage

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APA (6^th Edition):

Shi, L. (2015). Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2015ECDL0024

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Shi, Liu. “Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein.” 2015. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2015ECDL0024.

MLA Handbook (7^th Edition):

Shi, Liu. “Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein.” 2015. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Shi L. Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2015. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2015ECDL0024.

Council of Science Editors:

Shi L. Elaboration of protein microarrays for rapid screening and quantification of breast cancer biomarkers : Élaboration de puces à ADN à protéines pour dépistage et quantification de biomarqueurs de cancer du sein. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2015. Available from: http://www.theses.fr/2015ECDL0024

4. Sui, Ning. Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM.

Degree: Docteur es, Chimie et nanobiotechnologies, 2012, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2012ECDL0021

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L’exaltation de fluorescence par un métal est de plus en plus utilisée pour augmenter la sensibilité de détection dans les systèmes utilisant la fluorescence. Au… (more)

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L’exaltation de fluorescence par un métal est de plus en plus utilisée pour augmenter la sensibilité de détection dans les systèmes utilisant la fluorescence. Au cours de ce travail de thèse, nous avons étudié ce phénomène dans des nanoparticules hybrides Mé[email protected] possédant des émetteurs de fluorescence immobilisés sur la silice. Dans un premier temps, nous avons élaboré les nanoparticules cœur-coquille Mé[email protected] (Métal = Au ou Ag) en utilisant différentes méthodes et en les comparant pour choisir la plus adaptée selon le diamètre du cœur métallique. Dans un deuxième temps, nous avons étudié les propriétés de fluorescence exaltée des nanoparticules hybrides. Deux types d’émetteurs de fluorescence ont été sélectionnés : des nanoparticules semi-conductrices (SiC) et des fluorophores organiques (cyanine 3 et fluorescéine). Après fonctionnalisation de la silice, les émetteurs de fluorescence ont été greffés à la surface des nanoparticules Mé[email protected] L’exaltation de leur fluorescence a été analysée en fonction de leur densité surfacique, de leur distance par rapport au cœur métallique (fixée par l’épaisseur de silice), du diamètre du cœur métallique et de la longueur d’onde d’excitation. Le facteur d’exaltation le plus important (de l’ordre de 103) a été obtenu avec une faible épaisseur de silice (10 nm) pour les nanoparticules de SiC dont le rendement quantique intrinsèque est très faible (inférieur à 1%). Enfin, la surface de nanoparticules hybrides a été fonctionnalisée avec des nanoparticules d’oxyde de fer de manière à obtenir une combinaison de propriétés optiques (fluorescentes et plasmoniques) et magnétiques à l’intérieur d’une même nanoparticule hybride.

For the past decade, metal-enhanced fluorescence (MEF) has attracted much attention as it improved the sensitivity of fluorescence detection. In this work, MEF was investigated in hybrid [email protected] nanoparticles with fluorescent emitters immobilized onto silica. In the first part, core-shell [email protected] (Metal = Au or Ag) nanoparticles were elaborated and several elaboration methods were compared. A comparison was given in order to choose the most suitable method depending on metal core diameter. The second part was dedicated to MEF properties of hybrid nanoparticles. Two kinds of fluorescent emitters were selected: quantum dots (SiC) and organic dyes (cyanine 3 and fluorescein). After silica surface modification, fluorescent emitters were linked to [email protected] nanoparticles. MEF phenomenon was investigated by tuning the distance between metal and fluorescent emitter (fixed by silica thickness), metal diameter, the fluorescent emitter surface density, and the excitation wavelength. The highest enhancement factor (almost 103) was obtained for a low silica thickness (10 nm) with SiC nanoparticles whose intrinsic quantum yield is very low (lower than 1%). Finally, we functionalized the surface of hybrid nanoparticles with iron oxide nanoparticles to obtain a combination of optical (fluorescence and plasmonics) and magnetic properties inside one hybrid…

Advisors/Committee Members: Souteyrand, Eliane (thesis director), Monnier, Virginie (thesis director).

Subjects/Keywords: Fluorescence exaltée par un métal; Plasmonique; Nanoparticules; Fluorophores organiques; Chimie de surface; Magnétisme; Metal-enhanced fluorescence (MEF); Fluorescence; Plasmonics; Core-shell nanoparticles; Metal nanoparticles; Magnetism

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APA (6^th Edition):

Sui, N. (2012). Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2012ECDL0021

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Sui, Ning. “Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM.” 2012. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2012ECDL0021.

MLA Handbook (7^th Edition):

Sui, Ning. “Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM.” 2012. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Sui N. Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2012. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2012ECDL0021.

Council of Science Editors:

Sui N. Synthesis, characterization and optical properties of hybrid nanoparticles working with plasmon-fluorescence coupling : Contributions au filtrage Mean Shift à la segmentation : Application à l’ischémie cérébrale en imagerie IRM. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012ECDL0021

5. Yang, Zhugen. 3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D.

Degree: Docteur es, Micro et nano-technologies, 2012, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2012ECDL0018

► Un système est dit robuste s'il est possible de garantir son bon comportement Le cancer est en passe de devenir la première cause de décès… (more)

Subjects/Keywords: Diagnostic du cancer; Puces à protéines 3 D; Protein microarray; Surface chemistry; Immobilization; Tumor marker; Cancer diagnosis

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APA (6^th Edition):

Yang, Z. (2012). 3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2012ECDL0018

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Yang, Zhugen. “3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D.” 2012. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2012ECDL0018.

MLA Handbook (7^th Edition):

Yang, Zhugen. “3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D.” 2012. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Yang Z. 3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2012. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2012ECDL0018.

Council of Science Editors:

Yang Z. 3D-Microstructured Protein Chip for Cancer Diagnosis : Diagnostic du cancer par puces à protéines 3D. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2012. Available from: http://www.theses.fr/2012ECDL0018

6. Cornillon, Amandine. Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry.

Degree: Docteur es, STIC santé et micro et nano-technologies, 2014, Ecully, Ecole centrale de Lyon; Université de Sherbrooke (Québec, Canada)

URL: http://www.theses.fr/2014ECDL0052

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Cette thèse porte sur l’élaboration d’un outil de capture d’ADN permettant d’identifier une mutation génétique (SNP) grâce à la formation de sandwichs avec des particules… (more)

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Cette thèse porte sur l’élaboration d’un outil de capture d’ADN permettant d’identifier une mutation génétique (SNP) grâce à la formation de sandwichs avec des particules de carboxylatex biofonctionnalisées avec des oligonucléotides couplée à une détection de la fluorescence. Le modèle biologique choisi pour ce projet est le génotypage plaquettaire et plus particulièrement la recherche du gène biallélique HPA-1. Le principal objectif de ce travail a été d’optimiser un outil de capture préalablement développé dans l’équipe (Trévisan, 2011) afin de réduire le nombre d’étapes et de simplifier la mise en oeuvre globale du test en modifiant les interactions moléculaires utilisée pour capturer l’ADN cible et en utilisant des particules fluorescentes comme élément de détection. En présence d’ADN cible, des sandwichs sont formés entre les particules fluorescentes et les particules magnétiques biofonctionnalisées. Ces sandwichs sont purifiés par séparation magnétique et la fluorescence est détectée par trois méthodes : la cytométrie en flux, l’imagerie de fluorescence et l’Evareader (détection par ondes évanescentes). Dans un premier temps, les paramètres de fonctionnalisation chimique et biologique des différentes particules (magnétiques et fluorescentes) ont été déterminés et optimisés ainsi que les conditions d’hybridation pour la capture de l’ADN cible. Ensuite, la formation des sandwichs et leur détection ont été suivies par des mesures de fluorescence en utilisant trois méthodes différentes : la cytométrie en flux, l’imagerie de fluorescence et l’Evareader (capteur à ondes évanescentes). Les résultats obtenus avec les différentes méthodes de détection sont concordants et montrent que l’outil de capture d’ADN développé permet de capturer la cible synthétique (oligonucléotide) HPA-1 en réduisant le temps d’analyse de 45 min. Dans nos conditions, le test permet de discriminer l’allèle a de l’allèle b du gène HPA-1 qui ne diffère que d’un nucléotide. Le rapport des signaux de fluorescence issus du sandwich spécifique et du sandwich non spécifique est d’environ 2,5 à 3. Ce rapport devra être amélioré par la suite, en optimisant les conditions de formation des sandwichs. La prochaine étape consistera à optimiser le système de capture d’ADN développé pour gagner en spécificité et déterminer la limite de détection du test. Ce test devra également être validé avec des échantillons biologiques. A plus long terme, la fluorescence pourra être détectée par un photodétecteur miniaturisé actuellement développé à l’Université de Sherbrooke. Des études préliminaires présentées dans ce manuscrit montrent les potentialités de ce nouveau transducteur.

This thesis is about the development of a new assay to capture DNA. This assay is based on the formation of sandwiches between biofunctionnalized with oligonucleotides carboxylatex microparticles combined with fluorescence detection. It should be able to discriminate single nucleotide polymorphism (SNP). This assay is designed to be applied to platelet genotyping for the research of the…

Advisors/Committee Members: Cloarec, Jean-Pierre (thesis director), Souteyrand, Eliane (thesis director), Charette, Paul (thesis director).

Subjects/Keywords: Microparticules magnétiques; Microparticules fluorescentes; Sandwichs; Génotypage plaquettaire; Capteur à ondes évanescentes; Cytométrie en flux; Oligonucléotide; Magnetic microparticles; Fluorescent microparticles; Sandwiches; Platelet genotyping; Evanescent wave sensor; Flow cytometry; Oligonucleotide

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APA (6^th Edition):

Cornillon, A. (2014). Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon; Université de Sherbrooke (Québec, Canada). Retrieved from http://www.theses.fr/2014ECDL0052

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Cornillon, Amandine. “Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry.” 2014. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon; Université de Sherbrooke (Québec, Canada). Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2014ECDL0052.

MLA Handbook (7^th Edition):

Cornillon, Amandine. “Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry.” 2014. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Cornillon A. Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; Université de Sherbrooke (Québec, Canada); 2014. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2014ECDL0052.

Council of Science Editors:

Cornillon A. Test de génotypage plaquettaire in vitro à base de sandwich de microparticules biofonctionnalisées : Détection par capteur de fluorescence à ondes évanescentes, imagerie de fluorescence et cytométrie en flux : Biofunctionnalized microparticles based sandwiches for in vitro platelet genotyping test : detection by evanescent waves biosensor, fluorescence scanner and flow cytometry. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; Université de Sherbrooke (Québec, Canada); 2014. Available from: http://www.theses.fr/2014ECDL0052

7. Zhang, Jing. Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides.

Degree: Docteur es, STIC santé et micro et nano-technologies, 2010, Ecully, Ecole centrale de Lyon

URL: http://www.theses.fr/2010ECDL0029

► La glycomique est la science qui s’intéresse à l’étude structurelle et fonctionnelle des saccharides,également appelés hydrates de carbone (ou carbohydrates). Les saccharides (aussi appelés glycanes… (more)

Subjects/Keywords: Glycolbiologie; Puce ADN; Chimie de surface; Interaction sucre/lectine; Carbohydrate; Microarray; DNA immobilization

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APA (6^th Edition):

Zhang, J. (2010). Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides. (Doctoral Dissertation). Ecully, Ecole centrale de Lyon. Retrieved from http://www.theses.fr/2010ECDL0029

Chicago Manual of Style (16^th Edition):

Zhang, Jing. “Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides.” 2010. Doctoral Dissertation, Ecully, Ecole centrale de Lyon. Accessed April 14, 2021. http://www.theses.fr/2010ECDL0029.

MLA Handbook (7^th Edition):

Zhang, Jing. “Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides.” 2010. Web. 14 Apr 2021.

Vancouver:

Zhang J. Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides. [Internet] [Doctoral dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2010. [cited 2021 Apr 14]. Available from: http://www.theses.fr/2010ECDL0029.

Council of Science Editors:

Zhang J. Design and implementation of DNA-Directed Immobilisation (DDI) glycoarrays for probing carbohydrate-protein interactions. : Conception et élaboration de biopuces à oligosaccharides. [Doctoral Dissertation]. Ecully, Ecole centrale de Lyon; 2010. Available from: http://www.theses.fr/2010ECDL0029

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